籽用南瓜育種研究進(jìn)展

史玉滋 馬 瑋 孫廷珍 段 穎 王長林

（中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室，北京 100081）

南 瓜 為 葫 蘆 科（Cucurbitaceae） 南 瓜 屬（Cucurbita）一年生草本植物，其種子含有豐富的必需氨基酸、脂肪酸、礦質(zhì)元素、抗氧化物等，具有較高的營養(yǎng)價值和藥用保健價值（王萍 等，2001；Nawirska-Olszańska et al.，2013）。籽用南瓜（seed-used pumpkin）是以種子作為主要食用器官或加工對象的南瓜類總稱，包括美洲南瓜（Cucurbita pepo）、中國南瓜（C.moschata）、印度南瓜（C.maxima）、黑籽南瓜（C.f icifolia）等（趙一鵬 等，2004）。

我國籽用南瓜年栽培面積約30 萬～40 萬hm2，生產(chǎn)主要集中在黑龍江、新疆和內(nèi)蒙古三大產(chǎn)區(qū)，年產(chǎn)量約30 萬～40 萬t，年出口量達(dá)12 萬～ 15 萬t，主要銷往西歐、北美、中東、東南亞及我國港、澳地區(qū)，出口量約占世界籽用南瓜市場份額的70%，籽用南瓜產(chǎn)業(yè)已成為我國南瓜生產(chǎn)的優(yōu)勢特色產(chǎn)業(yè)（魏照信 等，2013；任建忠和魏照信，2018）。籽用南瓜種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀呈現(xiàn)出較為豐富的遺傳多樣性，作為商品類型可分為光板（美洲南瓜）、毛邊（中國南瓜）、白板或雪白片（印度南瓜）、黃厚皮（印度南瓜）、裸仁（主要為美洲南瓜）和黑籽（黑籽南瓜）等（周鎖奎 等，1995；于紅茹和蘇國輝，2001；魏照信 等，2013）。我國籽用南瓜生產(chǎn)最初以地方品種或農(nóng)家品種為主，瓜籽產(chǎn)量低且不穩(wěn)定。20 世紀(jì)80 年代后期開始，經(jīng)過廣大科技工作者的不懈努力，已育成了一系列的優(yōu)良品種，其中包括平?jīng)龃蟀鬃押推經(jīng)鲅┌鬃眩ㄖ苕i奎 等，1995）、甘南1 號（孫為民 等，2002）、銀輝1 號（張耀偉 等，2002）、梅亞雪城1 號（吉新文 等，2002）、梅亞雪城2 號（吉林 等，2007）和銀輝3 號（徐文龍 等，2018）等白板類型籽用印度南瓜品種；寶庫1 號（刁靜剛 等，2005）、綠農(nóng)1 號（張艷紅，2007）、金無殼、金平果★★（魏照信 等，2013）等裸仁類型籽用美洲南瓜品種；金蘋果AA、金平果新1 號、瑞豐9 號以及晶瑩、晶板系列（魏照信 等，2013）、金龍瓜1 號（韓俊巖 等，2018）等光板類型籽用美洲南瓜品種，這些品種在生產(chǎn)中的相繼應(yīng)用，為籽用南瓜的發(fā)展提供了有利的技術(shù)保障。目前生產(chǎn)上白板類型的籽用印度南瓜以常規(guī)品種為主，占90%以上，光板類型的籽用美洲南瓜90%以上為雜交品種，裸仁類型的籽用美洲南瓜雜交種使用比率較大，占95% 以上。

我國的籽用南瓜遺傳育種研究起步較晚，科研力量相對薄弱，相關(guān)基礎(chǔ)研究落后于肉用南瓜，限制了育種技術(shù)的提升與產(chǎn)業(yè)發(fā)展。目前，利用現(xiàn)代生物學(xué)手段培育優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)的南瓜新品種，是解決南瓜產(chǎn)業(yè)目前面臨問題的重要手段之一（鄭楊 等，2018）。近年來，南瓜屬多個栽培種的基因組和轉(zhuǎn)錄組測序工作相繼完成，一些籽用南瓜農(nóng)藝性狀的研究也取得了突破性成果，為系統(tǒng)開展籽用南瓜品種選育工作奠定了基礎(chǔ)（Montero-Pau et al.，2017；Sun et al.，2017）。本文從籽用南瓜種質(zhì)資源的評價與遺傳多樣性研究、產(chǎn)量相關(guān)性狀研究、種子農(nóng)藝性狀的遺傳定位及調(diào)控機(jī)制等方面進(jìn)行綜述，提出籽用南瓜育種面臨問題及對策，并對產(chǎn)業(yè)未來發(fā)展方向進(jìn)行展望，以期為籽用南瓜育種工作提供參考。

1 籽用南瓜種質(zhì)資源的鑒定評價與遺傳多樣性

對種質(zhì)資源進(jìn)行鑒定評價是獲得優(yōu)異育種材料的必要手段。張巖等（2012）對內(nèi)蒙古地區(qū)21 份籽用南瓜種質(zhì)資源的耐旱性和白粉病抗性進(jìn)行了研究，獲得抗白粉病材料5 份（中國南瓜2 份，美洲南瓜3 份），耐旱材料2 份（均為印度南瓜），為進(jìn)一步挖掘和利用內(nèi)蒙古地區(qū)籽用南瓜種質(zhì)資源提供了理論基礎(chǔ)。周克琴等（2003）、趙茜和徐麗珍（2012）分別對不同籽用南瓜的抗疫病和抗白粉病能力進(jìn)行了評價，均獲得抗病材料；靳娜（2012）對21 份籽用南瓜種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀、親緣關(guān)系和白粉病抗性進(jìn)行調(diào)查研究，并從中選取6 個籽用南瓜品種進(jìn)行脂肪酸、粗脂肪、蛋白質(zhì)、氨基酸、淀粉等營養(yǎng)成分分析，結(jié)果表明參試的印度南瓜品種和美洲南瓜品種的種子中粗脂肪含量均達(dá)到50%以上。

對籽用南瓜的遺傳多樣性進(jìn)行研究可以揭示不同種質(zhì)之間的遺傳變異程度和親緣關(guān)系，為親本選擇和種質(zhì)創(chuàng)制及利用提供依據(jù)。早期遺傳多樣性研究多以植物學(xué)性狀為主（曹麗霞和陳貴林，2009），張巖等（2010）對18 份籽用南瓜種質(zhì)的36個農(nóng)藝性狀進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)花萼形狀、葉片白斑、瓜面特征、種子周緣等質(zhì)量性狀可作為區(qū)別不同籽用南瓜栽培種的主要形態(tài)指標(biāo)。屈淑平等（2013）利用44 個形態(tài)學(xué)標(biāo)記對2 個栽培種的76 份種質(zhì)進(jìn)行聚類，認(rèn)為皮殼質(zhì)量、種仁質(zhì)量、千粒重、種子顏色、瓜型為籽用南瓜資源植物學(xué)描述評價的代表性狀。王豐豐等（2018）利用50 個形態(tài)學(xué)標(biāo)記，對3 個栽培種38 份籽用南瓜種質(zhì)的遺傳多樣性進(jìn)行評價，發(fā)現(xiàn)在歐氏距離10.38 時，可將籽用南瓜分為4 個類群，并認(rèn)為種子千粒重、老瓜肉厚和老瓜內(nèi)腔縱徑可作為評價籽用南瓜品種的綜合性 指標(biāo)。

采用細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、分子標(biāo)記結(jié)合形態(tài)學(xué)分析法，可以提高對籽用南瓜種質(zhì)資源多樣性評價的準(zhǔn)確性。Liu 等（2013a）利用35 個SSR 分子標(biāo)記，將來源于中國和俄羅斯的籽用南瓜種質(zhì)劃分為2 個栽培種及亞群，并發(fā)現(xiàn)其與形態(tài)學(xué)聚類結(jié)果較為一致；王豐豐等（2017）利用SCoT（start codon targeted polymorohism）分子標(biāo)記將3 個栽培種的44 份籽用南瓜進(jìn)行系統(tǒng)分類，獲得2 份特異性較強(qiáng)的種質(zhì)，通過與形態(tài)學(xué)聚類進(jìn)行比較后，進(jìn)一步肯定了多種分子標(biāo)記結(jié)合形態(tài)學(xué)標(biāo)記的方法在籽用南瓜遺傳多樣性分析上的可應(yīng)用性。

2 籽用南瓜產(chǎn)量相關(guān)性狀

2.1 產(chǎn)量構(gòu)成因素

種子產(chǎn)量是籽用南瓜最重要的農(nóng)藝性狀之一。對籽用美洲南瓜（光板有殼）種質(zhì)的產(chǎn)量構(gòu)成進(jìn)行研究，通過測定果實長寬、單瓜質(zhì)量、單瓜種子產(chǎn)量、單瓜種子數(shù)、百粒重、籽粒長度、籽粒寬度、籽粒厚度等性狀并進(jìn)行相關(guān)性分析和通徑分析，發(fā)現(xiàn)單瓜種子產(chǎn)量主要由百粒重和單瓜種子數(shù)決定（王萍 等，2012）。進(jìn)一步的分析表明籽粒長度和籽粒寬度直接影響產(chǎn)量構(gòu)成，其中籽粒長度與單瓜種子數(shù)密切相關(guān)，而籽粒寬度則與百粒重密切相關(guān)（Darrudi et al.，2018）。對籽用南瓜產(chǎn)量因子遺傳力的研究表明，單瓜籽粒數(shù)的遺傳力大于籽粒質(zhì)量，因此，在早期世代選擇時，可以優(yōu)先選擇單瓜籽粒數(shù)多的種質(zhì)（趙福寬 等，2000）。

對籽粒長度和寬度的遺傳分析表明，印度南瓜籽粒長度和寬度受到核基因控制，與胞質(zhì)遺傳無關(guān)，大籽粒對小籽粒表現(xiàn)為不完全顯性。籽粒長度和寬度均符合 D2 模型，且主基因效應(yīng)明顯（向成鋼，2013）。對印度南瓜籽粒長和籽粒寬的配合力進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)這2 個性狀的一般配合力方差大于特殊配合力方差，說明這些性狀以基因加性效應(yīng)占主導(dǎo)地位（徐東輝 等，2006）。研究還發(fā)現(xiàn)，籽粒大小與南瓜果實的大小呈正相關(guān)，而籽粒形狀與南瓜果實的形狀呈負(fù)相關(guān)（Paris & Nerson，2003），因此果形指數(shù)也會影響單瓜產(chǎn)量（王萍 等，2012）。

2.2 重要產(chǎn)量構(gòu)成因子的QTL 定位

利用不同的遺傳群體和分子標(biāo)記，對南瓜種子寬度和長度的QTL 定位研究已經(jīng)取得了一些進(jìn)展。目前發(fā)表了7 個籽粒寬度位點和3 個籽粒長度位點。譚行之等（2013）以 F2群體為試材，運用 SSR、AFLP、EST-SSR 這 3 類分子標(biāo)記技術(shù)構(gòu)建南瓜遺傳圖譜，采用復(fù)合區(qū)間作圖的方法對粒寬進(jìn)行QTL 定位，檢測到與南瓜粒寬性狀有關(guān)聯(lián)的4個QTL。毛曉微（2016）利用1 個F2遺傳群體，通過測序分型技術(shù)（genotyping by sequencing，GBS）建立了包含 456 個SNP 標(biāo)記的遺傳連鎖圖譜，共檢測到3 個與南瓜籽粒粒長性狀相關(guān)的QTL，分別位于第1、3、10 號連鎖群上，命名為 qLms1、qLms2、qLms3；同時也檢測到3 個跟南瓜籽粒粒寬性狀有關(guān)的QTL，分別位于第 3、5、10號連鎖群上，命名為 qWms1、qWms2、qWms3。對這些位點的準(zhǔn)確性進(jìn)行預(yù)測將有助于進(jìn)行大籽粒性狀的分子標(biāo)記輔助育種。

目前對南瓜籽粒質(zhì)量的研究較少，在葫蘆科其他作物中開展的研究表明，籽粒質(zhì)量表現(xiàn)為數(shù)量性狀的遺傳特征。利用1 個西瓜F2遺傳群體構(gòu)建CAPS 標(biāo)記遺傳圖譜，共定位了23 個與西瓜種子性狀有關(guān)的QTL 位點，其中種子寬度和百粒重的主效位點共同定位在第6 號連鎖群2 個標(biāo)記之間，說明該區(qū)域可能是種子性狀相關(guān)基因的富集區(qū)（周慧文 等，2016）。利用西瓜其他種質(zhì)構(gòu)建的遺傳群體進(jìn)行研究，也獲得了一些與百粒重相關(guān)的QTL位點，如SHW6.1、SHW9.1（遲瑩瑩 等，2017）；在甜瓜和黃瓜中也檢測到一些與籽粒百粒重相關(guān)的QTL 位點（王賢磊 等，2011；王敏 等，2014）。南瓜籽粒質(zhì)量可能表現(xiàn)出類似的遺傳調(diào)控機(jī)制，對此尚有待利用遺傳群體對南瓜種子相關(guān)性狀進(jìn)行QTL定位和基因克隆等研究。

3 籽用南瓜種皮顏色性狀

籽用南瓜有殼品種根據(jù)種皮顏色不同可分為大白板（種皮白色）、光板（種皮白黃色）和黑籽南瓜（種皮黑色）等，對種皮顏色遺傳和調(diào)控機(jī)制進(jìn)行研究，并開發(fā)相應(yīng)的分子標(biāo)記輔助選育，有助于加快優(yōu)良性狀在不同種質(zhì)材料之間的轉(zhuǎn)育和聚合，提高選育效率（Yan et al.，2009）。目前對于南瓜種皮顏色遺傳定位和致色物質(zhì)成分分析等研究尚不多見，但在葫蘆科和其他物種中已經(jīng)取得一些進(jìn)展（Negi et al.，2000）。研究表明，甜瓜種子種皮顏色為1 對核基因控制的質(zhì)量性狀，白色對黃色為顯性，并利用CAPS 標(biāo)記將種皮顏色定位到5 號連鎖群（張可鑫 等，2018）。絲瓜種皮顏色的變異符合1 對基因控制的質(zhì)量性狀遺傳特點，種皮黑色對白色為顯性（周慶友，2013）。西瓜種皮底色表現(xiàn)出質(zhì)量性狀遺傳特征，但F2不符合孟德爾遺傳分離定律（尚建立 等，2015）。目前尚未在葫蘆科作物中克隆到直接調(diào)控種皮顏色的 基因。

關(guān)于種皮顏色調(diào)控機(jī)制，在擬南芥和油菜中研究較為深入（Zhang et al.，2009）。種皮致色物質(zhì)主要是黃酮醇（f lavonol）和原花色素（proanthocynidins）等（Dean et al.，2011），與木質(zhì) 素位于同一代謝途徑。該途徑起始底物來源于苯丙烷類代謝途徑的香豆酰輔酶A（coumaroyl-CoA）和來自乙酰輔酶A 的丙二酰輔酶A（malonyl-CoA），經(jīng)一系列酶催化作用，形成花青苷（anthocyanin）、黃酮醇和單寧類物質(zhì)，最終使種皮呈現(xiàn)深褐色（Debeaujon et al.，2003）。野生型擬南芥種皮呈深褐色，而突變體種皮呈現(xiàn)出黃色、灰褐色至透明等不同顏色。在種皮顏色突變體中，編碼類黃酮生物合成中的一些酶和蛋白質(zhì)的基因突變導(dǎo)致植物體內(nèi)合成不同的類黃酮終產(chǎn)物，或者使類黃酮的積累量發(fā)生改變，從而引起種皮顏色 變 異（Liu et al.，2013b；Liu et al.，2014）。目前在擬南芥中已經(jīng)克隆到的種皮顏色基因主要有TT1（transparent testa gene 1）～TT19，TTG1、TTG2 以 及BAN、FLS1、FLOX 等（Chen et al.，2014），這些基因有一些是作為結(jié)構(gòu)基因編碼類黃酮代謝途徑中的酶；也有一些編碼轉(zhuǎn)錄因子，對結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄調(diào)控；還有部分編碼色素轉(zhuǎn)運蛋白參與類黃酮物質(zhì)的轉(zhuǎn)運和積累。推測葫蘆科作物的種皮顏色可能也通過類似的合成代謝機(jī)制進(jìn)行 調(diào)控。

4 籽用南瓜無殼性狀

無殼南瓜又稱為裸仁南瓜，最早在19 世紀(jì)發(fā)現(xiàn)于美洲南瓜中（Techermak-Seysenegg，1934）。由于無殼籽粒食用方便，易于加工處理，籽粒富含不飽和脂肪酸，對無殼南瓜的研究也日益深入（鄒伶威 等，2012）。解剖學(xué)研究發(fā)現(xiàn)有殼籽粒的種皮可分為5 層結(jié)構(gòu)：表皮層、下皮層、厚壁組織層、薄壁組織層和綠色組織層（Zraidi，2003；Li et al.，2013）。隨著種子發(fā)育成熟，種皮的下皮層和厚壁組織木質(zhì)化形成堅硬的外種皮。利用光學(xué)顯微鏡和掃描電鏡對不同發(fā)育時期的種皮結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)有殼種質(zhì)的皮層細(xì)胞和通氣組織細(xì)胞出現(xiàn)纖維狀或網(wǎng)狀的細(xì)胞壁次生加厚結(jié)構(gòu)；而無殼種質(zhì)的種皮早期發(fā)育與有殼種質(zhì)類似，但在發(fā)育中期種皮逐漸缺失，其表皮層、下皮層、厚壁組織層和薄壁組織層在發(fā)育過程中逐漸解體退化，且不同種質(zhì)的皮層缺失位置不同（Murovec et al.，2012）。此外，種子邊緣結(jié)構(gòu)也存在差異（Li et al.，2013）。種皮成分分析顯示無殼種質(zhì)的種皮纖維素和木質(zhì)素含量大幅度降低，與木質(zhì)素合成有關(guān)的酶活性也降低（Stuart & Loy，1983；薛應(yīng)鈺 等，2011），最終導(dǎo)致種子外僅存留一層薄 種皮。

利用遺傳群體對美洲南瓜無殼性狀進(jìn)行遺傳分析，結(jié)果表明，無殼性狀是由1 對核基因控制的隱性性狀（薛應(yīng)鈺 等，2011），而種皮厚度性狀則是數(shù)量性狀，受到一系列位點共同修飾（Teppner，2000；張仲保，2004）。我國南瓜育種家周祥麟通過連續(xù)自交，在中國南瓜中獲得1 個裸仁南瓜株系，通過遺傳分析發(fā)現(xiàn)中國南瓜種皮有無是由1 對單基因控制的隱性性狀，且薄種皮厚度由微效基因控制（周祥麟，1987），與美洲南瓜裸仁性狀的遺傳規(guī)律類似。目前尚未見裸仁印度南瓜種質(zhì)的相關(guān)報道。

采用高效液相色譜法（HPLC）對有殼和無殼籽粒種皮成分進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)無殼籽粒的纖維素、半纖維素、木質(zhì)素含量較低，而腐胺、精胺、亞精胺等多胺含量較高，推測這是由于種皮木質(zhì)素合成速率低，導(dǎo)致多胺類物質(zhì)與酚醛酸結(jié)合減少（Bezold et al.，2003）。木質(zhì)素合成主要依賴苯丙烷代謝途徑，與類黃酮和花色素合成途徑密切相關(guān)，關(guān)鍵酶主要包括苯丙氨酸解氨酶（PAL）、4-香豆酰-CoA 連接酶（4CL）、肉桂酸-4-羥基化酶（C4H）、肉桂醇脫氫酶（CAD）和過氧化物酶（POD）等。研究表明CCR 與PAL 基因?qū)γ乐弈瞎戏N皮發(fā)育與形成具有重要作用（陳剛 等，2013，劉佳，2014）。此外在有殼和無殼種皮中發(fā)現(xiàn)，谷胱甘肽還原酶、脫落酸響應(yīng)蛋白、絲氨酸-蘇氨酸激酶等編碼基因的轉(zhuǎn)錄水平差異較為顯著，可能也參與到木質(zhì)素合成代謝途徑中（Bezold et al.，2005）。近年來的研究表明，花色素代謝途徑中的重要轉(zhuǎn)錄因子MYB75 參與調(diào)控植株主莖中的木質(zhì)素合成，MYB75 是否也有可能作為植物種皮結(jié)構(gòu)與顏色的關(guān)鍵調(diào)控因子，有待于進(jìn)一步深入研究（Bhargava et al.，2010）。

目前，對無殼性狀的定位研究也取得一定進(jìn)展。早期利用ISSR、SRAP 和SSR 分子標(biāo)記對無殼性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析和集群分析，獲得了一些連鎖標(biāo)記（武峻新，2011；Inan et al.，2012）。利用RAPD、AFLP 和SSR 等標(biāo)記，在2 個不同的美洲南瓜遺傳群體中對無殼基因n 進(jìn)行比較定位，共獲得7 個與n 連鎖的標(biāo)記，其中最近遺傳距離為3 cM（Zraidi et al.，2007）。隨后，李智媛等（2011）在另一個美洲南瓜有殼與無殼親本雜交的F2遺傳群體中，利用集群分析法篩選到4 個與美洲南瓜裸仁基因n 連鎖的AFLP 標(biāo)記，最近遺傳距離為8.9 cM。鄒伶威（2013）采用SSR 標(biāo)記方法獲得4 個與裸仁性狀基因n 緊密連鎖的標(biāo)記，最近遺傳距離為5.7 cM。

5 籽用南瓜油用性狀

籽用南瓜種仁油脂含量高，是油類和蛋白質(zhì)的優(yōu)質(zhì)源泉，是營養(yǎng)保健佳品。并且，對于含油量較高的籽用南瓜品種，其單位面積的產(chǎn)油量要顯著高于大豆，可以作為新型的油料作物進(jìn)行栽培（張耀偉 等，2005）。印度南瓜種子粗脂肪含量（含油量）達(dá)到37.94%～59.36%，不飽和脂肪酸含量28.35%～80.84%，亞油酸含量20.87%～58.10%；美洲南瓜種子粗脂肪含量達(dá)到29.33%～53.02%，不飽和脂肪酸含量56.44%～61.34%，亞油酸含量10.37%～51.19%。中國南瓜種子粗脂肪含量達(dá)到48.61%～51.71%，不飽和脂肪酸含量71.64%～79.29%， 亞 油 酸 含 量31.47%～57.73%（王萍 等，1997；張耀偉 等，2005；Meru et al.，2018）。籽用南瓜不同栽培種以及相同栽培種的不同品種之間，種子的粗脂肪含量及組成成分間差異顯著，這也為定向選育含油量高及不飽和脂肪酸等保健功能成分含量高的品種提供了資源保障。

Meru 等（2018）的研究表明，美洲南瓜的種子含油量與種子大小呈正相關(guān)，而與種子蛋白質(zhì)含量呈負(fù)相關(guān)，且裸仁類型品種的含油量顯著高于有殼類型品種。Murkovic 等（1999）研究發(fā)現(xiàn)，美洲南瓜雜交后代種子粗脂肪、油酸、亞油酸含量介于雙親之間，硬脂酸含量高于雙親，棕櫚酸含量低于雙親，并提出可以通過培育叢生習(xí)性的品種來提高種子含油量。

6 籽用南瓜育種存在問題與展望

我國籽用南瓜的育種工作已經(jīng)取得了顯著進(jìn)步，但隨著籽用南瓜產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展，對品種也提出了更多、更高的要求，這給籽用南瓜的育種工作提出了新的課題。目前籽用南瓜育種尚存在以下 問題。

種質(zhì)資源匱乏，遺傳背景狹窄。缺少優(yōu)異的具有重大突破性的種質(zhì)材料是限制籽用南瓜育種的關(guān)鍵問題。由于種質(zhì)資源材料類型少、創(chuàng)新不夠，導(dǎo)致選育出的優(yōu)良品種較少，新品種更新?lián)Q代慢，尤其針對不同區(qū)域、不同栽培模式的優(yōu)勢品種不多，許多品種趨同性強(qiáng)。生產(chǎn)中之所以缺少優(yōu)良的印度南瓜類型和中國南瓜類型籽用南瓜雜交品種，也主要是由于可直接利用的種質(zhì)資源過少。因此，加大搜集、整理種質(zhì)資源力度，發(fā)掘與創(chuàng)制籽用南瓜優(yōu)異種質(zhì)，拓展種質(zhì)基礎(chǔ)仍將是當(dāng)前籽用南瓜育種工作的首要任務(wù)。

基礎(chǔ)研究薄弱，導(dǎo)致籽用南瓜育種進(jìn)展緩慢。由于對主要病害（如疫病、病毒病和白粉病等）抗病性和主要營養(yǎng)品質(zhì)（如口感、含油量、主要功能成分等）的遺傳規(guī)律和遺傳機(jī)制研究較少，優(yōu)異性狀的挖掘及轉(zhuǎn)育工作滯后，導(dǎo)致生產(chǎn)上綜合性狀優(yōu)異的抗病品種、高品質(zhì)品種和加工專用品種等嚴(yán)重缺乏。目前，疫病、病毒病和白粉病等病害仍對籽用南瓜的生產(chǎn)威脅嚴(yán)重；籽用南瓜種子含油量高且不同品種間差異較大，部分種質(zhì)資源的單位面積產(chǎn)油量甚至高于大豆，但目前市場上尚沒有專門的油用籽用南瓜品種。此外，開展適宜大面積機(jī)械化栽培的矮化株型育種、適宜我國高寒地區(qū)種植的早熟育種，以及高保健或藥用成分含量的功能育種等工作，都將受到籽用南瓜育種工作者的重視。

育種方法亟需改進(jìn)，育種效率有待提高。籽用南瓜育種起步晚，種質(zhì)資源遺傳背景狹窄，育種方法主要以傳統(tǒng)手段為主，田間工作量大，育種效率不高，品種選育年限長?，F(xiàn)代生物技術(shù)手段與傳統(tǒng)選育方法相結(jié)合，可以大大提高育種效率。如在資源創(chuàng)新上，通過單倍體培養(yǎng)、大孢子培養(yǎng)、遠(yuǎn)緣雜交、輻射誘變等手段進(jìn)行種質(zhì)資源的擴(kuò)增、改良與創(chuàng)新，采用分子生物學(xué)及生物信息學(xué)等技術(shù)手段鑒定和解析影響產(chǎn)量、熟性、品質(zhì)、抗病蟲害等重要農(nóng)藝性狀的基因功能，開發(fā)實用的分子標(biāo)記輔助育種等。相信這些工作的展開，將為我國籽用南瓜的品種選育及種質(zhì)創(chuàng)新提供更為豐富的理論依據(jù)，極大地提高育種效率，加快育種進(jìn)程，促進(jìn)我國籽用南瓜產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。