新型隱球菌生態(tài)學(xué)和種群結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展

陶星辰，劉曉英，劉碩然，蘇鴻雁*

（1.大理學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院，云南大理 671000;2.大理學(xué)院農(nóng)學(xué)與生物科學(xué)學(xué)院，云南大理 671003）

新型隱球菌生態(tài)學(xué)和種群結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展

陶星辰1，劉曉英1，劉碩然2，蘇鴻雁2*

（1.大理學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院，云南大理 671000;2.大理學(xué)院農(nóng)學(xué)與生物科學(xué)學(xué)院，云南大理 671003）

新型隱球菌是廣泛存在于環(huán)境中的病原真菌，其流行病學(xué)與各個(gè)變種的生態(tài)學(xué)密切相關(guān)。近年來(lái)，隱球菌病的發(fā)病率越來(lái)越高，所以研究自然環(huán)境中新型隱球菌各個(gè)變種的生態(tài)學(xué)、種群結(jié)構(gòu)以及季節(jié)性流行變化，對(duì)及時(shí)有效地預(yù)防和控制隱球菌病的發(fā)生與傳播有著重要意義。對(duì)國(guó)內(nèi)外自然環(huán)境中新型隱球菌各個(gè)變種的生態(tài)學(xué)、種群結(jié)構(gòu)以及季節(jié)性的流行變化的研究概況及研究成果進(jìn)行了概述。

新型隱球菌；生態(tài)學(xué)；種群結(jié)構(gòu)；季節(jié)性變化

新型隱球菌（Cryptococcus neoformans）屬于擔(dān)子菌門Basidiomycota、銀耳綱Tremenomycetes、銀耳目Tremellales、銀耳科Tremellaceae、隱球菌屬Cryptococcus，為酵母樣真菌，其屬名源于希臘語(yǔ)“kryptos”，意為隱藏的意思，即不能產(chǎn)生內(nèi)生孢子〔1〕。該菌于1894年被確認(rèn)為是一種人的致病菌，是由Otto Busse、Hora?ham Buschke和Sanfelice分別從人體和桃汁中分離出來(lái)并予報(bào)道的〔2〕。目前將新型隱球菌分為3個(gè)變種，即格魯比變種Cryptococcus neoformans var.grubii，新生變種Cryptococcus neoformans var.neoformans和格特變種Cryptococcus neoformans var.gattii。根據(jù)新型隱球菌細(xì)胞外莢膜多糖的抗原性差異，將新型隱球菌分為A、B、C、D和AD 5種血清型〔3〕。這種分類法成為新型隱球菌經(jīng)典的分類法，為分類學(xué)研究、流行病學(xué)研究和毒力因子研究奠定了基礎(chǔ)。新型隱球菌屬于環(huán)境來(lái)源的病原真菌，其流行病學(xué)和各個(gè)變種的生態(tài)學(xué)密切相關(guān)。目前我國(guó)尚未對(duì)不同地理環(huán)境下新型隱球菌進(jìn)行系統(tǒng)調(diào)查研究，故對(duì)環(huán)境中新型隱球菌變種的研究進(jìn)行概述。

1 新生隱球菌

在20世紀(jì)70年代中期，Kwon-Chung等〔4〕將新型隱球菌分為兩類：新生變種（血清型A、D和AD型）和格特變種（血清型B和C）。到了20世紀(jì)90年代末期，F(xiàn)ranzot等通過對(duì)URA5基因的核苷酸序列分析研究發(fā)現(xiàn)，血清型A菌株的URA5基因的核苷酸序列平均相差（3.0±1.7）bp，而血清型D菌株的URA5基因核苷酸序列平均相差（7.2±3.4）bp，血清型A與血清型D之間堿基差異為（41.9±2.7）bp，通過系統(tǒng)發(fā)育圖也可發(fā)現(xiàn)血清型A和血清型D是兩個(gè)完全不同的群組；因此Franzot等承認(rèn)這些遺傳差異以及之前報(bào)道的表型差異，將血清型A從新生變種中分離出來(lái)形成一個(gè)新的變種即格魯比變種〔5〕。

1.1新生隱球菌生態(tài)學(xué)新生隱球菌血清型A在全世界廣泛分布，而血清型D則主要分布在歐洲地區(qū)〔6〕。它們與鳥糞之間存在著某種聯(lián)系，尤其是鴿糞〔7〕。在自然界中，鳥類的體內(nèi)平均溫度達(dá)42.5℃，而該溫度會(huì)抑制隱球菌生長(zhǎng)，鴿子很少感染隱球菌，Swinne-Desgain等〔6〕研究發(fā)現(xiàn)鴿子的喙、爪子和羽毛也可以作為新生隱球菌的傳播媒介。新鮮鴿糞中高濃度的氨也會(huì)抑制其生長(zhǎng)，相比之下，暴露于空氣中的干燥鴿糞中會(huì)比較容易分離到新生隱球菌。干燥鴿糞為新生隱球菌提供了一個(gè)天然的優(yōu)良生長(zhǎng)環(huán)境，在此環(huán)境中，新生隱球菌可以分解代謝高濃度的尿素、兒茶酚胺和其它含氮化合物，為其生長(zhǎng)提供能量〔8〕。近年來(lái)，不斷有新生隱球菌從世界各地不同樹種中分離出的報(bào)道，包括在阿根廷、哥倫比亞、巴西、印度、南非和泰國(guó)。同樣有報(bào)道，新生隱球菌也可以從蝙蝠洞、腐爛的蔬菜、水果、昆蟲、乳制品和土壤中分離，但無(wú)論是陽(yáng)性率還是生物量都遠(yuǎn)低于鴿糞標(biāo)本〔6〕。

1.2新型隱球菌新生變種種群結(jié)構(gòu)（血清型D）由于對(duì)新型隱球菌血清型D（VNⅣ）的研究相對(duì)較少，繼而與它們種群相關(guān)的信息十分有限。通過MLEE技術(shù)對(duì)新型隱球菌新生變種遺傳多樣性進(jìn)行初步探索，并且從6株地理分布不同的血清型D菌株之間鑒定出5種基因型〔9〕。隨后的研究中，使用不同的遺傳標(biāo)記和不同來(lái)源的菌株，在血清型D菌株種群內(nèi)并沒有發(fā)現(xiàn)基因重組〔10〕。

雖然無(wú)性繁殖是新生隱球菌主要的繁殖形式，但是AD雜合菌株的出現(xiàn)表明新生隱球菌種群之間可以發(fā)生重組。在臨床與環(huán)境中的血清型A和D菌株中，MATɑ和a型菌株數(shù)的比例為40:1，顯示出MATɑ型所處的明顯優(yōu)勢(shì)地位〔10〕。AD雜合菌株交配型等位基因比例相對(duì)均衡，因?yàn)榇蠖鄶?shù)雜合菌株具有兩種交配型等位基因，在雜合過程中，其中一些從血清型D菌株中獲得MATa和從血清型A菌株中獲得MATɑ，而另外一些則從血清型D菌株中獲得MATɑ和從血清型A菌株中獲得MATa；在對(duì)兩個(gè)多態(tài)核基因序列分析中發(fā)現(xiàn)，14株AD雜合菌株的每個(gè)位點(diǎn)含有不同的等位基因；一個(gè)等位基因類似于血清型A菌株，另一個(gè)則類似于血清型D菌株。由于血清型D菌株樣本數(shù)量較少，因此血清型D菌株種群結(jié)構(gòu)與地理區(qū)域分布的關(guān)系并沒有被系統(tǒng)研究〔6〕。

1.3新型隱球菌格魯比變種種群結(jié)構(gòu)（血清型A）全世界90%以上的隱球菌病是由新型隱球菌格魯比變種引起的。該變種廣泛存在于環(huán)境中，如今已成功地從土壤、腐爛的樹木以及鳥類糞便中分離得到，以陳舊的鴿糞最常見〔11〕，其種群結(jié)構(gòu)和分子流行病學(xué)已經(jīng)得到廣泛研究。早期，多位學(xué)者通過RFLP〔12〕、多位點(diǎn)酶電泳〔13〕和PCR指紋技術(shù)〔14〕對(duì)血清型A菌株進(jìn)行分子流行病學(xué)方面的研究，研究發(fā)現(xiàn)血清型A菌株種群之間具有較低的遺傳多樣性。此研究結(jié)果后來(lái)被Jianping Xu等〔6〕所證實(shí)，他分析了314株血清型A菌株的3個(gè)基因位點(diǎn)和一個(gè)線粒體基因座，在全球種群抽樣中未發(fā)現(xiàn)地理區(qū)域分布的差異性。Boekhout等人〔15〕選用來(lái)自13個(gè)國(guó)家的96株臨床和環(huán)境菌株，通過AFLP基因分型并分析遺傳多樣性，也得到了類似的結(jié)果。同樣，Lit?vintseva等〔16〕在美國(guó)利用AFLP技術(shù)對(duì)臨床和環(huán)境中血清型A菌株進(jìn)行基因分型并分析它們的遺傳多樣性，結(jié)果發(fā)現(xiàn)血清型A菌株種群之間具極低水平的遺傳變異性。此外，早期的研究表明，無(wú)論是在環(huán)境中還是臨床上，擁有等位基因MATɑ血清型A菌株都占主導(dǎo)地位〔17〕。

全球血清型A菌株的種群包括3個(gè)亞群：VNⅠ、VNⅡ和VNB。VNⅠ和VNⅡ世界范圍內(nèi)廣泛分布，而VNB僅分布于非洲〔18〕。AFLP和DNA指紋技術(shù)用于VNⅠ和VNⅡ亞種群分布的研究。VNⅠ分布廣泛，具較低的遺傳多樣性，VNⅡ相對(duì)罕見且主要從臨床標(biāo)本中分離得到。2003年，在博茨瓦納發(fā)現(xiàn)不尋常的血清型A臨床菌株之后，學(xué)術(shù)界對(duì)格魯比變種種群結(jié)構(gòu)的認(rèn)識(shí)發(fā)生改變，格魯比變種種群可以發(fā)生高度遺傳變異，MATa交配型在實(shí)驗(yàn)條件下能夠發(fā)生配對(duì)和重組〔19〕。先前認(rèn)為MATa交配型菌株已經(jīng)滅絕，但在2000年〔20〕和2001年〔21〕，MATa交配型菌株首次被報(bào)道仍然存在。在隨后的調(diào)查研究中，通過MLST方法對(duì)博茨瓦納格魯比變種種群進(jìn)行基因分型，結(jié)果發(fā)現(xiàn)博茨瓦納格魯比變種種群非常多樣化且多數(shù)分布在非洲南部〔18〕。Bovers等〔8〕對(duì)117株新生隱球菌和格特隱球菌的6個(gè)基因位點(diǎn)進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析，證實(shí)血清型A的3個(gè)基因型確實(shí)存在，且發(fā)現(xiàn)VNB菌株不完全局限于非洲南部。Ngamskulrungroj等〔22〕通過MLST研究同樣也發(fā)現(xiàn)少數(shù)VNB菌株分布在美國(guó)南部地區(qū)，來(lái)自其他地域VNB菌株間的遺傳多樣性顯著低于非洲VNB菌株，另外，在不是非洲來(lái)源的VNB菌株中未發(fā)現(xiàn)交配型等位基因MATɑ?？傮w而言，目前的數(shù)據(jù)表明，雖然少數(shù)VNB菌株可分布在非洲以外地區(qū)，但大多數(shù)VNB菌株仍局限于撒哈拉以南地區(qū)，主要從非洲可樂豆樹Colophospermum mopane的腐洞中分離獲得〔6〕。

Jianghan Chen等〔23〕通過MLST技術(shù)對(duì)中國(guó)大陸16省的120株新生隱球菌（血清型A，MATɑ）研究發(fā)現(xiàn)，中國(guó)新生隱球菌是區(qū)別于VNⅠ標(biāo)準(zhǔn)菌株的一個(gè)亞群VNⅠc，VNⅠc世界性分布并非中國(guó)獨(dú)有。VNⅠc是否是最常見的基因型尚不清楚，因?yàn)槟壳霸谥袊?guó)只研究分析了臨床菌株，Jianghan Chen等〔23〕認(rèn)為環(huán)境中新生隱球菌的分離及分子分型將會(huì)對(duì)中國(guó)VNⅠc與健康人群之間感染關(guān)系的研究提供重要數(shù)據(jù)。

2 新型隱球菌格特變種（血清型B和血清型C）

新型隱球菌格特變種通過分子指紋技術(shù)（mo?lecular fngerprinting）和基因系譜（gene genealogical analyses）分析將其分為4個(gè)基因型：VGⅠ、VGⅡ、VGⅢ和VGⅣ〔24〕。

2.1新型隱球菌格特變種生態(tài)學(xué)環(huán)境抽樣分析表明4種基因型與腐木、樹皮及土壤關(guān)系密切，尤其是桉樹。1990年Ellis等報(bào)告由澳洲赤桉Eucalyptus camalduensis分離出新型隱球菌格特變種，并提出該變種的臨床感染病例分布與該植物的地理分布一致的觀點(diǎn)〔25〕。然而，尚未清楚桉樹中格特變種高陽(yáng)性率是與桉樹本身有關(guān)，還是實(shí)驗(yàn)偏差。最初格特變種采樣主要集中于三大洲，即澳洲、亞洲、北美，采樣植物主要是赤桉及其他桉樹品種；以往的文獻(xiàn)研究表明，桉樹作為采樣標(biāo)本的頻率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他植物品種。其實(shí)，格特變種同樣也分布于其他樹種中。在印度，格特變種可從當(dāng)?shù)貥淠局?，如印度楝Azadirachta indica、羅晃子Tamarindus indica、芒果樹Mangifera indica、閻浮樹Syzygium cumini等中分離出；在南美，在扁桃樹Terminalia catappa中分離獲得格特變種；在北美，溫哥華島上的花旗松Pseu?dotsuga menziesii、榿木Alnus rubra及西北太平洋地區(qū)其他的樹木都可以分離出格特變種〔6〕。

我國(guó)從澳洲引進(jìn)赤桉歷史久、地域廣，從17°～33°N均有大片的赤桉種植區(qū)，如江西、廣西、廣東等地區(qū)，李安生和吳紹熙等人選擇在6月份和11月份兩次采集該樹樹葉、樹皮、花和花蕊、腐敗木質(zhì)和土壤等標(biāo)本819個(gè)，接種于1 600多個(gè)CACA平皿，結(jié)果未分離到格特變種，李安生和吳紹熙等認(rèn)為可能和該樹種在我國(guó)自然環(huán)境下生長(zhǎng)之后發(fā)生適應(yīng)性變化，和自然生長(zhǎng)環(huán)境因子有關(guān)，此外，也可能與該地區(qū)引種的赤桉系由種子培育而成，原始攜帶的隱球菌孢子量相對(duì)較少也有一定的關(guān)系〔26〕。

2.2新型隱球菌格特變種種群結(jié)構(gòu)目前，大多數(shù)新型隱球菌變種系統(tǒng)地理學(xué)研究應(yīng)用的是來(lái)自不同基因型的組合數(shù)據(jù)，并不能為每個(gè)基因型的多樣性評(píng)估提供充分有效的解決方案〔10〕。Kidd等〔24〕對(duì)新型隱球菌格特變種做了全面的系統(tǒng)學(xué)分析，解決了評(píng)估遺傳多樣性和全球VGⅡ基因型種群結(jié)構(gòu)這一世界性課題。在這項(xiàng)研究中，Kidd等〔24〕分析了來(lái)自不同地理區(qū)域的VGⅠ和VGⅡ基因型的4個(gè)基因位點(diǎn)，但未發(fā)現(xiàn)種群間的地理隔離。另外，他們觀察到菌株之間的差異和地理距離之間沒有相關(guān)性。同樣，F(xiàn)raser等〔27〕采用多位點(diǎn)遺傳分析方法對(duì)新型隱球菌格特變種種群遺傳多樣性進(jìn)行分析，得出相同的結(jié)果。

研究結(jié)果表明，溫哥華持續(xù)爆發(fā)的隱球菌病與VGⅡ基因型密切相關(guān)，主要是VGⅡa和VGⅡb亞型，且已經(jīng)蔓延到不列顛哥倫比亞省〔10〕。VGⅡa亞型主要分布在太平洋西北地區(qū)。在2008年和2009年，從俄勒岡的動(dòng)物體內(nèi)和臨床中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的基因亞型VGⅡc〔28〕。

總而言之，綜合地理采樣和更精準(zhǔn)的遺傳分析相結(jié)合的分析方法，將提高人們對(duì)新型隱球菌格特變種的全球種群結(jié)構(gòu)和起源的理解〔6〕。

3 新型隱球菌季節(jié)性流行變化

近年來(lái)印度學(xué)者Randhawa H.S.研究了印度西北地區(qū)，在不同樹種腐洞中格魯比變種和格特隱球菌流行的季節(jié)變化。研究發(fā)現(xiàn)，格魯比變種和格特隱球菌在秋季的分離率是最高的，其次是在夏季。對(duì)于格特隱球菌而言，其在冬季的流行率是最低的，而格魯比變種最低的流行率則發(fā)生在雨季。同樣，在泰國(guó)北方地區(qū)對(duì)雞糞中新型隱球菌的一項(xiàng)調(diào)查研究中，也出現(xiàn)了相同的結(jié)果〔29〕。Granados等〔30〕做了一項(xiàng)回顧性的研究，他們?cè)诟鐐惐葋喌?個(gè)城市研究分析了樹樣中不同種類的新型隱球菌的流行率與氣候條件的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)格魯比變種比格特隱球菌更耐熱，但過多的水分不利于其生長(zhǎng)。1992年至2004年期間，Kidd等〔31〕在哥倫比亞的4個(gè)城市做了一項(xiàng)關(guān)于在一定氣候條件下樹樣中不同血清型的新型隱球菌分離率的回顧性研究，研究發(fā)現(xiàn)在陽(yáng)性的樣本中，56.5%是血清型B，24.7%是血清型C，18.8%是血清型A，結(jié)果表明環(huán)境氣候條件主要是濕度、溫度和太陽(yáng)輻射會(huì)通過不同方式影響樹木中不同血清型的新型隱球菌的流行率。2007年，Kidd等〔32〕在加拿大的不列顛哥倫比亞和美國(guó)西北部地區(qū)的一份環(huán)境調(diào)研報(bào)告中指出，在溫和、干燥和較低的相對(duì)濕度的夏季（5～8月份）格特隱球菌的菌落的群體密度顯著高于寒冷、潮濕和較高的相對(duì)濕度的月份。目前我國(guó)已有報(bào)道格特變種感染的臨床病例，然而國(guó)內(nèi)尚缺乏對(duì)種植的澳洲赤桉分離到該變種的報(bào)道〔25〕，也未有新型隱球菌季節(jié)性流行變化研究的相關(guān)報(bào)道。

4 展望

近幾十年來(lái)，侵襲性真菌感染的發(fā)病率在全球范圍內(nèi)呈現(xiàn)出持續(xù)上升趨勢(shì)，已成為住院患者致死病殘的主要威脅之一，隱球菌是遍布大自然界的一種擔(dān)子菌病原體，是全球最常見的中樞神經(jīng)系統(tǒng)（CNS）感染病原體之一。隨著國(guó)外對(duì)自然環(huán)境中新型隱球菌研究的深入，國(guó)內(nèi)新生隱球菌和格特隱球菌的生態(tài)學(xué)研究、種群結(jié)構(gòu)研究和季節(jié)性流行變化成為重要的流行病學(xué)研究課題，加強(qiáng)對(duì)新型隱球菌生態(tài)學(xué)和種群結(jié)構(gòu)的研究是我們所要面臨的任務(wù)。

〔1〕CASADEVALL A，PERFECT J R.Cryptococcus neofor?mans〔M〕.American Society for Microbiology，1998:1-121.

〔2〕鄒先彪.新生隱球菌分子生物學(xué)分類方法的研究〔J〕.第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào)，2001，5（1）:167-169.

〔3〕吳媛，盧金星.新型隱球菌分子分型進(jìn)展〔J〕.中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào)，2010，26（9）:867-873.

〔4〕KWON-CHUNG K J，BENNETT J E，THEODORE T S. Cryptococcus bacillisporus sp.nov.serotype BC of Crypto?coccus neoformans〔J〕.International Journal of Systematic Bacteriology，1978，28（4）:616-620.

〔5〕FRANZOT S P，SALKIN I F，CASADEVALL A.Crypto?coccus neoformans var.grubii:separate varietal statusfor Cryptococcus neoformans serotype A isolates〔J〕.Journal of Clinical Microbiology，1999，37（3）:838-840.

〔6〕KOZEL T R，KWON-CHUNG K J，PERFECT J R，et al. Cryptococcus:from human pathogen to modelyeast〔M〕. Washington，DC:ASM press，2011:1-311.

〔7〕CHEE H Y，LEE K B.Isolation of Cryptococcus neofor?mans var.grubii（serotype A）from pigeon droppings in Seoul，Korea〔J〕.Journal of Microbiology，2005，43（5）: 469.

〔8〕FISKIN A M，ZALLES M C，GARRISON R G.Electron cytochemical studies of Cryptococcus neoformans grown on uric acid and related sources of nitrogen〔J〕.Medical My?cology，1990，28（3）:197-207.

〔9〕BRANDT M E，BRAGG S L，PINNER R W.Multilocus enzyme typing of Cryptococcus neoformans〔J〕.Journal of clinical microbiology，1993，31（10）:2819-2823.

〔10〕BOVERS M，HAGEN F，KURAMAE E E，et al.Six monophyletic lineages identified within Cryptococcus neo?formans and Cryptococcus gattii by multilocus sequence typing〔J〕.Fungal Genetics and Biology，2008，45（4）: 400-421.

〔11〕RANDHAWA H S，KOWSHIK T，CHOWDHARY A，et al. The expanding host tree species spectrum of Cryptococcus gattii and Cryptococcus neoformans and their isolations from surrounding soil in India〔J〕.Medical Mycology，2008，46（8）:823-833.

〔12〕FRANZOT S P，HAMDAN J S，CURRIE B P，et al.Mo?lecular epidemiology of Cryptococcus neoformans in Bra?zil and the United States:evidence for both local genetic differences and a global clonal population structure〔J〕. Journal of clinical microbiology，1997，35（9）:2243-2251.

〔13〕BRANDT M E，HUTWAGNER L C，KLUG L A，et al. Molecular subtype distribution of Cryptococcus neofor?mans in four areas of the United States.Cryptococcal Dis?ease Active Surveillance Group〔J〕.Journal of clinical mi?crobiology，1996，34（4）:912-917.

〔14〕BRANDT M E，HUTWAGNER L C，KUYKENDALL R J，et al.Comparison of multilocus enzyme electrophoresisand random amplified polymorphic DNA analysis for mo?lecular subtyping of Cryptococcus neoformans.The Cryp?lococcal Disease Active Surveillance Group〔J〕.Journal of clinical microbiology，1995，33（7）:1890-1895.

〔15〕BOEKHOUT T，THEELEN B，DIAZ M，et al.Hybrid genotypes in the pathogenic yeast Cryptococcus neofor?mans〔J〕.Microbiology，2001，147（4）:891-907.

〔16〕LITVINTSEVA A P，KESTENBAUM L，VILGALYS R，et al.Comparative analysis of environmental and clinical populations of Cryptococcus neoformans〔J〕.Journal of clinical microbiology，2005，43（2）:556-564.

〔17〕VIVIANI M A，NIKOLOVA R，ESPOSTO M C，et al. First European case of serotype A MATa Cryptococcus neoformans infection〔J〕.Emerging infectious diseases，2003，9（9）:1179.

〔18〕LITVINTSEVA A P，THAKUR R，VILGALYS R，et al. Multilocus sequence typing reveals three genetic subpopu?lations of Cryptococcus neoformans var.grubii（serotype A），including a unique population in Botswana〔J〕.Ge?netics，2006，172（4）:2223-2238.

〔19〕LITVINTSEVA A P，MARRA R E，NIELSEN K，et al. Evidence of sexual recombination among Cryptococcus neoformans serotype A isolates in sub-Saharan Afri?ca〔J〕.Eukaryotic cell，2003，2（6）:1162-1168.

〔20〕LENGELER K B，WANG P，COX G M，et al.Identifica?tion of the MATa mating-type locus of Cryptococcus neo?formans reveals a serotype A MATa strain thought to have been extinct〔J〕.Proceedings of the National Academy of Sciences，2000，97（26）:14455-14460.

〔21〕VIVIANI M A，ESPOSTO M C，COGLIATI M，et al.Iso?lation of a Cryptococcus neoformans serotype A MATa strain from the Italian environment〔J〕.Medical Mycolo?gy，2001，39（5）:383-386.

〔22〕NGAMSKULRUNGROJ P，GILGADO F，F(xiàn)AGANELLO J，et al.Genetic diversity of the Cryptococcus species complex suggests that Cryptococcus gattii deserves to have varieties〔J〕.PLoS One，2009，4（6）:e5862.

〔23〕CHEN J，VARMA A，DIAZ M R，et al.Cryptococcus neoformans strains and infection in apparently immuno?competent patients，China〔J〕.Emerging infectious dis?eases，2008，14（5）:755.

〔24〕KIDD S E，GUO H，BARTLETT K H，et al.Comparative gene genealogies indicate that two clonal lineages of Cryp?tococcus gattii in British Columbia resemble strains from other geographical areas〔J〕.Eukaryotic Cell，2005，4（10）:1629-1638.

〔25〕ELLIS D H，PFEIFFER T J.Ecology，life cycle，and in?fectious propagule of Cryptococcus neoformans〔J〕.The Lancet，1990，336（8720）:923-925.

〔26〕李安生，吳紹熙，郭寧如，等.新生隱球菌生態(tài)學(xué)研究〔J〕.臨床皮膚科雜志，2008（1）:3.

〔27〕FRASER J A，GILES S S，WENINK E C，et al.Samesex mating and the origin of the Vancouver Island Crypto?coccus gattii outbreak〔J〕.Nature，2005，437（7063）: 1360-1364.

〔28〕BYRNES III E J，BILDFELL R J，F(xiàn)RANK S A，et al. Molecular evidence that the range of the Vancouver Island outbreak of Cryptococcus gattii infection has expanded in?to the Pacific Northwest in the United States〔J〕.Journal of Infectious Diseases，2009，199（7）:1081-1086.

〔29〕RANDHAWA H S，KOWSHIK T，CHOWDHARY A，et al. Seasonal variations in the prevalence of Cryptococcus neo?formans var.grubii and Cryptococcus gattii in decayed wood inside trunk hollows of diverse tree species in northwestern India:a retrospective study〔J〕.Medical Mycolo?gy，2011，49（3）:320-323.

〔30〕GRANADOS D P，CASTAN~EDAE.Isolation and charac?terization of Cryptococcus neoformans varieties recovered from natural sources in Bogotá，Colombia，and study of ecological conditions in the area〔J〕.Microbial ecology，2005，49（2）:282-290.

〔31〕GRANADOS D P，CASTAN~EDAE.Influence of climatic conditions on the isolation of members of the Cryptococ?cus neoformans species complex from trees in Colombia from 1992-2004〔J〕.FEMS yeast research，2006，6（4）: 636-644.

〔32〕KIDD S E，CHOW Y，MAK S，et al.Characterization of environmental sources of the human and animal pathogen Cryptococcus gattii in British Columbia，Canada，and the Pacific Northwest of the United States〔J〕.Applied and environmental microbiology，2007，73（5）:1433-1443.

*通信作者：蘇鴻雁，教授.

（責(zé)任編輯 毛本勇）

Progresses and Perspectives of Ecology and Population Structure ofCryptococcus neoformans

TAO Xingchen1,LIU Xiaoying1,LIU Shuoran2,SU Hongyan2*
（1.Pre-clinical College,Dali University,Dali,Yunnan 671000,China;2.College of Agriculture and Biology Science,Dali University, Dali,Yunnan 671003,China）

Cryptococcus neoformans is a pathogenic fungi which is widely spread in the environment,and its epidemiology is closely related to the ecology of the various variants.In recent years,with the gradual increasing of cryptococcosis incidence,the study of ecol?ogy of its various variants,population structure in natural environment and changes in seasonal epidemics has great significance for ef?fective prevention and control of the occurrence and transmission of cryptococcosis.This paper reviews the advancements in the study of ecology,population structure in natural environment and changes in seasonal epidemics of Cryptococcus neoformans at domestic and abroad.

Cryptococcus neoformans;ecology;population structure;seasonal change

R379.5

A

1672-2345（2014）06-0066-05

10.3969∕j.issn.1672-2345.2014.06.017

國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目（31060019；31100093）；云南省教育廳重大專項(xiàng)資助項(xiàng)目（ZD2010010）；云南省中青年學(xué)術(shù)帶頭人資助項(xiàng)目（2012HB-042）

2013-12-08

2013-12-18

陶星辰，碩士研究生，主要從事微生物及微生物疾病研究.