王書菁,施曉峰,廖寧波,吳康軍,周文婕,盧宇劍,程東慶**
(1.浙江中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院 杭州 310053;2.浙江省疾病預(yù)防控制中心 杭州 310051)
諾如病毒(Norovirus,NoV)屬于杯狀病毒科(Caliciviruses)的諾瓦克病毒屬,諾如病毒感染性極強(qiáng),是引起人類急性胃腸炎的最常見病原微生物之一[1]。中國自1995年報(bào)告首例諾如病毒感染病例后,國內(nèi)許多地區(qū)多次暴發(fā)諾如病毒感染性急性胃腸炎案例[2]。2016 年10 月17 號,哈爾濱醫(yī)科大學(xué)接到43 名學(xué)生反應(yīng)消化系統(tǒng)不適,出現(xiàn)嘔吐、發(fā)熱、腹瀉的癥狀,事后確診39 名為諾如病毒感染***中新網(wǎng).http://news.jxntv.cn/2016/1017/8177862.shtml。2014 年1 月下旬,浙江嘉興市海寧、海鹽兩地部分學(xué)校出現(xiàn)聚集性學(xué)生惡心嘔吐腹瀉等癥狀,經(jīng)當(dāng)?shù)丶部刂行臋z測確定為諾如病毒感染****人民網(wǎng).http://politics.people.com.cn/n/2014/0220/c70731-24414205.html。目前諾如病毒尚未有疫苗面世,也沒有特異的抗病毒藥物[3]。諾如病毒已成為一個日益嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題。
資料顯示,G Ⅱ型諾如病毒(Genogroups ⅡNorovirus,GⅡ.NoV)是中國的流行優(yōu)勢株,一般通過糞-口傳播。糞-口傳播包括了食源性、水源性以及人-人直接接觸傳播[4]。食物中的諾如病毒滅活一般采用熱高壓即可滅活[5],國內(nèi)外針對諾如病毒的滅活研究主要是水體中的諾如病毒。在傳統(tǒng)水處理工藝中,國內(nèi)外均采用總大腸菌群或大腸菌群作為評價水處理效果的指示微生物,水處理中病毒的安全問題未得到應(yīng)有的重視[6],而且水體很難做到完全清除病毒,因此開發(fā)和完善諾如病毒的檢測及滅活技術(shù),對諾如病毒的預(yù)防控制將起到重要作用。
本實(shí)驗(yàn)研究中藥提取物對諾如病毒的滅活效果,為減少諾如病毒污染、保障公共衛(wèi)生健康提供實(shí)驗(yàn)支撐。
諾如病毒陽性樣品:由浙江省疾病預(yù)防控制中心提供,樣品保存于-80℃?zhèn)溆茫?/p>
中藥材:魚腥草(Houttuynia cordata)購自興寧市長城醫(yī)藥有限公司泰安藥行,天然蜂膠原膠(Propolis)購于江蘇泰安市農(nóng)家養(yǎng)蜂園。
SKY-200B型恒溫培養(yǎng)搖床;MLS-3020CH型高壓蒸汽滅菌鍋;ABI 7500 熒光定量PCR 儀;1300 系列A2型生物安全柜;金屬?。蛔贤鈿⒕鷥x;W2010B 型數(shù)控恒溫水浴鍋;TC-15 恒溫電熱套;R-20J 旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀;SHZ-D-III 型循環(huán)水真空泵;SHP 250 型生化培養(yǎng)箱;DHG 9420A 型電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱;DR/2400 型便攜式分光光度計(jì)等。
Qiagen RNeasy Mini Kit(74104,Qiagen)、QIAamp Viral RNA Mini Kit(52904,Qiagen)、One Step PrimescriptTMRT-PCR Kit(RR064A,Takara)、人諾如病毒抗原ELISA檢測試劑盒(18584,上海江萊生物技術(shù)有限公司)等。
1.4.1 中藥提取物的制備[7-10]
中藥材清洗干燥后打成粗粉用于提取。
水提法:稱取50 g的藥物粉末,加蒸餾水1 L,95℃提取4 h,過濾除渣,取濾液。濾渣中再加蒸餾水1 L,按上法再次抽提2 h后過濾除渣,取濾過液,合并兩次濾過液,旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀濃縮干燥。
醇提法:稱取50 g 的藥物粉末,采用95%乙醇提取,按照1∶10的料液比,95℃提取4 h,過濾除渣,取濾液。濾渣中再加95%乙醇1 L,按上法再次抽提2 h 后過濾除渣,取濾過液,合并兩次濾過液,旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀濃縮干燥。
1.4.2 RT-qPCR檢測病毒含量
采用QIAamp Viral RNA Mini Kit 提取樣品中的核酸為模板,用One Step PrimescriptTMRT-PCR Kit 試劑盒進(jìn)行反應(yīng)。引物和探針均由上海生工有限公司合成,引物[11,12]序列(表1)、反應(yīng)體系(表2),42℃逆轉(zhuǎn)錄30 min 后95℃預(yù)變性2 min,變性5 s、55℃退火35 s 共40個循環(huán)。
表1 RT-qPCR引物和探針序列
表2 RT-qPCR反應(yīng)體系
1.4.3 中藥提取物對諾如病毒滅活的量效、時效關(guān)系研究
量效關(guān)系研究:中藥提取物(濃度1、10、25、50 mg·mL-1)室溫下與100 μL 的病毒懸液孵育30 min,設(shè)立溶劑對照組(只加100 μL的DMSO和100 μL的病毒懸液);空白對照組(加入100 μL 的無菌水和100 μL的病毒懸液),應(yīng)用RT-qPCR 進(jìn)行檢測,檢出Ct 值越大,滅活效果越明顯。
時效關(guān)系研究:中藥提取物(濃度50 mg·mL-1)室溫下與100 μL 的病毒懸液孵育一定時間(0、15、30、60、120 min),設(shè)立溶劑對照組(只加100 μL 的DMSO和100 μL的病毒懸液);空白對照組(加入100 μL的無菌水和100 μL 的病毒懸液),應(yīng)用RT-qPCR 進(jìn)行檢測,檢出Ct值越大,滅活效果越明顯。
1.4.4 滅活機(jī)理一——對諾如病毒蛋白外殼的破壞作用研究
中藥提取物(濃度1、10、25、50 mg·mL-1)室溫下與100 μL的病毒懸液孵育30 min,設(shè)立溶劑對照組(只加100 μL的二甲基亞砜(Dimethyl sulfoxide,DMSO)和100 μL的病毒懸液);空白對照組(加入100 μL的無菌水和100 μL 的病毒懸液),用ELISA 試劑盒檢測結(jié)構(gòu)未被破壞的完整病毒蛋白,檢測OD值越低說明對病毒的破壞作用越好。以紫外輻射法9 000 μ W·cm-2作用30 min、二氧化氯以10 mg·mL-1的濃度作用30 min、5%雙氧水作用30 min作為對照。
1.4.5 滅活機(jī)理二——對諾如病毒核酸的破壞作用
病毒滅活處理方法同上,提取病毒核酸,逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)擴(kuò)增GII.NoV 特異性片段,瓊脂糖凝膠電泳檢測各處理組核酸序列的完整性,擴(kuò)增引物(表3)、擴(kuò)增反應(yīng)體系(表4),42℃逆轉(zhuǎn)錄30 min后,95℃預(yù)變性5 s、變性35 s、55℃退火共40個循環(huán),擴(kuò)增產(chǎn)物由上海生工生物公司測序,比較各組序列的完整性,考察對核酸的破壞作用。
表3 GII.NoV 特異性片段擴(kuò)增所用引物
表4 GII.NoV 特異性片段擴(kuò)增體系
1.4.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
采用SPSS24.0 統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,數(shù)據(jù)用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示。統(tǒng)計(jì)學(xué)方法采用單因素方差分析,P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P<0.01 為差異有顯著性意義。
中藥提取物與GII.NoV 作用30 min,在0-50(mg·mL-1)劑量范圍內(nèi),與對照組相比,蜂膠醇提物和魚腥草水提物均對諾如病毒有一定滅活作用,且隨著濃度提高,效果越明顯。
以50 mg·mL-1的劑量與GII.NoV 作用0、15、30、60、120 min,隨著滅活時間的增加,病毒量不斷降低;30 min到1 h之間滅活達(dá)到最大效果,作用1-2 h之間,滅活效果增加不再明顯。
比較50 mg·mL-1蜂膠醇提物滅活30 min、50 mg·mL-1魚腥草水提物滅活30 min,輻射劑量9 000 μ W·cm-2紫外作用30 min,10 mg·mL-1二氧化氯作用30 min、5%雙氧水作用30 min(圖1),五種方法對水中GII.NoV 均有顯著滅活效果,10 mg·mL-1二氧化氯作用30 min 后可以滅活85.13%的GII.NoV,9000 μ W·cm-2的紫外作用30 min后滅活率達(dá)到96.7%、5%雙氧水作用30 min后滅活率達(dá)到81.09%;而蜂膠醇提物和魚腥草水提物作用30 min后可以滅活97.03%和97.88%的病毒,略高于其他滅活方法。
表5 中藥提取物對GII.NoV的滅活作用(±s,n=5)
表5 中藥提取物對GII.NoV的滅活作用(±s,n=5)
表6 中藥提取物作用時間對GII.NoV的滅活影響(±s,n=5)
表6 中藥提取物作用時間對GII.NoV的滅活影響(±s,n=5)
注:與對照組比較,P<0.05
圖1 五種滅活方法對GII.NoV的滅活效果
蜂膠醇提物、魚腥草水提物、紫外線、二氧化氯和雙氧水處理諾如病毒后通過ELISA檢測結(jié)構(gòu)未被破壞的完整病毒蛋白,其OD 值結(jié)果(表7)。與對照組相比,魚腥草水提物、紫外線、二氧化氯和雙氧水處理OD值均明顯下降,說明病毒外殼蛋白表面抗原受到了破壞,其中尤以二氧化氯和紫外效果最為明顯;但是蜂膠醇提物對諾如病毒顆粒的破壞作用不明顯。
表7 五種滅活方法處理后病毒液ELISA和RT-qPCR雙重檢測結(jié)果
圖2 幾種滅活方法處理前后的諾如病毒RT-PCR瓊脂凝膠電泳分析圖
表8 五種方法滅活處理后3對引物的擴(kuò)增結(jié)果
圖3 ORF1的蛋白編碼位點(diǎn)
表9 消毒處理后諾如病毒ORF1核酸突變情況
5種方法滅活處理后,提取病毒核酸,擴(kuò)增特異性片段,擴(kuò)增結(jié)果(圖2,表8),魚腥草組和雙氧水組3個片段均未能擴(kuò)增成功,蜂膠組、紫外組僅片段2擴(kuò)增成功,二氧化氯組則成功擴(kuò)出了第1、2片段。
RT-PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)上海生工生物公司測序,利用DNAstar分析測序片段,為更好地觀察突變的程度,分別定義了保守點(diǎn)、突變點(diǎn)和高突變點(diǎn),保守點(diǎn)堿基沒有發(fā)生變化,含有3 個堿基以內(nèi)突變的為突變點(diǎn),3 個以上堿基發(fā)生突變的為高突變點(diǎn),分別計(jì)算突變率從而可以清楚地發(fā)現(xiàn)序列的變異情況。
圖2 和表8 可見ORF2 和ORF3(片段3)均未能擴(kuò)增出,只有部分ORF1(片段1和片段2)能完整擴(kuò)增出,因此筆者著重對ORF1 上的6 個蛋白區(qū)域進(jìn)行詳細(xì)分析。ORF1 結(jié)構(gòu)如圖3 所示,5’-N 端開始依次分別是p48、NTPase、p22、VPg、Pro及RdRp。
將有0-5 個堿基突變的定義為“+”,有5-10 個堿基突變的定義為“++”,將有10個以上堿基突變的定義為“+++”。5 種滅活方法處理后,ORF1 上各位點(diǎn)的突變情況(表9)。
我國貝類產(chǎn)量已連續(xù)10多年名列世界第一,是我國水產(chǎn)品的重要組成部分。然而由于我國的水產(chǎn)品污染嚴(yán)重,檢測技術(shù)滯后,相關(guān)衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)不能和國際接軌等種種因素,水產(chǎn)品出口屢次遭遇國際技術(shù)性貿(mào)易壁壘的限制,其中一項(xiàng)就是諾如病毒不得檢出。2004年5月,新加坡農(nóng)業(yè)食品獸醫(yī)局(Agri-Food and Veterinary Authority of Singapore,AVA)從我國三批出口凍牡蠣檢出諾如病毒,貨物被退回。在此之前的2002 年,美國農(nóng)業(yè)部用RT-PCR方法從進(jìn)口中國文蛤中檢測出諾如病毒,導(dǎo)致中國出口到美國的文蛤受阻,使我國的貝類養(yǎng)殖業(yè)蒙受重大損失。
對貝類食源性病毒的滅活研究起步比較晚,研究的文章并不多,缺乏系統(tǒng)性。而諾如病毒對各種外界理化因素都有較強(qiáng)的抵抗力,在室溫條件下于pH 為2.7 的環(huán)境中暴露3 h 仍具有感染性[13];酒精處理諾如病毒后,病毒無法被滅活[14];在含3.75-6.25 mg·L-1氯的普通飲用水中,諾如病毒仍表現(xiàn)出一定的耐受性[15];在10 mg·L-1高濃度氯離子(處理污水采用的氯離子)存在時才能被滅活[16]。諾如病毒對高溫、冰凍、高壓等也有一定的抵抗力:60℃作用30 min后,病毒不能完全滅活[17];將含有諾如病毒的食品基質(zhì)冰凍6個月后,其活性幾乎不受影響。
筆者選取蜂膠醇提物和魚腥草水提物對GII.NoV的滅活規(guī)律進(jìn)行研究。在以0-50 mg·mL-1的中藥提取物作用30 min時,隨著濃度的增加,對諾如病毒的滅活效果越好。室溫下,蜂膠醇提物和魚腥草水提物以50 mg·mL-1為作用濃度,GII.NoV的減少率在30 min-1 h時達(dá)到最高,分別為1.16-1.77 log10和1.67-2.29 log10,表明中藥提取物對諾如病毒的滅活效率存在一定的時效性。蜂膠醇提物和魚腥草水提物作用30 min后可以滅活97.03 %和97.88 %的病毒,略高于其他滅活方法。在貝類收獲后,預(yù)先用含有上述提取物的溶液進(jìn)行浸泡或者銷售運(yùn)輸過程中的儲藏水里加入上述提取物,將有助于殺滅諾如病毒,有效地保障我國水產(chǎn)品衛(wèi)生安全,全面促進(jìn)我國水產(chǎn)品經(jīng)濟(jì)的持續(xù)發(fā)展。