劉向標 牛文婷 段江燕
(山西師范大學生命科學學院,臨汾 041000)
土壤鹽漬化影響著人類的農(nóng)業(yè)生產(chǎn),生態(tài)環(huán)境也面臨著嚴峻的挑戰(zhàn)。聯(lián)合國糧農(nóng)組織(FAO)和聯(lián)合國教科文組織(UNESCO)對地球土壤進行分析,得出全世界約1.5億hm2的耕地,0.77億hm2受到鹽化的影響[1]。我國的鹽化地約2 000萬hm2,次生鹽化土壤約670萬hm2,約占全國耕地總面積的14%,次生鹽化土壤面積每年以3%的速度擴大[2]。
種子的萌發(fā)是植物生長的最關(guān)鍵時期,在一定的溫度、水分、濕度條件下萌發(fā)時蛋白質(zhì)的變化反映了植物基因組從休止到開啟的表達情況[3]。近年來出現(xiàn)了大量的有關(guān)植物種子萌發(fā)時期蛋白質(zhì)組學研究的文獻報道:Callard等[4]以擬南芥種子為研究對象,分離到1 300多種蛋白質(zhì)。Fu等[5]對擬南芥做了進一步分析,鑒定出355個獨立基因編碼的437個蛋白點。Yang等[6]對水稻種子萌發(fā)進行蛋白質(zhì)組研究發(fā)現(xiàn),有63種蛋白下調(diào),69種蛋白上調(diào)。這些研究中多集中于擬南芥、水稻等植物,而在重要糧食作物小麥中卻少有報道。小麥擁有抗鹽基因[7],并且有類似的調(diào)節(jié)途徑和抗鹽因子。
2-DE技術(shù)為研究蛋白質(zhì)的動態(tài)變化提供了重要的技術(shù)支撐,可以對生物細胞或組織的蛋白質(zhì)表達進行定量分析,用于揭示不同條件下蛋白質(zhì)表達的變化情況。該技術(shù)具有高通量、高靈敏度、高分辨率、重復(fù)性好等優(yōu)點[8]。蛋白質(zhì)組學技術(shù)在植物種子萌發(fā)過程中鑒定出的蛋白質(zhì),大部分是這一過程中的下游成分,而不是上游成分[9]。同時在所鑒定的相關(guān)蛋白質(zhì)在數(shù)量、種類上還不能組建成詳細的動力學代謝途徑。這些信息的缺乏對我們進一步了解種子萌發(fā)機制是遠遠不足的。因此,我們通過識別NaCl脅迫下小麥種子萌發(fā)的蛋白含量變化的研究,對真正在蛋白質(zhì)水平上進行種子萌發(fā)的研究有重要的意義。
本研究以“晉麥-47”為研究材料,比較不同濃度的NaCl溶液對小麥種子萌發(fā)過程中的抑制作用,確定小麥種子萌發(fā)的NaCl濃度傷害閾值和存活閾值。在小麥萌發(fā)時28 h(胚根突破種皮2-3 mm)時,把胚和胚乳(包含糊粉層)分離,將胚用于2-DE電泳、考馬斯亮藍染色、PDQuest軟件對其進行研究,將有助于我們進一步從時空變化的角度理解NaCl脅迫下對小麥種子萌發(fā)的傷害機制和適應(yīng)機制。
1.1.1 小麥種子 “晉麥-47”由山西省農(nóng)科院小麥研究所提供。
1.1.2 主要試劑 曲拉通X-100、超純水、蒸餾水、丙酮、過硫酸銨(AP)、尿素、硫脲、十二烷基硫酸鈉(SDS)、三羥基甲基氨基甲烷(Tris)、N、N、N、N-四甲基乙二胺(TEMED)、0.1% HgCl2、牛血清蛋白(BSA)、冰乙酸、甘油、兩性電解質(zhì)(Bio-Lyte)1%溴酚藍、1 mol/L鹽酸、CHAPS、碘乙酰胺(IAM)、低熔點瓊脂糖、甘氨酸、丙烯酰胺(Acr)、85%磷酸、二硫蘇糖醇(DTT)、95%乙醇、考馬斯亮藍G-250、甲叉雙丙烯酰胺(Bis)。
1.2.1 不同NaCl濃度對小麥種子萌發(fā)的影響 選取干燥度一致、飽滿、種皮色澤正常的種子420粒。(經(jīng)0.1% HgCl2溶液浸沒消毒2 min后再用純水漂洗5次),置于25 mL純水,鋪有雙層定性濾紙的玻璃培養(yǎng)皿中,每皿60粒蓋上蓋。25℃恒溫避光處理發(fā)芽。在7個培養(yǎng)皿內(nèi)分別加入0、0.05、0.1、0.15、0.2、0.3和0.4 mol/L濃度的NaCl溶液,實時對培養(yǎng)皿進行稱重補充蒸發(fā)的水分,保證各處理組濃度不變。以28 h胚根突破種皮2-3 mm的種子為標準。在4、8、12、16、20、24和28 h隨機取20粒,統(tǒng)計每組的發(fā)芽率,每組均重復(fù)3次。
1.2.2 取樣 根據(jù)不同NaCl濃度對小麥種子發(fā)芽率的影響,選出有顯著差異的3個NaCl濃度,分別是0、0.1和0.2 mol/L。選取干燥度一致、飽滿、種皮色澤正常的小麥種子,按照上述方法進行消毒、沖洗、吸去多余的水分后,分別用0、0.1和0.2 mol/L的NaCl溶液中,在25℃恒溫箱中進行避光培養(yǎng)28 h,以胚根突破種皮2 mm為準,進行取樣,將胚和胚乳(包含糊粉層細胞)進行分離。
1.2.3 小麥種子胚中可溶性蛋白2-DE樣品的制備 按照上述3個濃度處理的小麥種子,用尿素/硫脲法提取小麥種子胚蛋白。取出的胚樣品在液氮中磨成粉末加入離心管中,加入尿素/硫脲蛋白提取液振蕩30 s,離心15 min后,取上清液再重復(fù)離心,收集上清液,加入3倍體積冷丙酮,并放入-20℃的冰箱里過夜,次日收集沉淀(視具體情況可再加一次,離心同上),4℃放置,使丙酮充分發(fā)揮,待沉淀干燥后,溶于400 μL樣品裂解液,4℃冰箱中過夜,第2天離心取上清液,得到蛋白質(zhì)樣品液,4℃放置待用。
1.2.4 小麥種子胚中可溶性蛋白濃度的定量測定 把牛血清蛋白母液(100 mg/L)配成不同濃度用分光光度計測其OD值,得出標準曲線。再根據(jù)測得樣品OD值估算出蛋白樣品的濃度,以此確定后續(xù)試驗中加樣量的一致。進行多次重復(fù)試驗,減少試驗的偶然性幾率。
1.2.5 小麥種子胚可溶性蛋白的2-DE 取出已經(jīng)配好的水化上樣液,加入0.001 g DTT,5 μL的40%Bio-Lyte(pH3-10),充分溶解,取均質(zhì)的水化上樣液與蛋白樣品溶液以4∶1混勻,即為上樣液。采用pH3-10,7 cm線性IPG預(yù)制膠條。主動水化在50 V電壓下12 h后,經(jīng)過250 V 0.5 h、500 V 0.5 h、4 000 V 3 h、最后穩(wěn)定在4 000 V下進行20 000 Vh,500 V快速保持時間視情況而定。聚焦完畢后,膠條先在平衡液Ⅰ[尿素36 g、SDS 2 g、Tris-HCl(pH8.8)25 mL、甘油20 mL、DTT 0.2 g]中,在搖床上平衡15 min,再在平衡液Ⅱ(0.25 g IAM代替0.2 g DTT,其余組分同平衡Ⅰ)中平衡15 min。然后進行第二向SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,分離膠濃度為12%。
1.2.6 考馬斯亮藍染色 剝離凝膠立即放入固定液(12% TCA)中固定2 h,充分固定后用雙蒸水洗3次,每次5 min,取出放入考馬斯亮藍染液(20%甲醇、1.8%磷酸、8%硫酸銨、0.08%的考馬斯亮藍G250染色至少2 h,脫色液(7%、5%甲醇)脫色1 h后換用雙蒸水進行脫色,直到蛋白點清晰為止。
1.2.7 2-DE圖像分析 凝膠用掃描儀(UMAX)進行掃描,得到蛋白圖像用PDQest軟件進行分析包括背景消減、斑點檢測、匹配、蛋白含量表達分析等。
隨著濃度的增大,未萌發(fā)的種子數(shù)目的趨勢增強,選出具有代表不同鹽脅迫下的3個NaCl濃度,即0(對照組)、0.1 mol/L(傷害閾值)、0.2 mol/L(存活閾值),作為鹽脅迫下對小麥種子胚蛋白影響的濃度(圖1)。
由圖1可知,通過不同濃度NaCl處理后小麥萌發(fā)率均下降。濃度越高萌發(fā)率下降的程度越大,對種子的危害程度也越大,這表明NaCl脅迫確實降低了小麥種子的萌發(fā)能力。對不同濃度下NaCl對萌發(fā)率的影響發(fā)現(xiàn),0 mol/L萌發(fā)率為93%、0.05 mol/L萌發(fā)率為89%,發(fā)現(xiàn)之間的萌發(fā)率差異不明顯,說明0.05 mol/L的NaCl對小麥萌發(fā)的影響并不明顯,可以把0.05 mol/L視作小麥種子萌發(fā)過程中的抗鹽閾值;0.1 mol/L萌發(fā)率為68%、0.15 mol/L萌發(fā)率為60%,發(fā)現(xiàn)萌發(fā)率差異不明顯,但是與0 mol/L的萌發(fā)率差異顯著,表明這時的濃度已經(jīng)達到或者超過了小麥種子抗傷害的界限,0.1 mol/L可看作是NaCl溶液對小麥種子的傷害閾值;0.2 mol/L萌發(fā)率為27%、0.3 mol/L萌發(fā)率為19%,此時的萌發(fā)率急劇下降,0.2 mol/L可看作是NaCl溶液對小麥種子存活閾值;0.4 mol/L這個濃度萌發(fā)率接近0,可認為0.4 mol/L為致死濃度。根據(jù)不同濃度NaCl脅迫下萌發(fā)情況,選取了有代表性的3個濃度,分別是0(對照組)、0.1 mol/L(傷害閾值)、0.2 mol/L(存活閾值)作為以下研究的NaCl濃度。本研究討論NaCl脅迫下小麥種子萌發(fā)過程中胚蛋白含量的變化,因此致死濃度0.4 mol/L不在本研究的考慮范圍之內(nèi)。
圖 1 不同濃度NaCl對小麥種子萌發(fā)率的影響
根據(jù)改良Bradford方法測定蛋白質(zhì)含量,并制成標準曲線(圖2)。蛋白質(zhì)上樣量為0.5 mg。由圖2可見,牛血清蛋白的含量與在595 nm的OD值呈線性相關(guān)。
圖2 標準牛血清蛋白曲線
由圖2標準曲線公式可以得出:0.1 mol/L NaCl時 樣 品 的OD值 為0.207,濃 度 為1.096 μg/μL;0 mol/L NaCl時樣品的OD值為0.202,濃度為1.07 μg/μL;0.2 mol/L NaCl時樣品的OD值為0.197,濃度為1.045 μg/μL。
為了進一步確定鹽脅迫下影響小麥種子蛋白含量的濃度,分別提取7個濃度下的小麥胚蛋白樣品100 μg進行SDS-PAGE(圖3)。從圖3可以清晰地看到隨著鹽脅迫濃度的上升,在凝膠上出現(xiàn)的蛋白條帶出現(xiàn)的變化,充分說明鹽脅迫確實對小麥胚的蛋白含量產(chǎn)生了影響。
圖3 不同濃度的鹽脅迫對小麥種子胚蛋白的SDS-PAGE
選取0、0.1及0.2 mol/L濃度的NaCl處理過的小麥種子露白時期的小麥胚蛋白100 μg,選用10 cm pH3-10的非線性膠條對上述的材料進行雙向電泳。3種濃度的蛋白樣品都進行3次重復(fù)操作。重點檢測變化點,用來了解不同NaCl濃度處理對小麥種子萌發(fā)過程中蛋白質(zhì)變化的影響。2-DE上的污點的灰度和位置的變化可以理解為蛋白質(zhì)點的降解、合成或翻譯后修飾。以0 mol/L NaCl處理的種子胚作為參考膠與其他兩塊膠0.1 mol/L NaCl脅迫、0.2 mol/L NaCl脅迫,通過用PDQuest8.0進行比對分析發(fā)現(xiàn):在檢測到的種子胚中以0 mol/L 時為對照膠約有蛋白點121個(圖4);0.1 mol/L NaCl脅迫下(圖5)有117個,其中有32個蛋白點豐度下調(diào),21個蛋白點豐度上調(diào),其中包括10個表達消失的點,3個新表達的點;在0.2 mol/L NaCl脅迫下(圖6)有102個蛋白點,檢測到46個蛋白質(zhì)點豐度下調(diào),16個蛋白點的豐度上調(diào),其中包括16個表達消失的點,7個新表達的點。為了使差異蛋白點更清楚的觀察,對部分變化的蛋白點進行了放大(圖7)。
圖4 0 mol/L NaCl脅迫下小麥種子2-DE圖譜
圖5 0.1 mol/L NaCl脅迫下小麥種子2-DE圖譜
圖 6 0.2 mol/L NaCl脅迫下小麥種子2-DE圖譜
從不同NaCl濃度對小麥種子萌發(fā)率影響來看,明顯地呈現(xiàn)出隨著濃度的升高未萌發(fā)的種子數(shù)量的趨勢加強。同時,對各濃度下小麥種子蛋白的SDSPAGE上更顯著地體現(xiàn)出圖一相同的特點,即0和0.05 mol/L之間,0.1 mol/L和0.15 mol/L之間,0.2 mol/L和0.3 mol/L之間對種子萌發(fā)的脅迫程度相近。因此,從中選出具有代表不同鹽傷害程度的3個NaCl濃度,即0(CK對照)、0.1 mol/L(傷害閾值)、0.2 mol/L(存活閾值),作為本研究的NaCl處理濃度。因本研究只討論NaCl脅迫下萌發(fā)種子的胚蛋白含量的變化,所以致死濃度0.3 mol/L不在選擇范疇內(nèi)。
圖 7 不同濃度鹽脅迫下小麥種子萌發(fā)過程中胚蛋白部分放大的差異蛋白點
植物的整個生命活動周期中,種子的萌發(fā)過程是一個異養(yǎng)過程。對不同濃度處理后的小麥種子,很清楚地發(fā)現(xiàn)鹽脅迫延遲了小麥種子的萌發(fā)。植物在受到非生物脅迫的時候,有些蛋白在萌發(fā)的過程中表達豐度上調(diào)了,這體現(xiàn)了植物體內(nèi)會誘導(dǎo)產(chǎn)生一些新蛋白質(zhì)或原有的蛋白含量的明顯增加以適應(yīng)逆境脅迫。本試驗中NaCl脅迫下處理的小麥種子,其胚蛋白的凝膠圖譜與正常的不同,說明NaCl脅迫處理影響了小麥種子胚中蛋白含量和組分。這與前人的研究結(jié)果一致。在鹽脅迫、臭氧等外界因素的脅迫下,小麥種子中SAM基因的表達增強[10]。大麥、玉米、擬南芥種子中LEA蛋白質(zhì)豐度的降低程度與種子處于寒冷和干旱脅迫有關(guān)[11],LEA蛋白能夠通過束縛水分子來保護萌發(fā)中的活性組織,進而起到穩(wěn)定蛋白的作用。鹽脅迫下水稻、擬南芥中PSCS基因的轉(zhuǎn)錄水平提高了5倍[12],說明PSCS基因可被鹽脅迫下誘導(dǎo)表達。山梨醇和海藻糖等也都是細胞滲透調(diào)節(jié)時產(chǎn)生的重要的可溶性物質(zhì),有利于增強植物的耐鹽性[13],超氧化物歧化酶(SOD)、過氧化物酶(POD)、過氧化氫酶(CAT)等在清除鹽脅迫情況下產(chǎn)生的有害物質(zhì)起到重要作用,同時,在轉(zhuǎn)基因植物中也發(fā)現(xiàn)保護植物組織的相關(guān)蛋白表達含量提高了植物的耐鹽性[14-16]。本研究中通過對不同濃度鹽脅迫下2-DE分析發(fā)現(xiàn),蛋白含量有下降和上升,也出現(xiàn)一些新蛋白。我們推測,這些變化都是植物體調(diào)節(jié)自身的理化反應(yīng),從而減緩鹽脅迫情況下給機體帶來的損傷。脅迫影響了胚正常發(fā)育過程中蛋白質(zhì)的表達,并隨脅迫程度的加強而加大。無規(guī)律變化上調(diào)的蛋白質(zhì),多是種子萌發(fā)過程中新產(chǎn)生的蛋白質(zhì),下調(diào)蛋白質(zhì)是成熟種子原來貯藏的蛋白或是原有的mRNA翻譯來的,對上調(diào)點和下調(diào)點影響的不同,說明鹽脅迫的危害主要是由于影響了種子萌發(fā)過程中新蛋白的表達模式。
代表不同鹽傷害程度的3個NaCl處理濃度,即0 mol/L(CK對照)、0.1 mol/L(傷害閾值)、0.2 mol/L(存活閾值);在該處理濃度下,既有新的蛋白質(zhì)的出現(xiàn),也有原蛋白子含量的增加和減少。檢測到正常的種子胚有121個點,0.1 mol/L NaCl脅迫下有32個蛋白點豐度下調(diào),21個蛋白點豐度上調(diào),其中包括10個表達消失的點,3個新表達的點;在0.2 mol/L NaCl脅迫下,檢測到46個蛋白質(zhì)點豐度下調(diào),16個蛋白點的豐度上調(diào),其中包括16個表達消失的點,7個新表達的點。
[1] Khan AG. Review:Mycorrhizoremediation—an enhanced form of phytoremediation [J]. Journal of Zhejiang University Science B, 2006, 7(7):503-514.
[2] 王寶山, 趙可夫, 鄒琦. 作物耐鹽機理研究進展及提高作物抗鹽性的對策[J]. 植物學通報, 1997, S1:26-31.
[3] 程思思, 乙引, 張習敏, 馬琛. 雙向電泳技術(shù)在植物應(yīng)答非生物脅迫蛋白質(zhì)組學研究中的應(yīng)用[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學, 2010, 03:1135-1138.
[4] Xu X, Fan R, Zheng R, et al. Proteomic analysis of seed germination under salt stress in soybeans[J]. Journal of Zhejiang University Science B, 2011, 7:507-517.
[5] Phang TH, Shao Gm, Lam HM. Salt tolerance in soybean[J]. Journal of Integrative Plant Biology, 2008, 10:1196-1212.
[6] Yin C, Teng Y, Luo Y, Christie P. Proteomic response of wheat embryos to fosthiazate stress in a protected vegetable soil[J]. Journal of Environmental Sciences, 2012, 24(10):1843-1853.
[7] 張恒, 戴紹軍. 植物鹽脅迫應(yīng)答蛋白質(zhì)組學研究的技術(shù)策略[J]. 應(yīng)用生態(tài)學報, 2011, 8:2201-2210.
[8] 劉衛(wèi), 陳蕊紅, 張改生, 牛娜. 小麥遺傳型與生理型雄性不育花藥蛋白質(zhì)雙向電泳分析[J]. 遺傳, 2008, 30(8):1063-1068.
[9] Jan A, Komatsu S. Functional characterization of gibberellinregulated genes in rice using microarray system[J]. Genomics Proteomics & Bioinformatics, 2006, 4(3):137-144.
[10] 陳章良, 瞿禮嘉. 高等植物基因表達的調(diào)控[J]. 植物學報, 1991(5):390-405.
[11] 劉昀, 劉國寶, 李冉輝, 等. 胚胎晚期富集蛋白與生物的干旱脅迫耐受性[J]. 生物工程學報, 2010(5):569-575.
[12] 賀長征, 胡晉, 朱志玉, 等. 混合鹽引發(fā)對水稻種子在逆境條件下發(fā)芽及幼苗生理特性的影響[J]. 浙江大學學報:農(nóng)業(yè)與生命科學版, 2002(2):59-62.
[13] Iordachescu M, Imai R. Trehalose biosynthesis in response to abiotic stresses[J]. Integr Plant Biolo, 2008, 10:1223-1229.
[14] 李國龍, 吳海霞, 溫麗, 等. 作物抗旱生理與分子作用機制研究進展[J]. 中國農(nóng)學通報, 2010, 23:185-191.
[15] 馬長樂, 王萍萍, 曹子誼, 等. 鹽地堿蓬(Suaeda salsa)APX基因的克隆及鹽脅迫下的表達[J]. 植物生理與分子生物學學報, 2002(4):261-266.
[16] 馬秀靈, 王增蘭, 戚元成, 等. 硫腺苷甲硫氨酸合成酶基因的克隆及其在鹽脅迫條件下的不同表達(英文)[J]. Acta Botanica Sinica, 2003(11):1359-1365.