宋婧 車南穎
結(jié)核病(tuberculosis,TB)已經(jīng)存在數(shù)千年,仍然是全球十大死因之一,死亡率在傳染性疾病中排名第一,嚴(yán)重威脅人類健康[1]。病理學(xué)是診斷結(jié)核病的重要途徑,尤其在痰菌陰性肺結(jié)核和肺外結(jié)核等疑難患者的診斷中發(fā)揮了重要作用[2]。傳統(tǒng)的結(jié)核病病理學(xué)診斷主要依靠常規(guī)病理學(xué)及抗酸染色,可與其他常見(jiàn)的腫瘤和感染性疾病進(jìn)行鑒別[3];但與其他一些肉芽腫性疾病,例如非結(jié)核分枝桿菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)病的鑒別診斷中遇到很多困難。隨著分子生物學(xué)與病理學(xué)的相互交叉滲透,20世紀(jì)70年代利用分子生物學(xué)技術(shù)研究疾病病因、發(fā)病機(jī)制、形態(tài)變化及功能損傷規(guī)律的新分支學(xué)科——分子病理學(xué)誕生[2]。近年來(lái),分子病理學(xué)技術(shù)發(fā)展迅速;在2017年發(fā)表的《中國(guó)結(jié)核病病理學(xué)診斷專家共識(shí)》中提出,分子病理學(xué)檢測(cè)是病理學(xué)確診結(jié)核病的主要依據(jù)。分子病理學(xué)可以有效解決結(jié)核病與NTM病的鑒別診斷,以及耐藥結(jié)核病的診斷等傳統(tǒng)病理學(xué)所無(wú)法完成的難題[4]。筆者從分子病理學(xué)診斷結(jié)核病、NTM病及耐藥結(jié)核病等3個(gè)方面對(duì)近幾年分子病理學(xué)診斷技術(shù)在臨床中的應(yīng)用進(jìn)展做一簡(jiǎn)要綜述。
TB的早期診斷是臨床治療的關(guān)鍵,分子病理學(xué)技術(shù)是診斷TB快速、有效的方法。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,新的PCR及其衍生技術(shù)的應(yīng)用,進(jìn)一步提高了TB病理學(xué)診斷的敏感度和特異度。
PCR是一種體外擴(kuò)增特異DNA片段的技術(shù),可在短時(shí)間內(nèi)將一個(gè)或幾個(gè)結(jié)核分枝桿菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)DNA拷貝擴(kuò)增到百萬(wàn)數(shù)量級(jí)。為了提高PCR診斷的敏感度和特異度,基于普通PCR的新型分子診斷技術(shù)大量涌現(xiàn)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,RT-qPCR)通過(guò)對(duì)PCR擴(kuò)增反應(yīng)中每一個(gè)循環(huán)產(chǎn)物熒光信號(hào)的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)實(shí)現(xiàn)對(duì)起始模板定性及定量的分析;巢式PCR通過(guò)設(shè)計(jì)“外側(cè)”、“內(nèi)側(cè)”兩對(duì)引物進(jìn)行2次PCR擴(kuò)增,提高了微量靶序列檢出的敏感度和特異度。董宇杰等[5]回顧性分析了胸腔鏡活檢獲取的36例結(jié)核性胸膜炎患者福爾馬林固定石蠟包埋組織標(biāo)本(formalin-fixed paraffin-embedded,F(xiàn)FPE),25例經(jīng)RT-qPCR檢測(cè)MTB-DNA陽(yáng)性,敏感度為69.4%,GeneXpert檢測(cè)胸腔積液的敏感度僅為12.5%,活檢組織MTB-DNA檢測(cè)在結(jié)核性胸膜炎診斷中具有重要價(jià)值。穆晶等[6]分別用RT-qPCR與抗酸染色檢測(cè)93例骨關(guān)節(jié)結(jié)核FFPE標(biāo)本,RT-qPCR檢測(cè)的敏感度(82.8%)明顯高于抗酸染色法(68.8%)。McKew等[7]結(jié)合65 kDa(相對(duì)分子質(zhì)量為65 000)熱休克蛋白編碼基因(65-kDa Heat Shock Protein Gene,hsp65 gene)和插入序列6110(IS6110)用RT-qPCR檢測(cè)FFPE標(biāo)本中的MTB,其敏感度(89%)優(yōu)于新鮮組織固體培養(yǎng)(70%)。Seo等[8]對(duì)IS6110和MPB64序列設(shè)計(jì)引物用巢式PCR和RT-qPCR檢測(cè)FFPE標(biāo)本的MTB,巢式PCR的敏感度高于RT-qPCR,能夠達(dá)到70%~87%,4種不同商業(yè)用試劑盒RT-qPCR陽(yáng)性檢出率為31.3%~80.0%不等。巢式PCR的缺點(diǎn)是2次擴(kuò)增中間有開(kāi)蓋過(guò)程,存在污染風(fēng)險(xiǎn),所以不適用于臨床檢測(cè)。RT-qPCR 只擴(kuò)增1次,耗費(fèi)時(shí)間短,且能對(duì)MTB起始模板進(jìn)行定量分析,更適用于臨床檢測(cè)。
多重PCR技術(shù)是在同一個(gè)PCR反應(yīng)體系中加入多對(duì)引物同時(shí)擴(kuò)增DNA樣本的幾個(gè)不同靶區(qū)域片段,節(jié)約樣本,省時(shí)省力。Fukumoto等[9]開(kāi)發(fā)了一種同時(shí)檢測(cè)病理組織標(biāo)本中細(xì)菌和真菌的“多微生物實(shí)時(shí)PCR”診斷系統(tǒng),能同時(shí)檢測(cè)68種細(xì)菌和9種真菌。在10例獲得性免疫缺陷綜合征患者尸檢時(shí)取肺部組織檢測(cè),金黃色葡萄球菌是最常見(jiàn)的微生物(8例),其次是銅綠假單胞菌(6例)、腸球菌(6例)和白色念珠菌(4例)。此外,在1例肺炎中檢測(cè)到MTB的潛伏感染?!岸辔⑸飳?shí)時(shí)PCR”診斷系統(tǒng)可用于檢測(cè)病理標(biāo)本中的細(xì)菌和真菌,有助于明確診斷感染性疾病。國(guó)內(nèi)也有學(xué)者利用多重PCR技術(shù)檢測(cè)TB患者FFPE組織標(biāo)本,李子玲等[10]對(duì)結(jié)核分枝桿菌熱休克蛋白65(heat shock protein 65,hsp65)、IS6110和人類β2珠蛋白基因序列設(shè)計(jì)引物進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示出較高的敏感度和特異度,且可以鑒別MTB和NTM。
GeneXpert是由美國(guó)Cepheid公司開(kāi)發(fā)的以半巢式實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)為基礎(chǔ),系統(tǒng)自動(dòng)運(yùn)行并同時(shí)檢測(cè)MTB和利福平耐藥性的診斷平臺(tái)。Polepole等[11]的研究評(píng)估了GeneXpert檢測(cè)FFPE標(biāo)本診斷肺外結(jié)核的準(zhǔn)確性,以病理組織學(xué)診斷為標(biāo)準(zhǔn),組織抗酸染色、PCR和GeneXpert診斷淋巴結(jié)結(jié)核的陽(yáng)性率分別為13%(95%CI:5%~27%)、41%(95%CI:27%~57%)和30%(95%CI:18%~46%);診斷淋巴結(jié)結(jié)核以外的其他肺外結(jié)核,陽(yáng)性率分別為12%(95%CI:2%~38%)、82%(95%CI:56%~95%)和35%(95%CI:15%~61%),PCR檢測(cè)肺外結(jié)核FFPE標(biāo)本的敏感度較GeneXpert更高。Pandey等[12]的研究表明GeneXpert對(duì)于大多數(shù)肺外結(jié)核新鮮組織標(biāo)本和呼吸道(除痰外)標(biāo)本的檢測(cè)具有潛在價(jià)值,選取腦脊液、胸膜腔積液、淋巴結(jié)組織、膿液,以及支氣管灌洗液等269份樣本,以培養(yǎng)為標(biāo)準(zhǔn),GeneXpert檢測(cè)的敏感度和特異度分別為89%和95%;對(duì)于抗酸染色涂片陽(yáng)性和涂片陰性樣本,GeneXpert檢測(cè)的敏感度分別為100%和77%,特異度分別為94%和96%。GeneXpert檢測(cè)新鮮組織標(biāo)本效果更好,可能與FFPE標(biāo)本制作過(guò)程中,福爾馬林固定液引起蛋白交聯(lián)導(dǎo)致DNA損傷、蠟塊組織保存時(shí)間過(guò)長(zhǎng)等因素有關(guān)。
總之,分子生物學(xué)技術(shù)在結(jié)核病組織病理學(xué)診斷中的應(yīng)用,大大提高了病理學(xué)診斷結(jié)核病的陽(yáng)性率,在結(jié)核病的早期診斷中具有較好的臨床實(shí)用價(jià)值。
NTM是分枝桿菌屬內(nèi)除結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群和麻風(fēng)分枝桿菌以外的其他分枝桿菌[13]。近年來(lái), NTM從臨床標(biāo)本中的分離率有所增加。NTM病與TB的組織形態(tài)學(xué)相似,抗酸染色也很難區(qū)別,分子病理學(xué)實(shí)現(xiàn)了傳統(tǒng)病理學(xué)無(wú)法完成的NTM感染的診斷。
目前共發(fā)現(xiàn)154種NTM和13個(gè)亞種,僅少部分對(duì)人體致病。NTM可以侵犯人體肺臟、淋巴結(jié)、骨骼、關(guān)節(jié)、皮膚和軟組織等器官,并可引起全身播散性疾病[13]。16S rRNA和16S-23S rRNA基因內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)、rpoB、hsp65等基因序列常被用來(lái)鑒別MTB和NTM。Kim等[14]觀察到MTB和NTM感染之間的組織形態(tài)學(xué)基本沒(méi)有差別,用多重PCR和RT-qPCR兩種MTB與NTM檢測(cè)試劑盒檢測(cè)154例分枝桿菌感染患者的FFPE肺組織標(biāo)本,包括137例TB患者和17例NTM病患者(分枝桿菌培養(yǎng)結(jié)果為12例胞內(nèi)分枝桿菌,2例膿腫分枝桿菌,1例鳥分枝桿菌,其余2例未鑒定出菌種)。多重PCR檢測(cè)NTM的敏感度略高于RT-qPCR,但兩種方法鑒別MTB與NTM差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。Sabeti等[15]報(bào)告的1例32歲患有終末期腎病的男性患者,手指病灶有皮下結(jié)節(jié)性病變,F(xiàn)FPE標(biāo)本組織行抗酸染色涂片檢查陽(yáng)性,PCR檢測(cè)結(jié)果為結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群陰性,進(jìn)一步用多重PCR鑒定出一種生長(zhǎng)緩慢的NTM——M.haemophilum,該菌可在免疫功能低下的患者中引起皮下潰瘍性或結(jié)節(jié)性病變。在患者標(biāo)本抗酸染色涂片檢查陽(yáng)性、MTB-PCR檢測(cè)結(jié)果陰性時(shí),應(yīng)考慮與NTM病的鑒別診斷。
核酸探針雜交技術(shù)的原理是與探針具有一定同源性和互補(bǔ)性的待測(cè)核酸分子在一定的條件下,可與探針通過(guò)氫鍵形成雙鏈分子。這種雙鏈分子經(jīng)過(guò)核素、熒光物質(zhì)或生物素標(biāo)記后,可通過(guò)放射自顯影或顯色反應(yīng)檢測(cè)出來(lái)[4]。德國(guó)Hain公司開(kāi)發(fā)的以23S rRNA為靶基因鑒定NTM的試劑盒包括GenoType Mycobacterium CM和GenoType Mycobacterium AS,前者鑒定結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群及常見(jiàn)的15種NTM,包括鳥胞內(nèi)分枝桿菌、偶發(fā)分枝桿菌、膿腫分枝桿菌等,后者用于鑒定臨床少見(jiàn)的其他16 種致病NTM,如恥垢分枝桿菌、草分枝桿菌、胃分枝桿菌等[16]。國(guó)內(nèi)深圳亞能生物公司開(kāi)發(fā)的分枝桿菌菌種鑒定試劑盒采用PCR-反向斑點(diǎn)雜交技術(shù)原理,試驗(yàn)?zāi)l上共有22個(gè)NTM探針位點(diǎn),標(biāo)本與相對(duì)應(yīng)探針雜交顯色,即檢測(cè)到相應(yīng)的分枝桿菌。北京博奧生物有限公司研發(fā)的分枝桿菌菌種鑒定芯片可以識(shí)別17種 NTM,Zhu等[17]用該芯片檢測(cè)150例MTB和67例 NTM臨床培養(yǎng)分離菌株樣本,生物芯片結(jié)果與16S rRNA測(cè)序結(jié)果一致;195例臨床痰標(biāo)本中,116(59%)例培養(yǎng)陽(yáng)性和79(41%)例培養(yǎng)陰性,生物芯片成功檢測(cè)到全部116例培養(yǎng)陽(yáng)性樣品,同時(shí)檢測(cè)到1株培養(yǎng)陰性的MTB。Munkhdelger 等[18]報(bào)道利用PCR-反向斑點(diǎn)雜交技術(shù)在FFPE 標(biāo)本中成功鑒定了多種NTM。核酸探針雜交技術(shù)較一般PCR具有更高的檢測(cè)通量,一次實(shí)驗(yàn)可以檢測(cè)多個(gè)基因位點(diǎn),從而鑒別多種NTM。
熔解曲線法是一種PCR后產(chǎn)物分析技術(shù),野生型基因有特定的熔解溫度值(Tm),而突變型基因因?yàn)镈NA雙鏈結(jié)合能力下降導(dǎo)致相應(yīng)的Tm值下降。Tm值下降的幅度與發(fā)生錯(cuò)配的堿基數(shù)目、類型和位置有關(guān),據(jù)此可以檢測(cè)出突變型和野生型。熔解曲線主要分為高分辨熔解曲線和熒光探針熔解曲線兩種方法。高分辨熔解曲線(high resolution melting,HRM)技術(shù)是PCR擴(kuò)增技術(shù)與熔解曲線分析技術(shù)相結(jié)合,依靠高分辨溫度檢測(cè)PCR儀和新型飽和熒光染料制作熔解曲線實(shí)現(xiàn)基因序列分析的新技術(shù)[19]。Khosravi等[20]使用德國(guó)QIAGEN Type-it HRM PCR試劑盒檢測(cè)98株分枝桿菌臨床分離株,rpoBC操縱子進(jìn)行實(shí)時(shí)PCR后進(jìn)一步HRM分析,成功鑒定出88株(89.7%)分枝桿菌。Issa等[21]采用16S rRNA基因作為實(shí)時(shí)PCR中的靶標(biāo),進(jìn)行HRM分析,區(qū)分出不同的分枝桿菌種類?;谔结樀臒晒馊劢馇€分析(fluorescence melting curve analysis,F(xiàn)MCA)是將帶有熒光標(biāo)記的探針-靶序列雜交體熱變性的溫度制作熔解曲線。張俊仙等[22]以DNA直接測(cè)序法為對(duì)照,應(yīng)用FMCA法分析22種分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株和11種非分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株,結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)株DNA測(cè)序一致,成功地建立了FMCA鑒定方法。初步鑒定32株分枝桿菌臨床分離株的結(jié)果顯示,30株(93.8%)快速鑒定到種,2株鑒定到分枝桿菌屬,F(xiàn)MCA具有較高的敏感度。目前,熔解曲線法用于FFPE標(biāo)本分枝桿菌鑒定的報(bào)道較少,未來(lái)還需做進(jìn)一步的研究。
DNA測(cè)序技術(shù)近年在多個(gè)生物研究領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,其優(yōu)點(diǎn)是通量高、速度快及準(zhǔn)確性高,但操作復(fù)雜及較高的成本限制了其在臨床中的應(yīng)用。Bao等[23]最近開(kāi)發(fā)了一種使用16S rRNA PCR擴(kuò)增和焦磷酸測(cè)序(PCR-Seq)快速檢測(cè)和鑒別FFPE標(biāo)本中抗酸菌(acid-fast bacterium,AFB)的方法,包括結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群、NTM、諾卡菌屬及其他的AFB,并進(jìn)行了評(píng)估。116例FFPE標(biāo)本抗酸染色涂片陽(yáng)性,其中83例(72%)通過(guò)PCR-Seq鑒定出AFB類型,除識(shí)別出14例結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群和3例麻風(fēng)分枝桿菌外,還確定了另外19個(gè)AFB菌種。在過(guò)去的幾十年中,NTM和其他AFB(如諾卡菌屬)的感染逐漸上升,肺外組織FFPE標(biāo)本中檢測(cè)出結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群和NTM等AFB顯得越來(lái)越重要。
傳統(tǒng)鑒定NTM的方法操作復(fù)雜,需要2~3個(gè)月時(shí)間,且在多數(shù)情況下無(wú)法獲得明確的鑒定,可能會(huì)延誤 NTM的診斷和治療。分子生物學(xué)方法操作簡(jiǎn)單、快速,一次檢測(cè)就可以獲得菌種鑒定結(jié)果,對(duì)NTM病的早期診斷具有重要價(jià)值。
根據(jù)2017年世界衛(wèi)生組織的最新報(bào)告,2016年我國(guó)新發(fā)耐藥結(jié)核病患者5.8萬(wàn)例,但發(fā)現(xiàn)并經(jīng)實(shí)驗(yàn)室確診的僅有1萬(wàn)余例[1]。傳統(tǒng)的MTB藥物敏感性試驗(yàn)(簡(jiǎn)稱“藥敏試驗(yàn)”)受生物安全、培養(yǎng)時(shí)間長(zhǎng)等因素影響,不能滿足臨床快速診斷耐藥結(jié)核病的需求。目前,具有生物安全要求級(jí)別低、檢測(cè)時(shí)間短、敏感度較高等特點(diǎn)的耐藥結(jié)核分子生物學(xué)診斷方法日益受到重視。
目前研究發(fā)現(xiàn),MTB耐藥的主要機(jī)制是抗結(jié)核藥物作用位點(diǎn)的靶基因突變,如利福平(RFP)的rpoB81 bp(密碼子507~533)耐藥決定區(qū)(rifampin resistance determing region,RRDR)、異煙肼(INH) 的KatG和inhA-mabA啟動(dòng)子基因突變等[24]。德國(guó)Hain公司的GenoType MTBDRplus試劑盒是世界衛(wèi)生組織推薦的檢測(cè)MTB耐藥性的方法,能夠可靠地檢測(cè)與INH和RFP耐藥相關(guān)的常見(jiàn)突變。Schaumburg等[25]從14例TB患者FFPE組織標(biāo)本中提取DNA,同時(shí)與基于培養(yǎng)的藥敏試驗(yàn)結(jié)果比較,評(píng)估核酸探針雜交技術(shù)檢測(cè)MTB對(duì)RFP和INH的耐藥性,結(jié)果顯示出較好的一致性。國(guó)內(nèi)譚景尹等[26]用PCR-膜芯片反向點(diǎn)雜交技術(shù)檢測(cè)FFPE標(biāo)本中MTB的耐藥基因突變,在42例MTBIS6110基因陽(yáng)性的標(biāo)本中,檢出INH基因突變2例,RFP或Sm耐藥相關(guān)基因突變各1例,INH、RFP和EMB耐藥相關(guān)基因同時(shí)突變1例,與測(cè)序結(jié)果基本相符。FFPE標(biāo)本提取DNA檢測(cè)INH和RFP耐藥性,較基于培養(yǎng)的藥敏試驗(yàn)檢測(cè)周期短,早期即可為患者抗結(jié)核治療藥物的選擇提供指導(dǎo)。Guo等[27]開(kāi)發(fā)和評(píng)估了檢測(cè)耐多藥結(jié)核病(multidrug-resistant tuberculosis,MDR-TB)的快速生物芯片系統(tǒng)。快速生物芯片系統(tǒng)測(cè)定結(jié)果與DNA測(cè)序結(jié)果的一致率為100%。與傳統(tǒng)藥敏試驗(yàn)相比,對(duì)于RFP耐藥性的檢測(cè),快速生物芯片系統(tǒng)檢測(cè)臨床分離株的一致率為91.8%,檢測(cè)痰標(biāo)本為94.6%;對(duì)于INH的耐藥性檢測(cè),快速生物芯片系統(tǒng)檢測(cè)臨床分離株與傳統(tǒng)藥敏試驗(yàn)的一致率為70.2%,檢測(cè)痰標(biāo)本一致率為78.1%。整個(gè)生物芯片測(cè)定需要6 h,而作為結(jié)核分枝桿菌耐藥檢測(cè)金標(biāo)準(zhǔn)的表型藥敏試驗(yàn)檢測(cè)方法需要2~3個(gè)月。但國(guó)內(nèi)外關(guān)于該方法的報(bào)道大多數(shù)是用痰或者培養(yǎng)物等標(biāo)本,對(duì)FFPE標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)的報(bào)道較少。
已有學(xué)者報(bào)道用熔解曲線法快速檢測(cè)新鮮組織MTB培養(yǎng)分離株的耐藥突變。Sharma等[28]用HRM在200例肺外結(jié)核患者新鮮組織培養(yǎng)分離菌株中檢測(cè)到22例MDR-TB患者(11%),3例(1.5%)單耐RFP患者,8例(4%)單耐INH患者。同時(shí)HRM直接從組織中鑒定出另外4例培養(yǎng)陰性的MDR-TB患者。HRM檢測(cè)結(jié)果和測(cè)序的結(jié)果具有100%的一致性。Luo等[29-30]建立了熒光探針熔解曲線技術(shù)檢測(cè)MDR-TB的系統(tǒng),用臨床分離株對(duì)一線抗結(jié)核藥物和二線抗結(jié)核藥物分別進(jìn)行了驗(yàn)證,并將檢測(cè)結(jié)果與測(cè)序結(jié)果比較,有較好的一致性。熔解曲線法操作簡(jiǎn)單,結(jié)果容易判讀,在MTB藥敏試驗(yàn)方面有較好的應(yīng)用前景。
GeneXpert檢測(cè)技術(shù)針對(duì)rpoB81 bp RRDR設(shè)計(jì)引物和探針,檢測(cè)是否發(fā)生RFP的耐藥突變,是世界衛(wèi)生組織推薦的快速診斷耐藥結(jié)核病的方法。Polepole等[11]用GeneXpert 技術(shù)檢測(cè)100例肺外結(jié)核患者的FFPE組織標(biāo)本,包括淋巴結(jié)、腹部組織、滑膜組織、皮膚、睪丸組織等,檢出2例對(duì)RFP耐藥的淋巴結(jié)結(jié)核患者,1例對(duì)RFP耐藥的男性睪丸結(jié)核,14例是否對(duì)RFP耐藥不明確。Rindi等[31]用GeneXpert技術(shù)檢測(cè)14例具有TB組織病理學(xué)特征的FFPE標(biāo)本和8例無(wú)TB組織病理學(xué)特征的健康組織標(biāo)本,14例MTB-DNA均為陽(yáng)性且對(duì)RFP敏感,對(duì)照組中均未檢測(cè)到MTB-DNA??傊?,GeneXpert技術(shù)檢測(cè)FFPE標(biāo)本中的MTB-DNA對(duì)RFP是否耐藥的報(bào)道較少,未來(lái)還需進(jìn)行更多樣本量的研究以評(píng)估其診斷效能。
目前,常用的MTB耐藥基因檢測(cè)技術(shù)的缺點(diǎn)是檢測(cè)位點(diǎn)有限,不能一次檢出對(duì)所有常用抗結(jié)核藥物的MTB耐藥基因突變。而高通量測(cè)序能夠檢測(cè)所有已知的耐藥基因突變位點(diǎn),也可以發(fā)現(xiàn)未知的耐藥基因突變。一項(xiàng)大樣本量多中心的研究結(jié)果顯示[32],與傳統(tǒng)藥敏試驗(yàn)結(jié)果比較,基因測(cè)序檢測(cè)MTB臨床分離株對(duì)RFP耐藥的敏感度為91%(靶基因?yàn)閞poB),檢測(cè)對(duì)INH耐藥的敏感度為86%(靶基因?yàn)閗atG,inhA-fabG啟動(dòng)子組合),檢測(cè)對(duì)PZA耐藥的敏感度為54%(靶基因pncA),檢測(cè)對(duì)Ofx耐藥的敏感度為85%(靶基因?yàn)間yrA和gyrB組合),檢測(cè)對(duì)Mfx耐藥的敏感度為88%(靶基因?yàn)間yrA和gyrB組合)?;驕y(cè)序可能成為監(jiān)測(cè)MTB對(duì)抗結(jié)核藥物是否有耐藥性的重要工具。由于存在對(duì)技術(shù)人員要求高、檢測(cè)設(shè)備昂貴的問(wèn)題,高通量測(cè)序難以在短期內(nèi)廣泛用于臨床對(duì)MDR-TB的檢測(cè)。
早期診斷和及時(shí)進(jìn)行規(guī)范治療是耐藥結(jié)核病防控的關(guān)鍵。目前,國(guó)內(nèi)已有基于核酸探針雜交技術(shù)和熒光探針熔解曲線技術(shù)的耐藥檢測(cè)試劑盒可供臨床使用,但總體上可檢測(cè)的抗結(jié)核藥物不夠全面,且成本較高,需要進(jìn)一步研究更經(jīng)濟(jì)、高效、準(zhǔn)確的方法用于耐藥結(jié)核病的診斷。