葉雅芳,劉德星,李婷婷,邱德義,劉環(huán)宇
蠓科(Ceratopogonidae)是雙翅目(Diptera)中種類繁多、分布甚廣的體型較小的昆蟲,部分刺吸人畜血液的種類被稱為吸血蠓,其中庫蠓屬(Culicoides)是分布最廣、種類最多、與人畜關(guān)系最密切的吸血蠓之一。庫蠓全世界分布,約有1 400多種,在我國分布有347種[ 1-2]。庫蠓不但刺吸人畜血液引起蟲咬性皮炎和皮膚過敏性癥狀,而且還是奧柔普西病毒病(Oropouche virus,OROV)、藍舌病毒(Bluetongue virus, BTV)、施馬倫貝格病毒(Schmallenberg virus, SBV)、等多種人畜病原體的傳播媒介[3]。家畜流行病對畜牧業(yè)影響巨大,歐洲BTV和SBV的大暴發(fā)曾造成巨大的經(jīng)濟損失[4-5]。了解庫蠓的種類、分布、吸血特性及病原體攜帶率是有效預防控制疫病流行和傳播的關(guān)鍵,因此庫蠓的準確鑒定對于蠓傳疾病的研究和防控有著重要的意義。
由于雌蠓才具吸血習性,對疾病的傳播具有重要意義,因此雌蠓的分類鑒定尤其重要,但傳統(tǒng)形態(tài)學鑒定方法是根據(jù)成蟲外部形態(tài)特征以及雄蟲的尾器才能進行有效鑒定,而雌蟲、幼蟲或肢體殘缺的蟲體難以辯認,且蠓類中有效的形態(tài)鑒定特征極少,對近似種的分類鑒定十分困難,從而影響庫蠓地理分布及其傳播疾病的深入研究[6-7]。近年來,隨著研究人員對線粒體DNA的深度挖掘和廣泛應用,線粒體DNA已成為昆蟲物種分類和分子序列分析的一種有效分子標記,如線粒體COI基因和Cytb基因片段[8-12]。
中山市位于東經(jīng)113°9′2″至113°46′,北緯22°11′12″至22°46′35″,位于珠江三角洲中部偏南的西、北江下游出海處,處于北回歸線以南,熱帶北緣,光照充足,熱量豐富,氣候溫暖,冬季氣候變化緩和,地理條件和氣候條件均適合蠓類生長,且目前尚未見到學者系統(tǒng)開展中山市庫蠓的調(diào)查研究。本研究以臺灣蠛蠓Lasioheleataiwana、叢林鋏蠓Forcipomyiabessa、美島裸蠓Atrichopogonformosanus、彎曲阿蠓Alluaudomyiaflexuosa為外群,對2018年4月至2019年3月在中山市不同生境采集的庫蠓進行系統(tǒng)的形態(tài)學鑒定以及COI基因和Cytb基因序列分析,為研究我國庫蠓快速、準確的分類鑒定提供資料,也為進一步研究其種群分布、種群遺傳結(jié)構(gòu)及其傳播相關(guān)疾病的防控提供科學依據(jù)。
1.1.1庫蠓標本 本研究所用的104只庫蠓(13只雄蟲,91只雌蟲)為2018年4月至2019年3月采集于中山市不同生境(詳細信息見表1)。
表1 12種庫蠓的詳細信息
Tab.1 Information ofCulicoidesin this study
種名拉丁學名雄♂雌♀采集地GenBank序列號COICytb原野庫蠓Culicoides homotomus1♀6MK917544MK917648蘇島庫蠓Culicoides sumatrae1♀5MK917542MK917646異域庫蠓Culicoides peregrinus1♀4MK917543MK917647琉球庫蠓Culicoides actoni3♀4MK917539-917539MK917608-917610殘肢庫蠓Culicoides imicola2♀5MK896861,917442MK917545,917546連斑庫蠓Culicoides jacobsoni1♀4MK917538MK917607撫須庫蠓Culicoides palpifer1♂14♀4,5,7MK917477-917491MK917547-917561荒川庫蠓Culicoides arakawai9♂8♀1,3,6,7MK917494-917509MK917564-917580環(huán)斑庫蠓Culicoides circumscriptus1♂1♀2MK917492-917493MK917562,917563尖喙庫蠓Culicoides oxystoma10♀4MK917527-917537MK917597-917606霍飛庫蠓Culicoides huffi2♂14♀2,4,6,7MK917511-917527MK917581-917596似同庫蠓Culicoides similis35♀5,4,7MK917443-917477MK917622-917645
注:采集地1:居民區(qū)(康逸豪園)2:辦公區(qū)(中山海關(guān)中山六路院內(nèi))3:城中村(三溪村)4:市內(nèi)公園(紫馬嶺公園)5:城郊農(nóng)莊(一魚六味飯店,有家禽舍)6:林區(qū)(大尖山農(nóng)戶雞舍)7:城郊大學校園(獅頭山)
1.1.2主要試劑 血液和組織DNA提取試劑盒(編號:Q5523)購自天根生化科技有限公司,dNTP、rTaq DNA聚合酶等購于大連寶生物有限公司,引物由Invitrogen公司合成。引物序列:
COI基因擴增引物:
LCO1490(5′-GGTCAACAAAATCATAAA-GATATTGG-3′);
HCO2198(5′-TGATTTTTTGGTCACCCTGGAAGTTTTA-3′)[13]
Cytb基因擴增引物:
Cytb424-449(5′-GCRTAWGCRAAWARRA-ARTAYCAYTCWGG-3′);
Cytb876-847(5′-ATYTGWCCYCAWGGWA-RWACRTAWCC-3′)[14]
1.2.1庫蠓采集 根據(jù)庫蠓的生活習性,選擇燈誘法(功夫小帥,24 W,12V,波長365 nm,武漢市吉星環(huán)保科技有限責任公司)。在7種不同的生態(tài)環(huán)境中居民區(qū)(康逸豪園)、辦公區(qū)(中山海關(guān)中山六路院內(nèi))、城中村(三溪村)、市內(nèi)公園(紫馬嶺公園)、城郊農(nóng)莊(一魚六味飯店,有家禽舍)、林區(qū)(大尖山農(nóng)戶雞舍)、城郊大學校園(獅頭山)布置采樣點進行蠓蟲收集,每月的上下旬各采集一次。在所選的生境內(nèi),選擇遠離光源干擾和避風的室外場所作為掛燈點,每個采樣點掛誘蟲燈3盞,光源離地1.5 m,于日落前1 h接通電源,連續(xù)燈誘3 h后取出集蠓袋,做好標記,蠓連同集蠓袋放置于-20℃冰箱冷凍致死。
1.2.2庫蠓基因組DNA提取 參照文獻的方法[15],挑選形態(tài)完整的庫蠓,切下翅置于玻片上,把剩余部分浸泡在220 μL含有1%蛋白酶K的組織消化緩沖液(天根公司DNA提取試劑盒)中,56 ℃消化過夜,按試劑盒操作說明從消化液中提取庫蠓基因組DNA,提取的DNA置于4 ℃暫存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3樣本處理和形態(tài)學鑒定 對消化后的庫蠓進行清洗、逐步脫水、切下頭部和腹部、將頭部的觸須、觸角,腹部、足擺正后,滴上加拿大樹膠(加丁香油),重新調(diào)整擺正,封片,最后制成玻片標本[16]。待研究庫蠓根據(jù)外部形態(tài)特征按照《中國蠓科昆蟲》[2],顯微鏡鏡檢鑒定種類,取一側(cè)翅進行拍照。
1.2.4PCR的擴增 分別采用COI基因和Cytb基因通用引物[13-14]進行 PCR 擴增。PCR擴增體系如下:DNA模板3 μL,上、下游引物(10 μL/L)各1 μL/L,10×PCR Buffer 5 μL,dNTP 2 μL,rTaq酶0.5 μL,加ddH2O補至50 μL。PCR反應條件為94 ℃預變性5 min,94 ℃變性45 s,54 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán),最后再72 ℃延伸10 min。
1.2.5序列測定及分析 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR擴增情況,并將擴增產(chǎn)物送至上海立菲公司雙向測序,測序引物同擴增引物。使用DNAMAN軟件,將去除兩端引物后的正向序列在GenBank數(shù)據(jù)庫進行比對鑒定物種。
1.2.6COI和Cytb序列分析 將庫蠓104條COI序列和Cytb序列上傳至GenBank,每條序列及其憑證標本詳細信息見表1,并在GenBank中引入85種庫蠓656條序列長度658 bp以上的COI序列和2種庫蠓234條序列長度300 bp以上的Cytb序列(已剔除未明確到種和同一蠓種的序列差異>2%的序列),采用自測的臺灣蠛蠓、叢林鋏蠓、美島裸蠓、彎曲阿蠓8條COI序列和8條Cytb序列分別作為外群,使用MEGA6.0軟件將以上所得的COI序列和Cytb序列,截取出完全重合的序列進行分析,基于Kimura2-parameter 模型,鄰接法構(gòu)建NJ樹(自檢值設(shè)置為1 000次)。
2.1主要形態(tài)特征描述 根據(jù)104只庫蠓頭部、翅、腹部、尾器的形態(tài)描述進行檢索鑒定標本,鑒定結(jié)果為原野庫蠓(1♀)、蘇島庫蠓(1♀)、異域庫蠓(1♀)、琉球庫蠓(3♀)、殘肢庫蠓(2♀)、連斑庫蠓(1♀)、撫須庫蠓(1♂,14♀)、荒川庫蠓(9♂,8♀)、環(huán)斑庫蠓(1♂,1♀)、尖喙庫蠓(10♀)、霍飛庫蠓(2♂,14♀)、似同庫蠓(35♀)12種庫蠓(表2、圖1)。由表2、圖1可知:1)頭部:該12種庫蠓頭部形態(tài)特征(復眼是否連接、眼面間柔毛、觸須第3節(jié)感覺器窩)之間不完全存在差異,不能作為鑒別特征。2)翅:該12種庫蠓翅特征(翅面淡、暗斑是否明顯、翅臀室淡斑數(shù)目、徑中淡斑是否覆蓋第1 徑室基部和徑中橫脈、翅面大毛所在位置、徑5 室淡斑數(shù)目、徑5 室淡斑位置)和一側(cè)翅圖之間均存在差異,可作為鑒別的特征。3)腹部:庫蠓雌蟲腹部特征(受精囊數(shù)目、受精囊形態(tài))之間不完全存在差異,可知庫蠓雌蟲腹部特征不能作為鑒別的特征。4)尾器:該12種庫蠓雄蟲尾器形態(tài)(陽莖中葉形態(tài)、陽莖中葉側(cè)突形態(tài))之間存在很大的差異,因此雄蠓可以根據(jù)其尾器形態(tài)進行有效鑒定。
圖1 12種庫蠓一側(cè)翅圖Fig.1 Wing of Culicoides
2.2.1COI序列構(gòu)成 104只12種庫蠓COI的長度均為658 bp。撫須庫蠓、環(huán)斑庫蠓、似同庫蠓、蘇島庫蠓4種庫蠓COI序列在GenBank中未找到相應序列,為本研究首次獲得。從GenBank數(shù)據(jù)庫中引用85種庫蠓COI序列656條,采用自測的其它蠓屬COI序列有臺灣蠛蠓2條、叢林鋏蠓3條、美島裸蠓2條、彎曲阿蠓1條。將以上所得的COI序列對齊,截取出完全重合的序列后,共獲得93種庫蠓768條長度為612 bpCOI序列。
2.2.2COI序列同源性比對 將本研究所獲12種庫蠓COI序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的序列進行同源比對,原野庫蠓、異域庫蠓、琉球庫蠓、殘肢庫蠓、連斑庫蠓、荒川庫蠓、尖喙庫蠓、霍飛庫蠓的COI序列相似度皆大于98%,說明該8種庫蠓的形態(tài)鑒定結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫中的COI基因序列比對結(jié)果一致。撫須庫蠓、蘇島庫蠓在GenBank中均未收錄COI序列,而似同庫蠓、環(huán)斑庫蠓與GenBank數(shù)據(jù)庫中的COI序列相似度小于98%。
2.2.3COI聚類分析 基于COI聚類分析表明(圖2),不同種類蠓間無交叉,且相同種類蠓的不同個體均聚在同一分支下,支持率達到99%以上,僅Bakhoum鑒定的似同庫蠓[17]雖聚在同一分支但支持度僅90%。庫蠓屬與蠛蠓屬、鋏蠓屬、裸蠓屬、阿蠓屬混在不同支序內(nèi),但因支持度低(<20%),無法說明其親緣關(guān)系,符合關(guān)于COI基因不適合進行系統(tǒng)進化關(guān)系分析的結(jié)論[18],對上述4屬并入庫蠓屬的現(xiàn)象,在其他昆蟲中也有類似的結(jié)果[19]。蘇島庫蠓與其近似種無害庫蠓序列相似度95.24%,低于98%,該兩庫蠓間無交叉,說明COI基因在不同蠓種間有明顯差異,可以用于鑒定和區(qū)分近似蠓種。撫須庫蠓、霍飛庫蠓、荒川庫蠓、環(huán)斑庫蠓該4種庫蠓雌蟲與其雄蟲形態(tài)特征之間存在差異,而雌蟲COI基因序列與雄蟲序列聚在同一分支下且相似度98%以上,說明同一種的雌雄庫蠓之間COI基因的差異小于種間差異,可以用于雌蟲的種類鑒定。
2.3.1Cytb序列構(gòu)成 104只12種庫蠓Cytb的長度均為394 bp。原野庫蠓、蘇島庫蠓、異域庫蠓、琉球庫蠓、殘肢庫蠓、連斑庫蠓、撫須庫蠓、荒川庫蠓、環(huán)斑庫蠓、尖喙庫蠓、霍飛庫蠓、似同庫蠓10種庫蠓Cytb序列在GenBank中未找到相應序列,為本研究首次獲得。從GenBank中引用2種庫蠓荒川庫蠓、殘肢庫蠓Cytb序列248條。采用自測的其它蠓屬Cytb序列有臺灣蠛蠓2條、叢林鋏蠓3條、美島裸蠓2條、彎曲阿蠓1條。將以上所得的Cytb序列對齊,截取出完全重合的序列后,共獲得16種庫蠓360條長度321 bpCytb序列用于分析。
2.3.2Cytb序列同源性比對 將本研究12種庫蠓的全部Cytb序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的序列進行同源比對,荒川庫蠓、殘肢庫蠓Cytb序列相似度皆大于98%,說明該2種庫蠓的形態(tài)鑒定結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫中的Cytb基因序列比對結(jié)果一致。其余10種庫蠓原野庫蠓、蘇島庫蠓、異域庫蠓、琉球庫蠓、殘肢庫蠓、連斑庫蠓、撫須庫蠓、荒川庫蠓、環(huán)斑庫蠓、尖喙庫蠓、霍飛庫蠓、似同庫蠓在GenBank中均未收錄有Cytb基因序列。
注:♂.雄性庫蠓序列;♀.雌性庫蠓序列;★.GenBank引用的序列。進化樹等邊三角形?的底邊長度代表每個物種含有個體數(shù)目的多少圖2 基于COI構(gòu)建的NJ樹(Kimura 2-parameter模型)Fig.2 Neighbor-jointing tree based on the mitohondrial gene COI sequence
2.3.3Cytb聚類分析 基于Cytb聚類分析表明(圖3),不同種類蠓間無交叉,且相同種類蠓的不同個體均聚在同一分支下,支持率均達到99%,說明Cytb基因在不同蠓種間有明顯差異,可以用于鑒定和區(qū)分蠓種。庫蠓屬與蠛蠓屬、鋏蠓屬、裸蠓屬、阿蠓屬混在不同支序內(nèi),但因支持度低(<10%),無法說明其親緣關(guān)系,說明Cytb不適合進行系統(tǒng)進化關(guān)系分析,對上述4屬并入庫蠓屬的現(xiàn)象,與本研究COI聚類分析的研究結(jié)果一致。撫須庫蠓、霍飛庫蠓、荒川庫蠓、環(huán)斑庫蠓雌蟲Cytb基因序列與雄蟲序列聚在同一分支下且相似度98%以上,說明同一種的雌雄庫蠓之間Cytb基因的差異小于種間的差異,可以用于雌蟲的種類鑒定。
注:♂.雄性庫蠓序列;♀.雌性庫蠓序列;★.GenBank引用的序列。進化樹等邊三角形?的底邊長度代表每個物種含有個體數(shù)目的多少圖3 基于Cytb構(gòu)建的NJ樹(Kimura 2-parameter模型)Fig.3 Neighbor-jointing tree based on the mitohondrial gene Cytb sequence
本研究在中山市不同生境采集的撫須庫蠓、霍飛庫蠓、荒川庫蠓、環(huán)斑庫蠓雄蟲可以根據(jù)其尾器的形態(tài)特征進行有效鑒定,而12種庫蠓雌蟲僅可從翅部特征的細微差異進行鑒定和區(qū)別,特別是近似種,如蘇島庫蠓與無害庫蠓。線粒體DNA(mtDNA)具有多拷貝、分子量小、母系遺傳、突變速度適中等特點,能準確鑒別物種[22]。目前,已有多個研究表明在對蚤目、同翅目和雙翅目(搖蚊科、麻蠅科)等昆蟲進行序列分析時聯(lián)合形態(tài)學特征以及線粒體DNA(mtDNA)綜合分析得到的結(jié)果比單獨使用線粒體COI基因分析得到的結(jié)果更為理想[23-25]。因此,本研究基于形態(tài)學特征和COI、Cytb分子標記數(shù)據(jù)綜合分析對12種庫蠓進行鑒定,驗證了線粒體COI和Cytb基因序列可作為庫蠓的分類鑒定和序列聚類分析的有效分子標記,可得到更為準確的種類鑒定和序列分析結(jié)果。
庫蠓雄蟲可以根據(jù)其尾器特征進行有效鑒定,而庫蠓雌蟲有效的形態(tài)鑒定特征極少,尤其大多近似種僅可從翅特征的細微差異進行鑒定和區(qū)別,例如蘇島庫蠓與無害庫蠓是近似種,許多形態(tài)特征相似,只能根據(jù)翅特征進行鑒別:蘇島庫蠓翅基淡斑大,向后延伸至臀室基部翅緣,即翅基淡斑與臀室基部淡斑融合,臀室只有2個淡斑;而無害庫蠓翅基淡斑與臀室基部淡斑分離,臀室均有3個淡斑,其余形態(tài)特征幾乎無異[15],但該2種庫蠓COI序列相似度95.24%,低于98%,說明COI基因在近似蠓種間有明顯差異,這與COI基因用于其它昆蟲近似種的研究結(jié)果相似[26-28],可以用于鑒定和區(qū)分近似蠓種,所以該12種庫蠓形態(tài)學鑒定的結(jié)果需要分子鑒定加以補充。本研究組的似同庫蠓形態(tài)特征與《中國蠓科昆蟲》[2]的似同庫蠓相一致,而Bakhoum鑒定的似同庫蠓[17]與本研究的似同庫蠓翅特征不一致,COI序列相似度為88.18%,低于98%;Harrup鑒定的似同庫蠓[20]與本研究的似同庫蠓COI序列相似度為93.15%,低于98%,且在基于COI構(gòu)建的NJ樹中,Bakhoum鑒定的似同庫蠓[17]聚在同一分支的支持度僅90%,其個體間COI序列差異較大,說明Bakhoum[17]、Harrup[20]鑒定的似同庫蠓可能不準確;同理,本研究組的環(huán)斑庫蠓形態(tài)特征與《中國蠓科昆蟲》[2]的環(huán)斑庫蠓相一致,而Slama D鑒定的環(huán)斑庫蠓[21]形態(tài)特征與本研究的環(huán)斑庫蠓不一致,說明Slama D鑒定的環(huán)斑庫蠓[21]可能不準確,因此上傳基因序列到數(shù)據(jù)庫前,應該盡量通過形態(tài)學的反復鑒定和確認。在構(gòu)建的2個基因NJ樹中,雖然不同蠓屬聚在同一大支,但不同蠓種間無交叉,且相同蠓種的不同個體均聚在同一分支下,支持率達到99%以上,說明COI和Cytb基因只適于蠓蟲種級的鑒定。撫須庫蠓、霍飛庫蠓、荒川庫蠓、環(huán)斑庫蠓雌蟲COI基因、Cytb基因序列與雄蟲序列聚在同一分支下且相似度98%以上,說明同一種的雌雄庫蠓之間COI基因、Cytb基因的差異小于種間的差異,這與COI基因、Cytb基因用于其它昆蟲的研究結(jié)果相似[29-32],可以用于雌蟲的種類鑒定。
線粒體COI基因和Cytb基因分子標記已應用于多種醫(yī)學昆蟲近似種的鑒定與區(qū)別[26-28],由于分子標記不受性別、早期階段的形態(tài)結(jié)構(gòu)、肢體殘缺的蟲體、鑒定者專業(yè)性的的影響[33],形態(tài)學與分子學相結(jié)合的方法鑒別庫蠓,可以相互驗證,使結(jié)果更為準確,為庫蠓的鑒別提供了準確高效的方法。
利益沖突:無