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    基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接分析苦參堿抗PRRSV的作用機(jī)制

    2021-03-30 09:20:30郝江花孫盼盼孫耀貴范闊海李宏全
    畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2021年3期
    關(guān)鍵詞:苦參堿抗炎靶點(diǎn)

    郝江花,孫 娜,孫盼盼,孫耀貴,范闊海,尹 偉,李宏全*

    (1. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,太谷 030801;2. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物管理中心,太谷 030801)

    苦參堿是一類生物堿,廣泛存在于多種植物的根莖中,包括北豆根、槐角、苦參、山豆根、菟絲子等[1-2]??鄥A具有多種藥理作用,包括抗病毒[3-4]、抗炎[5-7]、抗癌[8]等。本實(shí)驗(yàn)室前期研究表明,苦參堿具有抗豬繁殖與呼吸綜合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的作用,對(duì)其典型病變間質(zhì)性肺炎有明顯的治療作用。PRRS是一種急性、接觸性、高度傳染性的疾病[9],給全球養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失[10]。PRRS的主要臨床癥狀是嚴(yán)重的呼吸道癥狀,通過(guò)組織切片觀察可見(jiàn)嚴(yán)重的間質(zhì)性肺炎[11]。在苦參堿抗PRRSV/PCV2共感染昆明小鼠的研究中,發(fā)現(xiàn)苦參堿各劑量處理組均能不同程度地減輕病毒感染誘發(fā)的肺間隔增寬等肺病變[9];在PRRSV/LPS共刺激小鼠建立的間質(zhì)性肺炎模型中,苦參堿通過(guò)抑制白細(xì)胞的變化以及IL-1β和TNF-α的表達(dá)來(lái)改善 PRRSV/LPS共刺激誘導(dǎo)的間質(zhì)性肺炎[12]。目前,苦參堿抗PRRSV作用機(jī)制尚未完全闡明?;诳鄥A的抗炎作用,對(duì)苦參堿抗炎作用靶點(diǎn)、機(jī)制的挖掘?qū)⒂兄趯?duì)抗PRRSV機(jī)制的深入研究。

    在中國(guó)幾千年的歷史中,中藥在疾病預(yù)防和治療方面發(fā)揮著舉足輕重的作用,但由于人們?cè)谄浒l(fā)揮療效的作用靶點(diǎn)及機(jī)制方面認(rèn)識(shí)有限,嚴(yán)重限制了中藥的重新定位及作為新獸藥的開(kāi)發(fā)利用[13-14]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)這一新興分支學(xué)科的興起,為中藥機(jī)制研究提供了新的技術(shù)和方法。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是一種以系統(tǒng)生物學(xué)和多向藥理學(xué)為理論基礎(chǔ),利用生物分子網(wǎng)絡(luò)分析方法,在網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)查找、計(jì)算機(jī)虛擬計(jì)算以及高通量組學(xué)數(shù)據(jù)分析的基礎(chǔ)上構(gòu)建生物信息網(wǎng)絡(luò)并進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治龅目茖W(xué)研究方法[15-16]。

    利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)及在線分析平臺(tái),構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),通過(guò)Degree等屬性值篩選核心靶點(diǎn),并通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證;通過(guò)GO分析和KEGG分析尋找苦參堿潛在作用靶點(diǎn)的代謝通路,最終構(gòu)建“藥物-靶點(diǎn)-通路”網(wǎng)絡(luò),從整體的角度探索苦參堿的抗炎機(jī)制。通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)作用靶點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),為后續(xù)苦參堿抗病毒、抗炎的機(jī)制研究提供參考。

    1 材料與方法

    1.1 苦參堿靶點(diǎn)篩選

    登錄Pubchem數(shù)據(jù)庫(kù)(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/),通過(guò)搜索“Matrine”獲取苦參堿的化學(xué)結(jié)構(gòu),保存為sdf格式。然后將苦參堿的sdf格式文件上傳到反向藥效團(tuán)匹配數(shù)據(jù)庫(kù)PharmMapper(http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/),選擇“Druggable Pharmacophore Models ”,設(shè)置匹配的靶點(diǎn)數(shù)目為300,點(diǎn)擊submit,即可得到苦參堿對(duì)應(yīng)得分排名前300的靶點(diǎn)。得到靶點(diǎn)后,使用UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)中UniProtKB搜索功能,輸入蛋白名稱,經(jīng)上述數(shù)據(jù)庫(kù)檢索和轉(zhuǎn)化操作,將檢索得到的蛋白校正為其官方名稱,即Official Symbol。

    1.2 抗炎靶點(diǎn)篩選

    登錄GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.genecards.org/),以“Anti-inflammation”為關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索,獲取并篩選與抗炎相關(guān)的靶點(diǎn)數(shù)據(jù)。

    1.3 苦參堿抗炎靶點(diǎn)可視化分析

    通過(guò)生物信息在線作圖平臺(tái)(http://www.bioinformatics.com.cn/)繪制韋恩圖,對(duì)苦參堿抗炎靶點(diǎn)進(jìn)行可視化處理。

    1.4 蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建

    登錄String數(shù)據(jù)庫(kù)(https://string-db.org/),導(dǎo)入苦參堿發(fā)揮抗炎作用的潛在靶點(diǎn)并選擇“homo sapiens”物種,獲取靶點(diǎn)蛋白相互作用關(guān)系;minimum required interaction score選擇medium confidence(0.400)并導(dǎo)出PPI互作圖和tsv文件;將tsv文件導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2軟件繪制蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),利用Network Analyzer工具對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)鋵W(xué)分析,節(jié)點(diǎn)大小和顏色深淺用于反映degree的大小,邊的粗細(xì)用于反映combine score的大小。利用Network Analyzer工具對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)鋵W(xué)分析,選取節(jié)點(diǎn)連接度(degree)的兩倍中位數(shù)為篩選標(biāo)準(zhǔn),以節(jié)點(diǎn)連接度(betweeness)、節(jié)點(diǎn)緊密度(closeness)的中位數(shù)作為篩選依據(jù)繪制Hithubs網(wǎng)絡(luò),篩選核心靶點(diǎn)。

    1.5 GO功能分析和KEGG通路分析

    登錄DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)(https://david.ncifcrf.gov/),導(dǎo)入苦參堿發(fā)揮抗炎作用的潛在靶點(diǎn)并選擇“homo sapiens”物種,select identifier設(shè)置為official gene symbol,list type設(shè)置為gene list,對(duì)苦參堿抗炎靶點(diǎn)進(jìn)行GO分析和KEGG通路分析,導(dǎo)出txt文件。將靶點(diǎn)數(shù)目進(jìn)行降序排列,對(duì)GO的3個(gè) 分支Biological Process、Molecular Function及Cellular Component靶點(diǎn)數(shù)排列前20的生物過(guò)程繪制柱狀圖;利用Bioconductor中的R包對(duì)靶點(diǎn)數(shù)排列前20的KEGG Pathway繪制氣泡圖。

    1.6 藥物-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

    登錄Cytoscape 3.7.2軟件(https://cytoscape.org/),導(dǎo)入苦參堿抗炎靶點(diǎn)及通路信息,構(gòu)建“藥物-靶點(diǎn)-通路”網(wǎng)絡(luò)圖。

    1.7 苦參堿與靶點(diǎn)分子對(duì)接驗(yàn)證

    登錄Pubchem數(shù)據(jù)庫(kù),下載配體苦參堿結(jié)構(gòu)并保存為sdf格式,利用openbabel轉(zhuǎn)為mol2格式,利用AutodockTools1.5.6打開(kāi)配體小分子,并加氫、加電荷、檢測(cè)配體的root、進(jìn)行可旋轉(zhuǎn)鍵的搜尋與定義,并保存為pdbqt文件。登錄RCSB Protein Data Bank,下載核心靶點(diǎn)蛋白IGFⅠ、MAPK8、CASP3、NR3C1的3D結(jié)構(gòu),在AutodockTools1.5.6中打開(kāi),通過(guò)添加所有的氫原子、計(jì)算Gasteiger電荷、合并非極性氫后,將其定義為受體并保存成pdbqt文件。根據(jù)配體的位置,最終確定Vina分子對(duì)接的坐標(biāo)和盒子大小,為了增加計(jì)算的準(zhǔn)確度,將參數(shù)exhaustiveness設(shè)置為20。除了特別說(shuō)明,其他參數(shù)均采用默認(rèn)值。采用Autodock vina 1.1.2進(jìn)行半柔性對(duì)接,選取affinity最佳的構(gòu)象,作為最終的對(duì)接構(gòu)象。選取對(duì)接結(jié)合能量最低的構(gòu)象用于對(duì)接結(jié)合模式分析,并使用PyMol進(jìn)行作圖。

    2 結(jié) 果

    2.1 苦參堿抗炎靶點(diǎn)的篩選

    通過(guò)PharmMapper數(shù)據(jù)庫(kù)收集到118個(gè)苦參堿潛在作用靶點(diǎn),通過(guò)GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)收集到263個(gè)抗炎靶點(diǎn),將上述苦參堿靶點(diǎn)和抗炎靶點(diǎn)取交集,獲得23個(gè)苦參堿發(fā)揮抗炎作用的潛在靶點(diǎn)(表1)。

    2.2 苦參堿抗炎靶點(diǎn)可視化分析

    登錄生物信息在線作圖平臺(tái),在成比例文氏圖(Venn diagram)的疾病靶點(diǎn)和藥物靶點(diǎn)中分別輸入抗炎靶點(diǎn)和苦參堿作用靶點(diǎn),通過(guò)韋恩圖對(duì)苦參堿抗炎靶點(diǎn)進(jìn)行可視化(圖1)。

    2.3 構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)

    將篩選出的23個(gè)苦參堿抗炎潛在靶點(diǎn)輸入String數(shù)據(jù)庫(kù),限制物種為人,獲取蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(圖2),節(jié)點(diǎn)數(shù)為23,邊數(shù)為52,預(yù)期的邊數(shù)為14,平均節(jié)點(diǎn)度值為4.52,平均局部聚類系數(shù)為0.524,PPI富集P值為4.44×10-15,保存為tsv文件。將文件導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2軟件,根據(jù)其度值繪制柱狀圖(圖3),由圖可見(jiàn)度值排名前5的靶點(diǎn)包括IGFⅠ、MAPK8、CASP3、NR3C1及MAPK14;游離靶點(diǎn)包括PPARD、CYP2C9及LTA4H。利用Network Analyzer工具對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)鋵W(xué)分析,選取節(jié)點(diǎn)連接度(Degree)的兩倍中位數(shù)(10.4)為篩選標(biāo)準(zhǔn),以節(jié)點(diǎn)連接度(betweeness)中位數(shù)(0.007 761 435)和節(jié)點(diǎn)緊密度(closeness)中位數(shù)(0.567 297)作為篩選依據(jù)繪制Hithubs網(wǎng)絡(luò),篩選核心靶點(diǎn),結(jié)果見(jiàn)圖4。由圖4可知苦參堿抗炎核心靶點(diǎn)為IGFⅠ、MAPK8、CASP3、NR3C1。

    2.4 GO功能分析和KEGG通路分析

    將篩選出的23個(gè)苦參堿抗炎靶點(diǎn)輸入DAVID 數(shù)據(jù)庫(kù),物種限定為人,進(jìn)行GO功能分析,共獲得116個(gè)富集結(jié)果。獲得生物過(guò)程(biological process)81個(gè),細(xì)胞組分(cellular component)8個(gè),分子功能(molecular function)27個(gè)。其中,生物過(guò)程涉及RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、類固醇激素介導(dǎo)的信號(hào)通路、凋亡過(guò)程的負(fù)調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)磷酸化等。細(xì)胞組分涉及核質(zhì)、RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合物、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核、受體復(fù)合物等。分子功能涉及蛋白質(zhì)結(jié)合、鋅離子結(jié)合、類固醇激素受體活性、序列特異性DNA結(jié)合、蛋白激酶活性等。將GO功能分析中生物過(guò)程、細(xì)胞組分、分子功能的degree值排列前20的過(guò)程繪制柱狀圖(圖5~7)。KEGG 通路分析共獲得47個(gè)通路,利用Bioconductor中的R包對(duì)靶點(diǎn)數(shù)排列前20的KEGG Pathway繪制氣泡圖(圖8)。

    表1 苦參堿抗炎靶點(diǎn)

    2.5 苦參堿-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

    將DAVID通路注釋得到的數(shù)據(jù),通過(guò)Cytoscape3.7.2軟件構(gòu)建苦參堿靶點(diǎn)-代謝通路-疾病網(wǎng)絡(luò)模型(圖9)。Network Analyzer結(jié)果顯示,網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)數(shù)為71,網(wǎng)絡(luò)邊數(shù)為217,網(wǎng)絡(luò)密度為0.087,網(wǎng)絡(luò)直徑為4,網(wǎng)絡(luò)半徑為2,網(wǎng)絡(luò)中心度為0.483、網(wǎng)絡(luò)異質(zhì)性為1.217,最短路徑為4 970,特征路徑長(zhǎng)度為2.378,平均網(wǎng)絡(luò)度為6.113。

    2.6 苦參堿的分子對(duì)接驗(yàn)證

    選取Hithubs網(wǎng)絡(luò)中的4個(gè)核心靶點(diǎn)(IGFⅠ、MAPK8、CASP3、NR3C1),利用AutoDock Vina軟件分別與苦參堿進(jìn)行分子對(duì)接(表2)。為了從分子水平闡明蛋白與化合物的作用模式,將苦參堿對(duì)接至核心蛋白的活性口袋,理論結(jié)合模式如圖10~13所示。由圖可以看出,苦參堿與CASP3蛋白氨基酸LYS53形成鍵長(zhǎng)為3.4 ?的氫鍵作用;與IGFⅠ蛋白氨基酸TYR60形成鍵長(zhǎng)為3.4 ?的氫鍵作用;與MAPK8蛋白氨基酸ASN156形成鍵長(zhǎng)為3.4 ?的氫鍵作用;與NR3C1蛋白氨基酸ARG558形成鍵長(zhǎng)為3.4 ?的氫鍵作用,這些相互作用使得蛋白與化合物形成復(fù)合物,由于IGFⅠ蛋白較小,對(duì)接結(jié)合自由能較高,因此,可能不是很穩(wěn)定,而蛋白MAPK8與苦參堿對(duì)接結(jié)合能較低,可形成穩(wěn)定的復(fù)合物。因此,MAPK8為苦參堿的最佳結(jié)合靶點(diǎn)。

    圖1 苦參堿靶點(diǎn)和抗炎靶點(diǎn)交集Fig.1 Intersection of matrine and anti-inflammatory targets

    圖2 苦參堿抗炎潛在靶點(diǎn)蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)Fig.2 Potential target protein interaction network of matrine

    3 討 論

    目前,利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù)在藥物作用靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)和機(jī)制的研究方面已取得良好的成效。沈汶等[17]在研究銀黃藥對(duì)的抗病毒作用機(jī)制時(shí),運(yùn)用PharmMapper網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器、DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)、String數(shù)據(jù)庫(kù)等預(yù)測(cè)關(guān)鍵蛋白,發(fā)現(xiàn)銀黃藥對(duì)抗病毒作用的靶點(diǎn)主要有CDK2、CDK7、SRC、DHFR、CHEK1、CCNA2等,可能通過(guò)抑制DNA前體合成來(lái)發(fā)揮抗病毒作用。崔琳琳等[18]在陳皮干預(yù)COVID-19機(jī)制研究中,利用TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)、GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)及分子對(duì)接技術(shù)等獲得MAPK、MAPK8、CASP3、MAPK1、PTGS2、CAT、PPARG、NOS2等核心靶蛋白,提示陳皮可能通過(guò)抗病毒、抗炎、調(diào)控細(xì)胞凋亡、調(diào)節(jié)免疫等途徑,發(fā)揮抑制肺纖維化的作用。

    圖3 苦參堿抗炎潛在靶點(diǎn)度值排序Fig.3 Order of anti-inflammatory potential target values of matrine

    圖4 苦參堿抗炎靶點(diǎn)蛋白Hithubs網(wǎng)絡(luò)Fig.4 Hithubs network of matrine anti-inflammatory target proteins

    圖5 苦參堿抗炎靶點(diǎn)的生物過(guò)程Fig.5 Biological process of matrine anti-inflammatory target

    利用PharmMapper和Genecards數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘到23個(gè)苦參堿抗炎靶點(diǎn)。利用String和Cytoscape數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò),通過(guò)連接度(degree)、節(jié)點(diǎn)連接度(betweeness)、節(jié)點(diǎn)緊密度(closeness)篩選出4個(gè)核心靶點(diǎn),即IGFⅠ、MAPK8、CASP3和NR3C1。IGFⅠ又被稱為胰島素樣生長(zhǎng)因子Ⅰ(insulin-like growth factorⅠ,IGFⅠ),是胰島素樣生長(zhǎng)因子家族重要的一員。研究發(fā)現(xiàn),IGFⅠ在免疫系統(tǒng)炎癥調(diào)節(jié)方面發(fā)揮著重要作用。小鼠感染流感病毒后IGFⅠ表達(dá)上調(diào),IGFⅠ R磷酸化水平升高,促進(jìn)下游PI3K/AKT和MAPK8中的P38信號(hào)通路的激活進(jìn)而促進(jìn)炎癥反應(yīng)[19-20]。半胱天冬酶(caspase)是一類天冬氨酸特異性半胱氨酸蛋白酶家族,caspase-3是其最主要的成員之一[21],被稱為細(xì)胞凋亡的代表性效應(yīng)CASP,最近也被稱為焦亡的炎性介質(zhì)。Suzuki等[22]在caspase-3缺陷小鼠免疫相關(guān)腎病研究中,發(fā)現(xiàn)caspase-3缺陷小鼠表現(xiàn)出腎炎癥、輕度脾腫大和炎性基因表達(dá)上調(diào),表明caspase-3在炎癥反應(yīng)中起重要作用。NR3C1是糖皮質(zhì)激素受體基因(nuclear receptor subfamily 3, group C, member 1),糖皮質(zhì)激素(glucocorticoids,GC)是腎上腺皮質(zhì)細(xì)胞分泌的一種類固醇激素,具有強(qiáng)大的抗炎和對(duì)組織細(xì)胞的免疫抑制作用[23],廣泛用于治療包括類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎和哮喘在內(nèi)的不同炎癥性疾病[24]。糖皮質(zhì)激素受體(glucocorticoid reccptor,GR)是介導(dǎo)GC發(fā)揮作用的重要轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,GC作用于NR3C1進(jìn)而抑制炎癥基因表達(dá)是抗炎有效性的核心[25]。MAPK8又被稱為c-Jun氨基末端激酶1(c-Jun N-terminal kinase 1,JNK1),是MAPKs 家族的重要成員之一,在炎癥等病理過(guò)程中起著重要的調(diào)控作用[26-27]。研究表明,PRRSV感染能夠激活MAPK信號(hào)通路,促進(jìn)MAPK信號(hào)通路中JNK、p38和ERK1/2的磷酸化[28]。雷瑩瑩[28]在親和蛋白A對(duì)PRRSV增殖的影響及其作用機(jī)制的研究中,發(fā)現(xiàn)在親和蛋白A作用后,不影響PRRSV感Marc-145細(xì)胞中的JNK的表達(dá),但明顯抑制其磷酸化過(guò)程。余志彬[29]在PRRSV誘導(dǎo)白介素-12產(chǎn)生的分子機(jī)制研究中,發(fā)現(xiàn)PRRSV感染可以誘導(dǎo)IL-12p40和IL-12p35的表達(dá),且PRRSV對(duì)IL-12p40的誘導(dǎo)依賴于JNK-AP-1和NF-κB的信號(hào)途徑。Liu等[30]研究表明PRRSV可能通過(guò)TAK-1/JNK/AP-1途徑誘導(dǎo)IL-8的產(chǎn)生。運(yùn)用分子對(duì)接技術(shù)計(jì)算4個(gè)核心蛋白與苦參堿分子的結(jié)合能,結(jié)果可知MAPK8與苦參堿分子的結(jié)合能最低,形成的復(fù)合物最穩(wěn)定,因此,MAPK8可能是苦參堿發(fā)揮抗PRRSV作用的主要靶點(diǎn)。通過(guò)苦參堿抗炎作用靶點(diǎn)、通路的挖掘,為苦參堿抗PRRSV作用機(jī)制的深入研究奠定基礎(chǔ)。

    圖6 苦參堿抗炎靶點(diǎn)的細(xì)胞組分Fig.6 Cellular components of matrine anti-inflammatory target

    圖7 苦參堿抗炎靶點(diǎn)的分子功能Fig.7 Molecular function of anti-inflammatory matrine target

    圖8 苦參堿抗炎靶點(diǎn)的KEGG分析Fig.8 KEGG analysis of matrine anti-inflammatory targets

    圖9 苦參堿-靶點(diǎn)-通路的網(wǎng)絡(luò)模型Fig.9 Network model of matrine-target-pathway

    表2 核心靶蛋白與苦參堿對(duì)接結(jié)果

    a. 苦參堿與IGFI對(duì)接的整體圖; b. 苦參堿與IGFI對(duì)接的局部作用圖 a. Overall diagram of matrine docking to IGFI; b. Local action diagram of matrine docking to IGFI圖10 苦參堿與IGFI對(duì)接的最佳構(gòu)象相互作用示意圖Fig.10 Schematic diagram of the optimal conformational interaction of matrine docked to IGFⅠ

    a.苦參堿與MAPK8對(duì)接的整體圖;b. 苦參堿與MAPK8對(duì)接的局部作用圖 a. Overall diagram of matrine docking to MAPK8; b. Local action diagram of matrine docking to MAPK8圖11 苦參堿與MAPK8對(duì)接的最佳構(gòu)象相互作用示意圖Fig.11 Schematic diagram of the optimal conformational interaction of matrine docked to MAPK8

    a.苦參堿與CASP3對(duì)接的整體圖;b. 苦參堿與CASP3對(duì)接的局部作用圖 a. Overall diagram of matrine docking to CASP3; b. Local action diagram of matrine docking to CASP3圖12 苦參堿與CASP3對(duì)接的最佳構(gòu)象相互作用示意圖Fig.12 Schematic diagram of the optimal conformational interaction of matrine docked to CASP3

    a. 苦參堿與NR3C1對(duì)接的整體圖;b. 苦參堿與NR3C1對(duì)接的局部作用圖 a. Overall diagram of matrine docking to NR3C1; b. Local action diagram of matrine docking to NR3C1圖13 苦參堿與NR3C1對(duì)接的最佳構(gòu)象相互作用示意圖Fig.13 Schematic representation of the optimal conformational interaction of matrine docked to NR3C1

    4 結(jié) 論

    MAPK8是苦參堿發(fā)揮抗炎作用的主要靶點(diǎn),苦參堿可能通過(guò)作用于MAPK8這一關(guān)鍵蛋白發(fā)揮抗炎作用,進(jìn)而達(dá)到抗PRRSV的作用。

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