張學(xué)軍
230032合肥,安徽醫(yī)科大學(xué)皮膚病研究所
·專論·
精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)與皮膚病
張學(xué)軍
230032合肥,安徽醫(yī)科大學(xué)皮膚病研究所
精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究是指在大樣本研究獲得疾病分子機(jī)制的知識體系基礎(chǔ)上,以生物醫(yī)學(xué)特別是組學(xué)數(shù)據(jù)為依據(jù),根據(jù)“患者個體”在基因型、表型、環(huán)境和生活方式等各方面的特異性,應(yīng)用現(xiàn)代遺傳學(xué)、生物信息學(xué)和臨床醫(yī)學(xué)等方法與手段,制定個性化精準(zhǔn)預(yù)防、精準(zhǔn)診斷和精準(zhǔn)治療方案的一種新的醫(yī)療模式。本文根據(jù)近年來基因組學(xué)等方面的研究成果,結(jié)合具體皮膚疾病,介紹精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)及其在皮膚病領(lǐng)域中應(yīng)用所面臨的挑戰(zhàn)。
2011年,美國科學(xué)院、美國工程院、美國國立衛(wèi)生研究院及美國科學(xué)委員會共同發(fā)出“邁向精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”的倡議。美國科學(xué)院出版的美國國家智庫報告——《走向精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)》提出了如何通過遺傳學(xué)研究與臨床醫(yī)學(xué)相接軌達(dá)到對人類疾病進(jìn)行精準(zhǔn)治療和有效預(yù)警的問題,這或許是有關(guān)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)最早的詳細(xì)文件。2015年1月,美國總統(tǒng)奧巴馬在國情咨文中正式提出“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計劃”,首次將精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)上升為國家戰(zhàn)略。這體現(xiàn)了醫(yī)學(xué)科學(xué)發(fā)展的時代趨勢和醫(yī)學(xué)臨床實(shí)踐發(fā)展的方向,被認(rèn)為將大大提高國民健康水平、優(yōu)化國家醫(yī)療資源配置和推動相關(guān)學(xué)科和技術(shù)的快速發(fā)展,同時還能帶動相關(guān)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,孕育巨大的市場空間。
近年來,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)在世界范圍內(nèi)受到廣泛關(guān)注。2012年,英國政府發(fā)起了“10萬人基因組計劃”,投資3億英鎊,用于完成10萬個參與者的全基因組測序,根本目標(biāo)是將10萬人基因測序數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行整合,從而針對不同個體數(shù)據(jù),制定出個性化癌癥和罕見病療法。在我國,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)也受到較多關(guān)注。2013年5月,安徽醫(yī)科大學(xué)和自然出版集團(tuán)在上海聯(lián)合舉辦了主題為“From GWAS to Precision Medicine”的第三屆“自然-遺傳學(xué)”大會,率先關(guān)注“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”概念;2014年,上述兩家單位再次聯(lián)合,共同舉辦了主題為“Genome Variation in Precision Medicine”的第四屆“自然-遺傳學(xué)”大會,表明精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的時代趨勢、深遠(yuǎn)意義和廣闊前景。2015年3月,國家科技部召開首次精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)戰(zhàn)略專家會議,成立了精準(zhǔn)醫(yī)療戰(zhàn)略專家組。北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院、四川華西醫(yī)院等大型三甲醫(yī)院先后籌建精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究中心,其中華西醫(yī)院將開展總數(shù)為100萬的人群全基因組測序,建立大數(shù)據(jù)庫和樣本庫,為精準(zhǔn)醫(yī)療的開展進(jìn)一步奠定基礎(chǔ)。據(jù)悉,我國正在制定的“精準(zhǔn)醫(yī)療”戰(zhàn)略計劃也將被納入到國家“十三五”重大科技專項(xiàng),旨在繪制具有中國特色的“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”框架。
精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)也稱為精準(zhǔn)醫(yī)療,是以大量患者和健康人群的基因組信息為基礎(chǔ),通過對比分析得出患者特定疾病的突變位點(diǎn),從而針對突變位點(diǎn)為患者提供精準(zhǔn)的基因靶向治療以及為健康人群提供風(fēng)險評估和預(yù)測。鑒定出特定疾病的突變位點(diǎn)也是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)對不同疾病進(jìn)行重新分類的主要依據(jù),不同于傳統(tǒng)醫(yī)療模式基于臨床癥狀、體征和檢查等的分類方法;在疾病的診斷上,精準(zhǔn)醫(yī)療借助特異性診斷分子標(biāo)記,實(shí)現(xiàn)疾病的早期、準(zhǔn)確診斷,為有效治療方案的及早應(yīng)用和改善預(yù)后提供可能性;在疾病的治療上,精準(zhǔn)醫(yī)療模式通過對特定患者的特定疾病進(jìn)行靶向治療,實(shí)現(xiàn)個體化的精準(zhǔn)治療。
在國際上,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的應(yīng)用已經(jīng)得到了很好的發(fā)展。2013年,美國影視明星安吉麗娜·朱莉通過基因篩查發(fā)現(xiàn),其帶有家族性高發(fā)患乳腺癌風(fēng)險基因BRCA1的缺陷,隨后選擇了預(yù)防性的乳腺和卵巢切除,使她患乳腺癌的風(fēng)險由原來的87%降低到只有5%。我國在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的應(yīng)用也取得了可喜的成果,2011年,博奧生物研發(fā)的耳聾基因檢測試劑盒成功應(yīng)用于高危人群致聾基因篩查,為預(yù)防遺傳性耳聾提供了最有效的方法。經(jīng)濟(jì)學(xué)評估顯示,新生兒耳聾基因篩查每投入1元可以獲得7.27元的收益,通過該項(xiàng)目的實(shí)施,不僅可以避免大量耳聾的發(fā)生,而且也顯示出很好的社會效益和經(jīng)濟(jì)效益。
皮膚病是嚴(yán)重影響健康和生活的常見病之一,也是所有臨床科室疾病種類最多的疾病,約有2 000多種,其中遺傳性皮膚病約有330種,主要包括單基因遺傳病和多基因遺傳病。目前針對皮膚病的診斷主要是結(jié)合臨床癥狀和皮膚病理,對于某些早期較難確診的疾?。ㄈ缙つwT細(xì)胞淋巴瘤等)仍缺乏有效的分子標(biāo)記;治療上主要是以臨床醫(yī)生的經(jīng)驗(yàn)為主。皮膚病精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)應(yīng)利用大樣本人群研究特定疾病的分子標(biāo)記,從而精確尋找到疾病的病因、有效的診斷分子和治療靶點(diǎn),再以此為基礎(chǔ)對某些皮膚疾病進(jìn)行重新分類,結(jié)合應(yīng)用各種遺傳學(xué)、分子影像學(xué)等現(xiàn)代化的方法和手段,制定出個體化的精準(zhǔn)治療和精準(zhǔn)預(yù)防方案。下面從皮膚病的遺傳學(xué)研究,以及皮膚腫瘤和皮膚單基因病的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)等幾個方面進(jìn)行介紹。
1.皮膚病的遺傳學(xué)研究:近年來,隨著人類基因組計劃(human genome project,HGP)和國際人類基因組單體型圖計劃(The International HapMap Project,HapMap)的完成,人類在疾病的遺傳學(xué)研究上已取得突飛猛進(jìn)的發(fā)展。在單基因皮膚病研究方面,通過連鎖分析研究發(fā)現(xiàn),U2HR基因突變可導(dǎo)致Marie Unna型遺傳性稀毛癥[1];通過全基因外顯子測序,發(fā)現(xiàn)播散性淺表性光線性汗孔角化癥的致病基因MVK[2]。在復(fù)雜皮膚病研究方面,利用測序研究發(fā)現(xiàn),PTCH基因突變與基底細(xì)胞癌發(fā)病相關(guān)[3],并通過全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)及相關(guān)研究手段發(fā)現(xiàn)大量的麻風(fēng)、銀屑病、SLE易感基因[4-9]。通過對疾病的遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),疾病致病基因的突變位點(diǎn)和易感基因的遺傳學(xué)標(biāo)記可作為基因檢測的基礎(chǔ)。通過對這些突變位點(diǎn)或遺傳學(xué)標(biāo)記的檢測,可得到基因的狀態(tài),進(jìn)而評估個體對相關(guān)疾病的患病風(fēng)險率,用于疾病發(fā)病風(fēng)險的預(yù)測。
2.皮膚單基因?。簜鹘y(tǒng)的皮膚單基因病很難根治,只能以對癥治療為主。交界型大皰性表皮松解癥是一種皮膚非常脆弱、在輕微的摩擦或碰撞后易產(chǎn)生水皰和血皰的皮膚病,患兒預(yù)后差,多在2歲內(nèi)死亡,既往臨床治療只能緩解癥狀。最近的研究表明,以干細(xì)胞為基礎(chǔ)的基因治療在交界型大皰性表皮松解癥中取得良好療效,研究者首先獲取患者手掌部位的皮膚干細(xì)胞,糾正這些細(xì)胞的基因缺陷(LAMB3),然后將修正后的細(xì)胞植入患者的雙腿,1年后患者的皮膚基本恢復(fù)正常,且臨床隨訪近7年未見復(fù)發(fā)[10]。該治療方法首先通過遺傳學(xué)技術(shù)確定患者的致病基因突變,進(jìn)而運(yùn)用以干細(xì)胞為基礎(chǔ)的基因治療,體現(xiàn)了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)針對不同個體的精確治療。
3.皮膚腫瘤:皮膚T細(xì)胞淋巴瘤(CTCLs)是原發(fā)于皮膚、由T淋巴細(xì)胞克隆性增生所致的一組病譜性疾?。?1]。蕈樣肉芽腫(MF)及其白血病異型Sézary綜合征(SS)是最常見的 CTCLs,早期 MF 對光療、局部化療和光生物學(xué)治療等敏感,預(yù)后較好[12],但它在皮損形態(tài)及病理表現(xiàn)上與慢性皮炎、濕疹等炎癥性皮膚病難以鑒別,因而診斷常被延誤(最長可達(dá)10年之久),進(jìn)而導(dǎo)致有效治療措施不能被盡早應(yīng)用,約10%~25%的患者進(jìn)展至終末期(如SS)。SS缺乏有效的治療手段,5年生存率僅為24%[13-14]。
早期CTCLs的確診對于患者及早得到有效治療措施和改善預(yù)后至關(guān)重要。通過尋找遺傳學(xué)差異或有效的分子標(biāo)記,精準(zhǔn)醫(yī)療可以在CTCLs的早期診斷、治療和預(yù)后評估等方面得到應(yīng)用,并且可能促成CTCLs分類標(biāo)準(zhǔn)的重新定義。加拿大英屬哥倫比亞大學(xué)皮膚病學(xué)系周幼文教授研究團(tuán)隊(duì)通過比較基因組雜交芯片技術(shù),在全轉(zhuǎn)錄組水平上篩選CTCLs的早期差異表達(dá)基因,提出TOX可能是早期MF的特異性標(biāo)志物[15]。該猜想經(jīng)免疫組化方法驗(yàn)證,TOX成為目前最可能成為CTCLs早期診斷標(biāo)志物的候選基因之一。該發(fā)現(xiàn)若經(jīng)證實(shí),將有可能轉(zhuǎn)化為CTCLs的早期診斷試劑盒,并開展以TOX作為分子靶點(diǎn)的新藥開發(fā)項(xiàng)目,相關(guān)成果將有助于提高CTCLs的早期診斷效率,促進(jìn)疾病的精準(zhǔn)治療和改善預(yù)后,從而減輕公共衛(wèi)生負(fù)擔(dān)。
4.皮膚病藥物不良反應(yīng)和藥物療效:個體差異是出現(xiàn)藥物不良反應(yīng)的重要原因之一,不同的患者攜帶不同的分子標(biāo)記,因而對藥物的反應(yīng)也不同。如果我們遵循精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的理念,在每位患者使用某種高風(fēng)險藥物之前,對其進(jìn)行相應(yīng)風(fēng)險分子標(biāo)記的檢測,那么就可以避免陽性患者因使用這種藥物而導(dǎo)致藥物不良反應(yīng)的情況。
在我國,臨床上使用氨苯砜治療麻風(fēng)時,約有1.0%的患者會出現(xiàn)藥物超敏反應(yīng)綜合征,該癥一旦發(fā)生,死亡率約為 11.1%[16]。張福仁教授等[17]研究發(fā)現(xiàn),HLAB*13:01是中國人群氨苯砜超敏反應(yīng)綜合征的風(fēng)險因子,敏感性和特異性分別達(dá)82.5%和85.7%。因此,若臨床上應(yīng)用HLAB*13:01作為檢測氨苯砜超敏反應(yīng)綜合征的風(fēng)險因子,可使該藥的用藥風(fēng)險度降低7倍。更多藥物風(fēng)險分子標(biāo)記仍有待進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),這將為避免藥物不良反應(yīng)、正確選擇臨床用藥和藥物療效最大化提供精準(zhǔn)方案。
5.皮膚病的預(yù)后評估:改善預(yù)后需要在做到早期發(fā)現(xiàn)、早期診斷、早期治療的前提下,同時努力提高診療水平、診療理念和診療方法,再進(jìn)一步尋找疾病特異和敏感的分子標(biāo)記。精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)根據(jù)患者對疾病易感性的差異,以及患者對不同治療方法反應(yīng)性的差異,對疾病進(jìn)行重新精確分類和個體化治療。皮膚疾病種類繁多,特別是皮膚腫瘤和皮膚復(fù)雜疾病的臨床預(yù)后差異較大,利用精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的診療理念對皮膚疾病的預(yù)后評估具有重要的臨床指導(dǎo)意義。
雖然精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)有著美好的應(yīng)用前景,但是要全面推廣到臨床應(yīng)用仍然面臨著巨大挑戰(zhàn)。首先,基因或者生物學(xué)標(biāo)記物對于某些疾病而言相關(guān)性并不大,并不是說弄清了基因組成和蛋白表達(dá)就能搞清某些疾病的致病機(jī)理,學(xué)界依然需要諸如轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、再生醫(yī)學(xué)、人類大腦映射等科研計劃去深入認(rèn)識人體和疾?。黄浯?,治療費(fèi)用昂貴,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)依據(jù)患者不同的基因型或分子標(biāo)記對疾病進(jìn)行重新分類,這種分類使得適用于某種藥物的人群變得更小,增加了藥物研發(fā)成本;最后,對于海量的各種組學(xué)數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)間的整合和管理會是一個大問題。如何保證數(shù)據(jù)整合的質(zhì)量控制,以及數(shù)據(jù)的安全、有效和穩(wěn)定等,都直接關(guān)系到患者的基本隱私和健康。
精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是生物醫(yī)學(xué)發(fā)展的趨勢,也是個性化醫(yī)療的最終體現(xiàn)。雖然我們國家和發(fā)達(dá)國家相比仍然存在一定的差距,但是在皮膚科精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究方面,我們與世界研究水平基本同步。我們應(yīng)當(dāng)充分利用我國臨床資源優(yōu)勢,加上國家的投入與支持,加快發(fā)展皮膚病精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究進(jìn)程,為皮膚病的預(yù)防、診斷和治療提供新的策略和方法,最終為人類健康謀求更多的福利。作為一名皮膚科醫(yī)生和科研工作者,我們要面對挑戰(zhàn),抓住時機(jī),迎難而上,為我國精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展和科技創(chuàng)新做出自己的貢獻(xiàn)。
[1]Wen Y,Liu Y,Xu Y,et al.Loss-of-function mutations of an inhibitory upstream ORF in the human hairless transcript cause Marie Unna hereditary hypotrichosis[J].Nat Genet,2009,41(2):228-233.DOI:10.1038/ng.276.
[2]Zhang SQ,Jiang T,Li M,et al.Exome sequencing identifies MVK mutations in disseminated superficial actinic porokeratosis[J].Nat Genet,2012,44(10):1156-1160.DOI:10.1038/ng.2409.
[3]Wolter M,Reifenberger J,Sommer C,et al.Mutations in the human homologue of the Drosophila segment polarity gene patched(PTCH)in sporadic basal cell carcinomas of the skin and primitive neuroectodermal tumors of the central nervous system [J].Cancer Res,1997,57(13):2581-2585.
[4]Zhang FR,Huang W,Chen SM,et al.Genomewide association study of leprosy[J].N Engl J Med,2009,361(27):2609-2618.DOI:10.1056/NEJMoa0903753.
[5]Zhang XJ,Huang W,Yang S,et al.Psoriasis genome-wide association study identifies susceptibility variants within LCE gene cluster at 1q21 [J].Nat Genet,2009,41 (2):205-210.DOI:10.1038/ng.310.
[6]Sun LD,Cheng H,Wang ZX,et al.Association analyses identify six new psoriasis susceptibility loci in the Chinese population[J].Nat Genet,2010,42(11):1005-1009.DOI:10.1038/ng.690.
[7]Tang H,Jin X,Li Y,et al.A large-scale screen for coding variants predisposing to psoriasis[J].Nat Genet,2014,46(1):45-50.DOI:10.1038/ng.2827.
[8]Han JW,Zheng HF,Cui Y,et al.Genome-wide association study in a Chinese Han population identifies nine new susceptibility loci for systemic lupus erythematosus[J].Nat Genet,2009,41(11):1234-1237.DOI:10.1038/ng.472.
[9]He L,Wu WJ,Yang JK,et al.Two new susceptibility loci 1q24.2 and 11p11.2 confer risk to severe acne[J].Nat Commun,2014,5:2870.DOI:10.1038/ncomms3870.
[10]De Rosa L,Carulli S,Cocchiarella F,et al.Long-term stability and safety of transgenic cultured epidermal stem cells in gene therapy of junctional epidermolysis bullosa [J].Stem Cell Reports,2014,2(1):1-8.DOI:10.1016/j.stemcr.2013.11.001.
[11]Criscione VD,Weinstock MA.Incidence of cutaneous T-cell lymphoma in the United States,1973-2002 [J].Arch Dermatol,2007,143(7):854-859.DOI:10.1001/archderm.143.7.854.
[12]Dummer R,Assaf C,Bagot M,et al.Maintenance therapy in cutaneous T-cell lymphoma:who,when,what?[J].Eur J Cancer,2007,43(16):2321-2329.
[13]Lansigan F,Choi J,Foss FM.Cutaneous T-cell lymphoma[J].Hematol Oncol Clin North Am,2008,22 (5):979-996,x.DOI:10.1016/j.hoc.2008.07.014.
[14]Kim YH,Chow S,Varghese A,et al.Clinical characteristics and long-term outcome of patients with generalized patch and/or plaque(T2)mycosis fungoides[J].Arch Dermatol,1999,135(1):26-32.
[15]Zhang Y,Wang Y,Yu R,et al.Molecular markers of early-stage mycosis fungoides[J].J Invest Dermatol,2012,132 (6):1698-1706.DOI:10.1038/jid.2012.13.
[16]Tian W,Shen J,Zhou M,et al.Dapsone hypersensitivity syndrome among leprosy patients in China[J].Lepr Rev,2012,83(4):370-377.
[17]Zhang FR,Liu H,Irwanto A,et al.HLA-B*13:01 and the dapsone hypersensitivity syndrome [J].N Engl J Med,2013,369(17):1620-1628.DOI:10.1056/NEJMoa1213096.
張學(xué)軍,Email:ayzxj@vip.sina.com
10.3760/cma.j.issn.0412-4030.2016.03.001
2016-01-25)
(本文編輯:顏艷)