南京地區(qū)斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生物群落結構研究

鐘立強，王明華，張世勇，姜虎成，陳校輝，朱廣偉，邊文冀*

（1.江蘇省淡水水產研究所，南京210017；2.中國科學院南京地理與湖泊研究所 湖泊與環(huán)境國家重點實驗室 太湖湖泊生態(tài)系統(tǒng)研究站，南京210008；3.中國科學院大學，北京100049）

中國是全球最大的漁業(yè)養(yǎng)殖和水產品消費國家，水產養(yǎng)殖產量占世界水產養(yǎng)殖總產量的60%以上[1]。而內陸淡水池塘養(yǎng)殖又是其中最主要的養(yǎng)殖方式，2018 年養(yǎng)殖面積達252.7 萬hm2，養(yǎng)殖產量2 212.2 萬t，占全國水產品總產量的32.9%[2]。池塘養(yǎng)殖時，強調“養(yǎng)魚先養(yǎng)水”，即魚苗在下塘養(yǎng)殖前，要提前對養(yǎng)殖池塘的水體進行施肥等管理工作，使得養(yǎng)殖水體保持“肥、活、嫩、爽”。從生態(tài)學角度講，這個過程就是通過施肥加速養(yǎng)殖水體富營養(yǎng)化，促進藻類及浮游動物的生長，從而提高水體生產力，為魚類提供充足的生物餌料，形成相對穩(wěn)定并適合魚類生活的微生態(tài)環(huán)境。

與自然水域生態(tài)系統(tǒng)不同，淡水池塘養(yǎng)殖是特殊的人為操縱生態(tài)系統(tǒng)。充足的營養(yǎng)鹽通過上行效應提高魚類產量的同時，大量投入的有機質也為池塘生態(tài)系統(tǒng)食物網(wǎng)的腐屑鏈提供了能量和物質基礎。細菌在腐屑鏈中占據(jù)著重要地位，一方面細菌起著降解作用，是物質和能量的貯存者，另一方面，它們是重要的生產者，能夠將有機質轉化為細菌菌體蛋白，直接被浮游動物和魚類攝食[3]。已有研究表明，細菌群落與水體的營養(yǎng)水平及浮游植物的生物量存在明顯關系[4-5]。養(yǎng)殖池塘中，由于富營養(yǎng)化和魚類的牧食壓力，小型浮游植物和浮游動物占據(jù)優(yōu)勢[6]，進而可能對池塘生態(tài)系統(tǒng)中的細菌群落結構造成影響。因此，對養(yǎng)殖池塘水體細菌群落結構開展研究十分必要。本文采用16S rRNA 基因片段高通量測序技術對南京斑點叉尾鮰（Ictalurus punctatus）淡水養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的周年變化開展了研究，目的主要是：（1）了解斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落組成、多樣性的年度變化特點；（2）明確斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落結構的主要影響因子。這些研究結果將對斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體的精細化管理和健康養(yǎng)殖提供幫助。

1 材料與方法

1.1 養(yǎng)殖池塘及樣品采集

試驗在江蘇省淡水水產研究所國家斑點叉尾鮰遺傳育種中心養(yǎng)殖基地開展。養(yǎng)殖池塘面積0.21 hm2（50 m×42 m），位于南京市江寧區(qū)祿口鎮(zhèn)（31°77′03″N，118°88′29″E）。養(yǎng)殖開始前一個月抽干池水，漂白粉清塘后，加水至1.5 m左右，池塘中央設置一臺增氧機。4—10 月，每晚23：00 開啟增氧機至次日凌晨4：00，晴天中午11：00 點開啟2 h，保證養(yǎng)殖水體溶氧充足。夏季每月月中補水，春秋季則每2 月補水一次。池塘內放入2 747 尾斑點叉尾鮰魚種（平均18.91 g·尾-1），養(yǎng)殖從11月底至次年12月初。每日早晚兩次投喂漂浮性顆粒配合飼料（蛋白含量35%），飼料投喂量為魚體質量的3%左右。

養(yǎng)殖周期內，每月的月末開展水樣采集。每次上午10：00，利用Schindler 采水器（5 L）采集3處池塘表層50 cm 的水樣，放入滅菌塑料瓶。水樣放入4 ℃保溫箱帶回實驗室，分析時樣品為3 個點水樣的混合樣。取300 mL 混合水樣經0.22 μm 的聚碳酸酯膜（Millipore，Cork，Ireland）負壓過濾，得到濾膜樣品，放入2 mL 的無菌離心管，-80 ℃超低溫冰箱冷凍保存，留待DNA 提取。另取200 mL 混合水樣4 ℃低溫保存，進行水質的化學因子分析。

1.2 池塘水質因子測定

利用多功能水質參數(shù)儀（YSI6920v2，USA）現(xiàn)場測定溫度（Temp）、酸堿度（pH）、總溶解性懸浮物（TDS）、濁度（Tur）以及溶解氧（DO）等環(huán)境因子。塞氏盤測定水體透明度（SD）。其他水質指標在實驗室內按以下方法測定：總氮（TN）采用堿性過硫酸鉀消解紫外分光光度法（GB 11894—1989）；銨態(tài)氮（NH-N）采用納氏試劑分光光度法（GB 7479—1987）；硝態(tài)氮（NO-N）采用酚二磺酸分光光度法（GB 7480—1987）；亞硝態(tài)氮（NO-N）采用分光光度法（GB 7493—1987）；總磷（TP）和正磷酸鹽（PO-P）采用磷鉬藍比色法（HJ 670-2013）；總有機碳（TOC）采用燃燒-非分散紅外吸收法（GB 13193—1991）；化學需氧量（CODMn）采用高錳酸鉀滴定法（GB 11892—1989）。水樣經Whatman GF/C 0.45μm濾膜過濾后，分光光度法（HJ 897—2017）測定葉綠素a（Chl a）含量。

1.3 DNA提取和16S rRNA基因擴增

水樣過濾收集濾膜，用預先經75%酒精擦拭過的醫(yī)用剪刀剪碎后，利用Qiagen DNeasy Blood & Tissue Kit試劑盒（Qiagen，CA，USA）提取微生物總DNA。提取的DNA 經紫外分光光度計和1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測濃度及純度后，-20 ℃保存?zhèn)溆谩Ｒ酝ㄓ靡?38F 和806R 擴增16S rRNA 基因V3-V4 高變區(qū)[7]，建庫及高通量測序在上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司完成。

1.4 數(shù)據(jù)優(yōu)化與分析

生物信息學分析前，先用Trimmomatic軟件[8]去除測序原始序列的引物和barcode 標簽，再用FLASH 軟件[9]對序列進行拼接，使用VSEARCH（1.9.6）將序列以97%相似性聚類成操作分類單元（Operational taxonomic units，OTUs），比對的參考數(shù)據(jù)庫是Silva_132 16SrRNA database（http：//www.arb-sliva.de）[10]。

所有統(tǒng)計分析及可視化分析均利用R 語言中的vegan和ggplot2程序包（Version 3.2.2）以及上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司I-sanger 云平臺完成。多樣性分析前，根據(jù)每個樣本中最少的序列數(shù)進行抽平。利用mothur 軟件計算α 多樣性[11]。計算β 多樣性前，對抽平后的物種數(shù)據(jù)進行Hellinger 轉化[12]，再進行非度量多維尺度分析（Nonmetric multi-dimensional scaling，NMDS）[13]。對環(huán)境因子進行999次Monte Carlo置換檢驗的前向選擇后，采用冗余分析（Redundancy analysis，RDA）對環(huán)境因子與微生物群落進行典范對應分析[14]。采用相似性分析（Analysis of similarities，ANOSIM）檢驗季節(jié)間差異。最后，通過多物種線性差異判別分析（Linear discriminant analysis effect size，LEfSe），根據(jù)分類學組成對樣本按照不同分組條件進行線性判別分析（LDA），找出具有季節(jié)顯著性差異的菌群[15]。

2 結果與分析

2.1 水體理化特征

年度養(yǎng)殖試驗過程中，水溫（Temperature）呈現(xiàn)出明顯的季節(jié)性變化，從冬季的1月末逐步升高，夏季7月末達到峰值33.78 ℃，之后緩慢下降，除春季和秋季外，其他季節(jié)間水溫都存在顯著性差異（P＜0.05）?？側芙庑詰腋∥铮═DS）和水體透明度（SD）都呈現(xiàn)出持續(xù)下降的趨勢，且都是冬春季顯著高于夏秋季（P＜0.05）。全年水樣pH 介于7.68～9.50，始終保持偏堿性，冬季水體的堿性顯著強于夏季（P＜0.05）。水體溶氧（DO）含量為6.12～16.39 mg·L-1，適合魚類養(yǎng)殖，冬季水體的溶氧含量也顯著高于其他3 個季節(jié)（P＜0.05）。水體總氮（TN）和總磷（TP）濃度始終維持較高水平，一直處于富營養(yǎng)化狀態(tài)，四季間TN 變化不大，但冬季TP 濃度顯著低于夏秋季節(jié)（P＜0.05）。氨氮（NH+4-N）、亞硝酸鹽（NO-2-N）、硝酸鹽（NO-3-N）隨季節(jié)的變化表現(xiàn)出一定的差異，但正磷酸鹽（PO3-4-P）則全年無顯著性變化。總有機碳（TOC）也表現(xiàn)為冬春季顯著高于夏秋季（P＜0.05）。葉綠素a（Chl a）夏秋季要高于冬春季，其中夏季顯著高于其他3 個季節(jié)，并在7 月達到年度峰值，冬季的葉綠素a 濃度最低。水體理化特征見表1。

表1 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體理化性質Table 1 Summary of physicochemical parameters for water samples of channel catfish pond

2.2 微生物群落多樣性特征

經優(yōu)化處理后，共獲得356 877條序列，平均每個樣品有29 741 條高質量序列，序列平均長度為434.55 bp。這些序列被聚類為1 023 個OTUs。稀釋曲線分析中所有樣本的都接近平緩，表明本次試驗抽樣充分，測序深度足以反映每個樣本細菌群落的生物信息。

選取Ace指數(shù)、Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simp-son指數(shù)用來反映養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的物種豐富度和多樣性。結果顯示（圖1），養(yǎng)殖年度內，Ace 指數(shù)和Chao1指數(shù)變化趨勢較為一致：冬春季呈S形變化，最小值出現(xiàn)在冬季2 月，并與相鄰的1 月以及初春的3 月形成細菌群落物種豐富度的小低谷，之后的3 個月又持續(xù)上升；7 月Ace 指數(shù)和Chao1 指數(shù)大幅下降，之后鋸齒狀震蕩上升，并在10 月達到年度最大值。使用單因素方差分析（ANOVA）對4 個季度的Ace 指數(shù)和Chao1 指數(shù)進行多重比較，結果表明，兩個指數(shù)只有秋季和冬季之間存在顯著性差異（P＜0.05）。年度內養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的Shannon 指數(shù)和Simpson指數(shù)變化趨勢呈相反的趨勢，表明細菌群落多樣性變化相對穩(wěn)定，預測結果較為一致。Shannon 指數(shù)和Simpson指數(shù)為對應的“山”字狀，7月是細菌群落多樣性的最低值，且與其他月份差別較大，3月則是倒數(shù)第二低值，其他月份變化都不大（圖1）。單因素方差分析與多重比較（ANOVA）結果顯示，4 個季度Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)間無顯著性差異（P＞0.05）。

圖1 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生物群落α多樣性Figure 1 The alpha diversity of bacterial community in channel catfish pond

使用非度量多維尺度分析（NMDS）展示養(yǎng)殖池塘水樣細菌群落的β 多樣性。NMDS 分布圖（圖2A）顯示，所有樣本呈現(xiàn)出較好的季節(jié)性排列趨勢，即4個季度的樣本可以被明顯地區(qū)分，同一季度內的樣品間距離更近，其微生物群落也更加相似。同時，整個年度水體細菌群落也呈現(xiàn)出連續(xù)的演替特征，從排序圖的左側連續(xù)往右排列，只有夏季樣品的群落稍有例外，與秋季略有重疊，但整體排在右側。NMDS 分析的Stress值為0.042，也表明排序結果可靠。細菌群落層次聚類分析的結果與NMDS類似，所有群落聚為兩簇（圖2B）：夏季和秋季樣品（11 月樣品除外）聚為一簇，冬季和春季的樣品聚為另一簇。各分簇內部，每個季節(jié)的樣品也聚類為一支。

2.3 微生物群落結構

1 023 個OUT 被注釋為27 個門（Phyla）、60 個綱（Classes）和347個屬（Genera）。為了減少群落的復雜性和冗余性，相對豐度低于1%的群落都歸為稀有種，并為“Others”[16]。

養(yǎng)殖池塘水體樣本中OTU 數(shù)量從高到低呈現(xiàn)為秋季＞春季＞夏季＞冬季。4個季節(jié)樣本共享的OUT有324個，占全部OTU 的31.67%，3個季節(jié)和2個季節(jié)樣品間共享OUT分別為274個和267個，占比26.78%和26.09%。而單季樣品獨有的OUT 數(shù)量最少，只有158個，占比15.44%。其中，冬季和秋季樣品獨有OUT 最多，分別為48個和47個，占比4.69%和4.59%，夏季樣品獨有OUT最少，僅29個，占比2.83%。

圖2 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生物群落NMDS排序圖和層級聚類分析Figure 2 NMDS plot and hierarchical clustering analysis of the compositional dissimilarities of the bacterial communities

ANOSIM 檢驗表明4個季度養(yǎng)殖池塘水體樣品間細菌群落組成存在顯著性差異（P＜0.01）。然而，分析細菌群落結構組成，所有樣品在門水平上組成較為相似。相對豐度從高到低依次為：藍藻門Cyanobacteria（29%）、放線菌門Actinobacteria（25%）、變形菌門Proteobacteria（20%）和 擬 桿 菌 門 Bacteroidetes（12%），這4 個門占全部群落的86%。而疣微菌門Verrucomicrobia（3.9%）、浮 霉 菌 門Planctomycetes（3.2%）、厚壁菌門Firmicutes（2.5%）、綠菌門Chlorobi（1.8%）和綠彎菌門Chloroflexi（1.4%）相對豐度都低于4%。

門水平上，冬季水體樣品中放線菌門相對豐度最高，之后依次為變形菌門、藍藻門以及擬桿菌門。而春、夏、秋3 季的水體樣品中藍藻門相對豐度最高，之后分別為放線菌門、變形菌門和擬桿菌門。各個季度樣品內其他菌門的相對豐度都低于5%。從時間角度上看，養(yǎng)殖池塘水體中4 個主要菌門的相對豐度呈現(xiàn)出截然不同的變化趨勢（圖3）。藍藻門的相對豐度呈單峰形變化，夏季達到最高峰（37%），春秋季略有下降（30%和32%），冬季最低（17.45%）。其中，3 月和7 月水體中藍藻門相對豐度出現(xiàn)了兩次明顯的升高，分別為49.97%和56.77%。放線菌門相對含量則表現(xiàn)為增長的趨勢，從春季的20%一直增加至冬季的29%。變形菌門1 年內的相對豐度保持相對穩(wěn)定，維持在20%左右。擬桿菌門則呈U字形變化，即冬春季高（15%左右），夏秋季低（8.5%）。

4 個季度樣品間的細菌群落結構比較顯示，厚壁菌門、綠菌門和Saccharibacteria門存在顯著性差異（P＜0.05）。其中，冬春季的厚壁菌門相對數(shù)量顯著高于夏秋季，綠菌門相對數(shù)量則是夏秋季顯著高于冬春季，而秋季Saccharibacteria 門的相對數(shù)量顯著高于其他3個季節(jié)。

圖3 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生門級水平細菌群落結構的年度變動Figure 3 Annual dynamic of bacterial community composition at the phylum level

屬水平上，養(yǎng)殖池塘水體的優(yōu)勢菌屬為hgcI_clade、藍細菌屬norank_c__Cyanobacteria、聚球藻屬Syn?echococcus、CL500-29、CL500-3和多核桿菌屬Polynu?cleobacterium。聚類熱圖表明，屬水平上，所有樣品聚為冬春和夏秋兩簇（圖4）。其中，腸球菌屬Enterococ?cus、芽孢桿菌屬Bacillus、乳球菌屬Lactococcus、單胞菌屬Polaromonas、紅育菌屬Rhodoferax和黃桿菌屬Flavobacterium的相對豐度在冬春季明顯高于夏秋季。而甲基嗜酸菌屬Candidatus_Methylacidiphilum、球衣菌屬Sphaerotilus、玫瑰單胞菌屬Roseomonas、不動桿菌屬Acidibacter和湖沉積桿菌屬Limnobacter的相對豐度則是夏秋季明顯高于冬春季。

2.4 季節(jié)差異性菌群分析

圖4 養(yǎng)殖池塘水體微生物屬級水平的分層聚類熱圖Figure 4 Bacterial community heatmap analysis in genus level

4個季度樣品間的細菌群落結構比較在3個菌門發(fā)現(xiàn)了顯著性差異，在時間維度上進一步采用LefSe軟件對養(yǎng)殖水體細菌群落樣本進行線性判別分析（LDA），以找到各個季節(jié)顯著性對應的群落或物種。對LDA 判別值大于3.5 的細菌類群進行分析，共有不同分類水平的53個細菌類群，在4個季節(jié)間具有顯著差異（圖5）。春、夏和秋3 個季節(jié)的顯著優(yōu)勢種相對集中，主要分布于一兩個門。其中，春季的水體中，優(yōu)勢性菌群主要集中于厚壁菌門中的腸球菌屬Entero?coccus，以及藍藻門中的SubsectionIV。夏季水樣中，優(yōu)勢性菌群集中于變形菌門中的δ-變形菌綱Deltaproteobacteria，寡彎菌屬Oligoflexaceae，以及變形菌門中的球衣菌屬Sphaerotilus和藍藻門中的顫藻屬Oscillatoria。秋季的樣品優(yōu)勢菌群則主要集中于綠菌門中的OPB56 屬、Saccharibacteria 門，以 及 藍 藻 門 中 的 屬FamilyI和變形菌門中的紅螺菌目Rhodospirillales 與玫瑰單胞菌屬Roseomonas。冬季具有顯著優(yōu)勢菌群最多，共有2 個綱、6 個目、9 個科和10 個屬。其中，疣微菌門中的疣微菌綱Verrucomicrobiae 疣微菌科Verrucomicrobiaceae、豐佑菌綱OpitutaeVadin中的HA64屬、放線菌門中的PeM15 綱、從棒狀桿菌綱Corynebacteriales中的分枝桿菌屬Mycobaterium、厚壁菌門中的芽孢桿菌目Bacillales 芽孢桿菌屬Bacillus、鏈球菌科Streptococcaceae 乳球菌屬Lactococcus、變形菌門中的紅細菌目Rhodobacterales 到紅桿菌屬Rhodobacte?raceae、MNG 科、以及其他零星分布的普雷沃氏菌科Prevotellaceae、球形紅桿菌屬Candidatus_Aquirestis、嗜甲基菌屬Methylotenera、單胞菌屬Polaromona和Limnohabitans屬。

圖5 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘四季間差異性菌群多物種線性差異判別分析Figure 5 LEfSe identified the most differentially abundant taxa in the channel catfish pond among four seasons

2.5 細菌群落變化影響因素

與樣本菌群組成相關的環(huán)境因子很多，但其中部分因子存在共線性，所以先進行篩選，保留相互作用較小的環(huán)境因子。方差膨脹因子（Variance inflation factor，VIF）分析表明自變量間的多重共線性關系嚴重，過濾掉VIF 大于20的環(huán)境因子NO-3-N 和Chl a，多次篩選后，剩下的環(huán)境因子對應的VIF 值全部小于20。Monte Carlo 排序檢驗表明Temp、TDS、pH、NO2-N、TOC與細菌群落之間存在顯著的相關性（P＜0.05）。這5個因子對細菌群落格局的影響大小（r2）依次順序是：TDS＞Temp＞pH＞NO-2-N＞TOC（表2）。

利用前置檢驗挑選出來的5 個與細菌群落顯著相關的環(huán)境因子進行RDA 排序分析，結果表明，RDA1 軸和RDA2 軸分別解釋了細菌群落變異的44.53%和10.98%，主要菌群被聚為2 簇（圖6）。第1簇由冬季和春季樣品組成，第2 簇由夏季和秋季樣品組成，兩簇被RDA2軸分隔。其中，第1簇冬春季樣本分布比較緊密，主要受pH、TOC和TDS的影響；第2簇夏秋季樣本分布較為分散，且夏秋季樣品被RDA1 軸分 隔，主 要 受NO-2-N 和Temp 的 影 響。RDA 結 果 顯示，斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生物具有比較明顯的季節(jié)性，4個季節(jié)的樣品沿著RDA1軸從左往右排列。

3 討論

本文通過分析斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的年度變化過程，闡明斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的變化規(guī)律。研究表明，養(yǎng)殖池塘的微生物群落與營養(yǎng)鹽、水質、養(yǎng)殖對象及日常管理都具有重要的關系[3]。本研究結果表明，斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體優(yōu)勢菌群為藍藻門、放線菌門、變形菌門和擬桿菌門，與三疣梭子蟹和吉富羅非魚養(yǎng)殖塘水體較為相似，但是主要優(yōu)勢菌群的相對豐度排序略有差別[17-18]。不同養(yǎng)殖品種，甚至同一養(yǎng)殖品種的不同養(yǎng)殖階段，其養(yǎng)殖水體的微生物群落都有明顯的差別，這與養(yǎng)殖對象的棲息方式、食性特征以及養(yǎng)殖周期等差異有關[18]。斑點叉尾鮰和吉富羅非魚養(yǎng)殖過程中投餌量大，產生大量的殘餌和糞便，往往造成過量的營養(yǎng)物輸入至養(yǎng)殖池塘，同時，斑點叉尾鮰和羅非魚都是底棲性魚類，因此優(yōu)勢細菌群落較為相似。

ANOSIM 檢驗表明斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體4個季度樣品間細菌群落組成存在顯著性差異（P＜0.01），NMDS 分析（圖2A）也驗證了所有樣本呈現(xiàn)出較好的季節(jié)性排列趨勢。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體優(yōu)勢菌中，擬桿菌門相對豐度冬春季顯著高于夏秋季節(jié)，LefSe 分析進一步表明，主要差異菌群為冬季的普雷沃氏菌科Prevotellaceae、球形紅桿菌屬Candida?tus_Aquirestis。普雷沃氏菌科Prevotellaceae 能夠利用和降解蛋白質及各類有機物[19]，而斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘的總有機碳顯著高于夏秋季節(jié)，為普雷沃氏菌科細菌的繁殖提供了適合的環(huán)境。球形紅桿菌屬Candi?datus_Aquirestis廣泛分布于內陸高硬度水體，冬春季也會在自然水體中形成明顯的生物量高峰，秋冬季則維持較低的豐度[20]，與斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體的明顯季節(jié)性變化一致。

表2 環(huán)境因子對排序結果的相關性系數(shù)及顯著性檢驗值Table 2 Coefficient correlations between physicochemical parameters and RDA axis

圖6 細菌群落與環(huán)境因子之間的RDA分析Figure 6 RDA bioplot of the distribution of bacterial community and environmental variables

藍藻門作為廣泛分布于各類水體的細菌門類，其豐度狀況與水體富營養(yǎng)化程度密切相關。水產養(yǎng)殖環(huán)境中，因為營養(yǎng)鹽和有機物的密集投入，水體長期維持富營養(yǎng)化狀態(tài)，藍藻水華爆發(fā)已經變得越來越頻繁[21]。斑點叉尾鮰池塘的藍藻含量雖然沒有發(fā)現(xiàn)顯著的季節(jié)性差異，但是其相對豐度依然存在季節(jié)性的變化規(guī)律。春季3月和夏季7月斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘出現(xiàn)了兩次藍藻生物量的高峰，藍藻生物量占總細菌生物量的49.98%和56.77%，同時，3 月和7 月藍藻生物量的上升導致池塘水體細菌群落α 多樣性顯著降低。LefSe分析表明，春、夏和秋季藍藻門的顯著優(yōu)勢菌群各不相同。春季優(yōu)勢藍藻主要是念珠藻目的g__norank_f__FamilyI_o__SubsectionIV屬，大 都 呈 絲狀，形成厚壁孢子，在長換水周期、高pH、高溫和高光照強度等條件下，更具有優(yōu)勢[22]。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體沒有劇烈波動，冬春季pH 一直較高，3 月末溫度已經接近15 ℃，營養(yǎng)鹽也一直維持較高濃度，因此在3月末，藍藻迅速生長，并導致了葉綠素a濃度的上升。之后4 月藍藻大量死亡并氧化分解，消耗水體溶氧并產生乳酸等酸性物質，導致4 月池塘溶氧含量降低，pH 也略有下降。夏季優(yōu)勢的顫藻屬Oscillatoria是常見的淡水藍藻群體，呈絲狀不分枝，會節(jié)律性顫動。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體夏季顫藻屬快速生長，成為優(yōu)勢類群，并在7 月形成藍藻水華的最高峰，此時池塘水體葉綠素a 濃度也是全年最高，這個過程與開放湖庫的夏季藍藻水華演替較為相似[23]。秋季g__norank_f__FamilyI_o__SubsectionI屬的藍藻替代顫藻屬成為優(yōu)勢藍藻類群，該屬歸屬于藍藻綱Subsection I，皆為單細胞藍藻，有空泡，并合成藻膽蛋白，是湖泊、水庫等天然水體中秋季常見的水華藍藻種類[24]。

Monte Carlo 檢驗和RDA 排序分析表明斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落與環(huán)境因子間具有顯著的相關性，主要的環(huán)境因子包括TDS、Temp、pH、NO-N和TOC。5 個環(huán)境因子都表現(xiàn)出明顯的季節(jié)性差異，冬春季的TDS、pH 和TOC 顯著高于夏秋季，Temp 和NO-N 則是夏秋季顯著高于冬春季。其中，TDS 和Temp 對細菌群落的影響最大。TDS 能干擾水體的氧傳遞和降低細菌活性，從而影響硝酸鹽、有機物和COD 的去除[25]。大量的研究都表明溫度對細菌群落組成有重要影響。溫度會影響細菌降解有機物、再生營養(yǎng)以及參與微食物鏈等方面的生物學功能[26-27]，同時還對水體浮游植物的演替產生影響，改變水體微生態(tài)系統(tǒng)[28]，從而驅動細菌群落組成的改變。水溫季節(jié)性的波動造成棲息環(huán)境的季節(jié)性變化，進一步推動水體細菌群落組成呈現(xiàn)出季節(jié)性的響應[29]。此外，不同菌群對溫度的敏感差異，也會導致不同溫度下細菌群落結構的差異[30]。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘春季和夏季的水溫升高提高了藍藻門的生長速率，并給藍藻門帶來了競爭優(yōu)勢[31]，最終與其他因素共同導致斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘3月和7月的兩次藍藻爆發(fā)。

pH 被認為是生物化學地球轉換過程中重要的調控因子，它能調節(jié)水體中離子和微量金屬的利用率，從而對細菌的生長起到抑制或者促進的作用[32]。養(yǎng)殖水體光合作用的強弱對pH影響較大，因此pH會隨著光照強度和初級生產力的改變呈現(xiàn)出明顯的季節(jié)性變化。本研究中pH 冬春明顯高于夏秋，這可能與本試驗池塘水體初級生產力相對較低有關，葉綠素a濃度明顯低于草魚、烏鱧和羅非魚等品種的養(yǎng)殖池塘[33-34]。同時，夏季池塘補水量大，可能也會引起pH的降低。N 和P 一直被認為是細菌和浮游植物生長的限制性因子[35]，TOC 也被認為能夠直接影響細菌的生物量和組成，從而改變細菌群落結構[36]。然而，斑點叉尾鮰養(yǎng)殖水體一直呈人為的富營養(yǎng)化狀態(tài)，大部分的營養(yǎng)鹽（TN、NH-N、NO-N、TP 和PO-P）都沒有對細菌群落結構的塑造起到顯著性作用。而NO-N是水體中氮素存在的一個中間態(tài)，本研究池塘溶氧持續(xù)充足，整個養(yǎng)殖年度內NO-N 濃度一直維持在較低的狀態(tài)。因此，NO-N的低濃度加上夏秋高冬春低的波動，會對細菌群落如亞硝酸鹽硝化細菌等產生顯著的影響。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體的C/N[可由TOC（/NH-N+NO-N+NO-N）粗略計算]只有7～14，遠低于細菌生長的最適范圍20～30[37]，因此C（主要是TOC）是斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘細菌生長的限制因子。擬桿菌門的菌群能夠高效利用低碳物質[38]，冬春季的TOC 濃度顯著高于夏秋季節(jié)（P＜0.05，表1），因此冬春季的擬桿菌門Bacteroidetes 豐度也顯著高于夏秋季。

4 結論

本研究運用16S rDNA 擴增技術研究斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘微生物群落，結果表明斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落結構呈現(xiàn)出季節(jié)性變化，優(yōu)勢菌群為藍藻門、放線菌門、變形菌門和擬桿菌門。環(huán)境因子中，總溶解性懸浮物、水溫、酸堿度、亞硝酸鹽和總有機碳對水體細菌群落結構有顯著的影響。但是本研究局限于一個地方的斑點叉尾鮰池塘主養(yǎng)模式，而斑點叉尾鮰養(yǎng)殖已經遍布全國，因此，后續(xù)研究仍需進一步針對斑點叉尾鮰的不同養(yǎng)殖模式在不同地域開展大尺度的養(yǎng)殖池塘微生物群落結構比較，從而為不同地域不同模式的斑點叉尾鮰養(yǎng)殖管理提供精確理論指導。