王秋菊 關(guān)靜
耳聾是導(dǎo)致言語(yǔ)語(yǔ)言交流障礙的常見疾病,50%~70%的耳聾是由遺傳因素所致[1],隨著國(guó)際人類基因組計(jì)劃、人類基因組單體型圖計(jì)劃、千人基因組計(jì)劃順利實(shí)施,以及高通量新一代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing,NGS)的快速發(fā)展,越來越多的研究證實(shí)了遺傳因素在耳聾發(fā)生中的重要作用,對(duì)于耳聾相關(guān)基因的研究和基因診斷也進(jìn)入高速發(fā)展的新階段。自1992年發(fā)現(xiàn)第1個(gè)非綜合征型耳聾基因至今,隨著2005年之后新一代測(cè)序技術(shù)的問世,掀起了一場(chǎng)耳聾基因研究和發(fā)現(xiàn)的新熱潮[2]。
遺傳性耳聾是父母的遺傳物質(zhì)傳遞給后代所引起的聽力損失,父母一方或雙方可以是與子代表型類似的耳聾患者,也可以是聽力正常的致病基因攜帶者。特別要強(qiáng)調(diào),父母?jìng)鹘o后代的是導(dǎo)致耳聾的“遺傳物質(zhì)”,而不是耳聾本身。因此,不能簡(jiǎn)單根據(jù)是否有耳聾家族史和是否為先天性耳聾來判斷遺傳性耳聾。
一旦考慮與遺傳因素相關(guān)的耳聾,不僅關(guān)系到患者本人,還涉及其家庭成員。這類耳聾患者及其家庭成員除了關(guān)切患者聽力損失的發(fā)展趨勢(shì)和有效的治療手段外,同時(shí)對(duì)于遺傳因素是否會(huì)引起其有血緣關(guān)系的家庭其他人員罹患耳聾以及耳聾發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)性等問題更應(yīng)關(guān)注,這就促使耳鼻喉科醫(yī)生需要快速轉(zhuǎn)換成為臨床遺傳咨詢師的角色,給予專業(yè)確切的回答和降低發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的指導(dǎo)建議。
遺傳咨詢(genetic counseling)最早于1941年被提出,1975年美國(guó)人類遺傳學(xué)學(xué)會(huì)對(duì)其賦予定義,是幫助咨詢者理解遺傳因素對(duì)疾病的作用,解釋遺傳檢測(cè)結(jié)果及其在疾病診斷、治療和預(yù)后上的意義,告知遺傳方式和預(yù)測(cè)遺傳風(fēng)險(xiǎn),指導(dǎo)再生育方法選擇的交流溝通過程(communication process)[3,4]。目前在國(guó)內(nèi)尚無遺傳咨詢師這個(gè)職業(yè),遺傳咨詢都是由??婆R床醫(yī)生兼任。本文根據(jù)目前常見的遺傳咨詢問題和現(xiàn)象,梳理了對(duì)于耳聾遺傳咨詢的認(rèn)識(shí)和實(shí)踐,用于指導(dǎo)臨床。
不同類型聾病的臨床診斷依賴于耳鼻咽喉科??漆t(yī)生,一旦環(huán)境因素導(dǎo)致耳聾的病因被排除,則可從最簡(jiǎn)單的單基因病遺傳模式入手進(jìn)行遺傳咨詢。首先根據(jù)采集的患者病史和家族史,繪制家系圖譜,通過分析家系圖譜的遺傳特性,提出最可能的遺傳規(guī)律和模式。其次,指導(dǎo)患者及其家庭選擇適當(dāng)?shù)幕驒z測(cè)方法,幫助尋找耳聾的致病基因。最后,對(duì)患者的基因型與臨床表型信息進(jìn)行綜合分析,評(píng)估疾病發(fā)生、發(fā)展趨勢(shì),提供合理的指導(dǎo)建議,同時(shí)疏導(dǎo)由基因檢測(cè)結(jié)果產(chǎn)生的患者家庭的心理問題。
耳聾具有高度遺傳異質(zhì)性,遺傳學(xué)家估計(jì)約有250~300個(gè)基因與遺傳性耳聾相關(guān)。如何幫助患者檢測(cè)到真正的致病基因,臨床醫(yī)生選擇和建議的適當(dāng)基因檢測(cè)方法是關(guān)鍵。
基于大規(guī)模不同種族的聾病分子流行病學(xué)的研究以及聾病常見基因圖譜的繪制,人們已經(jīng)確認(rèn)GJB2、SLC26A4和mtDNA12SrRNA是我國(guó)耳聾人群中最常見的3個(gè)致病基因[5,6],同時(shí)在健聽人群中的突變攜帶率相對(duì)較高。2007年王秋菊首次提出新生兒聽力及基因聯(lián)合篩查理念[7],歷經(jīng)近10年的臨床實(shí)踐,包含有GJB2、SLC26A4和mtDNA12SrRNA這3種基因突變位點(diǎn)的檢測(cè)方法已廣泛應(yīng)用于聯(lián)合新生兒聽力篩查以及孕婦早中期的聾病易感基因篩查。耳聾基因篩查的應(yīng)用作為一種公共健康保障措施,不僅能夠早期發(fā)現(xiàn)先天性耳聾患者,還能發(fā)現(xiàn)遲發(fā)性耳聾患者和藥物敏感性耳聾基因攜帶者,并得到遺傳咨詢建議和后期有效的干預(yù),避免因聾致啞悲劇的發(fā)生,目前已成為聾病規(guī)?;揽啬J降牡浞?。但對(duì)于這3種常見耳聾基因的檢測(cè),僅能解答約36%聾病患者的致病基因。面對(duì)臨床眾多的聾病患者統(tǒng)一應(yīng)用常見耳聾基因檢測(cè),將無法滿足臨床的實(shí)際需要,這就亟需覆蓋更多耳聾基因的遺傳診斷手段。
基因檢測(cè)技術(shù)不斷在發(fā)展,從最初的Sanger測(cè)序、飛行時(shí)間質(zhì)譜,到新一代測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn),耳聾基因檢測(cè)方法也從最初能夠批量完成3個(gè)常見耳聾基因檢測(cè)到現(xiàn)在一次檢測(cè)上百個(gè)甚至更多基因的巨大技術(shù)飛躍。
新一代測(cè)序技術(shù)的目標(biāo)區(qū)域測(cè)序(NGS Panel)是對(duì)選定的目標(biāo)基因組區(qū)DNA富集后進(jìn)行高通量測(cè)序的技術(shù)手段,類似于“智能漁網(wǎng)”,能將感興趣的基因一次性捕獲。2010年至今,已有多篇基于不同種族耳聾群體利用覆蓋不同耳聾基因數(shù)量的NGS Panel進(jìn)行耳聾遺傳診斷的報(bào)道[8~10],延展了對(duì)耳聾致病基因突變譜的重新認(rèn)識(shí),提高了對(duì)稀有變異的檢測(cè)發(fā)現(xiàn),最重要的是幫助了更多病因不明的耳聾患者找到真正的致病“幽靈”。目前國(guó)內(nèi)市場(chǎng)已有針對(duì)耳聾基因的NGS Panel,檢測(cè)能夠覆蓋到包含非綜合征型耳聾及綜合征型耳聾相關(guān)100~200個(gè)基因編碼區(qū)及鄰近剪切區(qū),不同檢測(cè)機(jī)構(gòu)利用HisSeq 2000/2500/4000測(cè)序平臺(tái),提供了更深的基因覆蓋度及高通量檢測(cè),為耳聾患者遺傳基因的鑒定提供了更經(jīng)濟(jì)有效的新途徑,具有巨大的臨床應(yīng)用潛力。
對(duì)于常見耳聾基因篩查及已知耳聾相關(guān)基因檢測(cè)均未發(fā)現(xiàn)可疑的致病變異個(gè)體,需再次結(jié)合患者的病史進(jìn)行分析,明確遺傳因素致病的權(quán)重,進(jìn)一步針對(duì)可能存在的新致病基因進(jìn)行挖掘。人類基因組共由大約31.6億個(gè)堿基對(duì)組成,有180000個(gè)外顯子,包含了所有蛋白質(zhì)的編碼序列,占人類全部基因組序列的1%[11]。2009年Nature雜志發(fā)表了國(guó)際上首次利用全外顯子組測(cè)序技術(shù)(whole exome sequencing,WES)發(fā)現(xiàn)弗里曼謝爾登綜合征(freemansheldon syndrome,F(xiàn)SS)致病基因的文章[11],此后該技術(shù)廣泛應(yīng)用于檢測(cè)包括耳聾在內(nèi)的遺傳性疾病基因突變。WES能夠在短時(shí)間內(nèi)覆蓋大范圍的基因型,獲得更豐富、有意義的數(shù)據(jù),結(jié)合大量公共數(shù)據(jù)庫(kù)提供的外顯子組數(shù)據(jù),找到引起致病變異的可能性很高,更好地解釋疾病的致病機(jī)理。
然而,任何技術(shù)方法都有其應(yīng)用的局限性,目前認(rèn)為85%的疾病相關(guān)突變位于外顯子編碼區(qū)[12],而對(duì)于發(fā)生在非編碼區(qū)的變異,以及基因組結(jié)構(gòu)的變異包括拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNVs)、顛換(inversion)、易位(translation)等,外顯子測(cè)序便顯得束手無策。因此,如果采用外顯子測(cè)序方法,仍未能發(fā)現(xiàn)與表型共分離的候選致病位點(diǎn),預(yù)示著致病基因有可能位于非編碼區(qū)或存在基因組結(jié)構(gòu)變異,深入分析可考慮采用全基因組測(cè)序(whole genome sequencing,WGS)以及基于全基因組掃描的微陣列比較基因組雜交(array comparative genomic hybridization,aCGH)和單核苷酸多態(tài)性微陣列技術(shù)(single nucleotide polymorphism array,SNP array),在全基因組范圍內(nèi)搜尋疾病相關(guān)候選位點(diǎn)和區(qū)域。對(duì)于耳聾遺傳學(xué)病因分析,由于WGS檢測(cè)費(fèi)用昂貴、測(cè)序覆蓋整個(gè)基因組,基因變異信息解析時(shí)間長(zhǎng),目前主要應(yīng)用于少數(shù)的科研項(xiàng)目。
聾病咨詢的主要內(nèi)容包括耳聾發(fā)生的病因,耳聾的發(fā)展趨勢(shì)和嚴(yán)重程度,初次(或再次)妊娠發(fā)生耳聾的風(fēng)險(xiǎn),以及對(duì)于風(fēng)險(xiǎn)的有效防控措施。結(jié)合實(shí)際臨床咨詢中不同咨詢者家庭背景情況和上述關(guān)注內(nèi)容,可將聾病遺傳咨詢對(duì)象歸納為以下6類,本文案例均來自參與“中國(guó)聾病基因組計(jì)劃”的咨詢家庭。
圖1 咨詢者A家庭譜系圖
針對(duì)耳聾再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的孕前咨詢,首先根據(jù)咨詢者描述的家族成員聽力情況繪制出家系圖譜,圖1所示的咨詢者A家庭(Ⅲ-1和Ⅲ-2)是一對(duì)聽力正常(測(cè)聽結(jié)果無異常)的育齡夫妻進(jìn)行孕前咨詢,因男方咨詢者的父母均為聾啞人,且男方咨詢者的母親家族有2名耳聾患者。本案例咨詢者最關(guān)注的問題是遺傳因素是否會(huì)導(dǎo)致下一代耳聾的發(fā)生及風(fēng)險(xiǎn)性。首先需要幫助這個(gè)家庭查尋到存在的真正致病原因,再做咨詢指導(dǎo)。
本案例中男方咨詢者(Ⅲ-1)家庭中存在較高的遺傳風(fēng)險(xiǎn),其耳聾患者發(fā)生在Ⅱ代,建議男方咨詢者(Ⅲ-1)的父親(Ⅱ-3)和母親(Ⅱ-4)采血分別進(jìn)行包含有127個(gè)基因的遺傳性耳聾NGS Panel檢測(cè),男方家族的其他成員(Ⅱ-1,2,5,6)采血備用驗(yàn)證基因變異位點(diǎn)。
基因檢測(cè)結(jié)果(如圖2所示)發(fā)現(xiàn)男方咨詢者父親(Ⅱ-3)的耳聾基因是SLC26A4復(fù)合雜合突變(參考序列NM_000441,c.1174A>T雜合突變和c.1336C>T雜合突變,突變位點(diǎn)是已經(jīng)報(bào)道過的致病突變),男方咨詢者母親(Ⅱ-4)的耳聾基因是MYO15A復(fù)合雜合突變(參考序列NM_016239,c.7396-1G>A雜合突變和c.4823C>A雜合突變,突變位點(diǎn)均未被報(bào)道,致病屬性分別為可疑致病和臨床意義不明)。對(duì)于男方咨詢者母親(Ⅱ-4)基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)的兩個(gè)尚未報(bào)道過的變異位點(diǎn),根據(jù)2015ACMG遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)[13]致病變異證據(jù)標(biāo)準(zhǔn)分析為致病基因突變。SLC26A4基因是常染色體隱性遺傳非綜合征型耳聾4型(DFNB4)致病基因,MYO15A基因是常染色體隱性遺傳非綜合征型耳聾3型(DFNB3)致病基因。明確了家族中聾病患者的致病基因型后,對(duì)于家族其他成員利用Sanger測(cè)序法進(jìn)行檢測(cè)到的基因突變位點(diǎn)的驗(yàn)證,結(jié)果發(fā)現(xiàn)男方咨詢者(Ⅲ-1)攜帶了SLC26A4基因雜合突變和MYO15A基因雜合突變(見圖2)。
通過上述男方咨詢者(Ⅲ-1)家庭的基因檢測(cè),明確了男方咨詢者存在的潛在耳聾遺傳危險(xiǎn)因素(攜帶SLC26A4基因雜合突變和MYO15A基因雜合突變)。對(duì)于女方咨詢者(Ⅲ-2),無耳聾家族史和其他系統(tǒng)疾病,建議其進(jìn)行81個(gè)基因的非綜合征型耳聾NGS Panel檢測(cè),其中包含有2個(gè)線粒體遺傳性非綜合征型耳聾基因MT-RNR1和MTTS1。基因檢測(cè)結(jié)果(如圖2所示)顯示女方咨詢者(Ⅲ-2)SLC26A4基因和MYO15A基因序列均無變異,2個(gè)線粒體基因無變異。在本案例中,特別要強(qiáng)調(diào)對(duì)于聽力正常且無耳聾家族史的女方咨詢者(Ⅲ-2)一定不要忽略對(duì)于線粒體基因(mtDNA)檢測(cè),mtDNA占人體遺傳信息1%,子代mtDNA是來自卵細(xì)胞,屬于母系遺傳。
綜合咨詢者雙方的基因結(jié)果,可以確認(rèn)有耳聾家族史的男方(Ⅲ-1)家庭為常染色體隱性遺傳,盡管男方咨詢者攜帶兩個(gè)耳聾基因雜合突變位點(diǎn),但其配偶(Ⅲ-2)不攜帶這兩個(gè)耳聾基因的任何突變位點(diǎn)且耳聾相關(guān)線粒體基因無突變,所以子代再發(fā)耳聾的風(fēng)險(xiǎn)較低,孕前指導(dǎo)建議選擇自然妊娠。
圖2 咨詢者A家庭的基因檢測(cè)結(jié)果
圖3 咨詢者B家庭,男方咨詢者為耳聾患者且伴有耳聾家族史,女方咨詢者為聽力正常
首先根據(jù)B家庭咨詢者描述的家族成員聽力情況繪制家系圖譜,圖3所示的咨詢者(Ⅳ-9和Ⅳ-10)是一對(duì)育齡夫妻進(jìn)行孕前咨詢,男方咨詢者及其家族成員中共有9名耳聾患者,聽力下降開始于20~40歲之間的遲發(fā)型中重度聽力損失。本案例咨詢者最關(guān)注的問題是如何避免下一代耳聾再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)。
根據(jù)圖3家系圖譜,可以看到男方咨詢者(Ⅳ-9)的家系遺傳特征:①耳聾表型在這個(gè)家系3代中連續(xù)出現(xiàn),且男女均有發(fā)病;②耳聾患者的雙親中有一位為耳聾患者;符合常染色體顯性遺傳。在對(duì)這個(gè)家庭生育指導(dǎo)之前,首先需要明確男方咨詢者的遺傳致病基因。筆者建議男方咨詢者(Ⅳ-9)進(jìn)行包含127個(gè)基因的遺傳性耳聾NGS Panel檢測(cè),男方的父親(Ⅲ-6)和母親(Ⅲ-7)以及其他成員采血備用驗(yàn)證基因變異位點(diǎn)?;驒z測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)男方咨詢者(Ⅳ-9)EYA4雜合突變(參考序列NM_172105),EYA4基因是常染色體顯性遺傳非綜合征型耳聾10型(DFNA10)致病基因,在其家族成員進(jìn)行該突變位點(diǎn)驗(yàn)證(如圖4所示)存在突變疾病表型共分離現(xiàn)象,其中Ⅳ-7年齡30歲(無聽力異常主訴,但測(cè)聽顯示雙耳2~8 kHz對(duì)稱性緩降型中度感音神經(jīng)性聽力下降)、Ⅴ-4年齡4歲(對(duì)聲音反應(yīng)良好,測(cè)聽結(jié)果無異常)、Ⅴ-6年齡5歲(對(duì)聲音反應(yīng)良好,測(cè)聽結(jié)果無異常),因此在這個(gè)案例中明確男方咨詢者(Ⅳ-9)致病基因之外,對(duì)于3個(gè)(Ⅳ-7、Ⅴ-4,6)攜帶致病基因突變但尚未有顯著聽力異常的成員,需要在成年后定期檢測(cè)聽力變化。
常染色體顯性遺傳性耳聾的后代子女發(fā)病幾率高達(dá)50%或以上,再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)大。對(duì)于本案例的孕前咨詢夫妻,建議通過第三代試管嬰兒技術(shù)方法,利用胚胎植入前遺傳學(xué)診斷(preimplantation genetic diagnosis,PGD)阻斷家族中EYA4基因突變致聾的傳遞。
圖4 咨詢者B家庭的基因檢測(cè)結(jié)果
同證婚配是遺傳學(xué)中一種普遍現(xiàn)象,聾啞夫妻的婚配模式會(huì)增加連續(xù)的遺傳性狀變異發(fā)生幾率。圖5所示的咨詢者(Ⅱ-1和Ⅱ-2)是一對(duì)聾啞夫妻。其最關(guān)注的問題是下一代耳聾發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)。筆者建議夫妻雙方(Ⅱ-1和Ⅱ-2)分別進(jìn)行遺傳性耳聾NGS Panel檢測(cè),雙方的父母(Ⅰ-1,2,3,4)采血備用驗(yàn)證基因變異位點(diǎn)。
圖5 C家庭咨詢者為聾啞夫妻,雙方均為家中獨(dú)子/女,無耳聾家族史
基因檢測(cè)結(jié)果(如圖6所示)發(fā)現(xiàn)男方咨詢者(Ⅱ-1)的耳聾基因是GJB2復(fù)合雜合突變(參考序列NM_004004,c.235delC雜合突變和c.299_300delAT雜合突變,突變位點(diǎn)均為已經(jīng)報(bào)道過的致病突變),女方咨詢者(Ⅱ-2)的耳聾基因是TMC1純合突變(參考序列NM_138691,c.797T>C,突變位點(diǎn)未被報(bào)道,致病屬性是臨床意義不明),筆者根據(jù)2015 ACMG遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)[13]致病變異證據(jù)標(biāo)準(zhǔn)分析為致病基因突變。GJB2基因是常染色體隱性遺傳非綜合征型耳聾1型(DFNB1)致病基因,TMC1基因是常染色體隱性遺傳非綜合征型耳聾11型(DFNB11)致病基因。咨詢者(Ⅱ-1和Ⅱ-2)配偶雙方均不攜帶彼此致病基因的任何突變位點(diǎn),同時(shí)女方咨詢者(Ⅱ-2)無耳聾相關(guān)線粒體基因突變。
綜合咨詢者雙方的基因結(jié)果,可以確認(rèn)均為常染色體隱性遺傳。由于咨詢者夫妻雙方的致病基因不同且均不攜帶對(duì)方基因的任何突變位點(diǎn),所以子代再發(fā)耳聾的風(fēng)險(xiǎn)較低,孕前指導(dǎo)建議選擇自然妊娠。隨后這對(duì)聾啞夫妻順利生產(chǎn)一名女嬰(Ⅲ-1),并順利通過聽力篩查。
圖6 咨詢者C家庭的基因檢測(cè)結(jié)果
2012年北京市實(shí)施了為全市新生兒自愿免費(fèi)開展聾病易感基因篩查,2016年北京市衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)下發(fā)了《關(guān)于規(guī)范北京市0~6歲兒童聽力與耳聾基因聯(lián)合篩查診治工作的通知》,擬于早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早干預(yù)有聽力障礙的兒童。當(dāng)耳聾基因篩查結(jié)果顯示存在突變位點(diǎn)(包括雜合突變或純合突變)時(shí),醫(yī)生需要對(duì)基因結(jié)果的臨床意義進(jìn)行正確的解析并給予適當(dāng)?shù)淖稍兘ㄗh,如圖7所示是2007年王秋菊教授提出新生兒聽力與基因聯(lián)合篩查并繪制的結(jié)果咨詢要點(diǎn)流程圖[14],其中mtDNA突變攜帶者應(yīng)對(duì)其本人及母系成員進(jìn)行用藥宣教。
圖7 新生兒聽力與基因聯(lián)合篩查并繪制的結(jié)果咨詢要點(diǎn)流程圖
在我國(guó)人群中GJB2、SLC26A4、MT-RNR1基因突變檢出率約為4%~6%[15],目前北京市多家醫(yī)院在妊娠早期孕婦中開展了聾病易感基因的篩查工作,將聾病防控關(guān)口前移至產(chǎn)前階段。對(duì)于篩查檢出攜帶突變的孕婦,建議孕婦本人及其配偶同時(shí)進(jìn)行3種常見耳聾基因的全序列檢測(cè),根據(jù)雙方的基因檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行產(chǎn)前咨詢,對(duì)于夫妻雙方攜帶有同一基因的相同或不同突變位點(diǎn)的高危攜帶家庭,耳聾發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)相對(duì)增加,產(chǎn)前診斷可有效防止聾兒出生。
隨著我國(guó)實(shí)施全面二孩政策,要求再生育的婦女?dāng)?shù)量不斷增加。對(duì)于已生育一個(gè)耳聾患兒的家庭,希望對(duì)再次妊娠的耳聾再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行評(píng)估。明確咨詢家庭的遺傳方式和致病基因是預(yù)測(cè)胎兒受累機(jī)率的基礎(chǔ),從而提供正確的指導(dǎo)建議及有效的干預(yù)策略。
圖8 生育二孩的家庭,左圖為孕期咨詢,右圖為產(chǎn)前咨詢
如圖8所示的兩個(gè)生育二孩家庭,筆者建議圖中Ⅱ-1進(jìn)行耳聾基因檢測(cè)數(shù)量覆蓋度較大的遺傳性耳聾NGS Panel檢測(cè),父母(Ⅰ-1,2)采血備用驗(yàn)證基因變異位點(diǎn)。對(duì)于基因檢測(cè)存在以下3種可能結(jié)果:
①Ⅱ-1致病基因明確,且父母親(Ⅰ-1,2)是基因突變攜帶者:圖8左側(cè)家庭,孕育二孩的聾病再現(xiàn)風(fēng)險(xiǎn)度相對(duì)較高,可采取產(chǎn)前診斷方法,或選擇PGD試管嬰兒技術(shù)進(jìn)行主動(dòng)性防控。圖8右側(cè)家庭,二孩的聾病再現(xiàn)風(fēng)險(xiǎn)已客觀存在,僅能采取產(chǎn)前診斷獲悉胎兒是否存在耳聾基因型。
②Ⅱ-1致病基因明確,但父母親(Ⅰ-1,2)均不攜帶突變位點(diǎn):是在臨床遺傳咨詢中的一類特殊案例,Ⅱ-1的基因突變位點(diǎn)屬于“新生突變”(de novo mutations,DNMs)。DNMs可能來源于親代生殖細(xì)胞的減數(shù)分裂、精卵細(xì)胞形成過程中發(fā)生的突變,也可能是在受精卵形成后發(fā)生的突變。由于二孩的聾病再現(xiàn)風(fēng)險(xiǎn)無法預(yù)測(cè),建議可選擇產(chǎn)前診斷獲悉胎兒是否存在第一個(gè)孩子的耳聾基因型。
③Ⅱ-1致病基因不明確:可能存在已知耳聾基因結(jié)構(gòu)變異或耳聾新基因的可能性,建議圖8左側(cè)家庭可進(jìn)行WES和array-CGH/SNP array。對(duì)于圖8右側(cè)產(chǎn)前咨詢家庭,給予醫(yī)生進(jìn)行致病基因分析的時(shí)間有限,無法完成進(jìn)一步病因分析,建議二孩出生后監(jiān)測(cè)聽力變化。
根據(jù)咨詢者描述的家庭成員聾病發(fā)生情況,繪制家系圖譜。選擇適當(dāng)?shù)幕驒z測(cè)方法,明確致病基因,完成遺傳學(xué)基因診斷。分析遺傳方式,估計(jì)發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)并預(yù)測(cè)其子代患病風(fēng)險(xiǎn)。提供正確的遺傳咨詢:包括根據(jù)子代可能的再現(xiàn)風(fēng)險(xiǎn)度,建議采取適當(dāng)?shù)漠a(chǎn)前診斷方法,或PGD/PGS為代表的第三代試管嬰兒。
基因檢測(cè)不等于基因診斷,對(duì)于基因檢測(cè)結(jié)果的正確解讀是聾病遺傳咨詢的關(guān)鍵問題。2015年美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(huì)(american college of medical genetics and genomics,ACMG)聯(lián)合分子病理學(xué)會(huì)(association for molecular pathology,AMP)和美國(guó)病理學(xué)家協(xié)會(huì)(college of American pathologists,CAP)修訂了序列變異解讀的標(biāo)準(zhǔn)和指南[12],建議使用特定標(biāo)準(zhǔn)術(shù)語(yǔ)描述孟德爾疾病相關(guān)的基因變異——“致病”、“可能致病”、“意義不明確”、“可能良性”和“良性”,這在一定程度上為變異位點(diǎn)準(zhǔn)確解讀提供了部分依據(jù)。
每個(gè)人基因組中都有4~5百萬個(gè)基因變異位點(diǎn),這些位點(diǎn)中有些是在正常個(gè)體和患者個(gè)體中均有的中性基因變異(neutral variants),有些才是致病變異位點(diǎn),在人與人之間只有0.1%的序列差異中,致病性變異位點(diǎn)往往是在人群中罕見的或唯一的,準(zhǔn)確和完整的臨床信息對(duì)于眾多臨床意義不明確或存在分歧的檢測(cè)結(jié)果的解讀至關(guān)重要。遺傳咨詢醫(yī)師作為解讀咨詢者基因密碼的專業(yè)人員,需要直面遺傳咨詢的患者及其家庭,直面復(fù)雜的大數(shù)據(jù)檢測(cè)結(jié)果,遺傳咨詢師除了需要懂基因,更需要懂臨床,當(dāng)基因檢測(cè)結(jié)果只是唯一的證據(jù)時(shí),需告知家庭變異致病的可能性,并制訂出一系列可被咨詢者理解和接受的精準(zhǔn)指導(dǎo)和干預(yù)措施。
隨著基因檢測(cè)和基因組解析技術(shù)的進(jìn)步,必將推動(dòng)基因檢測(cè)臨床普及化,更多的單基因病可以進(jìn)行基因診斷并用于臨床,越來越多的人也將借助基因檢測(cè)技術(shù)獲得疾病的早期篩查和診斷,并接受有效的防控干預(yù)指導(dǎo)。我們正走進(jìn)一個(gè)能夠應(yīng)用基因組檢測(cè)進(jìn)行臨床實(shí)踐的新醫(yī)學(xué)時(shí)代,大道如虹任重道遠(yuǎn)!
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