徐晶鈺,張 璇,王曉煒,陸 燁,裴 蓓,魏品康
(1. 中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)第二附屬醫(yī)院,上海 200003;2. 中國人民解放軍海軍第905醫(yī)院,上海 200052)
全球范圍內(nèi)惡性腫瘤發(fā)病率、病死率每年逐步提升,使人民的生命健康受到嚴(yán)重威脅,并加重了國家的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)[1]。如何診治惡性腫瘤一直是醫(yī)學(xué)研究的熱點(diǎn)。隨著科研技術(shù)與方法的持續(xù)更新,針對惡性腫瘤發(fā)病機(jī)制的靶向藥物不斷被研發(fā),患者臨床獲益日漸明顯[2]。表皮生長因子受體抑制劑(epidermal growth factor receptor inhibitors,EGFRI)是臨床上使用最為廣泛、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)最為充分的靶向藥物,常見的EGFRIs包括吉非替尼、厄洛替尼、奧希替尼、西妥昔單抗等。目前公布的臨床數(shù)據(jù)證實(shí)在多種晚期實(shí)體腫瘤中,EGFRIs的使用使患者臨床癥狀明顯緩解,生活質(zhì)量得到改善,中位生存期顯著延長[3]。基礎(chǔ)研究證實(shí)EGFRIs能對腫瘤病程進(jìn)展中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)——EGFR信號通路進(jìn)行調(diào)控,對腫瘤細(xì)胞起到干預(yù)增殖、加速凋亡、抑制侵襲遷移、影響新生血管生成等多種作用[4]。EGFR不僅是跨膜酪氨酸激酶生長因子受體的重要組成部分,而且也是原癌基因c-erbB1活化后的特定產(chǎn)物,廣泛分布于皮膚角質(zhì)形成細(xì)胞膜表面及成熟毛囊的外根鞘部位[5]。抑制EGFR信號通路雖然可以干預(yù)腫瘤病程進(jìn)展,對腫瘤控制有益,但同樣對皮膚及其附屬器產(chǎn)生毒副作用,使正常皮膚結(jié)構(gòu)出現(xiàn)穩(wěn)態(tài)失衡,誘發(fā)丘疹膿皰樣疹、皮膚皸裂、皮膚干燥脫屑瘙癢、指甲或甲周改變、毛發(fā)脫落、卷曲、皮膚黑變、光敏反應(yīng)等毒副作用[6],病情嚴(yán)重者甚至需要減量或停藥,影響患者療效。目前針對本病并無特殊治療藥物,多采用對癥治療,常用藥物如局部使用激素、抗生素、皮膚保護(hù)劑等,療效并不明顯[7]。因此尋找既能增強(qiáng)EGFRIs抗腫瘤療效,同時(shí)又能緩解皮膚毒性反應(yīng)的藥物具有十分明確的臨床意義。中醫(yī)藥因其具有“異病同治”“內(nèi)病外治”等特殊治療特色,在本病的治療上受到廣泛關(guān)注。文獻(xiàn)研究表明,金銀花、苦參是治療EGFRIs皮膚毒性的最常用兩味中藥[8],但具體機(jī)制并未完全清楚。本研究運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,分析金銀花、苦參藥對治療EGFRIs皮膚毒性的分子作用機(jī)制,以期為該藥對的實(shí)驗(yàn)和臨床驗(yàn)證提供數(shù)據(jù)支持。
1.1EGFRIs相關(guān)皮膚毒性靶點(diǎn)搜集 EGFRIs相關(guān)皮膚毒性患者最常見癥狀為痤瘡樣皮疹和皮膚瘙癢,因此以“acne”“pruritus”“rash”“Dermatitis”作為檢索詞,通過CTD數(shù)據(jù)庫(http://ctdbase.org/)、Disgenet數(shù)據(jù)庫(http://www.disgenet.org/),OMIM數(shù)據(jù)庫(https://omim.org/)、drugbank數(shù)據(jù)庫(https://www.drugbank.ca/)檢索疾病相關(guān)靶點(diǎn),并將以上數(shù)據(jù)庫得到的靶點(diǎn)匯總并除去重復(fù)值,使用UniProt數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)對靶點(diǎn)信息進(jìn)行校正,從而建立EGFRIs相關(guān)皮膚毒性靶點(diǎn)數(shù)據(jù)集。
1.2金銀花、苦參成分及靶點(diǎn)搜集 檢索TCMSP數(shù)據(jù)庫(http://lsp.nwsuaf.edu.cn/tcmsp.php)得到金銀花、苦參含有的化合物成分,根據(jù)藥動(dòng)學(xué)特性(ADME)參數(shù)篩選活性成分,同樣通過Uniprot數(shù)據(jù)庫校正。
1.3共有靶點(diǎn)篩選及共有靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 借助Genomics平臺(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)篩選金銀花、苦參兩味中藥與疾病的共有靶點(diǎn),導(dǎo)入STRING平臺(https://string-db.org/)構(gòu)建共有靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)。
1.4金銀花、苦參“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 將中藥化合物成分和共有靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape(3.7.2)軟件(http://cytoscapeweb. cytoscape.org/),構(gòu)建成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),采用Cytoscape軟件內(nèi)置的Network Analyzer工具進(jìn)行可視化分析。關(guān)注“節(jié)點(diǎn)”(node)與“邊”(edge)。node表示中藥化合物成分和疾病靶點(diǎn),edge表示二者之間的關(guān)系。用度值(Degree)評價(jià)藥物成分和靶點(diǎn)的重要程度,度值表示網(wǎng)絡(luò)中與其他節(jié)點(diǎn)相連路徑條數(shù),數(shù)值越大表明該靶點(diǎn)在網(wǎng)絡(luò)中作用越重要。借此研究金銀花、苦參兩味中藥中較為重要的成分、靶點(diǎn)及二者之間的關(guān)系。
1.5GO分類、KEGG 通路富集分析 使用R語言(R version 3.6.3,http://www.r-project.org/)進(jìn)行基因本位(Gene Ontology,GO)、京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集(P<0.05),結(jié)果以氣泡圖顯示。GO富集分析包括分子功能(Molecular Function,MF)、生物過程(biological process,BP)和細(xì)胞組成(cellular component,CC)3個(gè)部分,可闡述關(guān)鍵靶點(diǎn)的抗EGFRIs皮膚毒性的生物過程;KEGG富集分析,揭示關(guān)鍵靶點(diǎn)抗EGFRIs皮膚毒性的主要信號通路。
1.6“藥物成分-作用靶點(diǎn)-作用通路”網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 將1.5中KEGG富集分析出的通路結(jié)果結(jié)合文獻(xiàn)分析,取排名前20的通路,并將金銀花、苦參有效成分和基于KEGG結(jié)果所映射的相關(guān)靶標(biāo)導(dǎo)入Cytoscape軟件構(gòu)建“藥物成分-作用靶點(diǎn)-作用通路”網(wǎng)絡(luò),進(jìn)一步篩選金銀花、苦參藥對治療EGFRIs皮膚毒性的關(guān)鍵靶點(diǎn)及通路。
2.1EGFRIs皮膚毒性及金銀花、苦參成分和靶點(diǎn)搜集 通過CTD、OMIM、Drugbank、Disgenet數(shù)據(jù)庫篩選出541個(gè)疾病靶點(diǎn)。通過TCMSP數(shù)據(jù)庫,根據(jù)設(shè)定ADME篩選標(biāo)準(zhǔn)納入金銀花成分15個(gè),苦參成分22個(gè),二者重復(fù)成分1個(gè),刪除重復(fù)值后共得到210個(gè)藥物靶點(diǎn)信息。
2.2共有靶點(diǎn)篩選及PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將金銀花、苦參和疾病靶點(diǎn)導(dǎo)入Genomics平臺構(gòu)建韋恩圖取交集,篩選共有靶點(diǎn),見圖1。將48個(gè)共有靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING平臺構(gòu)建靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò),見圖2A。網(wǎng)絡(luò)中包含48個(gè)節(jié)點(diǎn),319條邊,Degree平均值為13.3。將靶點(diǎn)信息導(dǎo)入Cytoscape軟件作圖并計(jì)算節(jié)點(diǎn)Degree值。予中位數(shù)(12,19,25)進(jìn)行Degree劃分,Degree≥25的節(jié)點(diǎn)是:AKT1、IL6、VEGFA、MAPK1、IL1B、EGFR、PTGS2,ALB,見圖2B及表1。
圖1 EGFRIs皮膚毒性和金銀花、苦參藥對靶點(diǎn)維恩圖
圖2 EGFRIs皮膚毒性和金銀花、苦參藥對共有靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)
表1 PPI網(wǎng)絡(luò)中EGFRIs皮膚毒性和金銀花、苦參藥對共有靶點(diǎn)
2.3金銀花、苦參成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將金銀花、苦參化合物成分和疾病靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape軟件構(gòu)建“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)(見圖3),可知槲皮素作用于AKT1、IL6、VEGFA、MAPK1、IL1B、EGFR、PTGS2,山奈酚作用于AKT1、PTGS2,木犀草素作用于AKT1、IL6、VEGFA、MAPK1、EGFR、PTGS2,beta-谷甾醇作用于PTGS2,即槲皮素、山奈酚、木犀草素、beta-谷甾醇既是金銀花、苦參中的重要化合物成分,也是治療EGFRIs皮膚毒性的潛在藥物成分。兩味中藥化合物成分中Degree前4的成分是MOL000098(槲皮素,quercetin)、MOL000422(山奈酚,kaempferol)、MOL000006(木犀草素,luteolin)、MOL000358(beta-谷甾醇,beta-sitosterol),見表2。
圖3 金銀花、苦參“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖
表2 金銀花、苦參藥對成分化合物(按Degree值取前十)
2.4GO和KEGG通路富集分析 GO富集分析結(jié)果顯示,48個(gè)相關(guān)靶點(diǎn)共得到 686個(gè)富集結(jié)果。其中包括生物過程(BP)391項(xiàng),主要涉及細(xì)胞對藥物、氧化應(yīng)激、營養(yǎng)、異源生物刺激的反應(yīng)等;分子功能(MF)43項(xiàng),主要涉及G蛋白耦聯(lián)的胺受體和神經(jīng)遞質(zhì)受體活性、細(xì)胞因子受體活性、抗氧化活性、磷酸酶結(jié)合等;細(xì)胞組成(CC)49項(xiàng),主要涉及膜筏、膜微區(qū)、膜區(qū)、突觸前膜、突觸后膜等。KEGG富集分析結(jié)果顯示,48個(gè)相關(guān)靶點(diǎn)共參與103條信號通路過程,篩選排名前 20位的信號通路。用R語言繪制GO和KEGG通路富集分析氣泡圖,見圖4。每張圖左側(cè)為排名靠前的富集名稱,氣泡顏色由紅到藍(lán)代表校正后p值從小到大,氣泡越大代表該通路的基因計(jì)數(shù)(Count)越大,橫軸代表該通路基因所占總體輸入基因的比率(Ratio)。綜合文獻(xiàn)分析,與本病相關(guān)的包括MAPK信號通路、VEGF信號通路、IL-17信號通路、TNF信號通路等。
圖4 金銀花、苦參藥對GO富集及KEGG通路富集氣泡圖
2.5“藥物成分-作用靶點(diǎn)-作用通路”網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 為進(jìn)一步揭示信號通路與候選靶標(biāo)及化合物之間的關(guān)系,構(gòu)建“藥物成分-作用靶點(diǎn)-作用通路”網(wǎng)絡(luò),見圖5。 從網(wǎng)絡(luò)中可知,PTGS2、MAPK14、MAPK1、AKT1、IL6、VEGFA、EGFR、IL1B具有較大的Degree值,分別為37,22,22,21,15,15,14,13,以上靶點(diǎn)較前述PPI 網(wǎng)絡(luò)結(jié)果中增加MAPK14,減少ALB,而化合物中前四位與“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)中一致。
圖5 金銀花、苦參藥對“藥物成分-作用靶點(diǎn)-作用通路”網(wǎng)絡(luò)圖
EGFRIs皮膚毒性屬于中醫(yī)外科學(xué)中“藥毒疹”的疾病范疇?!岸尽笔侵杆幬镏?,在現(xiàn)代醫(yī)學(xué)中等同于毒副作用。患者久病體虛,復(fù)感藥物之毒,損傷肌表,常見皮膚毒性具有皮疹、膿皰、紅斑、瘙癢等,故EGFRIs引起的藥毒之性應(yīng)屬溫?zé)嵝浴<又∧w衛(wèi)外功能減弱,易受風(fēng)、濕、熱、火等外邪侵犯,熱、火、濕、風(fēng)等相互搏擊,郁于皮膚腠理導(dǎo)致本病發(fā)生。目前清熱祛風(fēng)、解毒燥濕為中醫(yī)治療EGFRIs皮膚毒性的基本原則。鄧博等[8]通過臨床數(shù)據(jù)挖掘研究發(fā)現(xiàn)金銀花、苦參是治療EGFRIs皮膚毒性的最常用中藥。金銀花清熱解毒、疏散風(fēng)熱,為治一切內(nèi)癰外癰之要藥;苦參清熱燥濕、解毒殺蟲,與金銀花配伍無論內(nèi)服外治對EGFRIs皮膚毒性均有療效,但二者治療本病的具體機(jī)制尚待進(jìn)一步完善。
本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討了金銀花、苦參治療EGFRIs皮膚毒性的作用機(jī)制。在 PPI構(gòu)建的疾病靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)中,根據(jù)Degree值的中位數(shù)計(jì)算,AKT1、IL6、VEGFA、MAPK1、IL1B、EGFR、PTGS2,ALB的節(jié)點(diǎn)Degree值排名靠前,但在最后建立的“藥物成分-作用靶點(diǎn)-作用通路”網(wǎng)絡(luò)中,與前述節(jié)點(diǎn)相比,增加MAPK14,減少ALB。說明ALB與通路相關(guān)性不大,故PTGS2、MAPK14、MAPK1、AKT1、IL6、VEGFA、EGFR、IL1B這8個(gè)節(jié)點(diǎn)可能在本病治療中起到關(guān)鍵作用。EGFR是一種酪氨酸激酶受體,在細(xì)胞膜表面廣泛分布,參與了細(xì)胞增殖、凋亡、黏附、遷移等重要生物學(xué)進(jìn)程[9]。因此EGFRIs雖然可以干預(yù)腫瘤病程進(jìn)展,但同樣對皮膚及其附屬器產(chǎn)生毒副作用,這也是EGFRIs皮膚毒性發(fā)生的主要原因[10]。EGFRIs將破壞皮膚的完整性,這一病理過程將在局部招募大量炎癥相關(guān)因子、趨化因子,誘導(dǎo)皮膚出現(xiàn)明顯的炎癥反應(yīng)[11]。IL-6、IL1B是炎性介質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵成分,與炎性疾病的發(fā)生、發(fā)展和預(yù)后密切相關(guān)[12];PTGS2又名COX-2,是前列腺素生物合成中的關(guān)鍵酶,與炎癥和有絲分裂發(fā)生相關(guān)的前列腺素生物合成有關(guān)[13];MAPK1、MAPK14在MAPK通路中處于核心地位,廣泛參與了細(xì)胞外信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及細(xì)胞增殖、分化、運(yùn)動(dòng)、應(yīng)激等活動(dòng),其中MARK14扮演的是炎癥信號的角色[14]。AKT1是一種絲/蘇氨酸蛋白激酶,與角質(zhì)形成細(xì)胞及毛囊等附屬器細(xì)胞的生長與代謝相關(guān)[15];VEGFA 是血管生成刺激因子,影響內(nèi)皮細(xì)胞的血管通透性,可促進(jìn)皮膚創(chuàng)面的愈合,修復(fù)受損皮膚[16]。
在“藥物成分-疾病靶點(diǎn)”中,通過計(jì)算金銀花、苦參中成分化合物的Degree值,選擇槲皮素、山奈酚、木犀草素、beta-谷甾醇進(jìn)行分析。槲皮素化學(xué)名為 3,3’,4’,5,7-五羥基黃酮,分子式為C15H10O7,生物學(xué)活性豐富,藥理學(xué)作用多樣,具有抗炎、抗氧化、清除自由基、抗病毒、抗腫瘤、降糖及免疫調(diào)節(jié)等作用[17];山奈酚作為蛋白激酶抑制劑,可有效阻止炎癥介質(zhì)的釋放,減輕其對機(jī)體損傷[18];金銀花有效成分木犀草素在植物的次級代謝產(chǎn)物中含量豐富,同樣具有抗炎、抗氧化、抗過敏、抗菌和抗腫瘤特性[19],含有高木犀草素含量的中藥在炎癥相關(guān)的疾病治療中扮演了重要角色[20]。β-谷甾醇作為植物中甾醇類重要組成部分之一,屬于四環(huán)三萜類化合物,同時(shí)也是人體細(xì)胞膜的主要成分。生物功能主要包括抗氧化、抗炎、保護(hù)中樞神經(jīng)系統(tǒng)和抗腫瘤等[21]。根據(jù)文獻(xiàn)分析以上4種成分共性中比較重要的仍是抗炎、抗氧化及抗腫瘤,但進(jìn)一步根據(jù)節(jié)點(diǎn)Degree值考慮炎癥反應(yīng)與本病發(fā)生最為密切。
在人體多種炎癥反應(yīng)中,槲皮素可以通過下調(diào)炎癥因子的表達(dá)而起到抗炎作用。如人為對大鼠大腦中動(dòng)脈進(jìn)行閉塞后導(dǎo)致的腦缺血模型中,給予槲皮素治療,發(fā)現(xiàn)其可以通過上調(diào)IL-4、IL-10和TGF-β1等抗炎細(xì)胞因子表達(dá),下調(diào)IL-6、IL-1β等促炎細(xì)胞因子表達(dá),從而對腦缺血后炎癥導(dǎo)致的繼發(fā)性損傷起到明顯的改善作用[22]。在軟骨組織破壞的過程中,促炎性細(xì)胞因子IL-1β促使前列腺素E2和一氧化氮活化介導(dǎo)的炎性反應(yīng)發(fā)生是這一病理改變的誘因,山奈酚不僅能抑制該炎性通路的活化,還能使膠原蛋白等合成加速,從而明顯促進(jìn)破壞的軟骨組織的修復(fù)[23]。動(dòng)物和細(xì)胞實(shí)驗(yàn)證實(shí)木犀草素具有的抗炎作用可能是通過阻止前列腺素E2的釋放及NF-κB的磷酸化入核,進(jìn)而抑制炎性因子COX-2的表達(dá)。在大鼠足部炎癥模型中,木犀草素可明顯抑制前列腺素E2合成,下調(diào)其表達(dá),從而顯著降低炎足爪中COX-2蛋白表達(dá)[24]。在LPS誘導(dǎo)的RAW264.7細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中,木犀草素能顯著抑制前列腺素E2的表達(dá),使NF-κB的DNA結(jié)合活性減弱,從而降低COX-2的表達(dá)[25]。對C57BL/6J雄性小鼠采用葡聚糖酸鈉(DSS)誘導(dǎo)的結(jié)腸炎模型中,β-谷甾醇灌胃可減緩結(jié)腸縮短,使糞便中血紅素含量受到抑制,并且使結(jié)腸炎病理學(xué)評分得到顯著改善,這一過程可能是通過下調(diào)IL-6和COX-2 的表達(dá)而實(shí)現(xiàn)的[26]。
GO富集分析表明金銀花、苦參可調(diào)控細(xì)胞對藥物、氧化應(yīng)激、營養(yǎng)、異源生物刺激等生物進(jìn)程,干預(yù)G蛋白耦聯(lián)的胺受體和神經(jīng)遞質(zhì)受體、細(xì)胞因子受體、抗氧化活性等分子功能,影響細(xì)胞組成涉及的膜筏、膜微區(qū)、膜區(qū)、突觸前膜、突觸后膜等區(qū)域。根據(jù)文獻(xiàn)對KEGG富集通路進(jìn)一步篩選,排除不相關(guān)通路,發(fā)現(xiàn)金銀花、苦參治療EGFRIs相關(guān)皮膚毒性主要集中在炎癥通路(MAPK通路、IL-17信號通路、TNF信號通路)及VEGF相關(guān)通路。前文中8個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)在以上通路中富集度也高。說明靶點(diǎn)預(yù)測與KEGG的富集分析基本一致。文獻(xiàn)報(bào)道金銀花、苦參能顯著抑制炎癥反應(yīng),從而對本病起到有效治療作用,但具體生物學(xué)特性和相關(guān)通路的研究尚缺乏大數(shù)據(jù)驗(yàn)證。VEGF信號通路與血管生成聯(lián)系緊密,有利于皮膚的修復(fù),因此中藥有可能通過激活VEGF通路治療本病,但這與抗腫瘤機(jī)制相悖??紤]腫瘤部位環(huán)境復(fù)雜,存在大量的病理性血管生成,與正常血管生成區(qū)別較大,因此金銀花、苦參在不同的部位對同樣的通路作用效果也可能存在差異,值得進(jìn)一步探討。
本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法探討了金銀花、苦參藥對治療EGFRIs皮膚毒性的機(jī)制,闡明了中藥通過多成分、多靶點(diǎn)、多途徑對疾病進(jìn)行調(diào)控的思路。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)通過構(gòu)建“藥物活性成分-靶點(diǎn)”“成分-靶點(diǎn)-通路”等網(wǎng)絡(luò),從分子水平揭示靶點(diǎn)和疾病之間的相互關(guān)系和潛在機(jī)制,是目前了解中藥復(fù)方的熱點(diǎn)方法[20]。由于EGFRIs皮膚毒性的治療靶點(diǎn)與腫瘤治療靶點(diǎn)部分相悖,因此需要設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)深入研究金銀花、苦參在腫瘤、皮膚病變部位存在雙向調(diào)節(jié)機(jī)制的可能性,或者明確作用過程中是否有新化合物的產(chǎn)生。本研究的結(jié)論將為治療本病的新藥研發(fā)提供理論依據(jù)。
利益沖突:所有作者均聲明不存在利益沖突。
現(xiàn)代中西醫(yī)結(jié)合雜志2021年23期