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      江西省急性髓系白血病NPM1和FLT3-ITD基因突變分析

      2015-05-10 02:01:48簡正偉石淙聞芳萬臘根張長林
      實驗與檢驗醫(yī)學 2015年5期
      關鍵詞:突變率核型中位數(shù)

      簡正偉 ,石淙 ,聞芳 ,萬臘根 ,張長林

      (1、南昌大學第四附屬醫(yī)院檢驗科,江西 南昌330003;2、南昌大學第一附屬醫(yī)院檢驗科,江西 南昌330006)

      急性髓細胞白血病 (acute myeloid leukemia,AML)是多能干細胞發(fā)生突變所形成的一類具有細胞和分子遺傳學特征的高度異質性疾病。隨著分子生物學技術不斷的應用于臨床,越來越多的基因突變檢測對臨床的治療起著重要提示作用。其中NPM1和FLT3-ITD基因是突變率最多見的兩類,2010年美國血液學會 (American Society of hematology)會議已明確[1],NPM1基因突變是AML,尤其是正常核型AML預后良好的指標,而具有FLT3-ITD基因突變患者預后較差。本研究分析187例初發(fā)急性髓細胞白血病患者NPM1和FLT3-ITD基因突變情況,并分析其臨床特征。

      1 材料與方法

      1.1 臨床病例 收集2011年6月至2013年2月南昌大學第一附屬醫(yī)院急性髓細胞白血病初發(fā)病例187例,所有患者都經(jīng)細胞形態(tài)學和流式細胞術免疫學分型,并參照《血液病診斷及療效標準》[2]確診為AML的病例。其中M1占9例,M2占72例,M3占50例,M4占20例,M5占24例,M6占4例。男女比例100:87,中位年齡41(13~79)歲。

      1.2 染色體分析 取肝素抗凝的骨髓液2ml,換算成有核細胞約(1~2)×106/ml,然后分別用直接法和短期培養(yǎng)法制備染色體,采用G顯帶技術進行核型分析。染色體核型描述參照《人類細胞遺傳學國際命名體制(ISCN 2005)》。

      1.3 NPM1和FLT3-ITD突變檢測 取200μlEDTA抗凝骨髓,參照飛捷生物科技公司的微量基因組DNA極速抽提試劑盒提取基因組DNA,獲得的基因組DNA通過紫外分光光度計進行定量,取50~100ng/μl基因組DNA進行基因突變檢測。NPM1突變檢測方法見參考文獻[3]。以特異性引物擴展FLT3-ITD基因突變區(qū),上游引物為5’gcaatttaggtatgaaagccagc-3’, 下游引物為 5’ctttcagattttgacggcaacc-3’,擴展產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析,野生型FLT3擴展產(chǎn)物為329bp,存在ITD突變會在野生型條帶上游出現(xiàn)特異性條帶。

      1.4 統(tǒng)計學分析 應用SPSS17.0統(tǒng)計學軟件進行分析,以中位數(shù)進行統(tǒng)計,P<0.05有統(tǒng)計學意義。

      2 結果

      2.1 NPM1和FLT-ITD突變檢測 采用等位基因特異性PCR(Allele-specific PCR,AS-PCR)方法檢測NPM1基因突變,該方法可以檢測到4種常見的NPM1基因突變(圖1)。采用PCR擴展FLT3基因第12外顯子,通過觀察PCR產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠電泳的遷移情況判斷FLT3-ITD突變(圖2)。在收集到的187初發(fā)急性髓系白血病患者中,共檢查到67例(35.83%)患者存在基因突變,其中39例(20.68%)AML患者存在單一 NPM1突變,15例(8.02%)出現(xiàn)單一FLT3-ITD突變,13例(6.95%)患者同時存在NPM1和FLT3-ITD突變。

      圖1白血病病人NPM1突變檢測

      圖2 FLT3-ITD突變檢測

      2.2 NPM1和FLT-ITD突變與FAB分型關系 見表1。

      表1 白血病病人基因突變情況n(%)

      2.3 臨床資料特征 在187例患者中,有NPM1突變患者和非NPM1突變患者之間在男女比例、中位年齡、血小板中位數(shù)和骨髓原始細胞比例中位數(shù)均沒有差異性,但是白細胞中位數(shù)二者有差異(表2)。在FLT3-ITD突變患者臨床特征分析中,在男女比例、中位年齡、血小板中位數(shù)和非FLT3-ITD突變患者沒有差異性,兩者在白細胞中位數(shù)和骨髓原始細胞比例中位數(shù)有差異性,F(xiàn)LT3-ITD突變患者白細胞中位數(shù)和骨髓原始細胞比例中位數(shù)都比非FLT3-ITD突變患者高(表3)。

      表2 NPM1突變患者臨床特征分析

      表3 FLT3-ITD突變患者臨床特征分析

      2.4 突變和細胞遺傳學的關系 在187例白血病患者中,有72例患者沒有檢測染色體或者檢測了未檢見分裂相,在可分析的115例患者中,80例正常核型當中,有17例(21.3%)NPM1突變;在35例異常核型組中,檢見13例NPM1突變;在正常核型中同時檢測出11例FLT3-ITD突變,突變率為13.8%,而在異常核型組中,檢出8例FLT3-ITD突變,突變率為22.9%,但兩者之間均無統(tǒng)計學意義(表 4)。

      表4 比較白血病病人NPM1和FLT3-ITD突變患者染色體情況

      2.5突變型和野生型療效的比較 187例患者治療效果比較,其中NPM1突變型52例,野生型135例,2組之間≤2個治療周期CR緩解率分別為79.5%和35.8%(P<0.05);FLT3-ITD突變患者28例,野生型159例,兩者之間≤2個治療周期CR緩解率分別為27.6%和72.8%(P<0.05);隨訪時間1~25.6月,中位隨訪周期9.6月。

      此外,我們把187例患者分成NPM1+/FLT3-ITD-組、NPM1-/FLT3-ITD-組、NPM1+/FLT3-ITD+組和NPM1-/FLT3-ITD+組進行療效觀察,2個治療周期CR緩解率分別為82.3%、65.8%、52.9%和26.8%。其中單獨NPM1突變組完全緩解率最高,而單獨FLT3-ITD突變組完全緩解率最低。

      3 討論

      急性髓系白血病AML是起源于造血干細胞的惡性克隆性疾病,具有高度的異質性。一直以來,我們都是通過檢測白血病患者染色體的變異來區(qū)分病人的預后情況。但是對于一些染色體正常核型病人,我們不能很好地區(qū)分患者的預后情況。隨著分子生物學技術不斷地應用于臨床,一些新型基因突變檢測可以很好地對病人治療、預后提供指導價值。在這些基因突變中,NPM1和FLT3-ITD是突變率最高,對預后評估最有價值的兩類基因。

      我們在187例初發(fā)白血病患者中分別檢測出NPM1突變率為27.80%(52/187);檢測出FLT3-ITD突變率為14.97%(28/187)。 和日本學者Suzuki T(24.9%NPM1,22.6%FLT3-ITD)[4];德國學者 Thiede C(27.5%NPM1,21%FLT3-ITD)[5]、泰國學者 Boonthimat C (26%NPM1,33%FLT3-ITD)[6]相比較,NPM1突變率基本接近,但是他們FLT3-ITD突變率都比我們的研究結果要高,可能是由于樣本分布不同和種族差異有關。

      在本研究中NPM1突變主要存在于M5、M2和M1中。丁子軒等[7]研究656例中國急性髓系白血病患者NPM1基因突變情況,其中有169例突變,突變率大約25.8%,其中以M5、M1多見。Jeon Y等[8]研究發(fā)現(xiàn),在83例AML患者中有NPM1突變19例,突變率為22.9%,在形態(tài)學亞型中多見于M5和M2。這和我們的研究結果相近。但是我們研究FLT3-ITD突變多存在于M1、M4中較多見,而國外學者研究病例中FLT3-ITD突變多存在于M3[9],這可能是病例樣本組成不同或者國內外樣本差異有關。

      我們研究FLT3-ITD突變患者在年齡 、性別和血小板中位數(shù)之間差異沒有統(tǒng)計學意義,但是突變陽性患者比陰性患者在白細胞中位數(shù)和骨髓原始細胞比例中位數(shù)均顯著偏高,這和國外研究結果相一致[10]。這可能與FLT3-ITD突變引起近膜區(qū)空間構型改變引起RTK持續(xù)激活,導致細胞增殖有關[11]。而NPM1突變患者在年齡 、性別、血小板中位數(shù)和骨髓原始細胞比例中位數(shù)同陰性患者之間無顯劇差異,但是突變陽性患者白細胞中位數(shù)較陰性患者偏高[12]。

      國內外研究認為NPM1和FLT3-ITD突變在染色體正常核型多見[13],但我們在187病例中只有115例可分析染色體核型,兩者突變在正常核型和異常核型之間并沒有差異性,這與國外研究結果不一致,可能是國內外病例組成不同;另外我們有72例患者沒有檢測出染色體,可能這部分病例有較多正常核型樣本,所以對正異常核型比有一定影響。

      一般研究認為NPM1基因突變是預后良好的指標,存在NPM1基因突變的患者緩解率高,生存期長,并且在疾病進展中比較穩(wěn)定[14,15]。而FLT3-ITD突變意義則相反,一般預后較差。2008年世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)和歐洲造血與血液病理學協(xié)會共同制定AML新的分型分類計劃,認為NPM1基因突變的可以作為AML亞群中獨立的預后指標[16]。我們把NPM1和FLT3-ITD突變陽性和陰性患者在2個治療周期CR緩解率進行比較,發(fā)現(xiàn)NPM1陽性患者在2個治療周期CR緩解率較陰性患者效果好,而FLT3-ITD突變陽性患者則CR緩解率效果差,兩者之間差異均有統(tǒng)計學意義。同時我們按NPM1和FLT3-ITD突變陰陽性分成四組,發(fā)現(xiàn)單獨NPM1突變組完全緩解率最高,而單獨FLT3-ITD突變組完全緩解率最低,這與國內外研究結果相符[17]。

      通過同時檢測NPM1和FLT3-ITD突變情況,可以給臨床白血病患者治療、預后提供指導意義。

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