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    利用Stacking集成學(xué)習(xí)估算柑橘葉片氮含量

    2021-09-16 08:19:26劉凌杰席順忠任孟杰袁曉慧莊翠珍
    關(guān)鍵詞:冠層反射率柑橘

    吳 彤,李 勇,葛 瑩,劉凌杰,席順忠,任孟杰,袁曉慧,莊翠珍

    利用Stacking集成學(xué)習(xí)估算柑橘葉片氮含量

    吳 彤1,李 勇2※,葛 瑩2,劉凌杰1,席順忠2,任孟杰2,袁曉慧3,莊翠珍3

    (1. 河海大學(xué)水文水資源學(xué)院,南京 210098;2. 河海大學(xué)地球科學(xué)與工程學(xué)院,南京 211100;3. 新平褚氏農(nóng)業(yè)有限公司,新平 653407)

    準(zhǔn)確估算柑橘葉片氮含量對于科學(xué)合理的施肥具有重要的指導(dǎo)作用,該研究利用Landsat8 OLI衛(wèi)星遙感影像和地面采樣實(shí)測數(shù)據(jù),以K-近鄰(K-Nearest Neighbors,KNN),隨機(jī)森林(Random Forest,RF)和自適應(yīng)增強(qiáng)(Adaptive boosting,Adaboost)模型為基礎(chǔ),構(gòu)建Stacking集成學(xué)習(xí)框架,實(shí)現(xiàn)對柑橘葉片氮含量(Leaf Nitrogen Content,LNC)的估算。首先分析不同氮含量下的光譜反射特征,構(gòu)建植被指數(shù)(Vegetation Indices,VIs)并計(jì)算其與柑橘LNC的相關(guān)系數(shù);接著利用格網(wǎng)搜索、交叉驗(yàn)證訓(xùn)練模型,最后將Stacking模型與包括Bagging(Bootstrap Aggregating,Bagging)、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Artificial Neural Network,ANN)在內(nèi)的多個(gè)經(jīng)典機(jī)器學(xué)習(xí)模型試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行對比分析,并生成柑橘果園的氮含量分布圖。結(jié)果表明:1)構(gòu)建的光譜指數(shù)與LNC具有較好的相關(guān)性,大部分指數(shù)相關(guān)系數(shù)在0.55以上;2)相比KNN、RF、Adaboost等多個(gè)單一模型,Stacking模型的估算效果最佳,決定系數(shù)達(dá)到0.761,均方根誤差為1.366 g/kg,平均絕對百分比誤差為3.494%;同時(shí),Stacking模型的赤池信息準(zhǔn)則(Akaike Information Criterion,AIC)值最低,是觀測期內(nèi)LNC估算的最優(yōu)模型;3)研究區(qū)內(nèi)LNC值整體上處于30.5~31.5 g/kg左右,接近柑橘種植的理想?yún)^(qū)間,模型估算與實(shí)測值趨于一致??傮w上,該研究采用的光譜特征能夠有效表征柑橘冠層葉片氮含量,并證明Stacking集成學(xué)習(xí)能綜合多個(gè)基模型的優(yōu)點(diǎn),提高模型的準(zhǔn)確性,為利用衛(wèi)星遙感展開作物參數(shù)估算提供新的思路。

    衛(wèi)星;遙感;模型;柑橘;氮;Stacking;植被指數(shù)

    0 引 言

    氮是果樹生長過程中必需的營養(yǎng)元素,對果樹的生理生化過程起著重要的調(diào)控作用[1],也影響著果實(shí)最終的品質(zhì)和產(chǎn)量。在實(shí)際的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,氮肥的施用往往依靠人工經(jīng)驗(yàn),缺氮會(huì)影響果樹的生長發(fā)育,而過量的氮?jiǎng)t會(huì)導(dǎo)致果實(shí)的減產(chǎn)和環(huán)境的污染??焖贉?zhǔn)確地獲取果樹葉片氮含量(Leaf Nitrogen Content,LNC),科學(xué)合理地施用氮肥,能有效節(jié)約成本。以往獲取LNC的方法主要是化學(xué)檢測,這種方法需要到野外實(shí)地采樣,還需經(jīng)過長時(shí)間的樣品處理和實(shí)驗(yàn)室分析,其結(jié)果雖然準(zhǔn)確,但是成本高昂、對果樹具有破壞性,此外還存在時(shí)效性差、結(jié)果不具代表性等弊端[2]。

    隨著光譜探測技術(shù)的快速發(fā)展,其以無損、便捷等優(yōu)勢成為了作物生長機(jī)理分析和定量化研究的熱點(diǎn)。高光譜可以從生長機(jī)理上對作物光譜響應(yīng)進(jìn)行分析,但是存在著空間局限性,而且高光譜特征維數(shù)多,易產(chǎn)生信息冗余,對數(shù)據(jù)處理造成困難,而衛(wèi)星遙感具有大范圍、多時(shí)相、周期性觀測等特點(diǎn),克服了地面點(diǎn)狀信息的空間局限[3],因此被廣泛用于農(nóng)作物生長的監(jiān)測研究中。Clevers等[4]采用Sentinel-2/3衛(wèi)星數(shù)據(jù)分析了紅邊葉綠素指數(shù)和中分辨率成像光譜儀(Medium Resolution Imaging Spectrometer,MERIS)陸地葉綠素指數(shù)等植被指數(shù)(Vegetation Indices,VIs)和大豆、玉米冠層氮含量之間的關(guān)系,證明了紅邊波段對于植物冠層/葉片氮含量估算的重要意義。王凌[5]基于Landsat5 TM和先進(jìn)可見光與近紅外輻射計(jì)-2(Advanced Visible and Near Infrared Radiometer Type 2,ALOS AVNIR-2)從蘋果樹冠層反射率出發(fā),經(jīng)地形輻射校正削弱了地形影響,結(jié)合地面高光譜數(shù)據(jù)構(gòu)建并篩選出蘋果葉、花、冠層的氮磷元素的敏感波段,建立了支持向量回歸模型,實(shí)現(xiàn)了對盛花期蘋果樹氮磷的診斷。Delloye等[6]將人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和Sentinel-2衛(wèi)星遙感數(shù)據(jù)結(jié)合起來實(shí)現(xiàn)了對冬小麥冠層葉綠素和氮含量的估算,并討論了紅邊波段進(jìn)行生化指標(biāo)估算的潛力。Chemura等[7]同樣利用Sentinel-2遙感數(shù)據(jù)對咖啡LNC進(jìn)行估算,通過建立優(yōu)化植被指數(shù)的隨機(jī)森林模型得到了最好的擬合效果,決定系數(shù)達(dá)到了0.78。曹淑靜[8]基于地面高光譜數(shù)據(jù)和模擬GF-1號(hào)衛(wèi)星光譜數(shù)據(jù),對蘋果樹冠層光譜指數(shù)進(jìn)行了提取和篩選,建立并對比了二次多項(xiàng)式、支持向量回歸等模型對蘋果樹冠層氮含量的反演效果,試驗(yàn)結(jié)果表明該研究區(qū)內(nèi)的氮含量分布在24~32 g/kg的范圍內(nèi),且西南和東北部氮含量較高,與實(shí)際情況較為一致。Brinkhoff等[9]利用連續(xù)四年的WorldView-2衛(wèi)星影像對水稻不同生長時(shí)期的氮吸收率進(jìn)行了估算,通過研究以NDRE2光譜指數(shù)為主的單變量模型和加入了氣候、管理因素的多變量模型的估算精度,最終利用多變量模型對抽穗期水稻氮吸收率進(jìn)行了有效估算。熊靜玲[10]則對比了Landsat8、Sentinel-2和GF-6衛(wèi)星影像及其模擬數(shù)據(jù)對不同生長時(shí)期的蘋果樹冠層氮含量的估算精度,結(jié)果表明Sentinel-2和GF-6衛(wèi)星模擬數(shù)據(jù)的估算精度優(yōu)于Landsat8,較全面地對比和分析了基于不同衛(wèi)星遙感數(shù)據(jù)對蘋果樹冠層氮含量監(jiān)測的優(yōu)劣。Fabbri等[11]基于Rapid-Eye衛(wèi)星影像建立以修正葉綠素吸收反射指數(shù)、增強(qiáng)型植被指數(shù)為變量的線性回歸模型,實(shí)現(xiàn)氮營養(yǎng)指數(shù)的估算,進(jìn)而為農(nóng)民提供施氮的建議,經(jīng)田間試驗(yàn)證明該模型十分可靠。

    目前,利用衛(wèi)星遙感開展作物生化組分研究的對象大都是受控試驗(yàn)下的大田作物,對于單體較大、冠層結(jié)構(gòu)復(fù)雜的果樹(尤其是柑橘樹)的研究較少,而且大都是基于單一模型。集成多個(gè)不同類模型的Stacking學(xué)習(xí)能集成單一模型的效果,具有提高LNC估算精度的潛力,因此本文采用Landsat8 OLI衛(wèi)星影像,結(jié)合已有的光譜指數(shù)計(jì)算方法得到光譜特征,分析柑橘LNC與衛(wèi)星光譜特征間的相關(guān)性,構(gòu)建該時(shí)期葉片氮含量Stacking估算模型,發(fā)揮Stacking綜合多個(gè)模型估算結(jié)果的優(yōu)點(diǎn),實(shí)現(xiàn)對柑橘葉片氮含量的準(zhǔn)確估算,并生成對應(yīng)的氮含量空間分布圖,為果園精細(xì)化種植和科學(xué)管理提供決策支持。

    1 材料與方法

    1.1 研究區(qū)概況

    本研究區(qū)位于云南省中部的玉溪市(23°19′~24°53′N,101°16′~103°09'E),地勢西北高、東南低,以山地、峽谷、盆地為主,多種地貌交錯(cuò)分布,屬于亞熱帶氣候,年平均氣溫在20 ℃左右,光照充足。該區(qū)內(nèi)以弱酸性赤紅壤為主,適合柑橘的種植和生長。研究區(qū)共分為3個(gè)種植區(qū)域,如圖1所示。3個(gè)種植區(qū)平均樹齡在10 a左右,果樹根據(jù)地勢變化呈階梯狀規(guī)則排列,由農(nóng)戶按地塊進(jìn)行管理和種植,平均行、列間距分別為3和2 m,平均冠層直徑為3.1 m,平均樹高為2.8~3.2 m。

    1.2 數(shù)據(jù)獲取與預(yù)處理

    1.2.1 地面樣本數(shù)據(jù)

    在充分考慮研究區(qū)地理?xiàng)l件和果園種植情況的基礎(chǔ)上,地面采樣點(diǎn)布設(shè)的原則是:以農(nóng)戶種植地塊為基本單元,在研究區(qū)內(nèi)選擇種植水平差異較大,且能反映附近區(qū)域種植情況的地塊均勻布設(shè)采樣點(diǎn),并保證每個(gè)采樣點(diǎn)落入一個(gè)農(nóng)戶種植地塊內(nèi)。2017-2019年3個(gè)種植區(qū)共布設(shè)20個(gè)采樣點(diǎn),由于區(qū)域2種植面積較大,且為該果園的主產(chǎn)區(qū),所以2020年在該區(qū)域增設(shè)25個(gè)采樣點(diǎn),整個(gè)研究區(qū)采樣點(diǎn)共計(jì)45個(gè),如圖1所示。

    為了獲得果樹生長關(guān)鍵時(shí)期的LNC,對后續(xù)施肥進(jìn)行指導(dǎo),試驗(yàn)選擇2017-2019年的7月中旬進(jìn)行一次采樣。由于2020年增加了采樣點(diǎn)的數(shù)量,采樣時(shí)間由當(dāng)年的7月中旬開始至8月下旬結(jié)束,地面采樣情況見表1。

    表1 地面采樣與Landsat8 OLI影像信息

    采樣時(shí)使用RTK-GPS測量系統(tǒng)記錄采樣點(diǎn)及其左右兩棵樹的坐標(biāo)。柑橘果樹較大,果樹內(nèi)部的氮含量容易轉(zhuǎn)移,不同冠層高度、不同葉位的氮含量存在一定的差異,為使得采樣點(diǎn)柑橘葉片氮含量具有代表性,選擇每棵果樹冠層中上部的四個(gè)方位及中心位置枝條的倒三、倒四葉位進(jìn)行葉片采摘,如圖2所示。

    每個(gè)采樣方位采集20片樹葉,即一棵樹采集100片樹葉,一個(gè)采樣點(diǎn)共獲取300片樹葉。采集的葉片裝入干燥的牛皮紙袋并迅速送往實(shí)驗(yàn)室,先用去離子水清洗新鮮葉片,然后將葉片送入烘箱,在105 ℃的條件下殺青30 min,接著在75 ℃條件下將葉片烘干至質(zhì)量恒定,最后將烘干的葉片研磨成粉,充分混勻后采用凱氏定氮法測定葉片全氮含量。將這300片樹葉的氮含量平均值視作對應(yīng)采樣點(diǎn)的葉片氮含量,并以此值代表采樣點(diǎn)所在農(nóng)戶種植地塊的柑橘葉片氮含量水平。

    1.2.2 Landsat8 OLI衛(wèi)星影像

    由于果園施肥時(shí)間在采樣時(shí)間之后,采樣時(shí)葉片已處于生長成熟、各項(xiàng)生化組分較為穩(wěn)定的狀態(tài),因此使用與采樣時(shí)間鄰近日期的衛(wèi)星影像進(jìn)行周期性觀測并估算葉片氮含量。衛(wèi)星影像來源于美國地質(zhì)調(diào)查局官網(wǎng)(https://earthexplorer.usgs.gov/),分別于2017-2020年每年下載一景與采樣時(shí)間對應(yīng)的Landsat8 OLI遙感影像,影像信息與地面采樣時(shí)間見表1。所有影像數(shù)據(jù)均已經(jīng)過幾何精校正、輻射定標(biāo)和大氣校正。在對衛(wèi)星遙感影像進(jìn)行預(yù)處理后,利用采樣點(diǎn)GPS位置提取對應(yīng)像素的光譜反射率,以中心樹和左右兩棵樹提取到的光譜反射率平均值作為該采樣點(diǎn)最終的光譜反射率。

    1.2.3 數(shù)據(jù)預(yù)處理

    由于2018-2019年局部影像受到云霧遮擋,在提取采樣點(diǎn)光譜反射率時(shí)剔除了光譜反射異常值和缺失值。歸一化是機(jī)器學(xué)習(xí)中常常使用的數(shù)據(jù)預(yù)處理方法,對特征進(jìn)行適當(dāng)?shù)臍w一化對于訓(xùn)練模型和提高運(yùn)算效率十分重要[12]。試驗(yàn)中對所選擇的模型特征進(jìn)行歸一化處理,將特征范圍統(tǒng)一變換至[0,1]間,歸一化公式如下:

    new=(Xmin)/(maxmin) (1)

    式中new表示歸一化后的特征值,X表示原始特征,min和max分別表示的是該類特征中的最小值和最大值。

    1.3 研究方法

    1.3.1 集成學(xué)習(xí)

    Stacking是一種通過元模型(Meta-model)將多個(gè)單一模型進(jìn)行組合的集成策略,這些單一模型稱作基模型(Base-model)。Stacking集成學(xué)習(xí)能有效提高模型的魯棒性和泛化能力,但基模型性能的好壞影響著Stacking模型的最終效果,因此選擇基模型時(shí)應(yīng)充分考慮學(xué)習(xí)器的充分性和多樣性[13],即基模型具有良好的學(xué)習(xí)能力,且各基模型之間相互獨(dú)立,以此實(shí)現(xiàn)模型間信息的有效互補(bǔ)。

    K-近鄰模型(K-Nearest Neighbors,KNN)、自適應(yīng)增強(qiáng)模型(Adaptive boosting,Adaboost)和隨機(jī)森林模型(Random Forest,RF)在回歸問題上具有出色的表現(xiàn),并且有著較強(qiáng)的非線性擬合能力。KNN有成熟的理論作為支撐,數(shù)學(xué)原理易于理解,有廣泛的應(yīng)用;Adaboost能根據(jù)弱學(xué)習(xí)器的性能調(diào)整訓(xùn)練樣本的分布,并對得到錯(cuò)誤結(jié)果的樣本賦予更大的權(quán)重,通過不斷學(xué)習(xí)調(diào)整后的樣本,對所有弱學(xué)習(xí)器進(jìn)行加權(quán)組合得到最終的結(jié)果[14];RF不僅繼承了Bagging模型(Bootstrap Aggregating)高度并行的優(yōu)點(diǎn),選擇節(jié)點(diǎn)進(jìn)行特征劃分還使得RF能實(shí)現(xiàn)高效地訓(xùn)練[15]。這3種回歸模型滿足了選擇基模型時(shí)的充分性和多樣性原則,因此被廣泛使用作為Stacking的基模型[16-19]。本研究使用上述3種模型,結(jié)合線性回歸(Linear Regression,LR)構(gòu)建Stacking模型對柑橘LNC進(jìn)行估算,模型架構(gòu)如圖3所示。

    Stacking模型的原理就是將基模型在數(shù)據(jù)集上得到的特征用元模型進(jìn)一步擬合,實(shí)現(xiàn)對基模型特征提取能力的綜合和特征的堆疊。利用Stacking模型進(jìn)行柑橘LNC估算的步驟為:1)將衛(wèi)星光譜特征數(shù)據(jù)集劃分為訓(xùn)練集和測試集,在訓(xùn)練集上利用交叉驗(yàn)證和格網(wǎng)搜索實(shí)現(xiàn)對模型的訓(xùn)練;2)每個(gè)基模型訓(xùn)練后,在測試集上得到對應(yīng)的估算值;3)將基模型交叉驗(yàn)證得到的特征輸入到元模型中,并將基模型在測試集上的估算值取平均作為元模型的測試集;4)最后利用輸入的新特征對元模型進(jìn)行訓(xùn)練和測試,得到最終柑橘LNC的估算結(jié)果。此外,為了證明Stacking集成模型與其他研究中的單一模型相比估算效果更好,試驗(yàn)還對Bagging模型、多元線性回歸模型(Multiple Linear Regression,MLR)、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Artificial Neural Network,ANN)和多核支持向量機(jī)(Multiple-kernel Support Vector Regression,MK-SVR)[20]進(jìn)行訓(xùn)練,其中Adaboost和Bagging模型中所使用的基礎(chǔ)學(xué)習(xí)器為決策樹。

    1.3.2 光譜特征分析與指數(shù)構(gòu)建

    植物葉片在營養(yǎng)元素含量變化的影響下,其內(nèi)部生理代謝過程和生化組分會(huì)發(fā)生變化,導(dǎo)致葉片內(nèi)部化學(xué)鍵的振動(dòng)情況隨之改變,最終表現(xiàn)為不同波段上光譜反射率的差異[21]。為了分析Landsat8 OLI衛(wèi)星遙感數(shù)據(jù)對柑橘葉片LNC估算的可行性,首先要對不同LNC的光譜特征進(jìn)行分析。經(jīng)統(tǒng)計(jì),樣本實(shí)測LNC在26.40~37.6 g/kg之間,平均值為31.8 g/kg。由研究區(qū)生產(chǎn)經(jīng)驗(yàn)可知,最理想的LNC值為30~32 g/kg,因此將樣本按實(shí)測LNC值高低排序,并以“2 g/kg”為間隔劃分為6組,計(jì)算每組樣本的光譜反射率平均值,不同柑橘LNC與光譜反射率的關(guān)系如圖4所示。

    由圖4可知,柑橘冠層的光譜反射率與典型植物相似。在可見光區(qū)間內(nèi)(400~760 nm),由于氮能促進(jìn)葉綠素合成,葉綠素對光譜的吸收導(dǎo)致此波段范圍內(nèi)光譜反射率隨LNC增加而降低[22]。在近紅外波段(760~1 250 nm),果樹冠層多重反射導(dǎo)致反射率顯著高于其他波段。在1 750和2 250 nm兩個(gè)短波紅外處隨著LNC增加反射率逐漸降低,這是由于葉片存在水汽吸收特性,氮含量的增加使得葉片對水汽的吸收能力增強(qiáng)。綜上,在可見光至近紅外波段內(nèi)(400~1 250 nm),柑橘冠層光譜反射率存在明顯的差異,即LNC越高,光譜反射率越低,表明LNC的差異導(dǎo)致柑橘冠層葉片出現(xiàn)不同的光譜響應(yīng),因此可以利用Landsat8 OLI衛(wèi)星影像光譜數(shù)據(jù)對柑橘冠層LNC進(jìn)行估算。表2是對Landsat8衛(wèi)星波段反射率與柑橘LNC的相關(guān)分析結(jié)果,由表可知柑橘LNC與原始光譜波段反射率具有較好的相關(guān)性。在440、480、560和650 nm處,柑橘LNC與光譜反射率呈顯著相關(guān)(<0.01),與劉雪峰等[21]的研究結(jié)果相似。Min等[23]采用逐步多元回歸和偏最小二乘回歸發(fā)現(xiàn)柑橘葉片氮含量重要波段在448和669 nm左右,證明可以將對應(yīng)的衛(wèi)星原始波段作為構(gòu)建VIs的基礎(chǔ)。

    表2 柑橘LNC與Landsat8波段反射率的相關(guān)性

    注:“*”表示<0.01,下同。

    Note: “*” indicates<0.01, same as below.

    氮的光譜吸收波段主要集中在短波紅外區(qū),但是新鮮葉片在該區(qū)間內(nèi)存在3個(gè)典型的水汽吸收波段(1 450、1 950和2 700 nm),削弱了該區(qū)間內(nèi)氮的吸收特征,基于短波紅外區(qū)的氮素特征指數(shù)難以構(gòu)建[24]。氮素與葉綠素的合成密切相關(guān),利用VIs反演得到作物葉綠素的方法也有較為廣泛的應(yīng)用[25],因此本研究除了將Landsat8遙感影像的7個(gè)原始光譜波段作為輸入特征,還選擇了其他在葉綠素反演和氮含量估算中有潛力的VIs作為模型的輸入。

    為了篩選出適合輸入模型的特征指數(shù),計(jì)算了VIs與柑橘LNC的Pearson相關(guān)系數(shù)。Pearson相關(guān)系數(shù)表達(dá)式如下:

    =Σ(i?)·(i?)/[Σ(i?)2·Σ(i)2]1/2(2)

    式中代表計(jì)算得到的Pearson相關(guān)系數(shù),i和i分別代表各采樣點(diǎn)的第個(gè)植被指數(shù)值和對應(yīng)的實(shí)測LNC值,g/kg,和分別代表兩者的平均值。取值范圍通常為[?1,1],||>0.5表明兩變量之間具有較強(qiáng)的相關(guān)性,因此將||≤0.5的VIs予以剔除。試驗(yàn)構(gòu)建的光譜植被指數(shù)及與LNC相關(guān)分析結(jié)果見表3。

    表3 研究中構(gòu)建的光譜植被指數(shù)

    1.4 模型建立與評價(jià)

    研究采用Python 3.6中的Scikit-learn庫進(jìn)行模型的建立和訓(xùn)練。由于樣本較少,使用隨機(jī)抽樣會(huì)導(dǎo)致訓(xùn)練集和測試集數(shù)據(jù)分布出現(xiàn)較大差異,影響模型估算精度,因此本研究采用系統(tǒng)抽樣將數(shù)據(jù)集按照7:3劃分為訓(xùn)練集和測試集,保證數(shù)據(jù)具有相同分布。試驗(yàn)采用格網(wǎng)搜索和5折交叉驗(yàn)證訓(xùn)練模型,從而確定最優(yōu)模型參數(shù),緩解由有限樣本帶來的過擬合問題。模型參數(shù)格網(wǎng)搜索結(jié)果見表4。

    試驗(yàn)分別使用決定系數(shù)(Determination coefficient,2),均方根誤差(Root Mean Square Error,RMSE),平均絕對誤差(Mean Absolute Error,MAE)和平均絕對百分比誤差(Mean Absolute Percent Error,MAPE)對各模型的估算結(jié)果進(jìn)行定量分析和評價(jià)。

    模型復(fù)雜度也是用來評價(jià)模型性能的重要因素,因此,試驗(yàn)還選擇赤池信息準(zhǔn)則(Akakike Information Criteria,AIC)[26]作為更加綜合、客觀評價(jià)模型復(fù)雜度和擬合效果的指標(biāo)。AIC提供了權(quán)衡模型復(fù)雜度和擬合數(shù)據(jù)優(yōu)良性的標(biāo)準(zhǔn),在特征優(yōu)選、模型選擇等方面有廣泛的應(yīng)用[27],其值越小,說明該模型擬合效果更好。AIC表達(dá)式如下:

    AIC2(1)+ln(SSR/) (3)

    式中為模型中的變量個(gè)數(shù),為樣本個(gè)數(shù),SSR為殘差平方和。

    表4 各模型主要參數(shù)格網(wǎng)搜索結(jié)果

    2 結(jié)果與分析

    2.1 氮含量估算結(jié)果

    各模型基于訓(xùn)練集和測試集的柑橘冠層LNC估算結(jié)果見表5。

    表5 各模型估算結(jié)果

    注:2為決定系數(shù)。RMSE、MAE分別是均方根誤差、平均絕對誤差,g·kg-1。MAPE是平均絕對百分比誤差,%。AIC為赤池信息準(zhǔn)則。

    Note:2is coefficient of determination. RMSE and MAE are root mean square error, mean absolute error respectively, g·kg-1. MAPE is mean absolute percent error, %. AIC is Akaike Information Criterion.

    由表5可知,在訓(xùn)練集中Adaboost模型2最高,達(dá)到了0.999,ANN表現(xiàn)最差,2為0.577。在測試集中,除了MLR和ANN,其余模型2均在0.6以上。Stacking模型在測試集上表現(xiàn)最佳,2達(dá)到0.761,RMSE和MAE分別為1.366、1.046 g/kg,MAPE為3.494%,表明該模型泛化能力較強(qiáng)。與單一模型中精度最高的Adaboost相比,Stacking模型測試集2提高0.025, RMSE和MAE分別降低0.07和0.109 g/kg,MAPE降低0.325個(gè)百分點(diǎn)。同時(shí),Stacking模型的AIC值在所有模型中最小,為54.976,說明該模型是進(jìn)行LNC估算的最優(yōu)模型。各基模型和Stacking模型的實(shí)測值與估算值如圖5所示,當(dāng)實(shí)測LNC<32 g/kg時(shí),所有模型的估算值高于或接近實(shí)測值,而當(dāng)實(shí)測LNC>32 g/kg時(shí),所有模型都在不同程度上低估了實(shí)測值,導(dǎo)致RMSE偏大。各模型在LNC平均值(31.8 g/kg)附近時(shí),模型效果較好。綜合來看,Stacking模型的柑橘LNC估算效果較好,能夠綜合基模型優(yōu)點(diǎn),提高模型估算精度,同時(shí)其AIC明顯低于各單一模型,說明其能平衡模型復(fù)雜度和擬合精度,適合作為本研究觀測時(shí)期的LNC最優(yōu)估算模型。

    2.2 氮含量分布圖

    KNN、RF、Adaboost和Stacking模型估算的柑橘果園氮含量空間分布如圖6所示。由圖6可知,KNN模型得到的LNC值總體偏低,RF和Adaboost模型得到的柑橘LNC空間分布相似。Stacking模型生成的柑橘LNC分布圖顯示,研究區(qū)整體LNC值處于30.5~31.5 g/kg左右。區(qū)域1內(nèi)平均樹齡在10 a以上,是果樹生長狀態(tài)最為穩(wěn)定的區(qū)域,由于該區(qū)域樣本較少,模型估算結(jié)果未表現(xiàn)出明顯的分布規(guī)律。區(qū)域2平均樹齡與區(qū)域1接近,是研究區(qū)內(nèi)規(guī)模最大的種植區(qū),該區(qū)域東部LNC值多處于30.5~31.5 g/kg內(nèi)。區(qū)域3平均樹齡為6~8 a,與區(qū)域1、2相比果樹較為低矮,果樹之間間隙較大,影像中包含的土壤背景對模型估算結(jié)果造成了影響,其LNC值幾乎無差異??傮w而言,Stacking模型得到LNC估算值與實(shí)測值基本相符,且處于較理想的LNC值區(qū)間內(nèi)。

    3 討 論

    從研究區(qū)實(shí)際情況來看,受到果樹種植模式、冠層結(jié)構(gòu)和生長階段等因素的綜合影響,采樣點(diǎn)光譜反射率是樹冠信息的綜合反映,而土壤背景作為主要的噪聲混雜在像元中,對采樣點(diǎn)的光譜信息造成了干擾。土壤背景光譜反射率取決于表面粗糙度、含水率、有機(jī)質(zhì)含量等特性,隨著果樹的生長,土壤背景也具有動(dòng)態(tài)的光譜特征[28]。為了將土壤背景的影響降至最小,人們提出了土壤線的概念并廣泛應(yīng)用于遙感數(shù)據(jù)的解釋中[29],即根據(jù)與土壤線的距離或角度盡可能避免土壤背景對樹冠光譜反射率的影響。基于這一概念,大量用于克服土壤背景影響的VIs被提出,如EVI、EVI2、SAVI、OSAVI、TSAVI等,并在多個(gè)利用衛(wèi)星遙感影像對作物生化參數(shù)進(jìn)行估算的研究中使用[30-33]。同樣地,試驗(yàn)中選擇了這些VIs作為模型的輸入以充分地反映柑橘樹冠葉片的光譜特征,分析結(jié)果證明使用的光譜特征與LNC有較好的相關(guān)性,所以VIs作為構(gòu)建估算模型的重要特征,需要具有一定的削弱土壤背景影響的能力。由于冠層結(jié)構(gòu)造成的多重散射在近紅外區(qū)域尤為明顯,作為能夠區(qū)分植物不同氮水平的特征波段,試驗(yàn)采用的VIs也大都是基于近紅外波段計(jì)算的。此外,研究表明“光譜特征+紋理特征”對作物生化指標(biāo)進(jìn)行估算能獲得更高的精度[34-35],而本研究僅利用光譜指數(shù)構(gòu)建柑橘LNC估算模型,未能全面地提取柑橘果樹的特征信息,因此后續(xù)將嘗試綜合多種特征構(gòu)建估算模型。

    很多研究證明集成模型在許多應(yīng)用中的表現(xiàn)優(yōu)于單一模型[14,16,36],試驗(yàn)結(jié)果也證明,與單一回歸模型相比,Stacking能提高對柑橘LNC的估算精度。由試驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)Adaboost模型和多元線性回歸模型存在較嚴(yán)重的過擬合,造成這一結(jié)果的原因有:樣本數(shù)量的限制和模型參數(shù)的選擇不充分。從樣本數(shù)量來看,只針對果樹單個(gè)生長時(shí)期進(jìn)行觀測和采樣難以實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)集的擴(kuò)充;從模型參數(shù)的選擇方法來看,格網(wǎng)搜索有所局限,導(dǎo)致模型陷入局部最優(yōu)。試驗(yàn)中Stacking模型采用五折交叉驗(yàn)證進(jìn)行訓(xùn)練,緩解了過擬合現(xiàn)象,在保證模型具有較強(qiáng)擬合能力的同時(shí),提升了估算精度,增強(qiáng)了模型泛化能力。

    4 結(jié) 論

    柑橘產(chǎn)業(yè)是中國農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)的重要組成部分,果樹種植和生產(chǎn)迫切需要對柑橘氮肥的施用開展科學(xué)合理的定量化研究。本研究基于Landsat8 OLI遙感影像構(gòu)建了以K-近鄰(K-Nearest Neighbors,KNN),隨機(jī)森林(Random Forest,RF)和自適應(yīng)增強(qiáng)(Adaptive boosting,Adaboost)為基礎(chǔ)的Stacking集成模型,實(shí)現(xiàn)了對柑橘葉片氮含量的準(zhǔn)確估算,并得到了對應(yīng)的氮含量分布圖。研究結(jié)果表明:

    1)受氮含量變化的影響,柑橘冠層葉片的光譜響應(yīng)存在明顯的差異,經(jīng)光譜特征分析構(gòu)建的光譜指數(shù)與葉片氮含量(Leaf Nitrogen Content,LNC)有良好的相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)大都在0.55以上,藍(lán)-綠波段歸一化差值植被指數(shù)(Green-Blue Normalized Difference Vegetation Index,GBNDVI)和結(jié)構(gòu)增強(qiáng)植被指數(shù)(Structure Intensive Pigment Index,SIPI)與氮含量相關(guān)性較強(qiáng),相關(guān)系數(shù)分別為0.678和0.640;

    2)相比于KNN、RF和Adaboost模型,Stacking模型能提高對柑橘LNC的估算精度,同時(shí),Stacking模型的赤池信息準(zhǔn)則(Akakike Information Criteria,AIC)值明顯低于其他模型,是本研究觀測期內(nèi)估算LNC的優(yōu)選模型。

    3)估算的LNC空間分布圖顯示,研究區(qū)內(nèi)LNC大都處于30.5~31.5 g/kg,與實(shí)際情況相符,估算結(jié)果可靠。

    此外,加入影像紋理信息,增加對果樹其他生長時(shí)期的觀測是將要進(jìn)一步開展的工作??偟膩碚f,本研究證明了基于Landsat8 OLI遙感影像利用Stacking模型對柑橘葉片進(jìn)行LNC估算的可行性和有效性,能夠無損、快速獲取大尺度的柑橘果園氮含量分布情況,為利用衛(wèi)星遙感開展作物參數(shù)估算提供了新的思路。

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    Estimation of nitrogen contents in citrus leaves using Stacking ensemble learning

    Wu Tong1, Li Yong2※, Ge Ying2, Liu Lingjie1, Xi Shunzhong2, Ren Mengjie2, Yuan Xiaohui3, Zhuang Cuizhen3

    (1.210098,; 2.,211100,; 3..,,653407,)

    Leaf Nitrogen Content (LNC) is an important indicator to evaluate the quality and yield of fruits, where nitrogen is an essential nutrient element for the growth of citrus. Satellite remote sensing has been widely used to rapidly and nondestructively capture nitrogen content data for the cultivation and production of citrus in recent years. In this study, a two-layer stacking ensemble learning framework was constructed using Landsat8 OLI satellite remote sensing images and ground sample data, thereby accurately estimating the nitrogen content of citrus leaves in critical growth periods. K-Nearest Neighbor (KNN), Random Forest (RF), and Adoptive boosting (Adaboost) were utilized as base models, whereas, Linear Regression (LR) was employed as the meta-model. The LNC values were sorted from high to low and then divided into 6 groups at equal intervals. A systematic analysis was also made to compare the spectral characteristics under different LNC. There were significant differences in the spectral reflectance in the visible light range (400-760 nm) and near-infrared band (760-1 250 nm), due mainly to the absorption of chlorophyll and the multiple reflections of the canopy. The trees with higher LNC commonly presented lower spectral reflectance. The correlation coefficient between vegetation indices (VIs) and LNC was calculated to optimize the spectral features. Grid search and 5-fold cross validation were utilized to train the model, where the LNC distribution map was generated for the study area. The results showed that the Stacking presented the best performance in the testing dataset, with coefficient of determination (2) of 0.761, Mean Absolute Error (MAE) of 1.046 g/kg, Root Mean Squared Error (RMSE) of 1.366 g/kg and Mean Absolute Percent Error (MAPE) of 3.494%.. Compared with Adaboost, the best performance was achieved using individual models, where the2increased by 0.025, whereas RMSE, MAE, and MAPE decreased by 0.07, 0.109 g/kg and 0.325 percentage point, respectively. It revealed that the Stacking was fully integrated into the base models for a higher estimation accuracy. However, there was an obviously underestimated phenomenon in the measured value from each model, particularly in the LNC estimated values of >32 g/kg. Meanwhile, by comparing the Akaike Information Criterion (AIC) of each model, the AIC value of Stacking was significantly lower than other individual model, indicating that Stacking was the best LNC estimation model in the observation period of this study. In addition, soil background and model performance were discussed. The spectral information was interfered by soil background. Based on the concept of soil line, many researchers proposed some VIs to reduce the influence, which were also adopted. In this study, only spectral features were used to build the model, which limited the capability of the model. It would be considered to increase the observation periods and add texture features to construct a more comprehensive estimation model. In summary, Stacking could accurately and effectively estimate citrus LNC, providing the potential to estimate the nitrogen content in citrus leaves using satellite remote sensing.

    satellite;remote sensing; models; citrus; nitrogen; stacking; vegetation index

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    2021-01-22

    2021-06-07

    “十三五”國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFA0601504);國家自然科學(xué)基金(41977394);云南省重大科技專項(xiàng)計(jì)劃項(xiàng)目資助(202002AE090010)

    吳彤,研究方向?yàn)檗r(nóng)作物品質(zhì)遙感監(jiān)測。Email:wutonghhu@hhu.edu.cn

    李勇,副教授,研究方向?yàn)檗r(nóng)業(yè)時(shí)空數(shù)據(jù)智能處理與分析。Email:liyong@hhu.edu.cn

    10.11975/j.issn.1002-6819.2021.13.019

    S127

    A

    1002-6819(2021)-13-0163-09

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