SLC30A8基因rs13266634多態(tài)性與甘肅漢族、回族2型糖尿病的相關(guān)性
張淑蘭劉靜郭陸晉1郭茜馬曉琴劉菊香
(定西市人民醫(yī)院內(nèi)分泌科,甘肅定西743000)
摘要〔〕目的探討SLC30A8基因rs13266634單核苷酸多態(tài)性(SNP)在甘肅漢族、回族人群中的分布及其與2 型糖尿病(T2DM)的關(guān)系。方法應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法檢測(cè)漢族和回族T2DM組和對(duì)照組SLC30A8基因的基因型,同時(shí)進(jìn)行人體測(cè)量學(xué)及臨床指標(biāo)的檢測(cè),分別采用穩(wěn)態(tài)模型評(píng)估胰島素抵抗指數(shù)(HOMA-IR)和胰島β細(xì)胞分泌功能指數(shù)(HOMA-β)評(píng)估胰島素抵抗(IR)和胰島β細(xì)胞功能。 結(jié)果SLC30A8基因的基因型CC、CT和TT頻率在漢族、回族T2DM組和對(duì)照組之間比較有差異(P均<0.05);等位基因C、T頻率在漢族、回族T2DM組和對(duì)照組之間比較亦有差異(P均<0.05)。漢族C等位基因患T2DM的風(fēng)險(xiǎn)是T等位基因的1.54倍 (OR=1.54,95%CI 1.09~2.16);回族C等位基因患T2DM的風(fēng)險(xiǎn)是T等位基因的1.56倍(OR=1.56,95%CI 1.09~2.22)。 結(jié)論SLC30A8基因rs13266634多態(tài)性與甘肅漢族、回族T2DM的發(fā)病相關(guān),C等位基因可能是T2DM發(fā)病的易感基因之一。
關(guān)鍵詞〔〕SLC30A8基因; 單核苷酸多態(tài)性;2型糖尿病
中圖分類號(hào)〔〕R781.6+4〔文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼〕A〔
1甘肅省人民醫(yī)院內(nèi)分泌科
第一作者:張淑蘭(1970-),女,碩士,主治醫(yī)師,主要從事糖尿病分子生物學(xué)研究。
2型糖尿病(T2DM)是一種多因素、多基因疾病,具有廣泛的遺傳異質(zhì)性。最近國外全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn), SLC30A8 基因rs13266634單核苷酸多態(tài)性與T2DM的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)〔1,2〕。汪志紅等〔3〕報(bào)道,SLC30A8 基因rs13266634多態(tài)性與中國漢族人群T2DM相關(guān)。我國地域廣闊,民族眾多,不同種族由于遺傳背景及生活環(huán)境的差異,其發(fā)病機(jī)制可能有所不同,因此,在不同種族中驗(yàn)證已經(jīng)報(bào)道的疾病相關(guān)基因位點(diǎn)對(duì)研究人類復(fù)雜性疾病的發(fā)病機(jī)制具有重要意義。本研究應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法對(duì)漢族、回族T2DM患者和健康對(duì)照者SLC30A8的基因型進(jìn)行分析,探討甘肅漢族、回族人群該多態(tài)性位點(diǎn)的頻率分布以及與胰島素抵抗(IR)和胰島β細(xì)胞功能的相關(guān)性。
1對(duì)象和方法
1.1研究對(duì)象漢族T2DM組138例,男72例,女66例,平均年齡(56.99±13.65)歲,對(duì)照組135例,男75例,女60例,平均年齡(54.76±14.77)歲?;刈錞2DM組125例,男64例,女61例,平均年齡(53.55±12.26)歲,對(duì)照組127例,男79例,女48例,平均年齡(54.57±14.20)歲。T2DM組受試者均為2009年10月至2010年8月在甘肅省臨夏市人民醫(yī)院內(nèi)分泌科就診的門診或住院的漢族、回族T2DM患者,均符合1999年世界衛(wèi)生組織(WHO)糖尿病診斷標(biāo)準(zhǔn)。對(duì)照組受試者為同期門診體檢的健康成年人,均排除嚴(yán)重心肝腎疾病。彼此間無血緣關(guān)系。
1.2方法
1.2.1收集資料按照統(tǒng)一的測(cè)量標(biāo)準(zhǔn),對(duì)每位受試者測(cè)量身高、體質(zhì)量、腰圍、臀圍、收縮壓(SBP)、舒張壓(DBP);計(jì)算體質(zhì)量指數(shù)(BMI),腰臀比(WHR)。對(duì)所有受試者采集清晨空腹外周靜脈血5 ml,用于生化指標(biāo)的檢測(cè)和提取DNA。
1.2.2生化指標(biāo)的檢測(cè)采用葡萄糖氧化酶法測(cè)定空腹血糖(FPG),放免法測(cè)定空腹胰島素(FINS),血清總膽固醇(TC) 、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白膽固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)的測(cè)定均由自動(dòng)生化分析儀完成。
1.3胰島素抵抗(IR)評(píng)估采用穩(wěn)態(tài)模型計(jì)算胰島素抵抗指數(shù)(HOMA-IR)進(jìn)行評(píng)估,HOMA-IR=FPG×FINS/22.5。
1.4胰島β細(xì)胞功能評(píng)估采用穩(wěn)態(tài)模型評(píng)估胰島β細(xì)胞分泌功能指數(shù)(HOMA-β)進(jìn)行評(píng)估, HOMA-β = 20×FINS/FPG-3.5。
1.5DNA的提取采用酚-氯仿提取法提取全血基因組DNA。
1.6SLC30A8 基因rs13266634多態(tài)性檢測(cè)從GenBank核對(duì)序列,用軟件Primier5、Oligo6和DNAMAN設(shè)計(jì)和檢驗(yàn)引物。引物上游序列:5′-CCTGCCTTGTCTGTGTGAATGTA-3′,下游序列:5′-CCTTTGGTTCCTTATTTTCTATG-3′,引物由上海生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。擴(kuò)增產(chǎn)物為413 bp,PCR總反應(yīng)體系為25 μl,10×PCR緩沖液2.5 μl,MgCl2(25 mmol/L)2.5 μl,dNTP混合物(2.5 mmol/L)2.0 μl,上下游引物各0.5 μl,Taq酶(購自大連寶生物工程有限公司)0.25 μl,DNA模板1 μl,ddH2O17.75 μl。PCR循環(huán):94℃預(yù)變性5 min,94℃變性45 s,57℃退火45 s,72℃延伸45 s,共35個(gè)循環(huán),72℃終末延伸5 min。
1.7SLC30A8 基因rs13266634多態(tài)性分析反應(yīng)總體系20 μl,其中取PCR產(chǎn)物10 μl,限制性內(nèi)切酶PvuⅡ(購自TaKaRa大連寶生物工程有限公司)5 U,37℃溫育12 h,酶切產(chǎn)物用2.5%瓊脂糖凝膠電泳35 min(電壓80 V)后,用MI1708062BB凝膠成像系統(tǒng)分析儀(BIO-RAD,美國)觀測(cè)基因型。
2結(jié)果
2.1兩組人體測(cè)量學(xué)和代謝指標(biāo)的比較漢族人群T2DM組和對(duì)照組比較,T2DM組的BMI、WHR均顯著高于對(duì)照組(P<0.05);FPG、FINS、HOMA-IR、TC、TG、LDL-C均顯著高于對(duì)照組(P<0.01);而HOMA-β、HDL-C顯著低于對(duì)照組(P<0.01)。回族人群T2DM組和對(duì)照組比較,T2DM組FPG、FINS、HOMA-IR均顯著高于對(duì)照組(P<0.01),TG、TC、LDL-C亦高于對(duì)照組(P<0.05);HOMA-β、HDL-C均顯著低于對(duì)照組(P<0.01、P<0.05)。其余指標(biāo)差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表1。
2.2SLC30A8 基因rs13266634多態(tài)性酶切電泳結(jié)果采用限制性內(nèi)切酶學(xué)方法,獲得1條帶野生型CC型(413 bp)、2條帶純合子TT型(181 bp和232 bp)、3條帶雜合子CT型(413 bp、181 bp和232 bp)3種基因型酶切結(jié)果。
2.3SLC30A8 基因rs13266634多態(tài)性位點(diǎn)基因型和等位基因頻率分布SLC30A8 基因rs13266634位點(diǎn)的頻率分布在兩組人群中經(jīng)檢驗(yàn)均符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡,具有群體代表性。在漢族人群,CC、CT、TT基因型頻率在T2DM組和對(duì)照組比較差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=8.12,P=0.02),等位基因C和T的頻率在兩組中差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.11,P=0.01,OR=1.54,95%CI1. 09~2.16);在回族人群,CC、CT、TT基因型頻率在T2DM組和對(duì)照組比較差異亦有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.51,P=0.04),等位基因C和T的頻率在兩組中差異亦有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.02,P=0.02,OR=1.56,95%CI1. 09~2.22),表2。
表1 兩組臨床資料的比較 ± s)
與本民族對(duì)照組比較:1)P<0.05,2)P<0.01,3)數(shù)據(jù)經(jīng)對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換
表2 漢族、回族各組SLC30A8各
3討論
本研究提示T2DM患者存在IR和胰島β細(xì)胞功能減退,與其臨床表現(xiàn)和病理生理相符,且隨著血糖的升高,體內(nèi)出現(xiàn)了血脂代謝紊亂。
在漢族和回族人群,T2DM組rs13266634 的CC基因型頻率和等位基因C的頻率均顯著高于正常對(duì)照組,與文獻(xiàn)報(bào)道的結(jié)果一致〔4,5〕。漢族C等位基因攜帶者患T2DM的風(fēng)險(xiǎn)是T等位基因的1.54倍(OR=1.54,95%CI為1.09~2.16),與國內(nèi)報(bào)道的中國漢族OR值1.37(95%CI為1.20~1.56)結(jié)果近似〔6〕;回族C等位基因攜帶者患T2DM的風(fēng)險(xiǎn)是T等位基因的1.56倍(OR=1.56,95%CI為1.09~2.22)較漢族高。提示SLC30A8 基因rs13266634位點(diǎn)多態(tài)性與甘肅漢族和回族人群T2DM的發(fā)生有關(guān),其C等位基因?yàn)轱L(fēng)險(xiǎn)因子。
SLC30A8基因rs13266634位點(diǎn)多態(tài)性與甘肅漢族、回族人群T2DM的發(fā)生有關(guān),其機(jī)制可能與其分子結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能有關(guān)。人類SLC30A8基因定位于8q24.11,其核苷酸序列全長41 617 bp,含8個(gè)外顯子,其編碼的蛋白質(zhì)是含369個(gè)氨基酸的鋅轉(zhuǎn)運(yùn)體-8(ZnT-8),rs13266634C/T是該基因第8外顯子編碼的SNP,這一位點(diǎn)可發(fā)生變異。SLC30A8 基因特異地表達(dá)于胰島β細(xì)胞,能促進(jìn)胞質(zhì)中的鋅轉(zhuǎn)移至含有胰島素的囊泡中〔7,8〕,胰島素與兩個(gè)鋅離子結(jié)合成較穩(wěn)定的六聚體,當(dāng)胰島β細(xì)胞受到刺激時(shí)才將胰島素分泌出去〔9〕。因此,SLC30A8 基因第325位點(diǎn)堿基發(fā)生C-T突變(W325R)變異,即rs13266634C/T突變,使色氨酸變?yōu)榫彼?,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,可能會(huì)影響胰島素顆粒中鋅離子的聚積,影響胰島素的穩(wěn)定性、儲(chǔ)存或分泌,而增加T2DM的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)〔10〕。目前關(guān)于SLC30A8 基因的研究還比較少,其編碼的蛋白質(zhì)是如何調(diào)控鋅離子的轉(zhuǎn)運(yùn)以及如何參與胰島素分泌的調(diào)節(jié)還有待于進(jìn)一步研究。
綜上所述,SLC30A8 基因rs13266634位點(diǎn)多態(tài)性與T2DM的發(fā)病有關(guān),其C等位基因?yàn)轱L(fēng)險(xiǎn)因子;SLC30A8基因可能是甘肅漢族和回族人群T2DM的易感基因。
4參考文獻(xiàn)
1Sladek R,Rocheleau G,Rung J,etal. A genome-wide association study identifies novel risk loci for type 2 diabetes〔J〕. Nature,2007;445(7130):881-5.
2Zeggini E,Weedon MN,Lindgren CM,etal.Replication of genome-wide association signals in UK samples reveals risk loci for type 2 diabetes〔J〕.Science,2007;316(5829):1336-41.
3汪志紅,張素華,王增產(chǎn),等. 中國漢族人群SLC30A8 rs13266634多態(tài)性與2型糖尿病的關(guān)聯(lián)〔J〕.上海醫(yī)學(xué),2008;31(5):323-7.
4Saxena R,Voight BF,Lyssenko V,etal.Genome-wide association analysis identifies loci for type 2 diabetes and triglyceride levels〔J〕.Science,2007;316:1331-6.
5Xiang J,Li Y,Xu M,etal. Zinc transporter-8 gene (SLC30A8) is associated with type 2 diabetes in Chinese〔J〕. J Clin Endocrinol Metab,2008;93(10):4107-12.
6Lin Y,Li P,Cai L,etal. Association study of genetic variants in eight genes/loci with type 2 diabetes in a Han Chinese population〔J〕. BMC Med Genet,2010;11:97.
7Chirnienti F,Devergnas S,Favier A,etal. Identification and cloning of a beta cell specific zinc transporter,ZnT-8,localized into insulin secretory granules〔J〕. Diabetes,2004;53(9):2330-7.
8Chimienti F,Devergnas S,Pattou F,etal.In vivo expression and functional characterization of the zinc transporter ZnT8 in glucose-induced insulin secretion〔J〕.J Cell Sci,2006;119:4199-206.
9Chimienti F,FavierA,Seve M,etal. ZnT-8,a pancreatic beta cell specific zinc transporter〔J〕.Biometals,2005;18(4):313-7.
10Chimienti F,Devergnas S,Pattou F,etal.In vivo expression and functional characterization of the zinc transporter ZnT8 in glucose-induced insulin secretion〔J〕.J Cell Sci,2006;119(Pt20):4199-206.
〔2013-08-15修回〕
(編輯趙慧玲/曹夢(mèng)園)