張青松 朱傳衛(wèi) 王三六 趙吉光 沈俊 周琳
安徽宣城市中心醫(yī)院1檢驗(yàn)科,2腫瘤科,3普外科(安徽宣城242000);4江蘇省太湖康復(fù)醫(yī)院檢驗(yàn)科(江蘇無(wú)錫214086)
胃癌(gastric cancer,GC)是我國(guó)高發(fā)的腫瘤之一,據(jù)最新統(tǒng)計(jì)顯示我國(guó)胃癌的發(fā)病率在腫瘤中位于第二位(男性第二,女性第四)[1],嚴(yán)重地影響了群眾的健康。胃癌是一個(gè)復(fù)雜的疾病,其發(fā)病是一個(gè)慢性的病理過(guò)程?,F(xiàn)有研究顯示,胃癌的發(fā)病與是環(huán)境因素和遺傳因素相關(guān)。其中幽門(mén)螺桿菌(helicobacter pylori,Hp)感染被證實(shí)為明確的胃癌致癌因子,被定為Ⅰ類(lèi)致癌因素。
整合素是細(xì)胞表面的異二聚體蛋白家族,其介導(dǎo)細(xì)胞與基質(zhì)及細(xì)胞與細(xì)胞之間的相互作用。該家族蛋白的18 個(gè)α-亞單位及8 個(gè)β-亞單位形成25 種整合素[2]。整合素介導(dǎo)的信號(hào)對(duì)細(xì)胞的粘附、擴(kuò)散、遷移、增殖、分化、等都起到關(guān)鍵作用。此外,其還與多種腫瘤的發(fā)生及轉(zhuǎn)移相關(guān)[3-4]。研究顯示整合素α1β1 的表達(dá)上調(diào)與胃腸道粘膜的炎癥相關(guān)并與胃癌的發(fā)生相關(guān)[5]。研究[6-7]顯示整合素的遺傳多態(tài)性與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),亦有研究顯示[8]其與胃癌的治療及預(yù)后相關(guān)。因此進(jìn)一步探討整合素家族基因的遺傳多樣性與胃癌的發(fā)病及病理的相關(guān)性對(duì)于胃癌的發(fā)病機(jī)制及預(yù)后判斷有著重要的臨床應(yīng)用價(jià)值。
1.1 研究對(duì)象 研究招募2013年7月至2018年6月于安徽宣城市中心醫(yī)院經(jīng)病理診斷為胃癌的患者設(shè)為病例組。同期招募在醫(yī)院健康體檢結(jié)果且無(wú)消化道疾病史者為健康對(duì)照組。上述二組人群均抽取以肝素抗凝的靜脈血,400 ×g 離心10 min,然后分別收集血細(xì)胞與血漿,凍存于-80 ℃冰箱用于后續(xù)抗體檢測(cè)及基因分型。病例組組成為男186 例,女67 例,平均年齡(64.63 ± 12.17)歲。健康對(duì)照組組成為男213 例,女94 例,平均年齡(63.6±12.30)歲。
1.2 試劑和儀器 DNA 提取試劑盒購(gòu)自西安金磁納米生物技術(shù)有限公司;PCR 擴(kuò)增儀為美國(guó)ABI 公 司GeneAmp PCR System 9700 型。蛋白 核 酸檢測(cè)儀購(gòu)自美國(guó)Thermo 公司;MassARRAY 平臺(tái)所用的點(diǎn)樣儀及質(zhì)譜儀為美國(guó)Sequenom 公司產(chǎn)品;引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成;Iplex Gold Reagent kit 為美國(guó)Sequenom 公司產(chǎn)品。幽門(mén)螺桿菌檢測(cè)試劑盒由上海凱創(chuàng)生物技術(shù)公司產(chǎn)品。
1.3 樣本DNA提取 所有受試者取抗凝全血3 mL分離得到的白細(xì)胞,基因組DNA 提取采用GoldMag全血基因組DNA 提取試劑盒,按照試劑說(shuō)明書(shū)步驟進(jìn)行,主要步驟如下:(1)破碎紅細(xì)胞:向加入紅細(xì)胞裂解液,充分裂解后以500 ×g離心10 min,棄上清,留下沉淀;(2)破碎白細(xì)胞:向步驟1 管中加入白細(xì)胞裂解液及蛋白酶K,用以破碎白細(xì)胞;(3)清洗磁粒:取1 mL 充分搖勻的磁性微粒加入到一新離心管中,置于磁性分離器上,待溶液澄清后棄去上清,并向離心管中按一定的比例加入結(jié)合液BC,將離心管置于渦旋振蕩器上渦旋混勻15 s 后備用;(4)結(jié)合:將步驟3 中處理好的磁性微粒轉(zhuǎn)移到裝有步驟2 中已裂解的樣本離心管中,將離心管置于渦旋振蕩器上渦旋混勻15 s 后室溫放置5 min,然后將離心管置于磁性分離器上磁性分離5 min,待溶液澄清后棄去上清;(5)清洗Ⅰ:向離心管中加入清洗液并混勻15 s后置于磁性分離器上磁性分離,待溶液澄清后棄上清;(6)清洗Ⅱ:向離心管中加入清洗液Ⅱ,混勻15 s 后置于磁性分離器分離棄上清;(7)洗脫:加入洗脫液,混勻15 s 后置于磁性分離器上,收集上清中的DNA 到1.5 mL 離心管中,將離心管置于-80 ℃冰箱中保存?zhèn)溆??;蚪M提取后采用NaniDrop2000c 型蛋白核酸檢測(cè)儀并分析其純度與濃度。
1.4 多態(tài)性位點(diǎn)的選擇與分析基因多態(tài)性位點(diǎn)選擇 以中國(guó)人群最小等位基因頻率為0.05?;蚨鄳B(tài)性位點(diǎn)位于整合素家族基因上,見(jiàn)表1。所選擇的基因分型采用美國(guó)Sequenom 公司MassARRAY 平臺(tái)進(jìn)行分析。該平臺(tái)分析基因型主要為以下幾個(gè)步驟:(1)PCR 擴(kuò)增反應(yīng):采用多重PCR 擴(kuò)增含有多態(tài)性位點(diǎn)的序列片斷;(2)SAP 純化:SAP是一個(gè)純化的過(guò)程,主要采用蝦堿酶(shrimp alkaline phosphatase,SAP)來(lái)消化PCR 擴(kuò)增體系中多與的dNTPs 和引物;(3)Iplex 單堿基延伸反應(yīng):利用多重PCR 擴(kuò)增后的產(chǎn)物,針對(duì)該位點(diǎn)再設(shè)計(jì)一條延伸引物,延伸引物在iplex 酶的作用下進(jìn)行單堿基延伸反應(yīng)。根據(jù)SNP 位點(diǎn)的不同,探針將結(jié)合不同的ddNTP,從而具有不同的分子量,質(zhì)譜儀即可檢測(cè)出這種分子量差異,從而實(shí)現(xiàn)SNP 分型的目的;(4)樹(shù)脂純化:向每個(gè)反應(yīng)體系中加入Clean Resin(樹(shù)脂),混勻15 min 后離心5 min,其目的是為了去除前三步反應(yīng)中殘余的雜質(zhì);(5)點(diǎn)樣:使用MassArray 點(diǎn)樣儀將制備好的樣本點(diǎn)到檢測(cè)芯片的相應(yīng)位置上;(6)質(zhì)譜分析:利用MALDI產(chǎn)生離子常用飛行時(shí)間(Time-of-Flight,TOF)檢測(cè)器來(lái)檢測(cè)不同的核酸片斷,不同的等位基因會(huì)產(chǎn)生不同的質(zhì)譜牲,從而得到相應(yīng)的檢測(cè)結(jié)果;(7)結(jié)果分析:使用SequenomTyper 4.0 Software 觀看和分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果,得出不同的基因型。
表1 多態(tài)性位點(diǎn)信息Tab.1 Information of polymorphisms
1.5 Hp 感染檢測(cè) 采用膠體金法,嚴(yán)格按照檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書(shū)操作并判讀結(jié)果。主要步驟如下:用加樣吸管往加樣孔內(nèi)垂直滴加1 滴(大約20 μL)。然后立即垂直加入3~4 滴樣品稀釋液,加樣后5 min 判斷結(jié)果;判讀陽(yáng)性為質(zhì)控線(C 線)和檢測(cè)線(T 線)各有一條紅色線條出現(xiàn),表明樣本中存在胃幽門(mén)螺旋桿菌尿素酶抗體。判讀陰性為只有質(zhì)控線(C 線)有一條紅色線條,而檢測(cè)線(T 線)無(wú)紅色線條出現(xiàn),則指示胃幽門(mén)螺旋桿菌尿素酶抗體或胃幽門(mén)螺旋桿菌尿素酶抗體低于檢出水平。
1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 用SPSS 11.0 軟件包進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,組間比較采用獨(dú)立t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料用例數(shù)、百分比表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。對(duì)照組的各多態(tài)性位點(diǎn)的基因型采用χ2檢驗(yàn)進(jìn)行Hardy-Weinberg 平衡檢測(cè)。采用二分類(lèi)因變量Logistic 回歸分析多態(tài)性位點(diǎn)的與胃癌風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,以風(fēng)險(xiǎn)比(OR)及95%可信區(qū)間(CI)表示相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度,以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 一般資料 病例組及健康對(duì)照組的性別、年齡、吸煙等方面差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),但病例組的飲酒者比例顯著高于對(duì)照組,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。對(duì)照組中H.pylori 感染陽(yáng)性為151 例(49.19%),病例組為132 例陽(yáng)性(52.17%),二組差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。經(jīng)對(duì)對(duì)照組進(jìn)行Hardy-Weinberg 遺傳平衡(HWE)檢驗(yàn),結(jié)果顯示各位點(diǎn)均符合該定律(P>0.05),認(rèn)為具有群體代表性,見(jiàn)表2。病例組依臨床分期T1-T2 為79 例(31.23%),T3-T4 為174 例(68.77%)。依據(jù)臨床部位為賁門(mén)癌80 例(31.62%),非賁門(mén)癌173 例(68.38%)。
表2 胃癌組及健康對(duì)照組的臨床資料Tab.2 Clinical characteristics of participants 例(%)
2.2 各基因型在病例組及對(duì)照組中的分布及其與胃癌易感性關(guān)系 ITGA1rs2447867 位點(diǎn)在病例與對(duì)照組的分布有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,Logistic 回歸分析顯示rs244786TC(校正后OR= 1.69,95%CI:1.16~2.45,χ2=7.574,P=0.006)、TT(校正后OR=2.23,95%CI:1.25~4.00,χ2=7.303,P=0.007)及TC/TT(校正后OR=1.75,95%CI:1.23~2.50,χ2=9.411,P= 0.002)基因型與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。其他各位點(diǎn)的基因型分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見(jiàn)表3。
2.3 ITGA1rs2447867 位點(diǎn)的亞組分析 ITGA1 rs2447867 位點(diǎn)經(jīng)亞組進(jìn)行l(wèi)ogistic 回歸分析顯示,年齡>60 歲組各基因型均胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(TCvs.CC:校正后OR=2.05,95%CI:1.27~2.31,χ2= 8.507,P= 0.003;TTvs.CC:校正后OR= 2.58,95%CI:1.18~5.63,χ2= 5.667,P= 0.017;TC/TTvs.CC:校正后OR= 2.07,95%CI:1.31~3.28,χ2=9.702,P= 0.002),而在年齡≤60 歲組,僅有TT 基因型與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(TTvs.CC:校正后OR=2.90,95%CI:1.09~7.67,χ2=1.580,P=0.032)。此外在腫瘤部位分組中亦顯示,在非賁門(mén)癌中,各基因型均與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(TCvs.CC:校正后OR= 1.78,95%CI:1.17~2.72,χ2=7.191,P=0.007;TTvs.CC:校正后OR=2.68,95%CI:1.41~5.08,χ2= 9.080,P= 0.003;TC/TTvs.CC:校正后OR=1.90,95%CI:1.27~2.84,χ2=9.746,P=0.002),而在賁門(mén)癌中見(jiàn)未相關(guān)性。該位點(diǎn)在其他分組中分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見(jiàn)表4。
本研究采用病例-對(duì)照分析了整合素基因家族5 個(gè)基因的多態(tài)性位點(diǎn)與胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。結(jié)果顯示,ITGA1rs2447867 多態(tài)性位點(diǎn)是胃癌發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)因素。進(jìn)一步亞組分析顯示,該位點(diǎn)與年齡>60 歲的人群胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),且與非賁門(mén)癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。
ITGA1 位于染色體5q11.2,其編碼整合素的α1 亞單位。研究顯示其與胃癌細(xì)胞粘附及轉(zhuǎn)移相關(guān)[9]。此外,在韓國(guó)人群的一項(xiàng)研究中也發(fā)現(xiàn)ITGA1rs2447867 與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)[7],與本研究結(jié)果相一致。對(duì)其功能研究推測(cè)該位點(diǎn)是一個(gè)外顯子拼接增強(qiáng)子,導(dǎo)致蛋白翻譯后剪切的異常,因此與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)[7]。整合素是細(xì)胞粘附分子主要倡導(dǎo)細(xì)胞之間、細(xì)胞與胞外基質(zhì)及細(xì)胞與病原體的相互作用,其在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用,如介導(dǎo)白細(xì)胞遷移、突觸形成、吞噬作用等[10],因此在病原體感染導(dǎo)致胃部疾病進(jìn)展乃至胃癌的發(fā)生過(guò)程中,整合素作為介導(dǎo)細(xì)胞間的作用及免疫系統(tǒng)的改變發(fā)揮著重要作用[11]。ITGA1編碼整合素受體的α1 亞單位,其與β1 亞單位形成一個(gè)異源二聚體進(jìn)而與膠原及層粘連蛋白結(jié)合,參與細(xì)胞之間的粘附并在介導(dǎo)免疫與纖維化的發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮作用。該基因還被證實(shí)與膠原相互作用,調(diào)節(jié)基質(zhì)金屬蛋白的活性與腫瘤的發(fā)生相關(guān)[12]。亦有研究報(bào)道,整合素α1β1 在胃腸道炎癥過(guò)程中表達(dá)上調(diào),進(jìn)而與胃癌的發(fā)生有潛在的關(guān)聯(lián)[5]。此外,細(xì)胞及臨床研究進(jìn)一步證實(shí)整合素α1 亞單位陽(yáng)性胃癌細(xì)胞與細(xì)胞外基質(zhì)的粘附是其腹部轉(zhuǎn)移的重要過(guò)程[9,13]。綜合以上,雖然ITGA1 rs2447867 多態(tài)性位點(diǎn)的功能尚待研究,但現(xiàn)有研究顯示ITGA1 在胃癌的發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用,可以通過(guò)多個(gè)潛在的機(jī)制導(dǎo)致胃癌的發(fā)生。ITGA1rs2432143 位于ITGA1 基因內(nèi)含子1 內(nèi),在韓國(guó)人群中報(bào)道該位點(diǎn)與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)[7],而該位點(diǎn)的功能目前還沒(méi)有相關(guān)報(bào)道。本研究沒(méi)有發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),該位點(diǎn)目前還未見(jiàn)相關(guān)的研究報(bào)道,有待于今后的研究進(jìn)一步證實(shí)。
表3 基因型分布及其與胃癌風(fēng)險(xiǎn)性的關(guān)系Tab.3 Genotypes distribution and it′s association with GC risk例(%)
rs1126643 是一個(gè)位于ITGA2 外顯子7 的C/T基因多態(tài)性,導(dǎo)致一個(gè)無(wú)義的多態(tài)性位點(diǎn)(Phe253Phe)?,F(xiàn)有研究提示該多態(tài)性位點(diǎn)也心血管疾病及阿司匹林藥效有關(guān)[14]。迄今為止,尚未見(jiàn)其與胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性研究。rs3809865 與rs2675 分別位于ITGB3 基因ITGB5 基因的3′非編碼區(qū)(3′UTR)與基因的表達(dá)有潛在的相關(guān)性[15],有研究報(bào)道二個(gè)位點(diǎn)與口腔鱗癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)[16]。rs17664 位點(diǎn)ITGA6 基因的3′UTR 區(qū),有研究報(bào)道rs3809865,rs2675 及rs17664 而亦有研究報(bào)道這二個(gè)位點(diǎn)與胃癌的發(fā)病有潛在的相關(guān)性[17],與本研究的結(jié)論不一致,這可能與研究的方法(該研究采用高分辨溶解曲線法)、納入研究的群體的年齡及地區(qū)(四川)的差別有關(guān)。上述研究結(jié)果目前鮮有研究報(bào)道,有待于進(jìn)一步證實(shí)。
表4 ITGA1rs2447867 位點(diǎn)與胃癌風(fēng)險(xiǎn)的亞組分析Tab.4 Subgroup analysis of the assoication between ITGA1rs2447867 and GC risk
本研究還通過(guò)亞組分析進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)ITGA1-rs2447867 多態(tài)性位點(diǎn)與胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)系與年齡及胃癌的發(fā)生部位相關(guān),該位點(diǎn)與在年齡較大人群(>60 歲)的胃癌及與非賁門(mén)癌相關(guān)胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。眾所周知,個(gè)體的年齡越大,所受到環(huán)境因素的影響積累就越多,這其中其中環(huán)境因素(如吸煙、飲酒、Hp 感染)、遺傳因素及其二者的相互作用是胃癌發(fā)病的重要原因[18-19],隨著年齡的增長(zhǎng)個(gè)體的環(huán)境暴露時(shí)間增加,此會(huì)導(dǎo)致個(gè)體的胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加。就胃癌的發(fā)病部位而論,有研究顯示賁門(mén)癌與非賁門(mén)癌在致病因素及分子表型方面有顯著的差異[20],且二者在發(fā)病因素上亦有很大差異,如肥胖[21]、Hp 感染[22]等因素在二者發(fā)病的過(guò)程中起著不同的作用。此外,研究[23]還顯示,二類(lèi)胃癌在免疫表型上有很大差異,非賁門(mén)癌的發(fā)生更傾向于與炎癥相關(guān)?;谖覈?guó)人群的流行病學(xué)調(diào)查顯示,既往患消化道潰瘍、慢性胃炎為非賁門(mén)癌最強(qiáng)的危險(xiǎn)因素[24],提示炎癥在非賁門(mén)癌的發(fā)病中發(fā)揮重要作用,而ITGA1 在介導(dǎo)炎癥過(guò)程發(fā)揮重要作用,以上結(jié)論與本研究ITGA1rs2447867 與非賁門(mén)癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的結(jié)果一致。
胃癌的發(fā)病因素復(fù)雜,本研究探討的ITGA1rs2447867 位點(diǎn)的功能尚沒(méi)有研究報(bào)道。另外,本研究所納入的病例還相對(duì)較少,這些都是本研究的薄弱之處。本研究的結(jié)果還有待于更大樣本量的分子流行病學(xué)研究及相關(guān)的功能研究的證實(shí)。
綜合以上,本研究結(jié)果顯示ITGA1rs2447867多態(tài)性位點(diǎn)與胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),且風(fēng)險(xiǎn)在年齡>60 歲人群中增大,該位點(diǎn)與非賁門(mén)胃癌有更強(qiáng)的相關(guān)性。本研究的結(jié)論為胃癌發(fā)病的基礎(chǔ)研究提供了分子流病學(xué)資料,為胃癌發(fā)病的分子機(jī)制研究提供了臨床資料。