黃秀芳,劉城鑫,黃慧婷,徐衛(wèi)方,劉 瓊,劉小虹?
(1.廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,廣東 廣州 510405;2.廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院,廣東 廣州 510405;3.廣州中醫(yī)藥大學(xué)深圳醫(yī)院,廣東 深圳 518000)
哮喘是世界上最常見(jiàn)的慢性呼吸道疾病,隨著吸煙和過(guò)敏率的增加,以及空氣污染和人口老齡化,其發(fā)病率逐年上升,在1%~21% 之間[1],除了常見(jiàn)的臨床表現(xiàn)(如喘息、呼吸短促、胸悶和咳嗽等)外,還可引起呼吸衰竭、心血管疾病、腎臟疾病、猝死等并發(fā)癥,不僅危害人類健康,還增加經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。其發(fā)病機(jī)制復(fù)雜[2],現(xiàn)公認(rèn)的包括慢性氣道炎癥、氣道高反應(yīng)性、可逆性氣道限制、氣道免疫炎癥和神經(jīng)調(diào)節(jié)導(dǎo)致的氣道重塑[3]。臨床常用藥物有支氣管擴(kuò)張劑和吸入性皮質(zhì)類固醇,然而其副作用和患者耐受性使長(zhǎng)期治療受到限制[4],因此,開(kāi)發(fā)天然的中草藥可為相關(guān)研究提供新的思考方向。
射干-麻黃來(lái)自《金匱要略》 中的射干麻黃湯,射干味苦,性寒,具有止咳化痰的功效;麻黃性溫,味辛、微苦,有宣肺平喘的功效,兩者配伍,共同發(fā)揮宣肺平喘、止咳化痰作用。現(xiàn)代藥理研究表明,射干具有抗炎、抗腫瘤、抗氧化、清除自由基、雌性激素樣等作用[5],而麻黃則具有松弛支氣管平滑肌、免疫抑制、抗氧化、鎮(zhèn)咳平喘等作用,配伍后治療哮喘的前景廣闊[6]。劉小虹教授從事肺系疾病治療30 余年,對(duì)哮喘有獨(dú)特的醫(yī)治心得,本研究收集她于廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院嶺南名醫(yī)診區(qū)坐診時(shí)的哮喘病歷資料,以古今醫(yī)案云平臺(tái)(V1.5.7)分析使用頻次最高的藥對(duì),并對(duì)其機(jī)制進(jìn)行初步研究。
1.1 處方來(lái)源 收集2017 年12 月至2019 年1 月劉小虹教授于廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院嶺南名醫(yī)診區(qū)坐診時(shí)的病歷資料,均涉及支氣管哮喘。
1.2 處方納入與排除標(biāo)準(zhǔn) 納入標(biāo)準(zhǔn)①診斷符合中華醫(yī)學(xué)會(huì)呼吸病學(xué)分會(huì)哮喘醫(yī)學(xué)組制定的《支氣管哮喘防治指南(2016 版)》,并排除其他疾病所引起的喘息、氣急、胸悶及咳嗽;②病歷記載詳細(xì)、完整、準(zhǔn)確,包括患者年齡、診次、病史、癥狀、診斷、方藥等;③有不少于1 次的復(fù)診記錄,并且治療后患者主觀癥狀或客觀指標(biāo)改善。排除標(biāo)準(zhǔn)①不符合支氣管哮喘診斷標(biāo)準(zhǔn),或確診引起肺功能改變的其他疾病,如慢阻肺、肺結(jié)核、急性呼吸窘迫綜合征、肺炎等,以及近期有手術(shù)、外傷等影響呼吸功能的;②病案中關(guān)鍵信息(如主訴、現(xiàn)病史、刻下癥、證候診斷、方藥等)記錄不完整;③2 次就診記錄之間,在其他醫(yī)院門診已開(kāi)具處方治療;④合并其他心、腦、腎等危重疾病。
1.3 數(shù)據(jù)規(guī)范化與錄入 60 首門診處方參照《中藥學(xué)》[7]規(guī)范統(tǒng)一藥物名稱,如蛤殼=海蛤殼、甘草片=甘草、姜厚樸=厚樸、甘草泡地龍=地龍、冬瓜子=冬瓜仁等。由2 位研究者分別將門診病歷錄入Microsoft Excel 中,經(jīng)第3 位研究者進(jìn)行審核,并按照標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行規(guī)范化處理,最后統(tǒng)一導(dǎo)入古今醫(yī)案云平臺(tái)中,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析挖掘。
1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析 導(dǎo)入古今醫(yī)案云平臺(tái)后,執(zhí)行數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化選項(xiàng),并將結(jié)果批量加入分析池,執(zhí)行藥頻統(tǒng)計(jì)、用藥規(guī)律分析等功能。
1.5 射干-麻黃活性組分與對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的篩選 射干-麻黃的活性化合物來(lái)源于TCMSP(http://ibts.hkbu.edu.hk/LSP/tcmsp.php),含有大量中草藥的化學(xué)成分和藥物的動(dòng)力學(xué)特性信息。其中,口服生物利用度(oral bioavailability,OB)代表藥物散布于體循環(huán)的效率,類藥性(drug-likeness,DL)則代表優(yōu)化的藥代動(dòng)力學(xué)和藥物性質(zhì)。本研究選擇OB≥30%、DL≥0.18,并結(jié)合已報(bào)道的麻黃與射干中含有量較高的活性成分,得出射干-麻黃藥對(duì)有效化合物[5,8],并借助TCMSP 篩選出相關(guān)靶點(diǎn),輸入U(xiǎn)niProt 數(shù)據(jù)庫(kù),限定物種為“human”,獲得蛋白靶點(diǎn)的對(duì)應(yīng)的基因信息,將化合物-靶點(diǎn)的數(shù)據(jù)集導(dǎo)入Cytoscape3.7.1 軟件進(jìn)行可視化。
1.6 與哮喘有關(guān)的靶點(diǎn)篩選 哮喘有關(guān)靶點(diǎn)的數(shù)據(jù)來(lái)自2 個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù):(1)Drugbank 數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.drugbank.ca/),可獲取與哮喘相關(guān)的靶點(diǎn)[9];(2)TTD(http://systemsdock.unit.osit.jp/iddp/home/index),包含有關(guān)治療性蛋白質(zhì)的基因靶點(diǎn)、相關(guān)疾病、途徑和相應(yīng)藥物。從中獲得與哮喘相關(guān)的靶點(diǎn),輸入U(xiǎn)niProt 數(shù)據(jù)庫(kù),限定物種為“human”,獲得蛋白靶點(diǎn)的對(duì)應(yīng)的基因信息,將哮喘-靶點(diǎn)的數(shù)據(jù)集導(dǎo)入Cytoscape 3.7.1 軟件進(jìn)行可視化[9]。
1.7 核心靶點(diǎn)的篩選與蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)的構(gòu)建 將射干-麻黃藥對(duì)的靶點(diǎn)和與哮喘有關(guān)的靶點(diǎn)上傳至在線Draw Venn Diagram(bioinformatics.psb.ugent.be/Webtools/Venn/),
得到兩者的交集核心靶點(diǎn),輸入String 11.0 數(shù)據(jù)庫(kù)(https://string-db.org/),得到互作關(guān)系,以Combined score>0.4 為篩查標(biāo)準(zhǔn)[10]。
1.8 核心靶點(diǎn)的GO 分析 Metascape 可幫助生物醫(yī)學(xué)研究界分析基因/蛋白質(zhì)列表,作出更好的數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)決策。將核心靶點(diǎn)輸入Metascape 進(jìn)行GO分析,即可獲得核心靶點(diǎn)的GO 信息,參數(shù)設(shè)置為H species(1)[11]。
1.9 核心靶點(diǎn)的KEGG 通過(guò)David 6.8 數(shù)據(jù)庫(kù)(https://david.ncifcrf.gov/home.jsp)對(duì)核心靶點(diǎn) 行 KEGG 通路分析,參數(shù)設(shè)置為“ homo sapiens”,限定只展示P<0.05 的KEGG 結(jié)果[12]。
2.1 治療哮喘藥物頻次統(tǒng)計(jì) 共錄入60 首門診處方,核心藥物是射干、麻黃、紫蘇葉、浙貝母、杏仁、甘草、防風(fēng)、款冬花、法半夏、紫蘇子、紫菀等,其中射干、麻黃出現(xiàn)頻次最高,均為60 次,說(shuō)明兩者在治療哮喘中具有重要意義。見(jiàn)圖1。
圖1 治療哮喘核心藥物頻次Fig.1 Frequency of core drugs for asthmatic treatment
2.2 核心藥物關(guān)聯(lián)規(guī)則 采用Apriori 算法,支持度越高時(shí),越能體現(xiàn)其核心規(guī)律。置信度表示當(dāng)“->”左邊的藥物出現(xiàn)時(shí),“->”右邊藥物出現(xiàn)的概率,其中射干、麻黃支持度、置信度均為1,表示處方中出現(xiàn)其中一者時(shí),另一者出現(xiàn)的可能性是100%。其他藥物見(jiàn)表1。
2.3 治療哮喘藥物頻次統(tǒng)計(jì) 通過(guò)TCMSP 篩選得出射干-麻黃有效化合物共有42 個(gè),18 個(gè)來(lái)自射干,24 個(gè)來(lái)自麻黃,將其合并后刪除重復(fù)項(xiàng),剩余40 個(gè),見(jiàn)表2。
2.4 射干-麻黃-靶點(diǎn)相互作用網(wǎng)絡(luò) 射干-麻黃靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)共包括762 個(gè)節(jié)點(diǎn),包括40 個(gè)化合物節(jié)點(diǎn)、722 個(gè)靶點(diǎn)節(jié)點(diǎn),并含有1 524 條互相作用的邊,表示所含化合物與相互作用之間的關(guān)系;節(jié)點(diǎn)的度值表示邊或目標(biāo)的數(shù)量,度值越高的化合物或靶點(diǎn),在網(wǎng)絡(luò)中可能是越關(guān)鍵的樞紐。射干-麻黃存在1 個(gè)化合物與多個(gè)靶點(diǎn)的互相作用,也存在不同化合物作用于同1 個(gè)靶點(diǎn),本研究確定了9 個(gè)節(jié)點(diǎn)度值≥22 度的化合物、6 個(gè)節(jié)點(diǎn)度值≥10 度的靶點(diǎn)。具體而言,槲皮素、木犀草素、豆甾醇、山柰酚、環(huán)鳶尾醛型三萜、柚皮素、β-谷甾醇、麻黃堿分別作用于146、112、62、58、36、36、36、24個(gè)靶點(diǎn),可能是射干-麻黃重要的生物活性成分;PTGS2、PTGS1、HSP90AB1、NCOA2、AR、PIK3CG 分別與30、26、24、19、12、11 個(gè)化合物間有聯(lián)系,可能是其發(fā)揮藥性的重要基礎(chǔ)。見(jiàn)圖2。
表1 治療哮喘核心藥物間置信度Tab.1 Contradictions between core drugs for asthmatic treatment
表2 射干-麻黃中40 個(gè)有效化合物Tab.2 Forty effective compounds in Belamcandae Rhizoma-Ephedrae Herba
圖2 射干-麻黃-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖Fig.2 Network diagram for Belamcandae Rhizoma-Ephedrae Herba
2.5 哮喘-靶點(diǎn)相互作用網(wǎng)絡(luò) 通過(guò)Drugbank、TTD數(shù)據(jù)庫(kù)得出與哮喘相關(guān)的88 個(gè)作用靶點(diǎn),導(dǎo)入Cytoscape3.7.1 軟件進(jìn)行可視化,與哮喘相關(guān)的包括NPSR1、CYSLTR1、MYLK、ADORA2A、ADORA2B、ADRA2C、ALOX5、SERPINC1、NPR1、ADRB2、BDKRB2 等。見(jiàn)圖3。
圖3 哮喘-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖Fig.3 Target network diagram for asthma-targets
2.6 射干-麻黃與哮喘的核心靶點(diǎn)的構(gòu)建 通過(guò)TCMSP 數(shù)據(jù)庫(kù)得出射干-麻黃有效化合物對(duì)應(yīng)的靶點(diǎn),刪除重復(fù)的后共有256 個(gè),通過(guò)Drugbank、TTD 數(shù)據(jù)庫(kù)獲得與哮喘相關(guān)的基因88 個(gè),在線軟件進(jìn)行交集分析后發(fā)現(xiàn)15 個(gè),包括PTGER3、CHRM4、ADRA2C、SERPINE1、NOS2、ALOX5、PTGS2、ERBB2、IL-4、PDE3A、ADRB2、CCL2、CHRM2、CHRNA7、OPRM1,見(jiàn)圖4。將射干-麻黃與哮喘核心靶點(diǎn)導(dǎo)入String 11.0 進(jìn)行分析,其中節(jié)點(diǎn)表示靶點(diǎn)蛋白,邊則代表靶點(diǎn)蛋白與靶點(diǎn)蛋白相互作用的關(guān)系,PPI 提示該網(wǎng)絡(luò)含有15 個(gè)節(jié)點(diǎn)、33 條邊,節(jié)點(diǎn)度的平均值為4.4,見(jiàn)圖5。
圖4 射干-麻黃-靶點(diǎn)與哮喘-靶點(diǎn)的韋恩圖Fig.4 Venn diagram for Belamcandae Rhizoma-Ephedrae Herba-target and asthma-target
圖5 射干-麻黃與哮喘核心靶點(diǎn)的PPI 網(wǎng)絡(luò)圖Fig.5 PPI network diagram for core targets for Belamcandae Rhizoma-Ephedrae Herba and asthma
2.7 射干-麻黃與哮喘核心靶點(diǎn)的GO 分析 圖6提示,射干-麻黃與哮喘核心靶點(diǎn)主要涉及的生物學(xué)功能包括白細(xì)胞介素-4 和白細(xì)胞介素-13 信號(hào)傳導(dǎo)、G 蛋白偶聯(lián)受體信號(hào)通路,以及環(huán)核苷酸第二信使偶聯(lián)、鈣信號(hào)通路、平滑肌收縮、信號(hào)受體活性的調(diào)節(jié)、cAMP 介導(dǎo)的信號(hào)傳導(dǎo)、發(fā)熱、對(duì)脂多糖的反應(yīng)、調(diào)節(jié)內(nèi)皮細(xì)胞凋亡過(guò)程、蛋白激酶活性的正調(diào)節(jié)、血管生成、癌癥的途徑等。
圖6 射干-麻黃與哮喘核心靶點(diǎn)的GO 分析Fig.6 GO analysis of core targets for Belamcandae Rhizoma-Ephedrae Herba and asthma
2.8 射干-麻黃與哮喘核心靶點(diǎn)的KEGG 分析 表3 提示,射干-麻黃藥對(duì)與哮喘核心靶點(diǎn)主要涉及的通路包括鈣信號(hào)通路、神經(jīng)活性配體-受體相互作用、調(diào)節(jié)脂肪細(xì)胞中的脂肪分解、cAMP 信號(hào)通路、HIF-1 信號(hào)通路、膽堿能突觸、癌癥的途徑、cGMP-PKG 信號(hào)通路。
哮喘是一種常見(jiàn)的復(fù)雜呼吸系統(tǒng)疾病,中藥不僅控制其癥狀,還可提高患者日常生活質(zhì)量,減少急性發(fā)作的次數(shù)[9]。射干-麻黃來(lái)源于《金匱要略》,其中射干具有抗炎、鎮(zhèn)痛、祛痰、平喘、抑菌、抗病毒、抗腫瘤的作用,以及雌性激素樣與增強(qiáng)體液免疫活性,臨床主要用于治療支氣管哮喘,支氣管炎,慢性阻塞性肺疾病等肺系疾?。?3-14];麻黃主要具有解熱發(fā)汗、鎮(zhèn)咳平喘、利尿、免疫抗炎、抗菌、抗病原微生物、鎮(zhèn)痛、抗腫瘤等作用,臨床主要用于治療感冒、支氣管哮喘、腎炎等[5,15]。本研究通過(guò)收集劉小虹教授治療哮喘的驗(yàn)案,并使用古今醫(yī)案云平臺(tái)進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘,進(jìn)一步證明了射干-麻黃是治療哮喘的常用藥對(duì)。
射干-麻黃藥對(duì)具有40 個(gè)有效化合物,作用于722 個(gè)靶點(diǎn)節(jié)點(diǎn),其中作用最強(qiáng)的前8 個(gè)包括槲皮素、木犀草素、豆甾醇、柚皮素、β-谷甾醇、麻黃堿等。槲皮素可明顯減輕大鼠哮喘癥狀和IL-5、IL-6 水平,并能降低血中嗜酸粒細(xì)胞及IgE 水平,升高IFN-γ 水平,還可下調(diào)哮喘模型鼠氣道上皮TLR4/NF-κB 表達(dá),減輕氣道炎癥[16-18];木犀草素可能通過(guò)調(diào)控PPARγ 表達(dá)和p38MAPK 信號(hào)通路而抑制哮喘大鼠氣道炎癥,從而起到抑制平滑肌重塑的作用,還可降低哮喘模型大鼠血清中IL-4 水平,升高IFN-γ 水平[19-20];豆甾醇可減少哮喘模型豚鼠細(xì)支氣管周圍、血管周圍和肺泡炎性細(xì)胞的浸潤(rùn),并可逆轉(zhuǎn)膠原沉積[21];柚皮素可緩解哮喘模型小鼠氣道的慢性炎癥,還可降低支氣管肺泡灌洗液中Th2 水平和血清中IgE 水平,同時(shí)延緩氣道重塑的進(jìn)展[22];β-谷甾醇抑制哮喘模型豚鼠TNFα、IL-4、IL-5 水平,可預(yù)防肺組織組織病理學(xué)中的氣道炎癥,抑制Th2 細(xì)胞因子的釋放/合成[23];麻黃堿具有松弛支氣管平滑肌、抗氧化、抗病毒、抗癌、鎮(zhèn)咳平喘的作用,還可降低iNOS 水平,減輕 哮喘模型小鼠的癥狀[6,24];化合物-靶點(diǎn)中PTGS2、PTGS1 即是COX2、COX1,山柰酚可通過(guò)抑制COX2 介導(dǎo)的致敏肥大細(xì)胞中前列腺素D2 產(chǎn)生來(lái)抑制哮喘小鼠的氣道壁增厚[25]。氟替卡松、布地奈德和曲安西龍均可顯著降低COX2 與COX1表達(dá),從而起到治療哮喘的作用[26]。HSP90AB1參與調(diào)節(jié)蛋白結(jié)構(gòu)和特定靶蛋白,涉及細(xì)胞周期控制和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和調(diào)節(jié)與ATP 酶活性相關(guān)的功能循環(huán),與腫瘤的發(fā)生發(fā)展具有密切的關(guān)系[27]。AR 缺陷的肺泡巨噬細(xì)胞,會(huì)導(dǎo)致嗜酸性粒細(xì)胞募集趨化因子和IL-5 減少,揭示它促進(jìn)M2 巨噬細(xì)胞極化的新穎作用[28]。NCOA2 與PIK3CG 均與脂質(zhì)代謝相關(guān),其中NCOA2 還與腫瘤增殖、轉(zhuǎn)移和侵襲相關(guān)[29-31]。射干與麻黃均具有抗腫瘤的作用,GO、KEGG 分析都提示兩者具有調(diào)節(jié)脂質(zhì)代謝和能量代謝的功能,這可能是它們發(fā)揮抗腫瘤、調(diào)節(jié)脂質(zhì)、熱量代謝的潛在物質(zhì)基礎(chǔ)。射干-麻黃治療哮喘是多途徑的協(xié)同增效作用,如調(diào)節(jié)炎性因子NOS2、PTGS2、IL-4;PTGER3 是前列腺素E2 鑒定的4 種受體之一,其基因多態(tài)性在阿司匹林哮喘的發(fā)病機(jī)制中起重要作用[32]。SERPINE1 是一種糖蛋白,可促進(jìn)氣道纖維化,可能在慢性哮喘氣道炎癥的背景下導(dǎo)致氣道阻塞[33]。研究表明,ALOX5 與基因多態(tài)性之間存在遺傳關(guān)聯(lián),可以作為阿司匹林哮喘治療反應(yīng)的診斷標(biāo)志物或預(yù)測(cè)因子[34]。上皮生長(zhǎng)因子(EGF)家族成員在上皮細(xì)胞分化,增殖和修復(fù)中起重要作用,據(jù)報(bào)道哮喘患者中ERBB2 表達(dá)較低,限制了上皮修復(fù)過(guò)程,故恢復(fù)其穩(wěn)態(tài)功能應(yīng)被視為新的哮喘治療靶點(diǎn)[35]。異丁司特在日本被廣泛用于治療哮喘,其作用方式是通過(guò)抑制環(huán)核苷酸磷酸二酯酶(PDEs),但其優(yōu)先抑制PDE3A,可能成為治療哮喘的新途徑[36]。ADRB2 基因中的Glu27 變體與哮喘急性發(fā)作的頻率增加相關(guān),CHRM2 多態(tài)性與哮喘的遺傳病因?qū)W有關(guān),CCL2 哮喘介導(dǎo)趨化性,在哮喘模型鼠中的水平明顯增高[37-39],這說(shuō)明所得核心靶點(diǎn)大部分與哮喘發(fā)生有關(guān),可能是射干-麻黃發(fā)揮治療哮喘的潛在靶點(diǎn)。
表3 射干-麻黃與哮喘核心靶點(diǎn)的KEGG 分析Tab.3 KEGG analysis of core targets for Belamcandae Rhizoma-Ephedrae Herba and asthma
從GO、KEGG 富集分析可知,核心靶點(diǎn)主要富集于白細(xì)胞介素-4 和白細(xì)胞介素-13 信號(hào)傳導(dǎo)、鈣信號(hào)通路、平滑肌收縮、cAMP 介導(dǎo)的信號(hào)傳導(dǎo)、對(duì)脂多糖的反應(yīng)、蛋白激酶活性的正調(diào)節(jié)、癌癥的途徑、HIF-1 信號(hào)通路、膽堿能突觸、cGMPPKG 信號(hào)通路等,其中與哮喘最相關(guān)的包括鈣信號(hào)通路、神經(jīng)活性配體-受體相互作用、cAMP 信號(hào)通路、HIF-1 信號(hào)通路、白細(xì)胞介素-4 和白細(xì)胞介素-13 信號(hào)信號(hào)傳導(dǎo)、膽堿能突觸、cGMP-PKG;調(diào)節(jié)熱量或脂質(zhì)代謝有可能是射干-麻黃潛在的藥理作用,對(duì)心血管系統(tǒng)有一定的干預(yù)作用,而涉及的癌癥途徑更是證明了兩者具有抗腫瘤活性,與先前研究一致,也印證了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的準(zhǔn)確性。