張建波,呂曉東,宋 巍,孫淼淼,于慶凱,馮 穩(wěn),劉明閣,胡 駿,房百俊
1)鄭州大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院病理科 鄭州450003 2)鄭州大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院中心實(shí)驗(yàn)室 鄭州450003 3)中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室 廣州510089 4)鄭州大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院血液科 鄭州450003
T 細(xì)胞在抗腫瘤免疫中起重要作用,并以識別腫瘤相關(guān)抗原的T 細(xì)胞克隆性增生為特點(diǎn)[1]。研究[2]證實(shí)多種實(shí)體瘤患者體內(nèi)存在針對腫瘤抗原特異反應(yīng)的T 細(xì)胞克隆,分析這些克隆性增生的T細(xì)胞對于了解機(jī)體抗腫瘤的免疫狀態(tài)以及開展特異性免疫治療有重要意義。該研究旨在分析乳癌患者轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)中T 細(xì)胞的克隆性增生及T 細(xì)胞受體(T cell receptor,TCR)β 鏈互補(bǔ)決定區(qū)3(complementarity determining region 3,CDR3)亞家族基因譜型及氨基酸序列特點(diǎn),為尋找乳癌患者腫瘤相關(guān)抗原表位及個體化免疫治療等打下基礎(chǔ)。
1.1 標(biāo)本 鄭州大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院確診為乳腺浸潤性導(dǎo)管癌(組織學(xué)Ⅱ級)的住院患者5例,均為女性,年齡28~73歲,取其經(jīng)術(shù)中快速冰凍病理檢查明確有癌微轉(zhuǎn)移的腋窩前哨淋巴結(jié)標(biāo)本。同時取2例乳腺反應(yīng)性增生患者的淋巴結(jié)標(biāo)本作為對照。該研究經(jīng)鄭州大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)。
1.2 主要試劑 Trizol 試劑、SuperScript Ⅲ逆轉(zhuǎn)錄酶、SMART 引物、LD PCR 引物ⅡA 購自美國Invitrogen 公司,Advantage 2 Polymerase Mix 購自美國BD Biosciences Clontech 公司,Taq DNA 聚合酶購自美國Promega 公司,膠純化試劑盒購自美國Omega Biotek 公司。
1.3 RNA 提取及cDNA 合成 將癌轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)及對照淋巴結(jié)的新鮮標(biāo)本在200 目篩網(wǎng)上研磨后用PBS 沖洗,收集細(xì)胞懸液,加入1 mL 無血清RPMI 1640 培養(yǎng)液并計(jì)數(shù)。用Trizol 試劑提取總RNA,在SuperScript Ⅲ逆轉(zhuǎn)錄酶及SMART 引物作用下合成cDNA,在LD PCR 引物ⅡA 作用下合成cDNA 第2 鏈。
1.4 24個TCR β 鏈可變區(qū)(BV)亞家族的擴(kuò)增根據(jù)文獻(xiàn)[3]設(shè)計(jì)24個TCR BV 亞家族上游引物,并在β 鏈恒定區(qū)(C 區(qū))設(shè)計(jì)一條共用的FAM 標(biāo)記的下游引物和對照引物,引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成。總反應(yīng)體系為50 μL,反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3 min;94℃1 min,55℃1 min,72℃1 min,35個循環(huán);72℃延伸10 min。取7 μL PCR 反應(yīng)產(chǎn)物在15 g/L 瓊脂糖凝膠中電泳。
1.5 基因掃描分析 取5 μL 熒光引物擴(kuò)增的TCR BV 各亞家族PCR 產(chǎn)物與3 μL DNA 變性膠上樣緩沖液混合,加入0.5 μL 標(biāo)準(zhǔn)品。94℃4 min 后上樣至60 g/L 聚丙烯酰胺凝膠,于373 DNA 序列分析儀(ABI,Perkin Elmer)中電泳,計(jì)算機(jī)收集電泳過程中出現(xiàn)的不同顏色和強(qiáng)度的熒光素,用GeneScan 672軟件進(jìn)行基因掃描分析。
1.6 序列分析 將GeneScan 掃描分析提示單克隆或寡克隆增生的cDNA 重新進(jìn)行PCR 擴(kuò)增(條件同1.4),上游引物不變,下游引物改為未用FAM 標(biāo)記的C 區(qū)引物。PCR 產(chǎn)物經(jīng)純化回收后送上海英駿生物技術(shù)有限公司測序,利用DNAstar 軟件及網(wǎng)上TCR 資源(http://imgt.cines.fr/)進(jìn)行序列分析。
2.1 兩種淋巴結(jié)TCR BV 各亞家族RT-PCR 擴(kuò)增結(jié)果 RT-PCR 擴(kuò)增結(jié)果顯示對照淋巴結(jié)全部24個BV 亞家族均有擴(kuò)增。乳癌病例1、2、4 的轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)中24個BV 亞家族均有擴(kuò)增,病例3 的BV7 家族和病例5 的BV13、BV16 家族無擴(kuò)增,其余家族均有擴(kuò)增,病例5 的24個TCR BV 亞家族的擴(kuò)增結(jié)果見圖1。
圖1 病例5 的24個TCR BV 亞家族PCR 擴(kuò)增結(jié)果
2.2 兩種淋巴結(jié)TCR BV 亞家族基因掃描結(jié)果2例對照淋巴結(jié)各BV 亞家族均有表達(dá),基因掃描均呈中間高兩邊低、多個峰的譜型,提示為多克隆。乳癌病例1 的BV2、病例2 的BV4 掃描分析結(jié)果為單一主峰和少數(shù)小峰圖像,提示為寡克隆增生;病例3的BV18、病例4 的BV14、病例5 的BV2 和BV19 為單一主峰即單克隆增生,其余BV 亞家族為寡克隆趨勢和多克隆增生。5例乳癌患者T 細(xì)胞部分TCR BV 亞家族T 細(xì)胞克隆性特點(diǎn)見表1,其余亞家族均為多克隆表達(dá)。
表1 5例乳癌患者部分TCR BV 亞家族T 細(xì)胞克隆性特點(diǎn)
2.3 TCR β 鏈CDR3 序列測定結(jié)果 乳癌患者單克隆及寡克隆增生T 細(xì)胞TCR β 鏈CDR3 區(qū)核苷酸及氨基酸序列見表2。不同病例限制性取用的BV 亞家族不同,病例1 和病例5 均取用了BV2 家族,但其核苷酸序列不同。各亞家族CDR3 區(qū)序列長度為30~45 bp。
表2 乳癌患者T 細(xì)胞TCR BV 亞家族β 鏈限制性取用和CDR3 區(qū)核苷酸及氨基酸序列測定結(jié)果
T 細(xì)胞通過TCR 識別腫瘤細(xì)胞相關(guān)抗原,在機(jī)體抗腫瘤免疫反應(yīng)中起著重要作用[4]。腫瘤患者浸潤淋巴細(xì)胞中存在針對腫瘤抗原的特異性增生T細(xì)胞克隆。不同克隆T 細(xì)胞的TCR 重排時,V-D-J基因片段重排和隨機(jī)插入核苷酸形成一高度可變區(qū),稱為CDR3,是TCR 特異識別抗原的區(qū)域。CDR3 長度及堿基序列的不同形成了T 細(xì)胞表面多種多樣的TCR CDR3 基因譜型[5]。分析CDR3 基因譜型是一種獨(dú)特的檢測T 細(xì)胞克隆性的方法。PCR-基因掃描-序列分析方法通過檢測CDR3 的長度是否相同以確定T 細(xì)胞的克隆性,然后對出現(xiàn)單克隆或寡克隆的PCR 產(chǎn)物進(jìn)行序列分析,從而了解其CDR3 的核苷酸序列,是檢測T 細(xì)胞克隆性較為理想的方法[6]。
作者利用該方法分析了5例乳腺浸潤性導(dǎo)管癌(組織學(xué)Ⅱ級)患者轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)內(nèi)克隆性增生T 細(xì)胞。與乳腺反應(yīng)性增生患者T 淋巴細(xì)胞表達(dá)全部(24個)TCR BV 亞家族不同,乳癌患者TCR BV 亞家族表達(dá)存在明顯的限制性取用,每例患者均出現(xiàn)一個或多個TCR BV 亞家族的譜型偏移,表明乳癌患者轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)內(nèi)存在針對乳癌細(xì)胞釋放的腫瘤相關(guān)抗原的特異免疫反應(yīng)性T 細(xì)胞克隆性增生,而且這些優(yōu)勢克隆性增生的T 細(xì)胞會影響其他家族T細(xì)胞的表達(dá)。5例患者選擇性表達(dá)的TCR BV 亞家族亦不同,分析其原因可能為:乳癌腫瘤相關(guān)抗原具有復(fù)雜性和多樣性,不同的抗原表位可誘發(fā)機(jī)體產(chǎn)生針對性的BV 亞家族優(yōu)勢表達(dá),同時也與不同患者之間人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)型別存在差異、疾病病程的不同階段TCR 取用情況不同等有關(guān)[7]。該研究中2例乳腺浸潤性導(dǎo)管癌患者均表達(dá)了BV2 亞家族,是否BV2 亞家族T細(xì)胞克隆是乳腺浸潤性導(dǎo)管癌腫瘤相關(guān)抗原的特異性效應(yīng)T 細(xì)胞克隆,有待進(jìn)一步研究?;驋呙杞Y(jié)果顯示,5例乳腺浸潤性導(dǎo)管癌患者大部分BV 亞家族基因呈多克隆表達(dá),這是因?yàn)椴∽兞馨徒Y(jié)中仍存在一些正常BV 亞家族T 細(xì)胞,而且T 細(xì)胞對腫瘤相關(guān)抗原的反應(yīng)性克隆性增生也處于一個動態(tài)過程中。雖然病例1 和病例5 的3個克隆產(chǎn)物CDR3 序列長度相同,但其氨基酸序列完全不同,證實(shí)為不同的T 細(xì)胞克隆。有研究[7]提示TCR 識別抗原時,除HLA 型外,TCR CDR3 本身的結(jié)構(gòu)和空間構(gòu)型也有影響,不同譜型的CDR3 如果空間結(jié)構(gòu)相似很可能會識別相同的抗原表位[8],因此有必要對該研究中不同患者之間多樣性的CDR3 譜型進(jìn)行生物信息學(xué)分析,了解其是否具有相似的空間結(jié)構(gòu)。
乳癌患者體內(nèi)存在T 細(xì)胞的克隆性增生,一方面說明T 細(xì)胞參與了機(jī)體的抗腫瘤免疫應(yīng)答反應(yīng),可考慮采用特異性的TCR β 鏈單克隆抗體活化腫瘤自體T 細(xì)胞,獲得臨床治療數(shù)量的特異性細(xì)胞毒T 細(xì)胞,用于乳癌患者的個體化免疫治療;另一方面也說明了機(jī)體內(nèi)存在誘導(dǎo)T 細(xì)胞克隆性增生的腫瘤相關(guān)抗原。因此,監(jiān)測乳癌根治術(shù)后患者體內(nèi)T細(xì)胞克隆性增生情況,可為分析患者是否有微小腫瘤殘留及腫瘤復(fù)發(fā)提供依據(jù)和對比指標(biāo)[9]。
總之,該研究分析了5例乳癌患者轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)標(biāo)本中TCR β 鏈譜型偏移,表明患者體內(nèi)存在T 細(xì)胞的克隆性增生,有助于了解患者的細(xì)胞免疫功能狀態(tài)。進(jìn)一步的CDR3 氨基酸序列分析既證實(shí)克隆性增生T 細(xì)胞來自不同的T 細(xì)胞群,也為分析乳癌腫瘤相關(guān)抗原表位、疫苗研制,進(jìn)行個體化免疫治療等提供了幫助。
[1]He XY,Yang WM,Tang WT,et al.TRAV gene expression in PBMCs and TILs in patients with breast cancer analyzed by a DNA melting curve(FQ-PCR)technique for TCR α chain CDR3 spectratyping[J].Neoplasma,2012,59(6):693
[2]Sherwood AM,Emerson RO,Scherer D,et al.Tumor-infiltrating lymphocytes in colorectal tumors display a diversity of T cell receptor sequences that differ from the T cells in adjacent mucosal tissue[J].Cancer Immunol Immunother,2013,62(9):1453
[3]姚新生,馬驪,溫茜,等.監(jiān)測TCR CDR3 漂移的免疫掃描譜型分析技術(shù)的建立與鑒定[J].中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志,2006,26(6):571
[4]吳亞紅,高艷鋒,祁元明.腫瘤抗原細(xì)胞毒性T 淋巴細(xì)胞表位鑒定和多肽疫苗的研究進(jìn)展[J].鄭州大學(xué)學(xué)報(bào):醫(yī)學(xué)版,2011,46(5):657
[5]Sainz-Perez A,Lim A,Lemercier B,et al.The T-cell receptor repertoire of tumor-infiltrating regulatory T lymphocytes is skewed toward public sequences[J].Cancer Res,2012,72(14):3557
[6]Blohm JH,Blohm N,Hummel M,et al.Detection of clonal T-cell-receptor(TCR)Vbeta rearrangements in explanted dilated cardiomyopathy hearts by semi-nested PCR,GeneScan,and direct sequencing[J].Med Sci Monit Basic Res,2013,19:111
[7]Luo W,Liao WJ,Huang YT,et al.Cancer of the gastrointestinal tract results in a restricted T-cell repertoire dependent upon tumor differentiation[J].Cell Immunol,2011,270(1):47
[8]尹青松,譚獲,陳少華,等.抗原特異TCRα 和β 鏈基因克隆及分子空間結(jié)構(gòu)預(yù)測[J].第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào),2011,33(4):349
[9]Boone E,Verhaaf B,Langerak AW.PCR-based analysis of rearranged immunoglobulin or T-cell receptor genes by GeneScan analysis or heteroduplex analysis for clonality assessment in lymphoma diagnostics[J].Methods Mol Biol,2013,971:65