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    一種適用于生物反應(yīng)器觀察的生物顯微鏡設(shè)計(jì)

    2015-09-11 14:22:43于源華
    關(guān)鍵詞:視場控制算法顯微鏡

    徐 兵 于源華 李 琦 宮 平*

    1(長春工業(yè)大學(xué)機(jī)電工程學(xué)院, 長春 130012)2(長春理工大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院, 長春 130022)

    一種適用于生物反應(yīng)器觀察的生物顯微鏡設(shè)計(jì)

    徐 兵1于源華2李 琦2宮 平2*

    1(長春工業(yè)大學(xué)機(jī)電工程學(xué)院, 長春 130012)2(長春理工大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院, 長春 130022)

    基于目前國內(nèi)對(duì)“細(xì)胞工廠”生物反應(yīng)器在使用過程中監(jiān)測(cè)方法的局限性,為了在原位高效實(shí)時(shí)地監(jiān)測(cè)細(xì)胞工廠中細(xì)胞的生長狀況,提高疫苗等生物藥物企業(yè)的生產(chǎn)效益,提出一種通過細(xì)胞工廠透明側(cè)壁進(jìn)行傾斜的對(duì)細(xì)胞觀測(cè)的方法,并設(shè)計(jì)出用于監(jiān)測(cè)細(xì)胞工廠中所培養(yǎng)細(xì)胞的卡塞格林反射式長工作距顯微物鏡;同時(shí),針對(duì)該觀測(cè)裝置,設(shè)計(jì)了采用單神經(jīng)元自適應(yīng)PI控制算法的伺服控制系統(tǒng)。顯微物鏡放大倍率為5×,工作距離為85 mm,數(shù)值孔徑NA為0.3,可分辨的最小距離為1.1 μm,伺服控制系統(tǒng)重復(fù)定位精度為5 μm,重復(fù)性能良好,自動(dòng)觀察一個(gè)40層細(xì)胞工廠僅需2 min。

    顯微;細(xì)胞工廠;長工作距;自適應(yīng)PI

    引言

    細(xì)胞工廠(cell factory)是一種用于大規(guī)模細(xì)胞培養(yǎng)的多層疊板式細(xì)胞培養(yǎng)裝置,相鄰兩層培養(yǎng)疊板間距離僅17 mm。特有的設(shè)計(jì)使得單位體積內(nèi)大大增加了細(xì)胞培養(yǎng)表面積,并且可以保證操作的無菌性,最大限度降低批間差異,使疫苗、單克隆抗體、生物藥物等的生產(chǎn)規(guī)模放大變得簡單易行,細(xì)胞工廠的應(yīng)用實(shí)現(xiàn)了細(xì)胞培養(yǎng)的操作規(guī)程化[1]。

    近年來,我國細(xì)胞工廠培養(yǎng)技術(shù)迅速發(fā)展,因此生產(chǎn)企業(yè)需要對(duì)細(xì)胞工廠培養(yǎng)技術(shù)進(jìn)行實(shí)時(shí)質(zhì)量監(jiān)控。傳統(tǒng)的細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)采用轉(zhuǎn)瓶培養(yǎng),利用普通的倒置顯微鏡對(duì)轉(zhuǎn)瓶內(nèi)的細(xì)胞進(jìn)行觀察和質(zhì)量評(píng)價(jià)。然而,細(xì)胞工廠是多層固定的疊板式細(xì)胞培養(yǎng)裝置,倒置顯微鏡無法實(shí)施觀察。目前,僅日本4國精密儀器公司擁有對(duì)細(xì)胞工廠的相關(guān)自動(dòng)監(jiān)控技術(shù),產(chǎn)品單價(jià)在300萬元人民幣以上,并且該產(chǎn)品僅能觀察細(xì)胞工廠內(nèi)的一條線區(qū)域,觀察面積較小。目前,國內(nèi)沒有相關(guān)技術(shù)及產(chǎn)品。

    由于所培養(yǎng)的細(xì)胞為貼壁細(xì)胞,它們附著在細(xì)胞工廠疊板底面。筆者提出了一種將光學(xué)系統(tǒng)傾斜、透過細(xì)胞工廠透明的側(cè)壁從所培養(yǎng)細(xì)胞底部進(jìn)行觀察的方法,并分別對(duì)顯微光學(xué)系統(tǒng)及伺服控制系統(tǒng)進(jìn)行了設(shè)計(jì)及試驗(yàn)。由此,自主研發(fā)了可實(shí)現(xiàn)對(duì)多層細(xì)胞工廠培養(yǎng)皿中的細(xì)胞進(jìn)行實(shí)時(shí)自動(dòng)觀測(cè)的新型裝置。

    1 對(duì)細(xì)胞工廠觀測(cè)原理

    由于細(xì)胞工廠結(jié)構(gòu)的限制,采用傳統(tǒng)的觀測(cè)方式無法對(duì)細(xì)胞工廠內(nèi)部貼壁生長的細(xì)胞進(jìn)行觀察。細(xì)胞工廠材質(zhì)為符合《美國藥典》規(guī)定的聚苯乙烯,它的側(cè)壁是透明的,這樣就可以利用一個(gè)具有大的傾斜觀測(cè)角的顯微觀察裝置,透過細(xì)胞工廠透明的側(cè)壁,對(duì)上一層培養(yǎng)皿底面上貼壁生長的細(xì)胞進(jìn)行觀測(cè),觀測(cè)原理如圖1所示。

    圖1 顯微鏡的觀測(cè)原理Fig.1 Schematic diagram of microscope observation principle

    通過幾何關(guān)系可知,口徑為60 mm的顯微鏡頭以30°的角度觀察時(shí),為使水平方向可觀察距離x>50 mm,則要求顯微鏡頭的工作距離大于80 mm。同時(shí),由于觀察角度較大,導(dǎo)致物面與光軸是傾斜的,因此還要求光學(xué)系統(tǒng)擁有較大的景深。

    通過伺服控制系統(tǒng)控制細(xì)胞工廠和傾斜的長工作距顯微鏡的運(yùn)動(dòng),可實(shí)現(xiàn)自動(dòng)觀測(cè)的目的,可分別觀測(cè)到細(xì)胞工廠1~40層側(cè)邊一個(gè)矩形區(qū)域內(nèi)的細(xì)胞生長狀況,通過將細(xì)胞工廠旋轉(zhuǎn)一面的觀察,就可以看到另一側(cè)的一個(gè)矩形區(qū)域內(nèi)細(xì)胞生長狀況,大大增加了可觀測(cè)面積。細(xì)胞工廠內(nèi)細(xì)胞培養(yǎng)表面的寬度為200 mm,當(dāng)水平方向可觀察距離x=50 mm時(shí),細(xì)胞工廠被觀察面積達(dá)到了50%,觀察率遠(yuǎn)大于日本同類產(chǎn)品。

    2 長工作距顯微光學(xué)系統(tǒng)設(shè)計(jì)

    由細(xì)胞工廠單層尺寸(335 mm×205 mm×17 mm)決定,為了清晰全方位地觀察細(xì)胞,需要顯微鏡頭在具備較高分辨率和放大倍率的情況下,還要有較長的工作距離。通過對(duì)相關(guān)參數(shù)的計(jì)算,要求該光學(xué)系統(tǒng)的工作距要大于80 mm,而超長的工作距離給光學(xué)設(shè)計(jì)帶來困難。

    因此,在設(shè)計(jì)上采用李斯特顯微物鏡作為初始結(jié)構(gòu)形式,后方為卡塞格林系統(tǒng),光學(xué)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)如圖2所示。以李斯特顯微物鏡的兩組雙膠合透鏡中心為對(duì)稱軸,光學(xué)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)近似對(duì)稱,可對(duì)垂軸像差(即彗差、畸變、垂軸色差)有效減小。初始結(jié)構(gòu)中第一組負(fù)光焦度的雙膠合透鏡彎向光闌,可以有效校正像散[2-7]。

    圖2 初始結(jié)構(gòu)Fig.2 Initial structure diagram

    筆者選用像元尺寸為3.75 μm,最高分辨率為1280×960的120萬像素CCD高分辨率工業(yè)數(shù)字相機(jī),通過計(jì)算得出光學(xué)系統(tǒng)的相關(guān)參數(shù)。

    其中,像高為

    (1)

    (2)

    根據(jù)經(jīng)驗(yàn),當(dāng)線視場高度2y小于物鏡焦距的120時(shí),CCD相機(jī)的成像質(zhì)量是滿意的,設(shè)計(jì)所選取的是1/3英寸的CCD傳感器,根據(jù)公式要求,線視場2y=1.2 mm,物鏡焦距為60 mm,滿足上述條件[8]。

    通過對(duì)光學(xué)系統(tǒng)初始結(jié)構(gòu)進(jìn)行像差分析校正,經(jīng)優(yōu)化后最終設(shè)計(jì)結(jié)果如圖3所示,光學(xué)系統(tǒng)的長度為461.9 mm,工作距離為85 mm,放大倍率β=5×,數(shù)值孔徑NA=0.3,線視場物高2y=1.2 mm,系統(tǒng)的遮攔比為30%。

    圖3 最終結(jié)構(gòu)示意圖Fig.3 Final structure diagram

    光學(xué)系統(tǒng)的成像質(zhì)量評(píng)價(jià)參數(shù):光學(xué)調(diào)制傳遞函數(shù)(MTF)曲線、不同物方線視場(OBJ)的光線在像面(IMA)中呈現(xiàn)的點(diǎn)列圖以及系統(tǒng)能量圖分別如圖4中(a)~(c)所示。

    從圖4(a)MTF傳遞函數(shù)特征曲線可以看出,當(dāng)物方線視場為0 mm、0.35 mm和0.6 mm,子午方向的傳遞函數(shù)(T)和弧矢方向的傳遞函數(shù)(S)在中頻66 lp/mm處MTF值大于0.5,在高頻133 lp/mm,即CCD截止頻率時(shí)MTF值約為0.3,并且各個(gè)視場的子午面和弧矢面重合較好,有較好的成像質(zhì)量。

    從圖4(b)不同物方線視場的光線在像面中呈現(xiàn)的點(diǎn)列圖中可以看出,光學(xué)系統(tǒng)的彌散斑大小非常接近愛里斑直徑,并且物方線視場為0、0.35、0.6 mm的光線在像面上的均方根彌散斑分別為3.19、1.939、2.883 μm,均小于所選用的CCD相機(jī)的像元尺寸3.75 μm,因此該光學(xué)系統(tǒng)有很好的分辨率,成像質(zhì)量良好,不會(huì)因?yàn)槭艿诫s散光的影響導(dǎo)致彌散斑過大,分辨不清細(xì)胞圖像。

    從圖4(c)系統(tǒng)能量圖中可以看出,光學(xué)系統(tǒng)能量集中度較高,通過系統(tǒng)到達(dá)探測(cè)器的光能高,光學(xué)系統(tǒng)成像清晰,滿足適用于生物反應(yīng)器觀察的生物顯微鏡的使用要求。

    3 伺服控制系統(tǒng)設(shè)計(jì)

    3.1 細(xì)胞工廠自動(dòng)監(jiān)測(cè)裝置機(jī)械結(jié)構(gòu)

    在對(duì)細(xì)胞工廠的觀察過程中,傾斜光學(xué)顯微鏡頭與其照明系統(tǒng)相對(duì)位置固定。在移動(dòng)過程中,為使觀察檢測(cè)目標(biāo)不脫離觀測(cè)視場,要求機(jī)械系統(tǒng)具有較高的傳動(dòng)穩(wěn)定性和傳動(dòng)精度,運(yùn)動(dòng)采用閉環(huán)控制。監(jiān)測(cè)裝置的機(jī)械結(jié)構(gòu)以及各軸的定義如圖5所示。

    圖5 細(xì)胞工廠自動(dòng)監(jiān)測(cè)裝置的機(jī)械結(jié)構(gòu)Fig.5 The mechanical structure diagram of cell factory automatic monitoring device

    監(jiān)測(cè)裝置4軸分別為:光學(xué)系統(tǒng)水平軸(X軸)、光學(xué)系統(tǒng)豎直軸(Y軸)、細(xì)胞工廠進(jìn)給軸(Z軸)、細(xì)胞工廠旋轉(zhuǎn)軸(W軸)。在監(jiān)測(cè)裝置機(jī)械結(jié)構(gòu)中,機(jī)座是監(jiān)測(cè)裝置的底座,旋轉(zhuǎn)機(jī)構(gòu)和豎直運(yùn)動(dòng)機(jī)構(gòu)均安裝在機(jī)座上,通過控制4軸的運(yùn)動(dòng),實(shí)現(xiàn)光學(xué)系統(tǒng)相對(duì)于細(xì)胞工廠按照需要進(jìn)行相對(duì)位置移動(dòng)。

    進(jìn)給機(jī)構(gòu)將細(xì)胞工廠移動(dòng)到光學(xué)系統(tǒng)的視場中,通過控制豎直運(yùn)動(dòng)機(jī)構(gòu)控制光學(xué)系統(tǒng)到達(dá)細(xì)胞工廠所需觀測(cè)層的位置。水平移動(dòng)機(jī)構(gòu)控制光學(xué)系統(tǒng)到達(dá)細(xì)胞工廠被觀測(cè)層的觀測(cè)位置,繼續(xù)控制水平軸運(yùn)動(dòng)開始對(duì)細(xì)胞工廠內(nèi)部細(xì)胞進(jìn)行深度方向的一維觀測(cè),通過控制進(jìn)給機(jī)構(gòu)移動(dòng)細(xì)胞工廠某實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞工廠被觀測(cè)層的二維觀測(cè),可觀測(cè)一個(gè)矩形區(qū)域。觀測(cè)完細(xì)胞工廠的一個(gè)側(cè)面之后,控制旋轉(zhuǎn)機(jī)構(gòu)使細(xì)胞工廠旋轉(zhuǎn)180°,繼續(xù)對(duì)細(xì)胞工廠的另一個(gè)側(cè)面進(jìn)行觀測(cè),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞工廠內(nèi)所培養(yǎng)細(xì)胞的全局觀測(cè)。

    3.2 控制系統(tǒng)硬件結(jié)構(gòu)

    該生物顯微鏡的控制系統(tǒng)主要由人機(jī)交互系統(tǒng)、主控制器、伺服控制系統(tǒng)、通信系統(tǒng)等組成,控制系統(tǒng)結(jié)構(gòu)如圖6所示。

    圖6 細(xì)胞工廠自動(dòng)監(jiān)測(cè)裝置控制系統(tǒng)結(jié)構(gòu)Fig.6 The control system structure diagram of cell factory automatic monitoring device

    伺服控制器A、B、C、D分別控制運(yùn)動(dòng)軸X、Y、Z、W的伺服電機(jī)M。人機(jī)交互系統(tǒng)是細(xì)胞工廠自動(dòng)監(jiān)測(cè)裝置的人機(jī)交互工具,通過RS485通信與主控制器進(jìn)行數(shù)據(jù)交互。該系統(tǒng)的主要功能是:檢測(cè)控制系統(tǒng)的狀態(tài)信息,并接收其發(fā)來的數(shù)據(jù),顯示顯微光學(xué)系統(tǒng)的當(dāng)前位置;向主控制器發(fā)送伺服驅(qū)動(dòng)器控制命令和控制參數(shù);向主控制器發(fā)送CCD相機(jī)圖像采集控制命令;向主控制器發(fā)送編譯好的自動(dòng)控制程序及控制命令;錯(cuò)誤報(bào)警、故障檢測(cè)及緊急事件響應(yīng)。

    主控制器是細(xì)胞工廠自動(dòng)監(jiān)測(cè)裝置控制系統(tǒng)的核心,其處理器主要由 DSP模塊和FPGA模塊組成,其中DSP采用TI公司的浮點(diǎn)型DSP-TMS320F28335芯片,F(xiàn)PGA采用Altera公司的EP3C40F324芯片[9]。FPGA可以完成高速并行硬件操作,因其不適合浮點(diǎn)運(yùn)算,所以采用 32位的高速數(shù)字信號(hào)處理器DSP來完成浮點(diǎn)運(yùn)算。針對(duì)DSP和FPGA芯片的各自特點(diǎn),對(duì)控制器進(jìn)行功能劃分,如圖7所示。以DSP芯片作為主控制器,主要負(fù)責(zé)接收人機(jī)交互系統(tǒng)發(fā)送的速度指令,完成速度環(huán)和電流環(huán)的計(jì)算;以FPGA芯片作為協(xié)控制器,主要負(fù)責(zé)和伺服系統(tǒng)間的通信、伺服電機(jī)轉(zhuǎn)速的計(jì)數(shù)、PWM控制信號(hào)的調(diào)制以及系統(tǒng)故障處理等功能。

    圖7 主控制器功能Fig.7 Function block diagram of main controller

    DSP芯片通過其內(nèi)部的XINTF接口,分別擴(kuò)展SRAM和FLASH兩個(gè)外部存儲(chǔ)芯片。SRAM主要作為在程序運(yùn)行時(shí)的內(nèi)存,在其中存儲(chǔ)了相應(yīng)的控制信息,便于對(duì)控制系統(tǒng)的性能進(jìn)行分析;FLASH芯片在DSP啟動(dòng)時(shí)用于加載程序。通過PWM波定時(shí)器產(chǎn)生的中斷,DSP芯片不斷讀取來自FPGA的轉(zhuǎn)速計(jì)數(shù)信號(hào)和電流采樣信號(hào);DSP芯片通過運(yùn)行速度環(huán)的控制算法和電流環(huán)的矢量控制算法,得出相應(yīng)的控制指令并發(fā)送給FPGA,完成與FPGA間的通信。FPGA芯片作為協(xié)控制器來輔助DSP進(jìn)行控制,其采用模塊設(shè)計(jì)方式將FPGA需要完成的功能分為各個(gè)獨(dú)立的功能模塊,并在頂層實(shí)體中對(duì)各個(gè)獨(dú)立的功能模塊進(jìn)行直接調(diào)用。FPGA的功能模塊主要為A/D采樣模塊、PWM產(chǎn)生模塊、通信模塊、轉(zhuǎn)速計(jì)數(shù)模塊及故障保護(hù)模塊。

    3.3 控制算法實(shí)現(xiàn)

    該生物顯微鏡采用永磁同步電機(jī)作為動(dòng)力源,控制算法主要由電流環(huán)和速度環(huán)組成,控制結(jié)構(gòu)如圖8所示。為使電磁力矩最大,則要求電流環(huán)的直軸電流分量Id=0,使電流環(huán)可以實(shí)時(shí)、準(zhǔn)確地捕獲電流指令信號(hào),因此其控制器采用系統(tǒng)響應(yīng)快并且能消除靜態(tài)誤差的PI控制器。

    圖8 永磁同步電機(jī)控制結(jié)構(gòu)Fig.8 Structure of permanent magnet synchronous motor control

    速度環(huán)可以有效增強(qiáng)系統(tǒng)的抗負(fù)載擾動(dòng)能力,抑制速度波動(dòng),實(shí)現(xiàn)穩(wěn)態(tài)無靜差。該生物顯微鏡的圖像采集系統(tǒng)采用幀率為30 fps的120萬像素1/3″Gige千兆網(wǎng)口CCD工業(yè)相機(jī),在顯微光學(xué)系統(tǒng)實(shí)時(shí)運(yùn)動(dòng)時(shí),為觀察實(shí)時(shí)圖像,要求該系統(tǒng)運(yùn)動(dòng)速度波動(dòng)非常小。顯微光學(xué)系統(tǒng)與其光源固定在同一個(gè)C形支架上進(jìn)行運(yùn)動(dòng),整個(gè)運(yùn)動(dòng)體的質(zhì)量較大,慣性較大,當(dāng)處于低速運(yùn)行時(shí),導(dǎo)軌的摩擦等非線性因素造成低速運(yùn)動(dòng)的抖動(dòng),影響對(duì)細(xì)胞的觀測(cè)質(zhì)量。常規(guī)的PI控制算法并不能很好地解決該生物顯微鏡低速平穩(wěn)運(yùn)行問題,因而采用一種單神經(jīng)元自適應(yīng)PI控制器對(duì)永磁同步電機(jī)進(jìn)行控制,實(shí)現(xiàn)對(duì)生物顯微鏡低速狀態(tài)下的控制[10]。

    控制器輸入為r(k),輸出為y(k),控制所需的狀態(tài)變量為x1(k)、x2(k),狀態(tài)變量的形式與常規(guī)PI控制相同,單神經(jīng)元通過對(duì)加權(quán)系數(shù)的調(diào)整來實(shí)現(xiàn)自適應(yīng)學(xué)習(xí)功能,因此單神經(jīng)元自適應(yīng)PI控制算法具體可以表示為

    (3)

    (4)

    (5)

    (6)

    (7)

    式中,K為神經(jīng)元比例系數(shù),ωi(k)為對(duì)應(yīng)xi(k)的加權(quán)系數(shù),ηi為比例、積分作用的學(xué)習(xí)率。

    通過現(xiàn)場調(diào)試,調(diào)整比例系數(shù)K和學(xué)習(xí)率ηi就可以使系統(tǒng)獲得較佳的運(yùn)行效果。經(jīng)調(diào)試后伺服控制系統(tǒng)重復(fù)定位精度為5 μm,自動(dòng)觀察一個(gè)40層細(xì)胞工廠僅需2 min。

    4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

    所研制完成的用于觀察細(xì)胞工廠的生物顯微鏡如圖9所示。

    圖9 細(xì)胞工廠生物顯微鏡Fig.9 The physical diagram of cell factory automatic monitoring device

    利用該顯微鏡對(duì)細(xì)胞工廠進(jìn)行了大量的觀測(cè)實(shí)驗(yàn),圖10(a)、(b)、(c)分別是細(xì)胞工廠中第10、20、30層觀察到的人源二倍體細(xì)胞,圖10(d)為應(yīng)用尼康倒置顯微鏡對(duì)單層細(xì)胞工廠中培養(yǎng)的人源二倍體細(xì)胞的觀測(cè)結(jié)果。可以看到,該生物顯微鏡觀察到的細(xì)胞工廠中各層細(xì)胞的界限分辨得很清楚,連續(xù)動(dòng)態(tài)觀察時(shí)穩(wěn)定性較好。

    圖10 細(xì)胞工廠中細(xì)胞觀察效果。(a)第10層細(xì)胞;(b)第20層細(xì)胞;(c)第30層細(xì)胞;(d)尼康顯微鏡觀察到的細(xì)胞Fig.10 Observing effect of cells in cell factory. (a)The 10th layer of cells; (b)The 20th layer of cells; (c)The 30th layer of cells; (d)The cells by Nikon microscope

    5 結(jié)論

    本研究首先利用ZEMAX光學(xué)設(shè)計(jì)軟件,設(shè)計(jì)了一種適用于生物反應(yīng)器觀察的生物顯微鏡的光學(xué)系統(tǒng),并設(shè)計(jì)了采用單神經(jīng)元自適應(yīng)PI控制算法的伺服控制系統(tǒng)。最終得到最小分辨距離為1.1 μm,可連續(xù)觀察細(xì)胞工廠培養(yǎng)皿中細(xì)胞生長狀態(tài)的

    生物顯微鏡。光學(xué)系統(tǒng)成像質(zhì)量優(yōu)良,機(jī)械結(jié)構(gòu)簡單緊湊,控制精度較高,重復(fù)性能良好。

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    The Biological Microscope Design Applied to Observe Bioreactor

    Xu Bing1Yu Yuanhua2Li Qi2Gong Ping2*

    1(CollegeofMechanicalandElectricalEngineering,ChangchunUniversityofTechnology,Changchun130012,China)2(SchoolofLifeScienceandTechnology,ChangchunUniversityofScienceandTechnology,Changchun130022,China)

    microscopy; cell factory; long working distance; adaptive PI

    10.3969/j.issn.0258-8021. 2015. 04.017

    2015-01-01, 錄用日期:2015-06-30

    吉林省科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(20130204035GX)

    TN247

    D

    0258-8021(2015) 04-0501-06

    *通信作者 (Corresponding author),E-mail: gongmch@126.com

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