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    中度嗜熱混合菌在攪拌槽中浸出黃銅礦及其群落動(dòng)態(tài)

    2010-11-29 09:52:24周洪波謝英劍張汝兵曾偉民羅海浪王玉光
    關(guān)鍵詞:生物

    周洪波,謝英劍,張汝兵,曾偉民,羅海浪,王玉光

    (中南大學(xué) 資源加工與生物工程學(xué)院,生物冶金教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖南 長(zhǎng)沙,410083)

    生物冶金技術(shù)由于其具有反應(yīng)條件溫和、對(duì)環(huán)境友好、能耗少、成本低等優(yōu)點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于難處理金礦的生物氧化預(yù)處理和次生硫化銅礦的浸出[1]。黃銅礦作為最具有商業(yè)價(jià)值的硫化銅礦物之一,在世界上所知銅礦儲(chǔ)量中含量最大。隨著銅的需求量持續(xù)增加,研究黃銅礦的生物浸出具有重大意義。目前,采用常溫生物浸出黃銅礦的反應(yīng)速度緩慢,難以獲得較高的銅浸出速率和浸出率[1?2]。而中度嗜熱菌與常溫菌相比具有一定的優(yōu)勢(shì)。這是因?yàn)殡S著浸出的進(jìn)行,硫化礦物氧化以及微生物代謝產(chǎn)生大量的熱量,可以使整個(gè)浸出體系的溫度升高到50 ℃,局部溫度甚至可以達(dá)到75 ℃或者更高[3],此時(shí)常溫菌通常已經(jīng)死亡或失去活性,而中度嗜熱菌在該溫度下可以保持較高的活性,可以快速浸出硫化礦,因此,在工業(yè)浸出黃銅礦中,與常溫菌相比,中度嗜熱菌具有一定的優(yōu)勢(shì)。槽浸是生物浸出工業(yè)應(yīng)用中常用的工藝之一,其浸出體系中傳質(zhì)效果好(如攪拌、通氣等),可以較方便地對(duì)體系的主要工藝參數(shù)進(jìn)行控制,適合硫化礦物精礦的浸出[4]。浸礦工藝中有關(guān)微生物生態(tài)學(xué)的研究對(duì)于發(fā)展生物浸出技術(shù)具有重要的指導(dǎo)意義,只有了解浸礦體系中的生態(tài)結(jié)構(gòu)和主要微生物種群動(dòng)態(tài)變化規(guī)律,才能通過(guò)浸礦工藝的調(diào)控,優(yōu)化浸礦微生物群落結(jié)構(gòu),從而提高浸出速率[5]。Brierley認(rèn)為, 理解生物浸出中的微生物學(xué)過(guò)程尤其是微生物生態(tài)規(guī)律是提高工藝水平的關(guān)鍵[6]。PCR-RFLP(限制性酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性)方法是一種非常成熟的基于 PCR的基因指紋圖譜技術(shù),目前已廣泛應(yīng)用于酸性礦坑水(AMD)中的微生物類群分析[7],而對(duì)于生物浸出工藝中(如柱浸,槽浸等反應(yīng)體系中)浸礦微生物的種群動(dòng)態(tài)變化研究較少[8?9]。為此,本文作者采用 PCR-RFLP技術(shù)研究黃銅礦攪拌浸出過(guò)程中微生物群落變化動(dòng)態(tài),并分析pH值、電位等參數(shù)的變化對(duì)微生物群落動(dòng)態(tài)變化的影響,以便為調(diào)控微生物種群結(jié)構(gòu)、優(yōu)化浸出工藝過(guò)程、提高浸出速率和浸出率提供指導(dǎo)。

    1 材料和方法

    1.1 礦樣和菌種

    實(shí)驗(yàn)所用黃銅礦精礦來(lái)自江西德興。礦石經(jīng)粉碎后過(guò)篩,粒徑≤75 μm。

    經(jīng)X線衍射(XRD)分析,礦物主要由80%左右(質(zhì)量分?jǐn)?shù),下同)黃銅礦、5%左右黃鐵礦、5%左右石英等成分組成。礦樣的元素分析結(jié)果為:32.02% Cu,22.65% S,30.90% Fe。礦物元素組成見(jiàn)表1。

    表1 礦樣成分的能譜分析結(jié)果Table 1 Mineral sample composition by energy spectrum analysis

    本實(shí)驗(yàn)所用菌種主要為Acidithiobacillus caldus,Leptospirillum ferriphilum,Sulfobacillus acidophilus和Sulfobacillus thermosulfidooxidans等中度嗜熱菌種的混合菌,純菌菌株均由教育部生物冶金重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室分離和保藏。其中:At. caldus為硫氧化細(xì)菌;L. ferriphilum為亞鐵氧化細(xì)菌;S. acidophilus和S. thermosulfidooxidans既能氧化硫又能氧化亞鐵。菌種的培養(yǎng)用9K基本鹽溶液加入10 g/L的黃銅礦精礦。培養(yǎng)條件如下:pH=1.8,溫度為45 ℃,轉(zhuǎn)速為170 r/min。9K基本鹽的成分為:(NH4)2SO43.0 g/L,K2HPO40.5 g/L,KCl 0.1 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,Ca(NO3)20.01 g/L。

    1.2 實(shí)驗(yàn)裝置及條件

    浸礦實(shí)驗(yàn)是在1個(gè)總?cè)莘e為2.6 L的有機(jī)玻璃反應(yīng)器中進(jìn)行,內(nèi)徑為140 mm,高為170 mm,有1根通氣管沿槽壁豎直通向槽底,并且水平彎折。在水平通氣管的下面開(kāi)一排小孔,氣體從小孔中分散通入。用2個(gè)恒流泵加入H2SO4或者NaOH來(lái)調(diào)節(jié)初始pH值。pH值和電極電位Eh的測(cè)量值可以從微型電腦上直接讀取。實(shí)驗(yàn)裝置如圖1所示。

    圖1 實(shí)驗(yàn)裝置Fig.1 Experiment device

    把反應(yīng)器裝入圓形玻璃恒溫水浴缸中,使反應(yīng)器內(nèi)浸出液恒定維持在45 ℃,實(shí)際裝液量為2 L(9K基本鹽培養(yǎng)基),礦漿質(zhì)量濃度為10 g/L。菌種富集物以1.1×106個(gè)/mL的接種濃度被接入反應(yīng)器,浸出時(shí)間為30 d。反應(yīng)條件為:初始pH=2.0,溫度為45 ℃,攪拌漿轉(zhuǎn)速為500 r/min,通氣量為0.6 L/min。

    1.3 儀器和試劑

    實(shí)驗(yàn)儀器有:玻璃圓形水浴鍋;通氣泵;測(cè)量pH值和Eh的復(fù)合電極(Pt, Ag/AgCl)(JENCO,美國(guó)任氏公司生產(chǎn));原子吸收儀(北京華洋分析儀器有限公司生產(chǎn));恒流泵(HL-2S,上海滬西分析儀器有限公司生產(chǎn))。

    實(shí)驗(yàn)試劑為:重鉻酸鉀溶液,Taq DNA 聚合酶(MBI,USA);pGEM-T 載體(Promega,USA);內(nèi)切酶MspⅠ和Hin 6 Ⅰ ( M BI)。測(cè)序由北京三博遠(yuǎn)志生物公司完成。

    1.4 分析方法

    每2 d取樣分析,用原子吸收方法測(cè)定浸出液中總Fe2+和Cu2+的濃度,用重鉻酸鉀滴定法測(cè)定Fe2+的濃度,在總鐵含量中去除Fe2+含量即為Fe3+含量。應(yīng)用血球計(jì)數(shù)板測(cè)定菌數(shù);每天記錄浸出液的 pH值和Eh值。浸出結(jié)束后得到的礦渣經(jīng)洗滌及冷凍干燥后,與未浸出的礦樣一起應(yīng)用化學(xué)滴定分析的方法測(cè)定銅的含量,計(jì)算銅的浸出率。

    1.5 RFLP分析

    1.5.1 DNA的提取

    每隔 6~8 d取浸出液 100 mL(含固體)提取總DNA,提取方法參照文獻(xiàn)[10]。方法如下:在10 000 r/min轉(zhuǎn)速下離心固液混合樣品,去除上清液,剩余物冷凍干燥后與2 g干熱滅菌的沙子混合,加液氮研磨3次,用13.5 mL的DNA抽提緩沖液(0.1 mol/L 磷酸鈉,0.1 mol/L Tris-HCl,0.1 mol/L EDTA,1.5 mol/L NaCl,1% CTAB (pH=8.0))溶解研磨產(chǎn)物,加入50 μL蛋白酶K (10 g/L),經(jīng)37 ℃水浴30 min,加入1.5 mL 20%的SDS,于65 ℃水浴2 h(每隔15 min輕微搖動(dòng)1次),于4 000 r/min轉(zhuǎn)速下離心15 min,轉(zhuǎn)移上清液至新的離心管中,然后,加入等體積異丙醇,混勻并放入4 ℃冰箱中過(guò)夜, 最后以10 000 r/min離心15 min,棄上清液并加入2 mL預(yù)冷的70%乙醇洗滌2次,于室溫干燥后用100 μL TE溶解。粗提DNA,用瓊脂糖凝膠回收試劑盒(OMEGA,USA)進(jìn)行回收純化。

    1.5.2 PCR擴(kuò)增和純化

    提取得到的總DNA,用16S rRNA基因通用引物63F,1387R(63F:5’-CAGGCCTAACACATGCAAGTC-3’;1387R:5’-GGGCGGWGTGTACAAGGC-3’)來(lái)進(jìn)行擴(kuò)增[12],對(duì)所得的PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化。所得片段長(zhǎng)度為1.4 kb左右。

    1.5.3 克隆

    其次,你們需要接受自己,獲得自信能量。初中階段的你們不僅小秘密多了,情感也更加細(xì)膩敏感。越優(yōu)秀的學(xué)生對(duì)自我的認(rèn)同感就越高,一旦理想和現(xiàn)實(shí)出現(xiàn)差距,失落感就會(huì)更強(qiáng)烈。這時(shí)候,如果能客觀認(rèn)識(shí)現(xiàn)狀,接受成長(zhǎng)中的自己,讓自己的優(yōu)點(diǎn)更加“明亮”,缺點(diǎn)更加“暗淡”,我一定會(huì)離你們遠(yuǎn)遠(yuǎn)的。

    把純化后的片段連接到pGEM-T載體中,在16 ℃水浴中過(guò)夜,轉(zhuǎn)化到Ecoli DH5α[0]感受態(tài)細(xì)胞內(nèi)。涂平板用藍(lán)白篩選的方法挑選出陽(yáng)性克隆子。利用通用載體引物 M13F(5’-CAG GAA ACA GCT ATG AC-3’)和 M13R(5’-GTA AAA CGA CGG CCA GT-3’)對(duì)菌落PCR擴(kuò)增出插入片斷。然后,用內(nèi)切酶MspⅠ和Hin 6Ⅰ對(duì)插入片斷進(jìn)行酶切,在37 ℃酶切24 h。最后,用 3%的瓊脂糖凝膠作酶切分析,得到圖譜。對(duì)顯現(xiàn)不同條帶的克隆子(OTU)進(jìn)行測(cè)序,在GENBANK中進(jìn)行序列比對(duì),鑒定細(xì)菌種類。

    2 結(jié)果和分析

    2.1 浸出實(shí)驗(yàn)

    浸出液中微生物含量的變化見(jiàn)圖2??梢?jiàn):經(jīng)過(guò)對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期后在第 7天左右細(xì)菌濃度達(dá)到最大,為2.6×107個(gè)/mL;然后略有下降。但是,基本維持在2×107個(gè)/mL以上。經(jīng)推測(cè),部分菌體已經(jīng)吸附到礦物顆粒上。

    圖2 浸出液中微生物含量的變化Fig.2 Variation of cell number in leachate

    浸出液中pH和Eh變化曲線見(jiàn)圖3??梢?jiàn):接種后電位為400 mV,在第1天內(nèi)電位很快升高,然后緩慢上升,在第15天到第19天這一階段又有一個(gè)比較明顯的上升階段,然后,電位穩(wěn)定在660 mV左右。與電位相對(duì)應(yīng),pH值在第1天內(nèi)下降比較明顯,然后,一直呈平緩下降的趨勢(shì)。在浸出過(guò)程的后期,pH值基本保持不變。

    使用重鉻酸鉀滴定法測(cè)定溶液中Fe2+的質(zhì)量濃度時(shí)發(fā)現(xiàn)(見(jiàn)圖4):浸出液中Fe2+質(zhì)量濃度非常低,應(yīng)用原子吸收所測(cè)定的總鐵濃度近似等于 Fe3+質(zhì)量濃度;在第16天左右,總鐵的質(zhì)量濃度最高,達(dá)到0.72 g/L,然后開(kāi)始下降,到反應(yīng)結(jié)束時(shí)下降到0.49 g/L。銅的浸出持續(xù)增加,浸出液中 Cu2+的質(zhì)量濃度最高達(dá)到0.63 g/L。應(yīng)用化學(xué)滴定分析法,計(jì)算得出最后Cu的浸出率為 26.2%。該浸出率不高,可能與銅精礦殘留的浮選藥劑有關(guān),即浸礦微生物活性受到了一定程度的抑制。

    圖3 浸出液中pH和Eh變化曲線Fig.3 Variations of pH and Eh in leachate

    圖4 浸出液中Cu2+和Fe2+的質(zhì)量濃度變化曲線Fig.4 Concentrations of Fe2+ and Cu2+ in leachate

    2.2 微生物群落分析

    在第8,16,24和第30天分別取樣,因?yàn)椴町悧l帶只有3種,所以,每個(gè)樣挑取80個(gè)左右白色菌落,可足夠保證結(jié)果的可靠性。陽(yáng)性克隆的比例為96%。酶切圖譜的條帶類型見(jiàn)圖5。從酶切圖譜來(lái)看,各階段OTU數(shù)量的差異性比較明顯。挑選差異性的3個(gè)陽(yáng)性克隆子測(cè)序,在GENBANK數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)后,發(fā)現(xiàn)2種是At. caldus,分別編號(hào)為AC-1和AC-2;1種為L(zhǎng). ferriphilum,編號(hào)為L(zhǎng)F ;沒(méi)有檢測(cè)到代表其他菌種的OTU。在NCBI上比對(duì)后發(fā)現(xiàn)AC-1和AC-2序列與登錄號(hào)為DQ661629.1的At. caldus相似度達(dá)到99%,LF的序列與登錄號(hào)為EF025338.1的L. ferriphilum相似度達(dá)到99%。

    圖5 酶切圖譜的條帶類型Fig.5 RFLP pattern of 16S rRNA gene digested by restriction enzymes

    在第8天時(shí),群落中占優(yōu)勢(shì)地位的是At. caldus。總共挑取 82個(gè)克隆子,AC-1樣占全部克隆子數(shù)的62%,AC-2占全部克隆子數(shù)的34%,At. caldus總共占96%;代表L. ferriphilum的LF僅占全部克隆子數(shù)的4%。

    到第16天時(shí),84個(gè)陽(yáng)性克隆子中AC-1占總數(shù)的31%,AC-2占總數(shù)的21%,At. caldus總共占52%;LF占總數(shù)的48%。At. caldus和L. ferriphilum兩者的數(shù)量已經(jīng)基本相當(dāng)。

    到第24天時(shí),87個(gè)陽(yáng)性克隆子中AC-1占總數(shù)的33%,AC-2占總數(shù)的17%,At. caldus總共占50%;LF占總數(shù)的50%。At. caldus和L. ferriphilum的數(shù)量仍然基本相當(dāng)。

    3 討論

    黃銅礦的氧化過(guò)程開(kāi)始于質(zhì)子對(duì)礦物的攻擊和Fe3+的氧化攻擊[11?12]。由黃銅礦的晶格結(jié)構(gòu)可知,它的化合價(jià)鍵在S,Cu和Fe之間相互形成,結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,鍵能很高。在電子傳遞過(guò)程中,F(xiàn)e3+和H+攻擊黃銅礦的晶格結(jié)構(gòu),接受S與金屬之間化合鍵斷裂后的電子,使Cu2+和Fe2+釋放到溶液中。其中,浸礦細(xì)菌所起的作用是將Fe2+氧化為Fe3+,將S氧化為硫酸。生成的Fe3+可以繼續(xù)對(duì)礦物起氧化作用。具體反應(yīng)[13]如下:

    浸出過(guò)程發(fā)生的反應(yīng)很復(fù)雜,除上述反應(yīng)外,浸出液中還會(huì)發(fā)生如下反應(yīng):

    在每個(gè)浸出實(shí)驗(yàn)中,都能觀察到 pH值的持續(xù)下降和Eh的持續(xù)升高[14]。這是因?yàn)榻鲞^(guò)程是一個(gè)不斷產(chǎn)酸和有Fe3+釋出的過(guò)程。氧化還原電位Eh由液相中的主要離子對(duì)濃度比 c(Fe3+)/c(Fe2+)和 c(H+)/c(OH?)來(lái)決定。當(dāng)溶液中Fe2+濃度非常低時(shí),Eh取決于Fe3+濃度及 pH值的變化[15]。從反應(yīng)式(2)~(6)可以看出:浸出過(guò)程中不斷產(chǎn)生H+,使pH值持續(xù)下降。由反應(yīng)式(1)可知:當(dāng)細(xì)菌濃度增大并起氧化作用后,浸出液中Fe3+濃度也將越來(lái)越高,所以,電位也隨之升高(如圖3)。

    影響黃鉀鐵礬形成的主要因素包括pH值、溫度及硫酸鐵介質(zhì)的濃度[16]。當(dāng)溫度恒定時(shí),主要受H+和硫酸鐵介質(zhì)濃度的影響。如反應(yīng)式(3)~(6)所示,鐵沉淀的生成使溶液中如 K+,SO42?,NH4+等許多離子的濃度都發(fā)生了變化。從圖4可知:在第16天以后,浸出液中Fe2+質(zhì)量濃度開(kāi)始下降,可推測(cè)是黃鉀鐵礬大量生成的緣故。從圖3可以看出,當(dāng)生成黃鉀鐵礬時(shí)Eh有上升的趨勢(shì)。這是因?yàn)?H+增加,此階段 pH值下降。

    由RFLP分析可知:該中等嗜熱槽浸系統(tǒng)中微生物多樣性并不豐富,只有L. ferriphilum 和At. caldus被檢測(cè)到,生物多樣性遠(yuǎn)低于酸性礦坑水或堆浸系統(tǒng)中的多樣性。這主要是因?yàn)椴劢到y(tǒng)的溫度恒定,而且pH值、氧氣、CO2、營(yíng)養(yǎng)物水平都較均一。Foucher等[17]通過(guò)對(duì)傳統(tǒng)機(jī)械攪拌反應(yīng)器和氣升式懸浮顆粒柱狀反應(yīng)器中微生物群落組成情況進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn):L. ferrooxidans,At. caldus以及 S. thermosulfidooxidans是這2種反應(yīng)器中主要的微生物種群。可見(jiàn):這些反應(yīng)器內(nèi)的種群多樣性同樣并不豐富。

    在浸出開(kāi)始時(shí),At. caldus是優(yōu)勢(shì)菌,豐度為96%,在浸出進(jìn)行過(guò)程中,L. ferriphilum逐漸占主導(dǎo)地位,豐度為69%。這可能是礦物溶解后釋出的硫元素轉(zhuǎn)變?yōu)槎嗔蚧衔锔采w在礦物表面,在浸礦體系中最后氧化得到由元素硫形成的一層硫膜,而 At. caldus可以氧化元素硫變成硫酸[11]。只有在硫膜被逐漸溶解,礦物中慢慢釋放出Fe2+的情況下,L. ferriphilum才能迅速生長(zhǎng)并起作用。此外,還存在鐵濃度、pH值、Eh等因素的影響。Okibe等[18]的實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果表明,在低 pH值和高離子選擇壓力下,Leptospirillum spp.和Ferroplasma spp.將成為浸出過(guò)程中的優(yōu)勢(shì)種群,相反,在pH值較高時(shí),Acidithiobacillus 和 Sulfobacillus是群落中的主要成員。Demergasso等[19]的研究表明:Leptospirillum spp.的生長(zhǎng)與pH值密切相關(guān)。實(shí)驗(yàn)所用的At. caldus最適pH值為2.3左右,L. ferriphilum的最適pH值為1.6左右;L. ferriphilum比At. caldus能夠耐受更高的離子選擇壓力。因此,在第8天的樣品中,L. ferriphilum的含量只占微生物總量的4%;在浸出結(jié)束的第30天的樣品中,L. ferriphilum的含量達(dá)到了微生物總量的69%,這可能與pH值下降有關(guān)。

    4 結(jié)論

    (1) 中等嗜熱混合菌浸出黃銅礦過(guò)程中溶液 pH值逐漸下降,Eh持續(xù)升高,這是因?yàn)榻鲶w系的復(fù)雜反應(yīng)不斷產(chǎn)酸并有Fe3+釋出。浸出中間階段Fe3+質(zhì)量濃度下降,是由于有黃鉀鐵礬沉淀生成。

    (2) 槽式攪拌反應(yīng)器中浸出黃銅礦精礦的微生物群落結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,微生物種類不豐富,應(yīng)用 PCR-RFLP方法只檢測(cè)到 2種微生物,分別為 At. caldus和L. ferriphilum。這是因?yàn)榉磻?yīng)器浸出體系的選擇壓力更大。

    (3) 槽式攪拌反應(yīng)器中浸出黃銅礦精礦的群落動(dòng)態(tài)變化很明顯。在浸出開(kāi)始階段,At. caldus 是優(yōu)勢(shì)種群,其豐度為96%。隨著浸出的進(jìn)行,L. ferriphilum 逐漸增多,在浸出后期代替At. caldus成為優(yōu)勢(shì)種群,其豐度為69%。

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