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    寧麥9號及其衍生品種(系)揉混特性的關(guān)聯(lián)分析

    2016-08-27 04:02:11張平平陳小霖馬鴻翔
    作物學(xué)報 2016年8期
    關(guān)鍵詞:寧麥面團(tuán)關(guān)聯(lián)

    姜 朋 張平平 張 旭 陳小霖 馬鴻翔

    江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 / 江蘇省農(nóng)業(yè)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 / 江蘇省現(xiàn)代作物生產(chǎn)協(xié)同創(chuàng)新中心, 江蘇南京 210014

    寧麥9號及其衍生品種(系)揉混特性的關(guān)聯(lián)分析

    姜 朋 張平平 張 旭 陳小霖 馬鴻翔*

    江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 / 江蘇省農(nóng)業(yè)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 / 江蘇省現(xiàn)代作物生產(chǎn)協(xié)同創(chuàng)新中心, 江蘇南京 210014

    揉混特性是評價面團(tuán)流變學(xué)特性的重要指標(biāo), 影響面食產(chǎn)品的品質(zhì)。寧麥 9號曾是我國長江中下游小麥生產(chǎn)中大面積應(yīng)用的優(yōu)質(zhì)軟質(zhì)小麥品種, 而且以其為親本育成了17個小麥品種。研究與寧麥9號揉混特性相關(guān)的分子標(biāo)記可為該品種在軟質(zhì)小麥品種育種中的應(yīng)用提供依據(jù)。以寧麥9號及其117個衍生品種(系)為材料, 利用覆蓋小麥全基因組的185對多態(tài)性SSR引物對其進(jìn)行基因組掃描, 并結(jié)合2009—2010和2010—2011生長季的揉混參數(shù)表型數(shù)據(jù), 應(yīng)用混合線性模型(Mixed-linear Model, MLM)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析, 發(fā)掘與其相關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記位點(diǎn)。共檢測到 13個與揉混參數(shù)相關(guān)聯(lián)的標(biāo)記位點(diǎn)(P<0.01), 表型貢獻(xiàn)率為 5.71%~12.33%。其中, 與和面時間關(guān)聯(lián)的有 3個,Xwmc594連續(xù)2年被檢測到; 與峰值高度關(guān)聯(lián)的有3個; 與峰值寬度關(guān)聯(lián)的有2個, Xgwm299連續(xù)2年被檢測到; 與8 min帶寬關(guān)聯(lián)的7個中, 4個(Xwmc11、Xbarc320、Xbarc110和Xgwm577)連續(xù)2年被檢測到。此外, Xwmc594和Xgwm577同時與和面時間、8 min帶寬相關(guān)聯(lián)。以上6個穩(wěn)定的關(guān)聯(lián)位點(diǎn)均對相應(yīng)揉混參數(shù)起負(fù)向調(diào)控作用, 其連鎖的分子標(biāo)記有望應(yīng)用于以寧麥9號為親本的軟質(zhì)小麥遺傳改良。

    小麥; 揉混參數(shù); 關(guān)聯(lián)分析; 分子標(biāo)記

    面團(tuán)流變學(xué)特性是小麥的重要品質(zhì)指標(biāo), 它決定著小麥及其烘焙、蒸煮食品等最終產(chǎn)品的加工品質(zhì)。目前用于面團(tuán)流變學(xué)特性測定的儀器主要有粉質(zhì)儀、拉伸儀和揉混儀等。粉質(zhì)儀和拉伸儀所需面粉量通常超過 100 g, 且單個樣品測定時間較長[1],在育種世代中面對大量樣品時難以應(yīng)用; 而揉混儀樣品需要量少, 測定時間相對較短, 與粉質(zhì)儀、拉伸儀測定的主要參數(shù)間存在極顯著相關(guān)性[2-3], 而且與實(shí)際烘焙的揉混時間有較高的相關(guān)性[4], 目前已在國內(nèi)外小麥育種中廣泛應(yīng)用。

    面團(tuán)流變學(xué)特性受多基因調(diào)控, 研究其遺傳機(jī)制對優(yōu)質(zhì)專用小麥品質(zhì)育種具重要意義。隨著分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展, 近20年來對小麥產(chǎn)量、抗性和品質(zhì)等多個數(shù)量性狀進(jìn)行了QTL定位研究, 獲得了與其連鎖的分子標(biāo)記, 進(jìn)而應(yīng)用于分子標(biāo)記輔助育種。由于小麥面團(tuán)品質(zhì)分析需要專用儀器, 而且需要合適的遺傳群體, 測試工作量大, 國內(nèi)外圍繞小麥品質(zhì)指標(biāo)對面團(tuán)揉混特性的影響及品質(zhì)性狀間的相關(guān)性開展了廣泛研究[4-5], 而對揉混特性的 QTL定位則遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于對其他品質(zhì)性狀或產(chǎn)量和抗病性狀的研究。James等[6]利用人工合成小麥與普通小麥雜交產(chǎn)生的 114個重組自交系(recombinant inbred line, RIL)群體, 在1A、1B、3A、4D染色體上檢測到峰值高度、峰值寬度等揉混參數(shù)的 12個 QTL;Morgan等[7]利用 163個RIL群體在1B、1D等 12條染色體上檢測到31個揉混參數(shù)相關(guān)QTL, 其中有10個位點(diǎn)的貢獻(xiàn)率超過10%; Li等[8]利用82個導(dǎo)入系在1A、1B等13條染色體檢測到控制峰值寬度、8 min帶寬等品質(zhì)參數(shù)的QTL。然而, 利用關(guān)聯(lián)分析發(fā)掘揉混參數(shù)相關(guān)分子標(biāo)記的研究報道則較少。

    關(guān)聯(lián)分析是以連鎖不平衡為基礎(chǔ)鑒定群體內(nèi)性狀與遺傳標(biāo)記關(guān)系的分析方法, 在小麥[9]、玉米[10]、水稻[11]等作物上廣泛應(yīng)用, 亦有很多小麥品質(zhì)性狀相關(guān)分子標(biāo)記的報道。Bordes等[12]利用372份來自世界各地的小麥材料及803個分子標(biāo)記, 在15條染色體上檢測到14個與籽粒蛋白質(zhì)含量相關(guān)的分子標(biāo)記; Jin等[13]以90個黃淮麥區(qū)主要小麥品種為材料,利用1372個DArT標(biāo)記對其不溶性蛋白含量的關(guān)聯(lián)分析, 得到10個較穩(wěn)定的關(guān)聯(lián)標(biāo)記; 張勇等[14]利用混合線性模型(mixed-linear model, MLM)對不同硬度類型的176份小麥品種的4種溶劑保持力的關(guān)聯(lián)分析, 共獲得28個關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。在此基礎(chǔ)上, 張學(xué)勇等[15]提出通過牽連效應(yīng)和關(guān)聯(lián)分析相結(jié)合尋找一些骨干親本或主推品種重要染色體區(qū)段的方法。

    寧麥 9號是江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院選育的國內(nèi)首個弱筋品質(zhì)優(yōu)良的軟質(zhì)小麥品種, 不僅在小麥生產(chǎn)上得到了大面積應(yīng)用, 而且以其為親本直接育成了 17個通過國家或省審定的小麥品種。本研究以關(guān)聯(lián)分析發(fā)掘揉混參數(shù)相關(guān)的分子標(biāo)記, 為更好地利用寧麥9號這一優(yōu)異種質(zhì)提供依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 供試材料及其表型測定

    以寧麥9號及其117個衍生品種(系)為試驗(yàn)材料,其中衍生一代 39份, 衍生二代 78份[16]。2009—2010、2010—2011連續(xù)2個生長季, 將供試材料種植于江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院試驗(yàn)基地, 3行小區(qū), 常規(guī)田間管理。2010年和2011年分別收獲種子, 晾干后用Buh ler 202磨粉機(jī)(德國)磨粉。利用National Mixogr aph揉混儀(美國), 按照AACC 54-40方法測定和面時間(mix time, MT)、峰值高度(peak height, PH)、峰值寬度(peak width, PW)、8 min帶寬(eight-minute width, 8MW)等揉混參數(shù)。

    1.2 SSR標(biāo)記檢測

    選取每個品種幼嫩的葉片 5~6 cm, 采用 SDS-酚法提取DNA[17]。依據(jù)Somers等[18]的遺傳連鎖圖選擇SSR標(biāo)記, 共篩選到覆蓋全基因組的185對多態(tài)性SSR引物, 每條染色體5~14對, 平均8.8對。PCR反應(yīng)體系為 10 μL, 包含 10× buffer 1 μL、15 mmol L-1MgCl20.6 μL、2 mmol L-1dNTP 0.8 μL、20 ng μL-1引物1 μL、0.1 μL Taq酶、20 ng μL-1模板DNA 3 μL、去離子水3.5 μL。PCR擴(kuò)增程序?yàn)?4 ℃預(yù)變性5 min; 94℃變性45 s, 50~60℃ (依引物而定)退火 45 s, 72℃延伸 90 s, 36個循環(huán); 72℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測。在相同位點(diǎn)上, 有帶記為1, 無帶記為0, 缺失記為9。

    1.3 表型數(shù)據(jù)分析

    用Microsoft Excel 2007對表型數(shù)據(jù)進(jìn)行初步統(tǒng)計及相關(guān)分析; 利用 SPSS 19.0對表型數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析及多重比較(S-N-K法)。

    1.4 關(guān)聯(lián)分析

    在Structure V. 2.3.4軟件中進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析[19],參數(shù)iterations為10 000, burn-in period為100 000, K值取1~8, 每個K值單獨(dú)運(yùn)行5次, 根據(jù)Evanno等[20]的方法確定群體個數(shù)。用TASSEL 3.0軟件的MLM程序完成目標(biāo)性狀的關(guān)聯(lián)分析[21], 并估算各標(biāo)記效應(yīng), 當(dāng)P < 0.01時認(rèn)為該標(biāo)記與目標(biāo)性狀相關(guān)聯(lián)。以關(guān)聯(lián)標(biāo)記基因型為依據(jù), 將供試材料分為寧麥 9號基因型與非寧麥9號基因型兩組, 利用SPSS 19.0進(jìn)行關(guān)聯(lián)標(biāo)記的顯著性檢驗(yàn)(t檢驗(yàn))。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 寧麥9號及其衍生系的揉混參數(shù)的表型分析

    寧麥9號衍生品種(系)MT、PH和PW的平均值低于寧麥9號, 而8MW則高于寧麥9號; MT、PH、PW和8MW在衍生品種(系)中均呈現(xiàn)較大變異, 變異系數(shù)為 10.21%~48.99%, 連續(xù)兩年表型變異系數(shù)均為MT>8MW>PW>PH。多重比較結(jié)果顯示, 各揉混參數(shù)世代間差異不顯著, 就各世代數(shù)值來看, MT兩年均為寧麥9號>衍生一代>衍生二代, PH均為寧麥9號>衍生二代>衍生一代, PW與8MW年度間變化趨勢則存在差異(表1)。綜合看來, 衍生一代品種(系)的弱筋特性表現(xiàn)更為突出。方差分析結(jié)果表明,MT、PH、PW和8MW基因型間差異極顯著, PH、PW年份間也存在極顯著差異。

    2.2 不同揉混參數(shù)的相關(guān)分析

    不同性狀間相關(guān)性在兩年中表現(xiàn)一致, 說明這些性狀具有較好的遺傳穩(wěn)定性。其中MT與PW呈極顯著負(fù)相關(guān), PH、PW、8MW三者間存在極顯著正相關(guān)(表2)。

    2.3 寧麥9號及其衍生系的群體結(jié)構(gòu)分析

    利用分子標(biāo)記數(shù)據(jù)進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析, 當(dāng) K = 2時, ΔK具有最大值, 暗示本研究群體可分為2個亞群(圖1)。群體結(jié)構(gòu)具有顯著的世代特點(diǎn), 衍生一代品種(系)組成一個亞群, 另一個亞群主要為衍生二代。

    表1 寧麥 9 號及其衍生系揉混參數(shù)的方差分析Table 1 Analysis of varience in mixograph parameters of Ningmai 9 and its derivatives

    表2 寧麥9號及其衍生系揉混參數(shù)的相關(guān)系數(shù)Table 2 Correlation coefficients of mixograph parameters in Ningmai 9 and its d erivatives

    圖1 寧麥9號及其衍生品種(系)的群體結(jié)構(gòu)Fig. 1 Population structure of Ningmai 9 and its derivatives

    2.4 揉混參數(shù)的關(guān)聯(lián)分析

    在9條染色體上共檢測到13個與揉混參數(shù)相關(guān)的標(biāo)記(P<0.01), 單個標(biāo)記表型貢獻(xiàn)率為 5.71%~12.33%, 多數(shù)標(biāo)記對其關(guān)聯(lián)性狀有負(fù)向調(diào)控作用。其中, 與MT關(guān)聯(lián)的有3個, Xwmc594連續(xù)2年被檢測到; 與PH關(guān)聯(lián)的有3個; 與PW關(guān)聯(lián)的有2個,Xgwm299連續(xù)兩年均被檢測到; 與8MW關(guān)聯(lián)的有7個, Xwmc11、Xbarc320、Xbarc110和 Xgwm577連續(xù)2年被檢測到; 此外, Xwmc594和Xgwm577同時與MT、8MW相關(guān)聯(lián)(表3)。這6個穩(wěn)定關(guān)聯(lián)的標(biāo)記在全部材料中的頻率為48.28%~92.31%, 攜帶寧麥9號等位變異的品系, 其表型均值顯著低于攜帶非寧麥9號等位變異的品系(表4); 除Xbarc110和Xgwm5 77外, 其他4個標(biāo)記在衍生一代中的頻率均低于在衍生二代中(表5)。

    表3 寧麥9號及其衍生系中與揉混參數(shù)相關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記Table 3 Molecular markers associated with mixograph parameters in Ningmai 9 and its derivatives

    3 討論

    面團(tuán)流變學(xué)特性可用粉質(zhì)儀、拉伸儀或揉混儀測定, 3種測定方法各有特點(diǎn)[22-25]。揉混參數(shù)主要反映面團(tuán)塑性、彈性、黏性以及抗揉混能力, 其中MT 和8MW為面團(tuán)蛋白質(zhì)質(zhì)量參數(shù), 其值越大, 面筋的強(qiáng)度就越大, 抗揉混能力也越強(qiáng), 8MW同時是面團(tuán)黏度指標(biāo), 其帶越寬表示黏度越?。?PH為面團(tuán)蛋白質(zhì)數(shù)量指標(biāo), 其值越大, 蛋白質(zhì)含量就越高; 而 PW表示面筋彈性, 其值越大表明面筋彈性越強(qiáng)[3]。劉艷玲等[2]研究認(rèn)為, 揉混儀的MT和8MW與粉質(zhì)儀面團(tuán)穩(wěn)定時間和質(zhì)量指數(shù)、拉伸儀的拉伸面積、最大抗拉伸阻力等參數(shù)呈極顯著正相關(guān), 由于揉混儀測定面粉量少, 實(shí)驗(yàn)時間短, 可用揉混特性預(yù)測加工品質(zhì)。在本研究中, 寧麥 9號衍生后代各揉混參數(shù)均有較好表現(xiàn), 特別是衍生一代, 除8MW外的各參數(shù)均值都低于寧麥 9號; 關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)的幾個重要關(guān)聯(lián)位點(diǎn)均對相應(yīng)性狀有負(fù)調(diào)控作用, 其中Xwmc594在衍生二代的分布頻率明顯高于在衍生一代中, 可能是衍生二代 MT顯著低于衍生一代的主要原因; Xbarc110和Xgwm577在衍生一代分布頻率明顯高于衍生二代, 可能是衍生一代 8MW 顯著低于衍生二代的重要因素。

    表4 揉混參數(shù)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的表型均值及寧麥9號與非寧麥9號基因型間的t-檢驗(yàn)結(jié)果Table 4 Means of mixograph parameters on associated loci and t-test between Ningmai 9 and non-Ningmai 9 genotypes

    表5 揉混參數(shù)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)在寧麥9號衍生世代中的分布頻率Table 5 Frequencies of markers associated with mixograph parameters in Ningmai 9 derived generations (%)

    骨干親本對育種工作具有極其重要的意義, 其本身多是相關(guān)麥區(qū)的主推品種, 優(yōu)良性狀多, 一般配合力高[26]。寧麥9號是江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院選育的弱筋專用軟質(zhì)小麥品種, 具有高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)和廣泛的適應(yīng)性及抗小麥黃花葉病、赤霉病等特點(diǎn), 近年來已成為江蘇淮南麥區(qū)小麥育種的重要親本, 以其為親本已經(jīng)直接育成17個小麥新品種, 具有成為新一代骨干親本的潛力。研究表明, 寧麥9號在穗粒數(shù)、單穗粒重、收獲指數(shù)等產(chǎn)量性狀, 赤霉病、梭條花葉病抗性等抗病性狀及籽粒硬度、蛋白質(zhì)含量、面筋強(qiáng)度、堿水保持力等軟質(zhì)小麥品質(zhì)相關(guān)性狀方面一般配合力最好, 在小麥育種中具有較高利用價值[27-32]。117個寧麥9號衍生品種(系)與寧麥9號遺傳相似性分析結(jié)果顯示, 這些衍生品種(系)遺傳背景一半以上來自寧麥9號[16], 本研究得到的關(guān)聯(lián)位點(diǎn)除Xbarc110外, 在全部材料中的分布頻率均超 50%, 最高達(dá)92.31%, 表明在育種過程中, 這些位點(diǎn)被寧麥 9號基因強(qiáng)烈選擇。

    本研究共檢測到13個分子標(biāo)記位點(diǎn)與揉混參數(shù)相關(guān)性狀關(guān)聯(lián), 其中位于3A的Xwmc594連續(xù)兩年均與MT關(guān)聯(lián), 與Li等[8]發(fā)現(xiàn)的PH和8MW性狀QTL位置相近; 在3A上還連續(xù)兩年檢測到與8MW相關(guān)聯(lián)的Xwmc11, 但與報道的QTL[8]距離較遠(yuǎn); 在1D上的 8MW 關(guān)聯(lián)標(biāo)記 Xcfd72, 與其報道的控制8MW的QTL[8]亦有較大遺傳距離; McCartney等[33]在2B上發(fā)現(xiàn)控制PW的QTL, 該位點(diǎn)與本研究檢測到的PH關(guān)聯(lián)標(biāo)記Xwmc154相鄰。此外, 在2D、3B、6A、7B等染色體上均報道過揉混性狀 QTL[8,34-36],但這些位點(diǎn)均與本研究發(fā)現(xiàn)的關(guān)聯(lián)標(biāo)記距離較遠(yuǎn)。由于試驗(yàn)材料及作圖群體不同, 構(gòu)建的遺傳圖譜分子標(biāo)記位置可能存在較大差異, 因此不能確定本研究發(fā)現(xiàn)的關(guān)聯(lián)標(biāo)記與已報道的QTL間的關(guān)系。綜合前人研究結(jié)果, 我們認(rèn)為, 除 Xwmc594外的其他 5個較穩(wěn)定的關(guān)聯(lián)標(biāo)記附近區(qū)段, 同時還是產(chǎn)量、品質(zhì)、抗病等重要性狀相關(guān)QTL的熱點(diǎn)區(qū)域。據(jù)報道,Xgwm299附近區(qū)段存在莖腐?。?7-38]和條銹?。?9]抗性位點(diǎn), 還與耐鹽性有關(guān)[40]; Xwmc11與赤霉病抗性[41]及籽粒容重相關(guān)[42]; Xbarc320與沉降值相關(guān)聯(lián)[43];Xbarc110附近區(qū)段檢測到葉枯?。?4]、株高、穗密度[45]、抗旱性[46]等性狀的QTL; Xgwm577與抽穗期[47]、面包體積[48]、千粒重[49]、葉枯?。?0]、條銹病抗性[51]等性狀相關(guān)。因此, 為更好地在分子標(biāo)記輔助選擇育種中應(yīng)用, 尚需采用更多標(biāo)記對揉混參數(shù)進(jìn)行精細(xì)定位以獲得更加緊密的分子標(biāo)記。

    4 結(jié)論

    揉混參數(shù)在寧麥 9號衍生品種(系)中呈現(xiàn)較大變異, 基因型間差異極顯著。檢測到6個在年度間穩(wěn)定出現(xiàn)的揉混參數(shù)關(guān)聯(lián)位點(diǎn), 均對目標(biāo)性狀起負(fù)向調(diào)控作用, 可以提高軟麥品質(zhì)。這些標(biāo)記可應(yīng)用于軟質(zhì)小麥弱筋品質(zhì)分子標(biāo)記輔助選擇育種。

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    Association Analysis for Mixograph Properties in Ningmai 9 and Its Derivatives

    JIANG Peng, ZHANG Ping-Ping, ZHANG Xu, CHEN Xiao-Lin, and MA Hong-Xiang*
    Jiangsu Academy of Agricultural Sciences / Jiangsu Provincial Key Laboratory for Agrobiology / Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production, Nanjing 210014, China

    Mixograph property is one of the rheological properties affecting the quality of end-use products in wheat. Ningmai 9 is a soft wheat cultivar planted largely in the middle and lower reaches of Yangtze River and served as a main parent of 17 released wheat cultivars. For the purpose of utilizing Ningmai 9 in molecular marker-assisted selection, 185 polymorphic SSR markers associated with mixograph properties were tested in Ningmai 9 and its 117 derivatives. The mixed-linear model (MLM) was used in combination of phenotypic data collected in the 2009-2010 and 2010-2011 growing seasons. A total of 13 SSRs were identified to be significantly associated with mixograph properties (P < 0.01), explaining 5.71-12.33% of phenotypic variations. Among the 13 markers, three, three, two, and seven were associated with mix time (MT), peak height (PH), peak width (PW), eight-minute width (8MW), respectively. Markers Xwmc11, Xbarc320, Xbarc110, and Xgwm577 for 8MW, Xwmc594 for MT, and Xgwm299 for PW were identified over two years. Besides, Xwmc594 and Xgwm577 were associated with both (MT) and 8MW. The six markers identified over two years all negatively affected mixograph parameters in Ningmai 9 background and might be used in soft wheat breeding.

    Wheat; Mixograph parameters; Association analysis; Molecular markers

    10.3724/SP.J.1006.2016.01168

    本研究由國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(CARS-3), 江蘇省農(nóng)業(yè)自主創(chuàng)新資金項(xiàng)目(CX14-2002)和江蘇省科技支撐計劃項(xiàng)目(BE2013439, BE2015352)資助。
    This study was supported by China Agriculture Research System (CARS-3), Jiangsu Provincial Fund for Independent Innovation in Agricultural Sciences (CX14-2002), and Jiangsu Science & Technology Pillar Program (BE2013439, BE2015352).
    *

    (Corresponding author): 馬鴻翔, E-mail: hxma@jaas.ac.cn

    聯(lián)系方式: E-mail: hmjp2005@163.com
    Received(

    ): 2015-11-17; Accepted(接受日期): 2016-03-14; Published online(網(wǎng)絡(luò)出版日期): 2016-05-09.
    URL: http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20160509.0955.002.html

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