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    線粒體DNA與肺部疾病的研究進(jìn)展

    2018-03-18 04:28:41毛明清李男宋楠加慧李云霞夏書(shū)月
    關(guān)鍵詞:肺纖維化線粒體肺部

    毛明清,李男,宋楠,加慧,李云霞,夏書(shū)月*

    (1.沈陽(yáng)醫(yī)學(xué)院內(nèi)科學(xué)專(zhuān)業(yè)2016級(jí)碩士研究生,遼寧 沈陽(yáng) 110034;2.內(nèi)科學(xué)專(zhuān)業(yè)2015級(jí)碩士研究生;3.沈陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬中心醫(yī)院呼吸內(nèi)科)

    線粒體DNA(mtDNA)是真核細(xì)胞中唯一存在的除核DNA外的遺傳物質(zhì)[1-3]。每個(gè)細(xì)胞中有幾百至幾千個(gè)線粒體,且每個(gè)線粒體中又有2~10拷貝的mtDNA。近年來(lái),由于分子生物學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展,mtDNA在肺部疾病的診治及預(yù)后中的作用受到廣泛關(guān)注。線粒體在氧化磷酸化的同時(shí)產(chǎn)生大量自由基、mtDNA較核DNA的易突變性,以及mtDNA與細(xì)菌DNA的同源性等,使得mtDNA與肺部疾病的早期診斷、發(fā)生發(fā)展及預(yù)后有著密切關(guān)系。本文就mtDNA與肺部疾病的關(guān)系進(jìn)行綜述。

    1 mtDNA的結(jié)構(gòu)與生物學(xué)功能

    1.1 mtDNA的結(jié)構(gòu) 線粒體有內(nèi)外兩層膜封閉,包括外膜、內(nèi)膜、膜間隙和基質(zhì)四個(gè)功能區(qū)隔。人mtDNA是含有16 569 bp的閉環(huán)雙鏈分子,有輕、重鏈之分,又可分為編碼區(qū)和非編碼區(qū)兩個(gè)區(qū)域[1]。其編碼區(qū)共37個(gè)基因,其中13個(gè)基因編碼氧化磷酸化所需的13種多肽,包括復(fù)合物I(NADH脫氫酶)中的7個(gè)亞基(ND 1-6、NDS),復(fù)合物Ⅲ(細(xì)胞色素C還原酶)中的1個(gè)亞基(Cytb),復(fù)合物Ⅳ(細(xì)胞色素C氧化酶)中的3個(gè)亞基(COI-Ⅲ)以及ATP合成酶的2個(gè)亞基(ATPase6、ATPase8);同時(shí),mtDNA還可以編碼合成蛋白和生成ATP必需的22種tRNAs和2種rRNAs(16SrRNA、12SrRNA)。mtDNA無(wú)內(nèi)含子,唯一的非編碼區(qū)為D-loop區(qū),是mtDNA復(fù)制轉(zhuǎn)錄的調(diào)控區(qū),含有基因復(fù)制起點(diǎn)和負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的啟動(dòng)子區(qū)。

    1.2 mtDNA的生物學(xué)功能 線粒體是細(xì)胞凋亡的主要位點(diǎn),也是細(xì)胞內(nèi)氧化應(yīng)激的源頭[4]。線粒體可以通過(guò)線粒體通透性轉(zhuǎn)換孔(mtPTP)調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡,內(nèi)源性活性氧(ROS)是線粒體電子傳遞鏈發(fā)生氧化磷酸化反應(yīng)時(shí)伴隨產(chǎn)生的副產(chǎn)品[1]。mtDNA缺乏染色質(zhì)結(jié)構(gòu),不與組蛋白結(jié)合,且不被核膜所包裹,因此易受氧化損傷。此外,ROS會(huì)損傷線粒體脂質(zhì)和蛋白質(zhì),并誘發(fā)mtDNA發(fā)生突變[1]。而mtDNA本身又缺乏有效的DNA氧化損傷修復(fù)系統(tǒng)。因此,與核DNA相比,mtDNA更易發(fā)生突變。

    Margulis在1970年提出了“線粒體形成的內(nèi)共生學(xué)說(shuō)”,即在真核細(xì)胞的進(jìn)化過(guò)程中,細(xì)菌由于被原始真核細(xì)胞吞噬,在長(zhǎng)期互利共生中逐漸演化形成了現(xiàn)在的線粒體,而被吞噬細(xì)菌的DNA則演化成了現(xiàn)在的mtDNA[2]。研究顯示,mtDNA與細(xì)菌DNA的免疫刺激活性類(lèi)似,可以被機(jī)體固有的PRR免疫系統(tǒng)識(shí)別,從而激活炎癥反應(yīng)[4-6]。因此,mtDNA本身具有獨(dú)立于線粒體代謝的內(nèi)源性致炎作用。

    2 mtDNA與肺部疾病

    2.1 mtDNA與肺癌 原發(fā)性支氣管肺癌,簡(jiǎn)稱肺癌,為起源于支氣管黏膜或腺體的惡性腫瘤。在我國(guó),肺癌發(fā)病率為腫瘤的首位,并由于早期診斷不足致使預(yù)后差[7]。肺癌患者出現(xiàn)癥狀就診時(shí)大多已屬于晚期(Ⅲ/Ⅳ期),因此顯著提高生存率,仍有賴于早期診斷、規(guī)范治療和評(píng)估預(yù)后。由于mtDNA有長(zhǎng)度較短、分子結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單及數(shù)量大等特點(diǎn),使得外周血游離mtDNA成為倍受矚目的腫瘤早期監(jiān)測(cè)分子工具[8]。江磊[9]指出,mtDNA突變?cè)谠缙诎┙M織中大量存在,但在周?chē)恼=M織中少有發(fā)現(xiàn),提示其可能成為肺癌檢測(cè)的早期指標(biāo)提供依據(jù)。Huang等[10]研究發(fā)現(xiàn),在肺癌患者中,mtDNA作為篩查、診斷或預(yù)后工具的臨床實(shí)用性很弱。而Yang等[11]研究發(fā)現(xiàn),mtDNA突變?cè)诜伟┗颊叩暮舫鰵饫淠褐懈R?jiàn),可能作為肺癌患者篩選、診斷或預(yù)后的臨床實(shí)用工具。李林海[3]研究表明,mtDNA突變可削弱正常的細(xì)胞線粒體呼吸功能,釋放高水平的ROS,進(jìn)而增加腫瘤發(fā)生的危險(xiǎn)性,所以認(rèn)為腫瘤發(fā)生與mtDNA有密切關(guān)系。mtDNA的突變不僅在腫瘤的檢測(cè)上有一定的意義,在腫瘤的治療上也有一定意義。可以根據(jù)腫瘤細(xì)胞和正常細(xì)胞線粒體結(jié)構(gòu)和功能的差異,設(shè)計(jì)一種源頭創(chuàng)新的抗腫瘤藥物,其藥學(xué)機(jī)制為靶向突變的mtDNA且優(yōu)先破壞腫瘤細(xì)胞,而對(duì)正常細(xì)胞無(wú)影響或僅有很小的毒性。

    王紅梅等[12]研究發(fā)現(xiàn),mtDNA含量降低可能與非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的發(fā)生、轉(zhuǎn)移、治療和預(yù)后具有密切關(guān)系。薛金良[13]研究發(fā)現(xiàn),mtDNA 16390A/G 和16519T/C基因多態(tài)性與晚期NSCLC患者生存期相關(guān),G或T堿基攜帶者生存期顯著長(zhǎng)于A或C堿基攜帶者。江磊[9]研究發(fā)現(xiàn),mtDNA突變主要集中于HVRII區(qū)的OH區(qū),突變率最高的位點(diǎn)是73和263位點(diǎn),可為基因診斷提供參考。鄭世珍[14]通過(guò)對(duì)我國(guó)西南地區(qū)漢族人群肺癌易感相關(guān)性實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn),mtDNA單倍型與肺癌易感性密切相關(guān):mtDNA單倍型D和F是個(gè)體罹患肺癌的保護(hù)因素,單倍型G和M7是個(gè)體罹患肺癌的危險(xiǎn)因素。Qi等[15]研究發(fā)現(xiàn),在NSCLC患者中高度突變的mtDNA 10398G患者比低度突變的mtDNA 10398G患者有更長(zhǎng)的總生存期(P<0.05),低度突變的mtDNA 10398G異質(zhì)性可能作為NSCLC患者預(yù)后不良的標(biāo)志物。祁月瀟等[16]研究發(fā)現(xiàn),mtDNA含量低且10398A的NSCLC患者的總生存期顯著短于mtDNA含量高且10398G的患者,所以mtDNA含量和10398的基因型可能會(huì)成為預(yù)測(cè)NSCLC的新分子靶標(biāo)。Fang等[17]研究發(fā)現(xiàn),整個(gè)線粒體基因組有高頻率的體細(xì)胞突變,因此從整個(gè)mtDNA基因組中檢測(cè)體細(xì)胞突變,在一定程度上可作為中國(guó)人肺癌診斷的工具。Xu等[18]研究發(fā)現(xiàn),線粒體基因組DNA拷貝數(shù)是線粒體功能維持和細(xì)胞代謝獲取能量的關(guān)鍵,誘導(dǎo)NSCLC的上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)伴隨著mtDNA拷貝數(shù)的增多,表明能量代謝可促進(jìn)NSCLC的EMT過(guò)程。Ma等[19]研究表明,在A549肺癌細(xì)胞中,CXCL12通過(guò)極化線粒體再分配誘導(dǎo)肺癌細(xì)胞遷移,完整的mtDNA對(duì)線粒體再分配和CXCL12誘導(dǎo)的趨化反應(yīng)是極其重要的。

    2.2 mtDNA與急性肺損傷/急性呼吸窘迫綜合征 急性呼吸窘迫綜合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)是指由各種肺內(nèi)和肺外致病因素所導(dǎo)致的急性彌漫性肺損傷和進(jìn)而發(fā)展的急性呼吸衰竭。急性肺損傷(ALI)和ARDS是造成呼吸衰竭及多器官功能障礙的主要原因之一,病死率高達(dá)35%~40%[20]。Nakahira等[21]研究發(fā)現(xiàn),在分析僅有膿毒癥或ARDS患者時(shí),mtDNA濃度的升高增加了患者的死亡風(fēng)險(xiǎn)。何謙等[22]研究表明,沒(méi)食子兒茶素沒(méi)食子酸酯(EGCG)可以通過(guò)保護(hù)線粒體、減少mtDNA的釋放,從而降低百草枯導(dǎo)致的肺組織炎癥反應(yīng)水平。常玉立[23]在mtDNA激活內(nèi)皮細(xì)胞引起ALI的實(shí)驗(yàn)研究中發(fā)現(xiàn),臨床濃度的mtDNA即可早期活化微血管內(nèi)皮細(xì)胞(PMECs),增加其通透性,使其高表達(dá)黏附分子ICAM-1、E-selectin及血管活性因子vWF、EGDF等,提示創(chuàng)傷使組織細(xì)胞破裂,釋放mtDNA等成分入血,并且激活中性粒細(xì)胞和PMECs是創(chuàng)傷后全身炎癥反應(yīng)綜合征(SIRS)的啟動(dòng)因素。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)臨床水平的線粒體可溶性碎片經(jīng)大鼠尾靜脈注射后能誘發(fā)系統(tǒng)性炎癥,其主要活性物質(zhì)是mtDNA和線粒體甲?;鞍?,二者均可激活循環(huán)中的中性粒細(xì)胞,引起系統(tǒng)性炎癥[23]。Ruchko 等[24]指出,mtDNA損傷可能是氧化導(dǎo)致肺動(dòng)脈內(nèi)皮細(xì)胞凋亡的觸發(fā)物,了解mtDNA修復(fù)的限速?zèng)Q定因素可能成為干預(yù)ALI的新靶點(diǎn)。Zhang等[25]研究發(fā)現(xiàn),mtDNA含有未甲基化的CpG基序,表現(xiàn)出免疫刺激能力。LPS以依賴于TLR4的方式誘導(dǎo)mtDNA的釋放,而且mtDNA以依賴于TLR9而不依賴于TLR4的方式導(dǎo)致ALI和全身性炎癥反應(yīng)。Lee等[26]研究發(fā)現(xiàn),mtDNA以損傷相關(guān)分子模式(DAMPs)存在于濃縮紅細(xì)胞、新鮮冰凍血漿(FFP)及血小板中,從而為mtDNA介導(dǎo)輸血相關(guān)ALI提 供 證 據(jù) 。 Sun等[27]研 究 發(fā) 現(xiàn) ,mtDNA DAMPs在炎癥病理?xiàng)l件下增加內(nèi)皮細(xì)胞通透性,從而證明mtDNA DAMPs可能會(huì)成為ALI重要的治療目標(biāo)。Kuck等[28]研究發(fā)現(xiàn),mtDNA DAMPs介導(dǎo)細(xì)菌誘導(dǎo)的灌流大鼠肺血管損傷的前饋循環(huán),mtDNA與銅綠假單胞菌對(duì)血管濾過(guò)系數(shù)(Kf)的影響通過(guò)Toll樣受體9(TLR9)的寡核苷酸抑制劑,靶向線粒體的Ogg1以及通過(guò)將DNaseⅠ添加到灌注介質(zhì)中而減弱。所以深入研究mtDNA在ALI/ARDS發(fā)病機(jī)制中的具體作用,不僅可以為尋找新的治療靶點(diǎn)奠定理論基礎(chǔ),而且也有望在疾病的始動(dòng)環(huán)節(jié)上控制ALI的發(fā)生。

    2.3 mtDNA與慢阻肺、哮喘以及慢阻肺-哮喘重疊綜合征(ACOS) 慢性阻塞性肺疾病簡(jiǎn)稱慢阻肺(COPD),是以持續(xù)性氣流受限為特征,這種氣流受限通常呈進(jìn)行性發(fā)展,與氣道和肺部對(duì)有害顆粒物或氣體的增強(qiáng)的慢性炎癥反應(yīng)有關(guān)[29]。哮喘是一種異質(zhì)性疾病,通常以慢性氣道炎癥為特征。ACOS的特征是持續(xù)性氣流受限,同時(shí)具有與哮喘相關(guān)的特征和與COPD相關(guān)的特征。由于COPD復(fù)雜的病理生理特點(diǎn),其發(fā)病機(jī)制迄今尚未完全明了,遺傳易感性研究也無(wú)突破性進(jìn)展。戢福云等[30]研究發(fā)現(xiàn),具有mtDNA單倍型M7的個(gè)體易患COPD,而單倍型D和F則有助于個(gè)體抵御COPD的發(fā)生,其分子機(jī)制尚待深入闡明。Carpagnano等[31]研究表明,在炎癥/氧化呼吸道疾病中,分析呼出mtDNA與nDNA的比值,可作為一個(gè)新的呼出非侵入性標(biāo)志物。Carpagnano等[32]在新的研究中發(fā)現(xiàn),在ACOS患者中,mtDNA/nDNA比值增加,可知這種疾病存在線粒體功能障礙,這使得它更傾向于COPD而不是哮喘。因此mtDNA/nDNA的比值可作為鑒別診斷哮喘、COPD和ACOS的一個(gè)有效標(biāo)志物。Konokhova等[33]研究表明,與健康對(duì)照組相比,COPD患者肌肉中氧化損傷的DNA(8-OHdG)水平顯著更高,mtDNA缺失率更高。Liu等[34]研究發(fā)現(xiàn),COPD與白細(xì)胞mtDNA拷貝數(shù)和血清谷胱甘肽濃度降低有關(guān),其是由白細(xì)胞線粒體調(diào)節(jié)紊亂所致。

    2.4 mtDNA與睡眠呼吸暫停低通氣綜合征 睡眠呼吸暫停低通氣綜合征(sleep apnea hypopnea syndrome,SAHS)是由多種原因?qū)е滤郀顟B(tài)下反復(fù)出現(xiàn)低通氣和(或)呼吸中斷,引起間歇性低氧血癥伴高碳酸血癥以及睡眠結(jié)構(gòu)紊亂,進(jìn)而使機(jī)體發(fā)生一系列病理生理改變的臨床癥狀,包括:中樞型(CSAHS)、阻塞型(OSAHS)和混合型(MSAHS)[35]。 臨 床 上 最 常 見(jiàn) 的 SAHS 是OSAHS[35],患者多伴不同器官的損害。所以,對(duì)此疾病的早發(fā)現(xiàn)、早診斷和早治療對(duì)患者健康極其重要。李紅[36]研究發(fā)現(xiàn),OSAHS患者的mtDNA D-Loop區(qū)存在大量變異位點(diǎn),多為多態(tài)性現(xiàn)象;且mtDNA變異位點(diǎn)可能與OSAHS患者的臨床表現(xiàn)及并發(fā)癥有密切聯(lián)系;攜帶不同變異位點(diǎn)的OSAHS患者的臨床表現(xiàn)各不相同。Lacedonia等[37]研究發(fā)現(xiàn),OSAHS患者誘發(fā)的氧化應(yīng)激可致mtDNA損傷,間歇性缺氧可能是導(dǎo)致這一過(guò)程的主要機(jī)制。蘭國(guó)斌等[38]研究發(fā)現(xiàn),單純OSAHS或高血壓患者線粒體清除ROS的功能減退,促使細(xì)胞內(nèi)ROS水平明顯增加,損傷mtDNA,OSAHS合并高血壓患者的損傷更加嚴(yán)重。因此,OSAHS促發(fā)血壓升高可能是通過(guò)損傷線粒體功能從而增加細(xì)胞內(nèi)ROS濃度發(fā)生氧化應(yīng)激所致。

    2.5 mtDNA與肺纖維化 肺纖維化是肺組織損傷后常見(jiàn)的病理過(guò)程,表現(xiàn)為早期的彌漫性炎癥,后期的成纖維細(xì)胞過(guò)度增殖和細(xì)胞外基質(zhì)過(guò)度沉積,最終可引起呼吸衰竭,死亡率高達(dá)50%~70%[39]。目前認(rèn)為氧化應(yīng)激和細(xì)胞凋亡是肺纖維化的主要發(fā)病機(jī)制[4]。近幾年研究發(fā)現(xiàn),氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的mtDNA損傷促進(jìn)肺泡上皮細(xì)胞(AEC)的細(xì)胞凋亡和肺纖維化,OGG1/ACO-2/SIRT3/mtDNA軸在調(diào)節(jié)促進(jìn)肺纖維化的細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)中發(fā)揮重要作用,OGG1表達(dá)下調(diào)增強(qiáng)了石棉所致的肺纖維化,因此,mtDNA可能成為肺纖維化新的治療靶點(diǎn)[40-42]。Gazdhar等[43]在多變量模型中研究發(fā)現(xiàn),mtDNA缺失及mtDNA編碼的呼吸鏈功能障礙標(biāo)記物與肺TGF-β1濃度和預(yù)測(cè)肺纖維化顯著相關(guān)。

    2.6 mtDNA與肺炎 肺炎是指終末氣道、肺泡和肺間質(zhì)的炎癥,可由細(xì)菌、病毒、真菌、寄生蟲(chóng)等致病微生物,以及放射線、吸入性異物等理化因素引起。mtDNA作為重要的DAMPs,富含去甲基化的CpG序列,CpG單核苷酸通過(guò)TLR9受體,介導(dǎo)絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)磷酸化,上調(diào)NF-κB而進(jìn)一步誘導(dǎo)炎癥反應(yīng)[44]。姜慧[45]研究發(fā)現(xiàn),肺炎鏈球菌溶血素通過(guò)依賴Caspase,并涉及p38MAPK信號(hào)通路激活的方式激活線粒體途徑,誘導(dǎo)人急性單核細(xì)胞白血病單核細(xì)胞株(THP-1)凋亡。牟向東等[46]研究發(fā)現(xiàn),PCR法檢測(cè)肺孢子菌mtDNA對(duì)肺孢子菌肺炎(PCP)具有極高的臨床診斷價(jià)值,特別是痰液的PCR檢測(cè),可以作為一種無(wú)創(chuàng)的診斷方法,值得推廣。

    綜上所述,mtDNA在肺癌、ALI/ARDS、COPD、哮喘、ACOS、SAHS、肺纖維化、肺炎等肺部疾病的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。目前,mtDNA作用于肺部疾病的具體調(diào)控機(jī)制尚不十分清楚。隨著精準(zhǔn)醫(yī)療的不斷發(fā)展,對(duì)mtDNA相關(guān)機(jī)制的深入研究,將為其作為新的靶點(diǎn)進(jìn)行肺部疾病的診斷、治療與預(yù)后奠定基礎(chǔ)。

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