韓永卿,李 容,高晉蘭,繆時英,王琳芳
(中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)國家重點實驗室,北京100005)
精子發(fā)生的每一個發(fā)育階段,都伴有差異基因精確而有序地表達(dá)[1]。因此,深入了解與精子發(fā)生密切相關(guān)的差異表達(dá)基因,將有助于揭示生殖及進(jìn)化的奧秘。
研究表明,泛素化修飾在精子發(fā)生過程中發(fā)揮重要的作用,該修飾過程是通過多種酶級聯(lián)反應(yīng)實現(xiàn)的[2],其中E3泛素連接酶具有特異性識別底物的功能,目前精子發(fā)生過程中已有很多個差異表達(dá)基因被鑒定為E3泛素連接酶,其在精子發(fā)生過程中的作用機(jī)制正逐漸成為研究熱點[3]。
從人睪丸消減cDNA文庫中擴(kuò)增到一個差異表達(dá)基因,命名為HSD-34,經(jīng)序列比對為人源TRIM69基因編碼區(qū),該基因編碼的蛋白屬于TRIM家族蛋白,文獻(xiàn)提示TRIM家族很多成員都具有E3泛素連接酶活性[4-6]。該家族蛋白結(jié)構(gòu)特點是含有保守的RING finger結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域在介導(dǎo)泛素化修飾過程中發(fā)揮重要作用,因此推測,TRIM69也具有E3泛素連接酶活性,能夠促進(jìn)多聚泛素鏈形成。本研究旨在鑒定TRIM69是否具有催化多聚泛素鏈形成的活性,為進(jìn)一步驗證其是一個新的E3泛素連接酶奠定基礎(chǔ)。
通過PCR技術(shù),分別把TRIM69WT(1~1 503 bp)、TRIM69CA(1 ~1 503 bp,C61/64A)、TRIM69ΔR(247~1 503 bp)構(gòu)建到 pcDNA6/V5-HisB載體上;把TRIM69WT(1~1 503 bp)構(gòu)建到pGEX-4T-3載體上以及把HA-Ub構(gòu)建到pMSCVpuro載體上。
anti-Flag和anti-HA抗體(Sigma-Aldrich公司),anti-GST抗體(MBL公司),anti-ubiquitin(P4D1)抗體(Santa Cruz公司)。
HEK 293T和HeLa細(xì)胞(ATCC公司),培養(yǎng)基為加有10%胎牛血清的高糖DMEM培養(yǎng)基,細(xì)胞在含5%CO2,37℃的培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)。HEK293T細(xì)胞用engreen-D轉(zhuǎn)染試劑(英格恩公司)轉(zhuǎn)染,HeLa細(xì)胞用Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑(英俊公司)轉(zhuǎn)染。
首先確定HeLa細(xì)胞的嘌呤霉素最小致死濃度,經(jīng)篩選確定為5 mg/L;將構(gòu)建好的真核表達(dá)質(zhì)粒pMSCVpuro-HA-Ub,轉(zhuǎn)染進(jìn)HeLa細(xì)胞,轉(zhuǎn)染48 h后加入最小致死濃度的嘌呤霉素,每天換液1次,經(jīng)過2周左右的篩選,存活的細(xì)胞為穩(wěn)定表達(dá)HA-Ub基因的細(xì)胞。
將pGEX-4T-3和pGEX-4T-3-TRIM69重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸桿菌BL21(DE3),IPTG誘導(dǎo)表達(dá),裂解細(xì)胞,收集上清,過Glutathione SepharoseTM4B親和層析柱上,洗脫、分管收集、鑒定,將含目標(biāo)蛋白質(zhì)的組分合并、濃縮、上樣于Superdex200柱上純化2次,用于后續(xù)泛素化實驗。
轉(zhuǎn)染后48 h收集細(xì)胞,用如下裂解液裂解細(xì)胞,[50 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5),150 mmol/L NaCl,0.5%NP40,1%SDS],100 ℃ 煮沸10 min,15.7 ×1 000 g室溫離心15 min,上清1 mg用稀釋緩沖液稀釋10倍[50 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5),150 mmol/L NaCl,0.5%NP40],然后加入 Flag-M2-agarose(Sigma-Aldrich公司)室溫孵育1 h,免疫沉淀物用洗脫緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5),150 mmol/L NaCl,0.5%NP40,0.1%SDS)洗 5 次,8%SDSPAGE跑膠,用相應(yīng)抗體檢測。
TRIM69編碼的蛋白結(jié)構(gòu)域分析(圖1A):N-末端41~82位氨基酸殘基構(gòu)成RING結(jié)構(gòu)域,110~144位氨基酸殘基構(gòu)成B-box結(jié)構(gòu)域,175~195位和226~253位氨基酸殘基構(gòu)成coiled-coil結(jié)構(gòu)域,C-末端305~500位氨基酸殘基構(gòu)成 B30.2結(jié)構(gòu)域,即具有RING-B-box-coiled-coil(RBCC)3個連續(xù)的結(jié)構(gòu)域,因此,該蛋白質(zhì)屬于TRIM/RBCC蛋白質(zhì)家族成員。TRIM69屬于C-IV亞家族,與該亞家族的其他幾個成員相比含有相同的C3HC4 RING結(jié)構(gòu)域(圖1B)。
考馬斯亮藍(lán)結(jié)果(圖2)顯示目標(biāo)分子質(zhì)量位置(GST:26 ku和GST-TRIM69:82 ku)有高表達(dá)的蛋白條帶,在該種誘導(dǎo)條件下,GST蛋白在上清中有較多表達(dá),而GST-TRIM69融和蛋白在上清中有少量表達(dá)。
圖1 TRIM69結(jié)構(gòu)域模式圖Fig 1 The domain structure of TRIM69
圖2 GST-TRIM69以及GST在大腸桿菌BL21(DE3)細(xì)胞中的誘導(dǎo)表達(dá)Fig 2 The expression of GST or GST-TRIM69 fusion protein induced in Escherichia coli BL21(DE3)
層析純化的產(chǎn)物經(jīng)過考馬斯亮藍(lán)和Western blot鑒定(圖3,4),目的蛋白質(zhì)純度達(dá)到95%以上,可以用于后續(xù)的泛素化實驗。
純化的GST蛋白和GST-TRIM69融合蛋白偶連GSH-Sepharose4B珠子上,在有或無293T細(xì)胞提取物存在條件下,30℃孵育1 h,用泛素抗體檢測泛素化條帶。
在293T細(xì)胞提取物存在條件下,加入GSTTRIM69融合蛋白的實驗組能夠檢測到泛素化條帶,而加入GST蛋白的對照組則檢測不到泛素化條帶,說明TRIM69具有催化多聚泛素鏈形成活性;另外在沒有293T提取物存在條件下,即使加入GSTTRIM69也未見泛素化條帶,說明293T細(xì)胞提取物含有泛素化反應(yīng)所需的其他物質(zhì),如E1、E2等(圖5)。
圖5 細(xì)胞外泛素化試驗分析TRIM69能夠催化多聚泛素修飾的產(chǎn)物形成Fig 5 The activity of TRIM69 in catalyzing the formation of muti-uiquitination assayed by‘in vitro ubiquitination’experiment
將Flag-TRIM69和pcDNA6-Flag空載質(zhì)粒分別與HA-Ub質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,轉(zhuǎn)染40 h后收集細(xì)胞,經(jīng)免疫沉淀和Western blot檢測,結(jié)果顯示:(anti-HA抗體和anti-Flag)兩種抗體檢測的結(jié)果相同,與對照組相比,實驗組可見明顯呈階梯狀的條帶,說明TRIM69具有催化多聚泛素鏈形成的活性(圖6A)。
帶Flag標(biāo)簽空載、帶Flag標(biāo)簽的TRIM69WT、TRIM69CA、TRIM69ΔR質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)染進(jìn) HA-Ub穩(wěn)定表達(dá)的HeLa細(xì)胞株,經(jīng)免疫沉淀和Western blot檢測,結(jié)果顯示,與空載對照組相比,TRIM69WT組可見明顯高分子量彌散條帶,而當(dāng)RING結(jié)構(gòu)域點突變 (CA)或缺失 (ΔR),催化形成的高分子量彌散條帶明顯減弱,提示TRIM69具有催化多聚泛素鏈形成的活性且該活性與RING結(jié)構(gòu)域有關(guān)(圖6B)。
TRIM69小鼠同源物基因特異地表達(dá)于小鼠睪丸圓形精子細(xì)胞中[7]。有關(guān)它的功能,僅有1篇文獻(xiàn)報道[8]。有關(guān)人源 TRIM69基因功能方面的文章,還沒有文獻(xiàn)報道。本研究通過細(xì)胞內(nèi)外泛素化實驗觀察到TRIM69能夠催化多聚泛素化產(chǎn)物形成,而且該反應(yīng)過程依賴于 RING結(jié)構(gòu)域,提示TRIM69具有E3泛素連接酶活性。
E3泛素連接酶在精子發(fā)生過程中發(fā)揮重要作用,如RNF8在圓形精子細(xì)胞向長形精子細(xì)胞發(fā)育過程中發(fā)揮作用[9-10];RNF151在頂體形成過程中發(fā)揮作用[11];ZNF645在精子質(zhì)量控制方面發(fā)揮作用[12]。
在人、小鼠及大鼠精子發(fā)生過程中,有很多含有RING結(jié)構(gòu)域的蛋白參與其中,但其中只有少數(shù)蛋白被鑒定具有E3泛素連接酶活性。所以鑒定了TRIM69蛋白具有催化多聚泛素化的活性,為進(jìn)一步闡明其是一個新的E3泛素連接酶以及其在精子發(fā)生過程中的作用提供了依據(jù)。
圖6 細(xì)胞內(nèi)泛素化試驗分析TRIM69能夠催化多聚泛素修飾的產(chǎn)物形成Fig 6 The activity of TRIM69 in catalyzing the formation of muti-uiquitination assayed by in vivo ubiquitination
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