小粒種咖啡種質(zhì)資源重要農(nóng)藝性狀遺傳多樣性分析

閆林 陳婷 黃麗芳 李錦紅 馬關(guān)潤 王曉陽 董云萍 龍宇宙 李學(xué)俊

摘要：[目的]分析小粒種咖啡種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀的多樣性，為小粒種咖啡品種選育提供科學(xué)依據(jù)。[方法]以60份小粒種咖啡種質(zhì)資源為材料，進(jìn)行8個(gè)農(nóng)藝性狀和5個(gè)品質(zhì)性狀測定，并采用相關(guān)性分析、主成分分析和聚類分析等方法進(jìn)行多樣性分析。[結(jié)果]在8個(gè)農(nóng)藝性狀中，變異系數(shù)以鮮干比最高（25.15%），其次為鮮果重（19.85%），以出米率最低（1.97%）;遺傳多樣性指數(shù)以種子長為最高（2.04）。在5個(gè)品質(zhì)性狀中，變異系數(shù)以綠原酸最高（22.68%），其次為脂肪（12.40%），蛋白質(zhì)為最低（5.20%）;遺傳多樣性指數(shù)以綠原酸最高（2.07），其次為脂肪（2.06）和蛋白質(zhì)（2.05）。性狀相關(guān)性分析結(jié)果表明，干豆重與出米率呈顯著正相關(guān)，種子大小與百粒重、出米率、蛋白質(zhì)呈極顯著正相關(guān)，百粒重與出米率、蛋白質(zhì)、脂肪呈極顯著正相關(guān)，出米率與蛋白質(zhì)、脂肪呈極顯著正相關(guān)，蛋白質(zhì)與脂肪呈極顯著正相關(guān)，咖啡因與蔗糖呈極顯著負(fù)相關(guān)。主成分分析結(jié)果表明，前4個(gè)主成分因子（PCI、PC2、PC3、PC4）包含了12個(gè)農(nóng)藝性狀，累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)69.17%，表明這些性狀是造成小粒種咖啡種質(zhì)多樣性的主要因素。聚類分析結(jié)果表明，60份小粒種咖啡種質(zhì)可分為兩個(gè)大類群，第1類群有53份資源，第Ⅱ類群有7份資源。第Ⅱ類群的鮮果重大，尤其是II-2類群的鮮果重和干豆重。[結(jié)論]60份咖啡種質(zhì)資源存在豐富的遺傳多樣性，可通過引種馴化、雜交、嫁接和分子育種等技術(shù)將其優(yōu)異基因延續(xù)下去。第Ⅱ-2類種質(zhì)的鮮果重和干豆重大，可作為選育和改良品種的基本材料。

關(guān)鍵詞：小粒種咖啡;農(nóng)藝性狀;遺傳多樣性;相關(guān)性分析;主成分分析;聚類分析

中圖分類號(hào)：S571.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A 文章編號(hào)：1008-0384（2019）12-1379-09

0 引言

[研究意義]咖啡與可可、茶并稱為三大飲料作物，主要分布在拉丁美洲、亞洲及非洲等熱帶地區(qū)，2017年咖啡收獲面積1.09×10萬hm、產(chǎn)量921萬t?？Х葘貱offea約有100多個(gè)種，生產(chǎn)栽培的主要有小粒種（Coffea arabica L）和中粒種（Coffeacanephora Pierre），小粒種約占總產(chǎn)量的60%、中粒種約占總產(chǎn)量的40%。我國引種咖啡已有100多年歷史，主要分布在云南、海南、四川、臺(tái)灣等地區(qū)，經(jīng)過十多年的發(fā)展，目前已形成云南、四川小粒種咖啡優(yōu)勢產(chǎn)區(qū)和海南中粒種咖啡優(yōu)勢產(chǎn)區(qū)，2018年全國種植面積12萬hm，年產(chǎn)量17萬t、農(nóng)業(yè)產(chǎn)值20多億元，是產(chǎn)區(qū)農(nóng)民脫貧致富的主要經(jīng)濟(jì)來源。然而，我國咖啡產(chǎn)業(yè)存在種植品種單一、品質(zhì)較差和比較效益偏低等突出問題，加強(qiáng)優(yōu)良咖啡品種選育勢在必行。因此，開展咖啡種質(zhì)資源鑒定評(píng)價(jià)及遺傳多樣性研究，對(duì)咖啡優(yōu)良品種的選育及咖啡產(chǎn)業(yè)發(fā)展均具有重要意義。[前人研究進(jìn)展]我國收集保存了大量的咖啡種質(zhì)資源并進(jìn)行分析評(píng)價(jià)。周華等通過對(duì)其根、莖、葉、花、果等進(jìn)行評(píng)價(jià)，明確了不同性狀的表型分類。白學(xué)慧等對(duì)96份咖啡種質(zhì)抗銹病性狀進(jìn)行了評(píng)價(jià)。一些學(xué)者采用基于DNA水平的各種分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)我國咖啡種質(zhì)資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析，明確其親緣關(guān)系。植物表型性狀標(biāo)記具有簡單、明顯和易于識(shí)別的特征，是進(jìn)行種質(zhì)資源鑒定和描述等研究最直接和最基本的方法和手段。聚類分析可揭示種質(zhì)資源個(gè)體間的遺傳相似性，還能表明類群間的遺傳差異和相互間的親緣關(guān)系。主成分分析可揭示種質(zhì)資源的生物學(xué)特點(diǎn)和生物學(xué)意義，能從多個(gè)因素指標(biāo)中找出數(shù)量較少并能控制所有變量因子的主成分，其中每個(gè)主成分都能反映原始變量的大部分信息，且所含信息互不重復(fù)。聚類分析和主成分分析可為作物種質(zhì)資源鑒定評(píng)價(jià)和分類提供參考依據(jù)，已在豌豆、陸地棉’、甜高粱等作物進(jìn)行了相關(guān)研究。[本研究切入點(diǎn)]表型性狀鑒定是咖啡種質(zhì)資源研究最基本的途徑，咖啡因、綠原酸、蛋白質(zhì)、脂肪及蔗糖等主要生化成分是咖啡風(fēng)味及營養(yǎng)價(jià)值的主要決定因素。雖然我國收集保存了大量的咖啡種質(zhì)資源，但許多種質(zhì)資源尚未充分鑒定評(píng)價(jià)與開發(fā)利用，因而加強(qiáng)咖啡種質(zhì)資源鑒定評(píng)價(jià)是咖啡新品種選育研究的重要基礎(chǔ)工作。目前未見應(yīng)用聚類分析及主成分分析方法對(duì)咖啡種質(zhì)資源主要農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀進(jìn)行鑒定和分析評(píng)價(jià)的報(bào)道。[擬解決的關(guān)鍵問題]本研究以60份小粒種咖啡種質(zhì)為試驗(yàn)材料，測量其8個(gè)農(nóng)藝性狀和5個(gè)品質(zhì)性狀，采用相關(guān)性分析、主成分分析和聚類分析相結(jié)合的方法，綜合分析咖啡種質(zhì)農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀的遺傳多樣性，以期篩選優(yōu)良種質(zhì)或發(fā)掘咖啡資源的優(yōu)異性狀，為有效保護(hù)咖啡種質(zhì)資源及品種改良提供參考。

1材料與方法

1.1 供試材料

供試材料為60份小粒種咖啡種質(zhì)（表1），取自德宏熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所（農(nóng)業(yè)部瑞麗咖啡種質(zhì)資源圃），主要為波邦、鐵皮卡、卡杜艾、卡蒂姆、卡杜拉、薩其姆等品種類型。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 農(nóng)藝性狀測定鮮果重（kg）：在果實(shí)盛熟期，采摘單株鮮果，并稱取其重量，待全株果實(shí)采收結(jié)束時(shí)統(tǒng)計(jì)單株成熟鮮果重量。

干豆重（g）：在果實(shí)盛熟期，采摘鮮果。去中果皮，洗掉種子表面果膠，置于50℃烘箱烘72h，至帶種皮豆含水量約為12%時(shí)，測得的數(shù)據(jù)即為干豆重。

種子大?。ㄩL、寬、厚）：隨機(jī)抽取20粒種子。用游標(biāo)卡尺測量每粒種子基部至頂部的長度，即為種子長;種子最大橫切面的最大直徑，即為種子寬;種子最大橫切面的最小直徑，即為種子厚。

鮮干比（%）：帶種皮豆樣品，去種皮制成標(biāo)準(zhǔn)商品豆，計(jì)算商品豆重占鮮果重的比例，重復(fù)3次，計(jì)算平均值。

百粒重（g）：隨機(jī)取100粒帶種皮豆稱重，重復(fù)3次，計(jì)算平均值。

出米率（%）：隨機(jī)稱?。?00+1）g帶種皮豆樣品，去種皮制成標(biāo)準(zhǔn)商品豆并稱重，計(jì)算商品豆質(zhì)量占帶種皮豆質(zhì)量的比例，重復(fù)3次，計(jì)算平均值。

1.2.2 品質(zhì)性狀測定咖啡因按GB/T 5009.139-2014的方法測定，綠原酸按GB/T 22250-2008的方法測定，蔗糖按GB 5009.8-2016第二法測定，蛋白質(zhì)用杜馬斯燃燒法測定。

脂肪測定采用項(xiàng)目組先前研制的“咖啡脂肪含量測定的超聲超離方法，將樣品與石油醚混合液超聲提取（60℃水浴、時(shí)間3～7min、功率250W），通過冷凍離心分離固相與液相（溫度4℃、轉(zhuǎn)速5000～8000r·min、時(shí)間5～9min），烘干固相物質(zhì)，計(jì)算脂肪含量。

1.2.3數(shù)據(jù)分析采用Microsoft Excel 2007軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理，計(jì)算平均值、標(biāo)準(zhǔn)差和變異系數(shù)，并參照謝向譽(yù)等的方法計(jì)算遺傳多樣性指數(shù)（H’），即H’=-∑PilnPi，Pi為性狀第i級(jí)別內(nèi)材料份數(shù)占總份數(shù)的百分比。采用SPSS 19.0軟件進(jìn)行相關(guān)性分析和主成分分析，利用k-均值分類法進(jìn)行聚類分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 農(nóng)藝性狀表型評(píng)價(jià)

不同咖啡種質(zhì)農(nóng)藝性狀變化較大，統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果見表2。鮮果重變幅為0.79～2.97kg，平均1.87kg;干豆重變幅為300.49～592.68g，平均390.58g;鮮干比變幅為16.55%～48.79%，平均21.50%;種子長變幅為10.74～12.69mm，平均11.74mm;種子寬變幅為7.36～9.05mm，平均7.98mm;種子厚變幅為4.40～5.70mm，平均4.88mm;百粒重變幅為15.06～27.13g，平均19.51g;出米率變幅為78.63%～86.60%，平均84.01%。

由表2可知，60份咖啡種質(zhì)農(nóng)藝性狀存在很大差異，8個(gè)農(nóng)藝性狀的變異系數(shù)變幅為1.97%～25.15%，差異非常明顯。變異系數(shù)的大小順序?yàn)轷r干比>鮮果重>干豆重>百粒重>種子厚>種子寬>種子長>出米率。8個(gè)農(nóng)藝性狀中，變異系數(shù)以鮮干比最高（變異系數(shù)為25.15%），鮮干比最大值為48.79%、最小值為16.55%;其次是鮮果重（變異系數(shù)為19.85%），鮮果重最大值為2.97kg、最小值為0.79kg;以出米率變異系數(shù)最低（變異系數(shù)為1.97%），出米率最大值為86.80%、最小值為78.63%。鮮干比、鮮果重、干豆重變異系數(shù)大，說明這些性狀存在著豐富的變異，具有較好的遺傳改良基礎(chǔ)。出米率、種子長、種子厚的變異系數(shù)較小，說明他們一致性較強(qiáng)，具有較穩(wěn)定的遺傳特性。

8個(gè)農(nóng)藝性狀的遺傳多樣性指數(shù)在1.43～2.04，其遺傳多樣性指數(shù)由高到低依次為種子長>種子厚>種子寬、出米率>干豆重>鮮果重、百粒重>鮮干比。種子長的遺傳多樣性指數(shù)最高，其后依次是種子厚、種子寬和出米率，說明種子大小具有豐富的遺傳多樣性，但由于他們的變異系數(shù)較小，基于種子大小對(duì)咖啡種質(zhì)資源改良篩選潛力較小。鮮干比的遺傳多樣性指數(shù)最低，遺傳多樣性較窄。綜上所述，60份咖啡種質(zhì)資源的8個(gè)農(nóng)藝性狀存在較明顯的差異，表現(xiàn)出不同程度的遺傳多樣性。

2.2 品質(zhì)性狀評(píng)價(jià)

不同咖啡種質(zhì)品質(zhì)性狀變化較大，統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果見表3。蛋白質(zhì)變幅為11.98%～15.43%，平均13.40%;脂肪變幅為9.03%～15.91%，平均13.02%;綠原酸變幅為8.10～24.56mg·g，平均16.59mg·g;咖啡因變幅為7.62～11.80mg·g，平均9.89mg·g;蔗糖變幅為7.10～10.00g·hg，平均8.48g·hg。

60份咖啡種質(zhì)品質(zhì)性狀存在很大差異，蛋白質(zhì)、綠原酸等5個(gè)性狀的變異系數(shù)為5.2%～22.68%，差異非常明顯。在5個(gè)品質(zhì)性狀表現(xiàn)中，變異系數(shù)的大小順序?yàn)榫G原酸>脂肪>咖啡因>蔗糖>蛋白質(zhì)。綠原酸變異系數(shù)最大，最高含量為24.56mg·g、最低含量僅為8.10mg·g、平均值為16.59mg·g，說明綠原酸離散程度較大，穩(wěn)定性較差，具有較好的遺傳改良基礎(chǔ);脂肪的變異系數(shù)次之，為12.40%;咖啡因和蔗糖的變異系數(shù)分別為9.84%和9.42%;蛋白質(zhì)變異系數(shù)最小，為5.20%。蛋白質(zhì)、蔗糖、咖啡因的變異系數(shù)均較小，說明他們一致性較強(qiáng)，具有較穩(wěn)定的遺傳特性。

5個(gè)品質(zhì)性狀遺傳多樣性指數(shù)在0.55～2.07，其遺傳多樣性指數(shù)由高到低依次為綠原酸>脂肪>蛋白質(zhì)>咖啡因>蔗糖。綠原酸遺傳多樣性指數(shù)最高（2.07），說明具有豐富的遺傳多樣性，而且其變異系數(shù)也最大（22.68%），表明基于綠原酸對(duì)咖啡種質(zhì)資源篩選改良潛力較大。脂肪（2.06）、蛋白質(zhì)（2.05）和咖啡因（1.99）的遺傳多樣性指數(shù)也較高，說明這些性狀具有豐富的遺傳多樣性，但其變異系數(shù)較小，基于這些性狀對(duì)咖啡種質(zhì)資源進(jìn)行改良篩選的潛力較有限。蔗糖的遺傳多樣性指數(shù)最低，說明供試咖啡種質(zhì)在蔗糖方面的遺傳多樣性最小。綜上所述，供試咖啡種質(zhì)的主要品質(zhì)性狀具有豐富的遺傳多樣性。

2.3 農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀的相關(guān)性分析

對(duì)咖啡農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和分析（表4），結(jié)果表明，鮮果重與綠原酸呈極顯著負(fù)相關(guān);干豆重與鮮干比、種子長、蛋白質(zhì)呈極顯著正相關(guān)，與出米率呈顯著正相關(guān)，其中與種子長和鮮干比的相關(guān)系數(shù)分別為0.755和0.714，明顯大于與其他性狀間的相關(guān)系數(shù)，說明干豆重與種子長和鮮干比存在緊密關(guān)聯(lián);鮮干比與種子長呈極顯著正相關(guān);種子長與百粒重、出米率、蛋白質(zhì)呈極顯著正相關(guān)，與蔗糖呈顯著正相關(guān);種子厚與百粒重、出米率、蛋白質(zhì)呈極顯著正相關(guān)，與脂肪呈顯著正相關(guān);百粒重與出米率、蛋白質(zhì)、脂肪呈極顯著正相關(guān);出米率與蛋白質(zhì)、脂肪呈極顯著正相關(guān);蛋白質(zhì)與脂肪呈極顯著正相關(guān);咖啡因與蔗糖呈極顯著負(fù)相關(guān)。其余性狀間相關(guān)不顯著。

綜上所述，鮮果重越大，綠原酸含量越低;干豆重越大，鮮干比和種子長越大，出米率和蛋白質(zhì)含量也越高;種子越長越厚，百粒重、出米率也越大，蛋白質(zhì)含量也越高;出米率越高，蛋白質(zhì)、脂肪含量越高;蛋白質(zhì)含量越高，脂肪含量越高;咖啡因含量越高，蔗糖含量越低。

2.4主成分分析

8個(gè)農(nóng)藝性狀和5個(gè)品質(zhì)性狀的主成分分析結(jié)果（表5）顯示，前4個(gè)主成分（PCI+PC2+PC3+PC4）累計(jì)貢獻(xiàn)率為69.17%。PCI貢獻(xiàn)率為29.17%，種子長、種子寬、種子厚、百粒重和出米率在第1主成分有較高的載荷，特征值中貢獻(xiàn)最大的是百粒重，故第1主成分為百粒重的構(gòu)成因子;PC2貢獻(xiàn)率為16.25%，鮮果重、干豆重、脂肪、綠原酸在第2主成分有較高的載荷，特征值中貢獻(xiàn)最大的是鮮果重，故第2主成分為鮮果重的構(gòu)成因子;PC3貢獻(xiàn)率為12.35%，蛋白質(zhì)、咖啡因在第3主成分有較高的載荷，其特征向量值中蛋白質(zhì)貢獻(xiàn)最大，故第3主成分為蛋白質(zhì)構(gòu)成因子;PC4貢獻(xiàn)率為10.86%，鮮干比、綠原酸在第4主成分有較高的載荷，特征向量值中鮮干比貢獻(xiàn)最大，故第4主成分為鮮干比構(gòu)成因子?？梢姡?個(gè)主成分的12個(gè)性狀是構(gòu)成小粒種咖啡種質(zhì)多樣性的主要因素，也是小粒種咖啡育種中應(yīng)重點(diǎn)考慮的性狀指標(biāo)。

2.5 聚類分析

基于農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀差異，對(duì)60份小粒種咖啡資源進(jìn)行聚類分析，結(jié)果如圖1所示。在遺傳距離為25.0處，60份小粒種咖啡資源分為兩個(gè)大類群，第I類有53份資源，第Ⅱ類有7份資源，主要表現(xiàn)為鮮果重差異。第I類資源鮮果重均在2.20kg以下，第Ⅱ類資源鮮果重均在2.20kg以上?？梢姡×７N咖啡種質(zhì)資源的鮮果重存在明顯的差異。第1類又分為2個(gè)亞類，第I-1類包括49份資源，包含了卡蒂姆和薩其姆及未知品種類型的大多數(shù)資源，主要表現(xiàn)為比第1-2類有較大的鮮果重和種子寬，但綠原酸含量偏低，均在15.59mg·g以下。第I-1類又分為a和b兩個(gè)分支，a分支較b分支鮮果重大，綠原酸、咖啡因含量高。第1-2類有4份資源，分別是180、204、282和284，主要特點(diǎn)是鮮果重小，均在1.30kg以下。第Ⅱ類又分為兩個(gè)亞類，第Ⅱ-1類有3份資源，分別是10、51和88;第Ⅱ-2類有4份資源，分別是55、78、93和140。第Ⅱ-2類較第Ⅱ-1類具有更高的鮮果重和干豆重，鮮果重均在2.60kg以上，干豆重均在538.00g以上。綜上所述，第Ⅱ類鮮果重大，尤其是II-2類，可作為選育和改良品種的基本材料。

3討論與結(jié)論

遺傳多樣性是生物多樣性的基礎(chǔ)，生物遺傳變異均發(fā)生在分子水平，在不斷進(jìn)化過程中形成了豐富的遺傳多樣性。種質(zhì)資源遺傳差異大小直接影響性狀遺傳改良和研究利用的效果，優(yōu)異基因能否被發(fā)掘與有效利用影響著新品種選育或新材料創(chuàng)制。目前，我國云南和海南等地已開展對(duì)咖啡種質(zhì)資源的收集保存，周華等的研究結(jié)果表明了不同咖啡種質(zhì)資源之間存在豐富的遺傳多樣性，閆林等、黃麗芳等、王曉陽等的研究結(jié)果也表明小粒種咖啡遺傳關(guān)系較緊密，但從農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀方面進(jìn)行種質(zhì)資源遺傳多樣性分析還未見報(bào)道。變異系數(shù)反映了某性狀數(shù)據(jù)的離散程度，其大小與性狀的變異范圍呈正相關(guān)，變異系數(shù)越大，表明性狀的變異程度越大。本研究對(duì)60份小粒種咖啡種質(zhì)資源的8個(gè)農(nóng)藝性狀和5個(gè)品質(zhì)性狀進(jìn)行分析比較，鮮干比、鮮果重、干豆重、綠原酸的離散程度大，穩(wěn)定性差，具有較好的遺傳改良基礎(chǔ);出米率和蛋白質(zhì)的離散程度較小，性狀表現(xiàn)較為穩(wěn)定。遺傳多樣性信息指數(shù)是評(píng)價(jià)種質(zhì)資源的主要指標(biāo)之一，值越高，表明某性狀的多樣性越豐富。本研究中平均遺傳多樣性指數(shù)1.82，其中種子長（2.04）、綠原酸（2.07）、脂肪（2.06）、蛋白質(zhì)（2.05）遺傳多樣性指數(shù)較大，鮮干比（1.43）和蔗糖（0.55）較小。不同咖啡種質(zhì)間的性狀差異較大，表現(xiàn)出豐富的遺傳多樣性，且改良潛力大。

主成分分析是將多個(gè)變量轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個(gè)綜合因子，每個(gè)主成分基本上又能反映原始變量的大部分信息，其所含信息互不重復(fù)。本研究的前4個(gè)主成分提供了原性狀69.17%的信息，反映了所有表型性狀的大部分相關(guān)信息。種子厚、百粒重、鮮果重、鮮干比、蛋白質(zhì)對(duì)咖啡性狀多樣性構(gòu)成起主要作用，可見咖啡種質(zhì)資源的分類受到多個(gè)性狀的共同影響。這些性狀不僅可作為咖啡種質(zhì)鑒定評(píng)價(jià)的重要性狀，也可作為區(qū)分咖啡種質(zhì)資源的主要性狀。前4個(gè)主成分間包含的性狀信息具有一定的相關(guān)性，且各性狀類型差異較大，各主成分性狀載荷值反映了主要性狀的育種選擇潛力。綜上所述，在育種工作中，抓住種子厚、百粒重、鮮果重、鮮干比、蛋白質(zhì)等主要因子，可望縮短選育新品種或新品系的年限。

農(nóng)藝性狀大多受多基因控制，不同性狀間存在不同程度的相關(guān)性，某一性狀的改變會(huì)導(dǎo)致其他相關(guān)性狀發(fā)生變化，因此在育種過程中改良重要性狀的同時(shí)可同步改良次要性狀。本研究發(fā)現(xiàn)，種子長和種子厚與百粒重、出米率、蛋白質(zhì)均呈極顯著正相關(guān)，分別與蔗糖和脂肪呈顯著正相關(guān);出米率與蛋白質(zhì)、脂肪呈極顯著正相關(guān);咖啡因與蔗糖呈極顯著負(fù)相關(guān)。說明在咖啡品種選育過程中，通過篩選種子長和厚的種質(zhì)作為親本材料，可增加百粒重、出米率、蛋白質(zhì)、蔗糖和脂肪等產(chǎn)量性狀和品質(zhì)性狀;篩選咖啡因含量低的種質(zhì)作為親本材料，可增加咖啡蔗糖含量，提升品質(zhì)。

本研究利用聚類分析法對(duì)60份咖啡種質(zhì)的13個(gè)性狀進(jìn)行了聚類分析，讓性狀相近的聚為一類，使其同質(zhì)化程度最高。每個(gè)組群具有特定的形態(tài)特征，以便更系統(tǒng)地分析咖啡種質(zhì)資源的特點(diǎn)。第I類為單株鮮果重小的資源材料，這類材料具有較小的鮮果重和種子寬，綠原酸含量偏低等特點(diǎn)。第Ⅱ類的鮮果重大，具有較大的鮮果重和種子寬，但綠原酸含量偏低?？梢?，小粒種咖啡種質(zhì)資源的鮮果重存在明顯的差異，尤其是Ⅱ-2類的4份種質(zhì)，鮮果重和干豆重最大，可作為新品種選育和改良的基本材料。

60份咖啡種質(zhì)資源存在豐富的遺傳多樣性，可通過引種馴化、雜交、嫁接和分子育種等技術(shù)把其優(yōu)異基因延續(xù)下去。針對(duì)現(xiàn)有咖啡種質(zhì)資源具有豐富的農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀多樣性等特征，今后應(yīng)在現(xiàn)有研究的基礎(chǔ)上，結(jié)合全基因組測序和代謝組學(xué)等方法，對(duì)各表型性狀進(jìn)行精準(zhǔn)鑒定、關(guān)聯(lián)分析，挖掘重要性狀優(yōu)異基因，并與常規(guī)育種方法相結(jié)合，加快我國咖啡種質(zhì)資源的創(chuàng)新利用和新品種選育進(jìn)程。