李丹 杜夢潭 修明霞 劉興健 張志芳 李軼女
(1. 中國農業(yè)科學院生物技術研究所,北京 100081;2. 乳山市果茶蠶工作站,煙臺 264500)
干擾素(interferons,IFNs)是病毒或其他誘生劑刺激機體后產生的高活性糖蛋白,具有廣譜的抗病毒、抗腫瘤及免疫調節(jié)活性。1957年,英國病毒生物學家Isaacs在流感病毒實驗中發(fā)現(xiàn),經病毒感染的細胞會產生某種因子,可以干擾病毒在其它細胞中的復制,因此將其命名為干擾素[1]。近年來,干擾素在病毒學、腫瘤學、細胞學等多個領域成為研究熱點,已經被應用于治療畜禽的病毒性疾病及腫瘤性疾病,并取得良好的效果[2]。此外,由于其治療周期短、能有效預防繼發(fā)感染、減少抗生素使用等優(yōu)點,越來越受到人們的重視。
根據其結合的特異性受體差異,干擾素可被分為I型、Ⅱ型和Ⅲ型。I型干擾素有IFN-α、IFN-β等,IFN-α根據氨基酸序列不同,又將分為IFN-α-2a、IFN-α-1b、IFN-α-2b等,I型干擾素具有很強的抗病毒和抗腫瘤活性,對病毒感染引起的免疫反應發(fā)揮重要的調節(jié)作用。目前,I型干擾素的研究被廣泛關注,已經成為病毒學、腫瘤學等多個學科的研究熱點。Ⅱ型干擾素為IFN-γ,其主要功能是誘導主要組織相容性復合體(MHC)類抗原的表達和進行免疫調節(jié),但其抗病毒作用弱于I型干擾素[3]。I型干擾素與Ⅱ型干擾素在理化特性及生物學活性上具有明顯的差異,如I型干擾素能夠耐受pH 2.0的酸性條件,而Ⅱ型干擾素則會失活[4]。Ⅲ型干擾素為IFN-λ,于2013年首次被發(fā)現(xiàn)[5-6],具有廣譜的抗病毒及免疫調節(jié)活性[7]。
IFN-α屬于I型干擾素,具有高度的同源性和明顯的種族特異性,人的干擾素由約165個氨基酸殘基組成,分子量約為19 kD[8-9],主要由B淋巴細胞及部分巨噬細胞產生[10]。IFN-α可以通過增強NK細胞活性、促進B細胞增生來提高體液免疫活性,實現(xiàn)一定的抗病毒作用。此外,IFN-α可上調Th細胞上白細胞介素受體、主要組織相容性復合體 I、Ⅱ類分子的表達,增強CD8+細胞毒性T細胞應答,通過多種病毒相互作用途徑調節(jié)免疫活性[11]。由于IFN-α具有良好抗病毒及免疫調節(jié)作用,近年來被廣泛應用于臨床[12-14],如抗病毒、抗腫瘤、免疫調節(jié)等[15]。
小反芻獸疫病毒(peste des petits ruminants virus,PPRV),屬于副黏病毒科、麻疹病毒屬,是一種單股負鏈RNA病毒,主要感染山羊、綿羊等小反芻動物[16],給全球畜牧業(yè)的發(fā)展帶來嚴重的損失[17]。本研究將羊α干擾素基因序列進行優(yōu)化合成,利用桿狀病毒表達系統(tǒng)在家蠶中進行表達,根據細胞病變抑制法在BHK-VSV*GFP系統(tǒng)中檢測其抗病毒活性,并對其抑制小反芻獸疫病毒增殖活性進行測定。
大腸桿菌(Escherichia coli)感受態(tài)細胞Trans 5α購自北京全式金生物技術有限公司;高保真DNA聚合酶購自南京諾唯贊生物科技有限公司;BamH I、EcoR I限制性內切酶、T4DNA連接酶、DNA Marker購自Thermo Scientific公司;實驗用家蠶(JY1)來自中國農業(yè)科學院蠶業(yè)研究所;脂質體購自Invitrogen公司;DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清(FBS)購自Gibco公司;病毒基因組提取試劑盒、質粒提取試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自北京天根生化科技有限公司;桿狀病毒轉移載體pVL1393、失活拯救型穿梭質粒reBmBac、家蠶卵巢細胞系(BmN)、重組表達綠色熒光蛋白的水皰型口炎病毒(VSV- GFP)、幼地鼠腎細胞(BHK)皆由本實驗室保存;小反芻獸疫病毒疫苗(Clone9株)購自天康生物技術有限公司;其他試劑均為國產或進口分析純。
1.2.1 目的基因的優(yōu)化合成 從GenBank數(shù)據庫中查找目前已公布的羊α干擾素所有亞型的氨基酸序列,利用MEGA軟件[18]進行序列比對,篩選最優(yōu)氨基酸序列,并通過SignalP、TMHMM軟件對其進行信號肽預測及跨膜區(qū)分析,選擇分泌效率高的信號肽序列。根據家蠶密碼子偏好性對相應基因序列進行優(yōu)化合成,在其上游添加Kozak序列提高翻譯效率,下游添加終止密碼子終止翻譯。利用DNAMAN進行酶切位點分析后,將該序列5′端添加BamH I酶切位點,3′端添加EcoR I酶切位點便于克隆操作,優(yōu)化后的序列交由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。合成后的基因序列連接在pUC57載體上,命名為pUC57-OviIFN-α。
1.2.2 pVL1393-OviIFN-α轉移載體的構建 將合成后的質粒pUC57-OviIFN-α及桿狀病毒轉移載體pVL1393利用 BamH I、EcoR I于 37℃酶切 30 min,pUC57- OviIFN-α酶切產物經瓊脂糖凝膠電泳將大小不同的片段分離,用膠回收試劑盒回收OviIFN-α基因片段。pVL1393酶切產物經85℃滅活10 min后,與OviIFN-α片段以1∶6的比例混合,在T4DNA連接酶的作用下,于25℃連接10 min,轉化大腸桿菌Trans 5α感受態(tài)細胞,在含有氨芐抗性(60 μg/mL)的LB固體培養(yǎng)基中篩選陽性菌落。挑取單菌落于4.5 mL含有相同濃度氨芐的LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)約12 h,利用質粒提取試劑盒提取質粒,并用BamH I、EcoR I對重組質粒進行酶切鑒定,鑒定正確的質粒送至北京睿博興科生物技術有限公司測序,并將其命名為pVL1393-OviIFN-α。
1.2.3 重組桿狀病毒的構建及在家蠶中的表達 將轉移載體pVL1393-OviIFN-α與失活拯救型穿梭質粒reBmBac利用脂質體介導的轉染法共轉染家蠶BmN細胞,于27℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)約5.5 d,待大量細胞病變后收取細胞培養(yǎng)液,即重組病毒,置于4℃保存,經毒株純化實驗后,保存為毒種。將重組病毒液按照105PFU /頭注射5齡起蠶,同時設置親本病毒感染的家蠶作為對照,待達到家蠶預期的表達高峰時收取表達產物。利用試劑盒提取蠶血淋巴中的基因組DNA,設計引物對病毒基因組DNA中OviIFN-α部分片段進行PCR鑒定。上游引物 5′-CTGCGACTTGCCACACAACCAC-3′;下游引物5′-TTACGGTGAAGCCAAATCGCCG-3′,預期擴增出片段大小為520 bp。
1.2.4 重組羊干擾素α的抗病毒活性檢測 將表達樣品用PBS稀釋10倍后進行超聲破碎,12 000 r/min離心10 min,取上清液用0.22 μm的濾膜過濾,在BHK細胞中利用微量細胞病變抑制法檢測干擾素對VSV病毒復制的抑制作用,具體操作步驟參考文獻[19]中的方法。根據VSV*GFP在495 nm處有吸收峰的特點,在顯微鏡中對各組熒光情況進行觀察并統(tǒng)計,利用Reed-Muench法計算干擾素的抗病毒活性。
1.2.5 PPRV病毒滴度測定 將BHK細胞以104cell/孔鋪于96孔板中,置于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h,將PPRV疫苗株從10-1進行10倍倍比稀釋至10-10,每孔100 μL加到上述96孔板中,同時設置空白細胞對照組,每天通過光學顯微鏡觀察細胞狀態(tài),利用Reed-Muench法計算PPRV病毒的TCID50。
1.2.6 干擾素抑制PPRV增殖活性檢測 將表達樣品以適當倍數(shù)稀釋后以上述1.2.4中的方法在BHK細胞中孵育24 h,棄掉上清液,加入100 TCID50的PPRV 疫苗株病毒,于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)約36 h,觀察細胞狀態(tài),待病毒對照組全部發(fā)病時開始記錄,通過Reed-Muench法計算羊α干擾素半數(shù)抑制PPRV所需的單位數(shù)。
將查找的羊α干擾素氨基酸序列進行序列比對發(fā)現(xiàn),序列號為CAA41790.1及CAA41791.1的氨基酸序列與其它亞型一致性較高。對其進行信號肽預測及跨膜區(qū)分析顯示,其1-23位為信號肽,無跨膜區(qū)。我們選擇登錄號為CAA41790.1的信號肽,其余序列選擇登錄號為CAA41791.1的氨基酸序列。羊α干擾素由195個氨基酸組成,根據家蠶密碼子偏好性對相應基因序列進行優(yōu)化,去除原始序列中高GC含量區(qū),使得GC含量達到49.92%。CAI值為0.94,表明該基因序列的密碼子使用情況較為理想,優(yōu)化后的基因序列包含588個堿基。將合成的OviIFN-α經過BamH I、EcoR I雙酶切后連接在轉移載體pVL1393上,經轉化、挑斑篩選出陽性菌落,提質粒進行酶切鑒定,鑒定結果如圖1所示,在580 bp及大于9 600 bp附近分別出現(xiàn)清晰條帶,與預期結果一致。將其送至北京睿博興科生物技術有限公司測序,測序結果與目的序列相符,表明成功構建pVL1393-OviIFN-α轉移載體。
圖1 重組質粒的酶切鑒定Fig. 1 Enzyme digestion identification of recombinant plasmid
為了確定目的基因是否成功重組到桿狀病毒基因組中,并能在家蠶中復制,將羊α干擾素處理組及對照組家蠶的表達產物提取病毒基因組DNA,并設計引物進行PCR擴增,結果如圖2所示,以OviIFN-α樣品基因組DNA為模板時,PCR擴增出與預期大小一致的清晰條帶,而對照中則沒有條帶出現(xiàn),表明目的基因成功重組到桿狀病毒基因組中。
圖2 重組病毒感染家蠶后蠶血淋巴中目的基因的PCR鑒定Fig.2 PCR identification of the target gene in the hemolymph of the silkworm infected with the recombinant virus
采用微量細胞病變抑制法對羊α干擾素抑制VSV病毒活性進行檢測,當100 TCID50單位的VSV病毒感染細胞后,在熒光顯微鏡下可以觀察到綠色熒光(圖3-C),加入少量干擾素時可部分抑制病毒感染,顯微鏡中會出現(xiàn)少量熒光(圖3-B),而當干擾素濃度較高時能完全抑制病毒復制,則不會有熒光出現(xiàn)(圖3-A),空白細胞對照組同樣不會出現(xiàn)熒光(圖3-D)。我們從病毒對照組8個復孔全部發(fā)病時開始記錄,其結果如表1所示,當蠶血樣品稀釋1.0×104倍時能夠完全抑制VSV*GFP病毒感染,無熒光蛋白產生;稀釋4.0×104倍時不能完全抑制病毒感染,部分產生熒光蛋白,稀釋3.2×105倍時已不能抑制病毒感染,復孔中都有大量熒光蛋白產生,經統(tǒng)計后其熒光產生情況如表1所示,利用Reed-Muench法對其抗病毒效價進行計算。通過多次實驗得出重組羊α干擾素的表達量為6.5×105U/mL左右。
表1 重組羊α干擾素在BHK細胞中抑制VSV*GFP病毒活性檢測Table 1 Recombinant goat interferon alpha inhibits VSV*GFP virus activity in BHK cells
圖3 不同濃度干擾素處理組后BHK細胞感染VSV增殖情況Fig. 3 Proliferation of BHK cells infected with VSV after treatment with different concentrations of interferon
PPRV感染BHK細胞36 h時,出現(xiàn)明顯的細胞病變效應(cytopathic effect,CPE),細胞收縮,形態(tài)發(fā)生改變,并出現(xiàn)聚集現(xiàn)象,形成合胞體。觀察各孔細胞病變情況并記錄,結果如表2所示,利用Reed-Muench法計算其TCID50,為每1 mL 106TCID50。
表2 PPRV的TCID50測定結果Table 2 TCID50 measurement results of PPRV
將不同濃度的羊α干擾素用于抑制PPRV病毒在BHK細胞中的復制,抑制情況分為以下4種:PPRV感染BHK細胞病毒后,出現(xiàn)明顯的合胞體(圖4-A);當加入干擾素能完全抑制PPRV增殖,細胞不發(fā)生病變(圖4-B);當干擾素能部分抑制PPRV復制時,細胞出現(xiàn)少量合胞體;空白細胞對照組則不會發(fā)生病變(圖4-C)。以病毒組復孔半數(shù)發(fā)生病變?yōu)槠瘘c開始觀察,以病毒組復孔全部發(fā)生病變?yōu)榻y(tǒng)計終點,記錄合胞體出現(xiàn)情況,利用Reed-Muench法對羊α干擾素抑制PPRV病毒效價進行計算。結果顯示,干擾素對PPRV復制的半抑制濃度IC50為 136.93 U。
圖4 羊α干擾素抑制BHK細胞感染PPRV增殖效果圖Fig. 4 Effects of OviIFNα on inhibiting the proliferation of BHK cells infected with PPRV
家蠶桿狀病毒表達系統(tǒng)是目前廣泛應用于表達外源蛋白的真核表達系統(tǒng),本研究利用本實驗室構建的家蠶桿狀病毒表達系統(tǒng)[20]表達羊α干擾素。該系統(tǒng)將家蠶桿狀病毒BmNPV進行基因修飾,并缺失其復制所必須的ORF1629基因,構建相應的失活拯救型穿梭載體pVL1393,使得共轉染時只有外源基因插入的桿狀病毒才能進行復制,該策略使重組效率理論上提高到100%,為羊α干擾素的高效表達奠定了基礎。另外,相對于原核表達系統(tǒng)來說,家蠶桿狀病毒表達系統(tǒng)作為真核表達系統(tǒng),具有乙酰化、糖基化等翻譯后修飾功能,產物結構與天然蛋白相似,有利于生產具有更高比活的羊α干擾素。本研究利用家蠶桿狀病毒表達系統(tǒng)表達的羊α干擾素,在BHK-VSV*GFP系統(tǒng)中檢測到其表達量可達6.5×105U/mL。由于本實驗室在之前的豬、雞、犬等干擾素的活性檢測實驗中發(fā)現(xiàn),家蠶幼蟲或蠶蛹的蛋白,正常桿狀病毒及其表達產物在細胞病變抑制法中都無抗病毒活性[20-21],因此在檢測干擾素抗病毒活性時,沒有設置正常蠶血組作為對照。此外,由于羊α干擾素具有很強的種屬特異性,該抑制實驗應當在相應羊來源細胞系進行,但由于成熟的羊來源的細胞系較為稀少,故先選擇鼠源細胞(BHK)進行抑制實驗,因此,該干擾素在羊來源細胞中對病毒復制的抑制效果仍需進一步確認。
信號肽在外源蛋白的分泌時發(fā)揮重要作用,它能引導新生肽段穿越真核生物的內質網膜,避免產物大量聚集在細胞中,影響細胞活性。因此,在家蠶桿狀病毒表達系統(tǒng)中表達羊α干擾素時需要保留信號肽序列。但不同的信號肽序列有不同的分泌和切割能力,通過查找GenBank中羊α干擾素不同亞型的信號肽序列,根據信號肽剪切位點得分及S值變化趨勢,篩選出分泌效率高的信號肽序列登錄號為(CAA41790.1)用于本次表達實驗。
I型干擾素是機體固有免疫應答中一類重要的細胞因子,具有廣譜的抗病毒及抗腫瘤等作用[22]。干擾素α屬于I型干擾素中重要的一種,它既能抑制病毒復制,又能調節(jié)宿主免疫功能,其對各種類型細胞的功能都有廣泛的影響。研究表明,病毒感染早期給予外源性IFN-α,可以激活干擾素誘導的抗病毒狀態(tài),并使NK細胞表達穿孔素和顆粒酶A,從而增加宿主抗病毒的能力[23]。因此,本實驗選擇α干擾素進行抗病毒活性研究,表達具有高效、廣譜抗病毒活性的羊α干擾素。
多年來,小反芻獸疫疫情不斷在國內及周邊國家出現(xiàn),對全球的羊養(yǎng)殖業(yè)造成了極大的威脅,減毒活疫苗是目前市場上常用的方法,但其具有安全性低,不能區(qū)分自然感染動物與免疫動物等缺點,為小反芻獸疫疫情的防控帶來了很大的困難,而干擾素具有毒副作用小、抗原性弱,可反復使用等優(yōu)點,對病毒性感染引起的疫情防控具有積極地作用。近年來,干擾素已經被廣泛用于多種動物的抗病毒作用研究,并取得了一定的進展,目前市場上商品化的豬、犬、雞等重組干擾素產品已應用于實踐。本實驗將羊α干擾素用于抑制小反芻獸疫病毒增殖研究,結果顯示僅需136.93 U就可以對PPRV 病毒的復制產生明顯的抑制作用,該結果有望為小反芻獸疫疫情防控提供新的方法。
本研究利用家蠶桿狀病毒表達系統(tǒng)表達了羊α干擾素,經BHK-VSV*GFP系統(tǒng)檢測到該干擾素具有較強的抗病毒活性,為大量生產廉價且高效的羊α干擾素提供了一種新的方法。另外,該干擾素在對PPRV病毒的抑制實驗中顯示出較強的抗病毒作用,為干擾素用于PPRV疫情的防控提供了理論基礎。