王薇 馬慶海 張小玲 蘇烏云 常麗娟 王小蘭 李瑤 閆海成★
膠質(zhì)瘤是臨床上腦內(nèi)最常見的原發(fā)性腫瘤,占所有腦惡性腫瘤的80%[1]。膠質(zhì)瘤治療后容易復(fù)發(fā),臨床上對(duì)膠質(zhì)瘤的治療仍有一定的困難[2]。因此,迫切需要對(duì)膠質(zhì)瘤發(fā)展的機(jī)制進(jìn)行研究,尋找診斷和治療的新方法。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,LncRNA)在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮著重要作用[3]。長(zhǎng)基因間非編碼RNA 1088(long intergenic non-coding RNA 1088,LINC01088)是長(zhǎng)鏈非編碼RNA 中的一種,其在卵巢癌發(fā)展過程中發(fā)揮了重要作用[4-5],但在膠質(zhì)瘤細(xì)胞中的作用尚不清楚。本研究通過干擾LINC0108的表達(dá)分析LINC01088對(duì)膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞增殖、遷移和侵襲以及血管生成的影響,探討LINC01088在膠質(zhì)瘤中的作用。
MTT 細(xì)胞增殖檢測(cè)試劑盒(Cat.No.C0009)和極超敏ECL 化學(xué)發(fā)光試劑盒(Cat.No.P0018FM):碧云天公司;U251 細(xì)胞購于中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院細(xì)胞資源中心;siRNA 序列購于廣州市銳博;TRIzol Reagent(Cat.No.15596026)、Lipo-fectamine 2000(Cat.No.11668019)、SuperScript II Reverse Transcriptase(Cat.No.18064014)和 EX-PRESS One-Step Superscript qRT-PCR Kit(Cat.No.11781200):美國Invitrogen 公司;Transwell 小室(Cat.No.353097)和Matrigel 凝膠(Cat.No.356234):美國BD 公司;PI3K 抗體(Cat.No.365290)、AKT 抗體(Cat.No.5298)、p-AKT 抗體(Cat.No.377556)、GAPDH 抗體(Cat.No.47724)和m-IgGκ BP-HRP 抗體(Cat.No.516102):美國Santa cruz 公司;ABI Prism?快速7500 型熒光定量PCR 儀:美國Applied Biosystems 公司;倒置光學(xué)顯微鏡(OLYMPUS CKX41,U-CTR30-2):日本OLYMPUS 公司。
1.2.1 生物信息學(xué)分析LINC01088在膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)
利用生物信息學(xué)在線工具GEPIA(http://ge-pia.cancer-pku.cn/detail.php)分析LINC01088在膠質(zhì)瘤組織和正常組織中的表達(dá)(標(biāo)本數(shù)據(jù)來源于TCGA 和GTEx 數(shù)據(jù)庫)。
1.2.2 細(xì)胞培養(yǎng)及穩(wěn)定細(xì)胞株篩選
用含有10%胎牛血清、1%青霉素/鏈霉素的DMEM 培養(yǎng)液培養(yǎng)U251 膠質(zhì)瘤細(xì)胞株。小干擾RNA(siRNA)轉(zhuǎn)染膠質(zhì)瘤U251 細(xì)胞,操作按照Lipofectamine 2000 轉(zhuǎn)染試劑說明書進(jìn)行。在轉(zhuǎn)染中設(shè)置對(duì)照(si-NC)組,si-LINC01088-1組、si-LINC01088-2組、si-LINC01088-3組。然后將篩選出的si--LINC01088用于穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建,感染實(shí)驗(yàn)分為L(zhǎng)INC01088沉默組和對(duì)照組。
1.2.3 qRT-PCR
收集U251 細(xì)胞,Trizol 試劑提取總RNA,將RNA 逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,定量PCR 檢測(cè)LINC01088表達(dá)。以U6 作為內(nèi)參,用2-ΔΔCt法表示LINC01088相對(duì)表達(dá)。
1.2.4 MTT
將感染后的膠質(zhì)瘤U251 細(xì)胞接種至96 孔板中,隨后按照MTT 檢測(cè)試劑盒檢測(cè)0、24、48、72 h在570 nm 波長(zhǎng)下的吸光度。
1.2.5 Transwell
遷移實(shí)驗(yàn):將Transwell 小室放置于24 孔板內(nèi),將感染后的膠質(zhì)瘤U251 細(xì)胞接種于上室。培養(yǎng)24 h,4%多聚甲醛溶液對(duì)小室膜下面的細(xì)胞進(jìn)行固定,然后用0.1%結(jié)晶紫染色,顯微鏡下拍照并計(jì)數(shù)。侵襲實(shí)驗(yàn):將Matrigel基質(zhì)膠按照說明書對(duì)Transwell小室底部膜的上室進(jìn)行包被,其余同遷移實(shí)驗(yàn)。
1.2.6 血管擬態(tài)
按照王帆等[6]血管擬態(tài)實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備Matrigel 膠和培養(yǎng)板,將準(zhǔn)備好的各組細(xì)胞每孔按1×105個(gè)加入24 孔板中。培養(yǎng)24 h,利用共聚焦顯微鏡拍攝記錄結(jié)果,計(jì)數(shù)各組膠質(zhì)瘤細(xì)胞血管生成的形成水平。
1.2.7 Western blot
RIPA 裂解液提取細(xì)胞總蛋白,取各組變性30 μg 蛋白進(jìn)行SDS-PAGE 凝膠電泳并電轉(zhuǎn)至PVDF膜上。膜封閉后加入一抗(PI3K 按1∶500 稀釋,AKT按1∶1 000 稀釋,p-AKT 按1∶500 稀釋,GAPDH 按1∶2 000 稀釋)。隨后加入HRP 標(biāo)記二抗。最后用化學(xué)發(fā)光試劑盒進(jìn)行蛋白印跡條帶成像。
采用SPSS 19.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,數(shù)據(jù)以()表示,多組間比較采用單因素方差分析,組間多重比較采用SNK-q 分析。兩組間比較采用t檢驗(yàn)。P<0.05 表示差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
GEPIA 分析結(jié)果顯示,與正常組織相比,膠質(zhì)瘤組織中的LINC01088表達(dá)顯著上調(diào),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見圖1。
圖1 INC01088 在膠質(zhì)瘤組織和正常組織中的表達(dá)水平Figure 1 The relative expression level of LINC01088 in glioma tissues and normal tissues was analyzed
轉(zhuǎn)染24 h 后,與si-NC組相比,si-LINC01088組細(xì)胞中LINC01088表達(dá)顯著降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),si-LINC01088-1干擾效率最高。見表1。
表1 轉(zhuǎn)染si-LINC01088 對(duì)膠質(zhì)瘤U251 細(xì)胞中LINC01088 表達(dá)的影響(±s)Table 1 Effect of transfected with si-LINC01088 on the expression of LINC01088 in glioma U251 cells(±s)
表1 轉(zhuǎn)染si-LINC01088 對(duì)膠質(zhì)瘤U251 細(xì)胞中LINC01088 表達(dá)的影響(±s)Table 1 Effect of transfected with si-LINC01088 on the expression of LINC01088 in glioma U251 cells(±s)
注:與20 nM 對(duì)照組比較,aP<0.05;與50 nM 對(duì)照組比較,bP<0.05;與100 nM 對(duì)照組比較,cP<0.05。
組別si-NC si-LINC01088-1 si-LINC01088-2 si-LINC01088-3 F 值P 值相對(duì)LINC01088 表達(dá)20 nM 1.01±0.02 0.55±0.03a 0.63±0.02a 0.58±0.03a 10.342 0.008 50 nM 1.01±0.02 0.26±0.02b 0.53±0.02b 0.42±0.02b 15.326<0.001 100 nM 1.02±0.02 0.25±0.02c 0.42±0.02c 0.38±0.02c 18.543<0.001
與對(duì)照相比,LINC01088沉默組LINC01088的表達(dá)量顯著降低,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=45.346,P<0.001)。見圖2。
圖2 sh-LINC0108 慢病毒重組載體感染293T 細(xì)胞和U251 細(xì)胞圖(GFP 熒光,×200)Figure 2 Sh-LINC0108 lentivirus recombinant vector infected 293T cells and U251 cells.(GFP fluorescence,×200)
與對(duì)照相比,LINC01088沉默組細(xì)胞在24、48和72 h 的增殖顯著降低(P<0.05)。與對(duì)照相比,LINC01088沉默組遷移細(xì)胞顯著減少,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001),侵襲細(xì)胞顯著減少(P<0.001),管狀數(shù)量也顯著減少(P<0.001)。見表3、圖3。
表3 沉默LINC01088 對(duì)U251 細(xì)胞增殖、遷移、侵襲以及血管形成的影響(±s)Table 3 Effect of silencing LINC01088 on proliferation and migration of U251 cells(±s)
表3 沉默LINC01088 對(duì)U251 細(xì)胞增殖、遷移、侵襲以及血管形成的影響(±s)Table 3 Effect of silencing LINC01088 on proliferation and migration of U251 cells(±s)
注:與24 h 對(duì)照組比較,aP<0.05;與48 h 對(duì)照組比較,bP<0.01;與72 h 對(duì)照組比較,cP<0.001。
組別對(duì)照組LINC01088 沉默組t 值P 值細(xì)胞活性(OD570nm)0 h 0.33±0.02 0.35±0.01 1.625 0.180 24 h 0.51±0.02 0.41±0.01a 13.39<0.001 48 h 0.76±0.02 0.57±0.02b 14.36 0.006 72 h 0.98±0.03 0.63±0.02c 26.74<0.001遷移細(xì)胞數(shù)(個(gè))287.67±5.35 190.5±8.80a 23.10<0.001侵襲細(xì)胞數(shù)(個(gè))254.67±7.66 113.67±3.14a 41.72<0.001微管狀數(shù)目前(個(gè))34.67±3.50 13.00±5.40a 8.242<0.001
圖3 細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn)圖、侵襲及血管生成實(shí)驗(yàn)圖(結(jié)晶紫染色,×200)Figure 3 Cell migration in control group and LINC01088 silencing group.(Crystal violet staining,×200)
與對(duì)照組相比,LINC01088沉默組U251 細(xì)胞中PI3K 和p-AKT 蛋白表達(dá)水平顯著下降。見圖4。
圖4 細(xì)胞血管生成實(shí)驗(yàn)圖(×200)Figure 4 Cell angiogenesis of control(×200)
膠質(zhì)瘤的發(fā)展和轉(zhuǎn)移是一個(gè)復(fù)雜的多基因參與調(diào)控的過程,大量研究證實(shí)LncRNA 在其發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用[7]。越來越多的研究表明,異常表達(dá)的LncRNA 經(jīng)常在包括膠質(zhì)瘤在內(nèi)的多種癌癥發(fā)現(xiàn),有些表現(xiàn)出促進(jìn)癌癥的發(fā)展作用[8],也有些表現(xiàn)出抑制癌癥的發(fā)展作用,還有些在不同的癌癥中所表現(xiàn)的功能也不盡相同[9]。如LncRNA SNHG1 能促進(jìn)膠質(zhì)瘤的葡萄糖攝取、增殖、遷移、侵襲和血管生成[10]。LncRNA MT1JP 通過激活PTEN/AKT 信號(hào)通路抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、侵襲和遷移,促進(jìn)膠質(zhì)瘤細(xì)胞凋亡[11]。LncRNA XIST在結(jié)直腸癌、膀胱癌和胃癌中以致癌的方式存在,而在乳腺癌和前列腺癌中也被證明發(fā)揮抑制腫瘤的作用[12-16]。因此,研究LncRNA 在不同類型腫瘤中作用同樣具有重要的意義。
LINC01088是一個(gè)較新發(fā)現(xiàn)的LncRNA,目前對(duì)它有研究還很少,其在膠質(zhì)瘤中的作用尚未見報(bào)道。最近Zhang 等[4]研究發(fā)現(xiàn),與正常卵巢組織相比,卵巢良性腫瘤組織中LINC01088的表達(dá)明顯降低,LINC01088對(duì)裸鼠卵巢癌移植瘤的生長(zhǎng)有抑制作用,發(fā)揮抑癌作用。Ai 等[5]研究發(fā)現(xiàn)LINC01088低表達(dá)與上皮性卵巢癌臨床病理特征相關(guān)與上皮性卵巢癌FIGO 分期、分級(jí)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移有關(guān),而且LINC01088表達(dá)水平越低總體生存率較差。以上研究表明LINC01088在卵巢癌中可以作為預(yù)后標(biāo)志物,發(fā)揮抑癌作用。本研究發(fā)現(xiàn)膠質(zhì)瘤組織中的LINC01088相對(duì)表達(dá)水平明顯高于正常組織,沉默LINC01088能顯著抑制U251 細(xì)胞的增殖,同時(shí)還能抑制細(xì)胞遷移和侵襲。這些結(jié)果與Zhang 等和Ai 等研究LINC01088在上皮性卵巢癌組織中的表達(dá)和作用相反,這可能與LINC01088在不同類型腫瘤中發(fā)揮不同的作用有關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn)沉默LINC01088能顯著抑制膠質(zhì)瘤U251 細(xì)胞的血管生成能力。
PI3K/AKT 信號(hào)通路促進(jìn)腫瘤的發(fā)生發(fā)展,對(duì)細(xì)胞的生存、增殖和代謝等關(guān)鍵功能起著重要的調(diào)控作用[17]。該信號(hào)通路活化能夠細(xì)胞周期進(jìn)程加快從而促進(jìn)細(xì)胞增殖,同時(shí)也對(duì)腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移起促進(jìn)作用,AKT 是PI3K 信號(hào)途徑的一個(gè)重要下游靶激酶,在許多癌癥中經(jīng)常發(fā)現(xiàn)磷酸化激活A(yù)KT[18]。本研究發(fā)現(xiàn)沉默LINC01088能下調(diào)PI3K 和p-AKT 蛋白的表達(dá),表明沉默LINC01088對(duì)PI3K/AKT 信號(hào)通路有抑制作用。提示LINC01088在膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖、遷移、侵襲和血管生成中所起的作用可能與其調(diào)控PI3K/AKT 信號(hào)通路有關(guān)。
綜上所述,沉默LINC01088能夠抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、遷移、侵襲和血管生成,其作用機(jī)制可能與其抑制PI3K/AKT 信號(hào)通路有關(guān)。LINC01088可能是膠質(zhì)瘤干預(yù)治療的潛在靶點(diǎn)。