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    計(jì)算機(jī)圖像識(shí)別在白血病形態(tài)學(xué)診斷中的應(yīng)用

    2018-01-30 06:09:17顧桂穎劉景鑫石張鎮(zhèn)陳明欣白元松
    中國(guó)醫(yī)療設(shè)備 2018年6期
    關(guān)鍵詞:細(xì)胞核分類器白細(xì)胞

    顧桂穎,劉景鑫,石張鎮(zhèn),陳明欣,白元松

    吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院 a.腫瘤血液科;b.放射線科;c.醫(yī)務(wù)部,吉林 長(zhǎng)春 130033

    引言

    通過顯微鏡觀察血細(xì)胞形態(tài)是血液系統(tǒng)疾病診斷和評(píng)估的重要方法。白血病是一類造血干細(xì)胞的惡性血液系統(tǒng)疾病。傳統(tǒng)的檢測(cè)方式是對(duì)血液和骨髓涂片標(biāo)本進(jìn)行人工鏡檢,也是診斷的主要線索和依據(jù)。人工鏡檢是一項(xiàng)高度重復(fù)性工作,費(fèi)力、耗時(shí),由于高度依賴于檢驗(yàn)醫(yī)師的經(jīng)驗(yàn),并沒有嚴(yán)格量化的判定標(biāo)準(zhǔn)。血細(xì)胞分析儀是利用電阻抗法、激光散射法等原理對(duì)白細(xì)胞進(jìn)行分類計(jì)數(shù)[1]。這些儀器大大提高了檢測(cè)速度,準(zhǔn)確性也高,但是不能檢測(cè)細(xì)胞的形態(tài)學(xué)異常。流式細(xì)胞術(shù)通過測(cè)定電阻、熒光、光散射和光吸收來測(cè)定細(xì)胞大小、體積、顆粒情況、DNA及蛋白質(zhì)含量、酶活性、細(xì)胞膜受體和表面抗原等理化及生物學(xué)信息識(shí)別細(xì)胞。盡管結(jié)果準(zhǔn)確性很高,但是依然不能檢測(cè)細(xì)胞的形態(tài)學(xué)異常,而且價(jià)格相對(duì)昂貴。因此通過顯微鏡圖像進(jìn)行血細(xì)胞分析仍然是臨床實(shí)踐中診斷白血病的重要手段。圖像處理技術(shù)能夠進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù)并提供細(xì)胞的形態(tài)學(xué)信息,這使得利用計(jì)算機(jī)技術(shù)進(jìn)行白血病細(xì)胞識(shí)別和診斷成為可能。本文綜述了計(jì)算機(jī)輔助 診斷技術(shù)在白血病細(xì)胞識(shí)別領(lǐng)域的研究及應(yīng)用進(jìn)展。

    1 血細(xì)胞識(shí)別的基本過程及相關(guān)技術(shù)

    計(jì)算機(jī)輔助細(xì)胞學(xué)診斷技術(shù)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用由來已久。二十世紀(jì)60年代就出現(xiàn)了全自動(dòng)血涂片分析系統(tǒng)CELLSCAN/GLOPR、TICAS、SPECTERII,但其檢測(cè)的準(zhǔn)確性及處理速度均不理想;二十世紀(jì)70年代Hematrak及LARC等商用血涂片分類機(jī)問世,但其結(jié)構(gòu)復(fù)雜、體積大、成本高,且性能不穩(wěn)定;二十世紀(jì)80年代開始出現(xiàn)彩色細(xì)胞圖像分析儀,但是識(shí)別率仍不高[2-3]。近年來許多學(xué)者進(jìn)行了利用圖像識(shí)別進(jìn)行白細(xì)胞分類的研究,重點(diǎn)主要集中于細(xì)胞分割及識(shí)別的算法研究。其基本過程主要有4部分:采集顯微鏡下血/骨髓涂片標(biāo)本的圖像并進(jìn)行預(yù)處理,利用不同圖像分割算法進(jìn)行白細(xì)胞分割,提取特征,最后通過識(shí)別算法進(jìn)行細(xì)胞識(shí)別。

    1.1 圖像采集及預(yù)處理

    1.1.1 血細(xì)胞圖像的采集

    首先將外周血/骨髓液通過推片、干燥制作成涂片,然后進(jìn)行瑞士吉姆薩染色固定。在顯微鏡下(一般為油鏡,放大1000倍)利用數(shù)字?jǐn)z像機(jī)進(jìn)行拍攝。

    傳統(tǒng)的外周血細(xì)胞圖像包括3部分內(nèi)容:紅細(xì)胞、白細(xì)胞、血小板。目前研究的主要內(nèi)容集中在白細(xì)胞的分類。外周血白細(xì)胞一般可分為5大類:中性粒細(xì)胞、嗜酸性粒細(xì)胞、嗜堿性粒細(xì)胞、淋巴細(xì)胞和單核細(xì)胞??梢酝ㄟ^細(xì)胞形狀、大小、胞漿中是否含有顆粒、核分葉數(shù)量等來鑒別細(xì)胞。

    骨髓細(xì)胞較外周血復(fù)雜,除了成熟紅細(xì)胞及血小板外,主要為各類有核細(xì)胞包括粒系、紅系、淋巴系、單核系、漿細(xì)胞系,另外還有巨核細(xì)胞及少數(shù)骨髓基質(zhì)細(xì)胞。由于骨髓中細(xì)胞分布較外周血更為密集,形態(tài)更為復(fù)雜,所以骨髓細(xì)胞的自動(dòng)分類更難實(shí)現(xiàn)。

    1.1.2 圖像的預(yù)處理

    顯微鏡下采集的細(xì)胞圖像常常包含復(fù)雜的背景,成熟紅細(xì)胞及雜質(zhì)會(huì)影響白細(xì)胞的分析。圖像質(zhì)量也會(huì)受到模糊強(qiáng)度、噪聲等影響,不同成像條件會(huì)導(dǎo)致圖像亮度和色調(diào)的差異。各項(xiàng)圖像識(shí)別的研究中常常先進(jìn)行圖像預(yù)處理,主要方法有:直方圖均衡、平滑濾波、銳化濾波、低通及高通濾波等[4-7]。直方圖均衡是利用圖像直方圖對(duì)對(duì)比度進(jìn)行調(diào)整的方法。平滑濾波可以去除圖像中某些類型的噪聲,又分為鄰域平均法和中值濾波法。中值濾波法既能濾除噪音,又能保護(hù)圖像的邊緣,防止圖像模糊。銳化濾波能增強(qiáng)圖像的輪廓,突出圖像的細(xì)節(jié),也就是通常所說的“勾邊”技術(shù)。低通濾波是將頻域中的高頻濾掉,能降低圖像的視覺噪聲。高通濾波是濾掉頻域中的低頻部分,能加強(qiáng)圖像的邊緣及急劇變化部分。

    1.1.3 彩色空間模型

    彩色空間在圖像處理中并非研究的主流,但其選擇會(huì)影響圖像分割的效果。在血細(xì)胞圖像識(shí)別中常涉及到的彩色空間模型有RGB、HSI、CIELab等模型。各彩色空間可以通過算法實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)換。在細(xì)胞識(shí)別的相關(guān)研究中,通過不同彩色空間的轉(zhuǎn)換及組合取得了較好的分割效果[8-10]。

    (1)RGB模型。是一種線性的加色模式,圖像由紅(Red)、綠(Green)、藍(lán)(Blue)3個(gè)分量構(gòu)成。RGB是面向顯示器等硬件設(shè)備最常用的模型,但其圖像視覺效果差,缺乏直觀感,更適合于顯示系統(tǒng),而非圖像處理。

    (2)HSI模型。是一種非線性表示系統(tǒng),由色調(diào)(Hue)、飽和度(Saturation)、亮度(Intensity)3個(gè)分量構(gòu)成,分量之間相對(duì)獨(dú)立。HSI模型能定量地描述顏色特征,更符合人類的視覺特性,是彩色圖像處理中常用的模型。在HSI彩色空間圖像可以分為彩色信息和灰度信息,亦適合許多基于灰度的圖像處理技術(shù)。

    (3)CIELab模型。是一種均勻顏色空間,用亮度(L)和色差(a、b)來描述顏色分量。CIELab是一種與設(shè)備無關(guān)的彩色空間。

    1.2 白細(xì)胞分割算法

    現(xiàn)有的研究大多通過顯微鏡圖像進(jìn)行半自動(dòng)骨髓細(xì)胞形態(tài)分析,大量的研究工作集中在白細(xì)胞分割。由于特征提取及分類的準(zhǔn)確性依賴于正確的圖像分割,因此細(xì)胞分割是圖像識(shí)別中最重要也是最具挑戰(zhàn)性的一部分。目前常用的圖像分割的算法主要有[8]:① 閾值為基礎(chǔ)的算法,最大類間方差法、區(qū)域生長(zhǎng)、分水嶺算法等;② 模式識(shí)別為基礎(chǔ)的算法,有監(jiān)督分類主要是以學(xué)習(xí)為基礎(chǔ)的算法,如支持向量機(jī)(Support Vector Machine,SVM)、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等;無監(jiān)督分類主要是聚類,包括K均值聚類、模糊C均值聚類、EM算法等;③ 可變形模型為基礎(chǔ)的算法,分為參數(shù)模型和幾何模型,如常用的水平集方法、活動(dòng)輪廓模型等。除了以上3類外,還有形態(tài)學(xué)操作等算法。

    1.2.1 閾值法

    閾值是一種傳統(tǒng)的圖像分割方法,其分割的依據(jù)是圖像像素的灰度分布差異。因此解決問題的關(guān)鍵在于如何選取最佳閾值。閾值法的缺點(diǎn)是沒有考慮圖像的空間特性,對(duì)噪聲比較敏感。Madhloom等[6]通過圖像算法、最小濾波和全局閾值技術(shù)支持下的自動(dòng)對(duì)比延伸進(jìn)行外周血白細(xì)胞細(xì)胞核的分割,準(zhǔn)確性為85%~98%。Ghosh等[11]介紹了一種改進(jìn)的閾值技術(shù),通過伽瑪、高斯和柯西類型模糊隸屬函數(shù)實(shí)現(xiàn)細(xì)胞核的識(shí)別。相比而言,柯西隸屬函數(shù)較其他方法分割效果好。

    1.2.2 分水嶺法

    分水嶺法是基于測(cè)地重建理論,通過模擬盆地地形漲水過程來實(shí)現(xiàn)分割。該方法對(duì)微弱邊緣具有良好的響應(yīng),常用來處理細(xì)胞粘連問題。由于噪聲和梯度的局部不規(guī)則性,分水嶺法容易產(chǎn)生過分割的問題,圖像噪聲信息較多時(shí)分割效果差??娀鬯镜萚12]提出了一種結(jié)合距離變換與邊緣梯度的分水嶺算法,結(jié)果顯示在粘連及重疊的細(xì)胞分割時(shí)效果較好。在白細(xì)胞的分割中,由于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)及紅細(xì)胞的灰度差異較大,容易產(chǎn)生過分割。侯慧等[13]提出了結(jié)合EM聚類的改進(jìn)分水嶺算法,有效的減少了過分割區(qū)域。

    1.2.3 聚類法

    特征空間聚類法是將圖像空間中的像素用特征空間點(diǎn)表示,根據(jù)他們?cè)谔卣骺臻g的聚集進(jìn)行分割。聚類法最大的問題是影響分類結(jié)果的聚類數(shù)目、初始值等不易選取。K均值聚類是常用的聚類算法。Sinha等[9]對(duì)染色后外周血涂片的彩色圖像進(jìn)行白細(xì)胞五分類。在HSV色彩空間通過K均值聚類和EM算法來實(shí)現(xiàn)白細(xì)胞分割;提取特征后利用50例(每類10例)數(shù)據(jù)對(duì)不同分類器進(jìn)行訓(xùn)練,34例進(jìn)行測(cè)試。結(jié)果顯示分割的準(zhǔn)確性為80%。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分類準(zhǔn)確率為97%,SVM分類器準(zhǔn)確率為94%。但是該研究細(xì)胞數(shù)量較少,結(jié)果需要進(jìn)一步試驗(yàn)驗(yàn)證。

    模糊C均值聚類是從模糊集合理論出發(fā),用隸屬度確定每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)屬于某個(gè)聚類的程度的一種聚類算法,常采用誤差平方和準(zhǔn)則函數(shù)作為聚類準(zhǔn)則。其缺點(diǎn)在于對(duì)聚類初始化的中心較為敏感,選取不當(dāng)容易陷入局部極小值而難以收斂到聚類中心。Theera-Umpon[5]利用基于模糊C均值聚類法的自動(dòng)算法,對(duì)骨髓白細(xì)胞的細(xì)胞核和細(xì)胞漿進(jìn)行分割。再通過形態(tài)學(xué)開閉運(yùn)算完成圖像的最終處理;提取細(xì)胞特征后利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行骨髓粒細(xì)胞系6種細(xì)胞(原始粒細(xì)胞、早幼粒細(xì)胞、中幼粒細(xì)胞、晚幼粒細(xì)胞、桿狀核細(xì)胞和分葉核細(xì)胞)的分類。結(jié)果顯示,自動(dòng)分割圖像分類率為70.74%和65.69%,與人工分割圖像的分類率(71.81%和69.68%)相近。

    1.2.4 骨髓細(xì)胞分割需要解決的問題

    骨髓中有核細(xì)胞的種類及分布較外周血復(fù)雜,采用單一的分割方法效果并不理想。許多學(xué)者嘗試結(jié)合不同的彩色空間模型,綜合選用幾種分割方法進(jìn)行改進(jìn),從而提升分割的準(zhǔn)確性。骨髓細(xì)胞的分割常面臨的問題有:

    (1)將骨髓細(xì)胞區(qū)域與背景分離。細(xì)胞質(zhì)染色較淺,與背景及紅細(xì)胞的分割存在一定難度。

    (2)解決細(xì)胞粘連問題。某些疾病尤其是白血病時(shí)骨髓增生明顯活躍,細(xì)胞分布密集,細(xì)胞之間常常出現(xiàn)粘連重疊。解決細(xì)胞粘連常用的方法有腐蝕膨脹法、測(cè)地重建法、分水嶺變換重建邊界法、凹點(diǎn)檢測(cè)等[14-15]。

    (3)細(xì)胞核與細(xì)胞漿的分離。由于細(xì)胞核及細(xì)胞漿的特征在鑒別細(xì)胞時(shí)有很重要的作用,許多研究常常分別提取細(xì)胞核和細(xì)胞漿的特征,這種情況下則需要進(jìn)行核漿分離。由于細(xì)胞核染色深,細(xì)胞漿染色淺,兩者顏色反差比較大,因此可采用最大類間方差法進(jìn)行核漿分離。

    1.3 特征提取及選擇

    1.3.1 細(xì)胞識(shí)別常用特征

    經(jīng)過分割確定細(xì)胞區(qū)域后,提取特征參數(shù)用于細(xì)胞的識(shí)別分類。提取的特征值一般分3類[16]:

    (1)形狀特征:形狀的表達(dá)和描述包括輪廓特征如周長(zhǎng)、長(zhǎng)軸、短軸、離心率、曲率等;區(qū)域特征如面積、重心、外接矩特征、類圓度、等效直徑等;變換特征如傅里葉描述子等。

    (2) 顏色特征:直方圖顏色特征如顏色均值、方差、偏度、峰度等;顏色能量特征如能量、灰度熵等。彩色空間的選擇是描述顏色特征的一個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié)。

    (3)質(zhì)地特征:質(zhì)地特征的提取算法有灰度共生矩陣、Gabor變換、分形維數(shù)、LBP算子等。

    骨髓中有核細(xì)胞種類繁多,不同分化程度的細(xì)胞形態(tài)差異亦較大。傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)需要依據(jù)細(xì)胞大小、細(xì)胞核及細(xì)胞漿的特點(diǎn)、核漿比、顆粒等特點(diǎn)進(jìn)行鑒別。因此在許多研究中分別對(duì)細(xì)胞核和細(xì)胞漿進(jìn)行特征提取。由于骨髓細(xì)胞分割的一大難題是解決細(xì)胞相連的問題,而細(xì)胞核的分割較整個(gè)細(xì)胞的分割相對(duì)容易實(shí)現(xiàn)。Theera-umpon等[17]為了探索依據(jù)細(xì)胞核特征能否進(jìn)行細(xì)胞識(shí)別,他們從骨髓粒系6種細(xì)胞的灰階圖像中分割細(xì)胞核,并依據(jù)其形態(tài)粒度特性提取特征。然后利用貝葉斯分類器和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分類。結(jié)果顯示僅依據(jù)細(xì)胞核特征可以達(dá)到77%的分類率。

    1.3.2 特征篩選及降維

    在多數(shù)發(fā)表的研究中,大多需要人工選擇特征去進(jìn)行細(xì)胞的識(shí)別,良好的特征對(duì)最終識(shí)別的準(zhǔn)確性至關(guān)重要。Mohapatra等[18]設(shè)計(jì)了一種血和骨髓標(biāo)本中識(shí)別淋巴母細(xì)胞(惡性)和淋巴細(xì)胞(正常)的定量方法。白細(xì)胞的分割和識(shí)別通過圖像聚類實(shí)現(xiàn)。他們先提取了細(xì)胞核及細(xì)胞漿的44個(gè)特征參數(shù)如形狀、輪廓、不規(guī)則碎片、顏色、質(zhì)地、傅立葉描述子等,然后通過T檢驗(yàn)選擇了33個(gè)特征參數(shù)用來訓(xùn)練集成分類器識(shí)別細(xì)胞。這一方法最終取得了不錯(cuò)的結(jié)果,但是他們只是將細(xì)胞識(shí)別為良性和惡性,并沒有進(jìn)行亞型分類。Sarrafzadeh等[19]利用SVM分類器依據(jù)6個(gè)細(xì)胞核及細(xì)胞漿的顏色特征、6個(gè)細(xì)胞核的幾何特征及13個(gè)細(xì)胞漿的質(zhì)地特征進(jìn)行白細(xì)胞五分類的識(shí)別,準(zhǔn)確性為93%。

    一般情況下,提取的大量特征值中有些是冗余的。當(dāng)特征維數(shù)較大時(shí),可能會(huì)產(chǎn)生過擬合現(xiàn)象,導(dǎo)致分類器在訓(xùn)練數(shù)據(jù)上表現(xiàn)良好,而測(cè)試數(shù)據(jù)效果差。人工選擇特征帶有摸索性質(zhì),主觀因素較多。主成分分析是目前應(yīng)用廣泛的降維算法,對(duì)線性相關(guān)問題降維效果良好。Moradiamin等[20]在急性淋巴細(xì)胞白血病(Acute Lymphoblastic Leukemia,ALL)細(xì)胞識(shí)別的研究中,先通過模糊C均值聚類算法分割細(xì)胞核,然后提取了細(xì)胞核的幾何和統(tǒng)計(jì)學(xué)特征,利用主成分分析減少特征的空間維度,最后選擇了前8個(gè)主成分特征,通過支持向量機(jī)分類器進(jìn)行識(shí)別。結(jié)果發(fā)現(xiàn)通過主成分分析選擇特征,識(shí)別敏感性和精確度較其之前的研究提高了10%。在其之后的研究[21]中利用包含不同核心程序和參數(shù)的集成SVM分類器將細(xì)胞識(shí)別為L(zhǎng)1、L2、L3和非腫瘤細(xì)胞4類。由于該研究所用數(shù)據(jù)未公開,所以試驗(yàn)的重復(fù)性以及與其他方法的比較尚不能進(jìn)行。其他的降維算法還有Relief算法、遺傳算法以及各種改進(jìn)算法。

    目前的研究多為良惡性的二分類、五分類等簡(jiǎn)單分類,骨髓中細(xì)胞種類多,不同成熟程度的細(xì)胞之間可能不具備典型的類別特征,各類別之間可能存在特征重疊,因此對(duì)特征參數(shù)的要求更高,如何設(shè)計(jì)及篩選分類能力強(qiáng)的特征參數(shù)是一大難題。

    1.4 白細(xì)胞的分類識(shí)別算法

    1.4.1 淺層機(jī)器學(xué)習(xí)

    常用的分類、回歸等方法多數(shù)屬于淺層機(jī)器學(xué)習(xí),如決策樹、貝葉斯分類以及近年來出現(xiàn)的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、RBF神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、支持向量機(jī)等。淺層機(jī)器學(xué)習(xí)的局限性在于對(duì)復(fù)雜函數(shù)的表示能力有限。

    人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)是模擬人腦神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)和功能的非線性、自適應(yīng)運(yùn)算模型。常用的有多層感知器(Multilayer Perceptron,MLP)、極限學(xué)習(xí)機(jī)、誤差反向傳播(Back Projection,BP)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。最具代表性的為BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),結(jié)構(gòu)比較簡(jiǎn)單,具有很好的泛化能力。艾大萍等[22]利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)150例骨髓細(xì)胞進(jìn)行識(shí)別,識(shí)別準(zhǔn)確率在80%以上。針對(duì)單個(gè)分類器性能不穩(wěn)定的缺點(diǎn),陳林偉[23]用集成方法進(jìn)行決策,設(shè)計(jì)了基于元胞自動(dòng)機(jī)的極限學(xué)習(xí)機(jī)集成算法,在骨髓細(xì)胞的分類上精度達(dá)97.43%,有效的解決了神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器不穩(wěn)定的缺點(diǎn)。

    SVM是基于統(tǒng)計(jì)學(xué)中的VC維理論與結(jié)構(gòu)風(fēng)險(xiǎn)最小原理,將向量映射到一個(gè)高維空間,通過構(gòu)造一個(gè)或多個(gè)超平面來進(jìn)行分類。SVM對(duì)小樣本、高維、非線性問題具有很好的泛化能力。在細(xì)胞分類識(shí)別領(lǐng)域SVM分類器應(yīng)用廣泛。SVM的缺點(diǎn)在于如何確定核函數(shù)目前還沒有合適的方法。

    1.4.2 深度學(xué)習(xí)

    深度學(xué)習(xí)是近年來出現(xiàn)的一種圖像識(shí)別算法,其原理是模仿人的視覺信息處理過程,通過不斷的迭代與抽象從樣本信息中獲得特征,并得到最終的輸出結(jié)構(gòu)。深度學(xué)習(xí)通過學(xué)習(xí)一種深層非線性網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),用較少的參數(shù)實(shí)現(xiàn)復(fù)雜函數(shù)的逼近,具有強(qiáng)大的特征學(xué)習(xí)能力。常用的有卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、深度置信網(wǎng)絡(luò)、反卷積網(wǎng)絡(luò)等。深圳大學(xué)的賈洪飛[24]設(shè)計(jì)了一種深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)進(jìn)行外周血白細(xì)胞的自動(dòng)五分類。將外周血圖像進(jìn)行分割后,建立白細(xì)胞數(shù)據(jù)庫(kù),用一部分?jǐn)?shù)據(jù)集訓(xùn)練網(wǎng)絡(luò),另一部分?jǐn)?shù)據(jù)集驗(yàn)證網(wǎng)絡(luò)模型的性能,最終白細(xì)胞的平均識(shí)別率為99.64%。該方法不需要人工設(shè)計(jì)特征,大大降低了算法的復(fù)雜性。黃震[25]利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)外周血白細(xì)胞進(jìn)行五分類,結(jié)果顯示卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)于樣本多的類別分類優(yōu)于SVM,整體分類精度也高于SVM。但是該研究樣本數(shù)量較少,沒有對(duì)過擬合進(jìn)行改進(jìn)。

    2 計(jì)算機(jī)輔助技術(shù)在白血病細(xì)胞識(shí)別方面的研究

    白血病根據(jù)細(xì)胞的成熟程度和自然病程,可分為急性和慢性兩大類。法、美、英分型系統(tǒng)(FAB)將急性白血病分為急性髓細(xì)胞白血病(Acute Myelocytic Leukemia,AML)和ALL。骨髓及外周血形態(tài)分析對(duì)于白血病的診斷和病情評(píng)估至關(guān)重要。目前已有一些圖像識(shí)別輔助白血病細(xì)胞分類及診斷方面的研究,但主要還處于研究階段?,F(xiàn)發(fā)表的研究多針對(duì)骨髓中某一系統(tǒng)細(xì)胞進(jìn)行識(shí)別,以淋巴系統(tǒng)細(xì)胞分類為多。

    2.1 粒細(xì)胞系統(tǒng)

    FAB將AML分為M0~M7八種形態(tài)學(xué)亞型。Lim等[26]為了分割急性髓系白血病細(xì)胞,設(shè)計(jì)了一種包括梯度幅值、閾值、形態(tài)學(xué)操作、分水嶺算法的方法。他們報(bào)道對(duì)50幅測(cè)試圖像分割準(zhǔn)確性在94.5%,M2、M5、M6亞型的分割準(zhǔn)確性分別為94.58%、95.06%和95.65%。Agaian等[10]在ASH在線圖庫(kù)中選取了來自40例AML和40例正常人的外周血圖像,轉(zhuǎn)化為CIELAB色彩空間后,通過K均值聚類算法進(jìn)行分割,分別提取局部二元模式(Local Binary Pattern,LBP)算子處理前后的全片圖像的豪斯多夫維數(shù)特征、灰度共生矩陣特征及顏色、形狀特征。最后通過SVM識(shí)別細(xì)胞的良惡性。結(jié)果顯示,LBP算子處理后分類準(zhǔn)確率提高了4%。

    Nasir等[27]對(duì)200幅ALL和300幅AML圖像進(jìn)行分割提取特征后,分別利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)濾波算法和貝葉斯算法訓(xùn)練MLP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和簡(jiǎn)化模糊ARTMAP (SFAM)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),將細(xì)胞分為原始淋巴細(xì)胞、原始粒細(xì)胞和正常細(xì)胞。結(jié)果顯示分類準(zhǔn)確性均在90%以上。而貝葉斯算法訓(xùn)練MLP結(jié)果最佳,準(zhǔn)確率為95.7%。

    2.2 淋巴細(xì)胞系統(tǒng)

    FAB將ALL分為L(zhǎng)1、L2、L3三種形態(tài)學(xué)亞型。Li等[8]研究了一種雙閾值的方法分割A(yù)LL患者的淋巴細(xì)胞。他們結(jié)合RGB和HSV色彩空間的圖像,首先獲得對(duì)比延伸后的灰階圖像和HSV色彩空間的H維度圖像,通過雙閾值方法進(jìn)行細(xì)胞分割,最后通過數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)算法和中值濾波降低噪聲并去除不完整的白細(xì)胞。通過ALL-IDB數(shù)據(jù)庫(kù)圖像進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示白細(xì)胞分割準(zhǔn)確率為97.85%。Silbiger等[28]設(shè)計(jì)了一種自動(dòng)識(shí)別ALL的系統(tǒng),利用CIELAB色彩空間的AB維度,通過K均值聚類分割細(xì)胞核,提取細(xì)胞核的豪斯多夫維數(shù)特征。利用SVM識(shí)別細(xì)胞的良惡性,準(zhǔn)確率為93.5%。目前多數(shù)研究是對(duì)只含有一兩個(gè)細(xì)胞的剪切圖像進(jìn)行處理,該研究能直接對(duì)含多個(gè)白細(xì)胞的原始圖像進(jìn)行分割。Mirmohammadi等[29]在HSV色彩空間的H、S維度上通過模糊C均值聚類方法進(jìn)行細(xì)胞核的分割;提取細(xì)胞核的77個(gè)幾何及質(zhì)地特征;利用主成分分析方法選取前6個(gè)特征;通過SVM分類器識(shí)別ALL細(xì)胞并將其分為L(zhǎng)1、L2、L3三類。結(jié)果顯示分類準(zhǔn)確性分別為96%、92%、99%。這一研究只進(jìn)行了細(xì)胞核的分割及特征提取,并沒有進(jìn)行細(xì)胞漿的分析。Abbas等[30]通過最大類間方差法全局閾值和形態(tài)學(xué)操作膨脹來分割淋巴細(xì)胞的細(xì)胞核。他們處理了380幅顯微鏡圖像,分割準(zhǔn)確性為96.5%,并且計(jì)算時(shí)間減少了50%。Amin等[4]對(duì)來自14例ALL和7例正常人的21張外周血及骨髓標(biāo)本中總共958個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了分析,他們?cè)谥狈綀D均衡后的HSV色彩空間圖像上利用K均值算法進(jìn)行細(xì)胞核分割,提取細(xì)胞核的統(tǒng)計(jì)學(xué)及幾何特征,最終利用多重支持向量機(jī)分類器識(shí)別ALL的3種亞型,敏感性為84.3%,特異性為97.3%,準(zhǔn)確性95.6%。Neoh等[31]對(duì)ALL和健康人的標(biāo)本進(jìn)行研究。首先利用標(biāo)記符控制分水嶺分割算法分割白細(xì)胞,然后通過基于SDM(Stimulating Discriminant Measures)的聚類算法在CIELAB色彩空間分割細(xì)胞核和細(xì)胞漿。提取了細(xì)胞核及細(xì)胞漿的80個(gè)特征,包括形狀、質(zhì)地、顏色及統(tǒng)計(jì)學(xué)信息。最后通過MLP、SVM以及集成分類器進(jìn)行細(xì)胞識(shí)別。利用ALL-IDB2數(shù)據(jù)庫(kù)圖像進(jìn)行系統(tǒng)性能評(píng)估。結(jié)果顯示Dempster-shafer ensemble準(zhǔn)確性最高(96.72%),基于高斯徑向基核函數(shù)的SVM為96.67%。該研究考慮了類內(nèi)類間離散度,克服了經(jīng)典模糊C均值聚類算法著重于類內(nèi)離散度的缺點(diǎn),在細(xì)胞核和細(xì)胞漿的識(shí)別上優(yōu)于線性判別分析(Linear Discriminant Analysis,LDA)和模糊緊性分離(Fuzzy Compactness and Separation,F(xiàn)CS)。Khashman等[32]通過Otsu閾值、中值濾波、邊緣檢測(cè)、基于核的模式分析處理了來自ALL-IDB2數(shù)據(jù)庫(kù)的80幅ALL圖像,提取的圖像像素作為MLP的輸入,并設(shè)計(jì)了不同訓(xùn)練測(cè)試比(75%:25%,50%:50%,25%:75%)的3種測(cè)試策略來檢測(cè)系統(tǒng)性能。75%:25%訓(xùn)練測(cè)試比達(dá)到了90%的準(zhǔn)確性。Putzu等[33]對(duì)33幅圖像中245/267個(gè)白細(xì)胞通過閾值操作分割細(xì)胞核和細(xì)胞漿,然后提取了131個(gè)形狀、顏色、質(zhì)地特征,訓(xùn)練不同分類器進(jìn)行細(xì)胞識(shí)別。結(jié)果顯示基于高斯徑向基核函數(shù)的SVM是ALL識(shí)別的最適模型,準(zhǔn)確性93%,敏感性98%。

    2.3 漿細(xì)胞系統(tǒng)

    Sa eedizadeh等[34]研究了一種自動(dòng)識(shí)別骨髓瘤細(xì)胞和正常漿細(xì)胞的方法。他們利用K均值、瓶頸算法和分水嶺算法對(duì)50幅圖像的678個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了細(xì)胞核和細(xì)胞漿的分割。特征提取之后進(jìn)行一系列判定規(guī)則來判定是漿細(xì)胞還是其他骨髓細(xì)胞。結(jié)果顯示敏感性為96.52%,特異性93.04%,準(zhǔn)確性為95.28%。

    3 總結(jié)與展望

    目前的研究在計(jì)算機(jī)輔助血細(xì)胞識(shí)別尤其是白細(xì)胞五分類及ALL細(xì)胞識(shí)別方面取得了一定的成果,通過不斷改良分割及識(shí)別算法等細(xì)節(jié),細(xì)胞識(shí)別的準(zhǔn)確性及敏感性已經(jīng)逐漸提高。隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)尤其是深度學(xué)習(xí)的不斷發(fā)展,計(jì)算機(jī)輔助圖像識(shí)別技術(shù)克服了人工細(xì)胞形態(tài)分析的低效、偏主觀性等不足,有望為臨床提供一種快速、低成本的細(xì)胞分類計(jì)數(shù)方法。但骨髓中細(xì)胞種類繁多,目前進(jìn)行骨髓全部有核細(xì)胞系統(tǒng)的分類的研究有限。因此利用計(jì)算機(jī)圖像識(shí)別技術(shù)構(gòu)建全骨髓細(xì)胞形態(tài)分類診斷系統(tǒng),可能成為未來的研究方向之一。

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