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    土壤中產(chǎn)淀粉酶菌株的分離、鑒定及提高產(chǎn)酶能力的研究

    2012-07-19 01:52:06王東明
    綠色科技 2012年3期

    傅 冰,王東明

    (麗水職業(yè)技術(shù)學(xué)院 環(huán)境工程分院,浙江 麗水323000)

    1 引言

    淀粉酶是能催化淀粉水解轉(zhuǎn)化成葡萄糖、麥芽糖及其他低聚糖的一類(lèi)酶的總稱。在淀粉糖工業(yè)和食品工業(yè)中被廣泛利用,是最早實(shí)現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn),迄今為止用途最廣、產(chǎn)量最大的酶制劑品種[1]。按水解淀粉方式不同,把淀粉酶分為α-淀粉酶、β-淀粉酶、糖化酶和異淀粉酶4類(lèi)。目前工業(yè)生產(chǎn)上都以微生物發(fā)酵法大規(guī)模生產(chǎn)α-淀粉酶[2],其中枯草芽孢桿菌生產(chǎn)的淀粉酶極其應(yīng)用處于整個(gè)酶制劑的首位。自然界中具有十分豐富的產(chǎn)淀粉酶菌種資源,本實(shí)驗(yàn)從土壤中分離出高產(chǎn)淀粉酶能力的菌株,通過(guò)常規(guī)方法結(jié)合18SrDNA序列分析鑒定該菌株。通過(guò)化學(xué)誘變、物理誘變及復(fù)合誘變等方法誘變菌株,進(jìn)一步篩選獲得具有更高產(chǎn)淀粉酶能力的菌株,為今后獲得能夠應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn)的高產(chǎn)淀粉酶菌株奠定了一定的基礎(chǔ)。

    2 材料與方法

    2.1 材料

    Taq酶、dNTPs、EasyPure Quick膠回收試劑盒、MarkerIII均購(gòu)自TransGen Biotech生物公司;Mastercycle personal PCR 儀 (eppendorf,美 國(guó));Dolphlin-DOC Plus凝膠成像系統(tǒng)(Wealtec,美國(guó));HWY-100A恒溫?fù)u床(東莞吉之壟電子儀器有限公司);DHZ-CA恒溫?fù)u床(江蘇太倉(cāng)實(shí)驗(yàn)設(shè)備廠);2C40809023-723型分光光度計(jì)(上海欣茂儀器有限公司);XW-80A混勻器(上海棋特分析儀器有限公司)。

    平板初篩選及試管斜面保存培養(yǎng)基為胰化蛋白胨1%,酵母浸膏0.5%,NaCl 0.5%,可溶性淀粉2%,瓊脂2%,pH值為7.0;液體復(fù)篩培養(yǎng)基為胰化蛋白胨1%,酵母浸膏0.5%,NaCl 0.5%,可溶性淀粉2%,pH值為7.0;驗(yàn)證有無(wú)組成型突變菌株培養(yǎng)基配方為胰化蛋白胨1%,酵母浸膏0.5%,NaCl 0.5%,可溶性淀粉2%,葡萄糖2%,瓊脂2%,pH 值為7.0。

    2.2 產(chǎn)淀粉酶菌株的篩選

    2.2.1 篩選產(chǎn)酶菌株的土壤處理

    從麗水職業(yè)技術(shù)學(xué)院的花壇地下5~20cm處,獲取熟化、有機(jī)質(zhì)含量高的肥沃土壤,分離菌株。對(duì)土壤做以下幾種處理:不做任何處理為對(duì)照;刮去離地面5cm表土層,翻倒土壤,深度為5cm,邊長(zhǎng)為15cm,面積為225cm2,拌入50g可溶性淀粉;拌勻后,輕拍土壤,上蓋薄膜保濕。培養(yǎng)5d。刮去離地面5cm表土層,翻倒土壤,深度為5cm,邊長(zhǎng)為15cm,面積為225cm2,拌入50g可溶性淀粉、10g蛋白胨,拌勻后,輕拍土壤,上蓋薄膜保濕。培養(yǎng)5d。刮去離地面5cm表土層,翻倒土壤,深度為5cm,邊長(zhǎng)為15cm,面積為225cm2,拌入50g可溶性淀粉、10g硫酸銨,拌勻后,輕拍土壤,上蓋薄膜保濕,培養(yǎng)5d。刮去離地面5cm表土層,翻倒土壤,深度為5cm,邊長(zhǎng)為15cm,面積為225cm2,拌入50g可溶性淀粉、10g硝酸鉀,拌勻后,輕拍土壤,培養(yǎng)5d。

    2.2.2 平板初篩菌種

    取1g土壤,稀釋106倍,分別取103~106稀釋液涂平板,37℃培養(yǎng)48h,接著用0.1%稀碘液顯色1~2min,挑選菌落水解圈直徑與菌落直徑比值大的單菌落挑至斜面上,對(duì)菌株進(jìn)行編號(hào)。

    2.2.3 液體培養(yǎng)基復(fù)篩測(cè)定淀粉酶活力

    制備106個(gè)/mL孢子懸浮液,含40mL液體復(fù)篩培養(yǎng)基150mL三角瓶接種1mL菌懸液或孢子懸浮液,37℃培養(yǎng)48h,轉(zhuǎn)速170r/min。以1mL濾液5min內(nèi)水解淀粉生成1μmol還原糖量定義為1個(gè)活力單位(U),3,5-二硝基水楊酸法測(cè)定還原糖含量,挑選產(chǎn)酶活力最大值的菌株為目的菌株。

    2.3 菌株鑒定

    2.3.1 菌株形態(tài)觀察

    在平板初篩培養(yǎng)基平板上觀察霉菌的菌落形態(tài),利用水浸片法在高倍鏡下觀察菌絲體、孢子器及孢子形態(tài)。

    2.3.2 18SrDNA鑒定菌種

    (1)PCR反應(yīng)擴(kuò)增18SrDNA?;蚪MDNA的提取采用改進(jìn)的CTAB法[3],18SrDNA序列擴(kuò)增采用18SrNDA通用引物,PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳(電泳強(qiáng)度為5V/cm)檢測(cè)后,利用膠回收試劑盒回收PCR產(chǎn)物,交于測(cè)序公司測(cè)定序列。

    (2)18SrDNA序列分析。序列同源性用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中的BLAST工具進(jìn)行比較,并利用DNAS-tar軟件繪制進(jìn)化樹(shù)。

    2.3.3 菌株的誘變處理,提高菌株產(chǎn)酶活力

    (1)紫外誘變。取1mL106個(gè)/mL的孢子懸浮液于平皿中,采用20W紫外燈,照射距離為30cm,時(shí)間分別為5、8、10、15min,取1 02、103、104倍稀釋液各0.1mL涂布平板,35℃暗室培養(yǎng)至出現(xiàn)單菌落。挑選出挑選單菌落周?chē)苋εc單菌落直徑比值大的菌株挑至斜面上,確定初篩菌株后再通過(guò)搖瓶發(fā)酵進(jìn)行復(fù)篩。

    (2)化學(xué)誘變。取1mL 106個(gè)/mL的孢子懸浮液于平皿中,加入一定濃度的亞硝酸鈉1mL,28℃水浴反應(yīng)5min,加2mL pH值為4.5的醋酸緩沖液,分 別 反 應(yīng) 5、8、10、20min,加 濃 度 0.7mol/L Na2HPO42mL終止反應(yīng),按一定比例稀釋?zhuān)?.1mL涂布平板,35℃培養(yǎng)至出現(xiàn)單菌落,酶活鑒定同紫外誘變。

    (3)復(fù)合誘變。紫外誘變后,挑選的菌株進(jìn)行NaNO2誘變。NaNO2誘變后,挑選的菌株進(jìn)行紫外誘變。

    (4)驗(yàn)證有無(wú)組成型突變菌株。制備菌懸液或孢子懸浮液,稀釋涂平板,在菌落上滴加0.1%稀碘液顯色1~2min,觀菌周?chē)欠裼械矸鬯馊Α?/p>

    3 結(jié)果與分析

    3.1 產(chǎn)淀粉酶高產(chǎn)菌株的分離

    不做任何處理的土壤稀釋液涂平板,分離得到3株產(chǎn)酶活力較大的細(xì)菌菌株,水解圈直徑與菌落直徑比值分別為2.650、2.867、3.324;拌入50g可溶性淀粉土壤稀釋液涂平板,分離得到兩株產(chǎn)酶活力較大的細(xì)菌菌株,水解圈直徑與菌落直徑比值分別為2.983、4.053;拌入50g可溶性淀粉、10g蛋白胨稀釋液涂平板,分離得到3株產(chǎn)酶活力較大的細(xì)菌菌株和2株產(chǎn)酶活力較大的真菌菌株,水解圈直徑與菌落直徑比值分別為5.025、3.895、4.243、4.356、3.112;拌入50g可溶性淀粉、10g硫酸銨土壤稀釋液涂平板,分離得到4株產(chǎn)酶活力較大的細(xì)菌菌株,水解圈直徑與菌落直徑比值分別為4.449、4.500、4.356、4.264;拌入50g可溶性淀粉、10g硝酸鉀土壤稀釋液涂平板,分離得到3株產(chǎn)酶活力較大的細(xì)菌菌株,水解圈直徑與菌落直徑比值分別為4.250、5.011、4.800。對(duì)分離得到菌株依次編號(hào)為:ba-1、ba-2、ba-3、ba-4、ba-5、ba-6、ba-7、ba-8、fu-1、fu-2、ba-9、ba-10、ba-11、ba-12、ba-13、ba-14、ba-15,菌株ba-6平板培養(yǎng),水解圈直徑與菌落直徑比值最大,為5.025。分離得到17個(gè)菌株中,15個(gè)細(xì)菌菌株,2個(gè)霉菌菌株,未見(jiàn)放線菌菌株,與土壤中微生物數(shù)目培養(yǎng)時(shí)間、培養(yǎng)條件有關(guān),土壤中細(xì)菌數(shù)目最多,其次為霉菌孢子數(shù),細(xì)菌形成菌落一般為1~2d,霉菌3~4d,放線菌6~7d。土壤用可溶性淀粉富集培養(yǎng)后,篩選得到的產(chǎn)淀粉酶菌株產(chǎn)酶活力高,說(shuō)明富集培養(yǎng)有利于高產(chǎn)菌株篩選。細(xì)菌菌株平板培養(yǎng),以ba-5酶活力最高,水解圈直徑與菌落直徑比值為5.025,ba-1產(chǎn)酶活力最低為2.650,真菌中fu-1酶活力最高為4.356。

    從液體培養(yǎng)基復(fù)篩測(cè)定淀粉酶活力的結(jié)果可以看出,菌株平板培養(yǎng)、液體培養(yǎng)產(chǎn)酶活力不一致,微生物平板培養(yǎng)、液體培養(yǎng),菌體的生長(zhǎng)擴(kuò)散速度及養(yǎng)分和氧氣的供應(yīng)等都有差異,造成產(chǎn)酶能力變化不一致,以1mL濾液5min內(nèi)水解淀粉生成1μmol還原糖量定義為1個(gè)活力單位(U),液體培養(yǎng),菌株ba-3濾液酶活力最低,為14.8U/mL。菌株fu-1濾液酶活力最高,為36.9U/mL,選擇菌株fu-1為出發(fā)菌株。

    3.2 菌株鑒定

    3.2.1 菌株fu-1形態(tài)特征

    菌落初為白色,后變成黑色厚絨狀。分生孢子梗頂部形成球形頂囊,頂囊球形,其上全面覆蓋一層梗基和一層小梗,小梗上長(zhǎng)有成串褐黑色的球狀分生孢子,分生孢子褐色球形。有時(shí)在新分離的菌株中能找到白色、圓形、直徑約1mm的菌核(圖1、圖2)。

    圖1 菌株菌絲體形態(tài)

    圖2 菌株頂囊、分生孢子形態(tài)

    3.2.2 菌株fu-1鑒定

    (1)18SrDNA序列分析?;蚪M提取及PCR擴(kuò)增,提取分離菌株fu1的基因組,用真核生物通用引物SPF1、SPR1擴(kuò)增基因組DNA,結(jié)果顯示:分離菌株fu1 18SrDNA PCR產(chǎn)物大小約為1 700bp。

    (2)18SrDNA基因序列,獲得分離菌株的18S rDNA的PCR產(chǎn)物后,交于南京金斯特生物科技有限公司測(cè)序。

    (3)分離菌株fu-1SrDNA基因序列系統(tǒng)進(jìn)化分析,獲得fu-1SrDNA基因序列后,提交NCBI進(jìn)行BLAST分析,NCBI登錄號(hào)為lcl|15007,同時(shí)用DNAStar軟件繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖3),比對(duì)結(jié)果顯示fu1SrDNA基因序列與Aspergillus niger strain Ym33182相似性達(dá)到99%,結(jié)合形態(tài)特征,可以認(rèn)為分離菌株為黑曲霉(Aspergillus niger)。將分離分離菌株fu-1命名為黑曲霉An。

    圖3 分離菌株fu-1 18SrDNA基因序列與已知相關(guān)序列的聚類(lèi)進(jìn)化樹(shù)

    3.3 誘變處理,提高菌株產(chǎn)酶活力

    3.3.1 紫外線誘變

    以黑曲霉菌株An為出發(fā)菌株,誘變處理5min,誘變后的菌株中共有7株水解圈/菌株直徑比值 大 于 4.356,分 別 為 4.563、4.782 、4.877、4.471、4.688、4.874、4.844,誘變處理8min,誘變后的菌株中共有4株水解圈/菌落直徑比值大于4.356,分別為5.174、4.812、4.381、4.688,誘變處理10min,誘變后的菌株中共有2株水解圈/菌落直徑比值大于4.356,分別為4.542、4.733,誘變處理15min,誘變后的菌株中僅有1株水解圈/菌落直徑比值大于4.356,為4.755,上述菌株依次編號(hào)為An-1u至An-14u。紫外線誘變結(jié)果顯示,絕大多數(shù)突變?yōu)樨?fù)變,僅得到14個(gè)水解圈/菌落直徑比值大于原菌株的突變株,誘變處理5min效果較好,正變菌株數(shù)目最多,有7株,誘變處理8min,水解圈/菌落直徑比值5.174的菌株為正變幅度最大的菌株。

    原始菌株為36.9U/mL,誘變所分的菌株An-1u至An-14u液體培養(yǎng)產(chǎn)酶活力分別為;39.1、30.5、26.1、32.1、45.6、45.4 、41.0 、51.2 、31.5 、45.2、31.6、26.8、35.3、38.2U/mL,僅有7個(gè)菌株液體培養(yǎng)的濾液酶活力大于原始菌株,與水解圈/菌落直徑比值的結(jié)果不一致,是由于液體、固體培養(yǎng)條件不一致。液體培養(yǎng)產(chǎn)酶活力最大的菌株為An-8u,其濾液酶活力為51.2U/mL。

    3.3.2 NaNO2誘變

    以黑曲霉菌株An為出發(fā)菌株,分別用0.02、0.05、0.1mol/lHNO2處理孢子懸浮液5min、8min、10min、20min。

    0.02mol/L NaNO2處理孢子懸浮液5min、分離到水解圈/菌落直徑比值分別為5.467、4.706、5.538、5.810、5.440的菌株;處理8min,分離到水解圈/菌落直徑比值分別為5.086、5.273的菌株;處理10min,分離到水解圈/菌落直徑比值分別為6.325、4.043的菌株;處理20min,分離到水解圈/菌落直徑比值為4.543的菌株;共計(jì)10個(gè)菌株,依次編號(hào)為An-1c至An-10c。

    0.05mol/L HNO2處理孢子懸浮液5min,分離到水解圈/菌落直徑比值分別為 4.808、4.719、4.888的菌株;處理8min,未分離到水解圈/菌落直徑比值大的菌株,可能是分離的平板數(shù)目不足夠多的原因;處理10min,分離到水解圈/菌落直徑比值分別為4.727、5.168、4.741的菌株,處理20min,分離到水解圈/菌落直徑比值為4.855的菌株,共計(jì)7個(gè)菌株,依次編號(hào)為An-11c至An-17c。

    0.1mol/l NaNO2處理孢子懸浮液,僅在處理8min的孢子懸浮液中,分離到水解圈/菌落直徑比值分別為4.717、4.509的菌株依次編號(hào)為 An-18c、An-19c。

    以上結(jié)果顯示低濃度NaNO2處理、且處理時(shí)間短,平板分離的正突變株數(shù)目多,高濃度NaNO2處理或處理時(shí)間長(zhǎng),平板分離的正突變株數(shù)目少,可能因高濃度處理或長(zhǎng)時(shí)間處理造成孢子死亡率增加有關(guān)。

    菌株An-1c至An-19c液體培養(yǎng),濾液酶活力分別為52.1、39.9、26.3、33.6、42.0、35.8、57.6、38.9、33.4、34.6、41.2、43.7、43.2 、43.9、40.9、45.0、50.7、48.2、42.0U/mL,出發(fā)菌株黑曲霉菌An液體培養(yǎng),酶活力為36.9U/mL,19個(gè)突變株中有14個(gè)菌株為正突變。突變株An-7c突變率最大,其濾液酶活力為57.6U/mL。

    3.3.3 復(fù)合誘變

    誘變劑的復(fù)合處理常常呈現(xiàn)一定的協(xié)同效應(yīng),NaNO2誘變后采用紫外誘變,紫外誘變后采用NaNO2誘變。

    以菌株 An-8u為出發(fā)菌株,0.02mol/lNaNO2處理孢子懸浮液,處理5min,分離得到水解圈與菌落直 徑 比 值 分 別 為 5.261、5.727 突 變 株,處 理8min,分離得到水解圈與菌落直徑比值分別為5.307突變株,處理10min,分離得到水解圈與菌落直徑比值分別為5.531、6.242突變株,依次編號(hào)為An-8u-1c、An-8u-2c、An-8u-3c、An-8u-4c、An-8u-5c。

    以菌株An-7c為出發(fā)菌株,紫外誘變處理5min,分離得到水解圈與菌落直徑比值分別為5.456、6.313、5.767突變株,紫外誘變處理8min,分離得到水解圈與菌落直徑比值為5.403突變株,紫外誘變處理8min,分離得到水解圈與菌落直徑比值為5.984突變株,依次編號(hào)為An-7c-1u、An-7c-2u、An-7c-3u、An-7c-4u、An-7c-5u。

    驗(yàn)證有無(wú)組成型突變菌株培養(yǎng)基配方:胰化蛋白胨1%,酵母浸膏0.5%,NaCl 0.5%,可溶性淀粉2%,葡萄糖2%,瓊脂2%,pH7.0。制備An-8u-1c、An-8u-2c、An-8u-3c、An-8u-4c、An-8u-5c、An-7c-1u、An-7c-2u、An-7c-3u、An-7c-4u、An-7c-5u孢子懸浮液,涂布到驗(yàn)證有無(wú)組成型突變菌株培養(yǎng)基的平板上,在菌落上滴加0.1%稀碘液顯色1-2min,菌落周?chē)鷽](méi)有水解圈,說(shuō)明分離到上述突變菌株中沒(méi)有組成型突變,葡萄糖抑制了淀粉對(duì)淀粉酶的誘導(dǎo)作用,因而菌落周?chē)鷽](méi)有水解圈。

    An-8u-1c、An-8u-2c、An-8u-3c、An-8u-4c、An-8u-5c、An-7c-1u、An-7c-2u、An-7c-3u、An-7c-4u、An-7c-5u液體培養(yǎng),濾液酶活力分別為61.0、73.6、72.3、76.1、81.8、77.2、93.4、80.6、89.3、77.6U/mL,菌株 An-7c-2u濾液酶活力最高,確定為目的菌株。

    4 結(jié)語(yǔ)

    本實(shí)驗(yàn)從土壤中篩選分離17個(gè)菌株,以液體產(chǎn)酶活力最高的菌株fu1,作為出發(fā)菌株。通過(guò)18S rDNA PCR擴(kuò)增測(cè)序,結(jié)合形態(tài)學(xué)觀察,鑒定該菌株為黑曲霉。通過(guò)紫外誘變、化學(xué)誘變及復(fù)合誘變的方法,最終篩選到具有更高產(chǎn)淀粉酶能力的菌株An-7c-2,其酶活提高到了出發(fā)菌株的253.11%。

    前人對(duì)產(chǎn)淀粉菌株分離篩選及如何提高其產(chǎn)酶能力已經(jīng)有一定的研究:趙銘欽等對(duì)α-淀粉酶和菌株的誘變,其α-淀粉酶為出發(fā)菌株的1.964倍[4];陳遠(yuǎn)釗等以從醋醅中篩選出產(chǎn)α-淀粉酶的酵母菌為出發(fā)菌進(jìn)行N+離子注入誘變,使產(chǎn)物酶活提高了219%[5];余詩(shī)慶等以一株產(chǎn)耐高溫α-淀粉酶菌株(地衣芽孢桿菌)為出發(fā)菌株,原生質(zhì)體制備后經(jīng)NTG(亞硝基胍)藥物誘變,最終篩選到具有高產(chǎn)淀粉酶能力的菌株[6]。從這些研究中我們可以看到,高產(chǎn)淀粉酶分離篩選主要取決于兩方面:篩選地的選擇、誘變方法。篩選地的選擇因人而已,燕衛(wèi)東從貧瘠土壤中篩選淀粉酶生產(chǎn)菌株[7],陳遠(yuǎn)釗等以從醋醅中篩選產(chǎn)α-淀粉酶的酵母菌[5],王曉紅等從海洋沉積樣品及魚(yú)腸道中篩選出產(chǎn)淀粉酶的酵母菌菌株[8];目前常用的誘導(dǎo)方法有物理誘變、化學(xué)誘變及復(fù)合誘變,陳遠(yuǎn)釗等以N+離子注入誘變從醋醅中篩選出的產(chǎn)α-淀粉酶酵母菌[5],郭宏文等進(jìn)行了紫外線和硫酸二乙酯復(fù)合誘變處理。篩選得到1株高產(chǎn)異淀粉酶的菌株[9]。由于篩選地選擇的隨機(jī)性以及基因突變的不確定性,因此能夠投入工業(yè)生產(chǎn)的高產(chǎn)淀粉酶菌株的篩選及選育需要較大的精力、物力投入。

    由于時(shí)間關(guān)系,本研究未對(duì)發(fā)酵條件進(jìn)行優(yōu)化,未來(lái)需要通過(guò)單因子實(shí)驗(yàn)及正交試驗(yàn)對(duì)pH值、碳源、氮源等發(fā)酵條件進(jìn)行優(yōu)化,已期獲得適合產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)的最佳發(fā)酵條件。

    [1]張樹(shù)政.酶工業(yè)制劑(下冊(cè))[M].北京:科學(xué)出版社,1998.

    [2]孫曉菲,李?lèi)?ài)江.α-淀粉酶的應(yīng)用及研究現(xiàn)狀[J].畜牧獸醫(yī)科技信息,2008(6):13~14.

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    Isolation and Identification of Bacterial Strains Yielding Amylase in Soil and Improvement of Yielding Amylase Ability

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