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    裂殖酵母Shelterin五元復(fù)合物的電鏡結(jié)構(gòu)研究

    2022-05-05 08:51:24魯彥伽吳振芳
    關(guān)鍵詞:端粒谷胱甘肽高分辨率

    魯彥伽,孫 虹,吳振芳,雷 鳴

    上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院上海精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究院,上海 200125

    端粒是真核細胞線性染色體末端的保護性結(jié)構(gòu),由特定的DNA重復(fù)序列和蛋白質(zhì)組分構(gòu)成,在維持基因組的穩(wěn)定中發(fā)揮重要作用[1]。Shelterin復(fù)合物是一種結(jié)合在端粒DNA上的復(fù)合物,由多種亞基構(gòu)成。它與不同的復(fù)合物相互作用,通過精細的調(diào)控,使得端粒長度始終維持在穩(wěn)定的狀態(tài)[2]。人源Shelterin復(fù)合物由TRF1(telomeric repeat binding factor 1)、TRF2、TⅠN2(TRF1-interacting nuclear factor 2)、RAP1(repression/activation protein 1)、 TPP1 (adrenocortical dysplasia protein homolog,又稱ACD)、POT1(protection of telomeric protein 1)6種組分構(gòu)成,這些組分通過廣泛的相互作用,抑制多種DNA損傷應(yīng)答反應(yīng),調(diào)節(jié)端粒酶與端粒DNA的結(jié)合,維持端粒的穩(wěn)態(tài)[3]。除此之外,Shelterin復(fù)合物還會配合細胞周期的進程,保證端粒DNA復(fù)制的正常進行[4]。由于Shelterin復(fù)合物在維持端粒穩(wěn)態(tài)方面的重要性,其組分結(jié)構(gòu)和功能上的異常,都會導(dǎo)致疾病的發(fā)生。例如在人類的乳腺癌細胞中發(fā)現(xiàn)Shelterin復(fù)合物的各種組分表達異常增高[5],在其他多種腫瘤細胞中檢測到Shelterin組分的突變[6],這些變化大多會造成Shelterin復(fù)合物與DNA鏈之間或是Shelterin組分之間的相互作用遭到破壞,最終導(dǎo)致染色體脫帽,端粒DNA暴露在含有端粒酶以及多種損傷響應(yīng)因子的環(huán)境中,促使癌癥的發(fā)生[5,7]。

    對Shelterin復(fù)合物結(jié)構(gòu)的清晰認(rèn)識能夠極大地推進對慢性淋巴細胞白血?。╟hronic lymphocytic leukemia,CLL)[8]、先天性角化不良(dyskeratosis congenita,DKC)[9]等由Shelterin 組分功能異常導(dǎo)致的端粒相關(guān)疾病的認(rèn)識,以及相應(yīng)治療手段的研究進展。有研究表明,Shelterin 組分之間的相互作用是通過一種高度保守的“domain-peptide”(結(jié)構(gòu)域?qū)﹄亩危┑臋C制來達成的[10-11],即一種Shelterin組分可以通過同一結(jié)構(gòu)域中的保守殘基與多種蛋白質(zhì)相互作用。這種相互作用機制不僅利于小分子藥物的設(shè)計和開發(fā)[12],更是賦予了Shelterin 復(fù)合物較高的進化可塑性[11]。 裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe,S. pombe) 在進化上相對緩慢,相較于芽殖酵母(Saccharomyces cerevisiae)來說,還留有許多后生生物的特性。正因如此,裂殖酵母在染色體的保護機制上與高等哺乳動物具有較高的同源性[13-14]。裂殖酵母的Shelterin 復(fù)合物由Taz1(telomere length regulator taz1)、Rap1、Poz1 (Pot1-associated protein Poz1)、Ccq1 (coiled-coil quantitatively-enriched protein 1)、Tpz1(telomere-protecting protein)、Pot1 6 個組分組成,在結(jié)構(gòu)和功能上與人源Shelterin復(fù)合物都高度保守[15]。近年來也有不少以裂殖酵母的Shelterin復(fù)合物為研究對象,進行相關(guān)疾病起源的研究以及藥物研發(fā)的實例?;诹阎辰湍窽pz1-Pot1 之間和人源TPP1-POT1之間相互作用的保守性,通過Tpz1-Pot1生化和結(jié)構(gòu)特性的研究結(jié)果,推測人類黑色素瘤相關(guān)的POT1 突變(A532P)位于TPP1-POT1 界面,該突變引起的TPP1-POT1相互作用缺失可能是導(dǎo)致端粒異常延長的原因[16];利用人源POT1以及裂殖酵母Pot1結(jié)構(gòu)的高度相似性,以裂殖酵母Pot1 與單鏈DNA 結(jié)合復(fù)合物為對象進行藥物篩選,成功篩選到了一種能打斷Pot1與單鏈DNA 相互作用的小分子抑制劑[17]。這些治療手段與抑制端粒酶活性的治療方式聯(lián)合,能夠在一定程度上克服癌細胞對藥物的耐受性,有望顯著提高藥物對多種癌癥的治療效果[18]。

    近20 年來Shelterin 復(fù)合物中多種蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)以及蛋白質(zhì)-DNA 相互作用的高分辨率晶體結(jié)構(gòu)已獲得解析[19-24]。然而,Shelterin復(fù)合物在體內(nèi)具有高度的異質(zhì)性——各亞基間可能形成不同組合的亞復(fù)合物,參與不同的調(diào)控反應(yīng)[25];同時,Shelterin 復(fù)合物的結(jié)構(gòu)具有較大的可變性,這些因素都極大地阻礙了完整Shelterin復(fù)合物高分辨率結(jié)構(gòu)的解析。本實驗室之前的工作已解析了裂殖酵母Shelterin三元復(fù)合物(Rap1-Poz1-Tpz1)的晶體結(jié)構(gòu)[19],在此基礎(chǔ)上本研究采用在體外重組并表達裂殖酵母Shelterin復(fù)合物的方法,通過兩步親和層析、凝膠過濾層析等蛋白質(zhì)純化流程、負(fù)染技術(shù)、電子顯微鏡(電鏡)以及單顆粒重構(gòu)技術(shù),最終獲得了裂殖酵母Shelterin五元復(fù)合物Rap1-Poz1-Tpz1-Ccq1-Pot1 的低分辨率三維結(jié)構(gòu)模型,為解析高分辨率的Shelterin復(fù)合物結(jié)構(gòu)奠定了堅實的基礎(chǔ),對理解整個復(fù)合物的組裝方式及其發(fā)揮功能的分子機制具有重要的意義,同時也將為相關(guān)疾病的治療提供新的思路和潛在靶點。

    1 材料與方法

    1.1 實驗材料

    1.1.1 表達質(zhì)粒與菌株 pGEX-6P1 以及pET-28ASm2 克隆載體均由本實驗室保管,其中pET-28AS-m2為本實驗室基于pET-28a(+)改造的質(zhì)?!镁幋a小分子泛素相關(guān)修飾物蛋白(small ubiquitin related modifier,SUMO) 序列替換原pET-28a(+) 中的ACTGGTGGACAGCAAATGGGTCGC 序列。用于質(zhì)粒擴增的大腸埃希菌(E. coli)DH5α 以及用于蛋白質(zhì)表達的E.coliBL21(DE3)菌株由本實驗室保管。

    1.1.2 主要試劑以及儀器 LB 培養(yǎng)基購于青島生工生物科技有限公司,鎳離子金屬螯合親和層析介質(zhì)(Ni-NTA)購于德國Qiagen 公司,谷胱甘肽瓊脂糖凝膠(glutathione sepharose 4B)購于美國GE 公司,甲酸雙氧鈾購于美國TED PELLA 公司,氨芐青霉素、 卡納霉素、 氯化鈉(NaCl)、 甘油(glycerol)、異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropylbeta-D-thiogalactopyranoside,ⅠPTG)、苯甲基磺酰氟(phenylmethylsulfonyl fluoride,PMSF)、亮抑肽酶(leupeptin)、三羥甲基氨基甲烷(Tris)、二硫蘇糖醇(dithiothreitol,DTT)均購于生工生物工程(上海)股份有限公司,考馬斯亮藍G250 購于上海碧云天生物技術(shù)有限公司。本實驗使用的His-ULP1(帶組氨酸標(biāo)簽的SUMO 蛋白酶)以及谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶3C酶(GST-3C)均由實驗室表達、純化及保存。

    高壓細胞破碎儀(FB-110X)購于上海勵途超高壓設(shè)備有限公司,高速離心機(Beckman Avanti JXN26)購于美國Beckman Coulter 公司,超聲波清洗器(SB-5200DTN)購于寧波新芝生物科技有限公司,垂直電泳儀(Mini-PROTEAN Tetra Cell)購于Bio-Rad(中國)公司,控溫振蕩培養(yǎng)箱(YR101)購于上海西雷生物有限公司,快速蛋白質(zhì)液相色譜(fast protein liquid chromatography, FPLC) 系統(tǒng)(?KTATMpure)和SuperoseTM6 10/300 GL 層析柱購于美國GE 公司,普通碳支持膜(BZ1102XX)購于北京中鏡科儀有限公司,透射電子顯微鏡(Talos L120C)購于美國FEⅠ公司。

    1.2 實驗方法

    1.2.1 質(zhì)粒構(gòu)建 從Shelterin復(fù)合物各亞基間的相對位置關(guān)系(圖1A),復(fù)合物各組分之間的相互作用情況(圖1B),以及本實驗室已發(fā)表的實驗數(shù)據(jù)來看,Poz1全長蛋白質(zhì)中的71~83位肽段不利于蛋白質(zhì)穩(wěn)定純化[19];我們在本次構(gòu)建中去除了這段序列(本文仍簡稱Poz1),并在Poz1的羧基端引入編碼融合蛋白質(zhì)柔性連接——(GGS)2肽段的序列,再利用該連接將Poz1的C端與Rap1PBM(Rap1上與Poz1相互作用的區(qū)域,氨基酸殘基:465~491)的氨基端相連,構(gòu)建出融合蛋白質(zhì)Poz1-Rap1PBM[相對分子質(zhì)量(Mr)30 000]。同樣地,通過從氨基端到羧基端依次排列Tpz1PⅠM(Tpz1 上與Pot1 相互作用的區(qū)域,氨基酸殘基:167~240)、Tpz1CBM-Tpz1PBM(Tpz1 上與Ccq1 相互作用的區(qū)域-Tpz1 上與Poz1 相互作用的區(qū)域,氨基酸殘基:425~509),構(gòu)建Tpz1ⅠNT(Mr17 000),2個片段用(GGS)2肽段連接。將Pot1FL(Pot1全長蛋白質(zhì),Mr61 000)、Poz1-Rap1PBM和Ccq1TAD(Ccq1上與Tpz1相互作用的區(qū)域,氨基酸殘基:123~439,Mr34 000)3 段序列分別構(gòu)建于pET-28AS-m2 克隆載體,使它們各自氨基端帶上His-SUMO純化標(biāo)簽;Tpz1ⅠNT構(gòu)建于pGEX-6P1 克隆載體,使其氨基端帶上谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶(GST)純化標(biāo)簽(圖1C)。

    圖1 裂殖酵母Shelterin復(fù)合物各組分重組質(zhì)粒的構(gòu)建Fig 1 Construction of recombinant plasmids of each component of S.pombe Shelterin complex

    1.2.2 蛋白質(zhì)表達與純化 將Tpz1ⅠNT與Pot1FL共同轉(zhuǎn)化進E. coliBL21 (DE3),Poz1-Rap1PBM以及Ccq1TAD單獨轉(zhuǎn)化進BL21(DE3)。挑取單個菌落至對應(yīng)抗性的LB 液體培養(yǎng)基,于37 ℃活化12 h。將活化好的菌體轉(zhuǎn)接至1 L 對應(yīng)抗性的LB 液體培養(yǎng)基。接種比例為菌種∶培養(yǎng)基=1∶100。每次搖菌6 L,包括3 L Tpz1ⅠNT和Pot1FL共表達菌、2 L Poz1-Rap1 融合蛋白質(zhì)表達菌和1 L Ccq1TAD表達菌。

    在37 ℃下培養(yǎng)至吸光度值為0.8,降溫至18 ℃后,加入ⅠPTG(終濃度為0.2 mmol/L)誘導(dǎo)蛋白質(zhì)表達18 h。然后以3 990×g、25 ℃離心15 min,收集菌體。用lysis buffer吹懸菌體,直至無細菌團塊。向懸液中添加終濃度為1 mmol/L 的PMSF、1 μg/mL 的亮抑肽酶并混勻,于高壓均質(zhì)機中徹底裂解并取樣。裂解后的樣品立刻于39 190×g、4 ℃離心45 min,收集上清液并取樣。然后,將收集的上清液與Ni-NTA于4 ℃低轉(zhuǎn)速結(jié)合1 h。離心收集Ni-NTA 于層析柱,收集流穿液并取樣。之后用wash buffer Ⅰ清洗雜蛋白質(zhì)并取樣。洗雜期間,用考馬斯亮藍G250 實時監(jiān)測雜蛋白質(zhì)的洗脫情況,待考馬斯亮藍G250 幾乎不再變藍后,用elution buffer Ⅰ洗脫并收集目的蛋白質(zhì),取樣。然后立刻用His-ULP1 于4 ℃酶切處理洗脫液,去除所有蛋白質(zhì)氨基端的His-SUMO標(biāo)簽。

    在His-ULP1酶切進行6 h后,取樣。直接加入谷胱甘肽瓊脂糖凝膠進行第2 步的親和層析,于4 ℃低速旋轉(zhuǎn)結(jié)合4 h。4 h 后,將谷胱甘肽凝膠轉(zhuǎn)移至層析柱,收集流穿液,并取樣。然后用wash buffer Ⅱ徹底清洗雜蛋白質(zhì),將谷胱甘肽凝膠轉(zhuǎn)移至干凈的50 mL管,于4 ℃下用GST-3C 酶低轉(zhuǎn)速過夜處理谷胱甘肽瓊脂糖凝膠,將Tpz1 蛋白質(zhì)氨基端GST 標(biāo)簽以及GST-3C 酶與目的蛋白質(zhì)完全分開。將目的蛋白質(zhì)留在流穿液里,而將GST 標(biāo)簽和酶留在谷胱甘肽凝膠上。10 h 后200×g離心收集上清液并取樣,將純化各步驟留取的樣品行十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳 (sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)。檢查純化各步驟樣品蛋白質(zhì)組成的變化情況。

    在目的蛋白質(zhì)樣品中加入DTT (終濃度為2 mmol/L),用截留Mr為100 000 的超濾濃縮管將蛋白質(zhì)體積濃縮至1 mL,并于21 130×g離心10 min 后,取上清液,使用SuperoseTM6 10/300 GL 與FPLC buffer,以0.4 mL/min 的流速分離純化蛋白質(zhì)。根據(jù)出峰情況,利用SDS-PAGE檢測出峰位置對應(yīng)收集管內(nèi)的蛋白質(zhì)組成狀況。上述緩沖液配方見表1。

    表1 緩沖液配方Tab 1 Buffer recipes

    1.2.3 電鏡樣品制作、觀察以及數(shù)據(jù)處理 將銅網(wǎng)碳膜覆蓋面向上,經(jīng)過真空放電親水化處理后使用。取5 μL 稀釋后的蛋白質(zhì)樣品滴于銅網(wǎng)中心(碳膜面朝上),等待樣品吸附1 min,用濾紙邊緣吸走多余的液體。將3 個5 μL 0.75%(質(zhì)量體積濃度)甲酸雙氧鈾染液滴置于疏水薄膜,銅網(wǎng)碳膜面朝下蘸取染液,并立刻吸走多余染液,重復(fù)2 次。最后,吸取5 μL 染液靜置染色1 min,用濾紙吸取多余的染液。然后將銅網(wǎng)碳膜朝上置于濾紙上,65 ℃照射5 min,至銅網(wǎng)完全干燥。將干燥的樣品用120 kV 透射電鏡觀察,放大倍數(shù)設(shè)置為92 000 倍,欠焦值為-2~-1 μm,選擇襯度好、顆粒分散性好、形態(tài)均一、濃度合適的區(qū)域收集數(shù)據(jù)。每張照片拍攝的位置的中心應(yīng)間隔至少2 μm,以確保每張照片的視野沒有重疊的區(qū)域,收集到的顆粒均不重復(fù)。將收集的原始圖片數(shù)據(jù)用EMAN2 軟件進行顆粒抽取,然后從EMAN2 軟件中將抽取顆粒的圖像和位置信息全部導(dǎo)入RELⅠON3.0 軟件,經(jīng)過對采集數(shù)據(jù)的處理最終產(chǎn)生一個目的復(fù)合物的三維重構(gòu)模型。

    1.2.4 Shelterin復(fù)合物結(jié)構(gòu)初步分析 將獲得的三維重構(gòu)模型與已發(fā)表的裂殖酵母亞復(fù)合物高分辨率結(jié)構(gòu)進行擬合。亞復(fù)合物Rap1PBM-Poz1-Tpz1PBM(PDBⅠD:5XXF)、Ccq1TAD-Tpz1CBM(PDB ⅠD:7CUJ)、Pot1OB3-Tpz1PⅠM(PDB ⅠD:7CUⅠ)、Pot1OB1-OB2(PDBⅠD:7CUH)高分辨率結(jié)構(gòu)均由PDB 數(shù)據(jù)庫檢索獲得。將上述結(jié)構(gòu)導(dǎo)入USFC Chimera 軟件,與我們所獲得的重構(gòu)模型進行擬合,以推測各組分在整個Shelterin復(fù)合物中大致的分布以及取向情況。

    2 結(jié)果

    2.1 Shelterin復(fù)合物的表達與純化結(jié)果

    E. coli體系經(jīng)18 ℃誘導(dǎo),能大量表達目的蛋白質(zhì)。經(jīng)過Ni-NTA 親和層析,除去了大量雜蛋白質(zhì),但可以看出,洗脫后的樣品純度依然不高。之后,經(jīng)過His-ULP1處理以及谷胱甘肽瓊脂糖凝膠親和層析,可以獲得純度較高的樣品(圖2A)。為獲得性質(zhì)均一的蛋白質(zhì)樣品,我們又將獲得的樣品濃縮至1 mL后,以0.4 mL/min 的流速進行SuperoseTM6 10/300 GL 凝膠過濾層析,最終得到了性質(zhì)均一,并且組分齊全、比例合適的樣品,目的蛋白質(zhì)在SuperoseTM6 10/300 GL分子篩上大量被洗脫的體積為15.16 mL(圖2B),經(jīng)SDS-PAGE 檢測對應(yīng)出峰位置的蛋白質(zhì)樣品組成情況,可以證明蛋白質(zhì)樣品純度較高、組分齊全且比例合適(圖2C)。

    圖2 裂殖酵母Shelterin復(fù)合物的體外表達與純化Fig 2 Expression and purification of S.pombe Shelterin complex in vitro

    2.2 電鏡數(shù)據(jù)收集與處理

    從120 kV 電鏡的視野下觀察被甲酸雙氧鈾覆蓋的樣品,可以看見,蛋白質(zhì)顆粒的形態(tài)被染鹽襯托得較為清晰,顆粒與顆粒之間的距離合適。顆粒直徑約為15 nm,結(jié)合凝膠過濾層析結(jié)果,推測所純化出的復(fù)合物為二聚體。在視野中能看見存在不同角度投影的形態(tài)信息,這說明蛋白質(zhì)顆粒的多角度數(shù)據(jù)都能被收集(圖3A)??梢酝ㄟ^后期的數(shù)據(jù)計算,獲得較為立體的顆粒結(jié)構(gòu)信息。在92 000倍的放大倍數(shù)下,每張照片采集間隔2 μm 的距離,收集到負(fù)染圖片83 張,用EMAN2 軟件[26]挑選了18 659 個顆粒,然后使用Relion3.0 軟件[27]對所有的顆粒進行2D 分類(圖3B)、初始模型構(gòu)建、以及3D 分類和3D 優(yōu)化處理獲得Shelterin五元復(fù)合物的負(fù)染三維結(jié)構(gòu)模型。使用USCF Chimera 軟件對計算出的模型進行評測,可以看出目的蛋白質(zhì)顆粒結(jié)構(gòu)特征明顯,三維重構(gòu)效果良好(圖3C),挑選出的顆粒角度分布均勻(圖3D)。

    2.3 Shelterin復(fù)合物結(jié)構(gòu)初步分析

    3D 分類后的每個分組的顆粒個數(shù)基本均勻,選擇其中結(jié)構(gòu)形態(tài)各部分過渡最均勻的為模版進行優(yōu)化處理,最終獲得一個分辨率為17 ?(1 ?=0.1 nm)的三維模型(圖4A),整個蛋白質(zhì)復(fù)合物大小為145 ?×120 ?×110 ?(圖4B)。然后我們利用UCSF Chimera軟件[28]將PDB 數(shù)據(jù)庫[29]中已有的裂殖酵母相關(guān)高分辨率Shelterin亞復(fù)合物的結(jié)構(gòu)與我們獲得的模型進行擬合和匹配。

    根據(jù)近年來發(fā)表的多種裂殖酵母Shelterin 亞復(fù)合物的結(jié)構(gòu)信息可以得知:①Rap1PBM-Poz1-Tpz1PBM可以通過Poz1 的N 端前2 個α 螺旋形成反向平行的二聚體[19]。②在Ccq12-439-Tpz1406-508-Poz1FL復(fù)合物中通過基于雙琥珀酰亞胺亞砜(disuccinimidyl sulfoxide,DSSO)的交聯(lián)質(zhì)譜分析鑒定出Ccq1 的N端(氨基酸殘基:2~439)與Poz1 之間有廣泛的相互作用[30],并且在Tpz1 組分中與Ccq1 以及Poz1 產(chǎn)生相互作用的2 個結(jié)構(gòu)域Tpz1CBM、Tpz1PBM緊密相鄰。這說明,Ccq1 與Poz1 組分在空間位置上相近。③有相關(guān)的負(fù)染電鏡結(jié)果表明,在Ccq12-439-Tpz1406-508-Poz1FL二聚體中,2 個Ccq1 組分由于缺失C 端結(jié)構(gòu)域,會采取相對自由的取向[30]。所以,在我們進行匹配的模型中,將2 個Poz1-Tpz1PBM組分放在空間結(jié)構(gòu)上接近的位置,2 個Ccq1TAD分別放在與2 個Poz1 相近的位置。然后,由于Tpz1PⅠM和Tpz1CBM通過(GGS)2肽段連接,所以在匹配過程中我們將與Tpz1PⅠM有相互作用的Pot1OB3-Tpz1PⅠM,以及與Tpz1CBM有相互作用的Ccq1TAD-Tpz1CBM放置在相近的位置。最后,將Pot1OB1-OB2組分放置在整個結(jié)構(gòu)中相對獨立、占比大、且有對稱傾向的“三角形”的兩邊。從分子對接結(jié)果可以說明所有高分辨率結(jié)構(gòu)與重構(gòu)模型匹配情況良好,進而大致確定了各亞基在重構(gòu)模型中的相對位置(圖4C)。

    圖4 Shelterin復(fù)合物三維重構(gòu)模型和各亞基的分子對接情況Fig 4 3D reconstruction of the Shelterin complex and docking of solved structures into the overall envelope

    3 討論

    Shelterin 復(fù)合物是結(jié)合在真核生物端粒區(qū)域,維持基因組穩(wěn)定的重要復(fù)合物[2]。它保護端粒,防止其被識別為雙鏈DNA 而發(fā)生斷裂,并能夠調(diào)控端粒酶的結(jié)合[3],保證端粒DNA 復(fù)制正常進行[4]。正由于Shelterin復(fù)合物在端粒末端保護方面的重要性,其組分缺失、突變[31]或是復(fù)合物組分間相互作用的破壞[16]都會造成端粒功能紊亂,導(dǎo)致基因組穩(wěn)定性被嚴(yán)重破壞,進而導(dǎo)致疾病的發(fā)生。

    最近幾十年以來,研究人員已經(jīng)從進化上、功能上、結(jié)構(gòu)上對多種生物的Shelterin復(fù)合物開展了廣泛的研究[3,11,32]。這些研究的成果對幫助我們理解端粒末端穩(wěn)態(tài)調(diào)控的具體機制提供了寶貴的理論依據(jù)。但是到目前為止,由于Shelterin復(fù)合物分子量巨大,并且在結(jié)構(gòu)上具有高度的可變性,所以尚未有完整的復(fù)合物的結(jié)構(gòu)被解析出來。而Shelterin復(fù)合物行使調(diào)控端粒異染色質(zhì)形成[33]以及端粒酶結(jié)合等功能[34],都要依賴于復(fù)合物的正確組裝。所以,對Shelterin復(fù)合物整體結(jié)構(gòu)的解析,將會更全面地闡明其與端粒DNA 結(jié)合的情況,解釋Shelterin 整體復(fù)合物的組裝機制,從而便于從整體上來認(rèn)識Shelterin 復(fù)合物的功能。

    我們之前的工作解析了裂殖酵母Shelterin三元復(fù)合物(Rap1-Poz1-Tpz1)的晶體結(jié)構(gòu)[19],本研究在此基礎(chǔ)上采用在體外表達并重組裂殖酵母Shelterin復(fù)合物的方法,首次獲得了一個裂殖酵母Shelterin五元復(fù)合物(Rap1-Poz1-Tpz1-Ccq1-Pot1)的低分辨率結(jié)構(gòu)。我們對已有的高分辨率復(fù)合物組裝方式進行分析,并將這些高分辨率結(jié)構(gòu)與我們獲得的重構(gòu)模型進行分子對接,大致確定了各組分在整個復(fù)合物中的分布情況。另外,我們的凝膠過濾層析結(jié)果與結(jié)構(gòu)模型直接說明了該復(fù)合物是一個二聚體,這對復(fù)合物高分辨率結(jié)構(gòu)的解析和組裝機制的揭示有重要的意義,也對理解Shelterin 復(fù)合物發(fā)揮功能的分子機制提供了重要線索。但為了解析復(fù)合物組分間具體的相互作用情況,我們還需要獲得更高分辨率的結(jié)構(gòu)信息。接下來,我們還需要著手篩選適合冷凍觀察Shelterin 復(fù)合物的條件,用冷凍電鏡來分析裂殖酵母Shelterin 復(fù)合物的結(jié)構(gòu),獲得復(fù)合物的高分辨率信息,以更加精細地揭示Shelterin 復(fù)合物發(fā)揮各項調(diào)節(jié)作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。

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