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      基于LSCM的線掃描方向識(shí)別方法的建立與應(yīng)用

      2021-06-15 01:13:16劉雙雙肖桂鳳洪曉黎
      影像科學(xué)與光化學(xué) 2021年3期
      關(guān)鍵詞:掃描模式掃描線顯微鏡

      劉雙雙,肖桂鳳,洪曉黎,沈 逸

      浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院,浙江 杭州 310058

      基礎(chǔ)生物醫(yī)學(xué)的研究主要集中在細(xì)胞、組織和模式生物中的復(fù)雜動(dòng)態(tài)過(guò)程,這些過(guò)程發(fā)生在不同的時(shí)間和空間尺度范圍內(nèi),其研究方向包括器官的發(fā)育和功能的變化、細(xì)胞內(nèi)離子介導(dǎo)的信號(hào)傳導(dǎo)、囊泡和蛋白質(zhì)運(yùn)輸過(guò)程等。激光掃描共聚焦顯微鏡在解決這些問(wèn)題方面起著舉足輕重的作用[1,2]。通常采用的XY或XYZ掃描方式實(shí)現(xiàn)了高分辨生物結(jié)構(gòu)的可視化,但是高分辨率主要指的是空間分辨率,時(shí)間分辨率仍然落后于許多生物動(dòng)態(tài)過(guò)程的速度。

      為了實(shí)現(xiàn)快速共聚焦顯微成像,通常采用高速掃描裝置[3](如共振振鏡)或者多光束掃描裝置(Nipkow Spinning disk)[4,5],然而這些系統(tǒng)的靈敏度和分辨率較低,速度也只能達(dá)到每秒幾百幀,仍然達(dá)不到高分辨快速成像的要求。激光掃描共聚焦顯微鏡的XT線掃描方式是對(duì)同一條線段重復(fù)掃描,檢測(cè)一段時(shí)間里熒光信號(hào)的快速變化,XT線掃描方式能夠達(dá)到每秒上千幀的掃描速度,解決了生命科學(xué)研究中追蹤快速事件的難題。但有些品牌的共聚焦顯微鏡進(jìn)行XT線掃描時(shí),掃描方向無(wú)法識(shí)別。掃描方向不確定,則無(wú)法判斷熒光信號(hào)的具體定位及快速移動(dòng)信號(hào)的方向,限制了對(duì)諸多現(xiàn)象的深入研究。本研究建立了一套確定XT線掃描方向的實(shí)用方法,詳細(xì)闡述了Zeiss、Nikon 和Olympus 共聚焦顯微鏡XT線掃描模式的具體操作方法及線掃描方向的差異。

      1 制作熒光小球樣品

      以熒光筆制成熒光小球作為研究對(duì)象。利用紅色(或綠色)熒光筆在顯微鏡專用的活細(xì)胞培養(yǎng)皿底部畫(huà)1~2條線段,為避免熒光小球發(fā)生重疊,線段不宜過(guò)多。加入1 mL純凈水,輕輕搖晃培養(yǎng)皿,將劃線區(qū)域的熒光粉溶解,形成單個(gè)分散的熒光小球溶液,靜止10 min后,熒光小球貼于培養(yǎng)皿底。將培養(yǎng)皿放置到共聚焦顯微鏡載物臺(tái)上,利用60XO或者63XO物鏡進(jìn)行顯微成像(圖1)。

      圖1 熒光小球樣本制作和熒光小球XY二維圖像(物鏡:60XO)A.熒光小球樣本制作;B.熒光小球XY圖像

      2 建立線掃描方向識(shí)別技術(shù)

      共聚焦顯微鏡線掃描模式通常與T時(shí)間序列結(jié)合使用,稱為XT線掃描。有些品牌的共聚焦顯微鏡沒(méi)有標(biāo)注掃描方向,從圖像上也無(wú)法直接識(shí)別。為了確定線掃描方向,以熒光小球?yàn)檠芯繉?duì)象,首先采集一張熒光小球XY二維圖像,然后經(jīng)過(guò)熒光球畫(huà)出不同方向的掃描線段,分別為水平、垂直、斜向上、斜向下,其中線段的一端靠近熒光球,另一端則遠(yuǎn)離熒光球,最后對(duì)上述線段進(jìn)行時(shí)間序列掃描獲得XT線掃描圖像,其中線掃描圖像的X軸為經(jīng)過(guò)小球畫(huà)出的線段,Y軸為時(shí)間,熒光信號(hào)為位于熒光小球內(nèi)的線段部分。

      線掃描圖像的左端為掃描起始端,判斷XY二維圖像中掃描線段的掃描方向關(guān)鍵在于確定線掃描圖像左端對(duì)應(yīng)的掃描線段的位置。根據(jù)線掃描圖像靠近熒光信號(hào)的一邊對(duì)應(yīng)XY二維圖像中靠近熒光球的線段端,可以判斷圖2中:掃描線為水平線時(shí),掃描方向?yàn)閺淖筮叺接疫叄粧呙杈€為垂直線時(shí),掃描方向?yàn)閺南露说缴隙?;掃描線段為斜向下時(shí),掃描方向?yàn)閺淖笊隙说接蚁露?;掃描線段為斜向上時(shí),掃描方向?yàn)閺淖笙碌接疑?圖2)。

      圖2 確定共聚焦顯微鏡線掃描方向的示意圖

      3 不同品牌共聚焦顯微鏡XT線掃描技術(shù)的建立

      3.1 Olympus激光共聚焦顯微鏡XT線掃描技術(shù)

      (1)XT線掃描圖像的采集:紅色熒光筆制作熒光小球,利用Olympus 共聚焦顯微鏡FV10-ASW軟件采集圖像。選擇543激光器激發(fā)紅色熒光小球,檢測(cè)器接收范圍為560~660。通過(guò)Focus x2預(yù)覽圖像,調(diào)節(jié)焦面、激光通過(guò)率和光電倍增管電壓值等參數(shù),采集一張XY二維圖像。選擇【line】掃描方式,掃描速度設(shè)為10 μs/pixel,線掃描時(shí),【Time】默認(rèn)為選中狀態(tài),【TimeScan】選擇FreeRrun,【Num】選擇200~2000。經(jīng)過(guò)熒光球畫(huà)出不同方向的線段,分別為水平線、垂直線、斜向上線、斜向下線,其中線段的一端靠近熒光球,另一端則遠(yuǎn)離熒光球,點(diǎn)擊【capture】獲取XT線掃描圖像。

      (2)線掃描方向的確定:Olympus共聚焦顯微鏡在進(jìn)行線掃描時(shí),軟件沒(méi)有標(biāo)注掃描方向,也無(wú)法直接識(shí)別。對(duì)上述線段進(jìn)行XT線掃描,線掃描圖像中靠近熒光線的一端對(duì)應(yīng)XY圖像中靠近熒光球的線段末端。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn):掃描線段為水平線時(shí),掃描方向?yàn)閺木€段的左端到右端;掃描線段為垂直線時(shí),掃描方向?yàn)閺木€段下端到上端;線掃描線段為斜向上時(shí),掃描方向從左下端到右上端。掃描線段為斜向下時(shí),掃描方向從右上到左下(圖3),當(dāng)所畫(huà)線段的起點(diǎn)與上述線段起點(diǎn)相反時(shí),線掃描方向仍然保持不變。

      圖3 Olympus共聚焦顯微鏡線掃描方向的確定A1、B1、C1、D1是熒光球的XY二維圖像,A2、B2、C2、D2是掃描線段的XT圖像

      3.2 Zeiss激光共聚焦顯微鏡XT線掃描技術(shù)

      (1)XT線掃描圖像采集:綠色熒光筆制作熒光小球,利用Zeiss 880共聚焦顯微鏡Zen Black軟件采集XT線掃描圖像。設(shè)置光路,選擇488激光器激發(fā)熒光小球,檢測(cè)器接收范圍為500~550,點(diǎn)擊live預(yù)覽圖像,調(diào)節(jié)激光強(qiáng)度和Gain,獲取XY二維圖像。設(shè)置XT線掃描參數(shù),選中【Time Series】,設(shè)置Interval為0,cycles為200~2000?!維can Mode】選擇line,選擇線段按鈕【Line select】,經(jīng)過(guò)小球畫(huà)出不同方向的線段,點(diǎn)擊【Start Experiment】獲取線掃描圖像。

      (2)掃描方向的確定:Zeiss共聚焦顯微鏡在進(jìn)行線掃描時(shí),軟件標(biāo)注了掃描方向,可以直接識(shí)別。同樣利用熒光小球畫(huà)出上述4種線段,對(duì)線段進(jìn)行XT線掃描。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn):所畫(huà)線段的箭頭方向即為掃描方向,即從所畫(huà)線段的起始點(diǎn)到終點(diǎn)的方向進(jìn)行掃描(圖4),所以Zeiss共聚焦顯微鏡線掃描方向與所畫(huà)線段的起始點(diǎn)有關(guān)。

      圖4 Zeiss共聚焦顯微鏡線掃描方向的確定A1、B1、C1、D1是熒光球的XY二維圖像,A2、B2、C2、D2是掃描線段的XT圖像

      3.3 Nikon激光共聚焦顯微鏡線掃描技術(shù)的建立

      (1)XT線掃描圖像采集:綠色熒光筆制作熒光小球,利用Nikon A1R共聚焦顯微鏡NIS-Element軟件采集圖像。選擇488激光器激發(fā)綠色熒光小球,檢測(cè)器接收范圍為500~550。設(shè)置掃描參數(shù),采集一張XY二維圖像;【ND Acquisition】窗口選擇Time,【Interval】設(shè)置為No delay,【loop】設(shè)置為200~2000;【Alplus Scan Area】窗口選擇line scan area,經(jīng)過(guò)小球分別畫(huà)出上述4種線段,點(diǎn)擊run now采集XT圖像。

      (2)掃描方向的確定:Nikon A1R共聚焦顯微鏡進(jìn)行線掃描時(shí),軟件沒(méi)有標(biāo)注掃描方向。對(duì)上述線段進(jìn)行XT線掃描后,根據(jù)熒光線與兩邊距離的遠(yuǎn)近,識(shí)別線掃描圖像X軸兩端對(duì)應(yīng)掃描線段的兩端位置。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn):掃描線段為水平線時(shí),掃描方向?yàn)閺木€段的左端到右端;掃描線段為垂直線時(shí),掃描方向?yàn)閺木€段上端到下端;掃描線段為斜向上時(shí),掃描方向從左下端到右上端;掃描線段為斜向下時(shí),掃描方向從左上到右下(圖5)。利用Nikon共聚焦顯微鏡進(jìn)行XT線掃描時(shí),掃描方向與掃描線段的起始點(diǎn)無(wú)關(guān),與斜線傾斜角度也無(wú)關(guān)。

      圖5 Nikon共聚焦顯微鏡線掃描方向的確定A1、B1、C1、D1是熒光球的XY二維圖像,A2、B2、C2、D2是掃描線段的XT圖像

      4 XT線掃描技術(shù)在腦血管中的應(yīng)用

      XT線掃描模式能夠快速捕捉移動(dòng)信號(hào)隨時(shí)間的變化情況,如腦內(nèi)紅細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)。小鼠尾靜脈注射熒光染料fluorescein isothiocyanate-dextran (FITC-dextran),經(jīng)血液循環(huán)到達(dá)全身血管。FITC染料僅能標(biāo)記血漿而不進(jìn)入紅細(xì)胞,血漿被激發(fā)后發(fā)出綠色熒光,紅細(xì)胞呈現(xiàn)黑色暗影。沿著血管管腔中心畫(huà)一條掃描線,利用激光掃描共聚焦顯微鏡(或雙光子顯微鏡)對(duì)血流進(jìn)行XT線掃描,紅細(xì)胞隨著時(shí)間的變化形成黑色條紋運(yùn)動(dòng)軌跡,其中線掃描圖像中X軸為紅細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)距離,Y軸為掃描時(shí)間(圖6)。每一條黑色條紋代表一個(gè)紅細(xì)胞,根據(jù)紅細(xì)胞單位時(shí)間內(nèi)的運(yùn)動(dòng)距離可計(jì)算血流速度。

      圖6 XT線掃描在腦血管中的應(yīng)用A.腦血管二維圖像;B.XT線掃描圖像

      5 討論

      激光掃描共聚焦顯微鏡通過(guò)對(duì)細(xì)胞或生物個(gè)體高分辨率可視化檢測(cè)其結(jié)構(gòu)和功能的變化,在生命科學(xué)研究中有著重要作用。共聚焦顯微鏡的XT線掃描模式通過(guò)對(duì)一條線段進(jìn)行重復(fù)掃描,捕捉這條掃描線段上熒光信號(hào)的變化,可以達(dá)到1 kHz的掃描速度,為細(xì)胞內(nèi)的快速事件研究開(kāi)創(chuàng)了新思路。XT線掃描具有以下優(yōu)勢(shì):采集圖像的時(shí)間分辨率高;能夠同時(shí)可視化完整的細(xì)胞個(gè)體和熒光信號(hào)的快速動(dòng)態(tài)變化;對(duì)共聚焦顯微鏡硬件配置無(wú)特殊要求,活細(xì)胞時(shí)間序列掃描模式雖然能夠跟蹤熒光信號(hào)的動(dòng)態(tài)變化,但需要配備自動(dòng)聚焦系統(tǒng)和活細(xì)胞培養(yǎng)裝置[6]。

      目前,XT線掃描技術(shù)已在腦微循環(huán)[7-9]、離子信號(hào)[10,11]研究中得到應(yīng)用。但是很多商業(yè)化的共聚焦顯微鏡沒(méi)有指示線掃描方向,也無(wú)法直接識(shí)別。本研究利用熒光小球建立了識(shí)別線掃描方向的方法,用于已具有掃描方向的共聚焦顯微鏡后,發(fā)現(xiàn)本方法得到的結(jié)果與顯微鏡線掃描指示方向一致,如Zeiss共聚焦顯微鏡。對(duì)于沒(méi)有指示掃描方向的共聚焦顯微鏡,如Olympus和Nikon共聚焦顯微鏡,實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),Olympus和Nikon共聚焦顯微鏡在水平線和斜線中的掃描方向一致,水平線為從掃描線的左端到右端,斜線都是從斜線的左側(cè)到右側(cè),垂直線則不同,Olympus為從掃描線下端到上端,Nikon為從掃描線上端到下端。實(shí)驗(yàn)還發(fā)現(xiàn),沒(méi)有指示掃描方向的共聚焦顯微鏡,線掃描方向與所畫(huà)掃面線起始點(diǎn)無(wú)關(guān),這一點(diǎn)與有指示掃描方向的共聚焦顯微鏡不同。

      本研究建立的線掃描方向識(shí)別方法,簡(jiǎn)單易操作,且具有普適性,不僅適用于上述品牌激光掃描共聚焦顯微鏡,還適用于其他品牌,同時(shí),也適用于雙光子顯微鏡,希望本研究能為顯微成像相關(guān)研究提供一定的參考。

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