多種遺傳標(biāo)記親子鑒定1例

孫現(xiàn)鋒，劉亞舉

多種遺傳標(biāo)記親子鑒定1例

VariousGeneticMarkersforPaternityTestinginOneCase

孫現(xiàn)鋒1，劉亞舉2

法醫(yī)遺傳學(xué)；STR突變；遺傳標(biāo)記；親子鑒定

1 案例資料

1.1 案情簡要田某，男，39歲，2011年12月中旬，在外省偏僻山莊被抓獲，20 a前其在原籍搶劫殺人后潛逃，更名為徐某，辦案人員提取其和疑似父母親血樣要求進(jìn)行親緣關(guān)系鑒定比對。

1.2 檢驗過程及結(jié)果Chelex100法和磁珠法提取基因組DNA，采用Identifiler試劑盒(美國AB公司)進(jìn)行STR檢驗，發(fā)現(xiàn)CSF1PO基因座不符合孟德爾遺傳規(guī)律。隨后，依次采用了PowerPlex21(美國Promega公司)、Yfiler(美國AB公司)、AGCU 21+1和AGCU X-12(無錫中德美聯(lián)生物公司)、以及Investigator Argus X-12(德國QIAGEN公司)進(jìn)行STR檢驗，又發(fā)現(xiàn)Penta E和DYS458基因座不符合孟德爾遺傳規(guī)律。擴增體系10 μL按試劑盒使用說明書要求完成，運用3130遺傳分析儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳，用GeneMapper ID v3.2軟件進(jìn)行基因分型。最后擴增了mtDNA HVI區(qū)(16 000～16 385)區(qū)間片段，擴增產(chǎn)物經(jīng)純化后采用Big-Dye 試劑盒進(jìn)行測序反應(yīng)，兩者相同突變點，如下：16174T、16223T、16311N、16362C。將常染色體STR基因座，參照行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)《法庭科學(xué)DNA親子鑒定規(guī)范》(GA/T965-2011)和司法部的《親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》(SF/ZJD0105001-2010)對基因座及突變基因座進(jìn)行親權(quán)指數(shù)(PI)、累積親權(quán)指數(shù)(CPI)和親權(quán)概率(W)計算，各STR基因座分型結(jié)果和PI值計算結(jié)果見表1，X-STR和Y-STR分型結(jié)果見表2、3，計算所用STR基因座等位基因頻率依據(jù)中國漢族人群、平均突變率數(shù)據(jù)資料來自文獻(xiàn)[1]。

表1 40個STR基因座分型結(jié)果與親權(quán)指數(shù)

①不符合孟德爾遺傳規(guī)律的STR 基因座。PI：親權(quán)指數(shù)；CPI：累積親權(quán)指數(shù)；W：親權(quán)概率。

表2 X-STR分型結(jié)果

表3 Y-STR分型結(jié)果

2 討論

本案例是反轉(zhuǎn)親子鑒定，屬于父母皆疑，疑似母親與兒子40個常規(guī)STR、22個X-STR和mtDNA HVI區(qū)進(jìn)行比對時不排除親子關(guān)系；但將疑似父親與兒子40個常規(guī)STR和16個Y-STR進(jìn)行比對時,在Penta E、CSF1PO和DYS458基因座的基因型不符合遺傳規(guī)律的現(xiàn)象；將父母作為一個整體考慮時，他們與兒子仍舊在Penta E和CSF1PO基因座的基因型違反孟德爾遺傳規(guī)律。在這種情況下，不能輕易排除親子關(guān)系，分析這2個不符合遺傳規(guī)律的基因座有突變，與疑似父親都是減少一個重復(fù)單位，且突變來自父方，這些均符合突變規(guī)律。由于此2個基因座所在的染色體位置不一樣， 可以排除有連鎖遺傳關(guān)系，故推斷本案的Penta E、CSF1PO基因座同時發(fā)生了突變。為了避免受潛在突變影響，按國際法醫(yī)遺傳學(xué)會(ISFG)推薦要求，檢測的每個遺傳標(biāo)記均需計算親權(quán)指數(shù)，包括符合和不符合遺傳規(guī)律的遺傳標(biāo)記，本例按變異方法計算Penta E、CSF1PO基因座的PI值，40個常規(guī)STR基因座計算的CPI值為2.29×1010、W值為0.99999999996。有文獻(xiàn)[2]報道，DYS458在中國漢族人群具有較高的突變率，按照目前國內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)[3-4]，本例可確信父子關(guān)系，認(rèn)為DYS458基因座在本案中也系突變。

本案例尚未檢測低突變的2-等位基因SNP與缺失/插入InDel，但隨著新一代測序儀技術(shù)的推廣使用，將會對突變情況的親子鑒定起到助推作用。建議在親權(quán)鑒定中，當(dāng)1-3個STR基因座不符合遺傳規(guī)律時，為了獲得足夠的系統(tǒng)效能，應(yīng)當(dāng)檢測更多的STR基因座，并且使用不同的試劑盒進(jìn)行相互印證，不應(yīng)以幾個基因座不符合遺傳規(guī)律就考慮排除親權(quán)關(guān)系，同時在統(tǒng)計中應(yīng)計算包括變異的每個基因座的PI值，以CPI來判斷親權(quán)關(guān)系。

[1]李海霞，馬曉燕，張晉湘，等.24個常用STR基因座的突變觀察與分析[J].中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版)，2010,31(1)：13-16.

[2]吳微微，郝宏蕾，任文彥，等.中國漢族人群17個Y-STR基因座突變情況分析[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志，2012,27(6)：455-457.

[3]伍新堯，楊慶恩，劉雅誠，等.親權(quán)鑒定判斷標(biāo)準(zhǔn)和結(jié)論表述的建立[J].中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版)，2010,31(1)：20-22.

[4]伍新堯.高級法醫(yī)學(xué)[M].2版.鄭州：鄭州大學(xué)出版社,2011：426-427.

2014-01-13

1.禹州市公安局刑偵大隊，河南禹州 461670 2.許昌市公安局刑事科學(xué)技術(shù)研究所，河南許昌 461000

孫現(xiàn)鋒(1972-)，男，河南禹州人，主檢法醫(yī)師，從事法醫(yī)病理學(xué)和DNA檢驗工作。

DF795.4

B

1672-688X(2014)01-0064-03