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      細(xì)菌小RNA抗?fàn)I養(yǎng)應(yīng)激調(diào)控功能的研究進(jìn)展

      2016-04-11 21:17:39付竹青喻云梅溫小軍袁偉曦趙祖國(guó)
      生物技術(shù)通報(bào) 2016年3期
      關(guān)鍵詞:磷酸葡萄糖氨基酸

      付竹青喻云梅溫小軍袁偉曦趙祖國(guó)

      (1. 廣東醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)與免疫學(xué)教研室,湛江 524023;2. 解放軍第422中心醫(yī)院,湛江 524023;3. 廣東醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院肝膽外科,湛江 524023)

      細(xì)菌小RNA抗?fàn)I養(yǎng)應(yīng)激調(diào)控功能的研究進(jìn)展

      付竹青1喻云梅2溫小軍3袁偉曦1趙祖國(guó)1

      (1. 廣東醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)與免疫學(xué)教研室,湛江 524023;2. 解放軍第422中心醫(yī)院,湛江 524023;3. 廣東醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院肝膽外科,湛江 524023)

      細(xì)菌生存的環(huán)境復(fù)雜多變,經(jīng)常處于營(yíng)養(yǎng)元素過(guò)?;蛉狈Φ臓顟B(tài)。因此,細(xì)菌必須及時(shí)準(zhǔn)確地調(diào)節(jié)其基因表達(dá)以適應(yīng)不斷變化的營(yíng)養(yǎng)環(huán)境,才能得以生存。小RNA(small RNA,sRNA)是近年來(lái)在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的一類RNA調(diào)控子,在細(xì)菌應(yīng)對(duì)營(yíng)養(yǎng)應(yīng)激的基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮重要作用。就細(xì)菌sRNA的特點(diǎn)及其抗?fàn)I養(yǎng)應(yīng)激的作用進(jìn)行綜述。

      細(xì)菌小RNA;調(diào)控網(wǎng)絡(luò);營(yíng)養(yǎng)應(yīng)激

      細(xì)菌生存的營(yíng)養(yǎng)環(huán)境不斷變化,經(jīng)常被迫處于各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)應(yīng)激中。細(xì)菌在生長(zhǎng)過(guò)程中代謝物質(zhì)的累積和營(yíng)養(yǎng)元素含量的變化都能引起應(yīng)激反應(yīng)。例如,磷酸葡萄糖糖應(yīng)激、鐵應(yīng)激、氨基酸應(yīng)激等。為了應(yīng)對(duì)這些應(yīng)激環(huán)境,細(xì)菌必須通過(guò)精細(xì)的調(diào)控系統(tǒng)來(lái)調(diào)節(jié)營(yíng)養(yǎng)的吸收及代謝。以往的研究多關(guān)注蛋白質(zhì)水平的基因表達(dá)調(diào)控,然而近年來(lái)越來(lái)越多的研究表明sRNA對(duì)細(xì)菌的生長(zhǎng)繁殖、快速適應(yīng)外界環(huán)境變化及調(diào)節(jié)營(yíng)養(yǎng)代謝起著重要的作用[1-3]。sRNA可作用于多個(gè)靶點(diǎn),而且sRNA無(wú)需翻譯成蛋白質(zhì),在RNA水平即可發(fā)揮作用,再加上RNA的半衰期短,因此sRNA通常能夠更精確、迅速地調(diào)節(jié)多種基因的表達(dá),比蛋白質(zhì)水平的基因調(diào)控更具有優(yōu)勢(shì)。所以,生物體內(nèi)的sRNA的鑒定及其調(diào)控機(jī)制的研究已成為新的研究熱點(diǎn)。

      細(xì)菌sRNA是一類非編碼RNA,廣泛存在于真核和原核生物中,在細(xì)胞生長(zhǎng)繁殖過(guò)程中發(fā)揮著重要的生物學(xué)功能。細(xì)菌sRNA有以下特點(diǎn):(1)長(zhǎng)度多為50-500 nt。(2)多位于編碼基因間隔區(qū),少數(shù)位于mRNA 的5'或3'非編碼區(qū)域(non-codingregion,NCR)。(3)穩(wěn)定性多依賴于RNA分子伴侶蛋白Hfq(a host factor for RNA phage QP)。(4)轉(zhuǎn)錄通常開(kāi)始于一段能折疊成穩(wěn)定莖環(huán)結(jié)構(gòu)的序列,終止于Rho非依賴轉(zhuǎn)錄終止因子;由于莖環(huán)結(jié)構(gòu)有助于穩(wěn)定整個(gè)RNA分子的結(jié)構(gòu),因此大多數(shù)sRNA明顯比mRNA穩(wěn)定。(5)一個(gè)sRNA可調(diào)控一個(gè)或多個(gè)靶點(diǎn),一個(gè)靶點(diǎn)也可受到多個(gè)sRNA的調(diào)控。(6)細(xì)菌sRNA主要由細(xì)菌染色體編碼,少部分源于質(zhì)粒、噬菌體或轉(zhuǎn)座子[4]。

      1 sRNA的分類

      隨著生物信息學(xué)技術(shù)和實(shí)驗(yàn)方法的迅速發(fā)展,迄今發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌sRNA已超過(guò)200個(gè),其中來(lái)自大腸桿菌的sRNA就超過(guò)100種。在其他細(xì)菌中也發(fā)現(xiàn)一些sRNA,如枯草芽孢桿菌、霍亂弧菌、銅綠假單胞菌、葡萄球菌和單核細(xì)胞增生性李斯特菌等。根據(jù)sRNA作用機(jī)制及生物學(xué)功能不同,目前可以把細(xì)菌sRNA分為5種類型。

      1.1 行使管家功能的sRNA

      這類sRNA本身具有酶活性或者作為核糖核蛋白的組成部分發(fā)揮功能,此類sRNA是細(xì)菌生命活動(dòng)所必需的,其表達(dá)水平相對(duì)較高。目前至少發(fā)現(xiàn)3種該類型的sRNA,包括具有酶催化活性并形成RNaseP的催化亞單位M1RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)信使(transfer messenger RNA,tmRNA)及組成核糖核蛋白復(fù)合物的4.5S RNA[5,6]。

      1.2 反式編碼sRNA

      目前已發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌sRNA大部分屬于此類,也是研究得最清楚的一類sRNA。此類sRNA能與靶mRNA通過(guò)不完全堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合,阻斷mRNA與核糖體結(jié)合進(jìn)而阻斷翻譯過(guò)程來(lái)抑制靶基因的表達(dá)[7]。少數(shù)反式編碼sRNA與靶mRNA結(jié)合后,可通過(guò)RNase E 降解 mRNA 而降低靶基因的表達(dá)水平[8]。其大部分需要通過(guò)與RNA伴侶Hfq結(jié)合而發(fā)揮作用[9]。這類sRNA通常參與細(xì)菌的代謝和環(huán)境應(yīng)激調(diào)控。

      1.3 順式編碼sRNA

      順式編碼sRNA由靶基因的反義鏈編碼,這種sRNA能與靶mRNA完全互補(bǔ)配對(duì),通過(guò)促進(jìn)轉(zhuǎn)錄衰減、抑制翻譯、促進(jìn)靶基因降解來(lái)發(fā)揮調(diào)控功能[10]。多數(shù)順式編碼sRNA來(lái)自于質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座元件或噬菌體[11],近年來(lái)細(xì)菌染色體來(lái)源的sRNA也逐漸被發(fā)現(xiàn)[12]。例如,許多染色體順式編碼sRNA能夠調(diào)節(jié)對(duì)細(xì)胞有毒性的小疏水性蛋白的表達(dá),被認(rèn)為是抗毒因子[13]。

      通過(guò)中國(guó)知網(wǎng),南京體育學(xué)院圖書(shū)館及網(wǎng)絡(luò)搜索查閱了有關(guān)定向運(yùn)動(dòng)、高校運(yùn)動(dòng)和可持續(xù)發(fā)展方面的文獻(xiàn)、書(shū)籍及文件,基本掌握了普通高校開(kāi)展定向運(yùn)動(dòng)的現(xiàn)狀和可持續(xù)發(fā)展的基本特征,為本課題研究的順利進(jìn)行提供了基礎(chǔ)。

      1.4 蛋白質(zhì)結(jié)合sRNA

      這類 sRNA通過(guò)與蛋白質(zhì)相互作用來(lái)調(diào)節(jié)靶蛋白生物活性。目前研究比較透徹的有CsrB、CsrC、GlmY和6S RNA[14]。例如,CsrB和CsrC sRNA與全局轉(zhuǎn)錄后調(diào)控因子CsrA蛋白相互作用抑制CsrA活性,競(jìng)爭(zhēng)性使CsrA與靶mRNA 5'UTR(untranslated regions)結(jié)合減少,從而影響下游基因的表達(dá)。

      1.5 核糖開(kāi)關(guān)

      核糖開(kāi)關(guān)是一類非編碼RNA,多數(shù)位于mRNA的 5'UTR 區(qū),主要由適體平臺(tái)(aptamer platform)和表達(dá)平臺(tái)(expression platform)兩部分組成。它能通過(guò)感知小分子代謝物濃度的變化在轉(zhuǎn)錄和翻譯兩種水平上調(diào)控基因的表達(dá)。在轉(zhuǎn)錄水平上,配體結(jié)合適體平臺(tái)后,表達(dá)平臺(tái)構(gòu)象改變,促使或擾亂表達(dá)平臺(tái)中內(nèi)源性終止子的形成,導(dǎo)致下游基因轉(zhuǎn)錄提前終止或繼續(xù)延伸;在翻譯水平上,配體與適體結(jié)合,改變核糖體結(jié)合位點(diǎn)處核酸序列的二級(jí)結(jié)構(gòu),這種二級(jí)結(jié)構(gòu)暴露或者隱藏 SD 序列從而改變核糖體的結(jié)合狀態(tài),進(jìn)而激活或者終止翻譯的進(jìn)行[15]。

      2 sRNA抗?fàn)I養(yǎng)應(yīng)激的作用

      2.1 在鐵應(yīng)激中的作用

      鐵是細(xì)菌生命活動(dòng)所必需的營(yíng)養(yǎng)元素,含量過(guò)低會(huì)影響細(xì)菌的正常代謝,含量過(guò)高則會(huì)對(duì)細(xì)菌產(chǎn)生毒害作用,因此細(xì)菌必須及時(shí)調(diào)節(jié)菌體內(nèi)的鐵離子濃度。大部分細(xì)菌鐵的吸收和利用受到負(fù)調(diào)控因子鐵吸收調(diào)控蛋白Fur(ferric uptake regulator)的調(diào)控。當(dāng)環(huán)境中鐵豐富時(shí),F(xiàn)ur與Fe2+結(jié)合,F(xiàn)ur蛋白被激活,直接抑制一系列與鐵吸收有關(guān)蛋白的表達(dá),減少細(xì)菌對(duì)鐵的攝入量;同時(shí)激活一系列儲(chǔ)鐵蛋白和非必需鐵硫蛋白基因的表達(dá),增加體內(nèi)對(duì)鐵的儲(chǔ)存和利用,防止過(guò)量鐵對(duì)細(xì)胞毒害作用[16]。

      長(zhǎng)期困惑人們的問(wèn)題是,負(fù)調(diào)控因子Fur是如何調(diào)控上述基因的表達(dá)。隨著小RNA調(diào)節(jié)子RyhB的發(fā)現(xiàn)和深入研究,這個(gè)問(wèn)題得到了解釋:RyhB是一類長(zhǎng)度為90 nt的小RNA,它通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)與鐵儲(chǔ)存蛋白(如Bfr)和非必需的鐵硫蛋白(如超氧化物歧化酶sodB,sdhCDAB操縱子等)的mRNA在核糖體結(jié)合位點(diǎn)附近結(jié)合,降低靶mRNA穩(wěn)定性及翻譯效率,減少體內(nèi)鐵的儲(chǔ)存和利用[17]。當(dāng)環(huán)境鐵剩余時(shí),F(xiàn)ur與Fe2+結(jié)合并被活化,直接抑制參與鐵吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)的基因表達(dá),減少細(xì)菌對(duì)鐵的攝入量;與此同時(shí),活化后的Fur結(jié)合到RyhB啟動(dòng)子上,RyhB的表達(dá)受到抑制,細(xì)菌體內(nèi)編碼鐵儲(chǔ)存蛋白和鐵硫蛋白的基因得到表達(dá),消耗利用鐵離子,將細(xì)胞內(nèi)鐵濃度維持在一個(gè)正常的水平。當(dāng)環(huán)境鐵不足時(shí),F(xiàn)e2+與Fur分離,F(xiàn)ur處于失活狀態(tài),直接促進(jìn)鐵的吸收和轉(zhuǎn)運(yùn),增加細(xì)菌對(duì)鐵的攝入量,與此同時(shí),RyhB表達(dá)量增加,抑制鐵儲(chǔ)存蛋白和鐵硫蛋白的合成,減少體內(nèi)對(duì)鐵的消耗和儲(chǔ)存[18]。負(fù)調(diào)控因子 Fur在RyhB的幫助下,將細(xì)胞內(nèi)的鐵離子濃度維持在一個(gè)恒定的范圍,保證了細(xì)菌生命活動(dòng)的正常進(jìn)行。有研究表明,當(dāng)ryhB 基因缺失后,細(xì)菌不能在鐵缺乏的環(huán)境下生存[19]。

      此外,在其他菌屬中也陸續(xù)發(fā)現(xiàn)與RyhB功能類似的sRNA,如銅綠假單胞菌中的PrrF1、PrrF2和PrrF[20],芽孢桿菌FsrA[21],腦膜炎奈瑟氏菌NrrF[22]。

      2.2 在糖應(yīng)激中的作用

      許多細(xì)菌都是通過(guò)磷酸烯醇丙酮酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)(phosphoenolpyruvate phosphotransferase system,PTS)吸收葡萄糖[23,24]。在吸收葡萄糖的過(guò)程中伴隨產(chǎn)生大量的磷酸葡萄糖或磷酸葡萄糖代謝物(如G-6-P、αMG-6-P、2DG-6-P等)。然而磷酸葡萄糖在細(xì)胞內(nèi)累積會(huì)使細(xì)胞受損,即磷酸葡萄糖應(yīng)激。Aiba等[25]發(fā)現(xiàn),大腸桿菌在這種應(yīng)激條件下,大部分編碼葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)子基因ptsG的 mRNA發(fā)生降解,從而減少對(duì)葡萄糖的吸收,降低G-6-P水平。有意思的是,這種調(diào)控作用需要Hfq參與,這提示可能有sRNA參與。通過(guò)Hfq共免疫沉淀方法發(fā)現(xiàn)了這種調(diào)節(jié)磷酸葡萄糖應(yīng)激的sRNA-SgrS。誘導(dǎo)表達(dá)的SgrS能引起ptsG mRNA快速降解,反之,敲除sgrS基因能遏制由磷酸葡萄糖應(yīng)激引起的ptsG的下調(diào)[26]。

      SgrS是一個(gè)大小為 227 nt的反式編碼小 RNA,在磷酸葡萄糖應(yīng)激中發(fā)揮重要的調(diào)控功能。SgrS 能負(fù)向調(diào)控?cái)?shù)種靶mRNA的表達(dá),其中研究最多的是ptsG mRNA,其能編碼葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)子IICBGlc。SgrS 3'端有6 nt與ptsG mRNA 互補(bǔ)配對(duì),其中包含部分SD序列[27]。這樣,SgrS 阻止ptsG mRNA與核糖體結(jié)合,并能同時(shí)使ptsG mRNA 被Hfq蛋白與 RNaseE形成的降解復(fù)合體所降解,從而進(jìn)一步阻止新的IICBGlc合成,最終降低體內(nèi)磷酸葡萄糖的水平,減弱對(duì)細(xì)胞的損傷[28]。與此同時(shí),SgrS 5'端還能編碼一段小肽SgrT,抑制IICBGlc的活性,阻止磷酸葡萄糖的進(jìn)一步增加[29]。值得一提的是sRNA在降解靶mRNA的同時(shí),其自身也降解。這樣當(dāng)細(xì)胞內(nèi)磷酸葡萄糖恢復(fù)正常生長(zhǎng)狀態(tài)時(shí),SgrS的水平也隨之降低,其負(fù)調(diào)節(jié)pstG mRNA的功能也終止。

      最近研究發(fā)現(xiàn),SgrS也在轉(zhuǎn)錄后水平上負(fù)向調(diào)控manXYZ mRNA的表達(dá),后者編碼PTS轉(zhuǎn)運(yùn)子EIIABCDMan[30,31]。EIIABCDMan能轉(zhuǎn)運(yùn)多種糖分子到菌體內(nèi),如甘露糖、葡萄糖、甲基葡萄糖和脫氧葡萄糖。與SgrS調(diào)控ptsG 翻譯機(jī)制相比,SgrS對(duì)manXYZ mRNA的調(diào)控機(jī)制顯得稍復(fù)雜。manXYZ mRNA上有兩個(gè)獨(dú)立的SgrS結(jié)合位點(diǎn):第一個(gè)結(jié)合位點(diǎn)位于manX起始編碼子下游20-30 nt,SgrS與其堿基配對(duì)結(jié)合后可抑制manX的翻譯,但是不能抑制manY或manZ的翻譯;第二個(gè)結(jié)合位點(diǎn)在manX-manY基因間隔區(qū),SgrS與之結(jié)合后能進(jìn)一步抑制manY和manZ翻譯。SgrS同時(shí)結(jié)合這兩個(gè)位點(diǎn)后才能誘導(dǎo)manXYZ降解[32],阻止合成新的EIIABCDMan,從而阻止磷酸葡萄糖在菌體中進(jìn)一步累積。

      2.3 在碳源應(yīng)激中作用

      碳是細(xì)菌生長(zhǎng)必需的元素,是蛋白質(zhì)、核酸、脂類和酶類及菌體結(jié)構(gòu)的重要原料,同時(shí)又能為細(xì)菌提供能量。碳存儲(chǔ)調(diào)控因子A(CsrA)由 61 個(gè)氨基酸殘基組成的小分子翻譯調(diào)控蛋白,于1993年在大腸桿菌中被發(fā)現(xiàn),能參與碳源代謝的調(diào)節(jié)[33]。一方面,CsrA通過(guò)與glgC(編碼糖原合成相關(guān)酶)和fbp(編碼果糖二磷酸激酶-1)mRNA的非翻譯區(qū)或翻譯起始區(qū)(如SD序列處)結(jié)合,降低mRNA的穩(wěn)定性和阻礙核糖體對(duì)mRNA的正常識(shí)別,抑制糖原合成及糖異生;另一方面,CsrA能與pykF、pfkB(編碼糖酵解丙酮酸激酶同工酶F和A)和pfkA、pfkB(編碼磷酸果糖激酶同工酶I 和 II)mRNA的5'非翻譯區(qū)堿基配對(duì)結(jié)合,增強(qiáng)mRNA的穩(wěn)定性,從而提高目標(biāo)蛋白質(zhì)的表達(dá),促進(jìn)糖酵解及乙酸代謝[34,35]。

      那么,CsrA 的活性又是如何被調(diào)控的呢?當(dāng)細(xì)菌碳源不足時(shí),細(xì)菌通過(guò)雙組分調(diào)節(jié)系統(tǒng)(two component regulatory system,TCS)上調(diào)sRNA CsrB和CsrC的轉(zhuǎn)錄水平[36]。CsrB和CsrC能特異地與CsrA蛋白分子結(jié)合,抑制CsrA蛋白的活性。因此CsrA蛋白對(duì)靶基因的調(diào)節(jié)作用減弱,間接抑制糖酵解并且激活糖異生途徑,從而增加菌體內(nèi)碳含量。當(dāng)碳源充足時(shí),CsrB和CsrC能被CsrD通過(guò)RNaseE介導(dǎo)途徑降解[37]。

      此外,在其他的細(xì)菌(如中華根瘤菌、軟腐歐文菌等)中也發(fā)現(xiàn)CsrA同源蛋白R(shí)smA(repressor of secondary metabolism)[38],二者在氨基酸序列上高度保守,現(xiàn)在統(tǒng)稱為CsrA/RsmA,且也含有功能類似于CsrB/C的sRNA-RsmY/Z。

      新月柄桿菌是一種營(yíng)養(yǎng)匱乏菌,它能在養(yǎng)分少的環(huán)境中生存,但是關(guān)于它如何在貧瘠的環(huán)境中生存的分子機(jī)制知之甚少。直到最近有研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)碳饑餓和進(jìn)入穩(wěn)定期時(shí),新月柄桿菌大量合成一種sRNA-CrfA,表明CrfA可能與新月柄桿菌碳應(yīng)激調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有關(guān)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)CrfA 能顯著激活27種基因,這些靶基因中有1/3能編碼TonB-依賴受體家族[39],其中TonB-依賴受體——CC3461與碳源麥芽糊精和n-乙酰氨基葡萄糖的吸收有關(guān)。CrfA能與CC3461核糖體結(jié)合位點(diǎn)上游的莖環(huán)結(jié)構(gòu)結(jié)合,抵抗核酸酶的降解,增強(qiáng)CC3461 mRNA穩(wěn)定性,從而促進(jìn)新月柄桿菌對(duì)碳源的吸收。

      2.4 在氨基酸應(yīng)激中的作用

      由于氨基酸是蛋白質(zhì)合成不可或缺的成分,同時(shí)也是其他細(xì)胞內(nèi)成分如核苷酸和酶輔助因子的前體,因此氨基酸代謝必須被精確的調(diào)節(jié)。目前有研究發(fā)現(xiàn)小RNA也參與對(duì)氨基酸吸收的調(diào)控。例如,gcvB合成一種206 nt sRNA-GcvB,其能調(diào)控氨基酸和多肽轉(zhuǎn)運(yùn)子相關(guān)基因的表達(dá)。gcvB的表達(dá)受GvcA和GcvR兩種轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控。在氨基酸或者多肽剩余狀態(tài)下,GvcA蛋白結(jié)合于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游-29 至 -76區(qū)間上,激活gcvB的轉(zhuǎn)錄,GcvB得以表達(dá)[40]。GcvB能通過(guò)與多肽和氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因(如dppABCDF操縱,gltI、argT、livK和sstT等)mRNA的5'UTR區(qū)結(jié)合抑制其翻譯,進(jìn)而阻止氨基酸和多肽進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)[41]。反之,GcvA 和GcvR共同作用于GcvB mRNA,GcvB 的表達(dá)受到抑制,促進(jìn)氨基酸和多肽的吸收。在缺乏嘌呤時(shí),這種抑制作用被進(jìn)一步增強(qiáng)[42]。

      同時(shí)也有研究發(fā)現(xiàn),CsrA也參與氨基酸代謝調(diào)節(jié)。在氨基酸饑餓時(shí),CsrB和CsrC大量表達(dá),當(dāng)向基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入酪蛋白水解物,胰蛋白胨或者純氨基酸混合物后,CsrB和 CsrC RNA的表達(dá)迅速減少[43]。然而通過(guò)氨基酸如何抑制CsrB和CsrC的表達(dá)機(jī)制尚不清楚。

      3 展望

      sRNA作為原核生物中新發(fā)現(xiàn)的一類基因表達(dá)調(diào)控因子,通過(guò)感應(yīng)外界環(huán)境條件,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因的表達(dá),目前已成為新的研究熱點(diǎn)。雖然已分離的sRNA種類很多并不斷被人們認(rèn)知,但大多數(shù)sRNA功能未知,其作用機(jī)制及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究仍然處于初級(jí)階段。因此,深入認(rèn)識(shí)這些 sRNA可能開(kāi)辟出一個(gè)新的研究領(lǐng)域。

      細(xì)菌耐藥性的產(chǎn)生與細(xì)菌適應(yīng)生長(zhǎng)環(huán)境緊密相連,其調(diào)控機(jī)制符合sRNA的作用特點(diǎn)。因此我們猜測(cè)細(xì)菌對(duì)抗生素的耐受可能與sRNA有關(guān)。然而目前大部分對(duì)細(xì)菌sRNA的研究主要都集中在大腸桿菌等模式生物,而針對(duì)耐藥致病菌的sRNA 研究幾乎是一片空白。本實(shí)驗(yàn)室正在做相關(guān)方面的研究。隨著研究的深入,將會(huì)有越來(lái)越多的研究轉(zhuǎn)向sRNA對(duì)細(xì)菌耐藥性的調(diào)控機(jī)制,為臨床治療耐藥菌感染提供新的治療靶點(diǎn)和治療策略。

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      (責(zé)任編輯 狄艷紅)

      Research Progress on Regulatory Function of Bacterial Small RNA Resistance to Nutritional Stress

      FU Zhu-qing1YU Yun-mei2WEN Xiao-jun3YUAN Wei-xi1ZHAO Zu-guo1
      (1. Department of Microbiology and Immunology,Guangdong Medical College,Zhanjiang 524023;2. Central Hospital of PLA,Zhanjiang 524023;3. Hepatobiliary Surgery,Affiliated Hospital of Guangdong Medical College,Zhanjiang 524023)

      The survival environment of bacteria is complex and volatile,and it is usually in a state of over-nutrition or denutrition. Therefore,bacteria only are able to survive by using sophisticated regulation system to timely and accurately adjust its gene expressions to adapt to the changing nutritional environment. Bacterial small RNA(small RNA,sRNA)playing an important role in regulating expression of bacterial gene in response to nutrient stress,is a class of RNA regulators discovered in bacteria in recent years. This article reviews the characters and the functions of bacterial small RNA resistance to nutrient stress.

      bacterial small RNA;regulatory networks;nutrient stress

      10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.03.003

      2015-05-12

      國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(30901286),東莞市社會(huì)科技發(fā)展項(xiàng)目(201350715200246)

      付竹青,女,碩士研究生,研究方向:細(xì)菌中小RNA研究;E-mail:zhuziwell@163.com

      趙祖國(guó),男,博士,研究方向:微生物耐藥性及分子機(jī)制;E-mail:zuguozhao@126.com

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