姚春霖,孫 燕,陳 蕊,孫樹俊,林 云
華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬協(xié)和醫(yī)院麻醉科(武漢 430022)
新型冠狀病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)是以發(fā)熱、乏力、干咳為主要臨床表現(xiàn),以呼吸道飛沫和密切接觸為主要傳播途徑的烈性傳染病。2020年國家衛(wèi)生健康委員會第1號文件將COVID-19納入《中華人民共和國傳染病防治法》規(guī)定的乙類傳染病,并采取甲類傳染病的預(yù)防、控制措施[1-3]。COVID-19的致病微生物是新型冠狀病毒(SARS-CoV-2),進(jìn)入人體后常有1~14天的潛伏期,多數(shù)在3~7天發(fā)病,與SARS和MERS高致死率不同,COVID-19致死率較低,文獻(xiàn)報(bào)道僅為0.7%~5.8%[4]。截至2020年11月15日24時(shí),全球COVID-19累計(jì)確診病例超5.4×107例,累計(jì)死亡病例超過1.3×106例[3],目前COVID-19感染病例和死亡病例仍在持續(xù)增加,COVID-19相關(guān)研究依然是當(dāng)前醫(yī)學(xué)領(lǐng)域主要的研究熱點(diǎn)之一。
CiteSpace是目前廣泛使用的可視化分析軟件,被用于多學(xué)科領(lǐng)域的知識圖譜繪制[5-6]。本研究應(yīng)用CiteSpace軟件對Web of Science數(shù)據(jù)庫收錄的COVID-19相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行可視化分析,探索當(dāng)前COVID-19研究現(xiàn)狀、研究熱點(diǎn)和發(fā)展趨勢,為該領(lǐng)域未來研究提供科學(xué)參考。
以Web of Science核心合集為檢索數(shù)據(jù)庫,以"nCoV-2019" OR "2019-nCoV" OR "COVID-19" OR"SARS-CoV-2" OR "novel coronavirus"為檢索詞,時(shí)間限定于2019年12月1日至2020年11月15日。使用數(shù)據(jù)庫中的“文獻(xiàn)類型精煉”選項(xiàng)對檢索結(jié)果進(jìn)行提煉,納入論著、綜述,排除了會議摘要、評論、論文集論文、來信等不符合納入標(biāo)準(zhǔn)的文章類型。以“全記錄與引用的參考文獻(xiàn)”及“純文本”格式導(dǎo)出檢索內(nèi)容。本研究是對現(xiàn)有文獻(xiàn)的匯總分析,無需所在機(jī)構(gòu)倫理委員會審批。
使用CiteSpace 5.6軟件對COVID-19相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行計(jì)量分析,主題節(jié)點(diǎn)包括期刊、國家/地區(qū)、作者、研究機(jī)構(gòu)、關(guān)鍵詞聚類和被引文獻(xiàn)分析。其中網(wǎng)絡(luò)圖譜中節(jié)點(diǎn)的大小表示出現(xiàn)次數(shù)或被引頻次的多少,節(jié)點(diǎn)間線條粗細(xì)表示節(jié)點(diǎn)之間聯(lián)系緊密程度,線條越粗、顏色越深代表節(jié)點(diǎn)之間的聯(lián)系越緊密,有著更深的合作關(guān)系。
截止2020年11月15日,Web of Science網(wǎng)站已發(fā)表58 000余篇COVID-19相關(guān)文章。排除會議摘要、論文集和信件之后,獲得28 069篇論著和3 387篇綜述,其中28 875篇(91.79%)英文,604篇(1.92%)德文,575篇(1.83%)西班牙文,1402篇(4.46%)其他文種發(fā)表。本研究僅納入英文文獻(xiàn)并導(dǎo)入CiteSpace軟件進(jìn)行分析。
截止2020年11月15日,共有3 879個(gè)期刊發(fā)表了COVID-19相關(guān)文章。被引期刊/雜志排名前三的分別是Lancet(15 179次),New Engl J Med(13 838次 ) 和JAMA-J Am Med ASSOC(10 386次),表1中列出了被引排名前十的雜志。此外,我們通過CiteSpace對COVID-19相關(guān)期刊進(jìn)行了疊加,結(jié)果顯示共有三種引用路徑:黃色的途徑,在免疫學(xué)/生物學(xué)期刊上發(fā)表的論文大多引用了生物學(xué)/遺傳學(xué)領(lǐng)域的期刊;中間綠色路徑,在醫(yī)學(xué)/臨床期刊上發(fā)表的論文部分引用了生物學(xué)/遺傳學(xué)領(lǐng)域的期刊;最下面的綠色路徑是在醫(yī)學(xué)/臨床期刊上發(fā)表的論文,部分引用了健康/醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的期刊,如圖1所示。
圖1 與COVID-19相關(guān)的期刊的雙圖疊加圖Figure 1. The dual-map overlay of journals related to COVID-19
表1 2019年至2020年COVID-19研究論文被引排名前10的期刊Table 1.Top 10 journals cited for COVID-19 research from 2019 to 2020
作者發(fā)表研究的數(shù)量和引用頻次一定程度上可以反映作者的科研能力和學(xué)術(shù)水平。如表2和圖2所示,發(fā)文量前十的作者中,Zhang W(45篇)排名第一,其次是Li W(43篇)、Wang W(39篇)和Liu L(39篇)。但是,被引用次數(shù)最多的作者/機(jī)構(gòu)是Huang CL(5 580次),其次是WHO(4 625次)和Guan W(3 632次) 。
圖2 作者分布(A)對COVID-19研究做出貢獻(xiàn)的重要作者網(wǎng)絡(luò)地圖(B)對COVID-19研究做出貢獻(xiàn)的被引作者網(wǎng)絡(luò)地圖Figure 2. The distribution of authors(A) The network map of important authors contributed to COVID-19 research. (B) The network map of co-cited authors contributed to COVID-19 research.
表2 2019年至2020年COVID-19研究領(lǐng)域發(fā)文量被引量前10的作者Table 2. The rank of 10 authors and co-cited authors in the field of COVID-19 from 2019 to 2020
以國家(地區(qū))和機(jī)構(gòu)分別進(jìn)行文獻(xiàn)的視圖分析。 如表3和圖3所示,美國是COVID-19領(lǐng)域發(fā)表文章最多的國家,已發(fā)表9 060篇,且與其他國家研究合作緊密。 在COVID-19研究領(lǐng)域排名前5位的研究機(jī)構(gòu)分別是:華中科技大學(xué)(653篇)、哈佛大學(xué)(547篇)、武漢大學(xué)(414篇)、米蘭大學(xué)(329篇)和多倫多大學(xué)(329篇)。
圖3 國家(地區(qū))和機(jī)構(gòu)的分布(A)參與COVID-19研究的國家(地區(qū))網(wǎng)絡(luò)地圖 (B)參與COVID-19研究的機(jī)構(gòu)網(wǎng)絡(luò)地圖Figure 3. The distribution of countries and institutes (A) The network map of countries/regions that involved in COVID-19 research. (B) The network map of institutes that involved in COVID-19 research
表3 2019年至2020年COVID-19研究領(lǐng)域發(fā)文排名前10的國家和機(jī)構(gòu)Table 3. Top ten countries and institutions in the field of COVID-19 research from 2019 to 2020
通過觀察關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò),我們發(fā)現(xiàn)出現(xiàn)頻率最高的關(guān)鍵詞是COVID-19(16 959次),其次是冠狀病毒(5 688次)和SARS-CoV-2(5 678次)。CiteSpace中,節(jié)點(diǎn)的大小表示出現(xiàn)頻率的多少,節(jié)點(diǎn)越大,預(yù)示出現(xiàn)頻率越高。節(jié)點(diǎn)間線條越粗,顏色越深,預(yù)示著節(jié)點(diǎn)之間的聯(lián)系越緊密。如圖4所示,我們可以直觀地觀察到每個(gè)關(guān)鍵詞所對應(yīng)節(jié)點(diǎn)的大小,其中這些較大的節(jié)點(diǎn)主要集中在COVID-19致病機(jī)制和臨床表現(xiàn)方面。
圖4 COVID-19 關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析圖譜Figure 4. The keywords that published articles related to COVID-19 research
我們使用CiteSpace構(gòu)建了被引文獻(xiàn)的網(wǎng)絡(luò)(圖5),揭示了論文之間的相關(guān)性。所有分類均以出版物參考文獻(xiàn)中提取的術(shù)語命名,以關(guān)鍵詞為聚類標(biāo)簽,采用LLR算法進(jìn)行聚類。結(jié)果顯示最大的聚類簇是“#0羥氯喹”,其余依次為“#1臨床特征”“#2急性心肌梗死”“#3刺突蛋白”。
圖5 COVID-19引用文獻(xiàn)聚類分析網(wǎng)格圖集Figure 5. COVID-19 cited literature cluster analysis map
本研究對2019年12月1日至2020年11月15日Web of Science核心數(shù)據(jù)庫中COVID-19相關(guān)研究文獻(xiàn)進(jìn)行了計(jì)量分析。目前,COVID-19已在全球范圍內(nèi)廣泛擴(kuò)散和流行,其中美國是疫情最嚴(yán)重的國家之一,而我國是現(xiàn)階段為數(shù)不多的疫情得到基本控制的大國之一,就全球范圍而言COVID-19新進(jìn)確診病例和死亡病例目前仍在攀升,對COVID-19進(jìn)行深入的科學(xué)研究及尋找有效的控制方案依然是當(dāng)前醫(yī)學(xué)領(lǐng)域重要的科研焦點(diǎn),我們的研究為COVID-19研究者迅速掌握COVID-19研究基礎(chǔ)和把握COVID-19研究前沿提供科學(xué)指導(dǎo)。
研究結(jié)果表明,中國和美國在COVID-19研究領(lǐng)域處于領(lǐng)先地位。同時(shí),本研究結(jié)果展示了COVID-19研究領(lǐng)域重要的研究者和核心研究機(jī)構(gòu),這為COVID-19研究者尋找潛在合作伙伴提供參考。
文獻(xiàn)共被引是指同一引用文獻(xiàn)中引用的兩個(gè)不同的文獻(xiàn),它們可以揭示特定領(lǐng)域知識結(jié)構(gòu)的演變和研究重點(diǎn)。本文引用文獻(xiàn)聚類有很多種,大致包括臨床表現(xiàn)、治療方法、感染機(jī)制、診斷方法、病史、藥物疫苗和神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn)等。新型冠狀病毒肺炎的藥物治療、臨床表現(xiàn)和感染機(jī)制是研究的重點(diǎn)。
治療方案(聚類I):COVID-19爆發(fā)以來,醫(yī)務(wù)工作者和基礎(chǔ)科研人員從不同的機(jī)制探尋有效的治療方案,包括呼吸支持治療、抗病毒藥物應(yīng)用、免疫療法、激素應(yīng)用、中醫(yī)中藥以及抗凝干預(yù)等[7]。羥氯喹是氯喹的衍生物,這類藥物早期主要作為一種抗瘧疾藥在臨床中應(yīng)用,之后應(yīng)用范圍逐漸擴(kuò)大到自身免疫系統(tǒng)性疾病和抗病毒治療方面。Wang等通過體外實(shí)驗(yàn)證實(shí)了氯喹抗SARS-CoV-2病毒的療效,其可能是通過抑制細(xì)胞血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2受體的糖基化,從而干擾SARS-CoV-2病毒與受體細(xì)胞膜的融合[8]。然而,一些臨床觀察并未得出一致的結(jié)論,Cavalcanti 等發(fā)現(xiàn)單獨(dú)應(yīng)用羥氯喹或聯(lián)合阿奇霉素并不能改善輕中度COVID-19患者的臨床結(jié)局,且不良反應(yīng)明顯增加[9]。我國最新版《新冠肺炎診療方案》中不推薦單獨(dú)應(yīng)用羥氯喹或聯(lián)合使用阿奇霉素治療COVID-19[10]。關(guān)于抗病毒藥物除了氯喹/羥氯喹,α-干擾素、克立芝、利巴韋林、瑞德西韋等均有大量研究進(jìn)行療效觀察。然而,目前為止,COVID-19仍無特效藥物可以治療,探索新的治療藥物或手段仍是目前的熱點(diǎn)。
臨床特征(聚類II):大量已發(fā)表的文獻(xiàn)描述了COVID-19的臨床表現(xiàn),這是COVID-19患者所表現(xiàn)出的最直觀的特征。目前COVID-19的全球致死率為0.7%~5.8%,中國大陸的致死率為0.66%[4]。其中80%的COVID-19感染者為輕型病例,癥狀為無肺炎表現(xiàn)或輕型肺炎表現(xiàn),X線片可能無明顯改變;14%為重癥病例,癥狀或體征包括呼吸急促(頻率>30次/分)、血氧飽和度降低<93%(未吸氧狀態(tài)下)、氧合指數(shù)(PaO2/FiO2)<300或1~2天肺滲出液>50%;6%為危重病例,癥狀多表現(xiàn)為呼吸衰竭、敗血性休克和多器官功能衰竭[4,11-15]。除影響呼吸系統(tǒng)外,COVID-19還會影響:①心血管系統(tǒng)(心肌標(biāo)志物的升高提示心肌損傷,突發(fā)心臟衰竭或急性心肌梗死甚至心跳驟停)[16-17];②神經(jīng)系統(tǒng)(重癥患者的神經(jīng)系統(tǒng)損傷較明顯,多表現(xiàn)為中樞神經(jīng)癥狀,如頭痛、頭昏、意識障礙和急性腦血管病等)[18-19];③消化系統(tǒng)(癥狀多為腹瀉嘔吐,少數(shù)表現(xiàn)為腹痛,而危重癥患者的肝功能損害與輕癥患者相比則更加明顯)[20];④泌尿系統(tǒng)(63%患者會出現(xiàn)蛋白尿,27%出現(xiàn)血尿,少數(shù)患者則會發(fā)展為急性腎損傷和腎功能衰竭)[21]。
感染機(jī)制(聚類III):通過研究之前的冠狀病毒(如Ro-BatCoV HKU10和HCoV-EMC等)的感染機(jī)制,研究人員發(fā)現(xiàn)血管緊張素轉(zhuǎn)化酶-2(ACE2,宿主細(xì)胞膜上最重要的受體之一)與帶有弗林蛋白酶切割位點(diǎn)的刺突蛋白相互作用,發(fā)生蛋白水解和酸化,導(dǎo)致了SARS-CoV-2的入侵,同時(shí)機(jī)體釋放大量炎性因子,使得血管炎性滲出增加,加重了組織水腫,嚴(yán)重時(shí)可致器官衰竭[22-24]。而ACE2廣泛存在于身體內(nèi)重要器官中,這也解釋了COVID-19不僅僅是對呼吸系統(tǒng)造成損害,也表現(xiàn)出全身器官受累癥狀[25-26]。2020年最新研究發(fā)現(xiàn)COVID-19胞膜上的刺突蛋白與ACE2的結(jié)合能力相比SARS-CoV更強(qiáng),所以刺突蛋白可能是針對COVID-19研發(fā)治療性抗體和檢驗(yàn)診斷的關(guān)鍵靶點(diǎn)[27-29]。
本研究簡要分析了近 1年COVID-19研究的現(xiàn)狀、熱點(diǎn)和發(fā)展趨勢,研究的不足之處在于僅納入了 Web of Science 核心合集文獻(xiàn)中的英文文獻(xiàn),且文章類型僅包括“文獻(xiàn)”和“綜述”,可能會存在偏倚。此外由于本研究納入文獻(xiàn)時(shí)間跨度小,因此CiteSpace軟件無法根據(jù)COVID-19關(guān)鍵字時(shí)區(qū)圖分析COVID-19研究趨勢。