萬陽 楊奕 劉慧瑩 蔡恒斌 李金根 毛祥坤#
(1江西中醫(yī)藥大學(xué) 南昌330004;2江中藥業(yè)股份有限公司 江西南昌330077;3江西省南昌市強制隔離戒毒所 南昌330029)
咳嗽是一種呼吸道常見疾病,占呼吸科門診的30%左右,病因復(fù)雜,部分患者經(jīng)抗感染治療后仍無法緩解,長此以往,若得不到有效治療,將對呼吸系統(tǒng)造成損傷[1]。冠狀動脈粥樣硬化性心臟病簡稱冠心病,是冠狀動脈血管發(fā)生動脈粥樣硬化病變而引起血管腔狹窄或阻塞,造成心肌缺血、缺氧或壞死而致,臨床常見冠心病患者易患咳嗽,西醫(yī)認為與患者心肺功能不全有關(guān)[2]。從中醫(yī)角度而言,咳嗽病位在肺,因肺失宣肅、肺氣上逆、沖擊氣道而致,臨床可表現(xiàn)為咳嗽、咳痰,分外感與內(nèi)傷兩種,其中外感咳嗽若不能及時使邪外出,易演變?yōu)閮?nèi)傷咳嗽,內(nèi)傷咳嗽其病理因素多與“痰”相關(guān)。冠心病屬中醫(yī)的“胸痹、胸痛”等范疇,病位在心,病理因素與“痰、瘀血”相關(guān)?!靶臑榫髦?、肺為相傅之官”,肺能協(xié)助“君主之官”調(diào)節(jié)氣血,兩者發(fā)病亦與“痰”相關(guān),故咳嗽、冠心病在病因病機上常互為關(guān)聯(lián)。半夏、陳皮為臨床常用祛痰藥,兩者常相須為用,作為治療呼吸、心血管疾病的中藥復(fù)方核心藥在臨床上應(yīng)用廣泛[3]。中醫(yī)治病的法則,不著眼于疾病的異同,關(guān)鍵在于其病機的異同,“異病同治”則是該法則的主要體現(xiàn)。在不同疾病的發(fā)生發(fā)展過程中,只要出現(xiàn)相同的病機,就可以采用同一方法治療該病??人浴⒐谛牟≡诎l(fā)病過程中,常出現(xiàn)“痰濁阻滯”,用半夏-陳皮藥對治療符合“異病同治”之說。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是很多學(xué)者近年提出的一種采用系統(tǒng)生物學(xué)方法來進行藥理學(xué)研究的新型技術(shù)方法,是基于“疾病-基因-靶點-藥物”相互作用的網(wǎng)絡(luò),能系統(tǒng)綜合地觀察藥物對疾病網(wǎng)絡(luò)的干預(yù)與影響,這與中藥的多成分、多途徑、多靶點協(xié)同作用的原理相似[4]?;诖耍狙芯窟\用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,從中醫(yī)“異病同治”的角度,探究半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病的具體分子機制?,F(xiàn)報道如下:
1.1 藥物成分及靶點的查詢及篩選 在TCMSP數(shù)據(jù)庫(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)以口服生物利用度(Oral Bioavailability,OB)≥30%或類藥性指數(shù)(Drug Like Index,DL)≥0.18為標(biāo)準對中藥藥對半夏-陳皮的化合物進行篩選[5]。將符合條件的化合物輸入Pubchem數(shù)據(jù)庫(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)查找其國際化學(xué)標(biāo)識符(International Chemical Identifier,InChI)及CID,并將其輸入BATMAN-TCM數(shù) 據(jù) 庫(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)中,以得分(Score)≥20與調(diào)整P值(Adjusted P-value)<0.05為臨界值進行藥物靶標(biāo)的篩選[6]。
1.2 疾病基因的檢索 分別在基因疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫DisGeNET(http://www.disgenet.org/web/DisGeNET/menu)、人類孟德爾遺傳綜合數(shù)據(jù)庫OMIM(https://www.omim.org/)、藥物靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫Drug Bank(https://www.drugbank.ca/)以咳嗽(Cough)、冠心?。–oronary Heart Disease)為詞條進行相關(guān)疾病基因檢索。將所得的咳嗽、冠心病疾病基因進行整合,并應(yīng)用Uniprot數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)對基因進行標(biāo)準化。
1.3 構(gòu)建半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫PPI網(wǎng)絡(luò)圖 將半夏和陳皮中篩選所得的藥物靶標(biāo)分別與咳嗽、冠心病的疾病基因進行映射,分別得出該藥對治療咳嗽、冠心病的靶標(biāo)。將兩個數(shù)據(jù)集進行整合得到該藥對治療咳嗽和冠心病的共同作用靶基因,合并抽取交集靶基因,得出該藥對疾病共同作用的靶標(biāo)蛋白數(shù)據(jù)庫。將靶標(biāo)蛋白輸入STRING數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org),構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),用Cytoscape軟件(3.8.2)進行可視化分析。根據(jù)Cytoscape軟件中的Network Analysis plugin插件對圖中節(jié)點自由度(Degree)進行分析。自由度越大,該節(jié)點在網(wǎng)絡(luò)中的生物功能則越多。根據(jù)節(jié)點自由度大小進行顏色渲染,顏色由黃色漸變成紅色。其中黃色節(jié)點表明其Degree較?。ㄉ锕δ茌^少),紅色節(jié)點代表其自由度較大(生物功能較多)。
1.4 基 因 本 體(Gene Ontology,GO)、KEGG PATHWAY通路富集 分別將半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病及其交集靶基因輸入DAVID數(shù)據(jù)庫分別進行GO、KEGG分析,以P值<0.05為標(biāo)準進行篩選。
1.5 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病“活性成分-靶標(biāo)”網(wǎng)絡(luò)可視化構(gòu)建 分別將半夏-陳皮作用咳嗽、冠心病的有效作用成分、潛在靶標(biāo)輸入Cytoscape3.8.2 軟件,構(gòu)建“活性成分-靶標(biāo)”網(wǎng)絡(luò)圖。
2.1 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病靶標(biāo) 基于DisGeNET、OMIM及Drug Bank數(shù)據(jù)庫查詢所得,有230個基因與咳嗽相關(guān),1 658個基因與冠心病相關(guān)。經(jīng)過分析后發(fā)現(xiàn)藥對半夏-陳皮治療咳嗽的基因有49個、有效成分69個,治療冠心病的基因有342個,有效成分87個。
2.2 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫PPI網(wǎng)絡(luò)圖 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶標(biāo)共有24個,將其輸入STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)圖,發(fā)現(xiàn)除TBPL1之外,其余23個靶標(biāo)蛋白之間均可相互作用。將23個靶蛋白輸入Cytoscape軟件進行可視化,PPI網(wǎng)絡(luò)圖顯示共有23個節(jié)點,聚類系數(shù)為0.597,網(wǎng)絡(luò)密度為0.372,其中生物功能最多的前3個靶標(biāo)蛋白人白介素1B(IL1B)、腫瘤壞死因子(TNF)、白細胞介素8(CXCL8)。見圖1、圖2。
圖1 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶基因韋恩圖
圖2 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶基因PPI網(wǎng)絡(luò)圖
2.3 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶基因GO分析 用DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫分別對半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病及其交集靶標(biāo)進行GO在線富集,經(jīng)過篩選后發(fā)現(xiàn):藥對治療咳嗽的生物過程(Biological Process,BP)主要集中在炎癥反應(yīng)、對基因表達的正向調(diào)控、蛋白質(zhì)四聚體等方面,細胞組成(Cellular Component,CC)主要集中在胞外部分、細胞表面、細胞質(zhì)膜的整體組成等,分子功能(Molecular Function,MF)主要表現(xiàn)細胞因子活性、離子通道的活性、鈣離子通道活性等方面。中藥藥對治療冠心病BP主要集中在對藥物反應(yīng)、炎癥反應(yīng)、對脂多糖的反應(yīng)等部分,CC主要集中在細胞外部分、細胞質(zhì)及細胞表面等,MF主要集中在酶結(jié)合、細胞因子活性、受體結(jié)合等方面。半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶標(biāo)BP主要集中在炎癥反應(yīng)、對基因表達的調(diào)控、對鈣二醇1-單加氧酶活性的正向調(diào)控等方面,CC主要集中在細胞外部分、細胞表面、細胞膜等,MF主要表現(xiàn)在細胞因子活性、蛋白質(zhì)同源二聚體活性、酶結(jié)合等方面。見表1~3。
表1 半夏-陳皮治療咳嗽靶基因GO分析
表2 半夏-陳皮治療冠心病靶基因GO分析
表3 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶基因GO分析
續(xù)表
2.4 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶基因KEGG分析KEGG PATHWAY通路富集分析發(fā)現(xiàn),中藥對治療咳嗽的主要通路涉及TNF通路、T細胞受體信號通路、Toll樣受體通路等25個通路。藥對治療冠心病的主要通路涉及HIF-1通路、TNF通路、AMPK通路等127個通路。半夏-陳皮“異病同治”的主要信號通路涉及NOD樣受體信號通路、TNF通路、NF-κB通路、TGF-β通路等炎癥相關(guān)信號通路。見圖3、圖4、圖5。
圖3 半夏-陳皮治療咳嗽靶基因KEGG PATHWAY富集圖
圖4 半夏-陳皮治療冠心病靶基因KEGG PATHWAY富集圖
圖5 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶基因KEGG PATHWAY富集圖
2.5 半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病“活性成分-靶標(biāo)”圖 分別將半夏-陳皮藥對治療咳嗽、冠心病的有效活性成分、潛在作用靶標(biāo)及其通路輸入Cytoscape 3.8.2軟件,設(shè)置節(jié)點Degree≥10為標(biāo)準進行篩選,構(gòu)建“重要活性成分-靶標(biāo)”網(wǎng)絡(luò)圖,圖中棱形節(jié)點代表小分子化合物,圓形節(jié)點代表潛在靶點。見圖6、圖7。
圖6 半夏-陳皮治療咳嗽“重要活性成分-靶標(biāo)”圖
圖7 半夏-陳皮治療冠心病“重要活性成分-靶標(biāo)”圖
半夏為天南星科植物半夏的干燥塊莖,味辛、性溫,歸脾、胃、肺經(jīng),具有燥濕化痰、降逆止嘔、消痞散結(jié)的功效,現(xiàn)代藥理學(xué)研究發(fā)現(xiàn)其具有止咳平喘、抗消化性潰瘍、降壓、抗動脈粥樣硬化等功效,臨床常用于治療呼吸系統(tǒng)、心血管系統(tǒng)、消化系統(tǒng)、腫瘤等疾病[7]。陳皮為蕓香科植物橘及其栽培變種的干燥成熟果皮,味苦、辛,性溫,歸肺、脾經(jīng),具有燥濕化痰、理氣健脾之功效,現(xiàn)代藥理學(xué)研究發(fā)現(xiàn)其主要有效成分為黃酮類化合物,具有抗炎、抗腫瘤、抗動脈粥樣硬化、抗過敏等作用,廣泛運用于呼吸、心血管、消化等系統(tǒng)疾病[8]??人詾楹粑到y(tǒng)常見疾病,冠心病為心血管常見疾病,中醫(yī)理論認為兩者發(fā)病均與“痰”相關(guān),半夏、陳皮兩味中藥均為燥濕化痰常用藥,均歸屬于脾、肺兩經(jīng),“脾為生痰之源、肺為儲痰之器”,兩者常相須為用,是中醫(yī)臨床燥濕化痰之經(jīng)典藥對,其中化痰名方“二陳湯”是其充分體現(xiàn),臨床運用該藥對治療兩種疾病均取得較好療效,亦是“異病同治”之法的體現(xiàn)。
本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)這種新型的技術(shù)手段,對半夏-陳皮治療咳嗽、冠心病交集靶基因進行GO分析發(fā)現(xiàn),其BP主要集中在炎癥反應(yīng)、對基因表達的調(diào)控、對鈣二醇1-單加氧酶活性的正向調(diào)控等方面,CC主要集中在細胞外部分、細胞表面、細胞膜等,MF主要表現(xiàn)在細胞因子活性、蛋白質(zhì)同源二聚體活性、酶結(jié)合等方面。KEGG PATHWAY通路富集分析發(fā)現(xiàn),半夏-陳皮藥對治療冠心病的分子機制主要涉及HIF-1、TNF、AMPK通路等127個通路,治療咳嗽的分子機制則主要涉及NOD樣受體、T細胞受體、Toll樣受體通路等25個通路。藥對“異病同治”的主要信號通路涉及NF-κB通路、NOD樣受體信號通路、TNF通路、TGF-β等30個信號通路。核 轉(zhuǎn) 錄 因 子-κB(Nuclear Factor-kappa B,NF-κB)通路是參與炎癥反應(yīng)的“明星通路”,其存在于多種組織中,具有廣泛的生物活性。一般情況下,其以同源或異源二聚體的形式存在于細胞質(zhì)中,此時其表現(xiàn)為無活性,當(dāng)其受到一些炎癥介質(zhì)、病毒、自由基等因素刺激時,無活性的NF-κB進入細胞核中并與其相關(guān)的靶基因結(jié)合,誘導(dǎo)一些炎癥介質(zhì)的表達以發(fā)揮其生物學(xué)效應(yīng),研究發(fā)現(xiàn)其與動脈粥樣硬化、冠心病、慢性阻塞性肺疾病、哮喘等呼吸、心血管系統(tǒng)疾病相關(guān)[9~10]。NOD樣受體(NOD-like Receptors,NLRs)屬天然免疫系統(tǒng),是哺乳動物先天免疫系統(tǒng)的重要組成部分,其參與細胞內(nèi)細菌病原體相關(guān)分子模式的識別并可引起下游NF-κB信號通路的激活,從而誘發(fā)炎癥反應(yīng),研究發(fā)現(xiàn)其與機體內(nèi)炎癥反應(yīng)及代謝障礙相關(guān)[11]。腫瘤壞死因子-α(Tumor Necrosis Factor-α,TNF-α)是一種涉及系統(tǒng)性炎癥的細胞因子,可誘導(dǎo)多種炎癥介質(zhì)的釋放,是氣道炎癥的重要介質(zhì),其常在咳嗽患者體內(nèi)表達升高[12]。此外,研究發(fā)現(xiàn)冠心病患者體內(nèi)TNF-α亦過度表達,其作用于冠心病的機制與其促使血管內(nèi)皮增厚、增加血管內(nèi)皮平滑肌細胞數(shù)量、促使動脈粥樣硬化相關(guān)[13]。轉(zhuǎn)化生長因子-β(Transforming Growth Factor-β,TGF-β)廣泛存在于人體各系統(tǒng)中,TGF-β通路參與細胞生長、分化、凋亡、動態(tài)平衡等多種細胞生命活動[14]。其通過促進膠原纖維分泌及沉積、抑制炎癥反應(yīng)、雙向調(diào)節(jié)血管平滑肌等多途徑參與冠心病的發(fā)生發(fā)展,是冠心病發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵信號通路之一[15]。以上這些信號通路均與炎癥反應(yīng)關(guān)系密切,符合半夏-陳皮的藥理學(xué),亦與目前咳嗽、冠心病的機制相符。同時,進一步表明半夏-陳皮“異病同治”咳嗽、冠心病是通過多途徑、多靶點進行治療。