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    芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1基因的克隆及其對(duì)非生物脅迫的響應(yīng)

    2019-04-02 05:11:46楊青青劉潔霞徐志勝熊愛(ài)生
    關(guān)鍵詞:津南芹菜氨基酸

    楊青青, 劉潔霞, 徐志勝, 馮 凱, 黃 瑩, 熊愛(ài)生

    (南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院 作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 農(nóng)業(yè)部華東地區(qū)園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 江蘇 南京 210095)

    芹菜(ApiumgraveolensLinn.)隸屬于傘形科(Apiaceae)芹屬(ApiumLinn.),是一種重要的葉菜類(lèi)蔬菜作物。芹菜原產(chǎn)于地中海和中東地區(qū),在中國(guó)有著悠久的栽培歷史[1]。芹菜具有較高的營(yíng)養(yǎng)和藥用價(jià)值,富含類(lèi)胡蘿卜素、維生素、類(lèi)黃酮以及揮發(fā)性芳香成分,全株可入藥[2]。非生物脅迫是影響芹菜生長(zhǎng)發(fā)育、產(chǎn)量和品質(zhì)的重要因子,如高溫、低溫、干旱和鹽脅迫會(huì)破壞芹菜細(xì)胞的膜結(jié)構(gòu),打亂植株自身的水分平衡,對(duì)芹菜植株的生長(zhǎng)發(fā)育產(chǎn)生較大的影響,進(jìn)而影響芹菜的產(chǎn)量和品質(zhì)[3]。

    ICE(inducerofCBFexpression)基因是誘導(dǎo)CBF基因家族表達(dá)的轉(zhuǎn)錄激活因子,在植物中普遍存在。已有研究結(jié)果[4]表明:ICE蛋白定位于細(xì)胞核中,在低溫條件下,ICE蛋白被激活,達(dá)到活躍狀態(tài),可以和CBF基因啟動(dòng)子區(qū)的順式作用元件有效結(jié)合,激活植物體內(nèi)響應(yīng)冷脅迫相關(guān)的代謝來(lái)抵御寒冷脅迫。對(duì)植物抗寒分子機(jī)制的研究結(jié)果[5]表明:冷脅迫會(huì)誘導(dǎo)植物體內(nèi)抗凍相關(guān)基因的表達(dá),并且冷誘導(dǎo)基因(COR)在高等植物體內(nèi)普遍存在。ICE基因在植物遭遇低溫脅迫時(shí),能夠識(shí)別CBF基因啟動(dòng)子中的冷調(diào)控元件ICE box,誘導(dǎo)CBF/DREB調(diào)控下游基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),從而提高植物的抗寒性[6-7]。ICE蛋白可以通過(guò)多種方式調(diào)控不同低溫應(yīng)答基因[7]。近年來(lái),人們對(duì)植物抗寒基因ICE的研究取得了一定的進(jìn)展,ICE1基因的發(fā)現(xiàn)為提高植物的抗寒性提供了新的途徑。目前,已經(jīng)從茶樹(shù)〔Camelliasinensis(Linn.) O. Ktze.〕[4]、擬南芥〔Arabidopsisthaliana(Linn.) Heynh.〕[8]、異色菊〔Chrysanthemumdichrum(C. Shih) H. Ohashi et Yonek.〕[9]、蘿卜(RaphanussativusLinn.)[10]、蘋(píng)果(MaluspumilaMill.)[11]和胡蘿卜(Daucuscarotavar.sativaHoffm.)[12]等植物中分離鑒定出ICE基因,且通過(guò)轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)入ICE基因的植物抗逆性均有提高[13]。

    芹菜品種‘津南實(shí)芹’(‘Jinnan Shiqin’)植株緊湊直立、分枝少、顏色淡綠、葉片肥大、不易先期抽薹,在中國(guó)南北地區(qū)四季均可以栽培[14]。本研究從芹菜品種‘津南實(shí)芹’中克隆得到AgICE1基因,對(duì)該基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測(cè)AgICE1基因在高溫、低溫、干旱及高鹽4種非生物脅迫下的相對(duì)表達(dá)水平,以期為進(jìn)一步開(kāi)展芹菜ICE轉(zhuǎn)錄因子的逆境調(diào)控機(jī)制研究奠定基礎(chǔ),并為深入了解AgICE1基因在芹菜抵御非生物脅迫中的功能提供依據(jù)。

    1 材料和方法

    1.1 材料

    芹菜品種‘津南實(shí)芹’由南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供。供試材料栽植于晝溫25 ℃、夜溫18 ℃、光照時(shí)間16 h·d-1、光照強(qiáng)度300 μmol·m-2·s-1、空氣相對(duì)濕度60%~70%的人工氣候室內(nèi)。采集4月齡植株的根、葉柄和葉片,樣品采集后立即用液氮速凍后置于-80 ℃冰箱,用于總RNA提取、cDNA合成及基因表達(dá)分析[15]。此外,選取長(zhǎng)勢(shì)均一的4月齡植株進(jìn)行高溫(38 ℃)、低溫(4 ℃)、干旱(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù)20% PEG6000)和高鹽(0.2 mol·L-1NaCl)4種非生物脅迫處理,對(duì)照組用ddH2O處理,每個(gè)處理設(shè)置3組生物學(xué)重復(fù)。分別取處理0、1、2、4、8和24 h植株上部生長(zhǎng)健康的葉片,采用上述方法速凍,用于總RNA提取、cDNA合成及基因表達(dá)分析。

    大腸桿菌菌株DH5α為南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存;凝膠回收試劑盒購(gòu)自康寧生命科學(xué)(吳江)有限公司;引物合成由南京金斯瑞生物科技有限公司完成;pMD19-T質(zhì)粒載體、TaqDNA聚合酶、DNA marker DL2000、SYBR?PremixExTaqTM試劑盒均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司。

    1.2 方法

    1.2.1 基因克隆 基于作者所在課題組保存的芹菜轉(zhuǎn)錄組和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)[16],通過(guò)與其他物種ICE基因序列BLAST比對(duì)分析獲得芹菜品種‘津南實(shí)芹’ICE1基因的序列。根據(jù)開(kāi)放閱讀框(ORF)序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物,芹菜品種‘津南實(shí)芹’ICE1基因正向引物AgICE1-F的序列為5′-A ̄T ̄G ̄C ̄T ̄C ̄C ̄C ̄C ̄A ̄C ̄C ̄T ̄C ̄A ̄A ̄A ̄C G ̄A ̄C ̄G ̄T-3′,反向引物AgICE1-R的序列為5′-C ̄T ̄A A ̄A ̄T ̄T ̄G ̄C ̄G ̄C ̄C ̄A ̄T ̄G ̄A ̄A ̄A ̄A ̄C ̄C ̄A ̄G-3′。以‘津南實(shí)芹’葉片的cDNA為模板進(jìn)行PCR反應(yīng),PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s、54 ℃退火30 s、72 ℃延伸60 s,34個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR反應(yīng)體系總體積20 μL,包含cDNA模板1 μL、正向引物和反向引物各1 μL、ddH2O 7 μL以及ExTaq酶10 μL。PCR反應(yīng)產(chǎn)物用質(zhì)量濃度12 g·L-1的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行分離檢測(cè),回收產(chǎn)物連接pMD19-T質(zhì)粒載體,并轉(zhuǎn)化到大腸桿菌菌株DH5α中,挑取單菌落搖菌,經(jīng)PCR檢測(cè)后交由南京金斯瑞生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。

    1.2.2 氨基酸序列分析 各植物ICE轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列均來(lái)自NCBI數(shù)據(jù)庫(kù),采用ExPASy網(wǎng)站(https:∥web.expasy.org/protparam/)的相關(guān)軟件對(duì)芹菜品種‘津南實(shí)芹’ICE1轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸組成、理論相對(duì)分子質(zhì)量和理論等電點(diǎn)(pI)進(jìn)行分析[17];采用DNAMAN軟件進(jìn)行ICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列的多重比對(duì)及蛋白質(zhì)的親水性和疏水性預(yù)測(cè),利用Blast Conserved Domains Search(https:∥blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)對(duì)芹菜品種‘津南實(shí)芹’ICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列進(jìn)行保守域預(yù)測(cè),采用MEGA5對(duì)進(jìn)化樹(shù)進(jìn)行測(cè)試和編輯,生成報(bào)告圖形[18]。

    1.2.3 RT-qPCR 根據(jù)SYBR?PremixExTaqTM試劑盒操作說(shuō)明進(jìn)行RT-qPCR,然后通過(guò)IQTM5 Real-time PCR System完成RT-qPCR檢測(cè)。相對(duì)表達(dá)水平的計(jì)算采用參照基因的ΔCT法,相對(duì)表達(dá)水平是基于處理組與對(duì)照組之間目標(biāo)基因相對(duì)內(nèi)參基因表達(dá)量的比較[19]。以芹菜的actin基因作為內(nèi)參基因,該基因正向引物的序列為5′-A ̄G ̄A ̄A ̄G ̄T ̄C ̄C ̄T ̄G ̄T ̄T ̄C ̄C ̄A G ̄C ̄C ̄G ̄T ̄C ̄T ̄T-3′,反向引物的序列為5′-C ̄G ̄A ̄A ̄C ̄C ̄A ̄C C ̄A ̄C ̄T ̄G ̄A ̄G ̄C ̄A ̄C ̄T ̄A ̄T ̄G ̄T ̄T-3′。用于AgICE1基因表達(dá)分析的正向引物AgICE1-qF的序列為5′-C ̄T ̄G ̄C ̄T ̄T ̄T A ̄T ̄C ̄C ̄C ̄C ̄T ̄G ̄C ̄A ̄T ̄T ̄T ̄C ̄C ̄T-3′,反向引物AgICE1-qR的序列為5′-C ̄A ̄G ̄T ̄A ̄C ̄T ̄A ̄G ̄T ̄T ̄A ̄A ̄C ̄A ̄A ̄A ̄G ̄C ̄T ̄A ̄A-3′。同時(shí)擴(kuò)增內(nèi)參基因與目標(biāo)基因,每個(gè)樣品分別設(shè)置3個(gè)生物學(xué)重復(fù)和3個(gè)技術(shù)重復(fù)。PCR反應(yīng)體系總體積20.0 μL,包含ddH2O 7.2 μL、SYBR Green Ⅰ mix 10.0 μL,cDNA模板2.0 μL以及正向熒光定量引物和反向熒光定量引物各0.4 μL。RT-qPCR反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性30 s;95 ℃變性5 s、60 ℃退火延伸20 s,共40個(gè)循環(huán);通過(guò)從65 ℃至95 ℃逐步擴(kuò)增加熱獲得熔解曲線。

    采用Duncan’s新復(fù)極差法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行多重比較,采用one-way ANOVA對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行差異顯著性分析,采用EXCEL 2007和SPSS 20.0統(tǒng)計(jì)分析軟件分析RT-qPCR數(shù)據(jù)。

    2 結(jié)果和分析

    2.1 芹菜品種‘津南實(shí)芹’ICE1基因的克隆

    以芹菜品種‘津南實(shí)芹’未經(jīng)脅迫處理葉片的cDNA為模板,用引物AgICE1-F和AgICE1-R進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到1條長(zhǎng)約1 400 bp的目的片段(圖1),片段大小與預(yù)期一致。將回收產(chǎn)物依次進(jìn)行連接、轉(zhuǎn)化及測(cè)序,獲得芹菜品種‘津南實(shí)芹’ICE1基因的開(kāi)放閱讀框(ORF)序列,命名為AgICE1基因。測(cè)序結(jié)果(圖2)顯示:克隆得到的AgICE1基因含有1個(gè)長(zhǎng)度為1 455 bp的開(kāi)放閱讀框,編碼484個(gè)氨基酸。

    2.2 芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸序列及其理化性質(zhì)分析

    通過(guò)DNAMAN軟件對(duì)氨基酸序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明:芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸序列與大豆〔Glycinemax(Linn.) Merr.〕、擬南芥和歐洲油菜(BrassicanapusLinn.)等植物的ICE1轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸序列一致性較高(圖3)。

    氨基酸組成及理化性質(zhì)分析結(jié)果(表1)顯示:芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子和其他植物ICE1轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸序列的理論相對(duì)分子質(zhì)量在36 000~59 000之間,氨基酸殘基數(shù)在340~540之間,脂肪族氨基酸的比例明顯高于芳香族氨基酸的比例,芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子中酸性氨基酸的比例高于堿性氨基酸的比例,而其他植物ICE1轉(zhuǎn)錄因子中的堿性氨基酸的比例均高于酸性氨基酸的比例。

    *: 終止密碼子Stop codon.

    Ag: 芹菜品種‘津南實(shí)芹’Cultivar ‘Jinnan Shiqin’ of Apium graveolens Linn.; Gm: 大豆Glycine max (Linn.) Merr.; At: 擬南芥Arabidopsis thaliana (Linn.) Heynh.; Bn: 歐洲油菜Brassica napus Linn.; Sl: 番茄Solanum lycopersicum Linn.; Mp: 蘋(píng)果Malus pumila Mill.; Rs: 蘿卜Raphanus sativus Linn.; La: 獨(dú)行菜Lepidium apetalum Willd.; Bro: Brassica rapa subsp. oleifera (DC.) Metzg.

    表1芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子和其他植物ICE1轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸組成及理化性質(zhì)

    Table1AminoacidcompositionandphysicochemicalpropertyofAgICE1transcriptionfactorfromcultivar‘JinnanShiqin’ofApiumgraveolensLinn.andICE1transcriptionfactorsfromotherspecies

    種類(lèi)1)Species1)登錄號(hào)Accession No.氨基酸殘基數(shù)Number of amino acid residue理論相對(duì)分子質(zhì)量Theoretical relative molecular mass理論等電點(diǎn)Theoretical isoelectric point比例/% Percentage堿性氨基酸Basic amino acid酸性氨基酸Acidic amino acid脂肪族氨基酸Aliphatic amino acid芳香族氨基酸Aromatic amino acid總平均疏水性Grand average of hydrophobicityAgAgr22229484531 3615.0911.613.056.47.5-0.533GmNM_001254339.1531494 1475.4112.610.274.46.5-0.524AtAY195621.1404535 3895.5311.69.669.36.7-0.519BnJF268687.1499532 1415.0511.48.868.26.4-0.415SlJX625139.1531583 3715.3811.89.669.07.0-0.569MpEF495202.1531574 0015.5112.010.172.25.5-0.532RsHQ891287.1421457 9545.4112.812.173.36.9-0.444LaAGZ13680.1344368 3599.7213.27.380.07.3-0.032BroADZ24264.1497530 4945.1111.49.071.76.2-0.417

    1)Ag: 芹菜品種‘津南實(shí)芹’Cultivar ‘Jinnan Shiqin’ ofApiumgraveolensLinn.; Gm: 大豆Glycinemax(Linn.) Merr.; At: 擬南芥Arabidopsisthaliana(Linn.) Heynh.; Bn: 歐洲油菜BrassicanapusLinn.; Sl: 番茄SolanumlycopersicumLinn.; Mp: 蘋(píng)果MaluspumilaMill.; Rs: 蘿卜RaphanussativusLinn.; La: 獨(dú)行菜LepidiumapetalumWilld.; Bro:Brassicarapasubsp.oleifera(DC.) Metzg.

    利用Blast Conserved Domains Search分析芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列的保守域,結(jié)果(圖4)顯示:AgICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列在第300位至第346位氨基酸間含有bHLH保守域。

    圖4 芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列的保守域預(yù)測(cè)

    2.3 芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子的進(jìn)化分析

    根據(jù)芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子與其他植物的ICE1轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

    結(jié)果(圖5)顯示:傘形科的芹菜品種‘津南實(shí)芹’與薔薇科(Rosaceae)的蘋(píng)果的進(jìn)化關(guān)系最近。十字花科(Brassicaceae)的歐洲油菜、Brassicarapasubsp.oleifera(DC.) Metzg.、擬南芥和蘿卜聚為同一分支,茄科(Solanaceae)的番茄(SolanumlycopersicumLinn.)以及芹菜品種‘津南實(shí)芹’和蘋(píng)果聚為同一分支,但是豆科(Fabaceae)的大豆和十字花科的獨(dú)行菜(LepidiumapetalumWilld.)分別聚為單獨(dú)的分支。總體上看,ICE1轉(zhuǎn)錄因子在不同植物間呈現(xiàn)明顯的種屬特性,同科植物的親緣關(guān)系更近。

    Ag: 芹菜品種‘津南實(shí)芹’Cultivar ‘Jinnan Shiqin’ of Apium graveolens Linn.; Gm: 大豆Glycine max (Linn.) Merr.; At: 擬南芥Arabidopsis thaliana (Linn.) Heynh.; Bn: 歐洲油菜Brassica napus Linn.; Sl: 番茄Solanum lycopersicum Linn.; Mp: 蘋(píng)果Malus pumila Mill.; Rs: 蘿卜Raphanus sativus Linn.; La: 獨(dú)行菜Lepidium apetalum Willd.; Bro: Brassica rapa subsp. oleifera (DC.) Metzg.

    2.4 芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列的親水性和疏水性分析

    采用DNAMAN軟件對(duì)芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列進(jìn)行親水性和疏水性分析,結(jié)果(圖6)表明:AgICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列的親水性區(qū)域中,第300位至第312位氨基酸親水性最強(qiáng);疏水性區(qū)域中,第441位至第447位氨基酸疏水性最強(qiáng)??傮w上看,AgICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列的親水性區(qū)域多于疏水性區(qū)域,為親水性蛋白。

    圖6 芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列的親水性(A)和疏水性(B)

    2.5 芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1基因在不同組織和逆境處理下的表達(dá)特性分析

    RT-qPCR檢測(cè)結(jié)果(圖7)表明:芹菜品種‘津南實(shí)芹’根、葉柄以及葉片中均能夠檢測(cè)到AgICE1基因的表達(dá),但其在不同組織中相對(duì)表達(dá)水平的差異較大。AgICE1基因在葉片中的相對(duì)表達(dá)水平顯著高于根和葉柄中的相對(duì)表達(dá)水平,且根和葉柄間相對(duì)表達(dá)水平的差異不顯著。

    高溫(38 ℃)、低溫(4 ℃)、干旱(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù)20% PEG6000)和高鹽(0.2 mol·L-1NaCl)4種非生物脅迫處理下芹菜品種‘津南實(shí)芹’葉片中AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平見(jiàn)圖8。結(jié)果表明:不同非生物脅迫處理下芹菜品種‘津南實(shí)芹’葉片中AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平差異較大。

    高溫處理1 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平較處理0 h略有降低;高溫處理2、4和8 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平較處理0 h有所升高,分別為處理0 h的2.48、4.67和2.61倍;高溫處理24 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平較處理0~8 h顯著升高,為處理0 h的9.45倍。

    低溫處理1 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平較處理0 h升高,為處理0 h的1.66倍;低溫處理4 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平較處理0 h有所降低;低溫處理8 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平與處理0 h相比無(wú)明顯變化;低溫處理2和24 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平均顯著增加,分別為處理0 h的3.17和4.53倍。

    不同的小寫(xiě)字母表示在0.05水平上差異顯著Different lowercases indicate the significant difference at 0.05 level.

    不同的小寫(xiě)字母表示在0.05水平上差異顯著Different lowercases indicate the significant difference at 0.05 level.A: 高溫(38 ℃)High temperature (38 ℃); B: 低溫(4 ℃)Low temperature (4 ℃); C: 干旱(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù)20% PEG6000)Drought (mass volume fraction of 20% PEG6000); D: 高鹽(0.2 mol·L-1 NaCl)High salt (0.2 mol·L-1 NaCl).

    干旱處理1 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平較處理0 h顯著升高,為處理0 h的4.29倍;干旱處理2和8 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平均較處理0 h有所升高,分別為處理0 h的1.24和2.02倍;干旱處理4 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平最高,為處理0 h的9.03倍;干旱處理24 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平較處理0 h略有降低。

    高鹽處理1~24 h,AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平均較處理0 h有不同程度的升高,分別為處理0 h的3.30、1.55、2.30、2.54和2.95倍,其中,高鹽處理1 hAgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平最高。

    3 討論和結(jié)論

    低溫脅迫是植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中常見(jiàn)的一種非生物脅迫,不僅會(huì)導(dǎo)致作物產(chǎn)量降低,嚴(yán)重時(shí)還會(huì)導(dǎo)致植株死亡[20]。芹菜作為重要的葉菜類(lèi)蔬菜作物,在其栽培過(guò)程中經(jīng)常受到因氣候變化及不良土壤環(huán)境引起的非生物脅迫,嚴(yán)重影響芹菜的正常生長(zhǎng)發(fā)育。本研究從芹菜品種‘津南實(shí)芹’中克隆獲得AgICE1基因。該基因的開(kāi)放閱讀框編碼484個(gè)氨基酸,其氨基酸序列的第300位至第346位氨基酸間包含bHLH保守域。與其他植物ICE1轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸序列的多重比對(duì)結(jié)果表明:ICE1轉(zhuǎn)錄因子在進(jìn)化上具有保守性。通過(guò)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的分析可發(fā)現(xiàn),ICE1轉(zhuǎn)錄因子在同科植物間的親緣關(guān)系更近。RT-qPCR結(jié)果顯示:芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1基因在根、葉柄和葉片中均可表達(dá)但是相對(duì)表達(dá)水平差異較大,其在葉片中的相對(duì)表達(dá)水平顯著高于根和葉柄,說(shuō)明該基因的表達(dá)存在明顯的組織特異性。高溫(38 ℃)、低溫(4 ℃)、干旱(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù)20% PEG6000)和高鹽(0.2 mol·L-1NaCl)4種非生物脅迫處理下芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1基因的相對(duì)表達(dá)水平總體上有不同程度的升高,說(shuō)明AgICE1轉(zhuǎn)錄因子與非生物脅迫調(diào)控相關(guān)。

    已有研究結(jié)果表明:植物中許多基因家族的轉(zhuǎn)錄因子與植物的抗逆性有關(guān),這些轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)特異性識(shí)別并結(jié)合下游基因啟動(dòng)子中的順式作用元件來(lái)調(diào)控植物的抗逆應(yīng)答,如CBF/DREB是一類(lèi)可以調(diào)控多個(gè)與干旱、高鹽及低溫脅迫相關(guān)的功能基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子家族,在植物抵抗非生物脅迫中起重要作用[21-22]。ICE1轉(zhuǎn)錄因子可以與CBF3基因上游啟動(dòng)子結(jié)合從而激活CBF3基因的表達(dá)。黃瑩等[12]認(rèn)為,缺失ICE1基因的擬南芥會(huì)引起CBF3基因表達(dá)變化,使植物喪失抗寒能力;但在高溫條件下,擬南芥中CBF3基因未被激活,由此推測(cè)ICE1轉(zhuǎn)錄因子與CBF3基因上游啟動(dòng)子的結(jié)合存在低溫誘導(dǎo)型的修飾調(diào)控。也有研究發(fā)現(xiàn),與對(duì)照組相比,過(guò)量表達(dá)CBF3基因的轉(zhuǎn)基因擬南芥不僅抗寒性增強(qiáng),而且對(duì)干旱和高鹽脅迫也具有一定的抗性[23]。目前對(duì)ICE轉(zhuǎn)錄因子激活CBF類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子家族的研究多集中于其在抗低溫脅迫中的重要作用,而對(duì)其他非生物脅迫響應(yīng)的研究報(bào)道較少,因此,關(guān)于ICE1基因在非生物脅迫中具體的作用機(jī)制還有待進(jìn)一步的深入研究[24]。

    高等植物抵抗非生物脅迫的生理生化過(guò)程非常復(fù)雜,有研究認(rèn)為,植物的耐受性與其體內(nèi)的抗氧化酶活性相關(guān)[25]。當(dāng)植物受到逆境脅迫時(shí),體內(nèi)會(huì)產(chǎn)生過(guò)量的活性氧毒害細(xì)胞,植物本身可以通過(guò)產(chǎn)生抗氧化酶來(lái)清除這些有害物質(zhì),從而增強(qiáng)其抗逆能力[26-27]。已有的抗逆性相關(guān)研究結(jié)果[28]表明:植物在抵抗逆境過(guò)程中有著復(fù)雜的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。本文研究了芹菜品種‘津南實(shí)芹’AgICE1基因?qū)Ψ巧锩{迫的響應(yīng),對(duì)了解AgICE1基因在芹菜抗逆境脅迫中發(fā)揮的作用提供了參考,但對(duì)芹菜的抗逆性研究還需從分子及生理生化等方面進(jìn)行深入探討。

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