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    在中醫(yī)腫瘤學(xué)基礎(chǔ)研究中運(yùn)用系統(tǒng)生物學(xué)方法的芻議

    2021-03-26 17:02:13王院春吳勉華惠建榮王希勝朱葉萍
    中醫(yī)腫瘤學(xué)雜志 2021年3期
    關(guān)鍵詞:組學(xué)生物學(xué)基因

    王院春, 吳勉華, 惠建榮, 王希勝, 朱葉萍

    1.南京中醫(yī)藥大學(xué),江蘇 南京 210023;2.陜西中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院,陜西 咸陽(yáng) 712000

    在20世紀(jì)生物醫(yī)學(xué)取得巨大成就的背景下,美國(guó)科學(xué)院院士Leroy Hood[1]于1999年提出“系統(tǒng)生物學(xué)”的概念,并于2000年創(chuàng)立了第一個(gè)系統(tǒng)生物學(xué)研究所,他把這一學(xué)科描述為“研究一個(gè)生物系統(tǒng)中所有組成要素(如基因、mRNA、蛋白質(zhì)及代謝產(chǎn)物等)的構(gòu)成,以及在特定干擾條件下,如遺傳、環(huán)境等因素改變時(shí),所有要素之間相互關(guān)系的學(xué)科”[2,3]。系統(tǒng)生物學(xué)不是研究單個(gè)基因或蛋白質(zhì),而是利用高通量基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等平臺(tái),引入計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)等方法,研究生物系統(tǒng)在遺傳或環(huán)境等因素的干擾下,基因組、蛋白質(zhì)組等各要素和他們之間關(guān)系的變化,同時(shí),將這種變化的信息整合起來(lái),建立以數(shù)學(xué)或圖畫(huà)來(lái)描述生物系統(tǒng)各要素及其關(guān)系的模型,從整體上幫助人們理解生命的邏輯和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的秘密。系統(tǒng)生物學(xué)的核心特質(zhì)是多變量的整合,力圖實(shí)現(xiàn)不同干擾條件下對(duì)生物體從基因到細(xì)胞、組織、個(gè)體的多層次研究,從整體上解析生物系統(tǒng)的本質(zhì)規(guī)律。中醫(yī)學(xué)也是從先天、環(huán)境及社會(huì)等整體上研究人體和疾病,以聯(lián)系的、運(yùn)動(dòng)的觀點(diǎn)分析健康和疾病,辨證論治,與系統(tǒng)生物學(xué)在思維上有“異曲同工”之處[4]。有學(xué)者認(rèn)為系統(tǒng)生物學(xué)的理念和方法可助力中醫(yī)藥學(xué)的研究發(fā)展,已有不少學(xué)者在此領(lǐng)域取得一定成果[5-7]。中醫(yī)腫瘤學(xué)是中醫(yī)理論指導(dǎo)下,研究人類腫瘤,特別是惡性腫瘤類疾病的流行特點(diǎn)、學(xué)術(shù)沿革、病因病機(jī)、臨床表現(xiàn)、診斷規(guī)律、辨證論治體系及預(yù)防康復(fù)等科學(xué)的一門(mén)臨床學(xué)科[8]。相較于中醫(yī)其它臨床學(xué)科和現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的腫瘤學(xué)科,中醫(yī)腫瘤學(xué)雖已具備理論體系、學(xué)術(shù)特征和診治技術(shù),但在醫(yī)學(xué)日新月異的當(dāng)下,其學(xué)術(shù)體系仍需不斷完善,方法技術(shù)也需創(chuàng)新發(fā)展,筆者基于系統(tǒng)生物學(xué)思想與方法之考量,在中醫(yī)腫瘤學(xué)發(fā)展方面略有淺識(shí),茲述于下。

    1 中醫(yī)腫瘤學(xué)概況

    1.1 發(fā)展歷史概述

    國(guó)醫(yī)大師周岱翰認(rèn)為中醫(yī)腫瘤學(xué)是一門(mén)“古老”而又“年輕”的中醫(yī)臨床分科[8]。隋唐以前是中醫(yī)腫瘤學(xué)的奠基時(shí)期。甲骨文中即有“瘤”之記載,《山海經(jīng)》記載有治療“惡瘡、癭瘤、噎食”等類似腫瘤疾病的藥物,《黃帝內(nèi)經(jīng)》奠定了中醫(yī)學(xué)的基本理論,也奠定了中醫(yī)腫瘤學(xué)形成與發(fā)展的基礎(chǔ),《難經(jīng)》區(qū)分了“積”和“聚”,并對(duì)“五臟之積”的特點(diǎn)進(jìn)行描述,《本經(jīng)》記載治療“癥瘕、惡瘡、癭瘤”等抗癌中藥并沿用至今;《傷寒雜病論》創(chuàng)“六經(jīng)”辨證體系、方證體系和抗癌方藥,至今仍有鱉甲煎丸、大黃?蟲(chóng)丸等許多方劑應(yīng)用于腫瘤臨床[9];《諸病源候論》最早將癥瘕單獨(dú)作為一類疾病設(shè)專候論述,并重視脾胃功能,注意顧護(hù)正氣,為現(xiàn)代中醫(yī)診治提供了寶貴經(jīng)驗(yàn)[10]。宋金元時(shí)期是中醫(yī)腫瘤學(xué)的全面發(fā)展時(shí)期[11]。這一時(shí)期病名、病因、發(fā)病、病機(jī)、證治、預(yù)防都有了新的發(fā)展,如提出了“癌”的概念,并認(rèn)為“毒根深藏”是其形成的主要原因;病因?qū)W說(shuō)注意到“情志”因素,辨證論治逐漸形成;有官修方書(shū)載有大量方藥,至今仍為腫瘤臨床組方的參考;在治療原則方面,易水學(xué)派、補(bǔ)土派強(qiáng)調(diào)養(yǎng)正,提出“養(yǎng)正積自除”的觀點(diǎn),攻邪派強(qiáng)調(diào)“達(dá)”“發(fā)”“奪”“泄”“折”五法,滋陰派推崇從痰論治等。明清時(shí)期是中醫(yī)腫瘤學(xué)的成熟時(shí)期[12]。此時(shí)中醫(yī)腫瘤學(xué)從病因病機(jī)、診斷鑒別、治則方藥、技術(shù)手段等均已形成體系,許多醫(yī)家在其專著中多有論述,如《外科正宗》等外科專著注重內(nèi)外合治,已初具綜合治療的思想,《醫(yī)宗必讀》提出“初、中、末三法”分期論治,并明確攻補(bǔ)兼施用于治療各類腫瘤,成為現(xiàn)今中醫(yī)腫瘤學(xué)重要的理論和實(shí)踐淵源。晚清以來(lái),是中醫(yī)腫瘤學(xué)的現(xiàn)代化時(shí)期。如同中醫(yī)學(xué)一樣,中醫(yī)腫瘤學(xué)經(jīng)歷了近代以來(lái)的百年滄桑,但西學(xué)東漸也給中醫(yī)腫瘤學(xué)注入新的血液。新中國(guó)成立以來(lái),中醫(yī)腫瘤學(xué)經(jīng)歷了五六十年代的總結(jié)凝練、七八十年代的“減毒增效”,進(jìn)入上世紀(jì)90年代,中醫(yī)腫瘤學(xué)逐漸具備了相對(duì)完整的現(xiàn)代學(xué)術(shù)體系、人才隊(duì)伍和臨床分科的實(shí)踐基礎(chǔ),從中醫(yī)內(nèi)、外、婦、兒等學(xué)科中脫穎而出,成為現(xiàn)代中醫(yī)學(xué)體系中一門(mén)獨(dú)立的臨床學(xué)科,結(jié)合現(xiàn)代科技,走上快速的現(xiàn)代化道路。曰其“古老”,確系歷史悠久,源遠(yuǎn)流長(zhǎng);曰其“年輕”,實(shí)因規(guī)矩方才,宏途肇啟。

    1.2 優(yōu)勢(shì)、特色與局限

    中醫(yī)腫瘤學(xué)具有絕對(duì)優(yōu)勢(shì)和鮮明特色,在當(dāng)前腫瘤治療研究中具有不可替代的地位[8]。首先,整體觀念,強(qiáng)調(diào)人體自身、人與自然、人與社會(huì)均是不同層次的“整體”,發(fā)生腫瘤均是由于不同層次“統(tǒng)一性”的破壞,如人體局部發(fā)生腫瘤是因?yàn)槿黻庩?yáng)失衡,人與自然不相和諧會(huì)導(dǎo)致人群腫瘤患病率的升高,不同社會(huì)環(huán)境中人群腫瘤發(fā)病率也不同,在預(yù)防、治療腫瘤時(shí)從整體出發(fā),注重聯(lián)系,調(diào)整、恢復(fù)整體的穩(wěn)態(tài)或平衡。其次,辨證論治強(qiáng)調(diào)個(gè)體化、個(gè)性化治療,主張“因人、因時(shí)、因地”制宜,需根據(jù)患者的性別、年齡、體質(zhì)等特點(diǎn),結(jié)合季節(jié)、時(shí)令、地域、氣候等各種特定條件確定治療原則;還需根據(jù)腫瘤的類型、分期、證候等特點(diǎn)制定相應(yīng)的治法、方劑和藥物;近年還有結(jié)合現(xiàn)代影像、組織類型、分子檢測(cè)等手段確定優(yōu)勢(shì)人群及選擇特異方藥等方法,也是辨證論治的具體體現(xiàn)。再者,中醫(yī)腫瘤學(xué)具有以人為本的特色。診斷辨證注重正氣,強(qiáng)調(diào)“正氣存內(nèi)、邪不可干”,“治病”與“治人”緊密結(jié)合;療效評(píng)價(jià)首先考慮人的生存狀態(tài)和適應(yīng)能力,如生活質(zhì)量、生存期、心理健康等;在診療過(guò)程中注重醫(yī)患之間的信息溝通,采用“望聞問(wèn)切”等傳統(tǒng)方法診察疾病,通過(guò)藥物、針灸、推拿、導(dǎo)引等方法治療疾病,診療過(guò)程中充分調(diào)動(dòng)患者的主體能動(dòng)性,同時(shí)將醫(yī)者的治療目的、信息和能量傳遞給患者,這在針刺補(bǔ)瀉中尤為突出。第四,道法自然的認(rèn)識(shí)論強(qiáng)調(diào)世間萬(wàn)物都有其客觀規(guī)律,認(rèn)識(shí)生命和腫瘤都要遵循自然規(guī)律,以自然之理可以闡發(fā)生命和腫瘤的奧秘;由此而形成的“順勢(shì)思維”方法論強(qiáng)調(diào)在治療腫瘤時(shí)要遵循邪正盛衰,順勢(shì)而為,如早期腫瘤,正氣強(qiáng)盛,邪氣尚弱,可強(qiáng)攻邪氣,邪去正安;而晚期腫瘤,正氣大虧,邪氣鴟張,則需補(bǔ)養(yǎng)正氣,扶正祛邪;又如,肝氣以條達(dá)為補(bǔ),胃氣以和降為補(bǔ),均需順勢(shì)而為[13]。

    當(dāng)然,事物總有其發(fā)展的局限性,中醫(yī)腫瘤學(xué)也不例外。例如,中醫(yī)腫瘤學(xué)的基礎(chǔ)理論和經(jīng)驗(yàn)方法均脫胎于中醫(yī)基礎(chǔ)及臨床各科,理論的系統(tǒng)性有待完善[8],解釋實(shí)踐相對(duì)充分,但對(duì)具體實(shí)踐的指導(dǎo)性有待加強(qiáng);理論或經(jīng)驗(yàn)方法多為定性,定量不足,精準(zhǔn)不夠[14],缺乏用現(xiàn)代科學(xué)語(yǔ)言如數(shù)據(jù)等描述界定的標(biāo)準(zhǔn),可操作性還需提高;臨床診療多為經(jīng)驗(yàn)性,普遍接受或適用的規(guī)范體系尚未形成,包括療效評(píng)價(jià)體系;科學(xué)研究不能體現(xiàn)整體性,缺乏系統(tǒng)性,中醫(yī)屬性弱化[15]。在科學(xué)技術(shù)迅速發(fā)展的今天,唯有不斷突破局限、完善自身,中醫(yī)腫瘤學(xué)才能更好地發(fā)揮優(yōu)勢(shì)與特色,實(shí)現(xiàn)新的蛻變。

    2 系統(tǒng)生物學(xué)可為中醫(yī)腫瘤學(xué)發(fā)展的借鑒和補(bǔ)充

    相對(duì)于還原論為基礎(chǔ)的研究體系,系統(tǒng)生物學(xué)更強(qiáng)調(diào)整體思維,注重各要素的整合,其研究思想、方法體系可以成為中醫(yī)腫瘤學(xué)保持中醫(yī)屬性,發(fā)揮優(yōu)勢(shì)、特色,快速發(fā)展的借鑒和補(bǔ)充。

    2.1 基因組學(xué)與中醫(yī)腫瘤學(xué)

    基因組學(xué)是對(duì)所有基因進(jìn)行基因組作圖、核苷酸序列分析、基因定位和功能分析的科學(xué)。檢測(cè)腫瘤基因組的突變?cè)陬A(yù)測(cè)腫瘤發(fā)生、選擇治療方案和判斷預(yù)后方面意義重大。Brunner等[16]利用全基因組測(cè)序技術(shù),對(duì)收集到的5例正常肝臟和9例肝硬化肝臟的組織樣本構(gòu)建出482個(gè)全基因組序列,發(fā)現(xiàn)肝硬化肝組織含有的突變數(shù)量是健康肝組織和肝細(xì)胞癌組織的兩倍,相比于健康肝組織,肝硬化和肝癌組織中突變類型的多樣性更大,解釋了慢性肝病人群的肝癌風(fēng)險(xiǎn)增加是因?yàn)槠渲写罅緿NA損傷突變促進(jìn)了有潛力癌變細(xì)胞的出現(xiàn),對(duì)未來(lái)利用基因組學(xué)數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)慢性肝病患者患肝癌的風(fēng)險(xiǎn)成為可能。WEDGE等[17]對(duì)前列腺癌標(biāo)本進(jìn)行全基因組測(cè)序(whole genome sequencing,WGS)分析,新發(fā)現(xiàn)了5個(gè)編碼驅(qū)動(dòng)突變的基因,同時(shí)發(fā)現(xiàn)CDH12和ANTXR2基因的丟失與不良的生存預(yù)后相關(guān)。黃清潔等[18]基于二代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing,NGS)對(duì)300例肺癌患者腫瘤組織中的驅(qū)動(dòng)基因進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)EGFR可與其他驅(qū)動(dòng)基因突變共存,這些突變與患者年齡、性別、吸煙史、組織類型等有關(guān),還發(fā)現(xiàn)了一些低頻突變的基因,改變了以往驅(qū)動(dòng)突變獨(dú)立、互斥等認(rèn)識(shí),對(duì)肺癌驅(qū)動(dòng)突變的深入研究和臨床治療都有重大指導(dǎo)意義。

    中醫(yī)腫瘤學(xué)也從稟賦、體質(zhì)、行為習(xí)慣等預(yù)測(cè)腫瘤的發(fā)生、決定治療法則及判斷預(yù)后等,如“壯人無(wú)積,虛人則有之”、“過(guò)飲滾酒,多成膈證”等。我們可借鑒基因組學(xué)的方法和技術(shù),把中醫(yī)學(xué)的稟賦、體質(zhì)等概念進(jìn)行結(jié)構(gòu)化描述,賦予客觀的基因組信息,實(shí)現(xiàn)從宏觀到微觀的同一性,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)預(yù)測(cè)腫瘤發(fā)生、選擇治法方藥、判斷預(yù)后等的客觀可操作性。有學(xué)者論述基因組學(xué)技術(shù)已經(jīng)在中醫(yī)藥基于體質(zhì)的精準(zhǔn)預(yù)防、個(gè)體化診斷等方面有較多應(yīng)用,期待在中醫(yī)腫瘤學(xué)領(lǐng)域?qū)⒂懈嗌钊氲难芯亢蛻?yīng)用[19]。

    2.2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)與中醫(yī)腫瘤學(xué)

    轉(zhuǎn)錄組學(xué)是研究細(xì)胞內(nèi)所有基因轉(zhuǎn)錄情況和轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的科學(xué)[20]?;虻霓D(zhuǎn)錄產(chǎn)物稱為轉(zhuǎn)錄組,廣義上指全部從基因轉(zhuǎn)錄的RNA總和,包括編碼蛋白的信使RNA(messenger RNA,mRNA)和非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究,可以揭示基因表達(dá)與生命現(xiàn)象的內(nèi)在聯(lián)系,解釋基因調(diào)控機(jī)制和不同表達(dá)信息,對(duì)不同時(shí)間或環(huán)境條件下的生理病理現(xiàn)象提供基因表達(dá)譜的差異和調(diào)控信息。劉文琛等[21]通過(guò)高通量的轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測(cè)和生信分析,發(fā)現(xiàn)急性缺血性中分陰類證、陽(yáng)類證的lncRNA,miRNA,mRNA表達(dá)存在差異,并研究了不同類證的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。王階等[22]以冠心病血瘀證為切入點(diǎn),采集312例患者外周血基因信息,運(yùn)用轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究技術(shù),確立了冠心病血瘀證lncRNA-miRNA-mRNA 3個(gè)層面的潛在生物標(biāo)志物,構(gòu)建了冠心病血瘀證miRNA-mRNA及l(fā)ncRNA-miRNA-mRNA 2個(gè)水平的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),基于差異基因和調(diào)控網(wǎng)絡(luò),對(duì)202例活血化瘀中藥治療前后共計(jì)400余人次的基因檢測(cè)結(jié)果結(jié)合細(xì)胞實(shí)驗(yàn),從基因-蛋白-功能3個(gè)層面揭示了活血化瘀中藥干預(yù)冠心病血瘀證的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)機(jī)制。黃卉等[23]對(duì)小鼠腦腫瘤組織樣本進(jìn)行基因芯片檢測(cè),發(fā)現(xiàn)金龍膠囊組共有37個(gè)差異基因(倍數(shù)>2),106個(gè)拓?fù)浠?,其靶點(diǎn)主要集中在細(xì)胞粘附和凋亡、免疫應(yīng)答、神經(jīng)發(fā)育等,金龍膠囊通過(guò)誘導(dǎo)神經(jīng)細(xì)胞特有基因表達(dá)發(fā)揮抗腦腫瘤作用。

    惡性腫瘤具有病史相對(duì)較長(zhǎng)、演變復(fù)雜、異質(zhì)性突出的特點(diǎn),“證”的演變復(fù)雜多樣,借鑒轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究平臺(tái)可探索中醫(yī)腫瘤學(xué)病證聯(lián)系規(guī)律、“證”的本質(zhì)及演變調(diào)控規(guī)律,研究“證”的客觀化或確定標(biāo)志物,提供“證候差異、同病異證、同證異病”的分子依據(jù)等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究還可以對(duì)中藥復(fù)方、針灸等復(fù)雜體系的抗腫瘤作用機(jī)制研究提供技術(shù)支持[24]。

    2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)與中醫(yī)腫瘤學(xué)

    細(xì)胞或組織的基因組所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)稱為蛋白質(zhì)組,相對(duì)于固定的基因組而言,蛋白質(zhì)組因時(shí)間、地點(diǎn)和環(huán)境等各種條件的影響而呈動(dòng)態(tài)變化,蛋白質(zhì)組學(xué)[25]即是研究蛋白質(zhì)組的構(gòu)成、表達(dá)水平、功能和調(diào)控關(guān)系的科學(xué),與中醫(yī)學(xué)“整體觀”和“動(dòng)態(tài)觀”趨同。蛋白質(zhì)組是生物功能的執(zhí)行體,其動(dòng)態(tài)變化能全面反映生物體功能的改變。李曉亮等[26]利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)比較了人肺腺癌和癌旁遠(yuǎn)端正常組織的差異蛋白,發(fā)現(xiàn)癌組織和遠(yuǎn)端正常組織的蛋白質(zhì)存在顯著差異,并鑒定了14種肺腺癌相關(guān)的蛋白質(zhì),為肺癌的早期診斷和預(yù)后判斷奠定基礎(chǔ)。丁峰等[27]利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)比較了肝郁證肝癌患者、非肝郁證肝癌患者和健康人唾液樣本中蛋白質(zhì)組的差異,發(fā)現(xiàn)3組人群唾液標(biāo)本中蛋白質(zhì)存在顯著差異,以此建立了肝郁證肝癌特異的蛋白數(shù)據(jù)庫(kù),篩選出肝郁證肝癌演變可能相關(guān)的差異蛋白,為肝癌肝郁證證候本質(zhì)及臨床辨證提供客觀證據(jù)。饒希午等[28]通過(guò)血清蛋白差異表達(dá)研究,發(fā)現(xiàn)益氣養(yǎng)陰組與模型組差異表達(dá)的蛋白共116個(gè),通過(guò)功能鑒定,明確這些蛋白與肝癌進(jìn)展的多個(gè)環(huán)節(jié)和多條通路有關(guān),確定益氣養(yǎng)陰法的多靶點(diǎn)、多中心調(diào)控的作用。袁枝花等[29]學(xué)者認(rèn)為蛋白質(zhì)組學(xué)從整體研究的策略可顯著提高中藥作用靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)效率,在中藥現(xiàn)代研究中具有明顯優(yōu)勢(shì),并指出3種蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在中藥作用靶點(diǎn)研究中的具體應(yīng)用,為中藥作用機(jī)制的研究提供新思路、新方法。

    中醫(yī)學(xué)“司外揣內(nèi)”的診察方法有利于惡性腫瘤的早期診斷,但缺乏客觀指標(biāo),我們可利用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法,以差異蛋白將外露的“象”與內(nèi)在的“臟”之間建立客觀聯(lián)系,實(shí)現(xiàn)腫瘤的早期診斷;同一癌癥不同“證”的演變規(guī)律對(duì)我們整體把握疾病、確定治則治法至關(guān)重要,我們可利用蛋白質(zhì)組的整體性、動(dòng)態(tài)性、多樣性與中醫(yī)學(xué)整體觀、動(dòng)態(tài)觀、辨證觀建立聯(lián)系,對(duì)研究癌癥病程中的證候本質(zhì)和建立辨證體系很有意義;中醫(yī)的治法治則多具有多靶點(diǎn)、多中心的調(diào)控作用,復(fù)方、針灸等的作用靶點(diǎn)非常復(fù)雜,蛋白質(zhì)組學(xué)可以為治法治則、藥物及穴位的調(diào)控靶點(diǎn)、作用機(jī)制研究提供思路借鑒和技術(shù)支持。

    2.4 代謝組學(xué)與中醫(yī)腫瘤學(xué)

    代謝組學(xué)是從整體上全面、動(dòng)態(tài)研究生物體或組織器官的小分子代謝產(chǎn)物的科學(xué)[30,31],主要關(guān)注基因調(diào)控、酶活性改變和代謝變化。代謝組學(xué)把研究對(duì)象看做整體,跳過(guò)體內(nèi)具體環(huán)節(jié),通過(guò)全面分析生物體或組織器官代謝物的種類、數(shù)量及動(dòng)態(tài)變化,尋找差異,揭示生理或病理過(guò)程,發(fā)現(xiàn)其中的可能機(jī)制,具有活體研究、無(wú)創(chuàng)傷、與生理或病理過(guò)程相似等特點(diǎn)。江文俊等[32]利用代謝組學(xué)技術(shù)檢測(cè)了中分化胃癌細(xì)胞系、低分化胃癌細(xì)胞系和正常胃上皮細(xì)胞系的代謝譜,發(fā)現(xiàn)了9種差異性代謝產(chǎn)物,有望成為胃癌潛在的腫瘤標(biāo)志物,對(duì)胃癌的早期診斷和療效評(píng)價(jià)具有重要的意義。鞏振東等[33]運(yùn)用代謝組學(xué)技術(shù)檢測(cè)模型動(dòng)物唾液中代謝物的變化,發(fā)現(xiàn)與正常體質(zhì)組比較,腎虛體質(zhì)組唾液中3種代謝物含量升高,腎虛證候組唾液中5種代謝物含量下降,與腎虛體質(zhì)組比較,腎虛證候組唾液中1種代謝物含量升高,表明在“正常體質(zhì)-腎虛體質(zhì)-腎虛證候”的演變中,唾液中代謝物成分發(fā)生變化,這些物質(zhì)可能成為腎虛相關(guān)疾病的生物標(biāo)志物,對(duì)闡明“腎虛”的實(shí)質(zhì)提供客觀依據(jù),也有助于腎虛的早期診斷和防治研究奠定基礎(chǔ)。方婷等[34]利用代謝組學(xué)技術(shù)比較了正常組、乳腺癌荷瘤組和乳腺癌荷瘤薏苡仁油治療組小鼠的血清代謝譜,發(fā)現(xiàn)與正常組比較,荷瘤組小鼠有15種代謝物水平降低,1種代謝物水平升高,這些代謝物在薏苡仁油給藥后均有顯著回調(diào)的趨勢(shì),表明薏苡仁油可能通過(guò)調(diào)控體內(nèi)花生四烯酸等4類物質(zhì)代謝發(fā)揮抗腫瘤作用。

    中醫(yī)學(xué)素有通過(guò)“望、聞”排泄物與分泌物診察疾病的方法,可以說(shuō)是代謝組學(xué)診察疾病的雛形,故可通過(guò)代謝組學(xué)技術(shù)對(duì)“望、聞”的內(nèi)容繼續(xù)延伸,建立中醫(yī)腫瘤早期診斷和療效評(píng)價(jià)的新體系;代謝組學(xué)技術(shù)還可助力確立惡性腫瘤及其不同階段證候的生物標(biāo)志物,賦予證候以代謝組學(xué)實(shí)質(zhì);代謝組學(xué)技術(shù)同樣對(duì)研究中藥復(fù)方、針灸等復(fù)雜體系的作用機(jī)制具有借鑒和補(bǔ)充作用。另外,代謝組學(xué)在發(fā)現(xiàn)新藥[35,36]或新的治療方法[37],預(yù)測(cè)腫瘤治療效果等方面均已顯示出優(yōu)勢(shì),其對(duì)中醫(yī)腫瘤學(xué)今后的發(fā)病機(jī)制探索、腫瘤預(yù)防和治療、藥物發(fā)現(xiàn)和機(jī)制研究等領(lǐng)域均有重大借鑒和補(bǔ)充作用。

    2.5 多組學(xué)策略與中醫(yī)腫瘤學(xué)

    腫瘤是一類多因素、多環(huán)節(jié)、多階段發(fā)生發(fā)展的復(fù)雜疾病,可能涉及到基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組等一個(gè)或多個(gè)水平的異常,且不同水平之間可能還存在相互作用關(guān)系。因此,單組學(xué)研究對(duì)全面闡釋腫瘤所涉及的問(wèn)題具有局限性,多組學(xué)的研究策略可以從不同水平闡釋腫瘤發(fā)生、演化、進(jìn)展等復(fù)雜問(wèn)題,現(xiàn)代高通量技術(shù)正好為多組學(xué)研究策略奠定基礎(chǔ),現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué)已經(jīng)開(kāi)始實(shí)踐[38]。通過(guò)多組學(xué)研究還可以發(fā)現(xiàn)藥物的作用靶點(diǎn)、治療起效的物質(zhì)基礎(chǔ)等,這種研究策略與方法正好同中醫(yī)腫瘤學(xué)整體觀念及復(fù)法大方治療實(shí)踐相吻合,借鑒這種策略和方法可以補(bǔ)充中醫(yī)腫瘤學(xué)目前發(fā)展中的不足,啟發(fā)新的研究思路,有助于學(xué)科快速發(fā)展。

    多組學(xué)研究可以全面闡釋腫瘤發(fā)生發(fā)展的具體機(jī)制。LI等[38]利用多組學(xué)分析不同類型非小細(xì)胞肺癌組織,發(fā)現(xiàn)在肺癌組織中絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶2表達(dá)上調(diào),這一上調(diào)與染色體12q14.1位點(diǎn)的擴(kuò)增有關(guān),同時(shí)絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶2也與肺腺癌的轉(zhuǎn)移和不良預(yù)后有關(guān)。苗華等[39]基于系統(tǒng)生物學(xué)整合技術(shù)挖掘發(fā)現(xiàn)細(xì)胞周期和增殖信號(hào)通路是結(jié)直腸癌發(fā)生中的核心通路,UBE2C和AURKA等11個(gè)基因是該通路的驅(qū)動(dòng)基因。中醫(yī)腫瘤病因病機(jī)的研究同樣可以借鑒這種多組學(xué)策略或賦予多組學(xué)內(nèi)涵。

    在腫瘤診斷中,“見(jiàn)微知著”是中醫(yī)診斷疾病的一種思維方式,多組學(xué)整合有望在“微”上實(shí)現(xiàn)客觀化和定量化,有學(xué)者綜述近年來(lái)多組學(xué)技術(shù)在口腔癌和其它腫瘤診斷中的優(yōu)勢(shì)和應(yīng)用現(xiàn)狀,提出多組學(xué)整合可成為口腔癌診斷的系統(tǒng)生物學(xué)研究借鑒,是實(shí)現(xiàn)口腔癌早期診斷的有效途徑[40]。充分利用現(xiàn)代多組學(xué)高通量技術(shù),賦予望、聞、問(wèn)、切等診查技術(shù)客觀標(biāo)準(zhǔn),是實(shí)現(xiàn)中醫(yī)腫瘤學(xué)對(duì)高危人群早期診斷的有效途徑,可使中醫(yī)學(xué)“司外揣內(nèi)”等診察方法更具可操作性。

    在疾病分型和精準(zhǔn)治療方面,國(guó)醫(yī)大師王琦提出將系統(tǒng)生物學(xué)的研究方法引入中醫(yī)體質(zhì)學(xué)的研究,有助于從微觀上探討體質(zhì)的本質(zhì),有利于建立量化的體質(zhì)分類標(biāo)準(zhǔn),同時(shí)為辨體治療提供依據(jù)[41]。張繼玲等[42]研究發(fā)現(xiàn)大腸癌患者最常見(jiàn)的體質(zhì)類型為氣虛質(zhì),其次為濕熱質(zhì)與氣郁質(zhì),男性患者濕熱質(zhì)比例較高,女性患者氣郁質(zhì)比例較高,且體質(zhì)分布情況與年齡及TNM分期密切相關(guān)。引入多組學(xué)技術(shù)有望實(shí)現(xiàn)體質(zhì)、證型、陰陽(yáng)、五行等疾病分類屬性的系統(tǒng)化和客觀化,也為腫瘤的現(xiàn)代中醫(yī)精準(zhǔn)治療提供依據(jù)。

    在研究中藥、方劑的作用機(jī)制方面,多組學(xué)整合策略同樣顯示絕對(duì)優(yōu)勢(shì)。柳潤(rùn)輝[43]團(tuán)隊(duì)在國(guó)際上率先采用系統(tǒng)生物學(xué)的多組學(xué)方法進(jìn)行中藥方劑的多成分、多靶點(diǎn)作用機(jī)制研究,闡明麝香保心丸中藥效成分之間的增效、減毒、維持血藥濃度等相互作用關(guān)系,實(shí)現(xiàn)在分子水平整體闡明方劑的作用特點(diǎn)。半枝蓮是臨床最常用的抗癌中藥之一,胡晨駿等[44]利用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)算法篩選出與半枝蓮最相關(guān)聯(lián)的前100個(gè)基因、4個(gè)基因族和前10條KEGG信號(hào)通路,從系統(tǒng)生物學(xué)的角度挖掘半枝蓮的潛在作用機(jī)制,并經(jīng)過(guò)文獻(xiàn)研究分析驗(yàn)證,相關(guān)結(jié)果與半枝蓮的藥理研究和臨床應(yīng)用高度一致,為研究人員利用多組學(xué)策略從整體水平研究半枝蓮或其它抗癌中藥的藥理活性提供方法學(xué)參考。

    此外,多組學(xué)研究方法還有助于中醫(yī)腫瘤學(xué)的特殊概念客觀細(xì)化、科學(xué)界定,對(duì)診斷、治療的方法技術(shù)確定生物標(biāo)志物、整體上闡明藥物等的作用機(jī)制,對(duì)預(yù)后判斷確定科學(xué)依據(jù)、便于臨床操作。高通量的研究方法還有助于提高藥物、腧穴等的篩選效率,發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)。

    3 結(jié)語(yǔ)

    中醫(yī)腫瘤學(xué)已形成較為完整的理論體系和獨(dú)特的思維方式,在生命觀、疾病觀、治療觀、預(yù)防康復(fù)觀等方面均具有不可替代的優(yōu)勢(shì)和鮮明特色。然而,面對(duì)近代以來(lái)的西學(xué)東漸,特別是當(dāng)代科學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展和生物醫(yī)學(xué)取得的巨大成就,中醫(yī)腫瘤學(xué)在理論創(chuàng)新、研究方法迭代、技術(shù)精準(zhǔn)化以及與現(xiàn)代科學(xué)的相容性方面均表現(xiàn)出局限或不足,遇到新的挑戰(zhàn)。系統(tǒng)生物學(xué)全面、動(dòng)態(tài)的研究策略和方法體系與中醫(yī)腫瘤學(xué)整體觀念、動(dòng)態(tài)變化、辨證論治等思維方式具有趨同性,許多學(xué)者將系統(tǒng)生物學(xué)引入中醫(yī)學(xué)各領(lǐng)域的研究,并且取得了相應(yīng)成果。借鑒系統(tǒng)生物學(xué)的研究體系可推動(dòng)中醫(yī)腫瘤學(xué)的全面發(fā)展,特別是現(xiàn)代高通量的組學(xué)技術(shù)有助于開(kāi)展中醫(yī)腫瘤學(xué)病因、病機(jī)、診斷、治療、機(jī)制探索等多層次的研究,提供給中醫(yī)腫瘤學(xué)前所未有的發(fā)展機(jī)遇?;蚪M學(xué)研究可為中醫(yī)腫瘤學(xué)的病因與發(fā)病學(xué)說(shuō)提供客觀的基因組數(shù)據(jù),指導(dǎo)腫瘤預(yù)防、治療和判斷預(yù)后,還為中醫(yī)藥的個(gè)體化治療提供依據(jù)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究可助力中醫(yī)腫瘤學(xué)發(fā)病規(guī)律研究、證候本質(zhì)研究,為不同的中醫(yī)證候確定生物標(biāo)志物,闡明證候演變的調(diào)控關(guān)系,為同病異治和中醫(yī)藥預(yù)防提供轉(zhuǎn)錄組依據(jù)。蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)可幫助確定中醫(yī)診斷信息的標(biāo)志物,在腫瘤的早期診斷、預(yù)后判斷、證候本質(zhì)、中醫(yī)藥的作用靶點(diǎn)等研究方面均可實(shí)現(xiàn)客觀量化,也為發(fā)現(xiàn)新的中醫(yī)藥療法或治療靶點(diǎn)、闡明中醫(yī)藥的作用機(jī)制提供支持。多組學(xué)策略完全適應(yīng)中醫(yī)腫瘤學(xué)整體觀、動(dòng)態(tài)觀、辨證觀的優(yōu)勢(shì),在中醫(yī)腫瘤發(fā)病機(jī)制、診斷辨證、腫瘤分型、精準(zhǔn)施治、機(jī)制探索等各方面均可提供多層次的信息支持,并賦予中醫(yī)腫瘤學(xué)新的科學(xué)內(nèi)涵,實(shí)現(xiàn)現(xiàn)代化或與現(xiàn)代科學(xué)溝通、相融的基礎(chǔ)。

    盡管系統(tǒng)生物學(xué)的策略與方法已經(jīng)在醫(yī)學(xué)研究中開(kāi)始應(yīng)用,高通量技術(shù)也取得了一些成果,但仍需克服以下幾點(diǎn):第一,組學(xué)分析將大量的數(shù)據(jù)進(jìn)行整合,復(fù)雜的海量數(shù)據(jù)對(duì)生物信息平臺(tái)的分析能力提出了更高的要求,況且要去粗取精、去偽存真更是對(duì)分析平臺(tái)的考驗(yàn);第二、組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生的預(yù)測(cè)分析模型、診斷治療方法和作用靶標(biāo)距離在臨床中實(shí)現(xiàn)中醫(yī)藥預(yù)防、早期診斷、精準(zhǔn)醫(yī)療等還有很大的距離,還需不斷地探索求證;第三,組學(xué)技術(shù)有利于全面實(shí)現(xiàn)中醫(yī)腫瘤學(xué)概念、理論、方法、技術(shù)等的客觀量化和機(jī)制闡釋,但要保持中醫(yī)學(xué)屬性、強(qiáng)化中醫(yī)學(xué)特征、發(fā)揮中醫(yī)藥優(yōu)勢(shì)仍然面臨挑戰(zhàn);最后,系統(tǒng)生物學(xué)及高通量組學(xué)技術(shù)是一匹“寶馬良駒”,對(duì)中醫(yī)腫瘤學(xué)科隊(duì)伍的駕馭能力同樣提出挑戰(zhàn)。當(dāng)然,系統(tǒng)生物學(xué)的可貴之處在于其多變量整合、整體解析,中醫(yī)腫瘤學(xué)發(fā)展的根本動(dòng)力主要源于其自身實(shí)踐。筆者認(rèn)為,隨著技術(shù)局限性的突破和分析平臺(tái)的進(jìn)步,大膽借鑒系統(tǒng)生物學(xué)的研究策略和方法體系,不斷補(bǔ)充短板、發(fā)揮優(yōu)勢(shì),將使中醫(yī)腫瘤學(xué)取得更好的發(fā)展,在人類攻克癌癥的道路上發(fā)揮更大作用。

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