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      ULK1啟動(dòng)子區(qū)含有抑制ULK1轉(zhuǎn)錄的G4結(jié)構(gòu)*

      2021-08-04 03:15:22劉雪萍黃偉偉李曉梅
      中國病理生理雜志 2021年7期
      關(guān)鍵詞:調(diào)控基因蛋白

      劉雪萍, 黃偉偉, 李曉梅

      (西北農(nóng)林科技大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,陜西楊凌712100)

      自噬(autophagy)是真核生物中廣泛存在的依賴溶酶體的細(xì)胞內(nèi)降解途徑,對(duì)維持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)和保證細(xì)胞生命活動(dòng)有序進(jìn)行有重要作用。目前已發(fā)現(xiàn)超過30 種自噬相關(guān)基因(autophagy-related genes,ATG),ATG 蛋白及多條上游信號(hào)在各個(gè)階段參與調(diào)控自噬。UNC-51 樣激酶 1(ULK-51-like kinase 1,ULK1)作為酵母Atg1基因在哺乳動(dòng)物中的同源基因,其蛋白是自噬起始步驟的主要調(diào)控子[1]。ULK1參與形成的ULK1 復(fù)合物是細(xì)胞自噬起始所必需的[2]。另外,ULK1 參與形成前自噬體的核心結(jié)構(gòu)[3]。因此,ULK1是自噬起始過程中不可缺少的成分。

      ULK1 參與調(diào)控大量下游自噬相關(guān)通路。在ULK1敲除研究中,小鼠因缺乏ULK1而自噬功能受到強(qiáng)烈抑制[4]。除了參與調(diào)控經(jīng)典的自噬相關(guān)通路,ULK1 還參與一些非經(jīng)典信號(hào)通路的調(diào)節(jié),例如特殊壓力刺激導(dǎo)致的自噬,線粒體自噬等[5]。ULK1廣泛存在于人體各種組織中,與正常組織不同的是ULK1在各種腫瘤細(xì)胞中表達(dá)變化很大,其參與多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程并扮演不同角色[6],Zhang等[7]發(fā)現(xiàn),在雄激素阻斷治療后發(fā)生腫瘤轉(zhuǎn)移的前列腺癌患者中,ULK1的高表達(dá)可作為轉(zhuǎn)移性前列腺癌的有效標(biāo)志物。目前對(duì)于ULK1 的表達(dá)調(diào)控研究國內(nèi)外僅有少量文獻(xiàn)報(bào)道。Mukesh 等[8]發(fā)現(xiàn)ULK1結(jié)構(gòu)域中超過50%的突變會(huì)影響其功能和結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性。此外,王煥等[9]發(fā)現(xiàn)RAD001 能顯著上調(diào)子宮內(nèi)膜癌Ishikawa 及HEC-1A 細(xì)胞中ULK1蛋白的表達(dá)水平。本研究擬對(duì)ULK1的轉(zhuǎn)錄表達(dá)調(diào)控進(jìn)行研究,通過分析ULK1啟動(dòng)子序列,發(fā)現(xiàn)其中存在G 四聯(lián)體(G-quadruplex,G4)形成序列,提示ULK1啟動(dòng)子區(qū)可能形成G4并調(diào)控ULK1的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。G4是一類由富含連續(xù)鳥嘌呤的DNA 序列形成的四鏈螺旋結(jié)構(gòu),廣泛分布于基因組的許多重要區(qū)域,對(duì)DNA 復(fù)制、基因轉(zhuǎn)錄與翻譯和端粒代謝等多種細(xì)胞代謝產(chǎn)生重要影響。目前在多個(gè)基因的啟動(dòng)子區(qū)已發(fā)現(xiàn)G4,它參與轉(zhuǎn)錄激活或沉默基因表達(dá),如c-myc[10]和c-KIT[11]等。G4 廣泛參與基因的表達(dá)調(diào)控且與細(xì)胞衰老、凋亡和腫瘤的發(fā)生發(fā)展及一些其他疾病相關(guān)。正是由于G4在細(xì)胞內(nèi)重要的生物學(xué)功能,近年來G4研究受到廣泛關(guān)注。因此,本研究對(duì)ULK1啟動(dòng)子區(qū)是否形成G4,以及G4 對(duì)ULK1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用進(jìn)行研究,為揭示ULK1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制提供新的線索。

      材料和方法

      1 細(xì)胞

      人前列腺癌細(xì)胞系DU-145 購自北京協(xié)和醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)細(xì)胞中心,用含10%胎牛血清、1×105U/L 青霉素和 100 mg/L 鏈霉素的 RPMI-1640 培養(yǎng)基置于5%二氧化碳、37 ℃培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng),及時(shí)換液、傳代,保持細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài)良好。

      2 主要試劑

      DNA 寡核苷酸和引物由Invitrogen 合成;RPMI-1640 培養(yǎng)基和Opti-MEM 購自Gibco;胎牛血清(900108)購自Gemini;限制性核酸內(nèi)切酶和T4 DNA連接酶購自NEB;Lipofectamine? 2000 Reagent 購自Invitrogen;RNAex Pro RNA 提取試劑(AG21102)、Evo M-MLV 反轉(zhuǎn)錄試劑盒(AG11705)和SYBR Green Pro Taq HS 預(yù)混型PCR 試劑盒(AG11701)均購自艾科瑞生物公司;β-actin 抗體(AA128)、RIPA 裂解液(P0013B)、胰酶(C0201)和青霉素-鏈霉素溶液(C0222)均購自碧云天生物技術(shù)公司;ULK1 抗體(8054S)購自CST;HRP 標(biāo)記的山羊抗鼠(L3032)和山羊抗兔(L3012)Ⅱ抗購自SAB;ECL 顯色液(170-5061)購自Bio-Rad;質(zhì)粒小提試劑盒(D6943-01)和膠回收試劑盒(D2500-01)購自O(shè)mega;BCA 試劑盒(CW0014S)購自北京康為世紀(jì);TMPyP4(A5014-100MG)購自梯希愛(上海)化成工業(yè)發(fā)展有限公司;PDS(A3742)購自上海偉寰生物科技有限公司。

      3 方法

      3.1 質(zhì)粒構(gòu)建 設(shè)計(jì)合成特異性ULK1啟動(dòng)子PCR引物(見表1),分別引入EcoR I 和Hind Ⅲ酶切位點(diǎn),以HeLa 細(xì)胞基因組DNA 為模板,擴(kuò)增ULK1啟動(dòng)子序列,插入經(jīng)EcoR I和Hind Ⅲ雙酶切的pGLuc-Basic載體中,以構(gòu)建野生型ULK1啟動(dòng)子報(bào)告基因質(zhì)粒。

      表1 PCR引物序列Table 1.The sequences of the primers for PCR

      3.2 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(native-PAGE) 用含有 100 mmol/L LiCl 或 KCl 的 Tris-HCl(10 mmol/L,pH 8.0)將寡核苷酸稀釋至50 μmol/L,沸水浴退火5 min,緩慢冷卻至室溫。退火樣品經(jīng)12%非變性聚丙烯酰胺凝膠在0.5×TBE 中以100 V 恒壓電泳1.5 h。對(duì)凝膠進(jìn)行DNA 銀染,每次更換溶液時(shí)佩戴一次性PE 手套,避免接觸凝膠,最后用掃描儀掃描拍照。

      3.3 圓二色譜(circular dichroism,CD)分析 取20 μL 合成的寡核苷酸(100 μmol/L)和180 μL Tris-HCl(10 mmol/L,pH 8.0),混勻后置于PCR 儀按照Huang等[12]報(bào)道的程序退火,退火后的寡核苷酸用含有同等濃度陽離子的 Tris-HCl 稀釋至 500 μL,獲得 CD 樣品,用0.5 mm 的石英杯進(jìn)行檢測(cè),程序設(shè)置:波長(zhǎng)200~350 nm,溫度25 ℃。以被證實(shí)能夠形成G4 的人c-Myc 啟動(dòng)子區(qū)序列Pu27(5'-TGGGGAGGGTGGGGAGGGTGGGGAAGG-3')為陽性對(duì)照,以突變后不能形成G4 的端粒3’端簡(jiǎn)單序列Tel-MUT(5'-AGAGTTTAGAGTTTAGAGTTTAGAG-3')為 陰 性 對(duì)照[13]。以摩爾橢圓度為縱坐標(biāo),波長(zhǎng)為橫坐標(biāo)做圖,減去背景值繪制光譜圖,根據(jù)不同波長(zhǎng)下的摩爾橢圓率來鑒定各序列是否形成G4。

      3.4 螢光素酶報(bào)告基因檢測(cè) 將生長(zhǎng)狀態(tài)良好的DU-145細(xì)胞以適當(dāng)比例接種至24孔板過夜培養(yǎng),次日用Lipofectamine 2000 按照使用說明進(jìn)行轉(zhuǎn)染,報(bào)告質(zhì)粒轉(zhuǎn)染量為每孔200 ng,參照質(zhì)粒pCMV-SEAP的量為每孔5 ng,轉(zhuǎn)染前將RPMI-1640完全培養(yǎng)基更換為Opti-MEM,轉(zhuǎn)染6~8 h 后更換為完全培養(yǎng)基。轉(zhuǎn)染48 h 后收集培養(yǎng)基,分別測(cè)定GLuc 和SEAP 活性,每個(gè)樣品重復(fù)測(cè)定3 次,計(jì)算相對(duì)GLuc 活性,結(jié)果取平均值。

      3.5 RT-qPCR 將生長(zhǎng)狀態(tài)良好的DU-145 細(xì)胞以適當(dāng)比例接種至3.5 cm 培養(yǎng)皿過夜培養(yǎng),次日用不同終濃度的 TMPyP4 處理,48 h 后棄培養(yǎng)液,PBS 洗滌2 次,加入1 mL Trizol 反復(fù)吹打,待溶液變粘稠透明將其轉(zhuǎn)移至無菌無酶的離心管。參照提取試劑說明提取總 RNA。取1 μg 總RNA 反轉(zhuǎn)錄為 cDNA,按照試劑說明配制25 μL反應(yīng)體系,所用引物序列見表1。每個(gè)樣品設(shè)置3 個(gè)重復(fù),β-actin 為內(nèi)參照,按照試劑盒說明程序進(jìn)行。使用Bio-Rad CFX Manager V1.1.308.1111 軟件采用 2-ΔΔCt法進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)算靶基因的相對(duì)表達(dá)量。實(shí)驗(yàn)至少重復(fù)3 次,結(jié)果取平均值。

      3.6 Western blot 實(shí)驗(yàn) 取生長(zhǎng)狀態(tài)良好的DU-145細(xì)胞以適當(dāng)比例接種至12 孔板過夜培養(yǎng),次日用不同終濃度的TMPyP4 處理細(xì)胞,48 h 后收集細(xì)胞。根據(jù)收集細(xì)胞量的大小加入適量含有PMSF 和蛋白酶抑制劑的RIPA 裂解液,用超聲破碎儀裂解細(xì)胞,4 ℃,14 000 r/min離心15 min,取總蛋白上清液,測(cè)定蛋白濃度,將所有蛋白樣品調(diào)至同一濃度,加入5×SDS Loading Buffer,混勻后沸水浴5 min。獲得的蛋白樣品直接用于SDS-PAGE 或-20 ℃凍存。分離膠濃度為8%,采用濕轉(zhuǎn)法,350 mA 恒流模式下轉(zhuǎn)NC膜2 h,用TBST 配制的5%脫脂牛奶室溫封閉1 h,Ⅰ抗用Ⅰ抗稀釋液以1∶1 000 的比例稀釋,4 ℃過夜孵育,次日用TBST 洗膜洗膜3 次,每次6 min,Ⅱ抗用5%脫脂牛奶以1∶5 000 的比例稀釋,室溫孵育1 h,再次洗膜后用ECL 發(fā)光液均勻覆蓋NC 膜上目的蛋白所在區(qū)域,利用化學(xué)發(fā)光成像儀曝光,β-actin 為內(nèi)參照,用Image Lab軟件處理分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

      4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

      利用Graph Pad Prism 8.0.1 進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和制圖。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)表示,利用Student-T Test 檢測(cè)數(shù)據(jù)之間的差異顯著性,P<0.05為差異有顯著性。

      結(jié) 果

      1 ULK1啟動(dòng)子區(qū)含有富G/C區(qū)并形成G4結(jié)構(gòu)

      分析ULK1 啟動(dòng)子序列,發(fā)現(xiàn)ULK1轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游1 000 bp 的G/C 含量較高,轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游276~120 bp 的 C 含量為 61.5%,626 bp~358 bp 的 G 含量為63.6%,見圖1A,ULK1 啟動(dòng)子富G/C 的區(qū)域可能形成G4。設(shè)計(jì)引物(見表1)分別擴(kuò)增富G 序列(UGS)和富C 序列(UCS),在不同離子環(huán)境下退火處理,利用PAGE 檢測(cè)富G/C 的序列是否形成G4,見圖1B,富G/C 的序列在氯化鉀溶液中,形成緩慢遷移的G4 條帶,然而在沒有金屬陽離子存在或鋰離子存在的情況下,未形成G4 條帶。接下來我們研究了G4 DNA 配體 PDS(Pyridostatin)對(duì) G4 的影響。在 DNA退火前加入不同濃度的PDS,然后檢測(cè)G4 的形成,令人驚奇的是僅在 1 μmol/L PDS 存在時(shí),G4DNA 占總DNA 的比例達(dá)到100%,表明PDS 在DNA 退火期間促進(jìn)了G4的形成,見圖1C。

      Figure 1.The ULK1 promoter region contained rich G/C regions and formed a G4 structure.A:analysis of GC content of 1 000 bp sequence upstream of the transcription start point of ULK1 promoter;B:non-denaturing gel electrophoresis was used to detect whether G- and C-rich sequences form G4 structure.Using non-denaturing gel electrophoresis to detect whether G- and C-rich sequences form G4 structures,and G- or C-rich sequences form slow-moving G4 bands in potassium chloride solution;C:PDS promoted the formation of G4 during DNA annealing.圖1 ULK1啟動(dòng)子區(qū)含有富G/C區(qū)并形成G4結(jié)構(gòu)

      2 ULK1啟動(dòng)子區(qū)富G/C區(qū)G4形成序列的預(yù)測(cè)

      利用QGRS Mapper 對(duì)ULK1 轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游1 000 bp 序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)10 條可能形成G4 的序列,見圖2A,分別命名為 UPG-626、UPG-596、UPG-574、UPG-539、UPG-495、UPG-400、UPC-265、UPC-240、UPC-210 和 UPC-141,其中 6 條位于正義鏈,4 條位于反義鏈,大多長(zhǎng)度為20個(gè)堿基左右,均含有4個(gè)及以上的“GGG”,間隔少于7 個(gè)堿基且G-Score 均為65 以 上 ,其 中 UPG-400 和 UPC-210 的 G-Score 高 達(dá)106 和 107,見圖 2B),提示這些序列形成 G4 的可能性極高。因此,ULK1啟動(dòng)子區(qū)富G/C 區(qū)極有可能形成G4。

      Figure 2.Sequence prediction of G4 formation in the G/C-rich region of ULK1 promoter region.A:the online software QGRS Mapper was used to analyze the 1 000 bp promoter sequence upstream of the ULK1 transcription start point and 10 sequences that may form the G4 structure were found;B:among the 10 G4 forming sequences,6 were in the sense strand and 4 were in the antisense strand,and the G-Score scores are all above 65.圖2 ULK1啟動(dòng)子區(qū)富G/C區(qū)G4形成序列預(yù)測(cè)

      3 圓二色譜鑒定ULK1啟動(dòng)子區(qū)G4形成序列結(jié)構(gòu)

      預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)ULK1啟動(dòng)子區(qū)存在10 條G4 形成序列,能否形成G4 需要進(jìn)一步鑒定。圓二色譜可通過檢測(cè)核酸分子的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)鑒定是否形成G4。結(jié)果顯示,Tel-MUT 在何種情況下都未形成G4 特征峰。UPG-596、UPG-539、UPG-495、UPC-265、UPC-240 在K+存在的情況下,光吸收曲線趨勢(shì)與Pu27 極度相似,即在240 nm 處有一負(fù)峰,在262 nm 處有一正峰,這是典型的平行G4 的偏振光吸收特征,UPG-626、UPG-574、UPG-400、UPC-210、UPC-141 的光吸收曲線顯示在262 nm 處的正峰值略低于Pu27,表明上述序列在體外形成平行G4。UPG-574 除了在262 nm處出現(xiàn)一正峰,在295 nm 處出現(xiàn)第二個(gè)正峰,表明UPG-574 還可能形成反平行G4。上述結(jié)果說明ULK1啟動(dòng)子G4 形成序列能夠在體外形成G4。見圖3。

      Figure 3.Circular dichroism analysis of ULK1 promoter G4 formation sequence.In any case,Tel-MUT did not form a G4 characteristic peak.In the presence of K+,the curve trends of UPG-596,UPG-539,UPG-495,UPC-265 and UPC-240 were extremely similar to Pu27,with a negative molar ellipticity peak at 240 nm and a peak at 262 nm positive molar ellipticity peak.The curves of UPG-626,UPG-574,UPG-400,UPC-210 and UPC-141 showed that the positive molar ellipticity peak at 262 nm was slightly lower than Pu27,except for UPG-574 at 262 nm a positive molar ellipticity peak appeared at,and a second positive molar ellipticity peak appeared at 295 nm.圖3 圓二色譜分析ULK1啟動(dòng)子區(qū)G4形成序列

      4 Native-PAGE 電泳鑒定 ULK1 啟動(dòng)子區(qū) G4 形成序列結(jié)構(gòu)

      Native-PAGE 結(jié)果顯示,除了明顯的寡核苷酸單鏈線性條帶(ssDNA),在不同陽離子條件下退火后,10 條序列形成了多條不同程度遷移滯后帶,見圖4??拷黶sDNA 條帶的是分子內(nèi)G4,而遷移更加滯后的是分子間G4。在50 mmol/L KCl 的退火條件下,UPG-596 和 UPG-574 沒有形成靠近 ssDNA 的滯后帶,說明這兩條序列只能形成分子間G4,除此之外的8條序列可以形成分子間和分子內(nèi)兩種G4。

      Figure 4.Analysis of G4 formation sequence by non-denaturing polyacrylamide gel electrophoresis.Near the singlestranded linear band was intramolecular G4,and the more lagging migration was intermolecular G4.Under the annealing condition of 50 mmol/L KCl,UPG-596 and UPG-574 did not form a hysteresis band close to ssDNA.The other eight oligonucleotides not only formed hysteresis bands close to ssDNA but also formed a more hysteretic band.圖4 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析G4形成序列

      5 G4配體對(duì)ULK1轉(zhuǎn)錄的影響

      TMPyP4 和 PDS 是常用的 G4 配體,能夠特異結(jié)合并穩(wěn)定G4。因此,借助二者研究啟動(dòng)子G4 對(duì)ULK1轉(zhuǎn)錄表達(dá)的影響。首先將ULK1啟動(dòng)子報(bào)告質(zhì)粒轉(zhuǎn)染 DU-145 細(xì)胞,24 h 后用不同濃度 TMPyP4 處理,利用報(bào)告基因檢測(cè)TMPyP4 對(duì)ULK1的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn)受ULK1啟動(dòng)子調(diào)控的螢光素酶GLuc活性顯著降低,且呈現(xiàn)濃度依賴性,見圖5A。然后用不同濃度 TMPyP4 處理 DU-145 細(xì)胞 48 h,利用 qPCR 檢測(cè)ULK1 mRNA 的水平變化。結(jié)果顯示ULK1 的mRNA水平顯著降低,并呈現(xiàn)濃度依賴性,見圖5B。最后分別用不同濃度TMPyP4 和PDS 處理DU-145 細(xì)胞48 h,利用Wstern blot 檢測(cè)ULK1 蛋白水平變化。結(jié)果表明二者均導(dǎo)致ULK1蛋白水平顯著降低,并呈現(xiàn)濃度依賴性,見圖5C。上述結(jié)果證實(shí)ULK1啟動(dòng)子G4對(duì)ULK1的轉(zhuǎn)錄表達(dá)起負(fù)調(diào)控作用。

      Figure 5.The effect of G4 ligand on ULK1 transcription.A:reporter gene was used to detect the effect of TMPyP4 on ULK1 gene transcription;B:the qPCR experiment was used to detect the level of ULK1 mRNA in DU-145 cells after TMPyP4 treatment;C:Western blot was used to detect the changes of ULK1 protein levels in DU-145 cells after TMPyP4 or PDS treatment.Mean±SD. n=3.*P<0.05,**P<0.01 vs 0 μmol/L.圖5 G4配體對(duì)ULK1轉(zhuǎn)錄的影響

      討 論

      自噬在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中顯示兩面性作用,ULK1作為自噬核心通路中的關(guān)鍵調(diào)控基因,其表達(dá)的變化與腫瘤的關(guān)系錯(cuò)綜復(fù)雜。我們前期研究發(fā)現(xiàn)ULK1在前列腺腫瘤中顯著高水平表達(dá),且與腫瘤的病理分級(jí)呈正相關(guān)。因此,ULK1是一個(gè)極具吸引力的腫瘤治療靶點(diǎn),研究其表達(dá)調(diào)控有助于揭示ULK1在生理和病理過程中的作用機(jī)制。本研究首先分析了ULK1轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游1 000 bp 序列,發(fā)現(xiàn)富G/C區(qū),克隆G/C 的序列后通過PAGE 和DNA 銀染證明了這些序列可以形成G4;隨后分析ULK1啟動(dòng)子富G/C 序列,預(yù)測(cè)并合成 10 條序列,通過 CD、PAGE 和DNA 銀染證明在體外一定條件下ULK1啟動(dòng)子富G/C 區(qū)能形成G4;最后細(xì)胞試驗(yàn)證實(shí)啟動(dòng)子G4 對(duì)ULK1轉(zhuǎn)錄表達(dá)具有負(fù)調(diào)控作用。

      大量證據(jù)表明ULK1在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中具有調(diào)節(jié)作用,但關(guān)于ULK1自身的表達(dá)調(diào)控相對(duì)被忽略。目前有關(guān)ULK1的調(diào)控研究?jī)A向于轉(zhuǎn)錄后調(diào)控以及翻譯后修飾,腺苷單磷酸依賴型蛋白激酶(AMPK)磷酸化ULK1的多個(gè)位點(diǎn)激活其活性[14],泛素特異性肽酶24(USP24)通過影響ULK1的泛素化和蛋白穩(wěn)定性調(diào)控自噬[15],另外,轉(zhuǎn)錄激活因子4(activating transcription factor 4,ATF4)直 接 靶 向ULK1上調(diào)其 mRNA 和蛋白表達(dá)水平而激活自噬[16]。關(guān)于ULK1啟動(dòng)子區(qū)的研究較為少見,目前也沒有關(guān)于G4 調(diào)節(jié)ULK1表達(dá)的報(bào)道,本研究針對(duì)ULK1啟動(dòng)子區(qū)探討G4 對(duì)ULK1的表達(dá)調(diào)控作用,為揭示ULK1表達(dá)調(diào)控的機(jī)制奠定實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。

      G4 在調(diào)控基因表達(dá)方面,其作用之大不可忽視。人類基因組含有超過30 萬個(gè)具有G4 形成潛力的序列[17]。著名的Wnt 信號(hào)通路控制細(xì)胞增殖、遷移及發(fā)育,Wnt 1 陽性的癌細(xì)胞具有很高的增殖能力,研究者對(duì)Wnt 1 的近端啟動(dòng)子進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其啟動(dòng)子上游277 bp 便足以控制基因表達(dá),該277 bp包含一段富G 區(qū),此富G 區(qū)序列能夠在體外一定條件下形成 G4 并抑制 Wnt 1 表達(dá)[18]。本研究發(fā)現(xiàn)ULK1 啟動(dòng)子也可以形成G4 并負(fù)調(diào)控其表達(dá)。這些不斷被發(fā)現(xiàn)的G4 可能是腫腫瘤發(fā)生發(fā)展中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),是新興的治療靶點(diǎn)。如何調(diào)控G4 使其穩(wěn)定或降解是當(dāng)前的熱點(diǎn),能夠直接靶向G4 的小分子引發(fā)了非常有前途的潛在療法。一些關(guān)于使用G4 配體靶向端粒和致癌基因來治療癌癥的報(bào)道也已經(jīng)出現(xiàn)[19]??紤]到啟動(dòng)子序列中的任何突變都可能改變轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)從而影響基因表達(dá),我們用TMPyP4 和PDS 處理細(xì)胞以穩(wěn)定G4 的方法研究G4對(duì)ULK1轉(zhuǎn)錄表達(dá)的影響,結(jié)果證實(shí)啟動(dòng)子G4 抑制ULK1表達(dá)。

      總之,本研究首次發(fā)現(xiàn)ULK1啟動(dòng)子富G/C 區(qū)存在G4,細(xì)胞學(xué)檢測(cè)證實(shí)G4 對(duì)ULK1轉(zhuǎn)錄表達(dá)有負(fù)調(diào)控作用。啟動(dòng)子G4 的發(fā)現(xiàn)為ULK1的表達(dá)和功能研究提供新的線索,為開發(fā)靶向ULK1的腫瘤治療方案提供新的研究方向。

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