吳 瑨, 董素珍
(華東師范大學(xué) 腦功能基因組學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、上海市腦功能基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 200062)
GPR40家族包含4個(gè)成員(GPR40、GPR41、GPR42和GPR43),該家族在人、小鼠及大鼠等物種間的氨基酸序列高度保守[1].其中GPR41的表達(dá)分布較為廣泛,在脂肪組織中的表達(dá)量最高,在單核細(xì)胞和嗜中性粒細(xì)胞中也有表達(dá)[2].自1997年發(fā)現(xiàn)GPR41受體以來(lái),因未發(fā)現(xiàn)其配體故GPR41一直被歸為孤兒GPCR.直到2003年,Brown等人發(fā)現(xiàn)GPR41的配體是短鏈脂肪酸[3].短鏈脂肪酸是指碳原子數(shù)小于6個(gè)的有機(jī)脂肪酸,乙酸鹽(C2)、丙酸鹽(C3)和丁酸鹽(C4)是最主要的短鏈脂肪酸,主要由食物中不被消化的碳水化合物經(jīng)厭氧菌酵解生成,為胃腸道上皮細(xì)胞提供了主要的能量來(lái)源[2].短鏈脂肪酸除了作為能量來(lái)源,還可以參與誘導(dǎo)細(xì)胞分化和促進(jìn)細(xì)胞凋亡等生理現(xiàn)象.GPR41的去孤兒化,促使人們重新思考短鏈脂肪酸在體內(nèi)發(fā)揮作用的方式.已有研究表明GPR41參與調(diào)節(jié)瘦素的分泌,這表明GPR41可參與能量代謝過(guò)程[4].鑒于GPCRs在制藥領(lǐng)域占有極其重要的地位,對(duì)于創(chuàng)新藥物研究意義重大,而且目前對(duì)GPR41的配體篩選以及功能所知甚少,因此本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建了GPR41穩(wěn)定細(xì)胞株,用于篩選GPR41的激動(dòng)劑或拮抗劑.
在現(xiàn)代藥物研究中,天然產(chǎn)物的開發(fā)和利用占據(jù)著重要的位置.而海洋資源的開發(fā)逐漸成為熱點(diǎn),因?yàn)楹Q蟓h(huán)境具有高鹽、高壓、低溫等特點(diǎn),海洋生物為了適應(yīng)這樣獨(dú)特的生存環(huán)境,漸漸進(jìn)化出了與之相適應(yīng)的代謝系統(tǒng)和機(jī)體防御系統(tǒng).在海洋生物及其代謝產(chǎn)物中,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多新穎的生物活性物質(zhì),如抗腫瘤藥物、生物毒素、酶抑制劑、抗病毒化合物以及抗菌素等[5].在海洋生物資源中,海洋真菌具有種類繁多、分布廣泛、次級(jí)代謝產(chǎn)物量大、生物活性物質(zhì)種類豐富等特點(diǎn),研究海洋真菌次級(jí)代謝產(chǎn)物逐漸成為開發(fā)海洋藥物資源的重要內(nèi)容.將GPR41受體穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞模型用于篩選從福建莆田平海灣海藻來(lái)源的黃曲霉c-f-3(Aspergillusflavus)中提取到的次級(jí)代謝產(chǎn)物.通過(guò)cAMP檢測(cè)法對(duì)上述單體化合物進(jìn)行受體結(jié)合活性的篩選,希望能夠找到GPR41潛在的受體激動(dòng)劑,為后續(xù)的研究奠定基礎(chǔ).
人類基因組DNA、DNA連接試劑盒和Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑購(gòu)自Invitrogen公司;Taq酶、脫氧三磷酸核苷酸(dNTP)、限制性內(nèi)切酶和Trizol試劑購(gòu)自TaKaRa公司;質(zhì)粒及核酸片段純化試劑盒、Western顯影用BCIP/NBT顯影液購(gòu)自Promega公司;RPMI-1640培養(yǎng)基、胎牛血清、青霉素、鏈霉素和G418購(gòu)自Gibco公司;Blasticidin和兔抗c-Myc多克隆抗體購(gòu)自Sigma;cAMP檢測(cè)試劑盒購(gòu)自法國(guó)CIS生物公司;鈣流檢測(cè)試劑盒購(gòu)自Molecular Devices公司;大腸桿菌E.coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞、pcDNA3.1-N-myc和Gα載體由本實(shí)驗(yàn)室保存;用于cAMP測(cè)試的單體化合物為中國(guó)海洋大學(xué)分離提純并提供[6];其余化學(xué)試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?
PTC100 PCR儀購(gòu)自東勝創(chuàng)新生物科技有限公司;凝膠成像儀購(gòu)自基因公司;紫外分光光度計(jì)購(gòu)自Eppendorf公司;CO2培養(yǎng)箱購(gòu)自Thermo Life sciences公司;Analyst HTTM儀和FlexStation II Reader讀板儀購(gòu)于Molecular Devices公司.
1.3.1 GPR41-pcDNA3.1質(zhì)粒的構(gòu)建
參照GenBank中提供的人GPR41的序列(序列號(hào)NM_005304)設(shè)計(jì)并合成PCR擴(kuò)增引物,以人類基因組DNA為模板擴(kuò)增得到GPR41全長(zhǎng)序列.
引物序列如下:
上游引物:5′-GGGGTACCATGGATACAGGCCCCGAC-3′;
(斜體表示上游酶切位點(diǎn)KpnI)
下游引物:5′-CCGCTCGAGCTAGCTTTCAGCACAGGCA-3′
(斜體表示下游酶切位點(diǎn)XhoI)
運(yùn)用酶切連接等基因工程手段將GPR41序列插入pcDNA3.1-N-myc載體,構(gòu)建GPR41-pcDNA3.1重組質(zhì)粒.經(jīng)酶切和測(cè)序鑒定確認(rèn)重組子的序列.
1.3.2 細(xì)胞培養(yǎng)
野生型中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞(CHO)購(gòu)自中科院上海生物研究所細(xì)胞庫(kù).該細(xì)胞用含有10%胎牛血清、100 U/mL青霉素、100μg/mL鏈霉素的RPMI-1640培養(yǎng)基培養(yǎng).待實(shí)驗(yàn)用細(xì)胞處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,且細(xì)胞密度達(dá)到80%~90%時(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn).
1.3.3 GPR41穩(wěn)定細(xì)胞株的建立
將GPR41-pcDNA3.1重組質(zhì)粒與pcDNA3.1空載體分別轉(zhuǎn)染CHO細(xì)胞,操作方法按脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine2000說(shuō)明書進(jìn)行.轉(zhuǎn)染48 h后,用含有750μg/mL G418抗生素的篩選培養(yǎng)基進(jìn)行篩選.將Gα質(zhì)粒與GPR41-pcDNA3.1或pcDNA3.1空載體共轉(zhuǎn)染CHO細(xì)胞,操作方法如上所述.轉(zhuǎn)染48 h后,用含有750μg/mL G418和5μg/mLBlasticidin的篩選培養(yǎng)基進(jìn)行篩選.以野生型CHO細(xì)胞作為篩選的陰性對(duì)照.待野生型CHO細(xì)胞全部死亡后,將具有抗生素抗性的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞株,進(jìn)行單克隆篩選.經(jīng)篩選的單克隆細(xì)胞株(GPR41-CHO)或(GPR41-Gα-CHO)用于后續(xù)檢測(cè)鑒定.
1.3.4 用RT-PCR方法檢測(cè)穩(wěn)轉(zhuǎn)單克隆GPR41的表達(dá)
提取GPR41-CHO總RNA,經(jīng)反轉(zhuǎn)為cDNA后,用PCR方法檢測(cè)GPR41的表達(dá).設(shè)計(jì)并合成檢測(cè)GPR41基因的引物,以GAPDH基因作為內(nèi)參.
GPR41引物序列 上游引物:5′-ttcttcaccaccatctatctcacc-3′;
下游引物:5′-aattctatgacgtagaccacgctg-3′.
GAPDH 引物序列 上游引物:5′-catcatccctgcatccactg-3′;
下游引物:5′-tgcctgcttcaccaccttct-3′.
1.3.5 Western Blot檢測(cè)穩(wěn)轉(zhuǎn)單克隆GPR41的表達(dá)
根據(jù)RT-PCR的結(jié)果挑選穩(wěn)轉(zhuǎn)單克隆,用Western及IP細(xì)胞裂解液、1 mmol/L PMSF和10μL/mL的Cocktail蛋白酶抑制劑提取細(xì)胞總蛋白.經(jīng)BCA法測(cè)定總蛋白濃度后,用于Western Blot檢測(cè).經(jīng)SDS-PAGE電泳、轉(zhuǎn)膜后,用麗春紅染色.經(jīng)雙蒸水或TBST充分漂洗后,在5%BSA中室溫封閉1 h.按1∶1 000的比例稀釋一抗,4℃孵育過(guò)夜.經(jīng)漂洗后孵堿性磷酸酶連接的二抗,充分漂洗后用BCIP/NBT顯影.
1.3.6 cAMP法檢測(cè)穩(wěn)轉(zhuǎn)單克隆GPR41的活性
根據(jù)RT-PCR和Western Blot的結(jié)果篩選部分GPR41-CHO穩(wěn)轉(zhuǎn)單克隆,以每孔103個(gè)細(xì)胞的密度鋪384孔板(孔底和孔壁均為黑色)培養(yǎng)24 h.因?yàn)镚PR41屬于Gi偶聯(lián)的受體,受體激活后會(huì)導(dǎo)致cAMP水平降低,故需要先用10μmol/L Foskolin孵育細(xì)胞30 min后,再進(jìn)行cAMP檢測(cè).按照法國(guó)CIS-Bio公司cAMP檢測(cè)試劑盒的說(shuō)明書操作,細(xì)胞內(nèi)源cAMP與XL665標(biāo)記的cAMP競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合cAMP抗體,根據(jù)665 nm/620 nm的熒光值計(jì)算并分析細(xì)胞內(nèi)cAMP水平的變化情況.
1.3.7 鈣流檢測(cè)穩(wěn)轉(zhuǎn)單克隆GPR41的活性
篩選部分GPR41-Gα-CHO穩(wěn)轉(zhuǎn)單克隆,以每孔3×104個(gè)細(xì)胞的密度鋪96孔板(透明底黑色壁),37℃培養(yǎng)24 h.按照Molecular Devices公司鈣流檢測(cè)試劑盒的說(shuō)明書配制Loading Buffer,并加入終濃度1.25 mmol/L Probenecid和2.5μmol/L的Fluo-3 AM 熒光染料.混勻后,按照每孔100μL加入細(xì)胞孔內(nèi).37℃孵育1 h后,利用FlexStation II Reader讀板儀收集細(xì)胞孔內(nèi)的熒光信號(hào).
1.3.8 GPR41穩(wěn)定細(xì)胞株受體激動(dòng)劑的篩選
用cAMP方法從海洋真菌次生代謝產(chǎn)物中篩選GPR41受體激動(dòng)劑,cAMP檢測(cè)方法如前所述,用于測(cè)試的單體化合物的濃度為10μmol/L,1μmol/L和100 nmol/L,每個(gè)濃度做3個(gè)平行孔.
1.3.9 數(shù)據(jù)處理及分析
本實(shí)驗(yàn)所有數(shù)據(jù)及作圖均用Sigma-Plot 9.0軟件處理,每組實(shí)驗(yàn)均重復(fù)3次.結(jié)果用平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤差表示.
從人基因組中用PCR擴(kuò)增人GPR41基因全長(zhǎng)片段,PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,符合預(yù)期片段大?。? 041 bp).瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果見(jiàn)圖1a.GPR41-pc3.1重組質(zhì)粒經(jīng)酶切后電泳結(jié)果見(jiàn)圖1b,酶切片段大小符合預(yù)期.將重組質(zhì)粒測(cè)序后,測(cè)序結(jié)果與Gen-Bank檢索的GPR41基因序列(序列號(hào)NM_005304)完全一致.
圖1 GPR41-pcDNA3.1質(zhì)粒的構(gòu)建Fig.1 Construction of GPR41-pcDNA3.1 plasmid
提取細(xì)胞總RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,從RNA水平檢測(cè)穩(wěn)定細(xì)胞株中GPR41的表達(dá).圖2的RT-PCR結(jié)果表明在空載體轉(zhuǎn)染的CHO細(xì)胞中,無(wú)GPR41的擴(kuò)增條帶;而GPR41-CHO細(xì)胞中有明亮的擴(kuò)增條帶,說(shuō)明在RNA水平上檢測(cè)到GPR41的表達(dá).
圖2 RT-PCR檢測(cè)RNA水平GPR41的表達(dá)結(jié)果Fig.2 RT-PCR results to detect the RNA expression of GPR41
選取部分定量結(jié)果較好的細(xì)胞克隆,用 Western Blot檢驗(yàn)GPR41質(zhì)粒所帶的c-Myc標(biāo)簽的表達(dá),間接反應(yīng)GPR41的蛋白的表達(dá)水平.目的蛋白的大小應(yīng)為GPR41與c-myc融合蛋白的大小.圖3的Western Blot結(jié)果表明在野生型CHO細(xì)胞中,無(wú)目的條帶的表達(dá);而GPR41-CHO不同的單克隆細(xì)胞株中有藍(lán)紫色的顯色條帶,說(shuō)明在蛋白水平上檢測(cè)到GPR41的表達(dá).
圖3 Western Blot方法檢測(cè)蛋白水平c-myc的表達(dá)結(jié)果Fig.3 Determination of GPR41 protein levels in CHO WT and transfected cells using western blot
根據(jù)Western Blot結(jié)果,選取部分GPR41-CHO克隆用cAMP方法檢測(cè)GPR41受體的功能.前人研究已經(jīng)證實(shí)GPR41屬于Gi/o偶聯(lián)受體[7],因此需要先用腺苷酸環(huán)化酶的激活劑forskolin誘導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)cAMP水平升高,當(dāng)GPR41受體與其配體結(jié)合后,引起cAMP濃度降低,以此來(lái)測(cè)定GPR41的活化情況.如圖4cAMP實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,10μmol/L forskolin在GPR41過(guò)表達(dá)細(xì)胞和Mock細(xì)胞中引起cAMP水平上升3倍左右.500μmol/L丁酸鈉引起G41過(guò)表達(dá)的細(xì)胞株cAMP水平降低且有顯著差異(P<0.05),而在mock細(xì)胞中cAMP水平未見(jiàn)明顯變化(P>0.05).選取部分GPR41-Gα-CHO克隆用于檢測(cè)鈣流.實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖5所示.500μmol/L丁酸鈉作用于對(duì)照組細(xì)胞沒(méi)有引起鈣流的變化,而作用于GPR41-Gα-CHO細(xì)胞株時(shí)引起了鈣流的變化.上述實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明GPR41穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建成功可以用于篩選GPR41受體的激動(dòng)劑.
圖4 500μmol/L丁酸鈉和10μmol/L forskolin分別作用于G41-CHO和Mock細(xì)胞引起的cAMP水平變化Fig.4 Effect of butyrate(500μmol/L)and forskolin(10μmol/L)on the release of cAMP in GPR41-CHO and the mock cells
圖5 500μmol/L丁酸鈉作用于GPR41-Gα-CHO和Mock細(xì)胞引起鈣流變化Fig.5 Effect of butyrate(500μmol/L)on the release of calcium in GPR41-Gα-CHO and the mock cells
每種單體化合物在初篩過(guò)程中選取3個(gè)作用濃度10μmol/L,1μmol/L和100 nmol/L,根據(jù)初篩結(jié)果,選取有響應(yīng)的化合物進(jìn)行復(fù)篩,每組設(shè)置3個(gè)平行孔,以確保篩選結(jié)果的準(zhǔn)確.實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖6所示,10μmol/L foskolin可以顯著提高GPR41-CHO和mock細(xì)胞中cAMP的水平,37號(hào)化合物可以顯著降低GPR41-CHO細(xì)胞的cAMP水平(P<0.01),而mock細(xì)胞中cAMP水平則沒(méi)有明顯變化(P>0.05).該實(shí)驗(yàn)結(jié)果說(shuō)明,37號(hào)化合物可能是GPR41受體的潛在激動(dòng)劑,在1μmol/L的濃度下即可引起細(xì)胞內(nèi)cAMP水平的降低.其余化合物未見(jiàn)類似作用.
圖6 (a)37號(hào)化合物作用于G41-CHO初篩結(jié)果;(b)37號(hào)化合物作用于G41-CHO和 Mock細(xì)胞引起cAMP水平變化Fig.6 (a)Primary screen results of No.37 compound on cAMP accumulation in GPR41-CHO cells;(b)Effect of No.37 compound on cAMP accumulation in GPR41-CHO and Mock cells
G蛋白偶聯(lián)受體GPR41在多種組織中均有表達(dá),而且在人、小鼠及大鼠等物種間的氨基酸序列高度保守.自從2003年發(fā)現(xiàn)GPR41的配體是短鏈脂肪酸后,已有研究表明GPR41與能量代謝密切相關(guān).但是目前關(guān)于GPR41受體的功能和GPR41受體激動(dòng)劑的研究仍需深化,因此本實(shí)驗(yàn)將研究目的確定為GPR41受體激動(dòng)劑的篩選,為后續(xù)研究該受體的功能,以及揭示GPR41在生理和病理?xiàng)l件下扮演的角色打下基礎(chǔ).
本文首先選擇中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞(CHO)作為細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng),因?yàn)镃HO細(xì)胞具有轉(zhuǎn)染效率高、細(xì)胞容易操作、背景干凈、內(nèi)源性干擾小等特點(diǎn)[2].在構(gòu)建GPR41-CHO穩(wěn)定細(xì)胞株后,首先運(yùn)用RT-PCR和Western Blot檢測(cè)了RNA水平和蛋白水平上GPR41的表達(dá),但是上述檢測(cè)的陽(yáng)性結(jié)果并不足以說(shuō)明構(gòu)建的GPR41具有活性.隨后利用cAMP和鈣流檢測(cè),從功能水平上進(jìn)行了驗(yàn)證.實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,當(dāng)配體丁酸鈉與GPR41受體相結(jié)合時(shí),可以通過(guò)cAMP水平的高低來(lái)評(píng)估受體激動(dòng)劑的活性.本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建的GPR41具有受體活性,過(guò)表達(dá)細(xì)胞株構(gòu)建成功.短鏈脂肪酸作為GPR41低親和力的配體,短鏈脂肪酸激活GPR41的濃度范圍在微摩爾數(shù)量級(jí)(幾百微摩爾至毫摩爾)[8].短鏈脂肪酸相對(duì)的“低效”可能與它在血液中濃度較高以及其生理功能相關(guān).GPR41作為短鏈脂肪酸的低親和力受體,只在短鏈脂肪酸水平異常升高的情況下才會(huì)被激活,因此可以避免受體的持續(xù)活化[9].除此之外,短鏈脂肪酸也并非GPR41特異性的配體,不同碳鏈長(zhǎng)度的短鏈脂肪酸,對(duì)于GPR41激活有不同的效力.因此篩選特異性高、親和力強(qiáng)的配體成為本課題的研究目標(biāo).篩選的范圍鎖定在從福建平海灣海藻來(lái)源的黃曲霉中提取的一系列次級(jí)代謝產(chǎn)物[10],因?yàn)楹Q笳婢紊x產(chǎn)物種類繁多,生物活性物質(zhì)豐富.近年來(lái)已經(jīng)從海洋真菌次生代謝產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)了多種抗腫瘤藥物、生物毒素和酶抑制劑等生物活性物質(zhì),研究海洋真菌次級(jí)代謝產(chǎn)物逐漸成為開發(fā)天然藥物資源的重要內(nèi)容.
cAMP篩選結(jié)果表明,在GPR41細(xì)胞中,1μmol/L37號(hào)化合物能夠降低由foskolin引起的cAMP水平升高,在mock細(xì)胞中則不會(huì)引起這種變化趨勢(shì).在另外一種GPCR-CHO過(guò)表達(dá)細(xì)胞株(GPR12-CHO)未發(fā)現(xiàn)cAMP水平的變化.這一現(xiàn)象表明37號(hào)化合物具有GPR41受體激動(dòng)活性,有可能成為GPR41的潛在配體.經(jīng)結(jié)構(gòu)解析后發(fā)現(xiàn),37號(hào)化合物是一種新化合物,屬于吡喃酮類化合物[11].這是首次報(bào)道2-吡喃酮類化合物具有GPR41受體激動(dòng)活性.但是這種化合物是否是該受體特異的激動(dòng)劑,仍需要進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)證明.
綜上所述,GPCR作為新藥靶點(diǎn)的意義備受關(guān)注,但是仍有一些重要問(wèn)題亟待解決,例如對(duì)GPR41生理功能的認(rèn)識(shí)和病理意義的研究,又如對(duì)初篩得到的化合物進(jìn)行構(gòu)效關(guān)系研究.利用cAMP檢測(cè)方法對(duì)海洋真菌次級(jí)代謝產(chǎn)物活性成分進(jìn)行研究,并對(duì)初篩得到的化合物進(jìn)行化學(xué)結(jié)構(gòu)的修飾和優(yōu)化,并研究化學(xué)結(jié)構(gòu)與生物活性之間的關(guān)系,開發(fā)出有針對(duì)性和高效性的化合物,將對(duì)新藥的開發(fā)和對(duì)G蛋白偶聯(lián)受體的功能研究將產(chǎn)生重要的影響.針對(duì)GPCR開發(fā)更多特異性強(qiáng)、副作用小的全新天然小分子化合物,將為藥物開發(fā)帶來(lái)新的突破.
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