王 飛,鐘圣偉,李 勇,胡小芬,周作紅,楊?yuàn)檴?/p>
(江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院 江西 南昌 330045)
【研究意義】羊駝具有觀(guān)賞和毛用雙重價(jià)值。目前,一般采用化學(xué)染料對(duì)動(dòng)物毛發(fā)進(jìn)行染色,以獲得顏色多樣的動(dòng)物絨毛制品,但是化學(xué)染色對(duì)環(huán)境和健康的負(fù)面影響很大。對(duì)毛色發(fā)生機(jī)制的研究,為獲得人為控制的天然動(dòng)物毛色提供重要理論意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】miRNAs,一類(lèi)長(zhǎng)度約為22個(gè)核苷酸的內(nèi)源性非編碼RNA,通過(guò)與靶基因mRNA 的3′-UTR 不完全互補(bǔ)配對(duì),從而調(diào)控基因在轉(zhuǎn)錄后水平的表達(dá)[1]。近年來(lái),越來(lái)越多的研究表明miRNAs調(diào)控許多重要的生物進(jìn)程,如腫瘤的發(fā)生、炎癥和發(fā)育等[2]。miRNAs對(duì)動(dòng)物毛色的表型或黑色素生成具有一定的影響,如miR-137通過(guò)靶向MITF導(dǎo)致小鼠毛色從黑色變?yōu)樽鼗疑玔3]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】基于實(shí)驗(yàn)室前期的研究[4],發(fā)現(xiàn)miR-7081-5p在白色和棕色羊駝皮膚中呈差異表達(dá),推測(cè)miR-7081-5p 可能參與毛色的形成。通過(guò)miRBase、TargetScan 等生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)miR-7081-5p的靶基因,均發(fā)現(xiàn)sex-determining region Y-box 6(SOX6)為miR-7081-5p的靶基因之一。最近的研究表明SOX6在色素生成中具有一定的作用[5]。因此推測(cè)miR-7081-5p可能通過(guò)抑制靶基因SOX6的表達(dá)進(jìn)而影響黑色素細(xì)胞內(nèi)色素的生成?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】本研究通過(guò)在羊駝黑色素細(xì)胞中過(guò)表達(dá)miR-7081-5p檢測(cè)SOX6及相關(guān)色素生成基因的表達(dá)變化,酪氨酸酶活性的變化,以及總黑色素,真黑素和褐黑素的含量變化,從而為揭示miR-7081-5p靶向SOX6在色素生成過(guò)程中的分子機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。
黑色素細(xì)胞專(zhuān)用培養(yǎng)基(Sciencell,美國(guó)),基因定點(diǎn)突變?cè)噭┖校ū淘铺?,上海),雙熒光報(bào)告檢測(cè)試劑盒(Promega,美國(guó)),DNA 凝膠回收試劑盒(碧云天,上海),兔抗多克隆一抗:SOX6、MITF、TYR、TYRP1和TYRP2(Abcam,美國(guó)),兔抗β-actin 多克隆一抗(康為世紀(jì),北京),山羊抗兔二抗(康為世紀(jì),北京),Trizol(Invitrogen,美國(guó)),轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine 2 000(Invitrogen,美國(guó)),qRT-PCR 試劑盒(Takara,大連),RIPA 裂解液(碧云天,上海),pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR-7081-5p 真核表達(dá)載體由Invitrogen 公司合成,引物由北京六合華大科技股份有限公司合成。
羊駝來(lái)自山西農(nóng)業(yè)大學(xué)羊駝養(yǎng)殖基地,背部剪毛,消毒后,用取皮器采取皮膚組織,并置液氮中保存。研磨后,用Trizol法提取RNA,并轉(zhuǎn)錄為cDNA。根據(jù)miRBase生物學(xué)軟件中SOX63′-UTR 的序列利用primer 5.0軟件設(shè)計(jì)引物,并加相應(yīng)的酶切位點(diǎn),以羊駝皮膚cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系:Mix 5 μL,F(xiàn)orward primer 0.4 μL,Reverse primer 0.4 μL,cDNA 1.5 μL,ddH2O 補(bǔ)足至10 μL。反應(yīng)結(jié)束對(duì)所擴(kuò)PCR 產(chǎn)物進(jìn)行膠回收,回收產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。測(cè)序正確后,回收產(chǎn)物和pmirGL0分別進(jìn)行雙酶切反應(yīng),將其酶切產(chǎn)物進(jìn)行T4連接,轉(zhuǎn)化,提取質(zhì)粒,測(cè)序,從而獲得pmirGL0-SOX6 3′-UTR 雙熒光報(bào)告載體,命名為SOX6-wt。以pmirGL0-SOX6 3′-UTR 雙熒光報(bào)告載體為模板,按照基因定點(diǎn)突變?cè)噭┖羞M(jìn)行靶位點(diǎn)的堿基突變?cè)囼?yàn),將突變后的產(chǎn)物轉(zhuǎn)化,提取質(zhì)粒,測(cè)序,從而獲得pmirGL0-SOX6 3′-UTR突變載體,命名為SOX6-mut。質(zhì)粒于-80 ℃保存,備用。所用引物序列見(jiàn)表1。
表1 miR-7081-5p和mRNAs引物序列Tab.1 miR-7081-5p and mRNAs primer sequences
培養(yǎng)HEK 293T 細(xì)胞,待其融合度達(dá)到60%~75%時(shí),進(jìn)行轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染設(shè)為2 組:(1)SOX6-wt+miR-7081-5p/NC,(2)SOX6-mut+miR-7081-5p/NC,進(jìn)行共轉(zhuǎn)染,每組設(shè)3 個(gè)重復(fù)。待轉(zhuǎn)染結(jié)束后,收集細(xì)胞,按照雙熒光報(bào)告檢測(cè)試劑盒操作說(shuō)明進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。分別讀取海腎和螢火蟲(chóng)熒光素酶反應(yīng)強(qiáng)度值。螢火蟲(chóng)螢光素酶值/海腎螢光素酶值進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。所用引物序列見(jiàn)表1。
培養(yǎng)羊駝黑色素細(xì)胞至融合度60%~75%時(shí),進(jìn)行miR-7081-5p/NC 轉(zhuǎn)染(每組設(shè)3 個(gè)重復(fù))。轉(zhuǎn)染56 h 后,用Trizol 法提取細(xì)胞總RNA,用NanoDrop 測(cè)其OD260/OD280值及濃度,取1 μL 進(jìn)行RNA 快速凝膠電泳,并按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。按照qRT-PCR 說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作,每組設(shè)3個(gè)重復(fù)。目的基因相對(duì)表達(dá)量采用2-△△Ct[6]進(jìn)行計(jì)算,熒光實(shí)時(shí)定量PCR 結(jié)果均用均值±標(biāo)準(zhǔn)差(Means±SD)表示,其中各基因的表達(dá)量所示結(jié)果均由內(nèi)參基因β-actin的表達(dá)量進(jìn)行校正,所有數(shù)據(jù)采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行單因素方差分析檢驗(yàn)。
培養(yǎng)羊駝黑色素細(xì)胞至融合度60%~75%時(shí),進(jìn)行miR-7081-5p/NC 轉(zhuǎn)染(每組設(shè)3 個(gè)重復(fù))。轉(zhuǎn)染56 h 后,用RIPA 裂解液提取細(xì)胞總蛋白,測(cè)其濃度后進(jìn)行SDS-PAGE 凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜至NC 膜。NC 膜用5%封閉液進(jìn)行封閉,1 h。加入稀釋后的一抗,4 ℃,過(guò)夜孵育。次日室溫回溫30 min,洗膜,5 min×6 次,用含有HRP 標(biāo)記的二抗,37 ℃,孵育1 h。洗膜后用ECL 發(fā)光試劑盒顯色后曝光。對(duì)獲得的目的條帶進(jìn)行掃描分析。利用Image-ProPlus 6.0軟件測(cè)定目的蛋白的灰度值,并進(jìn)行半定量分析。數(shù)據(jù)用Means±SD表示,全部數(shù)據(jù)采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行單因素方差分析檢驗(yàn)。
將培養(yǎng)好的黑色素細(xì)胞消化后接種于含有爬片的24 孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,轉(zhuǎn)染56 h 后,取出。PBS 沖洗,4%多聚甲醛固定20 min,3%過(guò)氧化氫室溫孵育15 min,PBS 沖洗,細(xì)胞爬片用牛血清白蛋白封閉,37 ℃,25 min。在爬片上滴加稀釋后的SOX6 一抗,4 ℃,過(guò)夜孵育。次日,洗膜后,用含有HRP 標(biāo)記的二抗,37 ℃,孵育30 min。DAB顯色后,在顯微鏡下觀(guān)察結(jié)果。設(shè)陰性對(duì)照組,用IgG代替一抗。
培養(yǎng)羊駝黑色素細(xì)胞至融合度60%~75%時(shí),進(jìn)行miR-7081-5p/NC轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染56 h后,PBS吹洗并消化計(jì)數(shù)??偤谒氐臏y(cè)定:在細(xì)胞團(tuán)塊中加入300 μL 的0.2 mol/L 的NaOH 溶液,充分溶解后,80 ℃,5 min。酶標(biāo)儀475 nm下測(cè)其OD值。真黑素的測(cè)定:在細(xì)胞團(tuán)塊中加入300 μL 30%的氫碘酸,80 ℃,2 h;冷卻后,加入300 μL 50%乙醇,2 234 g離心10 min,取沉淀;在沉淀中加入0.2 mol/L的NaOH,80 ℃,4 h,取溶解后的樣品,10 700 g 離心10 min,取上清,酶標(biāo)儀350 nm 下測(cè)其OD 值。褐黑素的測(cè)定:在細(xì)胞團(tuán)塊中加入300 μL 0.1 mol/L PBS(pH=10.5),室溫劇烈混合10 min,10 000 r/min,離心10 min,取上清。在上清液中加入300 μL氯仿,振蕩混勻,4 000 r/min,離心10 min,取黃色上清液。上清液,10 000 g,離心10 min。取上清,酶標(biāo)儀400 nm下測(cè)其OD值。每組均設(shè)3個(gè)重復(fù)。
培養(yǎng)羊駝黑色素細(xì)胞至融合度60%~75%時(shí),進(jìn)行miR-7081-5p/NC轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染56 h后,消化離心,PBS清洗3次;PBS重懸細(xì)胞,加入96孔板,100 μL/孔,每組設(shè)3個(gè)重復(fù);每孔加入1%Triton X-100,100 μL,混勻,20 ℃,孵育1 h;加入PBS稀釋的0.1%的左旋多巴,100 μL,37 ℃,孵育2 h,酶標(biāo)儀460 nm測(cè)其OD值。
Trizol 法提取羊駝皮膚總RNA,用核酸濃度測(cè)定儀測(cè)定其濃度和質(zhì)量,并進(jìn)行凝膠電泳實(shí)驗(yàn)檢測(cè)RNA。核酸測(cè)定儀測(cè)定OD260/OD280比值為1.80~2.00,其純度較好;凝膠電泳結(jié)果顯示,RNA 樣品的28S,18S和5S條帶清晰可見(jiàn),符合進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)的要求(圖1)。
圖1 皮膚總RNA 1%凝膠電泳結(jié)果Fig.1 Total RNA of skin by 1%agrose gel
miRBase、TargetScan 等生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)miR-7081-5p 的靶基因,均發(fā)現(xiàn)SOX6是miR-7081-5p 的靶基因,且具有7 個(gè)nt 種子序列(圖2A)。SOX6-wt/ pmirGL0-SOX6-mut 和miR-7081-5p/NC,共轉(zhuǎn)染HEK 293T 細(xì)胞后,檢測(cè)熒光信號(hào)的變化情況。結(jié)果顯示:與SOX6-wt+NC 組相比,pmirGL0-SOX6 -wt+miR-7081-5p 組熒光素酶活性顯著下調(diào)42.54%(圖2B);與SOX6-mut+NC組相比,SOX6-mut+miR-7081-5p組熒光素酶活性無(wú)顯著變化(圖2C),通過(guò)熒光素酶活性的檢測(cè)證實(shí)SOX6 是miR-7081-5p 的靶基因。
圖2 SOX6與miR-7081-5p靶向關(guān)系驗(yàn)證Fig.2 SOX6 is one of target genes of miR-7081-5p
運(yùn)用qRT-PCR 實(shí)驗(yàn)檢測(cè)轉(zhuǎn)染miR-7081-5p 和NC 后的表達(dá)量變化。結(jié)果顯示:miR-7081-5p 組內(nèi)miR-7081-5p 的表達(dá)量顯著顯著高于NC 組,為NC 組的5.11 倍(圖3A),可用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。qRT-PCR 檢測(cè)轉(zhuǎn)染miR-7081-5p 后SOX6 基因的表達(dá)差異。結(jié)果顯示:與NC 組相比,miR-7081-5p 組內(nèi)SOX6 mRNA 表達(dá)水平降低40.51%,差異顯著(圖3B)。Western blotting 和細(xì)胞免疫組織化學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:與NC 組相比,miR-7081-5p組內(nèi)SOX6蛋白表達(dá)水平降低71.69%,差異顯著(見(jiàn)圖3C~E)。這些結(jié)果表明:SOX6基因的表達(dá)受miR-7081-5p的調(diào)控。
圖3 miR-7081-5p過(guò)表達(dá)對(duì)SOX6 mRNA和蛋白表達(dá)水平的影響Fig.3 The effect on mRNA and protein expression levels of SOX6 in melanocytes overexpressed miR-7081-5p
運(yùn)用qRT-PCR 和Western blotting 實(shí)驗(yàn)檢測(cè)miR-7081-5p 過(guò)表達(dá)對(duì)黑色素生成相關(guān)基因的影響。qRT-PCR結(jié)果顯示:與NC組相比,miR-7081-5p組MITF、TYR、TYRP1和TYRP2mRNA表達(dá)水平分別降低63.63%、59.22%、58.84%和63.80%(圖4A);Western blotting結(jié)果顯示:與NC組相比,miR-7081-5p組MITF、TYR、TYRP1和TYRP2蛋白表達(dá)水平分別降低65.23%、63.23%、58.52%和62.95%,差異顯著(圖4B~C)。
圖4 miR-7081-5p過(guò)表達(dá)對(duì)黑色素生成相關(guān)基因mRNA和蛋白表達(dá)水平的影響Fig.4 The effect on mRNA and protein expression levels of melanogenesis-related genes in melanocytes overexpressed miR-7081-5p
miR-7081-5p 轉(zhuǎn)染羊駝黑色素細(xì)胞56 h 后,分別收集miR-7081-5p 組和NC 組的黑色素細(xì)胞并計(jì)數(shù)。提取各組內(nèi)總黑色素、真黑素和褐黑素后,根據(jù)各組細(xì)胞數(shù)量及OD值計(jì)算總黑色素、真黑素和褐黑素的相對(duì)含量。結(jié)果顯示:與NC 組相比,miR-7081-5p組總黑色素、真黑素和褐黑素的相對(duì)含量分別下降了49.03%、62.4%和63.8%,差異顯著(圖5)。
圖5 miR-7081-5p過(guò)表達(dá)對(duì)黑色素含量的影響Fig.5 The effect on melanin amount of melanocytes overexpressed miR-7081-5p
miR-7081-5p轉(zhuǎn)染羊駝黑色素細(xì)胞56 h后,分別收集miR-7081-5p組和NC組的黑色素細(xì)胞,進(jìn)行酪氨酸酶活性的測(cè)定。結(jié)果顯示:與NC組相比,miR-7081-5p組酪氨酸酶活性顯著降低了63.06%(圖6)。
圖6 過(guò)表達(dá)miR-7081-5p對(duì)酪氨酸酶活性的影響Fig.6 The effect on tyrosinase activity in melanocytes overexpressed miR-7081-5p
本試驗(yàn)通過(guò)脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染法在羊駝黑色素細(xì)胞中過(guò)表達(dá)miR-7081-5p 后,引起黑色素細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的變化,導(dǎo)致靶基因SOX6和與色素生成關(guān)鍵基因表達(dá)水平降低,并降低了酪氨酸酶活性,最終導(dǎo)致黑色素含量的降低。
黑色素顆粒由皮膚內(nèi)的色素細(xì)胞合成,決定動(dòng)物毛發(fā)和人類(lèi)皮膚的顏色,并能保護(hù)皮膚免受紫外線(xiàn)輻射所造成的傷害。動(dòng)物黑色素主要分為真黑色素和褐黑色素兩種,并且兩者的相對(duì)數(shù)量及分布決定動(dòng)物皮膚及被毛的顏色[7]。越來(lái)越多的研究表明:microRNAs(miRNAs)在人類(lèi)和其他脊椎動(dòng)物毛發(fā)和膚色中具有重要的作用[8]。前期通過(guò)對(duì)不同毛色羊駝皮膚miRNAs 的深度測(cè)序結(jié)果,挖掘了多個(gè)miRNAs,如miR-5110[9]、lpa-miRnov-66[10]、miR-508-3p[11]?;趯?shí)驗(yàn)室前期的研究,筆者發(fā)現(xiàn)miR-7081-5p 在白色和棕色羊駝皮膚中呈差異表達(dá),推測(cè)miR-7081-5p可能參與毛色的形成[4]。
利用生物信息學(xué)工具,預(yù)測(cè)SOX6 是miR-7081-5p 的靶基因之一。SOX 家族包含20 個(gè)基因[12],分為8 組,命名為SOXA 到SOXH。在大多數(shù)脊椎動(dòng)物中,SOX6、SOX5 和SOX13 一起屬于SOXD 組[13]。SOX10通過(guò)激活靶基因MITF,TYR,TYRP1和TYRP2調(diào)控黑色素細(xì)胞內(nèi)色素的生成[14]。SOX5 與SOX10 反應(yīng)元件相結(jié)合可以調(diào)控人黑色素瘤細(xì)胞內(nèi)MITF 的表達(dá)[15]。作為轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,SOX 蛋白的表達(dá)受許多信號(hào)通路的調(diào)控[16-17]。它們的轉(zhuǎn)錄活性受翻譯后修飾和隔離機(jī)制的影響[18]。在脂肪形成中,SOX6 通過(guò)抑制Wnt信號(hào)通路促進(jìn)β-catenin的降解[19],而Wnt/β-catenin信號(hào)通路參與黑色素生成[9],因此推測(cè)SOX6可能在黑色素生成中具有重要的作用。
SOX6 是一個(gè)核內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子,SOX6 和SOXD 家族成員(例如SOX5 和SOX13)通過(guò)各種機(jī)制充當(dāng)正轉(zhuǎn)錄或負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子[20]。SOX5 和SOX6 與黑色素細(xì)胞中的SOXE 基因可以共表達(dá)[21]。之前研究表明SOX6 通過(guò)調(diào)節(jié)CyclinD1基因在黑色素生成中起到激活劑的作用[5]。最新研究表明,SOX6 可以直接調(diào)控MITF 的表達(dá)[22]。MITF 在黑色素細(xì)胞的發(fā)育中具有重要的作用[23],可以調(diào)控黑色素細(xì)胞的分化和黑色素生成酶的轉(zhuǎn)錄,包括TYR、TYRP1 和TYRP2[24]。本試驗(yàn)中miR-7081-5p 通過(guò)靶向SOX6,引起黑色素生成關(guān)鍵基因MITF 的表達(dá)降低,進(jìn)而下調(diào)了TYR、TYRP1 和TYRP2 的表達(dá),最終導(dǎo)致黑色素含量的降低。一個(gè)miRNA 會(huì)有多個(gè)靶基因,miR-7081-5p 是否還會(huì)通過(guò)其他與黑色素生成有關(guān)的基因調(diào)控黑色素含量有待進(jìn)一步研究。本試驗(yàn)的研究結(jié)果也為進(jìn)一步研究miR-7081-5p 在黑色素生成中的作用提供了理論基礎(chǔ)。