許玉玲 王海霞 李金月 夏向群 黃學勇
河南省疾病預防控制中心,傳染病預防控制所,河南省傳染病病原生物重點實驗室(鄭州 450016)
新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)(簡稱新冠肺炎)是近兩年全球大流行的一種呼吸道傳染病,患者多出現(xiàn)肺部感染癥狀[1],給全球經濟造成巨大損失?!缎滦凸跔畈《痉揽胤桨浮罚ǖ诎税妫┨岢觥巴夥垒斎搿确婪磸棥钡姆揽夭呗?,落實“早預防、早發(fā)現(xiàn)、早報告、早隔離、早治療”的措施,嚴格落實“動態(tài)清零”政策。當前新型冠狀病毒實驗室確診方法主要為核酸檢測實時熒光RT-PCR 法,需要專業(yè)實驗室、人員和儀器,樣本采集后經前處理、提取核酸,PCR 體系配制、PCR 擴增至獲得結果,最短需6 h??乖瓩z測膠體金法檢測的是樣本中新型冠狀病毒的一種蛋白,方便快捷,不受實驗條件和儀器限制,采樣后10 min 內出結果。本研究選擇河南省疾病預防控制中心生物資源庫保存的新冠樣本,用實時熒光和膠體金兩種方法檢測,對比結果,分析膠體金法能否作為早期快速診斷新冠感染的一種方法。
1.1 標本來源 所有標本來自河南省新冠肺炎監(jiān)測系統(tǒng),各省轄市疾控冷鏈運輸至河南省疾病預防控制中心生物資源庫,-80 ℃集中保藏。選擇2021年7-8月份新冠陽性鼻咽拭子60份,口咽拭子30 份;同期,中高風險區(qū)新冠陰性鼻咽拭子60 份,口咽拭子30 份。
1.2 梯度稀釋和RNA 提取 所有原始樣本按照《新型冠狀病毒防控方案》(第八版)》附件10《新冠病毒樣本采集和檢測技術指南》進行前處理后,在1.5 mL EP管中取原樣本50 μL,加450 μL的病毒保存液進行10 倍稀釋,混勻后取50 μL,加入450 μL的病毒保存液進行100 倍稀釋。原樣本、10 倍和100 倍稀釋后的樣本,使用QIAGEN 核酸提取試劑盒提取核酸。
1.3 RT-PCR 核酸檢測 使用武漢明德新型冠狀病毒2019-nCoV 核酸檢測試劑盒(熒光PCR 法)檢測ORF1ab∕N 基因,試劑批號:210804,有效期至2022年6月3日。配制反應體系:反應液20 μL,RNA 5 μL,設陰性、陽性對照,使用ABI 7500 實時熒光定量PCR 儀,反應條件:50 ℃15 min,1 個循環(huán);95 ℃30 s,1 個循環(huán);95 ℃3 s,60 ℃40 s,40 個循環(huán)收集熒光信號。陰性、陽性對照結果正常,Ct值≤38,結果判陽性。
1.4 膠體金法抗原檢測 使用南京諾唯贊公司的新型冠狀病毒(2019-nCoV)抗原檢測試劑盒檢測,試劑批號V20210506570,有效期至2023年2月17日。將樣本80 μL 加入保存液,混勻后加4 滴入檢測孔,15 min 內觀察質控線和檢測線,質控線測出實驗成立,觀察記錄結果。
1.5 統(tǒng)計學方法 使用Excel 和SPSS 25.0 進行統(tǒng)計,計量資料采用()表示,計數資料采用例數表示。以核酸檢測結果為金標準,計算180 個樣本膠體金法抗原檢測的陽性和陰性符合率,計算13 個陽性樣本10 倍和100 倍稀釋后,膠體金法抗原檢測的陽性符合率。分別對核酸檢測目標基因Ct 值<25 和25 <Ct 值<30 的樣本進行分層統(tǒng)計,按照公式分別計算陽性符合率:A∕(A+C)×100%,陰性符合率:D∕(B+D)×100%以及總符合率:(A+D)∕(A+B+C+D)×100%。對膠體金法與核酸檢測結果進行Kappa 分析。P<0.05 為差異具有統(tǒng)計學意義。
2.1 RT-PCR 法核酸檢測結果 從大疫情網獲得所有樣本均采自發(fā)病7 d 內,新冠陽性樣本90 份,核酸檢測目標基因Ct 值均小于35,新冠陰性樣本檢測結果均陰性。陽性樣本核酸檢測Ct 值結果見表1。
表1 新冠樣本Ct 值結果分布Tab.1 Distribution of Ct values of SARS-CoV-2 samples±s
表1 新冠樣本Ct 值結果分布Tab.1 Distribution of Ct values of SARS-CoV-2 samples±s
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2.2 膠體金法抗原檢測結果 核酸檢測的陽性樣本90 個,膠體金法抗原檢測只有1 例為陰性,核酸檢測陰性樣本90 個,金標法抗原檢測結果均陰性,見表2。
表2 膠體金標法檢測結果Tab.2 Results of colloidal gold method 例
2.3 膠體金法抗原檢測與RT-PCR 法核酸檢測結果符合率 以核酸檢測結果為金標準,膠體金法抗原檢測的陽性符合率為98.89%,95%CI:93.97%~99.80%,陰性符合率為100.00%,95%CI:95.91%~100%,總符合率99.44%,95%CI:96.92%~99.90%。對核酸檢測目標基因Ct 值<25,25<Ct 值<30 的樣本進行分層統(tǒng)計,膠體金法抗原檢測的陽性一致率分別為98.44%,95%CI:91.67%~99.72%;98.81%,95%CI:93.56%~99.79%。
2.4 Kappa 分析 Kappa=0.989,膠體金法抗原檢測結果與RT-PCR 法核酸檢測結果幾乎完全一致,一致性好。結果見表3。
表3 抗原檢測膠體金法與RT-PCR 法核酸檢測結果的Kappa 分析Tab.3 Kappa analysis of colloidal gold method for SARS-CoV-2 and RT-PCR
2.5 梯度稀釋后實驗結果 13個原樣本及其10倍和100 倍稀釋后核酸檢測ORF1ab 和N 基因分別為:(22.99 ± 3.83)、(22.49 ± 3.96);(25.74 ± 4.32)、(25.94±4.88);(28.66±4.16)、(28.85±4.32)。10倍稀釋后金標法檢測結果均陽性,100 稀釋后金標法有2 個陰性,Ct 值均大于33。10 倍和100 倍稀釋后金標法陽性符合率分別為100%、84.61%。
《新型冠狀病毒肺炎防控方案(第八版)》,新型冠狀病毒肺炎確診病例需滿足新冠疑似病例與核酸檢測陽性,或者病毒基因測序與已知新冠病毒高度同源,或未接種過新冠疫苗但新冠特異性IgM 抗體和IgG 抗體陽性等[2]。核酸檢測的是新冠病毒的遺傳物質RNA,如果檢測結果為陽性,可直接確診為感染病例,檢測靈敏度和特異性都高于其他方法。實時熒光RT-PCR 是核酸檢測最常用的方法,是確診新冠肺炎的“金標準”[3]。但PCR 方法也有一些缺點,從前期樣本處理到出報告通常需要至少4 ~6 h,且存在一定的假陰性;采樣不當、標本保存不當、采用不同類型的標本、采樣遇不排毒時期以及使用不同廠家試劑都可能造成核酸檢測結果“假陰性”而出現(xiàn)漏診。
病毒基因測序要求專業(yè)儀器、專業(yè)人員、測序專用試劑盒,新型冠狀病毒基因組全長近30 000 bp,二代測序至少需要48 h 出結果,結果分析更需要專業(yè)人員操作。但病毒測序有一錘定音的作用,配合流行病學調查常作為聚集性疫情病毒溯源的終結手段,適用于科研及專業(yè)機構。
抗體檢測的是患者體內免疫系統(tǒng)應對新冠病毒感染而產生的抗體,新冠患者血清特異性IgM和IgG 抗體在發(fā)病1 周內都非常低,隨著病程發(fā)展,IgM 逐漸升高,在第3 周達到峰值,然后逐漸下降;IgG 抗體在發(fā)病后3~6 周上升幅度較大,發(fā)病后第9 周達到峰值,并維持一定時間[4]。健康人群全程接種新冠疫苗后,體內特異性IgG 抗體也能維持較長時間。開展全員核酸檢測是為發(fā)現(xiàn)更多潛在的早期病例,在早期大規(guī)模篩查方法中,血清學試驗并不適用,在臨床上血清學檢測結合流行病學史、臨床表現(xiàn)和基礎疾病等情況動態(tài)觀察新冠患者的病程[4],綜合判斷。
抗原檢測膠體金法是檢測樣本的新型冠狀病毒的一種蛋白,采用雙抗體夾心法,以固相免疫層析形式進行測定,待檢樣本的抗原與標記物墊上的抗體結合為膠體金標記抗體-抗原的復合物,繼續(xù)擴散至T 線(檢測線)和C 線(質控線),指示反應完成。如果檢測陽性,很可能為新冠感染病例。張賽等[6]研究顯示該方法檢測新冠病毒抗原靈敏度和特異度都高于96.5%,且與其他呼吸道病原沒有交叉反應,可作為現(xiàn)有核酸檢測法的補充手段,用作早期篩查。泰國的研究者CHAIMAYO 等[7]對454 份(60 個陽性,394 個陰性)新冠樣本進行金標法抗原檢測與PCR 檢測對比,金標法的靈敏度和特異度為98.33%、98.73%,他們認為這種快速簡單的抗原檢測金標法可以用作篩查試驗。EJAZI 等[8-9]對當前各種新冠診斷方法進行綜述,認為核酸檢測試劑價格高、檢測時間長限制了它在大規(guī)模測試中的應用,免疫方法簡單且適合大規(guī)模檢測。國外多個研究團隊對比新冠抗原快速檢測方法和RT-PCR 檢測結果,認為快速檢測抗原的方法可以作為RT-PCR 核酸檢測的輔助方法[10-12]。本研究180 個樣本,核酸檢測新冠陽性90 個、新冠陰性90 個。用膠體金法檢測抗原,與核酸檢測結果比較,膠體金法陽性符合率98.89%,陰性符合率100%。膠體金法抗原檢測與RT-PCR法核酸檢測方法的一致性統(tǒng)計指標Kappa 值為0.989,一致性非常好。本次研究的新冠陽性樣本核酸檢測ORF1ab 和N 基因Ct 值為23.00 ± 4.38、21.14 ± 4.20,標本中病毒載量較高,抗原易檢出。在金標法未檢出的一例鼻咽拭子,分析未檢出原因可能與樣本曾進行56 ℃30 min 滅活,導致蛋白變性所致。挑選13 個樣本進行10 倍和100 倍的稀釋,每稀釋10 倍,核酸檢測靶基因的Ct 數值增加3.24 左右,當Ct 值大于33 時,金標法檢測的靈敏度下降,100 倍稀釋后金標法靈敏度下降,為84.61%。新冠患者早期感染,咽部排毒量較多,PCR 檢測Ct 值較小,膠體金法也更容易檢出,患者感染后期和復陽階段[13],咽部排毒量逐漸減少,PCR 檢測Ct值逐漸增加,Ct 值大于33 后,膠體金法檢測容易出現(xiàn)漏檢。
抗原檢測膠體金法具有較高的敏感度和特異度,該方法快速、簡單,準確并且不受場地、儀器、人員限制,可以作為聚集性疫情需要大規(guī)模排查時的初篩方法,更早發(fā)現(xiàn)新冠感染者,使“早發(fā)現(xiàn)”關口前移,提供更多的時間進行摸排、流調及后續(xù)一系列防控措施的制定,具有較高的應用價值,可以作為早期輔助診斷新型冠狀病毒感染的快速方法。