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    基于網(wǎng)絡(luò)藥理學探討桃紅四物湯治療骨質(zhì)疏松癥的主要活性成分及藥理作用機制

    2020-04-14 03:37:08樊梅馬武開蘭維婭
    風濕病與關(guān)節(jié)炎 2020年12期
    關(guān)鍵詞:桃紅四物湯活性成分網(wǎng)絡(luò)藥理學

    樊梅 唐 芳 馬武開 蘭維婭

    【摘 要】目的:從網(wǎng)絡(luò)藥理學角度研究桃紅四物湯治療骨質(zhì)疏松癥的主要活性成分及多維藥理作用機制。方法:從中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫和分析平臺中提取桃紅四物湯的化學成分,以口服生物利用度OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18篩選活性成分,通過該數(shù)據(jù)庫提取活性成分作用靶點,以GeneCards和OMIM在線分析平臺挖掘靶點相關(guān)疾病,采用Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建活性成分?作用靶點網(wǎng)絡(luò),String10.0構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò),最后通過基因本體(GO)和基因組百科全書(KEGG)富集分析桃紅四物湯治療骨質(zhì)疏松癥的藥理作用機制。結(jié)果:共篩選得到桃紅四物湯69個活性成分,涉及5346個作用靶點,主要涉及破骨細胞分化,激素,相關(guān)炎癥因子,甲狀旁腺激素的合成、分泌及作用等生物過程,通過調(diào)節(jié)白細胞介素-17、輔助性T細胞17、T細胞受體、Toll樣受體、雌激素、絲裂原活化蛋白激酶、PI3K-Akt、甲狀腺激素、FoxO、Wnt等信號通路發(fā)揮治療骨質(zhì)疏松癥的作用。結(jié)論:本研究體現(xiàn)了桃紅四物湯多成分?多靶點?多途徑的作用特點,為進一步開展桃紅四物湯治療骨質(zhì)疏松癥作用機制的研究提供了新的思路與方法。

    【關(guān)鍵詞】 骨質(zhì)疏松癥;網(wǎng)絡(luò)藥理學;桃紅四物湯;活性成分;作用機制

    骨質(zhì)疏松癥(osteoporosis,OP)是一種全身性骨骼疾病,表現(xiàn)為骨組織微結(jié)構(gòu)退行性變和低骨量,引起骨的脆性和骨折的敏感性增加。各年齡段骨質(zhì)疏松性骨折的發(fā)病率都在增加,女性患骨折的風險是男性的2倍。隨著我國社會進入人口老齡化階段,本病的發(fā)病率將持續(xù)升高[1]。OP主要以雙膦酸鹽類作為一線治療藥物,其次是核轉(zhuǎn)錄因子-κB受體活化因子配體(RANKL)抑制劑。甲狀旁腺素(甲狀旁腺激素的一個片段)是只有經(jīng)批準的合成代謝劑,激素替代療法(HRT)包括大量雌激素或雌激素加孕激素聯(lián)合制劑,其中一些被批準用于預(yù)防絕經(jīng)后骨折高危婦女的OP,補充鈣和維生素D經(jīng)常被認為是治療OP的輔助手段[2]。盡管這些策略對OP有很好的療效,但研究顯示長期服用這些藥物具有較大的不良反應(yīng),如對胃腸道損害、耐藥等。因此,尋求一種安全有效治療OP的藥物具有重要的臨床意義[3]。

    OP屬中醫(yī)學“骨痿”“虛勞”“骨痹”“骨枯”等范疇。許多中草藥及經(jīng)典古方在辨證論治基礎(chǔ)上治療OP得到了良好的應(yīng)用,在臨床上取得了較好的療效[4]。桃紅四物湯最早出自清·吳謙所著《醫(yī)宗金鑒》,是由四物湯加桃仁、紅花而成,也稱加味四物湯,全方有活血化瘀、養(yǎng)血補血的作用,是治療血瘀證的常用方。四物湯中當歸、川芎為血中之氣藥,熟地黃、白芍為血中之血藥,加上桃仁、紅花的活血作用,全方具有養(yǎng)血而不滯血、活血而不傷血的功效[5]。楊國柱等[6]利用潑尼松誘導斑馬魚OP模型評價桃紅四物湯抗OP作用的實驗研究發(fā)現(xiàn),桃紅四物湯對斑馬魚OP模型有明顯的治療作用。此外,很多研究都表明,桃紅四物湯具有治療OP的作用,這也體現(xiàn)了中醫(yī)藥治療OP具有很大的優(yōu)勢及潛力。桃紅四物湯在中醫(yī)藥治療OP的臨床實踐中雖得到廣泛的運用,但其藥效物質(zhì)基礎(chǔ)及具體作用機制尚不清楚,這是限制其臨床廣泛運用的關(guān)鍵問題。因此,基于桃紅四物湯所含有效成分的復(fù)雜性、多樣性,本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學方法探討桃紅四物湯對OP的藥理作用機制,并基于藥物、靶點和OP靶點之間的關(guān)系建立藥理學網(wǎng)絡(luò),希望能為深入了解桃紅四物湯治療OP提供一定的參考依據(jù)。

    1 研究方法

    1.1 桃紅四物湯所含化合物的收集與篩選 通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫和分析平臺(http://www.tcmspw.com/tcmsp.php,TCMSP)收集桃紅四物湯中桃仁、紅花、當歸、川芎、白芍、熟地黃6味藥的成分,并以口服生物利用度(OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18為限定條件對所收集到的化合物進行篩選。

    1.2 桃紅四物湯所含化合物作用靶點的預(yù)測 對1.1中化合物的作用靶點進行預(yù)測。

    1.3 OP發(fā)病靶點檢索及桃紅四物湯作用OP相關(guān)靶點的預(yù)測 通過UniProt數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)將所得藥物靶點ID轉(zhuǎn)換成GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)的基因名稱。以“osteoporosis”作為關(guān)鍵詞,在GeneCards數(shù)據(jù)庫、OMIM數(shù)據(jù)庫收集與OP相關(guān)的基因,取得分≥0.4的靶點,將挖掘得到的OP相關(guān)基因與桃紅四物湯靶點基因互相映射篩選出共同靶點,獲得桃紅四物湯治療OP的作用靶點。

    1.4 桃紅四物湯所含化合物作用OP相關(guān)靶點相互作用的網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將每個化合物與其作用的OP靶點相聯(lián)系,通過Cytoscape 3.7.2軟件進行桃紅四物湯的成分-OP相關(guān)靶點相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建并繪制網(wǎng)絡(luò)圖,利用軟件中的Network Analyzer插件分析網(wǎng)絡(luò)節(jié)點度和介數(shù)中心度。

    1.5 桃紅四物湯對OP作用靶點的蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 為了說明靶點蛋白在系統(tǒng)水平上的作用,將桃紅四物湯相關(guān)靶點基因上傳至在線String10.0軟件(https://string-db.org/),選擇研究物種為人類,設(shè)置靶點之間最低要求聯(lián)系分數(shù)為0.4,并隱藏不與其他靶點聯(lián)系的靶點,構(gòu)建由導入基因表達產(chǎn)物組成的PPI網(wǎng)絡(luò),并且利用R語言3.6.1軟件(https://www.r-project.org/)對PPI網(wǎng)絡(luò)中的蛋白繪制條形圖。

    1.6 桃紅四物湯治療OP預(yù)測靶點富集分析 運用DAVID數(shù)據(jù)庫,以P < 0.05作為篩選條件獲得靶點蛋白進行基因本體(GO)功能富集分析及基因組百科全書(KEGG)通路富集分析,包括生物過程、細胞組成和分子功能3個部分。

    2 結(jié) 果

    2.1 活性化合物的篩選 為了提供更準確的結(jié)果,本研究挑選TCMSP中OB≥30%、DL≥0.18的化合物,共檢索出730個化合物,其中桃仁66個、紅花189個、當歸125個、川芎189個、白芍85個、熟地黃76個,通過篩選得出69個活性化合物,如谷甾醇α1、β-胡蘿卜素、黃芩苷、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇、槲皮素、豆甾醇、芍藥總黃酮、芍藥苷、兒茶素等。

    2.2 桃紅四物湯所含化合物作用靶點的預(yù)測 對2.1中化合物的作用靶點進行預(yù)測,共得到5346個作用靶點。

    2.3 桃紅四物湯靶點與OP靶點相互作用韋恩圖 依據(jù)Relevance score≥4標準,按分子-靶蛋白對接結(jié)果篩選出相關(guān)靶蛋白,利用UniProt數(shù)據(jù)庫轉(zhuǎn)換成對應(yīng)的基因名稱,如遇PBD ID對應(yīng)多個基因,則核對靶蛋白內(nèi)容選擇基因,確保1個蛋白對應(yīng)1個基因。結(jié)果,共得到199個靶基因,再依據(jù)GeneCards數(shù)據(jù)庫、OMIM數(shù)據(jù)庫挖掘得到OP相關(guān)基因615個,最后將桃紅四物湯活性成分-OP靶點相關(guān)基因映射,共發(fā)現(xiàn)41個共同基因,確定為桃紅四物湯治療OP的靶基因。見圖1。

    2.4 桃紅四物湯靶點-OP相互作用網(wǎng)絡(luò) 將候選化學成分與OP靶點通過Cytoscape 3.7.2建立桃紅四物湯成分靶點-OP靶點群網(wǎng)絡(luò),得出桃紅四物湯靶點-OP網(wǎng)絡(luò)主要由56個節(jié)點(13個化合物節(jié)點,43個靶點節(jié)點)和115條邊組成,其中菱形節(jié)點紅色表示疾病OP,六邊形紫色表示藥物,黃色三角形節(jié)點表示桃紅四物湯藥物活性成分,圓形綠色節(jié)點表示桃紅四物湯可能是通過這些基因治療OP,連接化合物與靶點的每條邊表示桃紅四物湯活性成分與OP靶點之間的相互作用關(guān)系。見圖2。在桃紅四物湯靶點-OP靶點網(wǎng)絡(luò)中,桃紅四物湯中有13種主要成分作用于OP相關(guān)靶點,充分體現(xiàn)了其多成分、多靶點的作用特點。其主要的化合物有β-谷甾醇、木脂素、6-羥基山奈酚、黃芩素、槲皮素、β-胡蘿卜素、山奈酚、木犀草素、槲皮素、芍藥苷、兒茶素、肉豆蔻堿等,這些藥物的活性成分可能是治療OP的物質(zhì)基礎(chǔ)。

    2.5 靶點PPI網(wǎng)絡(luò)、關(guān)鍵基因分析 PPI網(wǎng)絡(luò)包含41個靶蛋白節(jié)點,共有403條相互作用連線。見圖3。其中度值較大的有白細胞介素(IL)-6(度值 = 38)、IL-B(度值 = 35)、JUN(度值 = 32)、基質(zhì)金屬蛋白酶-9(MMP-9,度值 = 30)、表皮生長因子(EGF,度值 = 28)、低聚果糖(FOS,度值 = 28)等,它們與其他蛋白相互作用,在該網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。見圖4。

    2.6 GO生物過程分析 將41個靶基因在DAVID數(shù)據(jù)庫進行GO生物過程富集,根據(jù)錯誤發(fā)現(xiàn)率(FDR) < 0.05篩選出62個GO生物過程。其中受體調(diào)節(jié)活性、DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活活性、RNA聚合酶Ⅱ特異性、受體配體活性、染色質(zhì)結(jié)合活性等位于GO生物過程富集的前面。見圖5、圖6。OP的發(fā)生、發(fā)展涉及蛋白質(zhì)的活性、轉(zhuǎn)錄因子的活性、DNA及RNA的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)等生物過程,而桃紅四物湯可通過調(diào)節(jié)以上生物過程治療OP。

    2.7 KEGG信號通路分析 通過DAVID數(shù)據(jù)庫將桃紅四物湯的41個靶基因在KEGG信號通路中富集,根據(jù)FDR < 0.05篩選出與OP密切相關(guān)的信號通路,包括IL-17、輔助性T細胞17(Th17)細胞、T細胞受體、Toll樣受體、雌激素、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)、PI3K-Akt、甲狀腺激素、FoxO、Wnt等信號通路。其中每條通路都有相對應(yīng)的通路圖,涉及破骨細胞分化,激素,相關(guān)炎癥因子,甲狀旁腺激素的合成、分泌及作用等生物過程。由此推測,桃紅四物湯可能主要通過調(diào)節(jié)以上關(guān)鍵基因,影響此類信號通路發(fā)揮治療OP的作用。KEGG富集通路的柱狀圖,見圖7。

    3 討 論

    OP是一種以骨量減少、骨的微觀結(jié)構(gòu)破壞為主要特征的全身性疾病,臨床上以全身骨痛及易于發(fā)生骨折為主要表現(xiàn),尤以老年人及絕經(jīng)后婦女多見,隨著我國人口老齡化加快,其分型又以絕經(jīng)后OP為常見[7-8]。季兆潔等[9]發(fā)現(xiàn),桃紅四物湯具有顯著的促進骨折愈合作用,促進骨痂微血管的新生,顯示出良好的祛瘀生新作用。中醫(yī)藥治療OP具有價格低廉、劑型豐富、不良反應(yīng)小、依從性好等優(yōu)勢,在治療早中期OP方面發(fā)揮著不可替代的作用[10]。而網(wǎng)絡(luò)藥理學通過對中藥的收集整合,建立了多種中藥數(shù)據(jù)庫,以可視化的形式將各個藥物與疾病之間的關(guān)系系統(tǒng)地呈現(xiàn)出來[11]。從本研究結(jié)果來看,桃紅四物湯中關(guān)鍵的活性成分、基因參與并調(diào)控了OP的進程,與目前已有的關(guān)于桃紅四物湯治療OP的研究相一致,為桃紅四物湯“多成分—多靶點—多疾病”治療OP的機制提供了參考。

    從OP與桃紅四物湯的共同靶點來看,OP與桃紅四物湯相關(guān)的活性成分-潛在靶點網(wǎng)絡(luò)中包含41個靶點,其中度值較大的有IL-6、IL-B、JUN、MMP-9、EGF、FOS等,推測桃紅四物湯有效成分可能通過抑制上述靶點發(fā)揮作用。如血清IL-6可能與OP的發(fā)病有關(guān)[12],MMP-9是破骨細胞前體的重要調(diào)節(jié)因子[13]。

    本研究初步篩選出桃紅四物湯治療OP的活性成分有β-谷甾醇、木脂素、6-羥基山奈酚、黃芩素、槲皮素、β-胡蘿卜素、山奈酚、木犀草素、槲皮素、芍藥苷、兒茶素、肉豆蔻堿等。β-谷甾醇是一種植物甾醇,在體外和體內(nèi)研究中被報道為具有抗炎、抗血管生成和降低膽固醇作用;槲皮素為一種黃酮類化合物,據(jù)報道,槲皮素可以降低因小鼠卵巢切除和骨修復(fù)而導致的骨完整性喪失。研究發(fā)現(xiàn),這兩種藥物具有改善骨脆性和骨折的藥理作用,能逆轉(zhuǎn)體內(nèi)外雌激素調(diào)節(jié)引起的骨重塑的衰弱狀態(tài),維持鈣、磷水平和骨完整性[14]。有研究者利用代謝組學的方法,評價木脂素對去卵巢OP模型大鼠的療效和治療靶點,最終鑒定出16種潛在的生物標志物,通過影響內(nèi)源性相關(guān)代謝機制,為絕經(jīng)后OP的治療提供了藥理依據(jù)[15]。付方勝等[16]實驗提示,黃芩素可以通過抑制RANKL誘導的破骨細胞分化和骨吸收功能,預(yù)防破骨細胞增強導致的OP;此外,它還可通過激活mTORC1信號通路刺激MC3T3-E1細胞分化為成骨細胞[17]。

    山奈酚是一種天然黃酮類化合物,從山奈酚根狀莖中提取,研究發(fā)現(xiàn),山奈酚對去卵巢大鼠OP的防治作用是使骨密度有顯著提高,明顯抑制大鼠尿液中骨鈣和磷的流失,能夠顯著抑制去卵巢大鼠血清中酒石酸酸性磷酸酶和組織蛋白酶K的活性,改善OP大鼠骨小梁形態(tài)結(jié)構(gòu)[18-19]。β-胡蘿卜素能促進成骨細胞的早期分化,維持骨轉(zhuǎn)換的正平衡[20]。木犀草素是一種具有抗氧化活性的植物類黃酮。研究發(fā)現(xiàn),其可以通過減輕氧化應(yīng)激促進成骨細胞增殖,并通過調(diào)節(jié)ERK/LRP-5/GSK-3β途徑促進成骨細胞分化,在糖皮質(zhì)激素性O(shè)P的治療中發(fā)揮重要作用[21]。芍藥苷是一種天然產(chǎn)物,能提高成骨細胞活性,抑制破骨細胞活性,從而減少去卵巢引起的OP[22]。綜上所述,桃紅四物湯的有效成分之間不僅存在緊密的協(xié)同關(guān)系,而且其作用靶點也在整個疾病進程中發(fā)揮著重要作用。

    從通路富集結(jié)果分析可知,桃紅四物湯治療OP核心基因的KEGG通路主要涉及IL-17、Th17細胞、T細胞受體、Toll樣受體、雌激素、MAPK、PI3K-Akt、甲狀腺激素、FoxO、Wnt、AGE-RAGE等。其中每條通路都有相對應(yīng)的通路圖,涉及破骨細胞分化,激素,相關(guān)炎癥因子,甲狀旁腺激素的合成、分泌及作用等生物過程。

    根據(jù)本研究結(jié)果,桃紅四物湯多靶點、多通路治療OP的機制得到初步驗證,網(wǎng)絡(luò)藥理學分析結(jié)果從另一方面也說明了引起OP因素多且復(fù)雜,為從分子水平方向進一步揭示桃紅四物湯治療OP的潛在化學成分及作用機制,為后期藥物研發(fā)及疾病治療提供一定的理論依據(jù)。

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    收稿日期:2020-02-29;修回日期:2020-04-16

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