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      山羊痘病毒ORF112基因的克隆與序列分析

      2018-02-02 02:46:01豆思遠鄂承鈞郭慧琳尚立宏陳伯祥
      中國草食動物科學 2018年1期
      關(guān)鍵詞:痘病毒羊痘山羊

      豆思遠,鄂承鈞,郭慧琳,尚立宏,楊 明,陳伯祥

      (1.甘肅省動物疫病預(yù)防控制中心,蘭州 730046;2.甘肅省畜牧獸醫(yī)研究所,平?jīng)?740000)

      山羊痘是由山羊痘病毒(goat pox virus,GTPV)引起的一種急性、熱性、接觸性傳染病,病羊以發(fā)熱、全身起痘、呼吸道和消化道損傷以及淋巴結(jié)腫大為特征[1]。該病的流行不但對當?shù)仞B(yǎng)羊業(yè)的發(fā)展和農(nóng)牧民造成巨大的損失,還影響國際貿(mào)易,被OIE列為必須報告的疫病,也列為我國一類動物疫病。

      近年來,山羊痘疫情在世界各地尤其東亞地區(qū)呈暴發(fā)流行態(tài)勢。山羊痘基因組大小為143~147 kb,共有147個開放閱讀框(ORF),編碼密度93%,所編碼的蛋白質(zhì)含53~2 027個氨基酸不等[2]。大量研究證實,A27L蛋白是痘苗病毒細胞內(nèi)成熟病毒粒子(intracellular mature virion,IMV)重要的免疫保護抗原之一。A27L蛋白又稱融合蛋白,其能與細胞膜表面的氨基葡聚糖受體結(jié)合,介導病毒與細胞的黏附及由病毒引起的細胞融合,參與IMV形成細胞內(nèi)包膜病毒粒子的過程;還能誘導機體產(chǎn)生高水平的中和抗體[3-5]?;蚪M學研究證明,GPTV ORF112編碼產(chǎn)物與痘苗病毒A27L蛋白同源[6]。因此,筆者等推測ORF112編碼產(chǎn)物是GTPV的主要免疫保護性抗原之一,可能在免疫應(yīng)答中發(fā)揮重要作用。為檢測該蛋白誘導的特異性免疫應(yīng)答,本文開展了山羊痘病毒ORF112基因的克隆與序列分析,為建立敏感、快速、準確、簡單易行的GTPV檢測方法和ORF112蛋白的后續(xù)研究奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 毒株與菌株 山羊痘毒株(GTPV-S-1)由甘肅省畜牧獸醫(yī)研究所保存,并在原代綿羊睪丸細胞中培養(yǎng)。

      1.1.2 主要試劑與載體 T4DNA連接酶、PCR試劑、Takara DNA Fragment Purification Kit Ver.2.0試劑盒、pMD18-T載體購自寶生物工程(大連)有限公司,SE.DNA kit(OMEGA bio-tek)購自 OMEGA公司;大腸桿菌DH5α 和 BL21(DE3)菌種購自 Solarbio。

      1.2 方法

      1.2.1ORF112基因的PCR擴增 根據(jù)GenBank中收錄的GTPV基因序列,遵循引物設(shè)計原則,設(shè)計一對引物用于擴增ORF112基因,上游引物P1:5’-GTTTTAAATGGACAGAGCG-3’;下游引物 P2:5’-AGATTTAAGTCCTAGTTTTTTG-3’,預(yù)期擴增的目的片段大小492 bp。引物由寶生物工程(大連)有限公司合成。

      取200 μL病毒細胞培養(yǎng)物,用病毒DNA提取試劑盒提取病毒基因組DNA,然后取5 μL病毒基因組DNA為模板,加入 4 μL dNTP 混合物、5 μL 10×PCR buffer、上下游引物各 1 μL、0.25 μL EX Taq 酶,最后補水至50 μL。PCR 反應(yīng)條件:94℃ 5 min;94℃ 50 s;55℃ 50 s,72℃60 s,35個循環(huán);最后72℃延伸10 min,4℃終止反應(yīng)。PCR產(chǎn)物在10 g/L的瓊脂糖凝膠中進行電泳檢測。

      1.2.2 連接及轉(zhuǎn)化 按照Takara DNA Fragment Purification Kit Ver.2.0的說明書操作,對PCR產(chǎn)物進行純化,與pMD18-T載體相連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞DH5α。在涂有氨芐青霉素的LB瓊脂平板上,挑選單個菌落接入含氨芐青霉素的LB培養(yǎng)液中,提取質(zhì)粒DNA樣本,經(jīng)PCR擴增檢測后將重組質(zhì)粒送大連寶生物工程有限公司測序。

      1.2.3 序列分析 應(yīng)用DNAStar、BLAST(NCB I)軟件與GenBank登錄的相應(yīng)序列進行比較,分析不同來源山羊痘病毒株ORF112基因核苷酸序列的同源性。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 PCR擴增及初步鑒定

      采用引物進行PCR擴增,從山羊痘病毒感染細胞培養(yǎng)物的核酸樣本中擴增出1條約500 bp大小的DNA條帶,而正常細胞顯現(xiàn)陰性反應(yīng),與預(yù)期大小相符合(圖1)。

      圖1 ORF112擴增產(chǎn)物電泳

      2.2 PCR產(chǎn)物克隆與重組質(zhì)粒鑒定

      從瓊脂糖凝膠中回收PCR產(chǎn)物,與pMD18-T載體相連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞DH5α。挑選LB培養(yǎng)基上耐Amp菌落提取質(zhì)粒DNA樣本,PCR擴增鑒定,得到約492 bp條帶,與預(yù)期結(jié)果一致(圖2)。

      圖2 ORF112重組表達質(zhì)粒PCR產(chǎn)物電泳

      2.3 ORF112基因核苷酸序列測定及同源性分析

      將鑒定的重組質(zhì)粒送大連寶生物工程有限公司測序,山羊痘病毒的ORF112基因均為492 bp。將此ORF112基因核苷酸序列與國內(nèi)外不同來源羊痘病毒株的相應(yīng)序列進行比較,結(jié)果見圖3。

      圖3 ORF112基因核苷酸序列比對

      山羊痘毒株(GTPV-S-1)的ORF112基因序列與不同來源的山羊痘病毒分離株比較,ORF112基因核苷酸序列的同源性達到86.8%以上。同源性分析結(jié)果表明,山羊痘病毒的ORF112基因具有高度保守性。

      3 討論

      山羊痘病毒在病毒形態(tài)、理化特性和血清學反應(yīng)上與綿羊痘病毒和牛疙瘩皮膚病病毒沒有區(qū)別,均屬于羊痘病毒屬,主要是按照易感宿主劃分的[1]。

      早期研究發(fā)現(xiàn),羊痘病毒IMV囊膜上的P32蛋白是一個重要的免疫保護性抗原,接種重組P32蛋白的動物可以產(chǎn)生特異性的中和抗體,并能部分抵御強毒攻擊。近年來基于痘苗病毒的大量研究發(fā)現(xiàn),A27L、L1R等其他IMV囊膜蛋白以及B5R、A33R等胞外包膜病毒粒子(EEV)表面的囊膜蛋白在痘病毒免疫中同樣發(fā)揮著重要作用,因此,研究者也逐漸將注意力轉(zhuǎn)移到GTPV IMV和EEV的其他囊膜蛋白。作為IMV囊膜上另外一個重要的蛋白質(zhì),A27L可以誘導針對IMV的高水平中和抗體和淋巴細胞增殖反應(yīng),免疫A27L蛋白的小鼠可以抵御痘苗病毒的攻擊。由于GTPV ORF112編碼產(chǎn)物與痘苗病毒A27L蛋白同源[2],推測它也是GTPV的一個關(guān)鍵免疫保護性抗原,在GTPV的免疫應(yīng)答中發(fā)揮重要作用。

      本試驗對所保存的山羊痘毒株(GTPV-S-1)的ORF112基因進行測序,其核苷酸序列與不同來源的山羊痘分離株的同源性達86.8%以上,顯示了山羊痘病毒ORF112基因的高度保守性。這為進一步研究山羊痘病毒ORF112基因的表達及其免疫原性、結(jié)構(gòu)與功能奠定了基礎(chǔ)。

      [1]殷震,劉景華.動物病毒學[M].2版.北京:科學出版社,1997:960-963.

      [2]Tulman E R,Afonso C L,Lu Z,et al.The genomes of sheeppox and goatpox viruses[J].J Virol,2002,76(12):6054-6061.

      [3]Knipe D M,Howley P M,Griffin D E,et al.Fields virology [M].4th ed.Philadelphia:Lippincott Williams and Wilkins,2001:2849-2883.

      [4]Hooper J W,Custer D M,Thompson E.Four-gene-combination DNA vaccine protects mice against a lethal vaccinia virus challenge and elicits appropriate antibody responses in nonhuman primates[J].Virology,2003,306(2):181-195.

      [5]Otero M,Calarota S A,Dai A L,et al.Efficacy of novel plasmid DNA encoding vaccinia antigens in improving current smallpox vaccination strategy[J].Vaccine,2006,24(21):4461-4470.

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