基于TXNDC11 基因?qū)Ψ喊┑念A(yù)后評(píng)估價(jià)值及其免疫調(diào)節(jié)作用的生物信息學(xué)分析

趙 瑩, 趙丹玉, 劉 超

（1.錦州醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)教研室，遼寧 錦州 121001；2.遼寧中醫(yī)藥大學(xué)中西醫(yī)結(jié)合學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室，遼寧 沈陽 110847）

為了鑒定主要組織相容性復(fù)合體（major histocompatibility complex，MHC） Ⅰ類分子的糖蛋白內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)降解（endoplasmic reticulumassociated degradation，ERAD） 相關(guān)基因，利用基因陷阱誘變和CRISPR/cas9 介導(dǎo)的基因敲除技術(shù)，對(duì)人類單倍體細(xì)胞進(jìn)行全面遺傳分析，上述2 種方法均鑒定出硫氧還蛋白結(jié)構(gòu)域11 （thioredoxin domain containing 11，TXNDC11） 基因［1］。TXNDC11 是由蛋白質(zhì)編碼的基因，其本質(zhì)是一種Ⅱ型跨膜蛋白，包含5 個(gè)硫氧還蛋白（thioredoxin，TXN） 樣結(jié)構(gòu)域，主要定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中，屬于蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶家族成員之一［2］。

TXNDC11 基因可能作為一個(gè)氧化還原調(diào)節(jié)器參與雙氧化酶蛋白折疊，以多蛋白復(fù)合物的形式發(fā)揮作用［3］。TXN 系統(tǒng)和含TXN 結(jié)構(gòu)域的硫氧還蛋白結(jié)構(gòu)域蛋白質(zhì)（TXN domain containing protein，TXNDC） 家族形成了維持細(xì)胞還原環(huán)境的網(wǎng)絡(luò)［4］。利用生物信息學(xué)的手段在癌癥基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas，TCGA） 數(shù)據(jù)庫中鑒定TXNDC11 為子宮內(nèi)膜癌（uterine corpus endometrial carcinoma，UCEC） 進(jìn)展的關(guān)鍵基因，可作為婦科癌癥預(yù)后和治療的新生標(biāo)志物之一［5］。TXNDC11 作為TXNDC 家族成員用于預(yù)測(cè)肝癌的生存預(yù)后，可作為提高肝癌患者生存率的潛在治療靶點(diǎn)之一［4］。TXNDC11 在其他癌癥中的表達(dá)和功能尚未見報(bào)道，因此探討TXNDC11 在癌癥預(yù)后、進(jìn)展和治療中的作用具有重要意義。本研究綜合利用ONCOMINE 數(shù)據(jù)庫、TIMER 數(shù)據(jù)庫、基因表達(dá)譜交互分析網(wǎng)站（Gene Expression Profile Interactive Analysis，GEPIA） 數(shù)據(jù)庫和臨床蛋白質(zhì)組腫瘤分析協(xié)作組（Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium，CPTAC） 數(shù)據(jù)庫分析了泛癌組織中TXNDC11 mRNA 和蛋白表達(dá)水平的差異，初步探討其對(duì)腫瘤預(yù)后的預(yù)測(cè)價(jià)值及是否參與調(diào)節(jié)多種腫瘤相關(guān)的免疫反應(yīng)，為進(jìn)一步明確潛在的腫瘤免疫治療靶點(diǎn)提供理論依據(jù)。

1 資料與方法

1.1 ONCOMINE 數(shù)據(jù)庫分析不同腫瘤組織中TXNDC11 mRNA 表達(dá)水平ONCOMINE 數(shù)據(jù)庫（https：//www.oncomine.org） 是一個(gè)大型腫瘤基因芯片數(shù)據(jù)庫，涵蓋包括715 個(gè)數(shù)據(jù)集和867 33 個(gè)樣本，可對(duì)基因表達(dá)譜差異、特定基因表達(dá)分析和基因表達(dá)與臨床相關(guān)性等進(jìn)行分析，還可依據(jù)已知基因-藥物分析尋找可能的分子標(biāo)記物與治療靶點(diǎn)［6-7］。本研究采用ONCOMINE 數(shù)據(jù)庫檢索不同腫瘤組織和癌旁正常組織中TXNDC11 mRNA 表達(dá)水平，檢索條件設(shè)定為： ①GeneTXNDC11 ；②Analysis Type： Cancervs.Normal Analysis ；③THRESHOLD （P-Value）：P＜0.001，F(xiàn)OLD CHANGE＞1.5，GENE RANK=ALL，Data Type：ALL。

1.2 UALCAN 數(shù)據(jù)庫分析不同腫瘤組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平UALCAN 數(shù)據(jù)庫（http：//ualcan.path.uab.edu/） 是一個(gè)癌癥數(shù)據(jù)在線分析和挖掘的網(wǎng)站，可以對(duì)CPTAC 數(shù)據(jù)集進(jìn)行蛋白質(zhì)表達(dá)分析［8］。首先輸入“TXNDC11”，點(diǎn)擊Explore，分別分析乳腺癌（breast cancer，BRCA）、 卵巢癌（ovarian cancer，OV）、 結(jié)腸癌（colon adenocarcinoma，COAD）、 腎透明細(xì)胞癌（kidney renal clear cell carcinoma，KIRC）、 UCEC和肺腺癌（lung adenocarcinoma，LUAD） 組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平。

1.3 GEPIA 數(shù)據(jù)庫分析不同腫瘤組織的病理分期登錄GEPIA 在線數(shù)據(jù)庫（http：//gepia.cancer-pku.cn/）［9］，選擇Stage Plot 模塊，輸入“GENE： TXNDC11”，log2（TPM+1） for logscale 轉(zhuǎn)化表達(dá)數(shù)據(jù)應(yīng)用于小提琴圖。通過GEPIA數(shù)據(jù)庫中的Stage Plot 模塊獲得多種不同病理分期（Stage Ⅰ、Stage Ⅱ、Stage Ⅲ和Stage Ⅳ） 腫瘤組織中TXNDC11 基因表達(dá)的小提琴圖。

1.4 采用Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫分析臨床不同腫瘤患者生存預(yù)后Kaplan-Meier Plotter （https：//kmplot.com/analysis/） 是一個(gè)包括LUAD［10］、OV［11］、胃腺癌（stomach adenocarcinoma，STAD）［12］和BRCA［13］患者基因表達(dá)和臨床資料的在線數(shù)據(jù)庫。為了評(píng)估特定基因的臨床預(yù)后價(jià)值，將患者樣本按照基因的中位表達(dá)（高表達(dá)與低表達(dá)） 分為2 組。利用Kaplan-Meier 生存曲線分析泛癌患者的總體生存（overall survival，OS） 率。分析不同腫瘤組織中TXNDC11 表達(dá)與OS 的關(guān)聯(lián)性，并計(jì)算95% 置信區(qū)間（95% confidence interval，95% CI）和對(duì)數(shù)秩P值的風(fēng)險(xiǎn)比（hazard ratio，HR）。

1.5 TIMER 數(shù)據(jù)庫分析腫瘤組織中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)TIMER2.0 （http：//timer.cistrome.org/） 是一個(gè)分析各種癌癥中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的在線資源數(shù)據(jù)庫［14］，應(yīng)用反卷積方法作為統(tǒng)計(jì)方法，從基因表達(dá)譜中推斷腫瘤組織中免疫細(xì)胞的浸潤(rùn)豐度。通過Cancer Exploration 模塊中的Gene_DE 分析TXNDC11 在33 種TCGA 數(shù)據(jù)庫腫瘤組織中的表達(dá)； 通過Immune Association 模塊中的Gene 分析TXNDC11 表達(dá)與免疫細(xì)胞（B 細(xì)胞、CD8+T 淋巴細(xì)胞、CD4+T 淋巴細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞） 浸潤(rùn)豐度的相關(guān)性。

1.6 SangerBox 數(shù)據(jù)庫分析免疫檢查點(diǎn)基因?qū)ΤＲ姷?7 個(gè)免疫檢查點(diǎn)基因進(jìn)行整理［15］，使用SangerBox 數(shù)據(jù)庫（http：//www.sangerbox.com/） 中R 軟件包分析TXNDC11 與免疫檢查點(diǎn)基因之間的相關(guān)性，并用熱圖呈現(xiàn)TXNDC11 與免疫檢查點(diǎn)基因的相關(guān)性。

1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析采用R 軟件包（3.6.3 版本） 進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。不同腫瘤組織和癌旁組織中TXNC11 mRNA 和蛋白表達(dá)水平呈正態(tài)分布，組間比較采用Student’t檢驗(yàn)；采用Kaplan-Meier 生存曲線評(píng)估TXNDC11 低表達(dá)組和高表達(dá)組患者OS 率（近似服從正態(tài)分布），采用Survival 軟件包（3.2-10 版本） 對(duì)患者生存資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，2 組間比較采用log-rank 檢驗(yàn)；采用GSVA 軟件包（1.34.0 版本） 對(duì)TXNDC11 基因表達(dá)與免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，TXNDC11 與免疫細(xì)胞關(guān)聯(lián)性指標(biāo)不服從正態(tài)分布，2 組間比較采用Spearman 相關(guān)性檢驗(yàn)；采用Psych 軟件（2.1.6 版本） 對(duì)TXNDC11 基因表達(dá)與免疫檢查點(diǎn)的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，TXNDC11 與免疫檢查點(diǎn)主要相關(guān)基因的關(guān)聯(lián)性指標(biāo)符合正態(tài)分布，2 組間比較采用Pearson 相關(guān)性檢驗(yàn)。以P＜0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié) 果

2.1 泛癌組織中TXNDC11 mRNA 和蛋白表達(dá)水平利用ONCOMINE 在線數(shù)據(jù)庫分析20 個(gè)不同癌組織中TXNDC11 mRNA 表達(dá)水平，對(duì)比不同實(shí)體瘤組織與癌旁正常組織中TXNDC11 基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，與癌旁正常組織比較，COAD、STAD 和肉瘤（sarcoma，SARC） 組織中TXNDC11 mRNA表達(dá)水平明顯降低（P＜0.01），而BRCA、 食管癌（esophageal carcinoma，ESCA）、腎嫌色細(xì)胞癌（kidney chromophobe，KICH） 和胰腺癌（pancreatic adenocarcinoma，PAAD）組織中TXNDC11 mRNA 表達(dá)水平明顯升高（P＜0.01）。采用TIMER 數(shù)據(jù)庫分析33 種泛癌組織中TXNDC11 mRNA 表 達(dá)水平，BRCA、 膽管癌（cholangiocarcinoma，CHOL）、ESCA、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤（giloblastoma multiforme，GBM）、頭頸鱗狀細(xì)胞癌（head and neck squamous cell carcinoma，HNSC） 和前列腺癌（prostate adenocarcinoma，PRAD） 組織中TXNDC11 mRNA 表達(dá)水平明顯升高（P＜0.01），COAD、腎乳頭狀細(xì)胞癌（kidney renal papillary cell carcinoma，KIRP）、LUAD、肺鱗狀細(xì)胞癌（lung squamous cell carcinoma，LUSC）、嗜鉻細(xì)胞瘤和副神經(jīng)節(jié)瘤（pheochromocytoma and paraganglioma，PCPG）、直腸腺癌（rectum adenocarcinoma，READ） 和甲狀腺癌（thyroid carcinoma，THCA） 組織中TXNDC11 mRNA 表達(dá)水平明顯降低（P＜0.01）。見圖1。綜合分析ONCOMINE 和TIMER 數(shù)據(jù)庫的結(jié)果，BRCA、ESCA 和COAD 表達(dá)譜數(shù)據(jù)趨勢(shì)一致。

圖1 采用ONCOMINE（A）和TIMER（B）數(shù)據(jù)庫分析不同腫瘤組織和癌旁正常組織中TXNDC11 mRNA 表達(dá)情況Fig.1 Expressions of TXNDC11 mRNA in different tumor tissues and adjacent normal tissues analyzed by ONCOMINE（A）and TIMER（B）databases

此外，利用CPTAC 數(shù)據(jù)庫分析6 種癌組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平。與癌旁正常組織比較，KIRC 和UCEC 組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平明顯升高（P＜0.01），BRCA、OV 和COAD 組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平明顯降低（P＜0.05 或P＜0.01）。見圖2。

圖2 CPTAC 數(shù)據(jù)庫分析不同腫瘤組織和癌旁正常組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平Fig.2 Expression levels of TXNDC11 protein in different tumor tissues and adjacent normal tissue analyzed by CPTAC database

2.2 不同臨床病理分期癌癥患者癌組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平利用GEPIA 數(shù)據(jù)庫分析31 種癌癥患者癌組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與腫瘤患者臨床病理分期之間的關(guān)聯(lián)，結(jié)果表明： TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與LUAD、 OV、THCA 和UCEC 患者的臨床病理分期有密切關(guān)聯(lián)（P＜0.05 或P＜0.01）。見圖3。

圖3 不同臨床病理分期LUAD、OV、THCA 和UCEC 患者TXNDC11 蛋白表達(dá)水平Fig.3 Expression levels of TXNDC11 protein in LUAD, OV, THCA and UCEC patients with different clinicopathological stages

2.3 TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與癌癥患者生存預(yù)后的相關(guān)性為了評(píng)估TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與腫瘤患者預(yù)后的關(guān)系，采用Kaplan-Meier Plotter 數(shù)據(jù)庫研究了21 種癌組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平。在多數(shù)癌組織中，如膀胱尿路上皮癌（bladder wrothelial carcinoma，BLCA） （HR=0.71，P=0.024）、BRCA （HR=0.68，P=0.021）、ESCA（HR=0.39，P=0.005 1）、 HNSC （HR=0.72，P=0.026）、 KIRC （HR=0.41，P=0.002 6）、LUAD （HR=0.53，P＜0.001）、 READ （HR=0.34，P=0.014）、SARC（HR=0.61，P=0.016）、胸腺癌（thymoma，THYM）（HR=0.14，P=0.004 2）、 THCA （HR=0.35，P=0.04 3） 和UCEC （HR=0.36，P＜0.001），TXNDC11 高表達(dá)與患者OS 率有明顯關(guān)聯(lián)，且在上述11 種癌組織中，TXNDC11 表達(dá)水平越高，腫瘤患者OS 率越高。見圖4。

圖4 不同TXNDC11 蛋白表達(dá)水平腫瘤患者的OS 率Fig.4 OS rates of tumor patients with different TXNDC11 protein expression levels

2.4 TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與腫瘤患者免疫細(xì)胞浸潤(rùn)水平的相關(guān)性利用TIMER 數(shù)據(jù)庫評(píng)估32 種癌組織中TXNDC11 表達(dá)水平與泛癌組織免疫細(xì)胞浸潤(rùn)水平的相關(guān)性。在BLCA、 BRCA、CESC、 COAD、 HNSC、 KIRC、 LGG、 LIHC、LUSC、 OV、 PCPG、 SARC、 皮膚黑色素瘤（skin cutaneous melanoma，SKCM） 和睪丸生殖細(xì)胞瘤（testicular germ cell tumor，TGCT） 組織中，TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與關(guān)鍵免疫細(xì)胞浸潤(rùn)水平有關(guān)聯(lián)，并在免疫細(xì)胞浸潤(rùn)中表現(xiàn)出一定的調(diào)控作用。TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與14 種癌組織中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)有明顯相關(guān)性，與免疫細(xì)胞（B 細(xì)胞、CD4+T 淋巴細(xì)胞、CD8+T 淋巴細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞） 的浸潤(rùn)水平均呈明顯正相關(guān)關(guān)系（P＜0.05 或P＜0.01）。見表1。

表1 TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與14 種癌組織中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)水平的相關(guān)性Tab.1 Correlations between TXNDC11 protein expression levels and immune cell infiltration in 14 kinds of tumor tissues

使用R 語言整體分析TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與泛癌組織中免疫細(xì)胞表達(dá)水平的相關(guān)性。TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與COAD、 LUSC、HNSC、 SARC 和SKCM 腫瘤組織中的免疫細(xì)胞（活化的樹突狀細(xì)胞、B 細(xì)胞、CD8+T 淋巴細(xì)胞、細(xì)胞毒性細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞、嗜酸性粒細(xì)胞、免疫性樹突狀細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、肥大細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、 NK 細(xì)胞亞群CD56bright、 NK 細(xì)胞亞群CD56dim、 NK 細(xì)胞、漿細(xì)胞樣DC 細(xì)胞、T 淋巴細(xì)胞、輔助性T 淋巴細(xì)胞、效應(yīng)性記憶T 淋巴細(xì)胞、 濾泡輔助性T 淋巴細(xì)胞、 γδT 細(xì)胞、 Th1 細(xì)胞、 Th17 細(xì)胞、 Th2 細(xì)胞和調(diào)節(jié)性T 淋巴細(xì)胞）表達(dá)水平有明顯相關(guān)性（0＜r＜1，P＜0.01）。見圖5。

圖5 TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與泛癌組織中免疫細(xì)胞表達(dá)水平的棒棒糖圖Fig.5 Lollipop diagrams of TXNDC11 protein expression levels and immune cells in pan-cancer tissue

2.5 TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與免疫檢查點(diǎn)基因表達(dá)水平的相關(guān)性采用SangerBox 數(shù)據(jù)庫中R 軟件包對(duì)TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與免疫檢查點(diǎn)基因表達(dá)水平的相關(guān)性進(jìn)行分析。分別計(jì)算47 個(gè)免疫檢查點(diǎn)基因與TXNDC11 蛋白表達(dá)水平的相關(guān)性，在多種癌組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與多個(gè)免疫檢查點(diǎn)基因表達(dá)水平呈明顯相關(guān)關(guān)系（－ 0.38＜r＜0.38）。見圖6。

圖6 SangerBox 數(shù)據(jù)庫分析TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與免疫檢查點(diǎn)基因表達(dá)水平的相關(guān)性Fig.6 Correlations between TXNDC11 protein expression levels and gene expression levels of immune checkpoints analyzed by SangerBox database

3 討 論

腫瘤是全世界范圍內(nèi)一個(gè)主要公共衛(wèi)生問題，已成為美國(guó)第二大致死原因［16］。在中國(guó)，癌癥已經(jīng)成為患者的主要死因［17］，癌癥的發(fā)病率和死亡率逐年增加［18］。腫瘤免疫在腫瘤復(fù)發(fā)和預(yù)后中起重要作用［19］，針對(duì)腫瘤免疫的治療也作為一種新型的治療方法在臨床中得以應(yīng)用［20］?；跈z查點(diǎn)的免疫療法（如免疫檢查點(diǎn)抑制劑） 已經(jīng)徹底改變了癌癥治療策略［21-22］。免疫檢查點(diǎn)，包括刺激和抑制檢查點(diǎn)分子，是免疫系統(tǒng)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子，在自體耐受和細(xì)胞免疫中起至關(guān)重要的作用。然而一些腫瘤可以通過調(diào)節(jié)免疫檢查點(diǎn)來保護(hù)自己免受宿主免疫系統(tǒng)的攻擊［23］，因此對(duì)腫瘤免疫機(jī)制的研究具有重要意義。

本研究首先利用ONCOMINE 數(shù)據(jù)庫、TIMER 數(shù)據(jù)庫、GEPIA 數(shù)據(jù)庫和CPTAC 數(shù)據(jù)庫聯(lián)合分析了泛癌組織中TXNDC11 的表達(dá)水平，初步探討了其對(duì)腫瘤預(yù)后的預(yù)測(cè)價(jià)值。ONCOMINE在線數(shù)據(jù)庫分析顯示：在COAD、STAD 和SARC組織中TXNDC11 mRNA 表達(dá)水平明顯降低，而BRCA、 ESCA、 KICH 和PAAD 組 織 中TXNDC11 mRNA 表達(dá)水平明顯上調(diào)；TIMER 數(shù)據(jù)庫結(jié)果顯示： TXNDC11 在BRCA、 CHOL、ESCA、 GBM、 HNSC 和PRAD 組織中高表達(dá)，在COAD、 KIRP、 LUAD、 LUSC、 PCPG、READ 和THCA 組織中呈低表達(dá)；CPTAC 數(shù)據(jù)庫結(jié)果顯示：與癌旁正常組織比較，KIRC 和UCEC組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平明顯升高，BRCA、OV 和STAD 組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平明顯降低；GEPIA 在線數(shù)據(jù)庫分析，TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與LUAD、OV、THCA 和UCEC 患者的臨床分期有密切關(guān)聯(lián)，TXNDC11 在不同類型腫瘤組織中的表達(dá)水平存在差異可能反映其不同的基本功能和機(jī)制。本文作者進(jìn)一步根據(jù)TXNDC11 的表達(dá)水平將腫瘤患者分為TXNDC11 高表達(dá)組和低表達(dá)組，利用Kaplan Meier Plotter數(shù)據(jù)庫分析TXNDC11表達(dá)水平與泛癌患者預(yù)后的關(guān)系，結(jié)果顯示：TXNDC11 高 表 達(dá) 與BLCA、 BRCA、 ESCA、HNSC、 KIRC、 LUAD、 READ、 SARC、THYM、THCA 和UCEC 等11 種癌癥更好的預(yù)后有關(guān)聯(lián)，提示TXNDC11 可作為一種潛在的腫瘤標(biāo)志物預(yù)測(cè)腫瘤患者的預(yù)后，與TXNDC11 表達(dá)水平在UCEC 和LIHC 患者中的生存預(yù)后分析一致［4-5］。

TXNDC 家族參與氧化應(yīng)激的研究［2，24］很多，但TXNDC11 基因的功能還未被明確報(bào)道。本研究利用TIMER 數(shù)據(jù)庫分析顯示：TXNDC11 基因與多種腫瘤組織的免疫細(xì)胞浸潤(rùn)有明顯的相關(guān)性，在22 種癌組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與B 細(xì)胞浸潤(rùn)水平呈明顯正相關(guān)關(guān)系；此外，TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與16 種癌組織中CD4+T 淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)水平、25 種癌組織中CD8+T 淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)水平、22 種癌組織中中性粒細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的浸潤(rùn)水平及23 種癌組織中樹突狀細(xì)胞浸潤(rùn)水平呈明顯正相關(guān)關(guān)系。TIMER 數(shù)據(jù)庫結(jié)果提示：TXNDC11 參與多種腫瘤的免疫調(diào)節(jié)，尤其是在COAD、HNSC和LUSC 組織中顯示出很強(qiáng)的免疫調(diào)節(jié)潛力，表明TXNDC11 可能作為腫瘤進(jìn)展中一個(gè)關(guān)鍵的免疫調(diào)節(jié)靶點(diǎn)。

腫瘤微環(huán)境（tumor microenvironment，TME） 由腫瘤細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞（如成纖維細(xì)胞）、多種免疫細(xì)胞（包括T 淋巴細(xì)胞、NK 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞） 以及細(xì)胞外基質(zhì)（包括上述細(xì)胞釋放的生化成分） 組成［23-25］。腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞（tumor-associated macrophages，TAMs） 構(gòu)成了腫瘤微環(huán)境的可塑性和異質(zhì)性細(xì)胞群，可占某些實(shí)體腫瘤的50%［26］。TME 不僅對(duì)腫瘤的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移有重要意義，而且依賴于腫瘤細(xì)胞與周圍環(huán)境的交叉對(duì)話，影響治療效果［27-28］。正常情況下，免疫系統(tǒng)可以識(shí)別并清除TME 中的腫瘤細(xì)胞，但是腫瘤細(xì)胞為了生存和生長(zhǎng)，能夠采用不同策略，從而達(dá)到抑制人體的免疫系統(tǒng)的效果［29-30］，使其不能正常地殺傷腫瘤細(xì)胞，以至于腫瘤細(xì)胞在抗腫瘤免疫應(yīng)答的各階段得以幸免。腫瘤免疫治療主要通過重新啟動(dòng)并維持腫瘤-免疫循環(huán)程序，恢復(fù)機(jī)體正常的抗腫瘤免疫反應(yīng)，達(dá)到控制和清除腫瘤的效果［31-32］。在過去的10 年里，通過免疫療法治療癌癥取得了很大的進(jìn)步［33］。實(shí)現(xiàn)抗癌免疫的一個(gè)非常有效的方法是阻斷免疫檢查點(diǎn)途徑——癌細(xì)胞通過該機(jī)制將自己偽裝成人體的正常組分［34］。為了進(jìn)一步驗(yàn)證TXNDC11 與免疫微環(huán)境的潛在關(guān)系，本文作者探討了TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與免疫細(xì)胞和免疫檢查點(diǎn)基因表達(dá)水平的關(guān)系，結(jié)果顯示：14 種癌組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與免疫細(xì)胞表達(dá)水平呈明顯正相關(guān)關(guān)系，在HNSC、LGG、 SKCM 和TGCT 組織中TXNDC11 蛋白表達(dá)水平與絕大部分檢查點(diǎn)基因表達(dá)水平呈明顯正相關(guān)關(guān)系，在UVM 組織中與幾乎全部檢查點(diǎn)基因表達(dá)水平呈明顯正相關(guān)關(guān)系，表明TXNDC11 基因可能參與多種腫瘤的免疫調(diào)節(jié)功能。通過對(duì)免疫細(xì)胞和免疫檢查點(diǎn)基因的相關(guān)分析，結(jié)果顯示：TXNDC11 不僅是腫瘤潛在的預(yù)后預(yù)測(cè)因子，而且可能是腫瘤的免疫調(diào)節(jié)因子。

綜上所述，TXNDC11 在多種腫瘤組織中表達(dá)下調(diào)，可能是一種潛在的腫瘤預(yù)后預(yù)測(cè)因子，在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮潛在的免疫調(diào)節(jié)因子作用。本研究結(jié)果為了解泛癌中TXNDC11 的功能提供了初步的依據(jù)，但其具體的生物學(xué)作用及其機(jī)制還需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。