摘要:本文利用常染色體的15個(gè)STR基因座,對(duì)西北特有少數(shù)民族撒拉族進(jìn)行基因掃描,獲得15個(gè)STR位點(diǎn)的A基因頻率、雜合度、個(gè)體識(shí)別能力、非父排除率、累計(jì)非父排除率、耦合率和多態(tài)信息含量等遺傳信息,顯示15個(gè)STR位點(diǎn)具有中度或高度多態(tài)性,結(jié)論:所選擇的15個(gè)STR位點(diǎn)具有中等或較高的個(gè)體識(shí)別力和多態(tài)性信息量,可用于群體遺傳學(xué)和法醫(yī)學(xué)研究。
關(guān)鍵詞:西北特有少數(shù)民族;STR基因座;遺傳多態(tài)性
撒拉族是三個(gè)位于中國西北部的特有少數(shù)民族,其語言屬阿爾泰語系突厥語族西匈奴語支的烏古斯語組,主要聚居在今天甘青結(jié)合部的青海循化、化隆二縣以及甘肅省積石山縣大河家一帶。據(jù)2000年第五次全國人口普查資料,全國的撒拉族人口為104503人。
短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)屬微衛(wèi)星DNA序列,重復(fù)單位為2~7 bp。STR基因座在人類基因組中含量豐富,分布廣泛,據(jù)估計(jì)三核苷酸和四核苷酸重復(fù)序列的STR基因座約有20萬個(gè),平均每隔15~20 kb就有一個(gè)。它不僅是繪制基因組物理圖譜和遺傳連鎖分析的理想標(biāo)記,也是群體遺傳學(xué)和法醫(yī)遺傳學(xué)高信息基因座的豐富來源。在法醫(yī)同一認(rèn)定、親緣關(guān)系鑒定、人口遺傳結(jié)構(gòu)和疾病相關(guān)性研究等方面發(fā)揮重要作用[1]。
1資料與方法
1.1一般資料 撒拉族多名無關(guān)個(gè)體FTA血卡樣本全部來自日常案檢積累。
1.2方法 采用美國AB公司AmpFSTR○R華夏TMPCR直接擴(kuò)增試劑盒,在AB 9700型擴(kuò)增儀上對(duì)15個(gè)STR基因座進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系為10?滋l,PCR產(chǎn)物經(jīng)AB 3500XL毛細(xì)管電泳,用GeneMapper○RID-X 1.0.1版進(jìn)行電泳數(shù)據(jù)分析。應(yīng)用PowerStats軟件計(jì)算,得到15個(gè)STR基因座的基因頻率、觀察雜合度(Ho)、個(gè)體識(shí)別能力(DP)、非父排除率(PE)、耦合率(Pm)和多態(tài)信息含量(PIC)[2]。
2結(jié)果與討論
西北特有撒拉族人群無關(guān)個(gè)體15個(gè)STR基因座等位基因及其頻率分布見表1。各基因座的群體遺傳學(xué)參數(shù)見表2。撒拉族人群中,個(gè)體識(shí)別力0.50~0.84,D8S1179最低,多態(tài)性信息含量0.50~0.80,非父排除率0.08~1.00。說明這15個(gè)STR在撒拉族群體中具有較高多態(tài)性,可以用于該地區(qū)法醫(yī)學(xué)親子鑒定和個(gè)體識(shí)別。
參考文獻(xiàn):
[1]陶曉嵐,姚宏兵,郝思靜.甘肅東鄉(xiāng)族人群15個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性[J]法醫(yī)學(xué)雜志,2014,V30(2):135-136
[2]伍新堯.高級(jí)法醫(yī)學(xué)[M]鄭州大學(xué)出版社,2002:289-292.
編輯/許言