Y染色體單倍群SNP復(fù)合檢測(cè)體系的構(gòu)建及其在家系排查中的應(yīng)用研究

宋正陽(yáng)，王小娟，錢恩芳，師 源，董 薇，陳 飛，李彩霞，黃 江，江 麗*

1貴州醫(yī)科大學(xué)法醫(yī)學(xué)院，貴州 貴陽(yáng)550004；2公安部物證鑒定中心，法醫(yī)遺傳學(xué)公安部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京市現(xiàn)場(chǎng)物證檢驗(yàn)工程技術(shù)研究中心，現(xiàn)場(chǎng)物證溯源技術(shù)國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室，北京100038；3貴州省人民醫(yī)院法醫(yī)司法鑒定所，貴州 貴陽(yáng)550002；4泰安市公安局刑事科學(xué)技術(shù)研究所，山東 泰安271000；5黔東南州公安局，貴州 凱里556000

人類Y染色體呈父系遺傳，其中非重組區(qū)約占95%，以單倍型形式傳遞給男性后代［1］。常用遺傳標(biāo)記有Y染色體短串聯(lián)重復(fù)序列（Y chromosome short tandem repeat，Y-STR）、Y染色體單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)（Y chromosome single nucleotide polymorphism，Y-SNP）等。Y-STR基因座組成的單倍型在不同家系間具有較高多態(tài)性，廣泛用于家系排查［2-4］，為案件偵查提供線索。此外，高突變率的快速突變YSTR（rapid-mutating Y-STR，RM Y-STR）基因座［5］和高遺傳多態(tài)性的多拷貝Y-STR（multi-copy Y-STR，MC Y-STR）基因座［6］可進(jìn)一步提高對(duì)同一家系中親緣關(guān)系較近的男性個(gè)體的區(qū)分能力。一般來(lái)說(shuō)，兩男性個(gè)體間單倍型容差≥3，可排除來(lái)自于同一生物學(xué)家系，但研究發(fā)現(xiàn)在排查親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的個(gè)體時(shí)，26個(gè)Y-STR基因座容差可低至1，增加6個(gè)RM Y-STR及MC Y-STR基因座后總?cè)莶睿?［7］。因此，在實(shí)際應(yīng)用時(shí)應(yīng)綜合考慮比對(duì)樣本間存在容差的基因座數(shù)目及其步長(zhǎng)、突變率等，適當(dāng)調(diào)整閾值標(biāo)準(zhǔn)［8］。

Y-SNP在家系調(diào)查研究中也有重要應(yīng)用，其具有突變率低、隨父系遺傳等特征，突變可穩(wěn)定遺傳給男性后代，后代在祖先突變基礎(chǔ)上累積新突變［9-10］。Y染色體單倍群是指具有共同祖先來(lái)源的一組Y-SNP單倍型，其分布具有群體和地理特異性，可用于未知男性生物樣本的父系溯源［11］。國(guó)際Y染色體命名委員會(huì)（the Y chromosome consortium，YCC）將世界男性分為20個(gè)主干單倍群（A-T）［12］，其中單倍群OM175、C-M130、D-M174、N-M231約占東亞所有男性的93%，單倍群O-M175約占東亞男性的60%［13］。已有國(guó)內(nèi)外學(xué)者將Y-STR和Y-SNP聯(lián)合應(yīng)用于家系相關(guān)的研究，如Lkhagvasuren等［14］利用Y-STR和YSNP調(diào)查蒙古皇室金氏家族5具遺體之間的關(guān)系；Claerhout等［15］建立了Y-STR和Y-SNP遺傳標(biāo)記與姓氏相關(guān)的預(yù)測(cè)模型；Wang等［16］通過(guò)分析曹操同姓后代家族中Y-SNP單倍群及其分布頻率，可反推該歷史人物最可能的單倍群；錢恩芳等［17］將Y-SNP和Y-STR兩種遺傳標(biāo)記相結(jié)合應(yīng)用于家系調(diào)查，顯著提高家系認(rèn)定的可信度等。

本研究通過(guò)調(diào)研相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)及文獻(xiàn)，篩選東亞地區(qū)典型分布的Y-SNP位點(diǎn)，基于微測(cè)序技術(shù)構(gòu)建復(fù)合體系，并評(píng)估該體系在家系排查中的應(yīng)用效能。

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1 位點(diǎn)篩選及引物設(shè)計(jì)

參照2019版Y染色體譜系樹(shù)（International Society of Genetic Genealogy，ISOGG）（https：//isogg.org/tree/index.html），結(jié)合文獻(xiàn)調(diào)研篩選Y染色體主干單倍群及高頻分布于東亞地區(qū)的O-M122單倍群下游SNP位點(diǎn)。共篩選74個(gè)Y-SNP位點(diǎn)，分為兩組：①核心體系，包含主干單倍群的37個(gè)SNP位點(diǎn)（圖1A）；②O體系，包含O-M122單倍群下游分支的37個(gè)SNP位點(diǎn)（圖1B）。利用軟件Primer Premier V5.0設(shè)計(jì)PCR及延伸引物（表略，可掃OSID碼查看附表1），并由生工生物工程（上海）股份有限公司合成。

圖1 74個(gè)Y-SNP位點(diǎn)譜系樹(shù)Figure 1 Phylogenetic tree of 74 Y-SNP

1.1.2 復(fù)合擴(kuò)增、純化及分型檢測(cè)

PCR反應(yīng)體系為5 μL，包括去離子水1.05 μL，10×PCR Buffer（含Mg2+15 mmol/L）0.5 μL，25 mmol/L MgCl20.7 μL，引物混合物0.5 μL，5 U/μL Hotstar Taq Plus DNA聚合酶（Qiagen公司，德國(guó)）0.2 μL，10 mmol/L dNTP 0.05 μL，5 ng/μL模板DNA 2 μL。PCR反應(yīng)條件：95℃5 min后，94℃30 s，55℃30 s，72℃1 min，循環(huán)40次，延伸72℃10 min。向PCR產(chǎn)物中加入去離子水1.3 μL，ExoⅠ（10 U/μL）0.4 μL，SAP（1 U/μL）1 μL，10×SAP Buffer 0.3 μL進(jìn)行純化，37℃30 min，96℃10 min。

單堿基延伸反應(yīng)體系為5 μL，包含純化后PCR產(chǎn)物1.5 μL，延伸引物0.3 μL，SNaPshot Multiplex Ready Reaction Mix 2.5 μL，ddH2O 0.7 μL。循環(huán)參數(shù)：96℃10 s后，50℃5 s，60℃30 s，循環(huán)25次。向延伸產(chǎn)物中加入0.5 μL SAP（1 U/μL）進(jìn)行純化，37℃孵育1 h，75℃15 min。

利用3130xl遺傳分析儀（Thermo Fisher Scientific公司，美國(guó)）進(jìn)行電泳檢測(cè)，GeneMapper v3.2軟件（Thermo Fisher Scientific公司，美國(guó)）分析結(jié)果。

1.1.3 Y染色體單倍群判別

根據(jù)樣本在74個(gè)Y-SNP位點(diǎn)上的分型結(jié)果，依據(jù)在譜系樹(shù)中突變情況遞推判別其所屬的單倍群類型。

1.1.4性能驗(yàn)證

①準(zhǔn)確性：取男性標(biāo)準(zhǔn)品DNA 2800（Promega公司，美國(guó)）、DNA 9948（Promega公司，美國(guó)）及10份無(wú)親緣關(guān)系的男性樣本DNA，對(duì)74個(gè)Y-SNP位點(diǎn)進(jìn)行Sanger直接測(cè)序（生工生物工程股份有限公司），用于驗(yàn)證體系分型結(jié)果的準(zhǔn)確性。②靈敏度：利用Y-SNP體系分別檢測(cè)模板量為10.00、6.00、2.00、1.60、1.20、0.80、0.40、0.20、0.16、0.12、0.08、0.06、0.018 ng的男性標(biāo)準(zhǔn)品DNA 2800重復(fù)檢測(cè)3次，測(cè)試體系的靈敏度。③重復(fù)性：以檢測(cè)最優(yōu)量對(duì)男性標(biāo)準(zhǔn)品DNA 2800重復(fù)檢測(cè)3次，比較3次檢測(cè)結(jié)果的分型與出峰位置的一致性。④檢材適應(yīng)性：檢測(cè)男性FTA血卡、口腔拭子、指甲、毛發(fā)（帶毛囊）等常見(jiàn)檢材各8份，分別取10 ng進(jìn)行檢測(cè)，統(tǒng)計(jì)不同類型檢材的出峰率。⑤抗女性成分干擾：取男性標(biāo)準(zhǔn)品DNA 2800和女性標(biāo)準(zhǔn)品DNA 9947按1∶1、1∶10、1∶100的比例進(jìn)行混合，確保每管內(nèi)男性DNA 2800的濃度均為0.5 ng/μL，分別取2 μL進(jìn)行檢測(cè)并與僅存在男性成分時(shí)的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比對(duì)。⑥種屬特異性：取恒河猴、黑猩猩、雞、牛、蛇、鼠、魚(yú)、豬等非人源樣本各10 ng進(jìn)行檢測(cè)，統(tǒng)計(jì)各種屬的出峰數(shù)目。

1.2 方法

1.2.1 樣本及DNA提取與定量

本研究收集來(lái)自4個(gè)社會(huì)學(xué)家系（分別命名為P1～P4家系）共20份男性血卡樣本，其中P1家系3例，P2家系6例，P3家系6例，P4家系5例。采用QIAamp?DNA Blood Mini M48試劑盒（QIAGEN公司，德國(guó)）提取DNA，使用NanoDrop 2000c分光光度計(jì)（Thermo Fisher Scientific公司，美國(guó)）進(jìn)行定量，用去離子滅菌水稀釋至5 ng/μL待檢。本實(shí)驗(yàn)室樣本均來(lái)源于國(guó)家科技資源共享服務(wù)平臺(tái)計(jì)劃項(xiàng)目（編號(hào)：YCZYPT［2017］01-3），所有樣本對(duì)象均簽署知情同意書(shū)，本研究已通過(guò)公安部物證鑒定中心倫理委員會(huì)的倫理審查（批準(zhǔn)號(hào)：2017LLSC-005）。

1.2.2 分型檢測(cè)

所有樣本采用本研究構(gòu)建的體系按照1.1.2方法進(jìn)行Y-SNP分型檢測(cè)；采用DNA TyperTMY29試劑盒（公安部物證鑒定中心，北京）進(jìn)行Y-STR檢測(cè)，包括26個(gè)Y-STR基因座（DYS19、DYS385、DYS389Ⅰ/Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS438、DYS439、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、GATA-H4、DYS444、DYS447、DYS460、DYS481、DYS508、DYS533、DYS643、DYF387S1、DYS518、DYS449、DYS576），其中3個(gè)基因座（DYS449、DYS518、DYS576）為RM Y-STR，2個(gè)基因座（DYS385、DYS389Ⅰ/Ⅱ）為MC Y-STR，1個(gè)基因座（DYF387S1）既是RM Y-STR也是MC YSTR。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

根據(jù)Y-SNP分型結(jié)果判別樣本Y-SNP單倍群類型，統(tǒng)計(jì)家系內(nèi)Y-SNP單倍群分布情況。以家系內(nèi)成員中共享人數(shù)最多的單倍型為參考，統(tǒng)計(jì)家系內(nèi)Y-STR單倍型分布情況及不同單倍型之間的容差和累計(jì)突變步長(zhǎng)?；?3個(gè)單拷貝Y-STR基因座分型，根據(jù)Median-Joining方法，使用Network v10.0和Network Publisher軟件分別對(duì)4個(gè)家系中YSTR單倍型變異情況進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)圖可視化分析。

2 結(jié)果

2.1 體系構(gòu)建

男性標(biāo)準(zhǔn)品DNA 2800用本研究構(gòu)建的Y-SNP體系檢測(cè)的分型圖譜如圖2所示。其中核心體系SNP位點(diǎn)延伸片段長(zhǎng)度在37～116 bp之間（圖2A），O體系SNP位點(diǎn)延伸片段長(zhǎng)度在31～115 bp之間（圖2B）。在DNA模板量為10 ng時(shí)（濃度5 ng/μL，體積2 μL），各位點(diǎn)均有分型峰，且峰高均超過(guò)200 RFU。

2.2 體系性能驗(yàn)證

①準(zhǔn)確性：12份DNA樣本的分型結(jié)果與Sanger直接測(cè)序結(jié)果的基因分型完全一致，構(gòu)建的復(fù)合體系對(duì)74個(gè)Y-SNP位點(diǎn)的基因分型結(jié)果準(zhǔn)確性可達(dá)100%，DNA2800核心體系檢測(cè)結(jié)果可掃OSID碼查看附圖1，O體系檢測(cè)結(jié)果可掃OSID碼查看附圖2，余11份DNA結(jié)果可掃OSID碼查看附表2。②靈敏度：對(duì)不同模板量的樣本進(jìn)行Y-SNP體系檢測(cè)，以等位基因峰高低于100 RFU視為位點(diǎn)丟失為標(biāo)準(zhǔn)。結(jié)果顯示，在DNA檢測(cè)量最低為0.14 ng（核心體系0.06 ng，O體系0.08 ng）時(shí)，74個(gè)Y-SNP位點(diǎn)均可正確判型，檢測(cè)結(jié)果可掃OSID碼查看附圖3。③重復(fù)性：74個(gè)Y-SNP位點(diǎn)在3次重復(fù)實(shí)驗(yàn)中的分型結(jié)果一致，相同位點(diǎn)之間的出峰位置差距平均為0.087 bp（核心體系0.025 bp，O體系0.061 bp），均≤1 bp（可掃OSID碼查看附表3）。說(shuō)明Y-SNP體系重復(fù)檢測(cè)相同的DNA樣本時(shí)，均能獲得相同的分型結(jié)果。④檢材適應(yīng)性：利用Y-SNP體系檢測(cè)的FTA血卡、口腔拭子、指甲、毛發(fā)（帶毛囊）DNA樣本，均能獲得完整分型，且同一樣本不同類型檢材分型結(jié)果一致，說(shuō)明該體系可以用于常用檢材的檢測(cè)（可掃OSID碼查看附圖4）。⑤抗女性成分干擾：在男性與女性成分比例為1∶1、1∶10、1∶100時(shí)，核心體系及O體系的出峰率均為100%。所出分型峰均與男性成分單獨(dú)檢測(cè)結(jié)果相同（可掃OSID碼查看附圖5）。⑥種屬特異性：所檢測(cè)的靈長(zhǎng)類動(dòng)物黑猩猩檢出52個(gè)位點(diǎn)峰，恒河猴檢出30個(gè)位點(diǎn)峰，其余樣本均未檢出特異性峰（可掃OSID碼查看附圖6）。

圖2 男性標(biāo)準(zhǔn)品DNA 2800分型圖譜Figure 2 The typing profile of male standard DNA 2800

2.3 家系排查應(yīng)用

來(lái)自4個(gè)社會(huì)學(xué)家系的20例男性樣本均獲得完整的Y-SNP與Y-STR分型，Y-SNP單倍群和YSTR單倍型分型結(jié)果可掃OSID碼查看附表4。家系內(nèi)各樣本間網(wǎng)絡(luò)圖以及結(jié)合家系調(diào)研信息繪制的家譜圖見(jiàn)圖3，網(wǎng)絡(luò)圖對(duì)家系內(nèi)Y-STR以及YSNP的變異情況進(jìn)行可視化。Y-STR單倍型編號(hào)對(duì)應(yīng)的分型可掃OSID碼查看附表4。

P1家系3例男性樣本Y-STR單倍型完全一致，其Y-SNP單倍群均屬于N1b-F2930。在圖3A中3例樣本聚在一起。

P2家系6例男性樣本共檢出4種Y-STR單倍型，其中單倍型H2共3例，H3共1例，H4共1例，H5共1例。以單倍型H2為參考，其與H3之間的容差為1，與H4之間的容差為4，與H5之間的容差為5，累計(jì)突變步長(zhǎng)分別為1、4、5步。所有樣本之間有5個(gè)Y-STR基因座（DYS439、GATA-H4、DYS518、DYS576、DYS385）的突變步長(zhǎng)均為1步，其余21個(gè)基 因 座（DYS19、DYS389I/II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS438、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、DYS444、DYS447、DYS460、DYS481、DYS508、DYS533、DYS643、DYF387S1、DYS449）分型一致。6例樣本Y-SNP單倍群均屬于N1b-F2930。在圖3B中，3例H2單倍型的個(gè)體聚在一起，與H3單倍型個(gè)體之間容差相差1，與H4單倍型個(gè)體之間容差相差3，與H5單倍型個(gè)體之間容差相差4。

P3家系6例男性樣本共檢出3種Y-STR單倍型，其中單倍型H6共4例，H7共1例，H8共1例。以單倍型H6為參考，其與H7以及H8之間的容差均為18。所有樣本之間僅3個(gè)Y-STR基因座（DYS391、DYS438、GATA-H4）分 型 一 致，在DYS458基因座中檢出分型14.1（H6）、18（H7）、17（H8），其余基因座之間的突變步長(zhǎng)在1～8步不等，其中DYS385基因座突變步長(zhǎng)最高為8步。6例樣本分別屬于3種Y-SNP單倍群，其中單倍型為H6的所有個(gè)體均屬于N1b-F2930單倍群；H7和H8單倍型的個(gè)體分別歸屬于單倍群C1-F3393和O2a1c1-F18。在圖3C中3種Y-STR單倍型各自聚在一起，且分別屬于不同的Y-SNP單倍群。

P4家系5例男性樣本共檢出2種Y-STR單倍型，其中單倍型H9共3例，H10共2例。2種單倍型之間的容差為10。所有樣本之間有8個(gè)Y-STR基因座（DYS391、DYS439、DYS447、DYS456、DYS533、DYS576、DYS385、DYS389I/II）的突變步長(zhǎng)為1步，1個(gè)基因座（DYF387S1）的突變步長(zhǎng)為2步，DYS449基因座檢出分型32（H9）、30.2（H10），其余16個(gè)基因座（DYS19、DYS390、DYS392、DYS393、DYS437、DYS438、DYS444、DYS448、DYS458、DYS460、DYS481、DYS508、DYS635、DYS643、GATA-H4、DYS518）分型一致。5例樣本Y-SNP單倍群均屬于O1a1a-M307.1。在圖3D中，分別屬于2種單倍型的個(gè)體聚在一起，容差為7。

3 討論

本研究構(gòu)建的Y-SNP體系共篩選74個(gè)Y-SNP位點(diǎn)，包含核心體系及O體系兩組子體系。該體系準(zhǔn)確性達(dá)100%，重復(fù)性好，最低DNA檢出量為0.14 ng；適用于常用檢材的檢測(cè)；在男女組分混合比例為1∶100時(shí)仍可檢出男性的完整分型，可用于混合斑的檢測(cè)；在非人源DNA中，由于黑猩猩與人類的Y染色體非重組區(qū)域相似性達(dá)98.3%［18］，恒河猴與人類基因組有93%同源性［19］，所以僅在兩者DNA中檢出少許位點(diǎn)峰，但難以判別其單倍群，無(wú)實(shí)際意義。Y-SNP體系可用于男性樣本Y-SNP單倍群的檢測(cè)。

來(lái)自同一父系的樣本Y單倍群類型相同，不同單倍群類型的樣本可排除來(lái)自同一父系。本研究篩選的Y-SNP位點(diǎn)其突變發(fā)生時(shí)間最近可追溯至2000年前（https：//www.yfull.com/chart/tree/），以本體系所選位點(diǎn)判斷的單倍群可回溯至80代（按照25年/代計(jì)算）。目前通常在家系調(diào)查或排查大家系時(shí)，Y-STR可追溯至2～10余代共同祖先［8］，本體系在應(yīng)用時(shí)可完全覆蓋。當(dāng)兩個(gè)體間Y-STR單倍型與Y-SNP單倍群均相同時(shí)，不排除來(lái)自同一父系，如本文中的P1家系；反之，當(dāng)Y-STR單倍型與Y-SNP單倍群均不同時(shí)則可排除來(lái)自同一家系，如本文中的P3家系中的H7、H8個(gè)體。Lkhagvasuren等［14］同樣通過(guò)2個(gè)個(gè)體間Y-STR單倍型與Y-SNP單倍群均不同，排除了2個(gè)個(gè)體源自同一父系。由于兩個(gè)體間親緣關(guān)系較遠(yuǎn)，減數(shù)分裂次數(shù)較多導(dǎo)致其YSTR單倍型容差可能稍大，采用常用標(biāo)準(zhǔn)閾值可能導(dǎo)致錯(cuò)誤排除，如本文中P2家系的H2單倍型個(gè)體與H4、H5單倍型個(gè)體之間分別為9級(jí)親緣關(guān)系和5級(jí)親緣關(guān)系，容差分別為4和5，但該家系成員均屬于同一Y-SNP單倍群，因此不能簡(jiǎn)單地依據(jù)常用標(biāo)準(zhǔn)閾值排除該家系成員來(lái)自同一父系。有研究表明，在考慮遠(yuǎn)親關(guān)系時(shí)，用于家系排查的標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)適當(dāng)上調(diào)，如兩個(gè)體間25個(gè)Y-STR基因座的容差閾值3可調(diào)整為4［20］。Y-SNP單倍群在Y-STR發(fā)生突變難以判斷時(shí)起到重要的輔助判斷作用。同時(shí)，在家系排查時(shí)，需注意家系成員中是否存在收養(yǎng)、抱養(yǎng)、入贅、非婚生子女等情況，避免家系排查的結(jié)果與家系調(diào)研的成員所屬親緣關(guān)系不符。

然而值得注意的是，由于Y-SNP單倍群在不同人群中頻率分布不同，兩個(gè)體之間可能出現(xiàn)Y-STR單倍型相差較大，但因抽樣隨機(jī)性而同屬相同YSNP單倍群的情況。在實(shí)際應(yīng)用中若樣本所屬單倍群在人群中分布頻率較高，則可能會(huì)出現(xiàn)不排除的結(jié)論，這就要求在應(yīng)用時(shí)需了解單倍群分布頻率數(shù)據(jù)。如本文中的P4家系，在排查時(shí)應(yīng)謹(jǐn)慎。在20個(gè)Y-SNP主干單倍群中，約75%的中國(guó)人可歸為單倍群O-M175［21］，該單倍群的3個(gè)主要下游：?jiǎn)伪度篛1a-M119主要分布在中國(guó)東南沿海、侗傣族群以及臺(tái)灣原住民［22-24］；單倍群O1b-M268在中國(guó)的東部、南部以及北部的漢族［13］中均有分布；單倍群O2-M122主要分布在中國(guó)的漢族（南方漢族約占53.72%，北方漢族約占52.06%），其下游3個(gè)主要支系O2a1b-002611、O2a2b1-M134、O2a2b1a1-M117各占漢族的16.9%、11.4%、16.3%［13，25］。P4家系成員所屬的Y-SNP單倍群O1a1a-M307.1為單倍群O1a-M119的下游分支，單倍群O1a1a在中國(guó)東部（22.2%）、南部（12.3%）、北部（1.6%）的漢族均有分布［13］。因此，相同Y-SNP單倍群的男性個(gè)體可能來(lái)自于不同父系。Y-SNP單倍群分支越精細(xì)，分布越局限，則越可能區(qū)分親緣關(guān)系較近的人群。如單倍群O1a-M119的下游O1a2-M110分布于中國(guó)臺(tái)灣（34.1%）、菲律賓（12.8%）、東南亞群島的中部和東部（2.5%和9.7%），而在東亞和東南亞的大陸以及東南亞群島的西部未見(jiàn)分布［24，26］。

同時(shí)，在本文中的4個(gè)家系中，在DYS458和DYS449基因座上檢出了微變異等位基因（14.1、30.2）。非整數(shù)與整數(shù)（例如31→30.2）STR等位基因之間的突變機(jī)制不同于滑動(dòng)鏈錯(cuò)配模式，其通常是因堿基缺失導(dǎo)致。這類突變的概率低于STR平均突變率，而高于SNP突變率［27-28］。因此，屬于同一父系的成員發(fā)生此類突變的幾率較低。

綜上所述，本文構(gòu)建的Y-SNP體系可用于實(shí)際案件樣本檢測(cè)以及家系排查。在家系排查中，由于Y-STR的高突變率，Y-STR難以用于相隔三代以上的父系親緣關(guān)系判定［29］，而Y-SNP單倍群可起到對(duì)Y-STR單倍型結(jié)果的補(bǔ)充和驗(yàn)證的作用，Y-SNP與Y-STR遺傳標(biāo)記和網(wǎng)絡(luò)圖的聯(lián)用，可提高家系排查的準(zhǔn)確率，為案件的偵查提供相應(yīng)線索。