靳松 黃愛軍 林昆 彭建強 李亞杰 鄒學農
骨髓間充質干細胞(MSC)是一類來源于骨髓的具有多向分化潛能的干細胞,具有自我更新、組織再生和抗炎修復等功能。研究表明,MSC經誘導分化后性別決定區(qū)Y框蛋白9(Sox9)、Ⅱ型膠原及缺氧誘導因子-1α(HIF-1α)的表達水平上調,提示其具有轉化為類髓核細胞的潛能[1]。MSC移植修復椎間盤退變疾病的重要機制是,在椎間盤微環(huán)境中MSC向類髓核細胞分化并增加基質大分子的合成。MSC來源廣泛、體外培養(yǎng)可誘導類髓核細胞分化,是一種非常有前景的可應用于臨床治療椎間盤退變疾病的種子細胞。微小RNA(miR)是一類含有18~24個核苷酸的非編碼RNA,通過與靶基因mRNA 3’端非翻譯區(qū)(3’UTR)的互補序列以堿基配對方式執(zhí)行降解靶基因或抑制其翻譯的功能,參與調控MSC分化過程中的多種生物學過程[2-4]。本研究通過在線軟件預測miR-124的靶基因,發(fā)現活化T細胞核因子c1(NFATc1)是其中一個潛在靶點。NFAT家族是一類具有廣泛生理功能的轉錄因子,在成軟骨分化過程中,NFATc1能促進軟骨基因表達[5]。NFATc1廣泛參與MSC生長、分化的生物學過程,特別是在成軟骨過程中有基因調控的功能[6]。由此推測,miR-124可能通過靶向調控NFATc1表達促進人MSC向軟骨細胞分化。本研究采用成軟骨分化誘導培養(yǎng)體系誘導C3H10T1/2細胞向成軟骨細胞分化,并探究miR-124在此過程是否通過調控NFATc1靶基因發(fā)揮生物學作用。
間充質干細胞株C3H10T1/2細胞系(中山大學骨科研究所提供);高糖型DMEM培養(yǎng)基、10%胎牛血清購自美國HyClone公司;谷氨酰胺購自美國Gibco公司;胰酶、0.02%乙二胺四乙酸(EDTA)、抗壞血酸、青霉素鏈霉素雙抗、β-甘油磷酸鈉、地塞米松購自美國Sigma公司; pmiR-RB-REPORTTM質粒載體、ribo FECTTMCP轉染試劑盒購自廣州銳博生物科技有限公司;LipofectamineTM2000轉染試劑盒及Trizol購于美國Invitrogen公司。Spe I、Hind Ⅲ、T4 DNA連接酶和SYBR Premix ExTaqTM定量PCR試劑均為大連寶生物公司產品。實時定量PCR miR檢測試劑盒購自廣州天根生物公司。miR-124模擬物(mimics)及抑制物(inhibitors)為美國Ambion公司產品。定點突變試劑盒購自美國Stratagene公司。雙熒光素酶活性檢測試劑盒購自美國Promega公司。Smad4抗體和GAPDH抗體購自美國CST公司。NFATc1小干擾RNA(siRNA)由美國Invitorgen公司合成,引物合成及測序由深圳達生生物科技公司完成。
1.細胞培養(yǎng)與軟骨誘導分化
以離心法進行軟骨微團的構建,具體操作步驟參照文獻[7]進行。小鼠C3H10T1/2細胞株經復蘇后室溫離心收集沉淀,用含10%胎牛血清的高糖型DMEM培養(yǎng)液混懸于37℃、5%CO2靜置培養(yǎng),待細胞融合至80%~90%,在胰酶消化下進行傳代,每3 d更換培養(yǎng)液1次。將培養(yǎng)的C3H10T1/2細胞分為對照組與成軟骨誘導組,分別加入含2%胎牛血清的DMEM和軟骨誘導液誘導培養(yǎng)。每3 d換液1 次,于第0、7、10、14日收集細胞微球進行基因表達檢測。
2.雙熒光素酶報告基因構建及檢測
使用在線靶基因預測軟件(PicTar、TargetScan、miRanda、miRDB),預測NFATc1 mRNA的3’UTR上173~185 nt為miR-124的結合位點(GCACTTT)。人工合成NFATc1 mRNA 3’UTR 區(qū)的靶點野生型序列(Wt)以及定點突變的突變序列(Mut, GCACTTT→CGTGAAA); XhoⅠ及NotⅠ雙酶切pmiR-RB-REPORTTM 質粒,再將Wt和Mut基因片段分別克隆到酶切后的pmiR-RBREPORTTM載體中,構建重組質粒pNFATc1-Wt或pNFATc1-Mut;基因測序確認重組質粒載體構建成功。按照試劑盒說明書突變NFATc1 3’UTR上miR-124結合位點,構建突變型pGL3-Mut-NFATc1真核表達載體。
取培養(yǎng)的C3H10T1/2細胞,根據轉染質粒的不同分為4組:①pNFATc1-Wt質粒對照組,為轉染pNFATc1-Wt質粒及miR-124 mimics對照;②pNFATc1-Wt質粒實驗組,為轉染pNFATc1-Wt質粒和miR-124 inhibitors;③pNFATc1-Mut質粒對照組,為轉染pNFATc1-Mut質粒與miR-124 mimics對照;④pNFATc1-Mut質粒實驗組,為轉染pNFATc1-Mut質粒與miR-124 inhibitors。各組轉染24 h后收集細胞,用雙熒光素酶報告基因系統(tǒng)檢測各組細胞的熒光素酶活性。每組實驗重復3次,結果取平均值。另外,將NFATc1的3’UTR用XhoI/NotI點雙酶切,插入到psiCHECKTM-2質粒中復制,與此相關的NFATc1 3’UTR片段被融合到熒光素酶中,并被轉移到C3H10T1/2細胞,根據轉染質粒分為不轉染對照組(空白對照組)、miR-124 mimics組、miR-124 inhibitors組、pNFATc1-Wt質粒或pNFATc1-Mut組(正常對照組)、pNFATc1-Wt質粒或pNFATc1-Mut質粒加miR-124 inhibitors組(正常對照inhibitors組),分析miR-124對NFATc1熒光素酶活性的影響。
3.實時定量PCR檢測
在成軟骨誘導分化第0、7、10、14日收集C3H10T1/2細胞微球,按RNA提取試劑盒說明書提取總RNA,并檢測總RNA的含量及純度,再按照逆轉錄試劑盒說明書進行逆轉錄,合成模板DNA第一鏈,實時定量PCR擴增目的基因,引物序列見表1。反應條件為95℃10 min,95℃15 s,60℃ 30 s,72℃ 20 s,40個循環(huán),內參為18 s。一步加A法逆轉錄miR,反應條件為95℃ 30 s,95℃ 3 s,60℃ 30 s,40個循環(huán),內參為U6。上下游引物序列分別為5’-CTCGCTTCGGCAGCACA-3’和5’-AACGCTTCACGAATTTGCGT-3’,使用2-ΔΔCt法計算基因相對表達量。每組實驗重復3次,結果取平均值。記錄軟骨分化的相關標志基因Aggrecan、Ⅱ型膠原蛋白(Col2a1)和Ⅹ型膠原蛋白(Col10a1)及Sox9 mRNA表達水平。另外,取成軟骨誘導7 d的C3H10T1/2細胞轉染pNFATc1-Wt質粒(Control組)、pNFATc1-Wt質粒及miR-124 mimics(miR-124組)、經siRNA干預的pNFATc1-Wt質粒(si-NFATc1組),按前述方法檢測NFATc1 mRNA表達水平。此外,取成軟骨誘導7 d的C3H10T1/2細胞,轉染miR-124 mimics和(或)pNFATc1-Wt質粒,轉染成功后分別加入miR-124 mimics 0、50、100 nmol/L miR-124 mimics或inhibitors培養(yǎng)24 h,用前述同樣方法分析各組NFATc1和miR-124 mRNA表達水平。
4.蛋白免疫印跡法檢測
提取各組細胞的總蛋白,測定蛋白濃度,加4倍SDS上樣緩沖液8 μl和二硫蘇糖醇2 μl混勻沸水浴5 min后作十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺SDS-PAGE凝膠電泳電泳,用電轉印儀(100 V電壓)電泳將凝膠上的蛋白轉印至聚偏氟乙烯(PVDF)膜。將蛋白Marker剪下,避光保存,余下膜用5%脫脂牛奶室溫封閉1 h,TBST緩沖液洗滌3次后,一抗4℃孵育過夜,TBST緩沖液再次洗滌3次,加入二抗室溫孵育2 h,同前洗滌。按體積比1∶1混合ECL試劑盒中A液和B液,混合液鋪在膜表面,凝膠成像系統(tǒng)曝光,Quantity one軟件分析結果。
表1 PCR引物序列
成軟骨誘導組中,在成軟骨誘導分化第7、10、14日的軟骨分化相關基因Aggrecan mRNA表達水平均逐漸升高(與誘導前比較,t分別為30.274、
46.132、160.752,P均<0.001);Col2a1 mRNA相對表達量在第7、10日升高(與誘導前比較,t分別為10.246、67.202、45.311,P均<0.001),第14日稍下降(與誘導前比較,t=53.244、P<0.001;與第10日比較,t=2.376、P>0.05);Col10a1第7、10日增加緩慢(與誘導前比較,P均>0.05),但第14日大幅上調(與誘導前比較,t=330.784,P<0.001)。軟骨分化后, 軟骨化基因表達逐漸穩(wěn)步增加,但并未達到峰值;Sox 9和NFATc1 mRNA表達水平隨著軟骨分化進展而增加(與對照組0 d及10 d時比較,t分別為65.266、80.232,P均<0.001),見圖1A~D。蛋白免疫印跡法顯示,成軟骨誘導組Col2a1、Sox 9和NFATc1蛋白呈逐漸增強表達,表明軟骨發(fā)生的進展,而肥厚性標記Col10a1蛋白顯示較穩(wěn)定表達(圖1E)。
通過Targetscan和miRanda等在線軟件分析,發(fā)現NFATc1是miR-124的潛在靶基因之一, NFATc1 mRNA的3’UTR與miR-124的種子區(qū)存在理論上的互補堿基配對序列(圖2A)。轉染NFATc1 Wt質粒的對照組熒光素酶活性低于實驗組(t=3.837,P<0.05);轉染NFATc1 Mut質粒的實驗組與對照組間熒光素酶活性比較差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05);轉染NFATc1 Wt質粒的實驗組NFATc1蛋白表達水平高于對照組(圖2B),表明miR-124直接作用于NFATc1。
圖1 C3H10T1/2誘導成軟骨分化的相關基因表達水平變化
miR-124組與si-NFATc1組的NFATc1 mRNA表達水平均低于Control組(LSD-t分別為5.642、4.338,P均<0.01),miR-124組與si-NFATc1組的NFATc1 mRNA表達水平接近(P>0.05);蛋白免疫印跡檢測結果與實時定量PCR結果基本一致(圖2C),表明miR-124能在C3H10T1/2軟骨分化的過程中靶向調控NFATc1表達。
圖2 miR-124 通過靶向NFATc1促進C3H10T1/2細胞軟骨分化
A:互補堿基配對序列;B:NFATc1 熒光素酶活性檢測結果和NFATc1蛋白表達;C:miR-124抑制NFAc1 mRNA和蛋白表達;與共轉染NFATc1 Wt質粒的對照組熒光素酶活性比較,*P<0.01;與Control組比較,#P<0.01
與未加入miR124 mimics相比,100 nmol/L的miR-124 mimics加入C3H10T1/2細胞后,miR-124 mRNA表達水平約增加60倍,而NFATc1 mRNA表達水平約降低60%(圖3A)。當100 nmol/L miR-124 inhibitors加入C3H10T1/2細胞時,與未加入時相比,miR-124 mRNA表達水平減少了大約60%,而NFATc1增加了大約1倍(圖3B)。轉染NFATc1-Wt質粒的miR-124 mimics組NFATc1熒光素酶活性低于其他4組(F=8.256,LSD-t分別為5.436、7.442、3.433、6.282,P均<0.05),轉染NFATc1-Mut質粒的miR-124 mimics組NFATc1熒光素酶活性與其他4組相近(P均>0.05),表明miR-124可作為NFATc1的抑制劑(圖3C)。
C3H10T1/2細胞系是一種小鼠胚胎源性間充質干細胞,具有多向分化潛能,轉染效率高且穩(wěn)定,易獲得大量轉染成功的活細胞,現已廣泛用于研究MSC分化潛能的實驗中[8]。miR作為一類重要的轉錄后調控因子,在MSC的分化過程中參與調控細胞的多種生物學過程[9-10]。已有研究發(fā)現,miR在調控MSC或前體細胞成軟骨、成骨及成脂的分化過程中發(fā)揮重要生物學功能[11]。miR-124能抑制MSC向軟骨分化[12]。上述研究證實,miR可通過抑制靶基因的表達參與MSC分化的調控。然而其中的分子機制和調控的靶基因尚不清楚。本課題組前期實驗首先誘導的C3H10T1/2細胞向軟骨的定向分化,在此過程中發(fā)現miR-124表達逐漸下調,提示其在MSC軟骨分化中可能具有重要的調控作用;然后通過生物信息學分析預測出miR-124潛在的其中一個靶基因NFATc1。本研究亦顯示,軟骨分化后NFATc1和軟骨化相關基因及蛋白表達逐漸穩(wěn)步增加。
圖3 干擾NFATc1或過表達miR-124時C3H10T1/2的NFATc1表達水平變化
與其他4組比較,*P<0.05
本研究將NFATc1 3’-UTR克隆入熒光素酶報告載體并且與miR-124共轉染C3H10T1/2細胞,結果顯示miR-124抑制NFATc1 mRNA的3’UTR熒光素酶活性,發(fā)現其特異性與NFATc1 mRNA的3’UTR相結合。然而在生理狀態(tài)下,靶基因3’UTR序列中的miR結合位點有可能由于mRNA的構象而被掩蓋,導致該miR無法發(fā)揮抑制靶基因表達的功能。因此進一步檢測該miR與NFATc1 3’UTR的結合能力及其對NFAc1表達的抑制作用,結果表明miR-124能抑制軟骨分化過程中的NFATc1 mRNA及蛋白表達,并且其強度與NFATc1 siRNA干擾NFATc1內源性表達一致,證明了miR-124直接靶向調控NFATc1表達。通過功能研究siRNA干擾NFATc1表達能抑制MSC的成軟骨化,它能部分模擬miR-124調控MSC軟骨分化的功能。另外,蛋白免疫印跡檢測結果也顯示轉染miR-124 mimics后,NFATc1的蛋白相對表達量比對照組明顯下調;相反,轉染miR-124 inhibitor后NFATc1的蛋白相對表達量與對照組比較則上調,表明在C3H10T1/2細胞成骨分化過程中miR-124通過調控靶基因NFATc1介導MSC向軟骨方向分化。
綜上所述,本研究運用生物信息學方法對miR-124和NFATc1基因的靶向配對關系進行預測,發(fā)現兩者靶向配對良好,采用熒光素酶報告系統(tǒng)、實時定量PCR及蛋白免疫印跡法發(fā)現miR-124可靶向抑制NFATc1的表達而負向調控C3H10T1/2細胞成軟骨分化。鑒于NFATc1是鈣形成信號通路中的重要轉導因子之一,因此miR-124調控成軟骨分化的作用機制可能是通過抑制NFATc1的表達,因此阻礙其下游信號通路的激活,進而抑制MSC的成軟骨分化。
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