2009—2012年發(fā)現(xiàn)的人口腔細菌新種屬簡介

肖曉蓉　李燕　肖麗英

[摘要] 細菌是人口腔微生物的優(yōu)勢種群，不斷有新的種屬被發(fā)現(xiàn)和命名。本文介紹2009—2012年從人口腔分離的5個新菌屬和16個新菌種的主要生物學特性。

[關鍵詞] 新菌屬； 新菌種； 人口腔

[中圖分類號] R 780.2 [文獻標志碼] A [doi] 10.7518/hxkq.2013.02.026

細菌是人口腔內微生物的優(yōu)勢種群，與口腔健康和疾病密切相關。隨著醫(yī)學理論和技術的發(fā)展和完善，人口腔內不斷有新的細菌種屬被發(fā)現(xiàn)和命名，其在微生物系統(tǒng)內的分類位置也會發(fā)生變動。了解這些新的種屬有助于全面了解口腔微生物的分類現(xiàn)狀，對口腔基礎和臨床研究也具有重要意義。新的細菌種屬被發(fā)現(xiàn)后，在《國際微生物分類進化學雜志》（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology）上發(fā)表后才能被業(yè)界認可，本文即介紹2009—2012年發(fā)表在該期刊上，從人口腔分離的5個新菌屬和16個新菌種的主要生物學特性。

1 新菌屬

1.1 錐形桿菌屬（Pyramidobacter）（Downes，et al.

2009）[1]

命名：因在培養(yǎng)基上形成錐形樣菌落而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力；蛋白胨-酵母提取物-葡萄糖（peptone yeast ex-tract glucose，PYG）肉湯培養(yǎng)物的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸、少量的異戊酸和痕跡量到少量的丙酸、異丁酸、琥珀酸、苯乙酸。

模式種：魚腥味錐形桿菌（Pyramidobacter pisco-lens），DNA的G+C摩爾分數(shù)為59%，分離自人的口腔。

1.2 擬普雷沃菌屬（Alloprevotella）（Downes，et al.

2012）[2]

命名：因與普雷沃菌有相似性而被命名為擬普雷沃菌屬。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力；發(fā)酵碳水化合物的終末代謝產(chǎn)物是乙酸和琥珀酸。

模式種：坦納擬普雷沃菌（Alloprevotella tanne-rae），DNA的G+C摩爾分數(shù)為45%～47%，分離自人的口腔。

1.3 依賴桿菌屬（Fretibacterium）（Vartoukian，et al.

2012）[3]

命名：因其良好的生長需要依靠助生菌，如具核梭桿菌，故被命名為依賴桿菌屬。

特性：革蘭陰性彎曲桿菌，專性厭氧、有動力；PYG肉湯培養(yǎng)物的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸和中等量的丙酸。

模式種：苛求依賴桿菌（Fretibacterium fastidio-sum），DNA的G+C摩爾分數(shù)為63%。

1.4 毛絨厭氧桿菌屬（Lachnoanaerobaculum）（Hed-

berg，et al. 2012）[4]

命名：因專性厭氧且在培養(yǎng)基上形成毛絨樣菌落而被命名為毛絨厭氧桿菌屬。

特性：專性厭氧的芽胞桿菌，革蘭染色陽性，但

易脫色而成革蘭染色陰性；在血瓊脂平板上，菌落外形為可變的斑點和擴散狀，邊緣為嚙蝕狀或須根狀；在PYG肉湯培養(yǎng)物的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸和丁酸。

模式種：于默奧毛絨厭氧桿菌（Lachnoanaero-

baculum umeaense），菌種號為CCUG 58757T（DSM 23576T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為35%～38%，分離自人的口腔、小腸、血和羊水。

1.5 口腔桿菌屬（Stomatobaculum）（Sizova，et al.

2012）[5]

命名：因最初的分離處為口腔而得名口腔桿菌屬，屬毛螺菌科（family Lachnospiraceae）。

特性：革蘭陽性長桿菌，嚴格厭氧、無動力、無芽胞；菌細胞大小為（0.5～0.8） μm×（4～40） μm，彎曲的絲狀體可長達200 μm；主要的終末代謝產(chǎn)物是丁酸、乳酸、異戊酸和乙酸。

模式種：長口腔桿菌（Stomatobaculum longum）。

2 新菌種

2.1 魚腥味錐形桿菌（Pyramidobacter piscolens）（Dow-

nes，et al. 2009）[1]

命名：因培養(yǎng)物有特別的魚腥味而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力；菌細胞大小為（0.7～0.8） μm×（0.8～2.2） μm；在苛求厭氧瓊脂（fastidious anaerobe agar，F(xiàn)AA）中厭氧培養(yǎng)7 d后，形成有明顯的魚腥味的錐體狀菌落。

模式株：W5455T（DSM 21147T，CCUG 55836T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為59%，分離自人口腔的牙源性膿腫。

2.2 口腔放線菌（Actinomyces oris）（Henssge，et al.

2009）[6]

命名：因分離自口腔得名為口腔放線菌；該菌種包括原先鑒定為內氏放線菌血清型Ⅱ、Ⅲ、NV，和黏性放線菌血清型Ⅱ的菌株。

特性：與內氏放線菌基因型Ⅱ型相同，通過atpA或metG基因序列檢測可與其他相關菌種相鑒別。

模式株：ATCC 27044T（CCUG 34288T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為66%，分離自人的痰液。

2.3 約翰森放線菌（Actinomyces johnsonii）（Henssge，

et al. 2009）[6]

命名：以美國分子分類學家John L. Johnson的名字命名為約翰森放線菌，以表彰他在口腔放線菌菌種遺傳學關系方面進行的大量研究；該菌種包括原先鑒定為內氏放線菌血清型WVA 963型和內氏放線菌基因型WVA 963型的菌株。

特性：與內氏放線菌基因型WVA 963型（Johnson et al. 1990）相同，通過atpA或metG基因序列檢測可與其他相關菌種相鑒別。

模式株：ATCC 49338T（CCUG 34287T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為67%，分離自健康兒童的齦溝。

2.4 產(chǎn)酸丙酸桿菌（Propionibacterium acidifaciens）

（Downes and Wade. 2009）[7]

命名：因該菌種產(chǎn)生丙酸而得名產(chǎn)酸丙酸桿菌。

特性：革蘭陽性桿菌，厭氧、無芽胞、無動力、多形態(tài)；細胞大小為（0.7～0.8） μm×（1.2～4） μm；在PYG肉湯培養(yǎng)基中的主要終末代謝產(chǎn)物是大量的丙酸和乙酸，以及中等量的琥珀酸。

模式株：C3M_31T（DSM 21887T，CCUG 57100T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為70%，分離自人口腔的齲損部位。

2.5 彩虹普雷沃菌（Prevotella micans）（Downes，et

al. 2009）[8]

命名：因形成閃爍的彩虹樣菌落而得名為彩虹普雷沃菌。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無動力，可產(chǎn)生色素；菌細胞大小為0.7 μm×（1.5～5.0） μm；在FAA瓊脂培養(yǎng)皿上培養(yǎng)5 d后，形成彩虹色菌落；在PYG肉湯培養(yǎng)物中的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸、異戊酸和琥珀酸，以及痕跡量到少量的異丁酸。

模式株：E 7.56T（DSM 21469T，CCUG 56105T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為46%，分離自人的口腔。

2.6 桔紅色普雷沃菌（Prevotella aurantiaca）（Saka-

moto，et al. 2010）[9]

命名：因產(chǎn)生桔紅色菌落而得名。

特性：革蘭陰性球桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力，可產(chǎn)生色素；菌細胞大小為（0.5～0.8） μm×1.6 μm或0.8 μm×（0.9～1.0） μm；在艾格森-蓋克?。‥ggerth-Gagnon，EG）瓊脂培養(yǎng)基上形成淺棕色到深棕色菌落；在PYG肉湯培養(yǎng)基中的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸、異戊酸和琥珀酸，以及很少量的異丁酸。

模式株：OMA 31T（JCM 15754T，CCUG 57723T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為39.7%，分離自牙周炎患者的牙周袋。

2.7 解糖普雷沃菌（Prevotella saccharolytica）（Downes，

et al. 2010）[10]

命名：因具有酵解糖的特性而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力，不產(chǎn)生色素；菌細胞大小為（0.6～0.7） μm×

（0.9～5） μm；主要的終末代謝產(chǎn)物是中等量的乙酸

和琥珀酸。

模式株：D033B-12-2T（DSM 22473T，CCUG

57944T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為44%，分離自人口腔的牙菌斑；在人口腔微生物組數(shù)據(jù)庫的分類單元是781（http：//www.homd.org）。

2.8 深黑色普雷沃菌（Prevotella fusca）（Downes and

Wade. 2011）[11]

命名：因在培養(yǎng)基上形成深黑色菌落而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力；菌細胞大小為0.8 μm×（1.2～6.0） μm；在FAA培養(yǎng)皿上延長培養(yǎng)時間，菌落中央可形成深黃色到深褐色的色素；在PYG肉湯培養(yǎng)基中主要的終末代謝產(chǎn)物是琥珀酸、中等量的乙酸和少量的乳酸。

模式株：W1435T（DSM 22504T，CCUG 57946T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為43%，分離自人口腔的齦下菌斑；在人口腔微生物組數(shù)據(jù)庫的分類單元是782（http：//www.homd.org）。

2.9 靶心普雷沃菌（Prevotella scopos）（Downes and

Wade. 2011）[11]

命名：因模式株的成熟菌落形成標志性的靶心樣菌落而得名靶心普雷沃菌。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無芽胞、無動力，可產(chǎn)生色素；菌細胞大小為0.7 μm×（0.9～3.0） μm；在FAA培養(yǎng)皿上延長培養(yǎng)時間，菌落中央可見深褐色的色素，形成靶心樣菌落；在PYG肉湯培養(yǎng)基中主要的終末代謝產(chǎn)物是琥珀酸、中等量的乙酸和痕跡量的異戊酸、乳酸。

模式株：W2052T（DSM 22613T，CCUG 57945T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為41%，分離自人口腔種植體。

2.10 褐色類香味菌（Myroides phaeus）（Yan，et al.

2012）[12]

命名：因產(chǎn)生褐色菌落而得名褐色類香味菌。

特性：直桿菌，菌細胞大小為（0.4～0.5） μm×

（0.7～1.2） μm；在LB（Luria-Bertani）瓊脂培養(yǎng)基上形成圓形、突起、邊緣規(guī)則的黃色到褐色菌落。

模式株：MY15T（DSM 23313T，LMG 25566T），

DNA的G+C摩爾分數(shù)為34.3%，分離自兒童的唾液。

2.11 韋格斯卡多維亞菌（Scardovia wiggsiae）（Dow-

nes，et al. 2011）[13]

命名：以美國微生物學家Lois Wiggs的名字命名，以表彰他在厭氧微生物學研究中的貢獻。

特性：革蘭陽性多形態(tài)桿菌，厭氧、無芽胞、無動力；菌細胞大小為（0.6～0.7） μm×（1.6～4） μm；

在FAA培養(yǎng)皿上培養(yǎng)7 d后，形成圓形，邊緣完整，或邊緣呈臼齒樣、波浪形的不規(guī)則菌落；在PYG肉湯培養(yǎng)基中的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸和少量到中等量的乳酸。

模式株：C1A_55T（DSM 22547T，CCUG 58090T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為55%，分離自人的口腔及其他臨床樣本；在人口腔微生物組數(shù)據(jù)庫的分類編號是195（http：//www.homd.org）。

2.12 灰色擬普雷沃菌（Alloprevotella rava）（Downes，

et al. 2012）[2]

命名：因在血瓊脂培養(yǎng)平板上形成灰色菌落而得名。

特性：革蘭陰性桿菌，專性厭氧、無動力；細胞大小為（0.5～0.6） μm×（1.0～5.0） μm，偶而可長達

10 μm；在PYG肉湯培養(yǎng)基的終末代謝產(chǎn)物主要是琥珀酸和中等量的乙酸，在蛋白胨-酵母提取物（pep-tone yeast extract，PY）肉湯培養(yǎng)基中也可檢出痕跡量到少量的異戊酸。

模式株：81/4-12T（DSM 22548T，CCUG 58091T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為47%，分離自人的口腔；在人口腔微生物組數(shù)據(jù)庫的分類單元是302（http：//www.homd.org）。

2.13 苛求依賴桿菌（Fretibacterium fastidiosum）（Var-

toukian，et al. 2012）[3]

命名：因對營養(yǎng)物的特殊要求而被命名為苛求依賴桿菌。

特性：革蘭陰性彎曲桿菌，專性厭氧、有動力；菌細胞大小為（1.0～1.5） μm×（2.0～13.0） μm；PYG肉湯培養(yǎng)基中的主要終末代謝產(chǎn)物是乙酸和中等量的丙酸。

模式株：SGP1T（DSM 25557T，JCM 16858T），

DNA的G+C摩爾分數(shù)為63%，分離自牙周炎患者的齦下菌斑。

2.14 口腔毛絨厭氧桿菌（Lachnoanaerobaculum orale）

（Hedberg，et al，2012）[4]

命名：因分離自口腔得名口腔毛絨厭氧桿菌。

特性：革蘭陽性芽胞桿菌，專性厭氧；菌細胞大小5～20 μm，常呈聚集狀；在血瓊脂平板上的菌落呈擴散狀，或形成中心為錐體狀、邊緣為須根狀的球形菌落；主要終末代謝產(chǎn)物是丁酸、乙酸和乳酸。

模式株：N1（CCUG 60305T，DSM 24553T），DNA的G+C摩爾分數(shù)為38%，分離自健康青年人的唾液。

2.15 長口腔桿菌（Stomatobaculum longum）（Sizova，

et al. 2012）[5]

命名：因菌細胞為長長的形狀而得名。

特性：革蘭陽性長桿菌，嚴格厭氧、無動力、無芽胞；菌細胞大小為（0.5～0.8） μm×（4～40） μm，彎

曲的絲狀體可長達200 μm；在基礎厭氧培養(yǎng)基（BM）、胰化酪蛋白-酵母提取物（trypticase peptone yeast ex-tract，TY）培養(yǎng)基和胰化酪蛋白-葡萄糖-酵母提取物（trypticase peptone-glucose yeast extract，TYG）培養(yǎng)

基中可產(chǎn)生黑色素；主要的終末代謝產(chǎn)物是丁酸、乳酸、異戊酸和乙酸。

模式株：DSM 24645T（230HM-480），DNA的G+C摩爾分數(shù)為55.05%～55.3%，分離自人的齦下菌斑。

2.16 當別町韋榮菌（Veillonella tobetsuensis）（Mashi-

ma，et al. 2012）[14]

命名：因菌種分離自日本北海道當別町得名當別町韋榮菌。

特性：革蘭陰性球菌，嚴格厭氧、無芽胞、無動力；菌細胞直徑為（0.3～0.7） μm，可見旋渦形表

面；厭氧培養(yǎng)條件下的主要代謝終末產(chǎn)物是乙酸和丙酸；通過dnaK和rpoB基因序列分析，可與其他韋榮菌菌種相鑒別。

模式株：B16T（JCM 17976T，ATCC BAA-2400T），分離自健康成人的舌生物膜。

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（本文編輯 吳愛華）