張秀梅++王杰++張凱++劉俊杰++吳雄偉+++湯劍鋒++王輝憲
摘 要:以吡咯(Pyrrole)為印跡分子,甲基丙烯酸(MAA)、4-乙烯基吡啶(4-Vp)、丙烯酰胺(AM)三種物質(zhì)分別作為功能單體,運(yùn)用密度泛函理論的M062X泛函,在6-31+G(d,p)基組下,模擬吡咯印跡分子與甲基丙烯酸、4-乙烯基吡啶、丙烯酰胺三種功能單體分子印跡聚合物自組裝體系的構(gòu)型,找到功能單體與模板分子結(jié)合所形成的復(fù)合物最優(yōu)構(gòu)型,并計(jì)算其結(jié)合能,并通過(guò)RDG函數(shù)的等值面分析來(lái)展現(xiàn)功能單體和吡咯分子弱相互作用類(lèi)型。模擬計(jì)算結(jié)果表明,三種單體與MIP均是通過(guò)氫鍵的形式相互作用,而丙烯酰胺與吡咯之間相互作用最強(qiáng),對(duì)MIP的識(shí)別能力最強(qiáng),最適合作為制備吡咯分子印跡聚合物。
關(guān)鍵詞:吡咯;分子印跡聚合物;弱相互作用;計(jì)算模擬
分子印跡聚合物(MIP)由于具有獨(dú)特的理化性質(zhì)成為研究熱點(diǎn),分子印跡材料能夠?qū)δ0宸肿舆M(jìn)行高度專(zhuān)一的選擇識(shí)別性,這類(lèi)分離材料已被廣泛應(yīng)用于固相萃取分離等新興分離技術(shù)中。分子印跡聚合物識(shí)別機(jī)理的研究是該技術(shù)進(jìn)一步發(fā)展的關(guān)鍵。隨著量子化學(xué)的快速發(fā)展,越來(lái)越多的研究者開(kāi)始結(jié)合計(jì)算模擬來(lái)解釋和研究實(shí)驗(yàn)問(wèn)題[1-4],探討印跡識(shí)別機(jī)理,快速篩選單體、印跡比例及溶劑顯得尤為重要。
本文以密度泛函理論理論計(jì)算為基礎(chǔ),研究吡咯分子與MAA、4-Vp、AM三種功能單體形成穩(wěn)定復(fù)合物的幾何構(gòu)型、成鍵情況、分子間的弱相互作用類(lèi)型,從分子水平上優(yōu)化篩選與吡咯分子更匹配的功能單體。
1 計(jì)算方法
使用參照文獻(xiàn)中描述方法,典型步驟如下:在6-31+G(d,p)基組[3]水平下,采用M062X密度泛函理論(DFT),使用Gaussian09程序,分別對(duì)模板分子和功能單體進(jìn)行以下操作:對(duì)Pyrrole、MAA、4-Vp、AM及其復(fù)合物進(jìn)行幾何構(gòu)型優(yōu)化,得到無(wú)虛頻且能量最低的幾何構(gòu)型;研究Pyrrole分別與MAA、4-Vp、AM形成的復(fù)合物的作用原理及其相互作用的強(qiáng)弱;用下式對(duì)得到的復(fù)合物穩(wěn)定幾何構(gòu)型進(jìn)行結(jié)合能計(jì)算,計(jì)算Pyrrole與單體相互作用的強(qiáng)弱,進(jìn)行單體篩選。
?E=E(復(fù)合物)-∑E(模板)-∑E(功能單體)
式中:E 表示優(yōu)化后的單點(diǎn)能。
本文使用Multiwfn波函數(shù)分析程序中的RDG分析功能進(jìn)行分析。
2 結(jié)果與討論
2.1 吡咯與功能單體幾何構(gòu)型的優(yōu)化
優(yōu)化篩選后得到的沒(méi)有虛頻且能量最低的Pyrrole和MAA、4-Vp、AM的分子幾何構(gòu)型。得到優(yōu)化后的分子模型后,參試對(duì)模板分子與功能單體之間的作用方式及作用強(qiáng)度,選用1:1比例配比進(jìn)行分析,結(jié)果如圖1所示。
2.2 功能單體與吡咯分子的弱相互作用
從圖2散點(diǎn)圖左邊1的spike的sign(λ_2)ρ比較負(fù),可看出相互作用存在對(duì)應(yīng)較強(qiáng)的氫鍵,因而氧原子和氫原子中間的等值面為淺藍(lán)色,形成的是氫鍵,與之對(duì)應(yīng)的圖2(b)是填色等值面圖中的O-H-N作用區(qū)域;而散點(diǎn)圖左邊2的spike的sign(λ_2)ρ相對(duì)于1要大得多,與之對(duì)應(yīng)的是填色等值面圖中的N-H-N中間區(qū)域,可以看出相互作用存在對(duì)應(yīng)的弱氫鍵或是范德華力。
從圖3散點(diǎn)圖左邊1的spike的sign(λ_2)ρ比較負(fù),可看出相互作用存在對(duì)應(yīng)較強(qiáng)的氫鍵,因而氧原子和氫原子中間的等值面為淺藍(lán)色,形成的是氫鍵,散點(diǎn)圖左邊2的spike的sign(λ_2)ρ相對(duì)于1要大得多,可以看出相互作用存在對(duì)應(yīng)的弱氫鍵或是范德華力。與圖2區(qū)別在于,圖2的兩個(gè)spike的sign(λ_2)ρ對(duì)應(yīng)圖3均更負(fù),說(shuō)明AM比MAA形成的氫鍵和弱氫鍵(范德華力)的效果更強(qiáng)。
從圖4散點(diǎn)圖左邊1的spike的sign(λ_2)ρ很負(fù),可看出相互作用存在對(duì)應(yīng)很強(qiáng)的氫鍵,因而氮原子和氫原子中間的等值面為深藍(lán)色,形成的是強(qiáng)氫鍵,散點(diǎn)圖左邊2、3的spike的sign(λ_2)ρ相對(duì)于1要大得多,可以看出相互作用存在對(duì)應(yīng)的弱氫鍵或是范德華力。與圖2區(qū)別在于,圖2的兩個(gè)spike的sign(λ_2)ρ的和對(duì)應(yīng)圖4均更負(fù),說(shuō)明AM比4-vp形成的氫鍵和弱氫鍵(范德華力)的貢獻(xiàn)更大,作用更強(qiáng)。
3 結(jié)論
基于密度泛函理論的計(jì)算模擬能夠準(zhǔn)確的選擇模合適的功能單體,能夠節(jié)省人力物力,大大提高M(jìn)IPs的研發(fā)效率。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)計(jì)算研究表明,對(duì)吡咯分子而言,相互作用最強(qiáng)的功能單體是AM,同時(shí)通過(guò)RDG 分析發(fā)現(xiàn)其分子間形成的氫鍵也是最強(qiáng),且復(fù)合物的結(jié)合能最低,預(yù)測(cè)其制備的MIPs也最穩(wěn)定。通過(guò)模擬計(jì)算,有助于為后續(xù)制備吡咯分子印跡聚合物的進(jìn)一步研究提供理論參考。
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作者簡(jiǎn)介
張秀梅:1991年生,女,河南信陽(yáng)人,碩士研究生;主要從事功能材料的研究。
*通訊作者
吳雄偉1980年生,男,副教授;主要從事全釩液流電池界面反應(yīng)機(jī)理及電池材料的研究。
湯劍鋒:1972年生,男,教授 主要從事面向清潔能源、環(huán)保等領(lǐng)域的金屬納米催化劑設(shè)計(jì)研究。
王輝憲:1961年生,女,教授;主要從事化合物的結(jié)構(gòu)與性能的關(guān)系研究。endprint