衡先培,王志塔,李 亮,黃蘇萍,楊柳清
(1.福建中醫(yī)藥大學(xué)附屬人民醫(yī)院,福建 福州 350004;2.福建中醫(yī)藥大學(xué),福建 福州 350122)
糖尿病不僅是糖脂代謝病,也是氨基酸代謝病,無論糖尿病的發(fā)病、進(jìn)展及預(yù)后,都與氨基酸代謝密切相關(guān)[1-2]。氨基酸代謝不但與糖脂代謝密切相關(guān),也與基因和蛋白質(zhì)代謝密不可分。由于氨基酸是蛋白質(zhì)的基礎(chǔ),蛋白質(zhì)是構(gòu)建人體組織器官、維護(hù)器官功能的基本要素,對人體生理、病理具有關(guān)鍵的影響,氨基酸代謝異??蓪?dǎo)致患者生活質(zhì)量與健康顯著下降?;瘜W(xué)藥物強化治療雖能有效改善血糖、血脂、血壓等客觀指標(biāo),但不能改善氨基酸代謝,甚至存在惡化氨基酸代謝的風(fēng)險[3]。臨床研究表明,痰瘀同治丹瓜方可改善糖尿病患者的糖脂代謝,降低高危糖尿病患者冠心病發(fā)病和全因不良風(fēng)險,同時也提高患者生活質(zhì)量[4]。由于氨基酸代謝與蛋白質(zhì)代謝之間存在著密切關(guān)系,提示痰瘀同治法的療效可能與改善氨基酸代謝有關(guān)。因此,本研究基于蛋白質(zhì)及磷酸化代謝組學(xué),探討丹瓜方對氨基酸代謝的影響。
1.1 實驗動物 7周齡SPF級雄性SD大鼠,體質(zhì)量(311±11)g,購于上海斯萊克實驗動物有限責(zé)任公司,許可證編號:SCXK(滬)2017-0005。飼養(yǎng)環(huán)境:溫度(22±1)℃,濕度(50±5)%,自由攝食。動物實驗遵守倫理原則,符合國家及相關(guān)部門有關(guān)實驗動物保護(hù)與使用準(zhǔn)則,善待動物。
1.2 實驗藥物 丹瓜方(國家發(fā)明專利號:2014 10599300.6)由丹參、栝蔞、赤芍、法半夏、僵蠶、薤白組成。
1.3 實驗試劑 鏈脲佐菌素(STZ)、碘代乙酰胺、二硫蘇糖醇、尿素、三乙基碳酸氫銨(美國Sigma公司);蛋白酶抑制劑(Calbiochem公司);胰酶(Promega公司);乙腈(Fisher Chemical公司);超純水、三氟乙酸(Sigma-Aldrich公司);甲酸(Fluka公司);EDTA、Ethidium Bromide、MOPS(華 美 生 物 工 程公司)。
1.4 實驗儀器 小型垂直電泳槽、電泳儀、IMARK酶標(biāo)儀(美國Bio-Rad公司);300 Extend C18色譜柱(美國Agilent公司);分析柱和Acclaim?PepMap?100 C18液相色譜柱(164568)、SpeedVac濃縮器、Heraeus Multifuge X1R臺式高速冷凍離心機(美國ThermoFisher Scientific公司);JY92-ⅡN高強度超聲波處理器(寧波新芝生物科技股份有限公司);High pH reverse-phase HPLC(L3000)(中國RIGOL Technologies);TS-200脫色搖床(江蘇海門其林貝爾儀器制造有限公司);DK-8D型電熱恒溫水槽(上海森信實驗儀器有限公司);Velocity 18R臺式冷凍離心機(英國Dynamica公司);timsTOF Pro質(zhì)譜儀(德國Bruker公司);CR2032微量血糖測試儀(德國BAYER公司);光學(xué)顯微鏡(德國Leica公司)。
2.1 造模與分組 SD大鼠適應(yīng)性飼養(yǎng)1周后進(jìn)行口服葡萄糖耐量試驗(OGTT),選取空腹血糖(FBG)<6.1 mmol/L、2小時血糖(2 h PBG)<7.8 mmol/L的大鼠。以空腹體質(zhì)量分層,按PBG由高到低,以1∶2隨機分為對照組和造模組。對照組飼以普通飼料,造模組飼以高脂高糖飼料(配方:精煉豬油10%,膽固醇2%,豬膽鹽0.3%,蔗糖20%,常規(guī)飼料67.7%)。4周后,造模組再做OGTT,以空腹體質(zhì)量分層,按PBG由高到低,以1∶1隨機分為模型組和丹瓜方組。丹瓜方組按20.5 g/(kg·d)以丹瓜方灌胃液灌胃,模型組用清潔自來水灌胃,每日1次。3組均繼續(xù)喂食各自原有飼料。根據(jù)既往實驗,用藥物干預(yù)10周后,禁食但不禁水12 h取標(biāo)本。根據(jù)體質(zhì)量與血糖,每組隨機取6只大鼠采血和取肝組織,用于本研究的指標(biāo)測定。
2.2 口服葡萄糖負(fù)荷試驗 大鼠禁食不禁水8~10 h后,鼠尾尖取血,用微量血糖儀測FBG后,按葡萄糖2 g/kg以50%的葡萄糖注射液灌胃并記錄灌胃時間,2 h后再次測2 h PBG。
2.3 生化檢測 采用常規(guī)生化法檢測血漿膽固醇(TC)、甘油三脂(TG)。
2.4 肝組織染色 分別采用HE染色、油紅O脂肪染色和Masson染色觀察各組大鼠肝組織。HE染色:組織洗滌,石蠟包埋,切片,脫蠟,蘇木素浸染,1%鹽酸酒精分藍(lán),自來水浸泡返藍(lán),伊紅浸染,浸洗,樹脂封片。Masson染色:石蠟切片,脫蠟,切片鉻化處理,自來水浸洗至黃色消失后,再用蒸餾水滴注洗滌,加入Regaud蘇木精染液,充分水洗,加入Masson麗春紅酸性復(fù)紅液,洗滌,1%磷鉬酸水溶液分化,苯胺藍(lán)染色,0.2%冰醋酸水溶液浸洗,脫水透明,中性樹膠封片。油紅O染色:冰凍切片,厚度10μm,70%乙醇固定,蒸餾水洗滌,油紅稀釋液染,避光,密封,加入60%乙醇,蒸餾水洗滌,蘇木素復(fù)染,蒸餾水洗滌,甘油明膠封片。
2.5 LC-MS/MS分析 取每只大鼠的肝標(biāo)本50 mg,將同一組的2個標(biāo)本放入研磨器中用液氮研磨。每組的3個樣品含有6個大鼠的肝組織樣本,用于蛋白質(zhì)提取和磷酸化修飾的非標(biāo)記定量組學(xué)分析。胰蛋白酶消化后,根據(jù)商家提供的說明書進(jìn)行機上檢測。技術(shù)路線:蛋白質(zhì)提取→胰蛋白酶消化→親和富集→LC-MS/MS分析→數(shù)據(jù)庫搜索→生物信息學(xué)分析。亞細(xì)胞定位用Wolfpsort庫(v.0.2,http://www.genscript.com/psort/wolf_psort.html),富集分析用Perl module庫(v.1.31,https://metacpan.org/pod/Text::NSP::Measures::2D::Fisher),GO注釋用InterProScan庫(v.5.14-53.0,http://www.ebi.ac.uk/interpro/)。
2.6 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。計量資料屬正態(tài)分布者用(±s)表示,多樣本兩兩比較采用單因素方差分析。
3.1 3組大鼠血糖、血脂指標(biāo)比較 模型組2 h PBG、TG和TC均明顯高于對照組(P<0.01);丹瓜方組2 h PBG、TG、TC均明顯低于模型組(P<0.05,P<0.01),見表1。
表1 3組大鼠血糖、血脂指標(biāo)比較(±s) mmol/L
表1 3組大鼠血糖、血脂指標(biāo)比較(±s) mmol/L
注:與對照組比較,1)P<0.01;與模型組比較,2)P<0.05,3)P<0.01。
TC 2.35±0.32 5.99±0.681)5.06±0.413)組別對照組模型組丹瓜方組n6 6 6 FBG 6.05±0.30 6.26±0.43 6.06±0.56 2 h PBG 6.58±0.43 8.00±0.801)7.38±0.192)TG 1.07±0.22 1.80±0.201)1.49±0.192)
3.2 3組大鼠肝組織病理形態(tài) 正常組肝臟呈暗褐色,肝細(xì)胞結(jié)構(gòu)正常,胞核分布均勻,僅在匯管區(qū)有少量藍(lán)色纖維組織染色和細(xì)粒狀脂肪染色。模型組肝臟呈嫩白色,肝細(xì)胞空泡狀且分布不均,胞核邊移,藍(lán)色纖維組織呈網(wǎng)狀,紅色大脂滴滿布。丹瓜方組肝臟呈褐紅色,肝細(xì)胞結(jié)構(gòu)清楚,胞核分布均勻,匯管區(qū)呈蟹足樣纖維染色,中小脂滴較多。見圖1。
圖1 3組大鼠肝組織病理形態(tài)圖
3.3 丹瓜方對差異表達(dá)蛋白亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)定位的影響 如圖2A所示,模型組與對照組的差異表達(dá)顯著性蛋白涉及細(xì)胞質(zhì)、線粒體、細(xì)胞核、質(zhì)膜及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等。如圖2B所示,丹瓜方組與模型組的差異表達(dá)蛋白出現(xiàn)在細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì),尤其是線粒體和質(zhì)膜。這些膜結(jié)構(gòu)及其功能,都與氨基酸與蛋白質(zhì)代謝密切相關(guān)。此外,丹瓜方組還能影響細(xì)胞骨架蛋白(cytoskeleton)的表達(dá)。由于蛋白質(zhì)由氨基酸構(gòu)成,表明丹瓜方可能影響糖脂代謝異常大鼠的氨基酸代謝,并可能由此改善蛋白質(zhì)代謝。
圖2 LC-MS/MS分析亞細(xì)胞定位餅圖
3.4 丹瓜方對生物學(xué)進(jìn)程的影響 如圖3A所示,丹瓜方不但可顯著影響肝組織甘油脂生物合成過程(glycerolipid biosynthetic process)、磷脂生物合成過程(phospholipid biosynthetic process)、甘油磷脂代謝過程(glycerophospholipid metabolic process)、磷脂代謝過程(phospholipid metabolic process)、甘油脂代謝過程(glycerolipid metabolic process)等糖脂的代謝進(jìn)程,而且也能調(diào)節(jié)包括細(xì)胞生長(regulation of cell growth)、細(xì)胞形態(tài)發(fā)生(regulation of cell morphogenesis)、心臟發(fā)育(heart development)、超分子纖維組織(regulation of supramolecular fiber organization)、骨骼發(fā)育(bone development)等。尤其是正調(diào)控細(xì)胞發(fā)育(positive regulation of cell development)、促進(jìn)蛋白質(zhì)寡聚化(protein oligomerization)和正調(diào)控轉(zhuǎn)移酶活性(positive regulation of transferase activity),都表明丹瓜方能加強蛋白質(zhì)的功能,促進(jìn)細(xì)胞發(fā)展,這些都離不開充分合理的氨基酸代謝,進(jìn)一步提示丹瓜方可能通過改善氨基酸代謝,以改善蛋白質(zhì)代謝及細(xì)胞功能。在圖3B的磷酸化組學(xué)中,丹瓜方顯著調(diào)控組織再生(tissue regeneration)、肽轉(zhuǎn)運(peptide transport)、酰胺轉(zhuǎn)運(amide transport),都與氨基酸代謝密切關(guān)聯(lián),表明此觀點與事實相符。
圖3 生物學(xué)進(jìn)程功能富集圖
3.5 丹瓜方對氨基酸代謝調(diào)控分析 從表2的COG功能條目中可以看出,涉及能量產(chǎn)生與轉(zhuǎn)化、碳水化合物的運輸與代謝、核苷酸轉(zhuǎn)運與代謝、酶轉(zhuǎn)運與代謝、脂肪轉(zhuǎn)運與代謝、無機離子轉(zhuǎn)運與代謝、次生代謝物的生物合成、轉(zhuǎn)運和分解代謝以及氨基酸的轉(zhuǎn)運與代謝,模型組都有多個功能蛋白發(fā)生顯著性差異表達(dá)和差異磷酸化。經(jīng)過丹瓜方干預(yù)后,其中大部分條目都有不同數(shù)量功能蛋白對模型組發(fā)生差異化表達(dá)。其中涉及氨基酸轉(zhuǎn)運與代謝的差異表達(dá)蛋白有4個(D3ZPY2、Q68FT5、P10860、D4A904),差異磷酸化蛋白有2個(P10860、D4A904),見表3。
表2 COG分類功能條目在丹瓜方干預(yù)后的差異表達(dá)蛋白個數(shù)
表3 氨基酸轉(zhuǎn)運與代謝差顯調(diào)節(jié)蛋白
氨基酸是蛋白質(zhì)的基本構(gòu)成單位,蛋白質(zhì)是生命活動的基本要素。人體組織器官的基本構(gòu)架都以蛋白質(zhì)為主體,人體的功能活動本質(zhì)上是蛋白質(zhì)功能的宏觀體現(xiàn)。糖尿病患者氨基酸代謝異常,必然伴隨著不同程度的組織蛋白質(zhì)合成障礙,同時也導(dǎo)致功能蛋白質(zhì)的異常。這些功能蛋白質(zhì)包括各種酶、激素、抗體與受體、神經(jīng)遞質(zhì)等,調(diào)控人體的各種功能及代謝,是影響患者生活質(zhì)量的關(guān)鍵因素。
大量研究表明,糖尿病伴隨氨基酸代謝異常,并且是影響糖尿病心血管事件及全因終點的獨立危險因素[2]。研究表明,2型糖尿病患者尿氨基酸排泄水平顯著升高,其中尿苯丙氨酸、精氨酸、色氨酸、酪氨酸和半胱氨酸的排泄顯著高于健康對照[5]。臨床研究發(fā)現(xiàn),2型糖尿病患者循環(huán)血液中的γ-氨基丁酸(GABA)(可由谷氨酸轉(zhuǎn)化而來)、精氨酸、谷氨酰胺和磷酸乙醇胺濃度顯著降低,而纈氨酸水平高于對照組。IGT組GABA水平降低,酪氨酸濃度升高。血漿必需氨基酸水平與空腹及激發(fā)后血糖、空腹C肽、HOMA胰島素抵抗、空腹胰高血糖素水平呈正相關(guān)[6]。2型糖尿病患者標(biāo)準(zhǔn)餐后150 min外周血中絲氨酸、鳥氨酸水平顯著低于健康對照組,而苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、亮氨酸、異亮氨酸水平高于正常對照組[7]。
在2019年,有研究者對475例2型糖尿病患者進(jìn)行了為期6年的隊列研究,發(fā)現(xiàn)甘氨酸水平位于最高分位的人群,5年新發(fā)為糖尿病的風(fēng)險比最低分位的人群降低了76%。支鏈氨基酸、芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸)水平較高的研究對象5年新發(fā)糖尿病的風(fēng)險明顯較高,而甘氨酸水平較高的研究對象5年新發(fā)糖尿病的風(fēng)險明顯較低[1]。另一項臨床研究結(jié)果也顯示,血漿多種氨基酸水平的變化與糖尿病發(fā)病風(fēng)險相關(guān)[8]。因此,調(diào)節(jié)氨基酸代謝,對于防治糖尿病及提高糖尿病的治療效果,是關(guān)鍵的一環(huán)。
本研究從系統(tǒng)生物學(xué)角度,利用組學(xué)技術(shù)研究了中藥復(fù)方制劑丹瓜方對糖脂代謝紊亂模型氨基酸代謝的影響。基于表3分析可以看出,D3ZPY2蛋白的基因是Hsd3b7,主要涉及代謝途徑包括膽汁酸和膽鹽的合成與代謝,在肝臟生物化學(xué)與生物物理兩大屏障方面與氨基酸代謝密切相關(guān),同時還與氨基酸交換和相關(guān)酶活性有關(guān)[9]。國外在肥胖兒童中發(fā)現(xiàn)參與脂質(zhì)與氨基酸代謝的基因CES1、NPRR3和BHMT2發(fā)生顯著性差異表達(dá)[10]。Q68FT5蛋白的基因是Bhmt2,即甜菜堿-高半胱氨酸S-甲基轉(zhuǎn)移酶,主要影響含硫氨酸(包括結(jié)構(gòu)氨基酸蛋氨酸、胱氨酸、半胱氨酸和非結(jié)構(gòu)氨基酸高半胱氨酸),促進(jìn)這些氨基酸的合成或轉(zhuǎn)化[11]。D4A904蛋白的基因是Nags,催化谷氨酸與乙酰輔酶A進(jìn)行乙?;磻?yīng)生成N-乙酰谷氨酸的酶。N-乙酰谷氨酸(N-acetyl glutamic acid,NAG)是精氨酸內(nèi)源合成途徑的第一個合成酶,即氨基甲酰磷酸合成酶I(carbamyl phosphate synthase I,CPSI)的變構(gòu)激活劑[1],還可催化氨甲酰磷酸合成酶以調(diào)節(jié)氨基酸代謝的最后環(huán)節(jié),即尿素循環(huán)。
P10860蛋白的基因是Glud1或GDH1,即谷氨酸脫氫酶1,是一種線粒體酶,催化氨還原性固定到α-酮戊二酸上,形成谷氨酸(α-酮戊二酸+NH3+NADH++H+→谷氨酸+NAD+)。此外,GDH1還調(diào)節(jié)纈氨酸、氨基丁酸、亮氨酸代謝。在慢性疲勞綜合征中,發(fā)現(xiàn)谷氨酸/谷氨酰胺、支鏈氨基酸和一些必需氨基酸都顯著下調(diào)[12]。表2示,丹瓜方不但顯著恢復(fù)性上調(diào)GDH1的表達(dá),還顯著上調(diào)其磷酸化水平,上調(diào)其功能,可以促進(jìn)更多的糖脂代謝中間產(chǎn)物轉(zhuǎn)化為谷氨酸。在組學(xué)數(shù)據(jù)中還發(fā)現(xiàn),與谷氨酸代謝或轉(zhuǎn)化相關(guān)的多種酶蛋白都有上調(diào),包括谷氨酸-半胱氨酸連接酶催化亞基(glutamatecysteine ligase catalytic subunit)、蛋白質(zhì)谷氨酸O-甲基轉(zhuǎn)移酶(protein-glutamate O-methyltransferase)、谷氨酸-半胱氨酸調(diào)節(jié)亞基(glutamate-cysteine regulatory subunit)、線粒體谷氨酸載體1樣蛋白(A0A0G2K5L2)、富含谷氨酸的WD重復(fù)序列蛋白1(基因為Grwd1)、D-谷氨酸環(huán)化酶(D-glutamate cyclase)、谷氨酸受體2(glutamate receptor 2)、葉酰聚谷氨酸合酶(folylpolyglutamate synthase);谷氨酸代謝磷酸化上調(diào)蛋白包括谷氨酸-半胱氨酸調(diào)節(jié)亞基(glutamate-cysteine regulatory subunit)、精氨酸-谷氨酸富集蛋白(arginine and glutamate-rich protein 1)。這表明,丹瓜方可顯著上調(diào)谷氨酸的代謝。由于谷氨酸是各種氨基酸代謝或轉(zhuǎn)化的樞紐和中間環(huán)節(jié),通過谷氨酸代謝的上調(diào),進(jìn)而可影響其他多種氨基酸的代謝。
研究結(jié)果顯示,丹瓜方干預(yù)糖脂代謝異常,可直接調(diào)節(jié)蛋氨酸、胱氨酸、半胱氨酸、高半胱氨酸、精氨酸、N-乙酰谷氨酸、氨甲酰磷酸、谷氨酸的合成,尤其是通過多途徑上調(diào)谷氨酸的合成,并通過調(diào)節(jié)膽汁酸代謝和尿素循環(huán),最終影響各種氨基酸的代謝,其機制與調(diào)節(jié)D3ZPY2、Q68FT5、P10860、D4A904蛋白表達(dá)及P10860、D4A904蛋白的磷酸化有關(guān)。綜上,痰瘀同治丹瓜方顯著改善糖脂代謝紊亂模型的氨基酸代謝,這一作用有助于理解丹瓜方顯著改善糖尿病患者生活質(zhì)量和預(yù)后的機制。