張慶芳,王浚晨,于爽,劉春瑩,遲雪梅,遲乃玉
(大連大學(xué) 生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,遼寧省海洋微生物工程技術(shù)研究中心,遼寧 大連,116622)
尿酸是人體嘌呤代謝的最終產(chǎn)物,很難被排出體外,如果在體內(nèi)大量積累會引發(fā)高尿酸血癥,長期保持在高濃度將會進(jìn)一步引發(fā)通風(fēng)等疾病。隨著人們生活水平日益提高,人們?nèi)粘z入的牛肉、海鮮等高嘌呤食品也不斷增多,痛風(fēng)的患病率逐年上升。尿酸氧化酶能夠有效催化尿酸降解生成尿囊素和CO2,使之在人體內(nèi)快速降解。而人體自身無法合成尿酸酶,只能靠外界的攝入。自然來源的尿酸酶最早在牛胃中發(fā)現(xiàn)[1],隨后從微生物中發(fā)現(xiàn)的尿酸酶被陸續(xù)報道。依靠繁殖快、產(chǎn)量大等特點(diǎn),微生物很快成為尿酸酶的主要來源。
尿酸酶因其能夠快速降解尿酸的作用,很早便被用作醫(yī)藥用酶[2-4]。近年來,國內(nèi)外針對尿酸酶的應(yīng)用與研究也在不斷深入。在臨床檢測上,尿酸酶可以用來制備尿酸檢測試劑盒以供相關(guān)病患預(yù)防痛風(fēng)等疾??;在臨床治療上,尿酸酶可以直接供高尿酸患者注射,有效降低尿酸濃度;在食品生產(chǎn)方面,尿酸酶亦可以用作食品添加劑專供高尿酸患者食用。根據(jù)早年報道,尿酸酶已經(jīng)成功在乳酸菌、釀酒酵母等食用菌株中異源表達(dá)[5],對微生物發(fā)酵工業(yè)有重要意義。
人體每天排出的尿酸,2/3從尿液中排泄,另外1/3則由腸道分解消化[6]。腸道吸收尿酸由腸道菌群參與代謝調(diào)控,腸道微生態(tài)環(huán)境在人體微生態(tài)系統(tǒng)中最為龐大,其含有的細(xì)菌種類繁多[7]。痛風(fēng)患者的腸道菌群,由于受到高濃度尿酸的影響,相對于正常人存在失調(diào)現(xiàn)象,主要表現(xiàn)為產(chǎn)尿酸酶菌株增多,乳桿菌和雙歧桿菌減少[8]。本實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)從痛風(fēng)患者糞便中篩選得到產(chǎn)尿酸氧化酶細(xì)菌,并對其菌株種類進(jìn)行16S rDNA鑒定,最后對其產(chǎn)生的尿酸酶進(jìn)行酶學(xué)性質(zhì)研究,旨在針對功能性尿酸酶的開發(fā)與研究做出突破,得到高產(chǎn)尿酸氧化酶菌株,為日后尿酸酶的發(fā)酵生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 材料與試劑
選擇1名痛風(fēng)患者新鮮糞便為樣品;
尿酸、酵母膏、NaCl、MgSO4、K2HPO4、KH2PO4、瓊脂、上海生工。
1.1.2 培養(yǎng)基
初篩培養(yǎng)基(g/L):尿酸5,酵母膏0.5,NaCl 0.5,MgSO40.5,K2HPO42.0,KH2PO40.5,瓊脂20,pH 7.5;
復(fù)篩培養(yǎng)基(g/L):尿酸5,酵母膏0.5,NaCl 0.5,MgSO40.5,K2HPO42.0,KH2PO40.5,pH 7.5;
菌株保藏培養(yǎng)基(g/L):酵母膏3,蛋白胨5,NaCl 0.1,MgSO40.5,K2HPO42.0,KH2PO40.5,瓊脂20,pH 7.5。
1.1.3 儀器與設(shè)備
HZC-250雙層恒溫振蕩培養(yǎng)箱,北京佳源興業(yè)科技有限公司;WS-300恒溫培養(yǎng)箱,北京金達(dá)陽光科技有限公司;DK98-1水浴鍋,北京泰澤嘉業(yè)科技發(fā)展有限公司;KL-14105鼓風(fēng)干燥箱,上??道噬锟萍加邢薰?;HBS-1906A酶標(biāo)儀,上海研卉生物科技有限公司;YXQ-LS-75A壓力蒸汽滅菌鍋,北京佳源興業(yè)科技有限公司;Sorvall ST 8臺式離心機(jī),北京昊諾斯科技有限公司;ELITE 300電泳儀,北京銘泰佳信科技有限公司。
1.2.1 菌株初篩
準(zhǔn)備250 mL錐形瓶1個,取少量患者糞便置于瓶內(nèi),倒入100 mL無菌水振蕩混勻。隨后將混勻后的樣品進(jìn)行梯度稀釋,分別涂布于初篩培養(yǎng)基上,37 ℃倒置培養(yǎng),隨時觀察菌落形態(tài)與透明圈大小,挑選合適菌株進(jìn)行復(fù)篩。
1.2.2 菌株復(fù)篩
將初篩得到的不同菌株分別接種于100 mL復(fù)篩培養(yǎng)基中,培養(yǎng)條件設(shè)置為37 ℃,120 r/min培育36 h,隨后對菌液進(jìn)行酶活檢測,方法參考1.2.4,挑選出酶活最高的菌株。
1.2.3 菌株鑒定
1.2.3.1 形態(tài)學(xué)鑒定
將篩選得到的菌株接種于固體培養(yǎng)基(同初篩培養(yǎng)基)上,37 ℃劃線培養(yǎng)24 h,得到單菌落;標(biāo)記單菌落,并觀察其菌落形狀、大小及顏色;利用接種環(huán)挑取合適菌株,通過革蘭氏染色,在光學(xué)顯微鏡(10×100)下觀察其形狀、排列及顏色,對其分類鑒定。
1.2.3.2 分子生物學(xué)鑒定
將篩選后的菌株進(jìn)行16S rDNA基因擴(kuò)增,通過瓊脂糖凝膠電泳觀察擴(kuò)增產(chǎn)物條帶大小,并對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行基因測序,測序工作由上海生工完成;將測序結(jié)果經(jīng)NCBI數(shù)據(jù)庫,進(jìn)行BLAST比對,利用軟件MEGA5構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.2.4 酶活鑒定
1.2.4.1 制備粗酶液
將菌株置于發(fā)酵培養(yǎng)基(同復(fù)篩培養(yǎng)基)中培育36 h、37 ℃、120 r/min,取菌液12 000 r/min離心10 min,倒掉上清液,將濕菌洗滌3次以上。利用超聲波破碎,參數(shù)設(shè)定為100 mL樣品,功率300 W,破碎時間3 s,間隔時間2 s,總時間15 min。將破碎得到的產(chǎn)物12 000 r/min離心15 min,提取上清液即粗酶液。
1.2.4.2 酶活測定方法
取150 μL 4-AAP(30 mmol/L),100 μL TBHBA(1 mmol/L),50 μL過氧化物酶(15 U/mL),加入到25 mL比色管中,40 ℃預(yù)熱10 min,再加入粗酶液100 μL,600 μL硼酸鹽緩沖液(pH 8.4,0.1 mol/L),0.2 g尿酸,去離子水定容至20 mL,分裝至96孔板,在540 nm處觀察吸光度的變化[9]??瞻讓φ諡榕鹚猁}緩沖液。
酶活單位定義為37 ℃測定條件下,1 min催化產(chǎn)生1 μmol H2O2的酶量為1個酶活單位。
1.2.5 酶的分離純化
離心破碎后得到粗酶液,通過70%飽和(NH4)2SO4進(jìn)行鹽析沉淀,4 ℃條件下過夜[10],隨后經(jīng)過透析袋,轉(zhuǎn)移到10 kDa超濾管中離心超濾;將超濾后的酶液進(jìn)行Sephadex G-100 凝膠過濾層析,在每個洗脫峰處進(jìn)行收集,分別檢測樣管酶活,收集酶活連續(xù)升高至降低的所有樣管即為純化后的尿酸氧化酶;最后通過SDS-PAGE電泳檢測純化后的產(chǎn)物,觀察分析其電泳條帶,并測定酶活大小,計(jì)算純化倍數(shù)。
1.2.6 酶學(xué)性質(zhì)研究
1.2.6.1 最適作用溫度
收集一定量酶液,分別檢測10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70 ℃條件下各樣品酶活,共計(jì)3組平行實(shí)驗(yàn),最終測量結(jié)果最高值設(shè)定相對酶活為100%,計(jì)算剩余樣品比活力。
1.2.6.2 酶的最適pH
將酶液分別置于pH 2.0、3.0、4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0、11.0不同緩沖液中,檢測各樣品酶活,共計(jì)3組平行實(shí)驗(yàn),最終測量結(jié)果最高值相對酶活設(shè)為100%,計(jì)算剩余樣品比活力。
1.2.6.3 酶的熱穩(wěn)定性
將酶液分別置于20、30、40、50、60、70 ℃水浴鍋中保溫1 h,在37 ℃檢測各樣品殘留酶活,共計(jì)3組平行實(shí)驗(yàn),取最終測量結(jié)果最高值相對酶活設(shè)為100%,計(jì)算剩余樣品比活力。
1.2.6.4 pH對酶穩(wěn)定性的影響
將酶液分別置于pH 2.0~11.0(條件同1.2.6.2)緩沖液中,37 ℃保溫1 h,檢測各樣品殘留酶活,共計(jì)3組平行實(shí)驗(yàn),取最終測量最高值相對酶活設(shè)為100%,計(jì)算剩余樣品比活力。
1.2.6.5 金屬離子對酶活的影響
在酶最適作用條件下,分別向酶液中加入Fe2+、Ca2+、K+、Mg2+、Cu2+、Zn2+、Mn2+等不同金屬離子緩沖液[11],濃度設(shè)為5 mmol/L,測定不同金屬離子對酶活的影響,共計(jì)3組平行實(shí)驗(yàn)。
從5種產(chǎn)尿酸氧化酶菌株中篩選出1株酶活最高的菌株,參照1.2.4.2在37 ℃下檢測其酶活達(dá)到15.18 U/mg,命名為JC-5。
2.2.1 形態(tài)學(xué)鑒定
如圖1所示,菌落產(chǎn)生較大透明圈,呈白色圓形,邊緣規(guī)則,表面光滑,未產(chǎn)生孢子,革蘭氏染色呈紅色,鑒定為革蘭氏陰性菌。
A菌落形態(tài);B-革蘭氏染色圖1 JC-5菌落形態(tài)及革蘭氏染色Fig.1 JC-5 colony morphology and gram staining
2.2.2 分子生物學(xué)鑒定
將擴(kuò)增出的16S rDNA基因片段進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果如圖2所示,在1 500 bp左右有明顯條帶。
M-Marker;1-16S rDNA圖2 菌株JC-5 16S rDNA瓊脂糖凝膠電泳Fig.2 Strain JC-5 16S rDNA agarose gel electrophoresis
隨后對基因序列進(jìn)行測序,測序工作由上海生工完成,測序后得到的基因大小為1 493 bp,與電泳結(jié)果一致。將測序得到的16S rDNA基因序列在GenBank基因庫中進(jìn)行BLAST比對,選擇同源性在99%以上的菌株及不同屬、種間相似度最高菌株基因序列,利用MEGA5構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果如圖3所示,菌株JC-5與彭氏變形桿菌Proteuspenneristrain 2203同源性最高,鑒定并命名為彭氏變形桿菌ProteuspenneriJC-5。
圖3 菌株JC-5 16S rDNA基因序列系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3 Phylogenetic tree of strain JC-5 16S rDNA gene sequence
分離純化結(jié)果如圖4所示,提取部分粗酶液,加入70%飽和(NH4)2SO4過夜鹽析后,進(jìn)行透析超濾,再經(jīng)過SDS-PAGE電泳得到明顯蛋白條帶。隨后利用Sephadex G-100 凝膠過濾層析,在293 nm處檢測吸光度變化,并檢測吸收峰處的酶活,在25管檢測到酶活,表示目的蛋白開始被洗脫下來,32管酶活達(dá)到最高,41管檢測不到酶活,表明已被完全洗脫,收集此吸收峰內(nèi)的產(chǎn)物即為純化后的尿酸氧化酶。對得到的純化產(chǎn)物進(jìn)行SDS-PAGE電泳,結(jié)果如圖5所示,25~32管所收集的樣品在35 kDa左右有明顯條帶,33~40管開始出現(xiàn)雜條帶,推測其分子質(zhì)量約為35 kDa。對純化后的樣品進(jìn)行酶活檢測,酶總活力為51.48 U,詳細(xì)結(jié)果參照表1,酶比活為66 U/mg,純化倍數(shù)達(dá)到3.6。
M-Marker;1-粗酶液;2-粗酶液 (4 ℃過夜);3-超濾圖4 粗酶液鹽析-SDS-PAGE電泳Fig.4 Crude enzyme solution salting out-SDS-PAGE electrophoresis
M-Marker;1-Sephadex G-100凝膠過濾層析(25~32管);2-33~40管圖5 凝膠過濾層析-SDS-PAGE電泳Fig.5 Gel filtration chromatography-SDS-PAGE electrophoresis
表1 粗酶液分離純化結(jié)果Table 1 Crude enzyme solution separation and purification results
2.4.1 酶最適作用溫度及熱穩(wěn)定性
對酶最適溫度的檢測結(jié)果如圖6所示,在35 ℃酶活達(dá)到最大,相對酶活定為100%,25~30 ℃時,相對酶活保持在80%左右,20 ℃酶活仍維持在50%,40 ℃開始酶活迅速下降,50 ℃相對酶活降至20%,60 ℃失活。針對該酶熱穩(wěn)定性的檢測,由圖7可知,在30 ℃處理1 h后該酶保持一定酶活且相對穩(wěn)定,在20 ℃處理1 h后仍有75%相對酶活,50 ℃處理1 h后相對酶活僅有6.2%,表明該酶熱穩(wěn)定性較差。
圖6 酶最適作用溫度曲線Fig.6 Enzyme optimum temperature curve
圖7 酶的熱穩(wěn)定性Fig.7 Thermal stability of the enzyme
2.4.2 酶的最適pH及穩(wěn)定性
將酶置于pH 2.0~11.0的緩沖液中檢測其酶活,結(jié)果如圖8所示,在pH 8.0時酶活最大,相對酶活設(shè)為100%,隨著pH降低或升高,酶活緩慢下降,堿性環(huán)境pH 9.0~10.0條件下,相對酶活在80%左右,pH 11.0時相對酶活為68%;在酸性環(huán)境中pH 4.0~6.0時,該酶相對酶活在70%左右,pH 2.0時仍有21%的相對酶活。針對其耐酸堿穩(wěn)定性研究結(jié)果如圖9所示,pH 8.0時檢測值最大,相對酶活設(shè)為100%,在pH 4.0~6.0時,相對酶活維持在50%以上,表明該酶具有一定的耐酸性,pH 7.0~9.0時相對酶活保持在80%以上,pH 11.0時的相對酶活降至20%,表明該酶在弱堿性條件下更利于保存。
圖8 酶的最適pH曲線Fig.8 Optimal pH curve of enzyme
圖9 不同pH對酶穩(wěn)定性影響Fig.9 Effect of different pH on enzyme stability
2.4.3 金屬離子對酶活性的影響
結(jié)果如表2所示,Ca2+與Mn2+對酶有激活作用,Ca2+的激活作用較強(qiáng),處理后的相對酶活達(dá)到132%,F(xiàn)e2+、K+、Mg2+、Cu2+、Zn2+對酶活都有一定的抑制作用,F(xiàn)e2+使酶活性降低50%。
表2 不同金屬離子對酶活的影響Table 2 Effects of different metal ions on enzyme activity
本實(shí)驗(yàn)從痛風(fēng)病人腸道內(nèi)篩選得到1株優(yōu)產(chǎn)尿酸氧化酶菌株,命名為JC-5,通過16S rDNA測序,鑒定為彭氏變形桿菌。通過鹽析、G-100 凝膠過濾層析等步驟分離純化,該菌所產(chǎn)尿酸酶最終酶活達(dá)到66 U/mg。通過對其酶學(xué)性質(zhì)研究,確認(rèn)該酶最適作用溫度為35 ℃,并在30~40 ℃保持一定熱穩(wěn)定性。該酶最適pH為8.0,在pH 7.0~9.0穩(wěn)定性強(qiáng)。Ca2+與Mn2+對該酶有一定激活作用,F(xiàn)e2+對酶抑制作用較強(qiáng),與豬的腸道菌群所產(chǎn)酶的作用結(jié)果相似[12]。該酶在常溫狀態(tài)下熱穩(wěn)定性一般,在保藏與運(yùn)輸方面存在不足,未來可對其產(chǎn)酶基因進(jìn)行修飾,用于工業(yè)化生產(chǎn)[13]。
變形桿菌主要存在于人體及動物的腸道內(nèi),以奇異變形桿菌(P.mirabilis)最為常見,而后是普通變形桿菌(P.vulgaris),彭氏變形桿菌(P.penneri)和摩爾根變形桿菌(P.morganii)相對較為少見[14]。奇異變形桿菌是引起人類食物中毒的主要菌株,一些還會造成泌尿感染、結(jié)石等疾病[15]。彭氏變形桿菌較為少見,一般在醫(yī)院環(huán)境及患者身上篩選得到[16],與銅綠假單胞菌具有高度相似性(86%)。最早在1988年有報道表明,同其他變形桿菌一樣,該菌株也能催化尿素形成CO2和氨,影響尿液的pH變化導(dǎo)致尿道結(jié)石等疾病[17]。除了能夠產(chǎn)生尿素酶催化尿素反應(yīng)外,變形桿菌在體內(nèi)也可以產(chǎn)生大量尿酸酶用于降解尿酸,其在尿毒癥患者體內(nèi)降解尿酸的能力僅次于大腸桿菌[18]。
本實(shí)驗(yàn)從痛風(fēng)患者糞便中篩選得到的產(chǎn)尿酸酶菌株通過系統(tǒng)發(fā)育樹鑒定為彭氏變形桿菌(P.penneri),相對于其他種類變形桿菌,P.penneri可隨呼吸道侵染人體或動物,進(jìn)入食道及腸道,當(dāng)?shù)挚沽ο陆禃r容易被感染。該菌株帶有一定的致病性,將來實(shí)驗(yàn)可以對該產(chǎn)酶菌株的生長、發(fā)酵特性及毒理學(xué)進(jìn)行研究;也可以將該菌株進(jìn)行誘變育種,提取其產(chǎn)酶目的基因進(jìn)行進(jìn)行基因克隆工業(yè)化生產(chǎn)。
目前國內(nèi)外少有關(guān)于尿酸酶熱穩(wěn)定性的報道[19-20],本實(shí)驗(yàn)篩選菌株所產(chǎn)尿酸酶,最適溫度處于人體體溫范圍,適合用于痛風(fēng)病人的臨床診斷與注射治療[21, 5];在人體弱堿性環(huán)境中能夠有效降解尿酸,未來在醫(yī)藥用酶的開發(fā)方面亦有著很大發(fā)展前景[22]。但其在低溫環(huán)境下穩(wěn)定性較差,不利于保存。張慶芳等[23]篩選的海洋來源菌株Z7所產(chǎn)低溫尿酸酶可以在20 ℃仍保持較好穩(wěn)定性,將來可以更多地篩選生長在嚴(yán)苛環(huán)境下的產(chǎn)尿酸氧化酶菌株,針對其耐寒性、耐熱性及抗酸堿性作出研究;另一方面,將來可以對兩種產(chǎn)酶基因進(jìn)行修飾,起到功能互補(bǔ)的作用。