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    白僵菌屬分類研究進(jìn)展

    2019-04-25 03:30:18郭東升翟穎妍任廣偉成巨龍安德榮
    關(guān)鍵詞:菌物白僵菌分生孢子

    郭東升,翟穎妍,任廣偉,成巨龍 ,劉 云 ,安德榮

    (1.西北農(nóng)林科技大學(xué) 植物保護(hù)學(xué)院,陜西楊凌 712100;2.中國(guó)煙草總公司 青州煙草研究所,山東青州 262500;3.陜西省煙草公司,西安 710000;4.陜西省煙草公司 寶雞市公司, 陜西寶雞 721000)

    白僵菌(Cordycipitaceae:Beauveria) 在180多年前作為家蠶病原物第一次被報(bào)道。當(dāng)然,那時(shí)候人們還不叫這種病原物為白僵菌。在菌物分類還沒(méi)有發(fā)展的年代里,人們認(rèn)為這種“病原物”是有害的,因?yàn)樗鼘?duì)家蠶養(yǎng)殖業(yè)造成巨大打擊。現(xiàn)在提到白僵菌就要說(shuō)明一下它是哪種白僵菌了。

    1912年,Beauverie建立白僵菌屬后,白僵菌的屬內(nèi)種不斷增加。目前所說(shuō)的白僵菌除從智利火山灰中分離的B.vermiconia和中國(guó)青藏高原土壤樣品中分離的B.malawiensis還未發(fā)現(xiàn)昆蟲(chóng)寄主,其余都屬于兼性死體營(yíng)養(yǎng)型的昆蟲(chóng)病原真菌。白僵菌可以存在于多種生態(tài)環(huán)境中。從現(xiàn)在的報(bào)道可以看到白僵菌可在土壤中[1]及植物根際存活[2];也可以內(nèi)生于植物[3];當(dāng)然,最多的是作為昆蟲(chóng)病原物在昆蟲(chóng)上被發(fā)現(xiàn)報(bào)道。白僵菌以腐生菌絲或休眠的繁殖體存在于土壤或內(nèi)生于植物中,直到它在周?chē)奈h(huán)境中黏附到合適的寄主上[4-5]。和近似屬的綠僵菌一樣,白僵菌也是最常見(jiàn)的昆蟲(chóng)病原真菌,擁有廣泛寄主范圍,能夠侵染超過(guò)700多個(gè)種類的昆蟲(chóng)[6]。白僵菌的寄主范圍已早不局限于家蠶了,它寄主范圍內(nèi)的昆蟲(chóng)還包括能給農(nóng)業(yè)和森林帶來(lái)巨大經(jīng)濟(jì)損失的重要害蟲(chóng)[7]、一些病害媒介昆蟲(chóng)[8]、蟑螂[9]、蜱[10]和蜘蛛[11]。而白僵菌菌株的分離一般是利用選擇培養(yǎng)基或昆蟲(chóng)誘餌法(如,大蠟螟誘餌法,菜粉蟲(chóng)誘餌法等)從土壤或昆蟲(chóng)尸體中分離出來(lái)的[12]。

    昆蟲(chóng)致病真菌的研究始于18世紀(jì)80年代初,主要是出于對(duì)歐洲蠶養(yǎng)殖業(yè)的疾病管理的需要。一開(kāi)始的研究發(fā)現(xiàn),白僵菌是引起蠶僵化病的病原,而進(jìn)一步的研究證實(shí),白僵菌也可能感染其他昆蟲(chóng)[13-16],這也激發(fā)了人們使用白僵菌控制害蟲(chóng)的想法。但之前嘗試用昆蟲(chóng)病原物來(lái)防治昆蟲(chóng)的想法和實(shí)踐被逐漸發(fā)展起來(lái)的化學(xué)農(nóng)藥所阻滯[4]。直到現(xiàn)在,原先效果好的化學(xué)農(nóng)藥逐漸顯露出它的弊端:新的殺蟲(chóng)藥劑更新緩慢,抗藥性昆蟲(chóng)群體的擴(kuò)大;化學(xué)農(nóng)藥的長(zhǎng)期使用和不合理使用對(duì)生態(tài)環(huán)境造成的破壞;最重要的是這些化學(xué)農(nóng)藥最終會(huì)流向食物鏈頂端的人類。在最常見(jiàn)的白僵菌屬內(nèi)種中,B.brongniartii和B.bassiana用于控制害蟲(chóng)以保護(hù)作物和根除人類疾病的媒介,已在世界范圍內(nèi)被廣泛開(kāi)發(fā)和利用[17-18]。據(jù)統(tǒng)計(jì),2002年到2007年,全球范圍內(nèi)共有171種基于昆蟲(chóng)致病真菌的產(chǎn)品已注冊(cè)為商業(yè)真菌殺蟲(chóng)劑,其中關(guān)于白僵菌的產(chǎn)品有63種,占到38%[6]。

    早在19世紀(jì)80年代的中國(guó),在政府的支持下用B.bassiana控制森林病害昆蟲(chóng)的面積已經(jīng)達(dá)到了80~130萬(wàn)hm2[19]。 2003年前后,浙江大學(xué)開(kāi)發(fā)的針對(duì)茶葉害蟲(chóng)中蟬和蚱蜢的白僵菌的殺蟲(chóng)劑的銷售標(biāo)志著白僵菌在中國(guó)的市場(chǎng)化[20]。在世界范圍內(nèi),如19世紀(jì)80年代的巴西、俄羅斯、捷克斯洛伐克、波蘭和19世紀(jì)90年代的古巴都有一些沒(méi)有商業(yè)化的優(yōu)質(zhì)白僵菌劑的生產(chǎn)[6]。雖然說(shuō)白僵菌的應(yīng)用前景一片大好,但是不得不承認(rèn)它的應(yīng)用仍然面臨著很多問(wèn)題:白僵菌產(chǎn)品生產(chǎn)廠家多但規(guī)模小,管理模式落后,技術(shù)薄弱,防效不穩(wěn)定,政府支持力度不夠大[21]。2015年起中國(guó)頒布一系列倡導(dǎo)生物防治和綠色防控的法令,這些法令的頒布為解決這一系列問(wèn)題提供強(qiáng)大動(dòng)力。雖然說(shuō)中國(guó)生物防治的研究還不夠成熟,但這也同時(shí)代表著它還有很大的發(fā)展空間。針對(duì)白僵菌藥效不穩(wěn)定的問(wèn)題,混合生防菌劑的研究和新的高效菌系的篩選不失為一個(gè)好的解決方案。例如,Prabhukarthikeyan等[22]利用白僵菌和芽孢桿菌聯(lián)合防治香蕉鐮刀菌枯萎病和一些水果穿孔病,取得良好效果。但對(duì)于新種的發(fā)現(xiàn),高效白僵菌菌株的篩選,依然存在以下問(wèn)題:在白僵菌屬分類中白僵菌屬內(nèi)種寄主范圍的混雜,形態(tài)特征的多變性影響白僵菌屬內(nèi)種的分類,命名[23-24]及生防制劑的開(kāi)發(fā)。例如,1989年Saccardo 在非洲阿爾及利亞的沙漠蝗蟲(chóng)(直翅目)上分離出的Botrytisbrongniartii,后來(lái)在白僵菌屬的分類命名發(fā)展中被歸到Beauveriabrongniartii, 雖然說(shuō)Beauveriabrongniartii的寄主范圍很廣,但至今還沒(méi)有發(fā)現(xiàn)它能侵染直翅目昆蟲(chóng),所以Botrytisbrongniartii這個(gè)命名就建議被保留而不是修改[25]。白僵菌屬的分類研究不僅對(duì)它的生防應(yīng)用前景和生物多樣性研究具有重大意義,而且為整個(gè)菌物的多樣性研究提供了參考模板。

    1 白僵菌的侵染過(guò)程

    因?yàn)榘捉┚刑厥獾睦ハx(chóng)致病機(jī)理(圖1)且寄主范圍廣[26-27],能夠相對(duì)簡(jiǎn)單地大量生產(chǎn)等優(yōu)點(diǎn),幾乎所有的白僵菌都有作為生防制劑防治害蟲(chóng)的潛力。白僵菌不像細(xì)菌和病毒那樣,它們能夠直接穿透和破壞寄主昆蟲(chóng)的皮層從而在昆蟲(chóng)體內(nèi)寄生,逐漸殺死寄主昆蟲(chóng)[28]。侵染過(guò)程的關(guān)鍵步驟就是白僵菌可以通過(guò)自身菌絲萌發(fā)產(chǎn)生的壓力和分泌的可以溶解昆蟲(chóng)皮層組分的酶類(如脂酶,幾丁質(zhì)酶,蛋白酶等)來(lái)破壞寄主昆蟲(chóng)皮層組織[29]。在白僵菌芽管萌發(fā)突破昆蟲(chóng)表皮后,菌絲逐漸在昆蟲(chóng)組織內(nèi)擴(kuò)展,在最后突破血淋巴膜后,進(jìn)入血淋巴。

    在血淋巴內(nèi)白僵菌先以菌絲體的形式或通過(guò)小的獨(dú)立繁殖體快速擴(kuò)繁。在血淋巴內(nèi)吸取蟲(chóng)體養(yǎng)分并不斷產(chǎn)生和釋放毒性物質(zhì),以創(chuàng)造出自己需要的物質(zhì)。這也最終導(dǎo)致寄主昆蟲(chóng)的死亡[30]。蟲(chóng)體養(yǎng)分被耗盡后白僵菌菌絲突破蟲(chóng)體長(zhǎng)出,隨后發(fā)育成產(chǎn)孢細(xì)胞,產(chǎn)生分生孢子去侵染其他寄主昆蟲(chóng)。

    2 白僵菌的分類歷史

    2.1 白僵菌的發(fā)現(xiàn)

    對(duì)于白僵菌的發(fā)現(xiàn)還要追溯到18世紀(jì)初,一種病害使得意大利和法國(guó)的家蠶養(yǎng)殖業(yè)蒙受近乎毀滅性的打擊。1807年,意大利科學(xué)家Agostino Bassi di Lodi (1773-1856)通過(guò)對(duì)這個(gè)病害近30 a的研究[31],于1835年發(fā)表了一篇名為《 Del mal Del segno, calcinaccio or moscardino》的文章,得出是一種微生物引起這個(gè)發(fā)生在家蠶上的病害[14-15,31]。他也是第一個(gè)定義微生物引發(fā)病害理論的人[31-33]。

    2.2 白僵菌屬無(wú)性型和有性型

    在過(guò)去,白僵菌屬的分類地位一直是半知菌亞門(mén)-絲孢綱-叢梗孢目-叢梗孢科-白僵菌屬。由于過(guò)去普遍認(rèn)為白僵菌屬是沒(méi)有有性型而只有無(wú)性型的屬[23,34]。直到發(fā)現(xiàn)蟲(chóng)草屬的亞洲有性型,隨后用分子系統(tǒng)發(fā)育證明其與白僵菌屬的密切聯(lián)系[23,35]?,F(xiàn)在很多研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)蟲(chóng)草屬有性型和白僵菌屬無(wú)性型之間的密切聯(lián)系。例如,B.bassiana和C.bassiana[36],B.brongniartii和C.brongniartii[37],B.sobolifera和C.sobolifera[34],B.sungii和C.scarabaeicola[35]。

    白僵菌的有性型在自然狀態(tài)下很少發(fā)現(xiàn),僅有少數(shù)的一些在亞洲國(guó)家被找到。例如,在日本和中國(guó)發(fā)現(xiàn)的C.brongniartii[38-39];在中國(guó)和韓國(guó)發(fā)現(xiàn)的C.bassiana[36,40 ];也有的,例如,C.scarabaeicola在新幾內(nèi)亞被報(bào)道的同時(shí)[41],隨后又在日本[42]、中國(guó)臺(tái)灣[43]、中國(guó)大陸[44]和韓國(guó)[45]被發(fā)現(xiàn)。有趣的是,近年來(lái),一些白僵菌的有性型在南美洲被找到。這表明在世界范圍內(nèi),一些白僵菌的屬內(nèi)種極有可能存在完整的生活史或者有些被發(fā)現(xiàn)物種的全型可能包含某些白僵菌的無(wú)性型階段[46]。對(duì)于以前的白僵菌屬的分類結(jié)果,現(xiàn)在已經(jīng)逐步開(kāi)始用分子系統(tǒng)發(fā)育重新進(jìn)行劃分。由于白僵菌屬有性型的發(fā)現(xiàn)和分子系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果的支持。最終根據(jù)Kirk[47]的結(jié)果,從 NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上可以看到,現(xiàn)在的白僵菌屬已被劃分到子囊菌門(mén)-子囊菌綱-肉座菌目-蟲(chóng)草菌科內(nèi)。

    圖1 白僵菌的侵染過(guò)程Fig.1 Infection process of Beauveria(From http://www.anatisbioprotection.com)

    2.3 以形態(tài)學(xué)特征為主要分類標(biāo)準(zhǔn)的白僵菌分類歷史

    在以形態(tài)學(xué)特征作為白僵菌屬內(nèi)種主要?jiǎng)澐忠罁?jù)的時(shí)代里,關(guān)于白僵菌的命名和屬內(nèi)劃分一直是沒(méi)有明確定論的。在白僵菌屬的分類歷史中,它有過(guò)許多不同的名字。如,Botrytis,Sporotrichum和Isaria,同時(shí)也被認(rèn)為是其他屬的無(wú)性型[48-50]。

    第一個(gè)給白僵菌命名的人是Balsamo-Crivelli,在1835年為了紀(jì)念白僵菌的發(fā)現(xiàn)者Agostino Bassi di Lodi,隨將其命名為BotrytisbassianaBals.-Criv[51]。而真正建立白僵菌屬的人則是Beauverie。在1911年,Beauverie指出該白僵菌應(yīng)屬于一個(gè)尚未被描述的新屬,1912 年Vuillemin 以Botrytisbassiana為模式標(biāo)本將該菌的屬名定為白僵菌屬(GenusBeauveria),為了認(rèn)可Beauverie在該屬上的巨大貢獻(xiàn),在1914年將Botrytisbassiana更名為Beauveriabassiana[23,51]。

    白僵菌屬建立后,有很多菌物學(xué)家通過(guò)培養(yǎng)特性和形態(tài)學(xué)特征對(duì)白僵菌屬進(jìn)行屬內(nèi)分類研究。1926年,Petch對(duì)先前被認(rèn)為是白僵菌屬內(nèi)8個(gè)近似種的樣本進(jìn)行分類研究,結(jié)果通過(guò)孢子形態(tài)特征將這8個(gè)種分成B.bassiana和B.densa(Link) F. Picard 2個(gè)種[52]。1954年,MacLeod 通過(guò)對(duì)白僵菌屬內(nèi)16個(gè)近似種的培養(yǎng)特性和形態(tài)學(xué)特征研究,最終確定2個(gè)種B.bassiana和B.tenella。這2個(gè)種之一的B.tenella是對(duì)Petch命名屬B.densa的修改[49]。1972年,De Hoog向外界發(fā)表他對(duì)于白僵菌的各個(gè)研究方向的研究成果,其中包括他個(gè)人總結(jié)的白僵菌屬間劃分的關(guān)鍵識(shí)別特征。他像Petch和MacLeod一樣將白僵菌屬內(nèi)劃分為2個(gè)種,不同的是用B.brongniartii代替B.densa和B.tenella。1978年,在先前的基礎(chǔ)上,De Hoog根據(jù)他的研究結(jié)果又增加1個(gè)B.alba,不過(guò)隨后De Hoog又將其劃分到Engyodontium[50]。1975年,De Hoog和Rao從智利火山灰分離出孢子形態(tài)為逗號(hào)狀的B.vermiconia[1]。1982年,Samson 和Evans從厄瓜多爾的鱗翅目幼蟲(chóng)上分離出孢子形狀為橢圓形且孢子表面帶有粘性膠質(zhì)層的B.velata[53],隨后他們又從巴西鞘翅目昆蟲(chóng)上分離出孢子形狀為圓柱形的B.amorpha[53]。1988年,Bisset和Widden從新西蘭沼澤地土壤中分離出孢子形狀為短圓柱狀的B.caledonica[54]。2006年,Rehner等在這些基礎(chǔ)上又從馬拉維雙斑弗天牛/桉嗜木天牛上分離出孢子形狀為圓柱狀的B.malawiensis。截至2018年1月10日,已報(bào)道的白僵菌屬內(nèi)種共有18種,它們的具體形態(tài)學(xué)特征見(jiàn)表1。

    3 形態(tài)學(xué)特征在白僵菌屬內(nèi)種鑒定中的局限性

    利用形態(tài)學(xué)特征可以很容易地在屬的層面上識(shí)別白僵菌。白僵菌的分生孢子梗無(wú)隔膜,由輪生、致密、透明、細(xì)胞壁平滑的產(chǎn)孢細(xì)胞團(tuán)簇組成;產(chǎn)孢細(xì)胞合軸分枝,短球狀或長(zhǎng)頸瓶狀;軸頂為人字形,表面呈鋸齒狀,在上面可見(jiàn)一連串無(wú)色,透明,全分裂的分生孢子[25,50]。在培養(yǎng)過(guò)程中,白僵菌一般生長(zhǎng)緩慢,菌落表面有綿毛狀物。很少形成菌絲束,白色或淡黃色,偶有粉紅色。氣生菌絲透明,細(xì)胞壁薄且光滑,松散,有時(shí)叢生。由于白僵菌可產(chǎn)生大量的球形、近球形和橢圓形到圓柱形等形狀不一且可變形的[55]分生孢子,老熟菌落表面呈粉狀[24,50]。還有一些白僵菌的屬內(nèi)種能夠分泌色素,例如,在一些培養(yǎng)基中產(chǎn)生紅色的二苯醌卵胞素[50,56]。值得一提的是,1994年,Eyal從B.bassianaNov. EO-1 菌株上分離的紅色色素對(duì)植物昆蟲(chóng)(如,粉虱)和土壤昆蟲(chóng)(如,橡皮蟲(chóng))有很高的毒力,具有很好的防治一些害蟲(chóng)的前景[57]。

    在過(guò)去的近2個(gè)世紀(jì)里,盡管有研究證明分生孢子形狀可能隨著培養(yǎng)而改變[55]。培養(yǎng)特性和分生孢子的形狀、大小依然是識(shí)別、鑒定白僵菌并進(jìn)行屬內(nèi)分類的主要方法??呻S著研究的深入,白僵菌屬孢子形狀大小的重疊,缺乏特征性識(shí)別特征的問(wèn)題逐漸凸顯出來(lái),這也導(dǎo)致一些種的誤判或者把一些種錯(cuò)誤地歸到更大范圍的類群[49,58]。因此,白僵菌屬的形態(tài)學(xué)分類存在的這些問(wèn)題降低了它在白僵菌屬內(nèi)分類的有效性。到目前為止只有從智利火山灰中分離出的B.vermiconia的逗號(hào)形狀的分生孢子與白僵菌屬內(nèi)其他種的分生孢子形態(tài)差異巨大,可以用形態(tài)學(xué)分類來(lái)準(zhǔn)確區(qū)分。

    在2005年后,隨著一些形態(tài)學(xué)相似但分子系統(tǒng)發(fā)育相差甚遠(yuǎn)的種和一些神秘種的發(fā)現(xiàn)[23-24,59-60]讓人們意識(shí)到:傳統(tǒng)的分類方法在白僵菌屬內(nèi)的分類應(yīng)用上顯得越來(lái)越不方便,不準(zhǔn)確;菌物的分類在分子時(shí)代正面臨著變革,白僵菌屬正是其中不可或缺的一員[4]。

    4 白僵菌屬的分子生物學(xué)鑒定

    4.1 探索階段的白僵菌屬的分子時(shí)代分類史

    1989年,Mugnai等運(yùn)用白僵菌的主要生物化學(xué)成分對(duì)白僵菌屬內(nèi)種進(jìn)行分類[61]并從B.bassiana復(fù)合種里成功分出B.alba。并鑒別出B.alba,B.amorph,B.bassiana,B.brongniartii,B.velata,B.vermiconia。在這之后,陸續(xù)也有對(duì)白僵菌生物化學(xué)成分進(jìn)行研究的報(bào)道[55,62-63]。這些報(bào)道對(duì)于白僵菌孢子和菌絲的代謝路徑研究以及白僵菌生物防控的優(yōu)化是具有重要意義的,但是作為白僵菌種間劃分的依據(jù)還不夠精確?,F(xiàn)在關(guān)于白僵菌屬劃分依據(jù)更多倡導(dǎo)多基因位點(diǎn)分子系統(tǒng)發(fā)育的鑒定方法。從19世紀(jì)開(kāi)始分子生物學(xué)技術(shù)就已經(jīng)運(yùn)用到白僵菌的分類研究中。如,DNA探針技術(shù)[64],隨機(jī)擴(kuò)增片段多態(tài)性(RAPD)技術(shù)[65],單鏈形態(tài)多態(tài)性(SSCP)技術(shù)[66],端粒指紋技術(shù)[67],限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性 (RFLPs) 技術(shù)[68],擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性 (AFLPs)技術(shù)[69],序列特異擴(kuò)增區(qū)域(SCAR)技術(shù)[70],簡(jiǎn)單序列重復(fù)多態(tài)性(SSR)技術(shù)[71],線粒體DNA 技術(shù)和簡(jiǎn)單序列重復(fù)區(qū)間(ISSR)技術(shù)[72]等?,F(xiàn)在看來(lái)這些技術(shù)沒(méi)有在白僵菌的分類研究中建立權(quán)威的標(biāo)準(zhǔn)分類模式,但卻成功地應(yīng)用到白僵菌在環(huán)境土壤中接種釋放后的持續(xù)和可追溯性評(píng)估中[72-73]。另外,這些技術(shù)還成功運(yùn)用于對(duì)一些真菌群體結(jié)構(gòu)特征[74]、基因多樣性[75]或者一些自然狀態(tài)下特異真菌種群的發(fā)生[76]等方面的研究。

    隨著分子技術(shù)的不斷革新與進(jìn)步,白僵菌的屬內(nèi)很多根據(jù)形態(tài)學(xué)特征劃分的種到現(xiàn)在被證明包含一些獨(dú)立親緣關(guān)系的種[23-24]。因此,根據(jù)形態(tài)學(xué)特征的分類已不足以評(píng)估白僵菌的生物多樣性了。慶幸的是,面臨的問(wèn)題正驅(qū)使菌物學(xué)家們探究,提議更多更好的可選擇方案來(lái)更加精確地劃分白僵菌的屬內(nèi)種,而絕不是僅僅通過(guò)形態(tài)學(xué)特征來(lái)劃分屬內(nèi)近緣種[24,77]。

    4.2 核糖體轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)ITS

    真菌中,核糖體轉(zhuǎn)錄區(qū)從3′到5′端依次是18S小亞基(SSU)、5.8S、28S大亞基(LSU)。轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)從3′到5′依次是ITS1和ITS2,被5.8S區(qū)段分開(kāi)。由于核糖體DNA的ITS區(qū)域變異水平高,而轉(zhuǎn)錄區(qū)域比較保守[78];測(cè)序花費(fèi)比較低;引物在所有真菌里基本通用,容易擴(kuò)增且測(cè)序方便。所以是目前應(yīng)用最廣泛的分子系統(tǒng)發(fā)育研究位點(diǎn)[79-81]。自20世紀(jì)90年代以來(lái),ITS-rDNA區(qū)域是真菌鑒定和分子分類學(xué)上最常見(jiàn)的遺傳標(biāo)記,近年也成為真菌研究的常用DNA條碼[79-80,82]。然而,僅以ITS區(qū)域作為真菌屬種間劃分依據(jù),已經(jīng)被許多菌物學(xué)家所詬?。灰?yàn)樗鼪](méi)有足夠的變異度來(lái)解決一些——諸如,白僵菌和綠僵菌等相近物種間的區(qū)分[23,83-85]——問(wèn)題。另外,在白僵菌的屬內(nèi)種的區(qū)分上,近年來(lái),很多報(bào)道也強(qiáng)調(diào)僅用核糖體ITS序列也是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的[71,86]。如,在Imoulan等的報(bào)道中,白僵菌屬內(nèi),只有ITS序列差異大的種僅能用ITS序列來(lái)區(qū)分 (如,B.bassiana,B.hoplocheli,B.malawiensis,B.sungii,B.sinensis,B.amorpha,B.caledonica,B.vermiconia,B.varroae,B.kipukae和B.lii),這也間接說(shuō)明單獨(dú)特定片段的DNA條碼的功能是有一定限度的。

    4.3 轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)因子EF-1a(TEF)

    在2005年,TEF首次被Rehner 和 Buckley應(yīng)用在一項(xiàng)區(qū)分分子系統(tǒng)發(fā)育不同的白僵菌屬內(nèi)種的綜合研究中,隨后的類似研究均把該位點(diǎn)作為一個(gè)優(yōu)質(zhì)位點(diǎn)多次采用[11-12,23-24,58,71,86-88]。在2005年的這篇論文中,5個(gè)與它們之前的形態(tài)學(xué)特征描述密切相關(guān)的種被劃分出來(lái)[71]。其中,廣義B.bassiana分生孢子有球形和亞球形,它的分子系統(tǒng)發(fā)育不是單一的,是由2種不相關(guān)的,但形態(tài)上無(wú)法區(qū)分的2個(gè)譜系組成,分別位于2個(gè)不同的分支A和C上,所以被認(rèn)為是2個(gè)獨(dú)立的種。分支A在全球范圍內(nèi)分布,與狹義B.bassiana,以及與分支C密切相關(guān),分支C中包含與分支A形態(tài)學(xué)特征不同的菌株。后來(lái)被鑒定定名為B.pseudobassiana[24]。分支B包括B.brongniartii的分離物,這是一種分生孢子為橢圓形的歐亞物種。分支D種有兩種,B.caledonica和B.vermiconia,分別產(chǎn)生圓柱形和逗號(hào)形狀的分生孢子。分支F由孢子形狀為圓柱形的B.amorpha組成[23]。

    在這之后又有報(bào)道說(shuō)明,由于狹義B.bassiana和B.pseudobassiana兩者的TEF序列對(duì)比差異太小,它們的區(qū)分僅通過(guò)TEF序列數(shù)據(jù)的話是不準(zhǔn)確的[23-24,59]。在分析2個(gè)來(lái)自摩洛哥和中國(guó)種的數(shù)百個(gè)樣品后,發(fā)現(xiàn)兩者的差異最顯著的地方是,氣生菌絲在產(chǎn)生分生孢子階段一個(gè)是灰白色,一個(gè)是黃褐色,從而導(dǎo)致它們的菌落顏色不一[89]。

    4.4 多基因位點(diǎn)分析

    在系統(tǒng)發(fā)育學(xué)科興起以來(lái),人們逐漸認(rèn)識(shí)到,在真菌中用某物種的單基因位點(diǎn)的譜系來(lái)反映整個(gè)物種的系統(tǒng)發(fā)育過(guò)程是沒(méi)有代表性的[90]。通過(guò)分析不同的單個(gè)基因位點(diǎn)推斷出的系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果可能是矛盾或是拓?fù)涞慕Y(jié)果。另外,已有理論研究表明,多基因聯(lián)合分析可以對(duì)單基因分析產(chǎn)生的結(jié)果有實(shí)質(zhì)性的補(bǔ)充改進(jìn)[91]。因此,為了更準(zhǔn)確地提供真正的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,近年對(duì)于物種間的差異性研究,多使用多基因位點(diǎn)聯(lián)合分析方法[92]。同樣的,許多研究認(rèn)為通過(guò)組合一個(gè)物種內(nèi)相對(duì)多的基因位點(diǎn)聯(lián)合分析可以提高物種的界定和識(shí)別的準(zhǔn)度。在菌物中,采用綜合的多位點(diǎn)基因條碼的方法來(lái)識(shí)別和界定物種已經(jīng)成為趨勢(shì)[5,24,91,93]。菌物分類學(xué)家們也通過(guò)自己的實(shí)驗(yàn)探究和同行間的交流,總結(jié)出菌物多基因位點(diǎn)分析系統(tǒng)實(shí)施的可靠方案,以此劃定和鑒別一些神秘物種,并避免對(duì)一些物種的錯(cuò)誤識(shí)別[24,60,85,94]。

    在一些可選擇的分子標(biāo)記[如,RNA聚合酶Ⅱ大亞基基因(RPB1),RNA聚合酶Ⅱ第二大亞基基因(RPB2),轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)因子1a基因(TEF),核基因間隔區(qū)block(bloc)]已經(jīng)被成功的應(yīng)用來(lái)處理白僵菌屬內(nèi)復(fù)雜的種間劃分問(wèn)題[24,60]。bloc是專門(mén)為鑒定非洲新熱帶的廣義B.bassiana系統(tǒng)發(fā)育起源設(shè)計(jì)的[60]。之后bloc被用作單基因位點(diǎn)成功地劃分出B.malawiensis[60]。在這之前,Rehner用TEF和ITS兩個(gè)基因位點(diǎn)對(duì)白僵菌屬內(nèi)進(jìn)行分子系統(tǒng)劃分[23]。RPB1和RPB2也經(jīng)常和一些其他不同的基因(例如,nucSSU,nucLSU和5.8S)聯(lián)合起來(lái),用于分析解釋菌物分類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系[5,60,95-96],其中包括白僵菌[24]。

    2011年,Rehner用以上所描述的4個(gè)基因位點(diǎn)對(duì)從不同地理位置,棲息地和寄主所取的68株白僵菌樣本進(jìn)行種的劃分[24]。結(jié)果用這個(gè)方法劃分出12種白僵菌(B.bassiana,B.australis,B.kipukae,B.pseudobassiana,B.varroae,B.brongniartii,B.asiatica,B.sungii,B.amorpha,B.caledonica,B.malawiensis和B.vermiconia)。隨后又有新種被陸續(xù)報(bào)道,如,B.lii[12],B.sinensis[87],B.rudraprayagi[88],B.hoplocheli[58]。還有最近報(bào)道的新種,從中國(guó)青藏高原分離的B.medogensis[86],從中國(guó)貴州分離的B.araneola[11]。所以,到現(xiàn)在白僵菌的屬內(nèi)種增加到18個(gè)。自2011年后,這6個(gè)新種的發(fā)現(xiàn)和界定主要也是依靠多基因位點(diǎn)的聯(lián)合分析的結(jié)果。整理所有通過(guò)多基因位點(diǎn)DNA條碼的方法鑒定且報(bào)道的白僵菌的種(圖2),然而結(jié)合圖3可知,有些不同種的白僵菌分享著相同的孢子形狀,但是分子系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果卻相差很大。如,2011年Rehner等,利用分子系統(tǒng)發(fā)育的方法在廣義B.bassiana里分出3個(gè)種(B.varroae,B.pseudobassiana和B.kipukae);從廣義B.brongniartii里分出2個(gè)種(B.asiatica和B.australis)。

    a-f.長(zhǎng)橢圓形或圓柱形分生孢子。a.B.lii; b.B.amorpha; c.B.sinensis; d.B.hoplocheli; e.B.malawiensis; f.B.caledonica. g-i.橢圓形分生孢子。g.B.asiatica; h.B.sungii; i.B.brongniartii. j-p,R.球形或亞球形分生孢子。j.B.australis; k.B.bassiana; l.B.kipukae; m.B.varroae; n.B.pseudobassiana; o.B.medogensis; p.B.rudraprayagi. R.B.araneola. q.B.vermiconia.比例尺:10 μm,*表示比例尺不可用。

    a-f.Beauveriaspecies with elongate ellipsoidal to cylindrical conidia; a.B.lii; b.B.amorpha; c.B.sinensis; d. B.hoplocheli; e.B.malawiensis; f.B.caledonica. g-i.Beauveriaspecies with ellipsoidal conidia, g.B.asiatica; h.B.sungii; i.B.brongniartii. j-p, R.Beauveriawith globose to sub-globose conidia, j.B.australis; k.B.bassiana; l.B.kipukae; m.B.varroae; n.B.pseudobassiana; o.B.medogensis; p.B.rudraprayagi.Beauveriawith comma-shaped conidia, R.B.araneola, q.B.vermiconia(Rehneretal. 2006,2011; Chenetal. 2013; Zhangetal. 2012; Agrawaletal. 2014; Imoulanetal. 2016b; CHEN W Hetal. 2017). Scale bars: 10 μm, * indicates scale bar not available.

    圖218種已被鑒別白僵菌的分生孢子形態(tài)
    Fig.2ConidiashapeoftheseventeenrecognizedBeauveriaspecies

    引導(dǎo)值(p50%)和后驗(yàn)概率(=100%)被標(biāo)記在分支上并被“/”分隔開(kāi)。分支末端的ARSEF標(biāo)記是Rehner 2011年報(bào)道中分離的單個(gè)菌株的登入號(hào)。除了RCEF5500, RCEF3903, Bt98, Bt121, Bt128 ,strain2898 和GZU0317。這些是2011年后新發(fā)現(xiàn)種的登入號(hào)(Zhang等,2012; Chen等,2013; Robène等,2015; Imoulan等,2016; CHEN W H等,2017)。

    Bootstrap values (P50%) and posterior probabilities (=100%) are labeled above branches and separated by “/”.Terminal clades are labeled according to ARSEF accession numbers of individual isolates reported in Rehneretal. (2011), except RCEF5500, RCEF3903, Bt98, Bt121, Bt128 ,strain2898 and GZU0317, which are newly accession number of those discovered species after 2011. (Zhangetal. 2012; Chenetal. 2013; Robèneetal. 2015; Imoulanetal. 2016; CHEN W Hetal. 2017).

    圖3運(yùn)用TEF1,RPB1,RPB2和Bloc多基因位點(diǎn)聯(lián)合分析的方法,基于最大似然法和貝葉斯定律對(duì)于白僵菌屬內(nèi)的18個(gè)種建立的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
    Fig.3Phylogenetictreeof18BeauveriabasedonMaximumparsimonyandBayesianinferenceofcombinedTEF1,RPB1,RPB2andBloc

    多基因位點(diǎn)分子系統(tǒng)發(fā)育分類得到的結(jié)果比形態(tài)學(xué)分類得到的結(jié)果更能反映白僵菌屬的生物多樣性[24,60]。這些研究證明多位點(diǎn)DNA條碼的方法在分析和鑒定未知的白僵菌上的前景,也為其他與白僵菌屬相類似的屬的分類提供參考依據(jù)。

    5 孢子形狀

    自從1912年Vuillemin建立白僵菌屬,現(xiàn)在共有18個(gè)屬內(nèi)種用多基因位點(diǎn)聯(lián)合分析的方法被劃分出來(lái)。根據(jù)分生孢子的形態(tài) (表1,圖3),白僵菌屬內(nèi)主要被劃分為4個(gè)類群。第1個(gè)類群中包含6個(gè)種:B.amorpha,B.caledonica,B.malawiensis,B.lii,B.sinensis和B.hoplocheli(圖3-a~3-f),它們的分生孢子形態(tài)是加長(zhǎng)的橢圓形或圓柱形。第2個(gè)群體包含3個(gè)種:B.brongniartii,B.asiatica和B.sungii,它們分生孢子的形態(tài)是橢圓形 (圖3-g~3-i)。第3個(gè)群體包含8個(gè)種:B.bassiana,B.australis,B.kipukae,B.pseudobassiana,B.varroae,B.rudraprayagi,B.medogensis和B.araneola(圖3-i~3-p,3-R),分生孢子形態(tài)是球形到亞球形。第4個(gè)群體包含1個(gè)種:B.vermiconia(圖3-q),分生孢子形態(tài)是逗號(hào)形。

    6 總結(jié)和展望

    總的來(lái)說(shuō),白僵菌屬內(nèi)分類混亂的問(wèn)題給白僵菌的生物多樣性及其應(yīng)用研究帶來(lái)很大問(wèn)題和挑戰(zhàn),而分子系統(tǒng)發(fā)育的方法是解決這一問(wèn)題的有效手段。如,在應(yīng)用白僵菌的過(guò)程中很多人會(huì)認(rèn)為白僵菌是不是會(huì)感染家蠶,從而在控制其他害蟲(chóng)的同時(shí)對(duì)家蠶養(yǎng)殖業(yè)造成打擊。Wang等[97]通過(guò)研究中國(guó)西南部家蠶養(yǎng)殖業(yè)病原白僵菌的多樣性,發(fā)現(xiàn)家蠶養(yǎng)殖業(yè)中的病原白僵菌和生防所用的病原白僵菌分子系統(tǒng)發(fā)育差異較大,是不同的種類。從而在一定程度上推廣了白僵菌的應(yīng)用。

    由于白僵菌屬的分生孢子形態(tài)的重疊,導(dǎo)致該屬缺乏精確的形態(tài)學(xué)識(shí)別特征。如,之前用傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)分類方法只劃分出2個(gè)種B.bassiana和B.brongniartii[49,50,52]。所以,僅用形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行分類的方法被認(rèn)為是不準(zhǔn)確的。

    在大規(guī)模DNA測(cè)序技術(shù)問(wèn)世之前,傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)分類方法一直缺乏批判性的觀點(diǎn)[23-24]。但是僅用ITS序列這一單一的基因位點(diǎn),在一些種的分類上是沒(méi)有代表性或者說(shuō)是不合適的。現(xiàn)在,白僵菌屬內(nèi)劃分采用的是除形態(tài)學(xué)以外,聯(lián)合ITS的多基因位點(diǎn)或ITS以外的單或多基因位點(diǎn)分析的方法。多基因位點(diǎn)聯(lián)合分析的方法也被許多菌物學(xué)家提倡作為種間或種內(nèi)劃分的有效工具[24,86],也是識(shí)別鑒定隱含種極其有效的工具[98]。

    一直以來(lái),分生孢子形態(tài)是絕大多數(shù)菌物的屬內(nèi)種的形態(tài)學(xué)劃分依據(jù),也是比較有效的劃分依據(jù)??呻S著學(xué)科的發(fā)展,發(fā)現(xiàn)在白僵菌屬中用分生孢子特征進(jìn)行白僵菌屬內(nèi)分類的方法是不夠準(zhǔn)確和全面的。所以在白僵菌屬內(nèi)和其他的菌物屬內(nèi),分生孢子形態(tài)更多的是作為菌物分類中最重要的形態(tài)學(xué)特征扮演著輔助分子系統(tǒng)發(fā)育,從而精確劃分種的角色。

    目前,已經(jīng)有18個(gè)白僵菌的種通過(guò)多基因條碼的方法被劃分出來(lái)。然而在index of fungorum(www.indexfungorum.org; 2018-01-10)上可以看到61種關(guān)于白僵菌的分類命名,其中尚有43種有待通過(guò)多基因條碼來(lái)驗(yàn)證。

    分子系統(tǒng)學(xué)分類方法可以通過(guò)發(fā)現(xiàn)白僵菌新種和了解它們的地理分布[99],從而共同增加現(xiàn)有的白僵菌的生物多樣性,進(jìn)而拓展白僵菌的應(yīng)用。同樣的,一些其他用于多基因位點(diǎn)聯(lián)合分析的有效位點(diǎn)的增加也會(huì)極大地幫助人們對(duì)白僵菌基因結(jié)構(gòu)的全面理解,當(dāng)然也會(huì)為種的識(shí)別和劃分提供有力的幫助。另外,新一代基因測(cè)序技術(shù)(NGS)出現(xiàn)后已經(jīng)在一些研究中得到應(yīng)用,它能夠快速測(cè)序整個(gè)基因組,并增加所測(cè)序目標(biāo)區(qū)域的深度。這個(gè)新技術(shù)的出現(xiàn),使研究者在整個(gè)基因組層面上做分子系統(tǒng)發(fā)育成為可能[100-101]。這種新技術(shù)的出現(xiàn)將顯著改變菌物分類學(xué)家們分析和研究白僵菌以及其他真菌群之間進(jìn)化關(guān)系的方式。

    致謝:首先感謝實(shí)驗(yàn)室的陳雅寒師姐,李曉宇師姐,程睿君師姐,邱珂師姐和汝冰璐師兄給予的支持。其次要特別感謝孫廣宇老師,張榮老師,江聰老師和梁曉飛老師提供的幫助。最后還要感謝原晨虹同學(xué)給予的鼓勵(lì)和對(duì)論文完成的幫助。

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